Oddělení společných laboratoří Název: Laboratorní příručka OSL, Příloha č. 1 Mikrobiologie Signatura: OSL_LP_01 Datum vydání: 01. 06. 2016
Strana 1 z 5 Verze 1 Výtisk č. 2
1) Bakteriologie materiál výtěr z nosu, krku, nosohltanu, mandlí, hrtanu a hrtanu
výtěr z hrtanu,nosohltanu sputum, aspirát, BAL
vyšetření
odběrová souprava
transport
doba odezvy
kultivační
tampon v TPA
pokojová teplota, 24 hod.
3 dny
tampon na drátě v TPA
pokojová teplota, 4 hod.
7 dní
sterilní zkumavka, sterilní kontejner sterilní zkumavka, sterilní šroubovací kontejner URICULT sterilní zkumavka, sterilní šroubovací kontejner tampon v TPA tampon v TPA
2 - 8ºC, 4 hod. transport ihned!
4 dny
cílené kultivační na Bordetella pertussis a Bordetella parapertussis kultivační na nespecifickou mikroflóru kultivační
moč
2 - 8ºC, 18 hod.
poznámka cílená vyšetření na Corynebacterium diphteriae, Neisseria meningitidis, MRSA - označit na žádance předem objednat
4 dny
1 - 5 ml
pokojová teplota, 24 hod. 10 ml
předem objednat ev.vč.vyšetření na Campylobacter
pokojová teplota, 1 hod.
8 hod.
kultivační cílené kultivační na GO kultivační výtěr z recta tampon v TPA cílené na kampylobaktery kultivační tampon v TPA pro epidemiologii kultivační tampon v TPA výtěr z urogenitálního (včetně anaerobní kultivace) traktu cílené na urogenitální odběrová souprava mykoplazmata (dodá OSL úsek klinické mikrobiologie) mikroskopické vč. detekce nátěry nátěry na stanovení MOP Trichomonas vaginalis 2 podložní skla
pokojová teplota, 24 hod. pokojová teplota, 24 hod.
4 dny 4 dny
pokojová teplota, 24 hod.
4 dny
pokojová teplota, 24 hod.
4 dny
pokojová teplota, 24 hod.
12 dnů
uretra, cervix, lochie, event. další lokalizace
2 - 8ºC, 2 dny
3 dny
uretra, cervix
pokojová teplota, 24 hod.
2 dny
vagina, cervix, zadní klenba poševní
ucho - výtěr
kultivační
tampon v TPA
pokojová teplota, 24 hod.
5 dnů
oko - stěr
kultivační
tampon v TPA
pokojová teplota, 24 hod.
5 dnů
mikroskopie v FK
včetně výtěru ze zvukovodu a středouší včetně výtěru ze spojivkového vaku
Oddělení společných laboratoří Název: Laboratorní příručka OSL, Příloha č. 1 Mikrobiologie Signatura: OSL_LP_01 Datum vydání: 01. 06. 2016
Strana 2 z 5 Verze 1
1) Bakteriologie materiál stěr
vyšetření kultivační (včetně anaerobní kultivace) kultivační před hemokulturou
odběrová souprava
transport
doba odezvy
tampon v TPA
pokojová teplota, 24 hod.
12 dnů
tampon v TPA
pokojová teplota, 24 hod.
3 dny
pokojová teplota, 3 hod.
10 dnů
odběrové lahvičky pro kultivační aerobní, anaerobní hemokultura v automatickém systému kultivaci event.lahvička pro odběr na pediatrii (včetně anaerobní) mikroskopické a kultivační likvor sterilní zkumavka (vč. anaerobní) mikroskopické, kultivační sterilní zkumavka punktát (primárně sterilní injekční stříkačka tělesné tekutiny) (vč. anaerobní) mikroskopické a kultivační sterilní zkumavka hnis injekční stříkačka (vč. anaerobní) lahvička na malé množství mikroskopické a kultivační sterilní zkumavka lahvička tkáň, kostní dřeň na malé množství (vč. anaerobní) kultivační tampon v TPA výtěr (ev. anaerobní) (drát, plast)
biopsie žaludku
žluč (obsah žluč.cest)
cizorodý materiál
příjem nonstop pokojová teplota, 1 hod.
4 dní
pokojová teplota,24 hod. transport ihned!
10 dní
pokojová teplota,24 hod. transport ihned!
10 dní
pokojová teplota,24 hod. transport ihned!
10 dní
vč. tkání z patologie
pokojová teplota,24 hod. transport ihned!
10 dní
(absces, peritonzilární absces, dekubit apod.)
mikroskopické a kultivační vyšetření na Helicobacter pylori
sterilní zkumavka s 2 - 8ºC, 24 hod. tekutým transportním médiem sterilní zkumavka event. mikroskopické a kultivační lahvička na malé množství pokojová teplota, 2 hod. (vč. anaerobního) kultivační vyšetření
sterilní zkumavka
dialyzát
mikroskopické a kultivační
dialyzační vak
antrum
kultivační
sterilní zkumavka
poznámka z kůže, rány, dekubitu, defektu, dutiny ústní apod. kontrolní stěr z místa odběru krve na hemokultivaci nepřelepovat čárový kód lahvičky štítkem s údaji
2 - 8ºC, 2 hod. pokojová teplota, 2 hod. pokojová teplota, 2 hod.
příjem nonstop ascites,tek.z Douglasu, perikard. tek, pleurání punktát, kloubní punktát, mateřské mléko, aj. obsah patologických dutin (absces, z peritonea, peritonzilární absces, apod.)
7 dní
10 dní
5 dnů
katetry, kanyly, kont. čočky, apod. katetry cca 5 cm špičky
5 dnů 5 dnů
paranazální dutiny
Oddělení společných laboratoří Název: Laboratorní příručka OSL, Příloha č. 1 Mikrobiologie Signatura: OSL_LP_01 Datum vydání: 01. 06. 2016
Strana 3 z 5 Verze 1
2) Rychlé metody (imunografické testy - přímé stanovení antigenů) materiál
stolice
moč
nos - výtěr
vyšetření odběrová souprava stanovení Clostridium kontejner s lopatičkou difficile stanovení původců virových gastroenteritid kontejner s lopatičkou (rota-, adeno- a noroviry) stanovení Campylobacter ssp. stanovení antigenu sterilní zkumavka, sterilní Streptococcus pneumoniae šroubovací kontejner imunochromatografické sterilní zkumavka, sterilní stanovení antigenu šroubovací kontejner Legionella ssp. stanovení RSV tampon (plast)
transport
doba odezvy
poznámka
pokojová teplota, 3 hod.
2 dny
2 ccm resp. 2 ml
2 - 8ºC, 3 dny
2 dny
2 ccm resp. 2 ml
pokojová teplota, 24 hod.
2 dny
1 - 5 ml
pokojová teplota, 24 hod.
2 dny
1 - 5 ml
pokojová teplota, 1 hod.
24 hod.
event. výtěr z nasofaryngu
transport
doba odezvy
poznámka
2 - 8ºC, 24 hod.
71 dnů
předběžný výsledek 3 a 6 týdnů
2 - 8ºC, 24 hod.
71 dnů
předběžný výsledek 3 a 6 týdnů
2 - 8ºC, 24 hod.
71 dnů
předběžný výsledek 3 a 6 týdnů
2 - 8ºC, 24 hod.
71 dnů
předběžný výsledek 3 a 6 týdnů
2 - 8ºC, 24 hod.
71 dnů
předběžný výsledek 3 a 6 týdnů
2 - 8ºC, 24 hod.
71 dnů
předběžný výsledek 3 a 6 týdnů
2 - 8ºC, 24 hod.
71 dnů
předběžný výsledek 3 a 6 týdnů
3) Průkaz mykobakterií materiál sputum,aspirát,BAL výtěr z laryngu
vyšetření mikroskopické a kultivační (kult. v automat.systému)
odběrová souprava sterilní zkumavka, sterilní kontejner
kultivační
tampon na drátě
stolice
mikroskopické a kultivační
likvor
mikroskopické a kultivační
kůže
mikroskopické a kultivační
moč
kultivační
ostatní tekuté materiály
mikroskopické a kultivační
tkáň
mikroskopické a kultivační
nátěr na sklíčku
mikroskopické
sterilní zkumavka, sterilní kontejner sterilní zkumavka, sterilní kontejner sterilní zkumavka, sterilní kontejner sterilní kontejner 100 ml sterilní zkumavka, sterilní kontejner sterilní zkumavka, sterilní kontejner podložní sklo
2 - 8ºC, 24 hod. pokojová teplota, 24 hod.
71 dnů 2 dny
předběžný výsledek 3 a 6 týdnů
Oddělení společných laboratoří Název: Laboratorní příručka OSL, Příloha č. 1 Mikrobiologie Signatura: OSL_LP_01 Datum vydání: 01. 06. 2016
Strana 4 z 5 Verze 1
4) Průkaz kvasinek a vláknitých mikromycet materiál kůže, nehty, vlasy
vyšetření mikroskopické a kultivační
odběrová souprava sterilní zkumavka, sterilní kontejner
transport
doba odezvy
pokojová teplota, 24 hod.
30 dní
poznámka kvasinky a dermatofyta uvést lokalizaci (HK, DK ...)!
sputum, aspirát, BAL výtěr z ucha materiál z ucha nátěr na sklíčku stěr z kůže
mikroskopické a kultivační kultivační mikroskopické a kultivační mikroskopické kultivační mikroskopické a kultivační
stolice
mikroskopické a kultivační
likvor jiný materiál - tekutý
mikroskopické a kultivační
jiný materiál - pevný
mikroskopické a kultivační
stěry a výtěry
kultivační
sterilní zkumavka, sterilní kontejner tampon na drátě sterilní zkumavka, sterilní kontejner podložní sklo tampon na drátě sterilní zkumavka, sterilní kontejner sterilní zkumavka, sterilní kontejner sterilní zkumavka, sterilní kontejner sterilní zkumavka, sterilní kontejner
pokojová teplota, 24 hod.
10 dní
kvasinky a hyfomycety
2 - 8ºC, 24 hod.
10 dní
kvasinky a hyfomycety
pokojová teplota, 24 hod.
10 dní
kvasinky a hyfomycety
pokojová teplota, 24 hod. pokojová teplota, 24 hod.
2 dny 30 dní
uvést lokalizaci (ucho, dutina ústní) kvasinky a dermatofyta
pokojová teplota, 24 hod.
10 dní
kvasinky a hyfomycety
pokojová teplota, 2 hod.
10 dní
kvasinky a hyfomycety
pokojová teplota, 24 hod.
10 dní
kvasinky a hyfomycety
pokojová teplota, 24 hod.
10 dní
tampon na drátě či plastu pokojová teplota, 24 hod.
10 dní
kvasinky a hyfomycety uvést druh materiálu a lokalizaci kvasinky a hyfomycety uvést druh materiálu a lokalizaci
5) Průkaz parazitárních agens materiál
transport
doba odezvy
mikroskopické standardní
odběrová souprava plastový kontejner s lopatičkou
2 - 8ºC, 24 hod.
3 dny
perianální otisk (Grahamova metoda)
mikroskopické
podložní sklo s lepicí páskou
pokojová teplota, 48 hod.
3 dny
poznámka 3 vzorky stolice odebrané v průběhu 72 hod., jeden vzorek musí být čerstvý (ne z chladničky) 3 vzorky odebrané v průběhu 72 hod.
suspektní útvary
mikroskopické
3 dny
nesmí se použít formalín nebo jiná fixační tekutina!
suspektní ektoparaziti seškrab kůže - scabies
mikroskopické mikroskopické
3 dny 24 hod.
bez fixačních tekutin! po předchozí domluvě
stolice
vyšetření
kontejner nebo zkumavka s fyziologickým roztokem pokojová teplota, 24 hod. nebo vodou kontejner nebo zkumavka pokojová teplota, 48 hod. provádí se na OSL 30 minut
Oddělení společných laboratoří Název: Laboratorní příručka OSL, Příloha č. 1 Mikrobiologie Signatura: OSL_LP_01 Datum vydání: 01. 06. 2016
Strana 5 z 5 Verze 1
6) Molekulárně biologické metody - PCR
Po telefonické domluvě je možné vzorky zpracovat přednostně. Vzorek nesmí obsahovat talek z rukavic, stopy zásypů nebo mastí, hemolyzovanou krev. Odběr provádějte 14 dní po vysazení léčby antibiotiky, uroseptiky, narkotiky. materiál sputum (min 1 ml) aspirát, hrudní punktát, výpotek výtěr ze spojivkového vaku výtěr z krku výtěr z uretry výtěr z cervixu výtěr z uretry výtěr z cervixu
vyšetření
odběrová souprava
transport
doba odezvy
Mycobacterium tuberculosis komplex
sterilní zkumavka
2 - 8ºC, 24 hodin
4 dny
Chlamydia trachomatis
odběrová souprava pro PCR
pokojová teplota, 24 hod.
4 dny
Human papilomavirus vysoké riziko
pokojová teplota, 24 hod.
4 dny
sérum
Hepatitis C virus (HCV)
2 - 8ºC, 24 hodin
4 dny
stolice
Clostridium difficile
odběrová souprava pro PCR zkumavka k odběru srážlivé krve
4 dny
Poznámka k době odezvy: Pokud je překročení doby odezvy kratší než dva dny, není vydána neshoda. Toto opatření přijímáme z důvodu přirozeného prodloužení doby vyšetření v laboratoři (např. opakované kultivace, víkendy, svátky, atd.)
Zpracoval : Mgr. Antonín Melichal ml. 1.6.2016
poznámka pacient nebyl léčen antituberkulotiky nebyl léčen posledních 60 dnů byl léčen méně než 7 dnů
vyšetření následuje po stanovení imunochromatickým testem, není jako samostatné vyšetření