Humán pathogén anaerob baktériumok Nemzeti Referencia Laboratóriuma Referencia tevékenység, hazai hálózati kapcsolatok, nemzetközi kötelezettségek
dr. Urbán Edit SZTE, ÁOK Klinikai Mikrobiológiai Diagnosztikai Intézet, Szeged A HAZAI NEMZETI REFERENCIA LABORATÓRIUMOK ELSŐ TALÁLKOZÓJA Budapest, 2011 február 24.
Beszámoló a „Humán pathogén anaerob baktériumok” Nemzeti Referencia Laboratóriuma tevékenységéről • Személyi feltételek: ▫ Vezetőjének neve: Dr. Urbán Edit ▫ Végzettsége, szakképesítése: - PharmD, klinikai laboratóriumi vizsgálatok szakgyógyszerész, gyógyszerészi mikrobiológia szakgyógyszerész ▫ Tudományos fokozata: Dr. med. habil, PhD ▫ e-mail címe:
[email protected] ▫ Munkatársak: 4 diplomás, 2 szakasszisztens
• A laboratórium a Szegedi Tudományegyetem, Általános Orvostudományi Kar, Klinikai Mikrobiológiai Diagnosztikai Intézethez tartozik • Postai címe: 6725 Szeged, Semmelweis u. 6.
Tárgyi feltételek • Inkubálás: ▫ Concept 400, Bug Box chamberek ▫ Gáz pakkok
• Izolálás: ▫ Fénymikroszkóp fáziskontraszt feltéttel ▫ Telepmikroszkóp
• Identifikálás: ▫ GLC Shimadzu ▫ ATB automata ▫ VITEK 2 automata
• Molekuláris diagnosztika: ▫ PCR készülékek: EPPENDORF Applied Biosystem Veriti OneStep RT PCR
▫ BD GeneOhm CDiff, Cepheid CD
• A referencia laboratóriumi témakörébe tartozó rutin vizsgálatok száma: ▫ 2008-ben: 11 098 ▫ 2009-ben: 11 982 ▫ 2010-ben: 13 302
• Alkalmazott módszerek: ▫ ▫ ▫ ▫ ▫
Szövet toxicitási teszt ATB, API, Vitek 2 E teszt, agar dilúció ELISA, ELFA RT-PCR, real-time PCR, ERIC-PCR, szekvenálás PCR-RFLP, PFGE, PCR ribotipizálás
• Hány megkeresés történt más laboratóriumok részéről referencia tevékenység végzésére: ▫ 2008: 685 (főleg C. difficile vizsgálatok) ▫ 2009: 632 (főleg C. difficile vizsgálatok) ▫ 2010: 1250
Akkreditálás • Akkreditált státusz megszerzésének időpontja: • 1. akkreditáció: 2004 • 2. reakkreditáció: 2008 ▫ A NAT által NAT-1-1254/2008 számon akkreditált laboratórium
Referencia anyagok • • • •
• • • • •
Clostridium perfringens ATCC 10543 Bacteroides fragilis ATCC 25285 Fusobacterium varium ATCC 27725 Peptoniphylus assacharolyticus ATCC 29743 Clostridium tertium ATCC 19405 Clostridium difficile VPI 10463 Bacteroides thetaiotaomicron ATCC 29742 Propionibacterium acnes ATCC 11828 Eggerthella lenta ATCC
• Nemzetközi Referencia laboratórium által igazolt különböző C. difficile ribotípusok/toxinotípusok • nimA-F géneket hordozó B. fragilis típustörzsek • bft 1-3 géneket hordozó B. fragilis típustörzsek metallo-béta laktamáz és cefalosporináz termelő Bacteroides/Parabacteroides törzsek • Különböző antibiotikum rezisztenciákban fontos szerepeket játszó IS elemeket hordozó törzsek • Acne-ban és különböző kórfolyamatokban szerepet játszó P. acnes törzsek (IA, IB, II, III)
Külső minőségellenőrzés • Milyen körkísérletekben vesz részt az adott területen: • Hazai: ▫ Qualicont : 1998 óta résztvevő ▫ OEK
• Nemzetközi: ▫ ECDIS study: Dr. Jon Brazier (ARU, Cardiff, UK) által az országos nemzeti referencia laboratóriumok számára szervezett körvizsgálatok ▫ NEQUAS
• Milyen hazai körkísérlet szervezésében vesz részt, vagy szervezett az adott területen: ▫ Qualicont: anaerob körkísérletek szervezője: évi 2 alkalom: 55-65 laboratórium ▫ Mikrobiológiai kiértékelő csoport ▫ Beszámoló: 13. Qualicont Fórum, Szeged, 2011. január 28.
Módszertan • Milyen országos érvényű módszertani irányelvet dolgoztak ki: ▫ C. difficile által okozott nozokómiális hasmenések diagnosztikájának protokollja ▫
▫ ▫
Nagy Erzsébet, Urbán Edit, Terhes Gabriella: Clostridium dificile által okozott hasmenés klinikai jelentősége, diagnosztikája, terápiája és megelőzése. Infektológia és Klinikai Mikrobiológia 14:7-12. (2007) Terhes Gabriella, Urbán Edit, Nagy Erzsébet: Új hypervirulens Clostridium difficile törzs megjelenése Európában. Infektológia és Klinikai Mikrobiológia. 14:13-22. (2007) Nagy E., Terhes G.: Javasolt infekciókontroll intézkedések a Clostridium difficile terjedésének megakadályozására. Infektológia és Klinikai Mikrobiológia 15: 48-60 (2008)
• Az országos Epidemiológiai Központ Módszertani levele a Clostridium difficile fertőzések megelőzésére (folyamatban)
Nemzetközi kapcsolatok Társaságok • Nemzetközi társaságok: • ASA: Anaerobe Society of the Americas • ESCMID: European Society of Clinical Microbiology and Infectious Diseases • ESGARAB: ESCMID Study Group for Antimicrobial Resistance in Anaerobic Bacteria • ESGCD: ESCMID Study Group for Clostridium difficile • ESGAI: ESCMID Study Group of Anaerobic Infections
▫ Elnöke 2011-től: Prof. Dr. Nagy Erzsébet
Nemzetközi kapcsolatok Intézetek • ARL (Anaerobe Reference Laboratory, Cardiff, UK): ▫ Val Hall, Jon Brazier, Prof. BI. Duerden
• Brueker Daltonik, Germany: ▫ M. Kostrzewa, T. Mayer
• Karolinska Institute, Sweden: ▫ Maria Hedberg, Prof. CE Nord
• Leiden University, NL: ▫ Ed Kujper
• Groningen University, NL: ▫ Prof. J. Degener
• Istituto Suoeriore di Sanita, IT: ▫ P. Spigaglia
• Hôpital Saint-Antoine, Paris, Fr: ▫ F. Barbout • Edinburgh University, Edinburgh, UK: ▫ Prof. Ian Poxton
• Wadsworth Laboratory, Santa Barbara, CA, USA: ▫ Diane Citron, E. Goldstein
• Kuwait: ▫ Prof. Rotimi O.V
• Anaerobe Systems, Morgan Hill, CA, USA: ▫ Mike Cox
• Arab Emirátusok: ▫ Prof. M. Conlon
• Törökország: ▫ Nurver Ulger Toprak
• Severo Ochoa’ Molecular Biology Centre, Spain: ▫ Prof. J. Ayala, SM. González
Nemzetközi kapcsolatok Felmérések-studyk • ESGARAB: Europe-wide antibiotic resistance studies in Bacteroides: European antibiotic susceptibility survey • Tigecyclin érzékenységi vizsgálat (anaerob baktériumok) TEST-study • European surveillance study on antimicrobial susceptibility of Grampositive anaerobic cocci (GPAC) • European surveillance study on the antibiotic susceptibility of Propionibacterium acnes • A European survey of diagnostic methods and testing protocols for Clostridium difficile • Prospective study of Clostridium difficile infections in Europe with phenotypic and genotypic characterisation of the isolate • In vitro activity of nadifloxacin against Gram-positive bacteria
Hazai kapcsolatok Országos
Helyi
• SZTE ÁOK:
• ▫ Szülészeti és Nőgyógyászati Klinika • ▫ Bőrgyógyászati- és Allergológiai Klinika ▫ Fül-Orr-Gégészeti és Fej-Nyaksebészeti • • Klinika ▫ ▫ ▫ ▫
Gyermekgyógyászati Klinika I. Belgy. Klinika Infektológia Ortopédiai Klinika Urológiai Klinika
• SZTE FOK: ▫ Parodontológiai Tanszék ▫ Fogpótlástani- és Orális Biológiai Tanszék
• SZTE GYTK: ▫ Gyógyszertechnológiai Intézet
• BayGen
• • • • •
OEK Anaerob Laboratórium ÁNTSZ Intézetei Laboratórium Kft. Laboratóriumai DEOEC Orvosi Mikrobiológiai Intézet SOTE Klinikai Mikrobiológiai Diagnosztikai Laboratórium Szt. László-Szt. István Laboratórium Hetényi Géza Kórház Mikrobiológiai Laboratóriuma Erzsébet Kórház, Hmvásárhely Dr. Lajos Zoltán
Pályázatok • 1997-2000 OTKA T023652 ▫ A biofilm képződés mechanizmusa és szerepe a nyálkahártyák normál flórájának fenntartásában és a krónikus gyulladásos folyamatában. (Tematikus pályázat)
• 2000-2003 ETT 579/2000 ▫ Szájüregi fertőzések lehetséges szerepe a koraszülésben.
• 2000-2003 OTKA T 032385 ▫ Molekuláris biológiai módszerek alkalmazása speciális. kórképekben szerepet játszó anaerob baktériumok pathogenitási tényezőinek vizsgálatára. (Tematikus pályázat)
• 2006-2008 ETT 434/2006 ▫ Titán implantátumok biointegrációját elősegítő fizikai-kémiai és biokémiai felületmódosítások in vivo és in vitro vizsgálata.
• 2007-2011 OTKA K-69044 ▫ Speciális kórfolyamatokban szerepet játszó anaerob kórokozók patogenitást befolyásoló virulencia faktorainak molekuláris biológiai vizsgálata. (Tematikus pályázat) • Spanyol-Magyar TÉT együttműködés • TÁMOP, műszerpályázat • Beadás alatt: 3 pályázat
Tudományos tevékenység • A humán patogén anaerob baktériumok egyes kórképekben betöltött patogén szerepének vizsgálata: ▫ A koraszülés és a periodontitis kapcsolata ▫ Periodontopatogén baktériumok kimutatása terhesek esetén hagyományos és molekuláris diagnosztikai módszerekkel: ▫ Anarob baktériumok patogenitási szerepének vizsgálata szájüregi tumorok esetében ▫ Biofilm képzés vizsgálata a fluoriddal kezelt titánium implantátumokon ▫ Intrauterin eszközök biofilm-flóra vizsgálata SEM és tenyésztéses módszerrel ▫ Anaerob baktériumok szerepe nőgyógyászati infekciókban (BV, PID...) ▫ Anaerob baktériumok szerepe a krónikus prostatitisben, a férfi infertilitásban ▫ Új gyógyszerformák farmakológiai, farmakodinámiai hatásának kipróbálása anaerob baktériumok által okozott infekciókban ▫ P. acnes humán keratinocytákra hatása, immunológiai vizsgálatok
• Clostridium difficile törzsek vizsgálata ▫ toxintermelés genetikai háttere, epidemiológiai: PCR ribotyping, antib É
• Bacteroides fragilis csoportba tartozó törzsek pathogenitási tényezőinek rezisztencia mehnizmusainak molekuláris vizsgálatai
Publikációs tevékenység 2008-2009 • Referált folyóiratban megjelent cikk: ▫ Magyar nyelvű: 4 ▫ Angol nyelvű: 11 (IF: 27,02)
• Előadás/poszter kivonat: ▫ Magyar nyelvű: 14 ▫ Angol nyelvű: 22
• Szakdolgozat, diplomamunka: 10
Konferenciák-külföldi • The 9th Biennal Congress of the Anaerobe Society of the Americas, Long Beach, California, USA, 2008 június 24-27.
▫ 4 poszter, 2 előadás • 18th European Congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, Barcelona, Spain, 2008 április 19-22.
▫ 2 poszter, 1 előadás • ESCMID, 19th European Congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, Helsinki, Finland, 2009 május 16-19.
▫ 5 poszter, 2 előadás • ESCMID, 20th European Congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, Bécs, Ausztria, 2010 április 10-13. ▫ 3 poszter, 1 előadás • The 10th Biennial Congress of the Anaerobe Society of the Americas, Philadelphia, Pennsylvania, USA, 2010 július 7-10. ▫ 4 poszter, 2 előadás
Konferenciák-hazai • • • • • • • • • •
CEFORM: 2nd Central European Forum for Microbiology MMT Kongresszus QualiCont Fórum MLDT Kongresszus Magyar Infektológiai és Klinikai Mikrobiológiai Társaság Kongresszusa Magyar Fül-, Orr-Gége és Fej-, Nyaksebész Orvosok Egyesülete 40. Jubileumi Kongresszusa Magyar STD Társaság Nagygyűlése Magyar Nőorvos Társaság XXIX. Nagygyűlése A Magyar Ortopéd társaság és a Magyar Traumatológus Társaság 2010 évi közös Kongresszusa 32nd Annual Congress of European Prosthodontic Association
Továbbképzések: tanfolyamok • XVIII. Anaerob tanfolyam 2010. • Egyéni továbbképzések • FRANK Diagnosztika II. Továbbképzés: „MIC érték meghatározás gradiens diffúziós módszerrel” • Role of Anaerobic Bacteria in Infections: Diagnostics, Antibiotic Resistance, New Therapy Options: ESCMID Postgraduate Technical Workshop, Groningen, NL, 2010. március 22-27. • ESCMID Postgraduate Education Anaerobic Course, Szeged, 2007. június 2-4.
Továbbképzések • SZTE GYTK: ▫ Gyógyszerész rezidensek Akkreditált Továbbképzése
• SZTE FOK: ▫ Akkreditált Továbbképzések: A Magyar Fogorvosok Egyesülete DélkeletMagyarországi Szakcsoportja Kötelezően választható-szintentartó tanfolyamok ▫ Szent-Györgyi Napok, Fogorvos-továbbképző Tanfolyam: Halitosis Szimpozium
• SZTE ÁOK Továbbképző Tanfolyamok: ▫ ▫ ▫ ▫ ▫
A klinikai mikrobiológiai diagnosztika aktuális kérdései Minőségirányítás a mikrobiológiai laboratóriumban Hagyományos és új módszerek a rutin klinikai mikrobiológiai diagnosztikában Hogyan értékeljük a laboratóriumi eredményeket? Szent-Györgyi Napok
• DEOEC • SOTE
Tudományos fokozatok • Akadémiai doktori értekezés: ▫ Nagy Erzsébet: Speciális kórfolyamatokat kiváltó anaerob baktériumok és diagnosztikájuk.
• PhD: ▫ Szőke Ildikó: Examination of pathogenic factors of anaerobic bacteria. ▫ Sóki József: Molecular biological investigation of cryptic plasmids and imipenem resistance of Hungarian clinical isolates of Bacteroides. ▫ Török László: Infekció okozta férfi infertilitás. ▫ Urbán Edit: Epidemiological investigation of toxin producing C. difficile and antibiotic resistant Bacteroides strains with the use of traditional and molecular biological methods. ▫ Terhes Gabriella: Investigation of some clinically important toxin-producing anaerobic bacteria and their epidemiology. ▫ Radnai Márta ▫ Pál Zoltán ▫ Novák Tibor ▫ Fehér András ▫ Folyamatban: Stájer Anett, Wellinger Károly
Utánpótlás nevelés Szakdolgozatok ▫ ▫ ▫ ▫ ▫ ▫ ▫ ▫ ▫ ▫ ▫ ▫ ▫ ▫ ▫ ▫ ▫
Bíró János (ÁOK) Terhes Gabriella (TTK) Rátkai Csilla (TTK) Tóth Melinda (TTK) Bessenyei Zsuzsanna (TTK) Dobó Katalin (GYTK) Nagy Ilona (TTK) Pordán Nikolett (TTK) Nagy Dénes (TTIK) Szúnyogh Ágota (ÁOK) Jónás Sándor (ÁOK) Zalai Zsolt (FOK) Horváth Andrea (FOK) Kőhalmi Helga (TTIK) Ungvári Nóra (TTIK) Redetzky Andrea (DEOEC) Magyar Mónika (DEOEC)
TDK ▫ ▫ ▫ ▫ ▫ ▫ ▫ ▫ ▫ ▫ ▫
Bíró János (ÁOK): I. helyezés Terhes Gabriella (TTK) I. helyezés Országos III. helyezés Nagy Dénes (TTIK) Szúnyogh Ágota (ÁOK) Jónás Sándor (ÁOK) Zalai Zsolt (FOK): I. helyezés Országos: különdíj
Díjak, elismerések Eötvös Ösztöndíj: 3 fő LAM díj 2009 Medicina Thoracalis Nívódíj 2010 ESCMID bioMérieux Award 2010 MIFKMT közlemény díj, fotópályázat díj
• Hány megkeresést kapott a laboratórium referencia vizsgálat végzésére? • Sajnos, a C. difficile törzsek toxintermelése vizsgálatain kívül meglehetősen kevés mintát kapunk, azokat is csak néhány, állandó partner laboratóriumtól. • Ritkán kapunk „furcsa”, szokatlan rezisztenciával rendelkező törzseket, illetve nem, vagy nehezen tipizálható törzseket. • Finanszírozási kérdéseket hogyan oldja meg a laboratórium? • Saját pályázatok
Köszönöm a figyelmet!!
