Rozvoj a posílení vzájemné spolupráce mezi akademickými i soukromými subjekty se zaměřením na chemický a farmaceutický výzkum reg. číslo: CZ.1.07/2.4.00/31.0130
Zpráva ze zahraniční odborné stáže Zahraniční odborná stáž byla realizována v rámci projektu ROZVOJ A POSÍLENÍ SPOLUPRÁCE MEZI AKADEMICKÝMI A SOUKROMÝMI SUBJEKTY SE ZAMĚŘENÍM NA CHEMICKÝ A FARMACEUTICKÝ VÝZKUM (CZ.1.07/2.4.00/31.0130). Účel cesty:
Vědecká stáž na University of Alabama at Birmingham
Účastník:
Vojtěch Franc
Doba trvání cesty:
16. 6. – 13. 12. 2013; 178 nocí v Birminghamu
Místo:
Birmingham (USA)
Jméno zahraničního profesora: Výsledky spolupráce: Ve dnech 16. 6.
–
13.
Prof. Jan Novak, Ph. D.
12.
2013
jsem
v
rámci
projektu
ChemPharmNet
(CZ.1.07/2.4.00/31.0130) vycestoval na zahraniční stáž do Birminghamu, USA, na pracoviště Department of Microbiology at University of Alabama at Birmingham (Katedra Mikrobiologie Univerzity v Alabamě v Birminghamu). Účelem pobytu byla vědecká stáž, během které jsem pokračoval v experimentální práci týkající se tématu mé doktorské práce. Během stáže jsem se věnoval vývoji metody pro analýzu glykosylace imunoglobulinu A a G (IgA a IgG). Imunoglobuliny jsou glykoproteiny, které jsou součástí imunitního systému. Abnormální glykosylace IgA a IgG je spojována s patogenezí různých nemocí jako je IgA nefropatie, revmatoidní artritida nebo rakovina. Studium změn glykosylačních profilů imunoglobulinů izolovaných z rozdílných buněčných linií může proto poskytnout velmi důležité informace o fyziologii těchto molekul a hlubší porozumění některých chorob na molekulární úrovni. Jednou z nejpoužívanějších metod pro analýzu proteinů je hmotnostní spektrometrie, která by ovšem sama o sobě nebyla natolik efektivní a úspěšná, pokud by se nekombinovala se separačními a frakcionačními metodami jako jsou elektroforéza a kapalinová chromatografie. Vzorek glykoproteinu se zpravidla vyznačuje tzv. heterogenitou, což znamená, že je populací molekul čítající i desítky různých isoforem, které se navzájem liší pozicí glykanu, jeho strukturou nebo obojím. To dělá z analýzy glykoproteinů pomocí Tento projekt je spolufinancován Evropským sociálním fondem a státním rozpočtem České republiky.
Rozvoj a posílení vzájemné spolupráce mezi akademickými i soukromými subjekty se zaměřením na chemický a farmaceutický výzkum reg. číslo: CZ.1.07/2.4.00/31.0130
hmotnostní spektrometrie velmi složitý a náročný úkol a to nejen z pohledu získání dat, ale i jejich následné interpretace. Experimentální práce zahrnovala optimalizaci přípravy vzorků IgA a IgG pro jejich hmotnostně spektrometrickou analýzu. Po štěpení IgA a IgG trypsinem byly připravené peptidové směsi separovány kapalinovou chromatografií a analyzovány pomocí tandemové hmotnostní spektrometrie. Následná interpretace hmotnostních spekter poskytla hodnotné informace o struktuře studovaných glykopeptidů a heterogenitě vzorku IgA a IgG izolovaných z různých buněčných linií. Stáž byla ukončena diskuzí s odbornými pracovníky institutu. Získaná data byla publikována v odborném časopise a prezentována na dvou vědeckých konferencích. Zároveň budou použita k plánování dalších experimentů a vytváření hypotéz, které v budoucnu povedou k nalezení nových biomarkerů, vývoji diagnostických metod a cílené léčbě některých nemocí. Výstupem stáže je odborný článek v impaktovaném časopise. Citace: Franc V, Řehulka P, Raus M., Stulík J, Novak J., Renfrow MB, Šebela M (2013) Elucidating heterogeneity of IgA1 hinge-region O-glycosylation by use of MALDI-TOF/TOF mass spectrometry: Role of cysteine alkylation during sample processing. J. Proteomics 92 299-312; doi: 10.1016/j.jprot.2013.07.013. Dále dva příspěvky na vědeckých konferencích ve formě posteru: 1) Protocol optimization for analysis of changes in N-glycosylation profiles of immunoglobulins from different sources by using separation techniques and mass spectrometry. 22nd Annual Microbiology Research Retreat October 18-20, 2013, University at Birmingham, The Alabama 4-Center, Columbiana , USA; poster by V. Franc. 2) Analysis of changes in N-glycosylation profiles of monomeric and polymeric immunoglobulin A1 by using separation techniques and mass spectrometry. Glycoimmunobiology 2013, November 22, 2013, University at Birmingham , The Edge of Chaos, Lister Hill Library, Birmingham, USA; poster by V. Franc. Příloha: fotodokumentace
Tento projekt je spolufinancován Evropským sociálním fondem a státním rozpočtem České republiky.
Rozvoj a posílení vzájemné spolupráce mezi akademickými i soukromými subjekty se zaměřením na chemický a farmaceutický výzkum reg. číslo: CZ.1.07/2.4.00/31.0130
Tento projekt je spolufinancován Evropským sociálním fondem a státním rozpočtem České republiky.
Rozvoj a posílení vzájemné spolupráce mezi akademickými i soukromými subjekty se zaměřením na chemický a farmaceutický výzkum reg. číslo: CZ.1.07/2.4.00/31.0130
Tento projekt je spolufinancován Evropským sociálním fondem a státním rozpočtem České republiky.
Rozvoj a posílení vzájemné spolupráce mezi akademickými i soukromými subjekty se zaměřením na chemický a farmaceutický výzkum reg. číslo: CZ.1.07/2.4.00/31.0130
Tento projekt je spolufinancován Evropským sociálním fondem a státním rozpočtem České republiky.
Rozvoj a posílení vzájemné spolupráce mezi akademickými i soukromými subjekty se zaměřením na chemický a farmaceutický výzkum reg. číslo: CZ.1.07/2.4.00/31.0130
Tento projekt je spolufinancován Evropským sociálním fondem a státním rozpočtem České republiky.
Rozvoj a posílení vzájemné spolupráce mezi akademickými i soukromými subjekty se zaměřením na chemický a farmaceutický výzkum reg. číslo: CZ.1.07/2.4.00/31.0130
Tento projekt je spolufinancován Evropským sociálním fondem a státním rozpočtem České republiky.
Rozvoj a posílení vzájemné spolupráce mezi akademickými i soukromými subjekty se zaměřením na chemický a farmaceutický výzkum reg. číslo: CZ.1.07/2.4.00/31.0130
V Olomouci dne 6.1.2014
Vojtěch
Franc
Tento projekt je spolufinancován Evropským sociálním fondem a státním rozpočtem České republiky.
Příloha č. 1
Tento projekt je spolufinancován Evropským sociálním fondem a státním rozpočtem České republiky.
