DAFTAR PUSTAKA Almatsier S. 2002. Prinsip Dasar Ilmu Gizi. Jakarta : Gramedia Pustaka. Ammon SJF, Osheroff N. 1995. Topoisomerase poisons: harnessing the dark side of enzyme mechanism. J Biol Chem. 270(37) : 21429-21432. Andreas C, Mehta R, Runyan C, Rao K, Vaughan A, Moo R. 1995. Flavonoids as DNA topoisomerase antagonist and poison: structure activity relationship. J. Nat. Product 58: 217-225. Anonim, 2003. Amino Gold. http://www.sportindo.com/index.php?sportindosid.htm [8 Juli 2007]. Anonim. 2004. Asam Amino [14 Juni 2004] http://www.news-lama.php.htm. [3 Juli 2007]. Anonim. 2006. Semua berita tentang kanker : kanker. http://centrin.net.id/~rdpnet/index-10-kanker.htm [4 Januari 2007]. [AOAC] Association of the Official Analytical Chemist. 1995. Official Methods on Analysis. Washington DC, USA: Benjamin Franklin. hlm: 1148. Apriyantono AD, Fardiaz D, Puspitasari NL, Sedarnawati, Budiyanto S. 1989. Analisis Pangan. Bogor: Pusat Antar Universitas Pangan dan Gizi, Institut Pertanian Bogor. Ausebel MF, Roger B, Robert EK, David DM, John GS, Smith JA, Kevin S. 1990. Curret protocols in molecular biology. Volume 1. New York: John Wiley & Sons. Bhakuni DS, awat DS. 2005. Bioaktive Marine Natural Product. New Delhi: Anamaya Publisher. Belitz HD, Grosch W. 1999. Food Chemistry. Heidelberg Berlin: Springer. Bernik BRG, Jimeno J. 2001. Depsipeptid (NSC 630176). J. Angiogenesis 26: 26-33. Bintang M. 1999. Penuntun Praktikum Antibiotik. Bogor: Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam, Institut Pertanian Bogor. Bruneton J. 1993. Pharmacognosy, Phytochemstry, Medicinal Plants. Paris: Lavoiser Publishing. Cyber Lipid Center [CBD]. Fat and Oil: Sterols. http://www.cyberlipid.org/accueil.htm [23 Nopember 2007]. Dalimartha S. 1999. Ramuan Tradisional untuk Pengobatan Kanker. Jakarta: Penebar Swadaya. Darusman LK, Sajuthi D, Komar, Pamungkas. 1995. Naskah seminar: Ekstraksi komponen bioaktif sebagai obat dari kerang-kerangan. Bunga karang dan ganggang laut di Perairan Pulau Pari Kepulauan Seribu. Buletin Kimia. Bogor: FMIPA, Institut Pertanian Bogor.
55
Davlin TM. 1993. The Text Book of Biochemistry. With Clinical Correlation. Third edition. New York: John Wiley & Sons Dence JB. 1980. Steroids and Peptides. New York: John Wiley & Sons. De Riccardis F, Iorizzi M, Minale L, Riccio R. 1992. The first occurrence of polyhydroxylated steroids with phosphate conjugation from the starfish tremaster novaecaledoniae. Tetrahedron Lett. 33: 1097-1100. Dewick PM. 2001. Medicinal Natural Products A Biosynthetic Approach. 2nd edition. New York: John Wiley & Sons. Effendi YH. 2002. Pengantar Gizi Kesehatan. Bogor: Fakultas Pertanian, Institut Pertanian Bogor. Evans WC. 2002. Trease and Evans Pharmacognosy. 15th Edition. London: Saunders. FAO/WHO. 1991. Protein Quality Evaluation. Report of Joint FAO/WHO expert consultation. FAO. Food and Nutr. Faulkner DJ. 2000. Marine pharmacology. Antonie van Leeuwenhoek 77: 135145. Facompre M, Tardy C, Bal-Mahieu C, Colson P, Perez C, Manzanares I, Cuevas C, Bailly C. 2003. Lamellarin D : A novel potent inhibitor of topoisomerase I. Cancer Res. 63: 7392-7399. Fahy E, Subramaniam S, Brown HA. 2005. A comprehensive classification system for lipids. J. Lipid Res. 46 (5): 839–861. Garcia R, Cayunao C, Bocic R, Backhouse N, Delporte C, Zaldivar M, Erazo S. 2004. Antimicrobial activity of Isopteropodine. Z. Naturforsch. 60c : 385388. Girindra A. 1993. Biokimia I. Jakarta: Gramedia Pustaka Utama. Goad LJ. 1978. Sterol dari invertebrata lautan: Komposisi, biosintesis dan metabolit. Di dalam Scheuer PJ (ed). Produk Alami Lautan: Dari Segi Kimiawi dan Biologi. Koensoemardiyah, penerjemah. Jilid II. New York: Academic Press. Hao D, Hammond LA, Eckhardt SG, Patnaik A, Takimoto CH, Schwartz GH, Goetz AD, Tolcher AW, McCreery HA, Mamun K, Williams JI, Holroyd KJ, Rowinsky EK. 2003. A Phase I and pharmacokinetic study of squalamine, an aminosterol angiogenesis inhibitor. Clin. Cancer Res. 9(7):2465-71. Harborne JB. 1987. Metode Fitokimia Penuntun Cara Modern Menganalisis Tumbuhan. Padmawinata K, penerjemah. Edisi Kedua. Bandung: Institut Teknologi Bandung. Terjemahan dari: Phytochemical Methods. Harli M. 2003. Kerang dan udang aman bagi pembuluh darah. MMA-IPB.
[email protected].
56
Hengstler JG, Heimerdinger CK, Schiffer IB, Gebhard S, Sagemuller J, Tanner B, Bolt HM, Oesch F. 2002. Dietary topoisomerase II-poisons: contribution of soy products to infant leukemia. EXCLI Journal 1: 8-14. Heryani H. 2002. Kajian fraksi aktif dan formulasi tabat barito (Ficus deltoida jack) sebagai anti mikroorganisme klinis [disertasi]. Bogor: Sekolah Pascasarjana, Institut Pertanian Bogor. Hostettmann K, Wolfender JL, Rodrigue. 1997. Rapid detection and subsequent isolation of bioactive constituens of crude plant extract. J. Planta Med. 6: 2-10. Houngton PJ, Raman A. 1998. Laboratory Handbook for the Fractination of Natural Extracts. London: Thomson Sci. Hsiang YH. 1989. Arrest of replication fork by drug-stabilized topoisomerase I DNA cleavable complexes as a mechanism of cell killing by camptothecin. Cancer Res. 49: 5077-5082. Jusuf M. 2001. Genetika I: Struktur dan Ekspressi Gen. Bogor : Institut Pertanian Bogor. Joseph MC. 1989. Protein-linked DNA strand breaks induced in mammalian cells by camptothecan inhibitor of topoisomerase I. Cancer Res. 52: 525532. Kanazawa A. 2001. Sterols in marine invertebrates. Review article. Fisheries Sci. 67: 997-1007. Kawashima H, Ohnisi M, Negishi Y, Amano M, Kinoshita M. 2007. Sterol composition in muscle and viscera of the marine bivalve Megangulus zynonensis from coastal waters oh Hokkaido, Nortehern Japan. J. Oleo Sci. 56 (5): 231-235. Ketaren S. 1987. Pengantar Teknologi Minyak dan Lemak Pangan. Jakarta: Universitas Indonesia Press. Khopkar SM. 1990. Konsep Dasar Kimia Analitik. Terjemahan Saptohardjo A. Jakarta: Universitas Indonesia Pres. Laus G, Keplinger D. 1994. Separation of stereoisomeric oxindole alkaloids from Uncaria tomentosa by high performance liquid chromatography. J. Chromatography. 662: 243-249. Lee KK, Zhou BN, Kingston DGI, Vaisberg AJ, Hammond GB. 1999. Bioactive indole alkaloids from the bark of Uncaria guianensis. Planta Med. 65: 759760. Lehninger AL. 1997. Dasar-dasar Biokimia. Thenawijaya M, penerjemah. Jakarta: Erlangga. Terjemahan dari: Principles of Biochemistry. Litwack G, Schmidt TJ. 2002. Biochemistry of hormones II: steroid hormones. Di dalam Devlin TM (ed). Texbook of Biochemistry, with Clinical Correlations. 5th edition. New York: John Wiley & Sons.
57
Martin GE, Sanduja R, Alam M. 1986. Isolation of isopteropodine from the marine mollusk Nerita albicilla: establishment of the structure via two dimensional NMR techniques. J. Nat. Product. 49: 406–411. Matsuura K, Sumadiharga OK, Tsukamoto K. 2000. Fiel guide to Lombok Island : identification guide to marine organisms in seagrass beds of Lombok Island, Indonesia. Tokyo : Ocean Research Institute, University of Tokyo. Moore KS, Wehrli S, Roder H, Rogers M, Forrest J, Mccrimmon D, Zasloff M. 1993. Squalamine: An aminosterol antibiotic from the shark. Proc. Natl. Acad. Sci. 90: 1354-1358. Muladno. 2002. Seputar Teknologi Rekayasa Genetika. Bogor: Pustaka Wirausaha Muda, 123 hal. Mulyadi. 1997. Kanker Karsinogen, Karsinogenesis dan Antikanker. Yogyakarta : Tiara Wacana. Mycek MJ, Harvey RA, Champe PC. 2000. Lippincott’s illustrated reviews. Pharmacology second edition. Anticancer drugs. Philadelpia: Lippincott, Williams & Wilkins. Nasoetion A, Riyadi H, Mudjajanto ES. 1994. Dasar-dasar Ilmu Gizi. Jakarta: Direktorat Jenderal Pendidikan Dasar dan Menengah, Departemen Pendidikan dan Kebudayaan. Nur MA, Adijuwana H. 1989. Teknik Pemisahan dalam Analisis Biologis. Bogor : Pusat Antar Universitas Ilmu Hayat, Institut Pertanian Bogor. Pelletier SW. 1983. The nature and defenition of an alkaloid. In: Pelletier SW (ed). 1983. Alkaloids, Chemical and Biological Perspectives. New York: John Wiley & Sons. Poedjiadi A, Supriyanti FMT. 2006. Dasar-dasar Biokimia. Jakarta: Universitas Indonesia. Pommier Y. 1993. DNA topoisomerase I and II in cancer chemotherapy : update and prospective. Cancer Chemotherapy Pharmacol. 32 (2): 103-108. Putri NE. 2004. Inhibisi fraksi aktif biji mahoni pada pertumbuhan Saccharomyces cerevisiae sebagai uji antikanker [skripsi]. Bogor : Program Studi Kimia, Faklutas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam, Institut Pertanian Bogor. Purwaningsih S. 2007. Aktivitas antiproliferasi keong matah merah (Cerithidea obtusa) pada sel lestari tumor secara in vitro dan in vivo [disertasi]. Bogor: Sekolah Pascasarjana, Institut Pertanian Bogor. Riana A. 2000. Nutrisi. http://www.asiamaya.com/nutrients/.[16 Juli 2007]. Riccio R, Auria MVD, Minale L. 1993. Polyoxygenated Steroids of Marine Origin. Chem. Rev. 93: 1839-1895 Rivory LP. 2002. Experimental and clinical pharmacology : New drugs for colorectal cancer mechanisms of action. Aust. Prescriber 25(5): 108-110.
58
Robinson T. 1995. Kandungan Kimia Organik Tumbuhan Tinggi. Padmawinata K, penerjemah. Edisi Keenam. Bandung: Institut Teknologi Bandung. Terjemahan dari: The Organic Constituents of Higher Plants. Rosmiati, Emma S. 2000. Isolasi, identifikasi dan pengaruh senyawa bioaktif spons (Callyspongia pseudoreticula) terhadap bakteri patogen dari udang. Jurnal Bioteknologi Pertanian; 6 (1). Sabel W, Warren JDF. 1973. Theory and Practices of Oleoresin Extraction on Proceding at The Conference on Species. London: Tropical Product Institut. Sakai S. 1995. Chemical studies of indole alkaloids. Yakugaku Zassh. 115: 351369. Sanduja R, Weinheimer AJ, Euler KL, Alam M. 1985. Unusual occurrence of fulvoplumierin, an antibacterial pigment, in the marine mollusk Nerita albicilla. Texas : Department of Medical Chemistry and Pharmacognosy, University of Houston. Siswandono, Soekardjo. 1995. Kimia Medisinal. Surabaya: Universitas Airlangga. Sufness M, Pezzuto JM. 1991. Assays related to cancer drugs discovery . Di dalam Dey PM, Harborn JB (ed). Methods in Plant Biochemistry. Vol. 6. London: Academic Press. Sukardiman, Poerwono H, Mubarika S, Sismindari. 2002. Skrining aktivitas antikanker fraksi n-heksana, etil asetat, n-butanol dari ekstrak metanol benalu teh (Scurula arthopurpurea) dengan molekul target enzim DNA topoisomerase. Majalah Farmasi Airlangga 2: 72-75. Supari SF. 2007. The 2nd annual national cancer symposium. www.tabloidnova.com/articles.asp.htm. [22 Juli 2007]. Suradikusumah E. 1989. Kimia Tumbuhan. Bogor: Pusat Antar Universitas Ilmu Hayat, Institut Pertanian Bogor. Suryandri S. 1981. Pengambilan Oleoresin dengan Cara Solvents Extraction. Bogor: Balai Penelitian Industri Hasil Pertanian. Sutaryadi. 1991. Dari Jamu Menjadi Obat Tradisional Menuju Ke Fitofarmaka. Surabaya: Laboratorium Botani Farmasi Farmakologi, Fakultas Farmasi Universitas Airlangga. hlm. 26-28. [TopoGEN] TopoGen. 2006. Manual for topoisomerase drug screening kit. http://www.topogen.com/html [28 Nopember 2006]. Webb MR, Ebeler SE. 2004. Comparative analysis of topoisomerase IB inhibition and DNA intercalation by flavonoids and similar compounds: structural determinates of activity. J. Biochem. 384: 527-541. White JA, Hart RA. 1992. HPLC analysis of amino acids. Dalam: Nollet LML (ed). Food Analysis by HPLC. New York: Marcell Dekker. Wilson B. 1993. Australian Marine Shells. Odssey publishing 4 Saint lives loop Kallaroo Western Australia: Vol I : 408 hal.
59
Winarno FG. 1995. Minyak Goreng dalam Menu Masyarakat. Jakarta: Gramedia Pustaka. Winarno FG. 1997. Kimia Pangan dan Gizi. Jakarta: Gramedia Pustaka Utama. Witjaksono HT. 2005. Komposisi kimia ekstrak dan minyak dari lintah laut (Discodoris boholensis) [tesis]. Bogor: Sekolah Pascasarjana, Institut Pertanian Bogor. Yanagihara M, Sasaki NT, Sugahara T, Yamamoto S, Shinomi M, Yamashita I, Hayashida M, Yamanoha B, Numata A, Yamori Y, Andoh T. 2005. Leptosins isolated from marine fungus Leptoshaeria species inhibited DNA topoisomerases I and/or II induced apoptopsis by inactivated Akt/protein kinase B. J. Cancer Sci. 96(11) : 816-824. Zahir A. 1996. DNA topoisomerase I inhibitors : cytotoxic flavones from Lethedon tannaensis. J. Nat. Product. 59: 701-703.
LAMPIRAN
60
Lampiran 1. Road map penelitian penapisan dan uji aktivitas inhibitor topoisomerase I dari Kablang ( Nerita albicilla) Siput Laut Nerita sp
Nerita albicilla Sanduja et al. (1985) Pigmen antibakteri fulvoplumierin
- Analisis proksimat (air, abu, protein, lemak, karbohidrat) - Asam amino - Asam lemak
Nerita albicilla Martin et al. (1986) Senyawa Isopteroprodine
Ekstraksi dengan 3 pelarut organik dengan tingkat kepolaran berbeda. (Heksan, etil asetat, methanol)
Ekstrak kasar
Uji inhibitor Topoisomerase
Ekstrak aktif
Karakterisasi ekstrak aktif - Uji Ninhidrin - Uji Molish - Uji Burchard - Uji Bradford
Fraksinasi senyawa ekstrak aktif
Uji aktivitas fraksi aktif inhibitor topoisomerase
Isolasi dan identifikasi senyawa aktif
Siput laut (Nerita sp) Dani Royani, 2006 aktivitas inhibitor topoisomerase
61
Lampiran 2 Contoh perhitungan rendemen ekstrak Kablang (Nerita albicilla)
Ekstrak Heksana
Berat awal sampel (g) 50,060
Berat ekstrak kasar (g) 1,025
% rendemen (w/w) 2,05
Etil asetat
50,060
0,780
1,56
Metanol
50,060
3,495
6,99
Rendemen ekstrak =
Berat ekstrak ( g ) x 100 % Berat sampel awal ( g )
Rendemen ekstrak heksana (%) =
1,025 g x 100 % = 2,05 % 50,060 g
Rendemen ekstrak etil asetat (%) =
0,780 g x 100 % = 1,56 % 50,060 g
Rendemen ekstrak metanol (%) =
3,495 g x 100 % = 6,99 % 50,060 g
62
Lampiran 3. Contoh perhitungan asam amino Kablang (Nerita albicilla) Untuk menghitung asam amino lisin pada contoh, tinggi puncak kromatogram asam amino lisin = 4,55 cm dan pada standar = 7,08 cm, BM lisin = 146,2 Lisin = 7,81 cm x 0,250 μmol / ml x 3 ml x 4 x 146,2 x 10 −6 x 100% 13,3 cm 10 x 10 −3 g = 2,8 % Kemudian satuan kadar asam amino diubah ke dalam mg/g protein dengan rumus: 100 mg/g protein =
x % asam amino x 10 Kadar protein 100
mg/g protein =
x 2,8% x 10 = 44,8 62,05
As. Amino Aspartat Glutamat Serin Glisin Histidin Arginin Treonin Alanin Prolin Tirosin Valin Metionin Sistin Isoleusin Leusin Fenilalanin Lisin
Bobot Molekul asam amino (µg/µ mol) 133,1 147,3 105 75 155,1 174,2 119,1 89 115,1 181,1 117,1 149,2 120,1 131 131,1 165,1 146,2
63
Lampiran 4. Kurva standar analisis asam amino
No.
Asam amino
1 Aspartat 2 Glutamat 3 Serin 5 Glisin 6 Histidin 7 Arginin 8 Treonin 9 Alanin 10 Prolin 11 Tirosin 12 Valin 13 Metionin 14 Sistin 15 Isoleusin 16 Leusin 17 Fenilalanin 18 Lisin TOTAL PEAK RET :
Retention Time 1,14 1,66 2,81 4,46 5,30 6,22 6,92 7,50 8,48 9,42 10,26 11,19 11,63 12,79 13,75 14,94 16,59
AREA
CONC
291826 259662 458789 303191 420738 396565 371543 440682 414414 416426 543065 371238 385453 282701 467231 568627 489076 6881227 5000
4,241 3,773 6,667 4,406 6,114 5,763 5,399 6,404 6,022 6,052 7,891 5,395 5,602 4,103 6,791 8,263 7,107 100,000
64
Lampiran 5. Hasil analisis asam amino dari sampel Kablang (Nerita albicilla)
NO.
Asam amino Aspartat Glutamat Serin Glisin Histidin Arginin Treonin Alanin Prolin Tirosin Valin Metionin Sistin Isoleusin Leusin Fenilalanin Lisin
2 3 6 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 22 24 TOTAL PEAK RET :
Retention Time 1,15 1,59 2,90 4,38 5,33 6,33 7,00 7,55 8,48 9,44 10,36 11,27 11,70 12,70 13,76 14,91 16,47
AREA 130525 179748 53444 107765 58998 50236 99791 127571 68941 72355 156285 68835 45076 116623 163711 89563 128250 1779739 5000
CONC 7,334 10,100 3,003 6,055 3,315 2,823 5,607 7,168 3,874 4,065 8,781 3,868 2,533 6,553 9,199 5,032 7,206 100,000
65
Lampiran 6 Pereaksi untuk uji aktivitas inhibitor topoisomerase I
Tambahkan bahan-bahan berikut ke dalam tabung ependorf dengan berurutan : H2O = hingga volume reaksi 20 µl, 10x TGS (Tris glysine SDS) buffer = 2 µl Supercoiled DNA (250 ng/µl) = 1 µl Sampel ekstrak = bervariasi, 1-2 µl Enzim topoisomerase I. = 2 µl (4 unit) Selain reaksi dengan sampel, reaksi-reaksi yang disertakan yang berfungsi sebagai kontrol.: Kontrol 1
: :
Kontrol 2
: :
Kontrol 3
: :
Kontrol 4 Kontrol 5
: :
:
H2O (13 µl), buffer TGS (2 µl),DNA superkoil (1 µl), enzim topoisomerase I (1 µl) untuk menunjukkan aktifitas enzim, dimana akan terjadi relaksasi DNA H2O (15 µl), buffer TGS (2 µl), Marker DNA superkoil (1 µl), pelarut sampel (DMSO 10%) (2 µl) Untuk menunjukkan bahwa pelarut tidak mempengaruhi mobilitas DNA H2O (13 µl), buffer TGS (2 µl), DNA superkoil (1 µl), pelarut sampel (DMSO 10%) (2 µl), enzim topoisomerase I (2 µl) Untuk menunjukkan bahwa pelarut tidak mempengaruhi aktifitas enzim H2O (16 µl), buffer TGS (2 µl), DNA relaks marker (2 µl). H2O (11 µl), buffer TGS (2 µl), DNA superkoil (1 µl), camptothecin (larutkan stok dalam 10% DMSO hingga 1 mM – gunakan 1/10 volume dalam reaksi) (4 µl), enzim topoisomerase I (2 µl). Untuk mendeteksi cleavage complexes
