UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI
26.11.2014
D - PŘEDMĚTY - AKREDITAČNÍ SESTAVA 2014/15
Předměty studijního programu Fakulta:
PRF
Akad.rok:
2014
N1407-Chemie
Obor:
1403T001-Analytická chemie
Specializace:
01
Aprobace:
99
Typ studia:
Navazující
Forma studia:
Prezenční
Interní forma:
Není
Interní specifikace:
Není
Etapa:
1
Verze:
A
1 / 93
UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI
26.11.2014
2 / 93
PŘEDMĚTY - AKREDITAČNÍ SESTAVA 2014/15
ACH/APCH
Aplikovaná analytická chemie Applied Analytical Chemistry
Statut:
Povinný
Počet kreditů:
4
Forma výuky:
Přednáška
Rozsah výuky:
4 HOD/TYD
Ukončení:
Zkouška
Garant:
Doc. RNDr. Petr Bednář, Ph.D.
Obsah: Normotvorná činnost, normy jakosti a normou předepsané analytické postupy. Hierarchie norem - ISO, ČSN. Zásady správné laboratorní praxe. Akreditace postupů a laboratoří. Mezilaboratorní kontrola, kruhové testy, mezinárodní spolupráce. Správný odběr vzorků, úprava a příprava k analýze, strategie volby postupu (izolace, potlačení maticových efektů, zakoncentrování, volba měřící a detekční metody). Analýza potravin. Makro a mikro komponenty, Anorganické složky potravin, stanovení makro a mikroelementů. Stanovení vody a oxidu uhličitého. Stanovení bílkovin, vázaných a volných aminokyselin, ostatních dusíkatých složek. Stanovení lipidů, jejich dělení, kontrola stárnutí a nutriční kvality. Izolace, důkaz a stanovení monosacharidů, oligosacharidů a polysacharidů. Důkaz a stanovení antioxidantů a konzervačních prostředků. Izolace, identifikace a stanovení nežádoucích komponent v potravinách - rezidua pesticidů, toxiny.Analýza soudní. Vstup toxických látek do organizmu a jejich metabolizmus. Anorganické toxické látky a jejich stanovení. Otrava oxidem uhelnatým, chronické otravy některými kationty. Stanovení alkoholu a dalších těkavých organických toxikantů v organizmu. Stanovení extrahovatelných jedů a medikamentů. Klasické a moderní extrakční postupy. Chromatografie a elektroforéza v soudní analýze.Analýza makromolekul a polymerů. Technické hodnocení a identifikace polymerů. Obecné barevné reakce. Klasifikační reakce. Fyzikální konstanty vhodné pro identifikaci, posouzení krystalinity a mikrostruktury polymerů. Speciální techniky v analýze makromolekul (diferenciální enthalpimetrie, inverzní chromatografie, optické metody). Střední molekulová hmotnost a distribuce hmotností - techniky měření.Analýza ropy a produktů petrochemického průmyslu. Odběr vzorků. Měření fyzikálních parametrů. techniky ke zjištění základních komponent (aromatické podíly, nasycené, nenasycené, lineární rozvětvené uhlovodíky). Stanovení nežádoucích komponent (síra, anorganické složky). GC v analýze ropných materiálů.Analýza pomocných látek a jejich rozdělení. Důležité skupiny (plastifikátory, antioxidanty, akcelerátory, antistatické prostředky, katalyzátory, tenzidy). Izolace, dělení identifikace a stanovení tenzidů ve vodách a jiných ekosystémech.Analýza hornin, rud, nekovových materiálů. Rozklad hornin. Stanovení základních složek. Fázová analýza. Analýza půdy, stanovení živin a organických složek. Huminové látky a kyselin. analýza průmyslových hnojiv.Analýza slitin. Železné slitiny, oceli. Rozbor uhlíkových ocelí, legovaných ocelí a ferroslitin. Slitiny barevných kovů, lehkých kovů a vzácných kovů. Literatura: Vačková M., Smirnová L.: Aplikovaná analytická chémia. UK Bratislava 1983. Davídek J.: Laboratorní příručka analýzy potravin, SNTL Praha 1985. König H.: Analyse von tenziden, Springer Verlag, Berlin 1971. Drobník J. a kol.: Mezinárodní pravidla pro práci v chemických a biologických laboratořích. UK Karolinum, 1995. . 10. Pearson D., Laboratory Techniques in Food Analysis, London Butterworths, London 1973. 11. Hart F.L., Hisher H.J., Modern Food Analysis, Springer-Verlag, New York
UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI
26.11.2014
3 / 93
PŘEDMĚTY - AKREDITAČNÍ SESTAVA 2014/15
1971. 12. Wohler F., Handbookof Mineral Analysis, Henry Carey Baird, Industrial Publisher, Philadelphia 1871. 13. Girard J.E., Principles of Environmental Chemistry, Jones and Bartlett Publishers, Sudbury 2005. 14. Belcher R., Submicro Methods of Organic Analysis, Elsevier, Amsterdam 1966. 15. Beamish F.E. The Analytical Chemistry of the Noble Metals, Pergamon Press, Oxford 1966. 2. Holzbecher Z., Churáček J., Analytická Chemie, SNTL, Praha 1987. 3. Davídek J.: Laboratorní příručka analýzy potravin, SNTL Praha 1977 a 1985. 4. Pearson D., Laboratory Techniques in Food Analysis, London Butterworths, London 1973. 5. Hart F.L., Hisher H.J., Modern Food Analysis, Springer-Verlag, New York 1971. Wohler F., Handbookof Mineral Analysis, Henry Carey Baird, Industrial Publisher, Philadelphia 1871. 6. Girard J.E., Principles of Environmental Chemistry, Jones and Bartlett Publishers, Sudbury 2005. 7. Belcher R., Submicro Methods of Organic Analysis, Elsevier, Amsterdam 1966. 8. Beamish F.E. The Analytical Chemistry of the Noble Metals, Pergamon Press, Oxford 1966. 9. Mermet J.M., Otto M., Widmer H.M., Analytical Chemistry, Wiley-VCH, Weinheim 1998.
ACH/APCHC
Cvičení z aplikované analytické chemie Practicals in Applied Analytical Chemistry
Statut:
Povinný
Počet kreditů:
3
Forma výuky:
Cvičení
Rozsah výuky:
3 HOD/TYD
Ukončení:
Zápočet
Garant:
Doc. RNDr. Petr Bednář, Ph.D.
Obsah: Stanovení konzervačních látek v nápojích (HPLC, CE)Identifikace neznámého polymeru (elementární analýza, roztoková analýza, IR)Částečný rozbor vápence (gravimetrie, volumetrie, AAS)Určení základních parametrů půdy (volumetrie, ISE, plamenová fotometrie, AAS) Stanovení Cu a Ni v oceli (rozklad na mokré cestě, voltametrické techniky)Stanovení Cd v máku (rozklad na mokré cestě, voltametrické techniky)Stanovení Mn ve slitině (UV-VIS spektrofotometrie)Stanovení obsahu s-triazinů ve vodě (SPE, GC)Stanovení mastných kyselin v tucích (GLC) Literatura: 1.Návody do cvičení - dostupné u garanta předmětu. 2.Churáček J., Analytická separace látek, SNTL, Praha 1990. 3.Snyder L.R., Kirkland J.J., Glajch J.L., Practical Method Development, John Wiley & Sons, Inc., New York 1997. 4.Gratzfeld-Husgen A., Schuster R., HPLC for Food Analysis, A primer, Agilent Technologies Company, Germany 2001.
UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI
26.11.2014
4 / 93
PŘEDMĚTY - AKREDITAČNÍ SESTAVA 2014/15
ACH/ASX
Atomová spektrometrie Atomic Spectrometry
Statut:
Povinný
Počet kreditů:
1
Forma výuky:
Přednáška
Rozsah výuky:
1 HOD/TYD
Ukončení:
Zkouška
Garant:
Ing. David Milde, Ph.D.
Obsah: Děje probíhající v optické atomové spektrometrii. Šířka a intenzita spektrálních čar. AAS - princip metody, zdroje záření, monochromatizace záření, detekce záření. Optické uspořádání u AAS. Specifická a nespecifická absorpce záření, korekce pozadí v AAS. Plamenová atomizace v AAS. Složení a struktura plamene. Termodynamická rovnováha. Základní pochody při plamenové atomizaci. Zavádění vzorků. Interference u FA AAS. ETA, charakteristika, zdroje napájení, atmosféra, materiál atomizátoru. Děje při atomizaci, parametry charakterizující podmínky atomizace, průběh signálu. Teplotní program v ETA, teplota atomizátoru, neizotermičnost atomizačního děje, dávkování vzorků do ETA. Interference u ETA AAS, modifikátory. Generování těkavých sloučenin. Převedení na plynný hydrid. Možnosti stanovení rtuti. Hydridová AAS, podmínky pro generaci hydridů, způsoby generace, kolekce a atomizace. AFS - typy přechodů, experimentální uspořádání, interference. Disperzní prvky pro jednotlivé metody atomové spektrometrie. Disperze záření na mřížce. Hodnocení kvality disperzních prvků. Typy monochromátorů a polychromátorů. OES - emisní spektrum a zákonitosti jeho vzniku. Budící zdroje používané v OES. Spektrografie. Konstrukční uspořádání spektrografů. Analytické vyhodnocení emisního spektra. Přístroje automatické spektrometrie. Plamenová fotometrie. OES s buzením v plazmatu. Definice a charakterizace plazmatu. Stejnosměrně a mikrovlnně vázaná plazma. ICP OES - vznik, plazmová hlavice a její funkce. Generátor vysokofrekvenčního proudu. Tvar plazmatu. Topografie ICP výboje, excitační a deexcitační mechanismy. Optimalizace parametrů analýzy. Axiální pozorování. Zavádění vzorků do ICP. Interference. Metody anorganické hmotnostní spektrometrie, SIMS, GD/MS. ICP/MS - ICP jako zdroj iontů, extrakce iontů do MS. Instrumentální uspořádání. Interference. Způsoby excitace sub valenčních elektronů a klasifikace metod. Roentgenovo záření a jeho charakterizace. Rentgenová fluorescenční analýza a její využití. Augerova elektronová spektrometrie, PIXE. Literatura: Černohorský T., Jandera P.: Atomová spektrometrie, Univerzita Pardubice, Pardubice 1997. Dean J.R.: Practical Inductively Coupled Plasma Spectroscopy. Wiley-VCH, Chichester 2005. Komárek J.: Atomová absorpční spektrometrie. Masarykova Univerzita. Brno 2000. Lajunen L.H.J.: Spectrochemical analysis by atomic absorption and emission. Royal Society of Chemistry, London 1992. Nolte J.: ICP Emission Spectrometry. Wiley-VCH, Chichester 2003. Taylor H.E.: Inductively Coupled Plasma - Mass Spectrometry. Academic Press, New York 2001.
UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI
26.11.2014
5 / 93
PŘEDMĚTY - AKREDITAČNÍ SESTAVA 2014/15
ACH/DP1
Diplomová práce 1 Master of Science Thesis Work 1 in Analytical Chemistry
Statut:
Povinný
Počet kreditů:
5
Forma výuky:
Cvičení
Rozsah výuky:
5 HOD/TYD
Ukončení:
Zápočet
Garant:
Prof. RNDr. Karel Lemr, Ph.D.
Obsah: Volba tématu diplomové práce. Zpracování literární rešerše a osvojení si metodik pro experimentálního řešení problému. Literatura: According to given topic of the Thesis.
ACH/DP2
Diplomová práce 2 Master of Science Thesis Work 2 in Analytical Chemistry
Statut:
Povinný
Počet kreditů:
10
Forma výuky:
Cvičení
Rozsah výuky:
10 HOD/TYD
Ukončení:
Zápočet
Garant:
Prof. RNDr. Karel Lemr, Ph.D.
Obsah: Experimenty a sledování literatury. Literatura: According to given topic of the Thesis.
UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI
26.11.2014
PŘEDMĚTY - AKREDITAČNÍ SESTAVA 2014/15
ACH/DP3
Diplomová práce 3 Master of Science Thesis Work 3 in Analytical Chemistry
Statut:
Povinný
Počet kreditů:
15
Forma výuky:
Cvičení
Rozsah výuky:
15 HOD/TYD
Ukončení:
Zápočet
Garant:
Prof. RNDr. Karel Lemr, Ph.D.
Obsah: Pokračování experimentálního řešení zvolené problematiky. Literatura: According to given topic of the Thesis.
ACH/DP4
Diplomová práce 4 Master of Science Thesis Work 4 in Analytical Chemistry
Statut:
Povinný
Počet kreditů:
20
Forma výuky:
Cvičení
Rozsah výuky:
20 HOD/TYD
Ukončení:
Zápočet
Garant:
Prof. RNDr. Karel Lemr, Ph.D.
Obsah: Dokončení experimentů a sepsání diplomové práce. Literatura: According to given topic of the Thesis.
6 / 93
UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI
26.11.2014
7 / 93
PŘEDMĚTY - AKREDITAČNÍ SESTAVA 2014/15
ACH/EM
Elektroanalytické metody Electroanalytical Methods
Statut:
Povinný
Počet kreditů:
2
Forma výuky:
Přednáška
Rozsah výuky:
2 HOD/TYD
Ukončení:
Zkouška
Garant:
Doc. RNDr. David Jirovský, Ph.D. RNDr. Jana Skopalová, Ph.D.
Obsah: Základní elektrochemické pojmy, klasifikace elektroanalytických metod. Elektrochemické články, typy elektrod. Rovnovážná potenciometrie přímá: iontově selektivní elektrody, měření pH skleněnou elektrodou, potenciometrické senzory plynů, biosenzory. Nepřímá potenciometrie - potenciometrické titrace. Elektrolýza, elektrochemické reakce, látkový transport v roztocích, polarizační křivky. Voltametrické metody: DC a tast polarografie, lineární a cyklická voltametrie, pulzní metody -normální pulsní, diferenční pulsní, square-wave polarografie a voltametrie, tenzametrie, elektrochemická rozpouštěcí analýza. Voltametrické pracovní elektrody - rtuťové, tuhé, modifikované, mikroelektrody. Amperometrie a amperometrické detektory. Metody založené na vyčerpávající elektrolýze - elektrogravimetrie a coulometrie v potenciostatickém a galvanostatickém uspořádání, coulometrické titrace. Titrace s polarizovatelnými elektrodami - amperometrické, biamperometrické, bipotenciometrické, potenciometrické titrace s jednou polarizovanou elektrodou. Elektrochemické analytické metody v průtokových systémech: FIA, CFA, amperometrické a coulometrické detektory v HPLC. Vodivostní metody: nízkofrekvenční a vysokofrekvenční konduktometrie; dielektrimetrie. Literatura: " Acworth I. N., Naoi M., Parvez H. and Parvez S.: Coulometric electrode array detectors for HPLC, VSP Utrecht, 1997. " Barek J., Opekar F., Štulík K.: Elektroanalytická chemie. Karolinum, Praha 2004. " Brett C. M. A., Brett A. M. O.: Electroanalysis. Oxford University Press, Oxford 1998. " Monk P. M. S.: Fundamentals of Electroanalytical Chemistry. Wiley, Chichester 2001. " Štulík K., Barek J.: Elektrochemické analytické metody. SPN Praha 1984. " Štulík K., Pacáková V.: Elektroanalytická měření v proudících kapalinách. SNTL Praha 1989. " Volf R., Karlík M.: Elektroanalytické metody. VŠCHT Praha 1993. " Wang J.: Analytical Electrochemistry. Wiley-VCH, New York 2000.
UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI
26.11.2014
8 / 93
PŘEDMĚTY - AKREDITAČNÍ SESTAVA 2014/15
ACH/CHEX1
Chemometrie 1 Chemometrics 1
Statut:
Povinný
Počet kreditů:
4
Forma výuky:
Přednáška,Seminář
Rozsah výuky:
2 HOD/TYD + 2 HOD/TYD
Ukončení:
Zkouška
Garant:
Ing. David Milde, Ph.D.
Obsah: Zabývá se statistickou analýzou jednorozměrných dat. Seznamuje s praktickými aplikacemi statistiky pro chemii. V rámci semináře jsou řešeny příklady s využitím statistického softwaru. Náplň: statistické míry polohy, rozptýlení a tvaru. Bodové a intervalové odhady; analýza malých výběrů Hornovým postupem; průzkumová analýza jednorozměrných dat (EDA); ověření předpokladů o datech; transformace dat; testování statistických hypotéz (testy správnosti a shodnosti, párový test, testy vylučování odlehlých hodnot, neparametrické testy); analýza rozptylu; úvod do regresní analýzy; lineární regresní modely; metoda nejmenších čtverců (MNČ) a předpoklady pro její použití. testování hypotéz v lineární regresi; korelační analýza; polynomická regrese; regresní diagnostika (analýza regresního tripletu. identifikace vlivných bodů); vícerozměrná lineární regrese; lineární a nelineární kalibrace; postupy řešení při porušení předpokladů MNČ (metoda vážených nejmenších čtverců, ortogonální regrese, robustní regrese). Literatura: Jobson J.D.: Applied Multivariate Data Analysis - Volume I: Regression and Experimental design. Springer-Verlag, New York 2001. Meloun M., Militký J., Forina M.: CHEMOMETRICS FOR ANALYTICAL CHEMISTRY: Volume 1: PC-Aided Statistical Data Analysis. Ellis Horwood, Chichester 1992. Meloun M., Militký J.: Kompendium statistického zpracování dat. Academia, Praha 2002. Meloun M., Militký J.: Statistické zpracování experimentálních dat. Plus Praha, 1994.
UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI
26.11.2014
9 / 93
PŘEDMĚTY - AKREDITAČNÍ SESTAVA 2014/15
ACH/MSP
Molekulová spektrometrie Molecular Spectrometry
Statut:
Povinný
Počet kreditů:
2
Forma výuky:
Přednáška
Rozsah výuky:
2 HOD/TYD
Ukončení:
Zkouška
Garant:
Doc. RNDr. Petr Fryčák, Ph.D.
Obsah: Původ barevnosti sloučenin, skládání barev. Molekulové orbitaly, typy elektronových přechodů molekul a iontů. Absorpční spektra, vliv na strukturu, vliv rozpouštědla, volba rozpouštědla. Lambert-Beerův zákon a jeho odchylky. Spektrofotometrické studium komplexů, stanovení disociační konstanty, určování struktury org. látek. Luminiscenční spektrometrie. Podstata luminiscence, singletové a tripletové stavy, Franck-Condonův princip. Relaxace molekuly. fluorimetrie, fosforimetrie. Termoluminiscence, chemiluminiscence. Výtěžek a zhášení luminiscence. Luminiscenční odměrná analýza, fluorescenční indikátory. Refraktometrie a interferometrie. Index lomu, Snellův zákon, Lorenzova molární refrakce. Nefelometrie a turbidimetrie. Rozptyl záření, druhy rozptylu. Principy, výběr metody, stanovení koncentrace, aplikace. Infračervená a Ramanova spektrometrie. Vibrace a rotace molekul, druhy vibrací. Pravidla v IČ spektrometrii. Disperzní spektrometr, spektrometr s Fourierovou transformací. Speciální techniky IČ - vnitřní a vnější reflexe.Odlišnosti Ramanovy a IČ spektrometrie. Ramanův rozptyl. Aplikace. Nukleární magnetická rezonance. Spin jádra, precesní pohyb, energie spinových přechodů, populace jader, rezonanční podmínka. Pulzní NMR, relaxace, stínění, chemický posun, spin-spinová interakce, spin-mřížkový čas, decoupling. Interpretace NMR spekter - počet signálů, chemický posun, intenzita a tvar signálu, konstanta spin-spinové interakce. Moderní metody NMR, 2D NMR. Elektronová paramagnetická rezonance (EPR). Literatura: " Freeman R.: Magnetic resonance in chemistry and medicine. Oxford University Press, 2003. " Friebolin H.: Basic One- and Two-Dimensional NMR Spectroscopy. WILEY-VCH Verlag GmbH & Co. KGaA, Weinheim, 2005. " Garaj. J., Bustin D., Hladký Z.: Analytická chemia. Alfa/SNTL, Bratislava 1987. " Harris D. C., Bertolucci M. D.: Symmetry and spectroscopy. Dover Publications, Inc., New York, 1989. " Harvey D.: Modern Analytical Chemistry, DePauw University, 2000. " Jandera P.: Molekulová spektroskopie v organické analýze. Univerzita Pardubice, Pardubice 1999. " Kalous V. a kol.: Metody chemického výzkumu. SNTL/Alfa, Praha 1987. " Stužka V.: Instrumentální metody chemické analýzy. IV. Vibrační spektroskopie organických molekul., UP Olomouc, 1976. II. vydání - UP Olomouc, 1982. III. vydání - UP Olomouc, 1993. " Stužka V.: Spektrální identifikace organických látek. Příklady, tabulky, UP Olomouc 1997. " Stužka V.:Instrumentální metody chemické analýzy. III. Jaderná magnetická rezonance., UP Olomouc, 1982. II. vydání - UP Olomouc, 1993. " Volka K. a kol.: Analytická chemie I. VŠCHT, Praha1995. " Zýka J. a kol.: Analytická příručka, 2. díl. SNTL/Alfa, Praha 1988.
UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI
26.11.2014
PŘEDMĚTY - AKREDITAČNÍ SESTAVA 2014/15
10 / 93
UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI
26.11.2014
11 / 93
PŘEDMĚTY - AKREDITAČNÍ SESTAVA 2014/15
ACH/OSE1
Oborový seminář 1 Special Seminar 1
Statut:
Povinný
Počet kreditů:
1
Forma výuky:
Seminář
Rozsah výuky:
1 HOD/TYD
Ukončení:
Zápočet
Garant:
Prof. Ing. Vladimír Havlíček, Dr.
Obsah: Seminář je věnován nejnovějším vědeckým výsledkům v oboru analytické chemie. Předmět je každoročně aktualizován podle nejaktuálnějších publikovaných výsledků a probíhá interaktivní diskusní formou. Hlavním cílem předmětu je know-how "jak psát odborné texty", tedy zvl. příprava pro psaní diplomových prací/odborných publikací. Součástí předmětu je databázové vyhledávání literatury (SciFinder, Web of Science, Medline) a zpracování literárních odkazů (např. Endnote). V rámci přípravy na samotné obhajoby diplomových prací si předmět dále klade za cíl naučit studenty srozumitelně a jasně prezentovat svoje experimentální výsledky ústní formou (přednáška s prezentací výsledků, český i anglický jazyk). Podle možností budou aktuálně zařazovány hodinové přednášky zvaných lektorů (mimoolomouckých, zahraničních). Domácí příprava je dále volena formou "Journal club": každý ze studentů dostane PDF vědecké publikace z vysoce prestižního časopisu, s jejímž obsahem ostatní studenty seznámí a následně její hlavní myšlenky obhájí v diskusi. Literatura: dle doporučení garanta. Původní časopisecká literatura. Vědecké databáze. Zákon č. 130/2002 Sb., o podpoře výzkumu, experimentálního vývoje a inovací z vřejných prostředků, ve znění pozdějších předpisů. Zákon č. 206/2000 Sb., o ochraně biotechnologických vynálezů. Zákon č. 478/1992 Sb., o užitných vzorech. Zákon č. 527/1990 Sb., o vynálezech a zlepšovacích návrzích.
UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI
26.11.2014
12 / 93
PŘEDMĚTY - AKREDITAČNÍ SESTAVA 2014/15
ACH/OSE2
Oborový seminář 2 Special Seminar 2
Statut:
Povinný
Počet kreditů:
1
Forma výuky:
Seminář
Rozsah výuky:
1 HOD/TYD
Ukončení:
Zápočet
Garant:
Prof. Ing. Vladimír Havlíček, Dr.
Obsah: Seminář je věnován nejnovějším vědeckým výsledkům v oboru analytické chemie. Předmět je každoročně aktualizován podle nejaktuálnějších publikovaných výsledků a probíhá interaktivní diskusní formou. Hlavním cílem předmětu je know-how "jak psát odborné texty", tedy zvl. příprava pro psaní diplomových prací/odborných publikací. Součástí předmětu je databázové vyhledávání literatury (SciFinder, Web of Science, Medline) a zpracování literárních odkazů (např. Endnote). V rámci přípravy na samotné obhajoby diplomových prací si předmět dále klade za cíl naučit studenty srozumitelně a jasně prezentovat svoje experimentální výsledky ústní formou (přednáška s prezentací výsledků, český i anglický jazyk). Podle možností budou aktuálně zařazovány hodinové přednášky zvaných lektorů (mimoolomouckých, zahraničních). Domácí příprava je dále volena formou "Journal club": každý ze studentů dostane PDF vědecké publikace z vysoce prestižního časopisu, s jejímž obsahem ostatní studenty seznámí a následně její hlavní myšlenky obhájí v diskusi. Literatura: dle doporučení garanta. Původní časopisecká literatura. Původní časopisecká literatura. Vědecké databáze. Vědecké databáze. Zákon č. 130/2002 Sb., o podpoře výzkumu, experimentálního vývoje a inovací z vřejných prostředků, ve znění pozdějších předpisů. Zákon č. 206/2000 Sb., o ochraně biotechnologických vynálezů. Zákon č. 478/1992 Sb., o užitných vzorech. Zákon č. 527/1990 Sb., o vynálezech a zlepšovacích návrzích.
UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI
26.11.2014
13 / 93
PŘEDMĚTY - AKREDITAČNÍ SESTAVA 2014/15
ACH/OSE3
Oborový seminář 3 Special Seminar 3
Statut:
Povinný
Počet kreditů:
1
Forma výuky:
Seminář
Rozsah výuky:
1 HOD/TYD
Ukončení:
Zápočet
Garant:
Prof. Ing. Vladimír Havlíček, Dr.
Obsah: Seminář je věnován nejnovějším vědeckým výsledkům v oboru analytické chemie. Předmět je každoročně aktualizován podle nejaktuálnějších publikovaných výsledků a probíhá interaktivní diskusní formou. V rámci přípravy na samotné obhajoby diplomových prací si předmět dále klade za cíl naučit studenty srozumitelně a jasně prezentovat svoje experimentální výsledky ústní formou (přednáška s prezentací výsledků, český i anglický jazyk). Podle možností budou aktuálně zařazovány hodinové přednášky zvaných lektorů (mimoolomouckých, zahraničních). Domácí příprava je dále volena formou "Journal club": každý ze studentů dostane PDF vědecké publikace z vysoce prestižního časopisu, s jejímž obsahem ostatní studenty seznámí a následně její hlavní myšlenky obhájí v diskusi. Dále je probrána příprava grantových projektů (národní i zahraniční) a problematika transferu poznatků do výrobní sféry (patentová literatura, rešerše) a využití duševního vlastnictví. Je nastíněn současný národní systém hodnocení vědeckých výsledků (Rada vlády pro výzkum, vývoj a inovace). Literatura: dle doporučení garanta. Patentové databáze. Původní časopisecká literatura. Původní časopisecká literatura. Vědecké databáze. Vědecké databáze. Zákon č. 130/2002 Sb., o podpoře výzkumu, experimentálního vývoje a inovací z vřejných prostředků, ve znění pozdějších předpisů. Zákon č. 206/2000 Sb., o ochraně biotechnologických vynálezů. Zákon č. 478/1992 Sb., o užitných vzorech. Zákon č. 527/1990 Sb., o vynálezech a zlepšovacích návrzích.
UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI
26.11.2014
14 / 93
PŘEDMĚTY - AKREDITAČNÍ SESTAVA 2014/15
ACH/OSE4
Oborový seminář 4 Special Seminar 4
Statut:
Povinný
Počet kreditů:
1
Forma výuky:
Seminář
Rozsah výuky:
1 HOD/TYD
Ukončení:
Zápočet
Garant:
Prof. Ing. Vladimír Havlíček, Dr.
Obsah: Seminář je věnován nejnovějším vědeckým výsledkům v oboru analytické chemie. Předmět je každoročně aktualizován podle nejaktuálnějších publikovaných výsledků a probíhá interaktivní diskusní formou. V rámci přípravy na samotné obhajoby diplomových prací si předmět dále klade za cíl naučit studenty srozumitelně a jasně prezentovat svoje experimentální výsledky ústní formou (přednáška s prezentací výsledků, český i anglický jazyk). Podle možností budou aktuálně zařazovány hodinové přednášky zvaných lektorů (mimoolomouckých, zahraničních). Domácí příprava je dále volena formou "Journal club": každý ze studentů dostane PDF vědecké publikace z vysoce prestižního časopisu, s jejímž obsahem ostatní studenty seznámí a následně její hlavní myšlenky obhájí v diskusi. Dále je probrána příprava grantových projektů (národní i zahraniční) a problematika transferu poznatků do výrobní sféry (patentová literatura, rešerše) a využití duševního vlastnictví. Je nastíněn současný národní systém hodnocení vědeckých výsledků (Rada vlády pro výzkum, vývoj a inovace). Literatura: dle doporučení garanta. Patentové databáze. Původní časopisecká literatura. Původní časopisecká literatura. Vědecké databáze. Vědecké databáze. Zákon č. 130/2002 Sb., o podpoře výzkumu, experimentálního vývoje a inovací z vřejných prostředků, ve znění pozdějších předpisů. Zákon č. 206/2000 Sb., o ochraně biotechnologických vynálezů. Zákon č. 478/1992 Sb., o užitných vzorech. Zákon č. 527/1990 Sb., o vynálezech a zlepšovacích návrzích.
UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI
26.11.2014
15 / 93
PŘEDMĚTY - AKREDITAČNÍ SESTAVA 2014/15
ACH/PAC
Pokročilá analytická chemie Advanced Analytical Chemistry
Statut:
Povinný
Počet kreditů:
7
Forma výuky:
Cvičení
Rozsah výuky:
7 HOD/TYD
Ukončení:
Zápočet
Garant:
RNDr. Pavlína Baizová, Ph.D.
Obsah: Elementární analýza (stanovení síry, halogenů,...), stanovení nenasycených vazeb, analýza mastných kyselin v přírodních tucích, stanovení esterů karboxylových kyselin, identifikace uhlovodíků plynovou chromatografií na základě retenčních indexů, identifikace těkavých organických látek na základě reakcí funkčních skupin za plynově chromatografickou kolonou, identifikace organických sloučenin pomocí GC/MS, identifikace organických sloučenin pomocí HPLC/MS a HPLC/MS/MS, určení sekvence aminokyselin v peptidech s využitím MSn, stanovení kyseliny pikrové diferenčně pulsní voltametrií, stanovení protilátek beta-laktoglobulinu pomocí techniky ELISA pro diagnostiku intolerance na kravské mléko, kvalitativní chemická analýza moči, stanovení methamfetaminu ve slinách pomocí kapilární elektroforézy, spektrofotometrické stanovení léčiv v odpadních vodách, spektrofotometrické stanovení jednosytných fenolů ve vodě, využití iontově-selektivní elektrody ve farmaceutické analýze, jodometrické stanovení obsahu vody v léčivech metodou Karl Fischera, identifikace monoterpenů v silici citrusových plodů, coulometrické stanovení kyseliny askorbové v potravinách Literatura: www.ach.upol.cz. D. Harvey: Modern analytical chemistry. The McGraw-Hill Companies, 2000. P. Patnaik: Dean's Analytical Chemistry Handbook. The McGraw-Hill Companies, 2004. R. Kellner, J.M. Mermet, M. Otto, H.M. Widmer (Eds.): Analytical chemistry. Wiley-VCH, 1998.
UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI
26.11.2014
16 / 93
PŘEDMĚTY - AKREDITAČNÍ SESTAVA 2014/15
ACH/PHS
Hmotnostní spektrometrie Mass Spectrometry
Statut:
Povinný
Počet kreditů:
1
Forma výuky:
Přednáška
Rozsah výuky:
1 HOD/TYD
Ukončení:
Kolokvium
Garant:
Prof. RNDr. Karel Lemr, Ph.D.
Obsah: Úvod do hmotnostní spektrometrie, terminologie, vznik hmotnostního spektra; přístrojové schéma, rozlišovací schopnost, systémy zavádění vzorků. Mechanismus ionizace, konstrukce vybraných iontových zdrojů a jejich využití (ionizace elektronem - EI, chemická ionizace - CI, chemická ionizace za atmosférického tlaku - APCI, ionizace elektrosprejem - ESI, fotoionizace za atmosférického tlaku - APPI, termosprej - TSP, ionizace rychlými atomy resp. ionty - FAB, CFFAB, FIB, ionizace polem - FI, desorpce polem - FD, desorpce laserem - LD, ionizace laserem za asistence matrice - MALDI, DESI, přímá analýza v reálném čase - DART a další desorpční techniky).Typy hmotnostních spektrometrů - princip a teorie separace iontů v plynné fázi, oblast aplikace (sektorové přístroje, lineární kvadrupól, iontová past, průletový analyzátor, iontová cyklotronová rezonance, orbitální past). Tandemové přístroje (MS/MS resp. MSn). Indukovaná disociace (CID, SID). Detekce a registrace iontů, vakuové systémy.Hmotnostní spektrometrie ve strukturní analýze. Stanovení molekulové hmotnosti a určování elementárního složení, využití přirozených izotopů, měření při vysokém rozlišení. Dusíkové pravidlo, určení počtu nenasycených míst v molekule, určení strukturního typu a funkčních skupin.Fragmentace iontů po ionizaci elektronem, vybrané typy fragmentací a přesmyků, metastabilní ionty, přehled fragmentace vybraných skupin organických sloučenin (uhlovodíky, halogenderiváty, alkoholy a fenoly, ethery, aldehydy a ketony, karboxylové kyseliny, estery, dusíkaté a sirné sloučeniny), postup interpretace spekter.Metody kvantitativní analýzy v hmotnostní spektrometrii. Hmotnostní spektrometrie anorganických látek. Literatura: Barker J.: Mass spectrometry, John Wiley and sons, Chichester, 1999. Cole, R. B. (editor): Electrospray ionization mass spectrometry, Wiley Chichester, 1997. de Hoffmann E., Stroobant, V.: Mass Spectrometry. Principles and Applications. John Wiley and sons, Chichester, 2002. Niessen W.M.A.: Liquid Chromatography-Mass Spectrometry, Marcel Dekker, New York, 1999. Scientific publications devoted to mass spectrometry (mass spectrometric and analytical journals). Technical and application notes of leading producers of mass spectrometers. 1. Watson J.T.: Introduction to Mass spectrometry, Lippincott-Raven Publishers, Philadelphia, 1997. 2. Ubik K.: Fyzikálně-chemické metody, část 2, Hmotnostní spektrometrie, Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, Praha, 2000. 3. Jandera P.: Molekulová spektroskopie v organické analýze. Univerzita Pardubice, Pardubice, 1999. 4. Barker J.: Mass spectrometry, John Wiley and sons, Chichester, 1999. 5. Holčapek M. (editor): Spojení vysokoúčinné kapalinové chromatografie a hmotnostní spektrometrie, Spektroskopická společnost Jana Marca Marci a Univerzita Pardubice, Pardubice, 2001. 6. Vřešťál J. (editor): Hmotnostní spektrometrie, Masarykova Univerzita, Brno, 1998.
UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI
26.11.2014
17 / 93
PŘEDMĚTY - AKREDITAČNÍ SESTAVA 2014/15
ACH/SEM1
Separační metody 1 Separation Methods 1
Statut:
Povinný
Počet kreditů:
1
Forma výuky:
Přednáška
Rozsah výuky:
2 HOD/TYD
Ukončení:
Kolokvium
Garant:
Doc. RNDr. Petr Barták, Ph.D.
Obsah: Rozdělení separačních metod. Separace podle velikosti částic na základě rozdílných migračních rychlostí v silových polích (sedimentace, cetrifugace, ultracentrifugace, cyklony, inpaktory, pěnová flotace, termodifúze, elektrostatické a magnetické separace, techniky tokové analýzy-FFF), permeační metody (prosévání, filtrace, membránové metody, ultrafiltrace, dialýza, elektrodialýza, reverzní osmoza, elektroultrafiltrace). Fyzikálně-chemické separace (vymrazování, krystalizace a zonální krastalizace, vysolování a srážení, inkluzní sloučeniny, sublimace, lyofilizace, destilace a rektifikace- , azeotropní destilace, ko-destilace, vakuová destilace, molekulární destilace). Selektivní rozpouštění ( L-S extrakce). Kapalinová (L-S) extrakce (odchylky od rozdělovacího zákona, extrakční soustavy jednoduchých molekul, pseudomolekulárních látek, chelátů a iontových asociátů, techniky extrakce, kinetika extrakce). Plynová chromatografie: teorie - Van Deemterova rovnice a charakteristika jednotlivých členů, rovnice pro náplňové a kapilární kolony, rozlišení a jeho ovlivňování, výběr kolon. Dávkovací systémy pro náplňové a kapilární kolony, detektory TCD, FID, AFID (TID, NPD), HeD(ArD), CSD, ECD, PID, elektrochemické detektory, O-FID, kombinované techniky (GC/AED GC/MS, GC/FTIR). Kvalita v GC - retenční data, retenční indexy jejich souvislosti se strukturou, selektivní detekce, derivatizace, reakční plynová chromatografie (abstrakční techniky, hydrogenace, dehydrogenace, chromatografie uhlíkatého skeletu, pyrolýza, identifikační reakce za kolonou). Kvantifikace výsledků v kolonových metodách. Literatura: J. Churáček a kol.: Analytická separace látek, SNTL Praha, 1990. W. Jennings: Analytical Gas Chromatography. Academic Press, INC. 1987. Modern Analytical Chemistry, D. Harvey, The Mc Graw Hill 2000. Modern Practice of Gas Chromatography Ed. R.L. Grob, E.F. Barry, WileyInterssience , 2004. Štulík K. a kol: Analytické separační metody, Karolinum UK Praha 2004.
UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI
26.11.2014
18 / 93
PŘEDMĚTY - AKREDITAČNÍ SESTAVA 2014/15
ACH/SEM2
Separační metody 2 Separation Methods 2
Statut:
Povinný
Počet kreditů:
3
Forma výuky:
Přednáška
Rozsah výuky:
2 HOD/TYD
Ukončení:
Zkouška
Garant:
Prof. RNDr. Karel Lemr, Ph.D.
Obsah: Úvod, kapalinová chromatografie, vysokoúčinná kapalinová chromatografie (HPLC) historie, základní pojmy, základní veličiny. Separační principy využívané v kapalinové chromatografii - termodynamická stránka separačního děje.Transport látek kolonou - kinetická stránka separačního děje, porovnání HPLC a GC. Mimokolonové příspěvky v HPLC. Ovlivnění separačního děje v HPLC (rozlišení, selektivita, kapacita, účinnost).Instrumentace v HPLC-vysokotlaká čerpadla, dávkovací zařízení, předkolony, kolony. Detektory, reakční detektory, pomocná zařízení. Záznam a zpracování dat. Spojení HPLC se spektrálními technikami (HPLC-MS, HPLC-FTIR, HPLC-NMR).Tok mobilní fáze kolonou, používané náplně a jejich porovnávání. Chromatografické systémy - popis retence, mechanismus separace, použití. Chromatografie na polárních sorbentech. Chromatografie v systémech s obrácenými fázemi, chromatografie iontových párů. Chromatografie na středně polárních chemicky vázaných fázích. HILIC systémy. Chromatografie v systému kapalina - kapalina.Separace chirálních látek. Ionexy v analytické chemii, chromatografie na měničích iontů. Gelová chromatografie. Afinitní chromatografie. Využití dalších rovnováh v HPLC.Volba chromatografického systému, pracovních podmínek a jejich optimalizace.Mikrokolonová HPLC, preparativní kapalinová chromatografie. Další uspořádání v kolonové kapalinové chromatografii (středotlaká, nízkotlaká). Kapalinová chromatografie v plošném uspořádání (papírová a tenkovrstvá) - materiály, volba podmínek, detekce, instrumentace, použití.Pohyb iontů v elektrickém poli. Pohyblivost iontů. Pohyblivost limitní, aktuální, efektivní. Typy elektromigračních metod. Elektroforetický a elektroosmotický pohyb. Elektrická dvojvrstva, elektrokinetický potenciál. Ovlivnění elektroforetické rychlosti, pohyblivosti a elektroosmózy.Zónová elektroforéza. Rozšiřování zón a potlačení difúze stabilizací zón. Zonová elektroforéza v gelech. Analytická a preparativní elektroforéza v plošném uspořádání. Kapilární zónová elektroforéza. Účinnost a rozlišení. Vliv disipovaného tepla, osmózy, adsorpce, elektromigrační disperze na účinnost. Vliv chemické úpravy kapiláry radiálního napětí, volby základního elektrolytu, pracovní napětí. Instrumentální uspořádání.Separace neutrálních molekul. Micelární kapilární elektroforéza. Speciální ovlivnění efektivních pohyblivostí. Inkluzní komplexy, crown komplexy, afinitní komplexy, separace optických isomerů. Speciální úpravy s proměnným složením základního elektrolytu.Izoelektrická fokusace, charakteristika techniky. Fokusace v gradientu pH, gradientu ligandu. Samozaostřující a koncentrační efekt. Spojení IEF a CZE. Kapilární izotachoforéza, charakteristika techniky. Samozaostřující efekt, izotachoforetická podmínka. Kohlrauschova regulační funkce-podmínka kontinuity. Vedoucí a koncové elektrolyty. Předpověď a výpočet optimálních podmínek separace. Spojení ITP a CZE.On-line prekoncentrační techniky. Aplikace metod na malé molekuly a makromolekuly. Literatura: D. R. Baker, Capillary electrophoresis, Wiley and sons, 1995. F. Fore, L. Křivánková, P. Boček, Capillary zone electrophoresis, Wiley and sons, 1993. Churáček J. a kol.: Analytická separace látek, SNTL Praha, 1990. Poole C., F., Poole S., K.: Chromatography Today, Elsevier, Amsterdam, 1991. Altria K. D.: Capillary Electrophoresis Guidebook, Methods in Molecular Biology
UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI
26.11.2014
19 / 93
PŘEDMĚTY - AKREDITAČNÍ SESTAVA 2014/15
52, Humana Press Totowa, NJ, USA, 1996. Foret F., Křivánková L., Boček P.: Capillary Electrophoresis (Radola B. J., ed.), VCH Verlagsgesellschaft Weinheim, 1993. Heiger D. N.: High Performance Capillary Electrophoresis ? An Introduction, Hewlett-Packard GmbH Waldbronn, 1992. Li S. F. Y.: Capillary Electrophoresis, Journal of Chromatography Library 52, Elsevier Amsterodam, 1993. I. Wilson, C. Poole, M. Cooke: Encyclopedia of separation science. Academic Press, San Diego, London, Boston, New York, Sydney, Tokyo, Toronto 2000. J. P. Landers, Handbook of capillary electrophoresis, CRC Press, 1997. R. E. Ardrey: Liquid Chromatography - Mass Spectrometry: An Introduction. John Wiley & Sons, Chichester 2003. R. Westermeier, Electrophoresis in Practice, A Guide to Methods and Applications of DNA and Protein Separartions, Wiley and sons, 2005.
UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI
26.11.2014
20 / 93
PŘEDMĚTY - AKREDITAČNÍ SESTAVA 2014/15
KFC/COM
Vědecká komunikace Scientific Communication
Statut:
Povinný
Počet kreditů:
1
Forma výuky:
Seminář
Rozsah výuky:
1 HOD/TYD
Ukončení:
Zápočet
Garant:
Prof. RNDr. Radek Zbořil, Ph.D.
Obsah: 1. týden Předmět vědecká komunikace. Formy komunikace. Písemná komunikace. Odborný článek - publikace. 2. týden Grafická úprava. Citování literárních odkazů. Od rukopisu k vytištění publikace. Ústní (verbální) komunikace. Organizační formy ve vědecké a odborné komunikaci. 3. týden Ústní sdělení - přednáška. Technika projevu. Fonetické prostředky. Publikum a jeho aktivizování. 4. týden Příprava přednášky. Plán vystoupení. Průběh vystoupení. Nejčastější chyby při přednášce. Řízení zasedání a diskuse. 5. týden Plakátové sdělení (poster). Diskuse u posteru. Oponentský posudek na odbornou práci. Mimoslovní (nonverbální) komunikace. 6. - 12. týden Praktické nacvičování přednesu krátkého sdělení a řízení diskuse. 13.týden Zásady psaní diplomové práce (název, obsah, struktura a členění do kapitol, prezentace experimentálních dat a výsledků, tabulky, grafy, vzorce, citace literatury, souhrn), technická realizace (napsání textu, vazba). Literatura: Dohalská M., Hůrková-Novotná J., Pařízek V., Špalek V, Vymětal, J. Mluvím, mluvíš, mluvíme. Horizont, Praha, 1985. Hubáček J. Jak mluvit a přednášet. Profil, Ostrava, 1983. Mandel S. Jak úspěšně vystupovat. Linde, Praha, 1993. Šalda J. Od rukopisu ke knize a časopisu. SNTL, Praha, 1983. Thiel E. Mluvíme tělem. Knižní klub, Praha, 1997. Vymětal E., Váchová M. Úvod do studia odborné literatury. Orac, Praha, 2000. Vymětal J. a kol. Úvod do studia odborné literatury v chemii. Orac, Praha, 2001.
UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI
26.11.2014
21 / 93
PŘEDMĚTY - AKREDITAČNÍ SESTAVA 2014/15
ACH/AGC
Aplikovaná plynová chromatografie Applied Gas Chromatography
Statut:
Povinně volitelný
Počet kreditů:
4
Forma výuky:
Přednáška,Seminář
Rozsah výuky:
1 HOD/TYD + 1 HOD/TYD
Ukončení:
Kolokvium
Garant:
Doc. RNDr. Petr Barták, Ph.D.
Obsah: Instrumentace v plynové chromatografii - kolony, detektory, nástřiky. Údržba a řešení potíží. Příprava vzorku. Aplikace plynové chromatografie - organické kyseliny a báze, pesticidy, léčiva, sacharidy, lipidy, polymery, potravinářská analýza, analýza složek životního prostředí, soudní analýza, chirální separace, preparativní plynová chromatografie, pyrolýza. Literatura: A. Braithwaite, F.J. Smith: Chromatographic methods. Kluwer Academic publisher, 1999. Firemní literatura. I. Wilson, C. Poole, M. Cooke (Eds.): Encyclopedia of separation science. Academic Press, 2000. Pawliszyn J (Ed.): Applications of solid phase microextraction. The Royal Society of Chemistry, Hertfordshire,UK 1999. J. Churáček (Ed.): Identifikace a stanovení cizorodých, toxikologicky významných organických látek v materiálech a prostředí I-III. VŠCHT, Pardubice 1992 K.J. Hyver, P. Sandra (Eds.): High resolution Gas Chromatography. Hewlett Packard, Palo Alto, CA, USA 1989. Walter Jennings: Analytical Gas Chromatography, Academic pres, Inc. 1987. Chromatography. (A laboratory handbook of chromatographic end electrophoretic metods), Ed Erich Heftmann, Van Nostrand Reinhold Company New York 1975. R. Soniassy, P. Sandra, C. Schlett (Eds.): Water Analysis (Organic Micropolutants). Hewlett Pavkard, Palo Alto, CA, USA 1994. R. Soniassy (Ed.): Environmental Analysis. Hewlett Pavkard, Palo Alto, CA, USA 1994. S. Mitra (Ed.): Sample Preparation Techniques in Analytical Chemistry. John Wiley & Sons, Inc., Hoboken 2003. W. Jennings, E. Mitlefehldt, P. Stremple: Analytical gas chromatography. Academic Press, 1997.
UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI
26.11.2014
22 / 93
PŘEDMĚTY - AKREDITAČNÍ SESTAVA 2014/15
ACH/AHS
Aplikovaná hmotnostní spektrometrie Applied Mass Spectrometry
Statut:
Povinně volitelný
Počet kreditů:
4
Forma výuky:
Přednáška,Seminář
Rozsah výuky:
1 HOD/TYD + 1 HOD/TYD
Ukončení:
Kolokvium
Garant:
Prof. RNDr. Karel Lemr, Ph.D.
Obsah: Úvod, aplikace hmotnostní spektrometrie v organické analýze, historie a vývoj.Strukturní analýza malých organických molekul (potvrzení struktury, identifikace nečistot ve farmaceutické substanci, identifikace metabolitů), určení molekulové hmotnosti a sumárního vzorce, fragmentace po ionizaci elektronem, kolizí indukovaná fragmentace, fragmentační cesty a studium fragmentace.Aplikace ESI-MS, optimalizace iontového zdroje, analýzy malých objemů vzorků s využitím nano-ESI.MADI-TOF v analýze polymerů, praktické problémy ionizace.Spojení hmotnostní spektrometrie se separačními technikami. GC/MS v toxikologické analýze (databáze spekter).HPLC/MS - optimalizace analytické metody, limity využívaných rozhraní a jejich srovnání (např. ESI versus APCI).HPLC/MS v analýze složek životního prostředí a farmaceutické analýze.CE/MS - realizace spojení a optimalizace metody, vybrané aplikace (analýza biopolymerů).Hmotnostní spektrometrie peptidů a jejich fragmentace (určení sekvence aminokyselin).Aplikace FTICR. Pokroky v MS. V semináři jsou diskutována témata přednášek a řešeny odpovídající problémy (např. interpretace spekter malých organických molekul, vyhodnocení analýzy GC/MS, určení sekvence aminokyselin v peptidech). Literatura: Barker J.: Mass spectrometry, John Wiley and sons, Chichester, 1999. Cole, R. B. (editor): Electrospray ionization mass spectrometry, Wiley Chichester, 1997. de Hoffmann E., Stroobant, V.: Mass Spectrometry. Principles and Applications. John Wiley and sons, Chichester, 2002. Kinter M., Sherman N. E.: Protein Sequencing and identification using tandem mass spectrometry, John Wiley and sons, New York, 2000. Niessen W.M.A.: Liquid Chromatography-Mass Spectrometry, Marcel Dekker, New York, 1999. Scientific publications devoted to mass spectrometry (mass spectrometric and analytical journals. Snyder A.P.: Interpreting protein mass spectra, American Chemical Society and Oxford University Press, Washington D.C., 2000. Technical and application notes of leading producers of mass spectrometers. Watson J.T.: Introduction to Mass spectrometry, Lippincott-Raven Publishers, Philadelphia, 1997.
UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI
26.11.2014
23 / 93
PŘEDMĚTY - AKREDITAČNÍ SESTAVA 2014/15
ACH/ALC
Aplikovaná kapalinová chromatografie Applied Liquid Chromatography
Statut:
Povinně volitelný
Počet kreditů:
4
Forma výuky:
Přednáška,Seminář
Rozsah výuky:
1 HOD/TYD + 1 HOD/TYD
Ukončení:
Kolokvium
Garant:
Doc. RNDr. Petr Bednář, Ph.D.
Obsah: Instrumentální základy HPLC. Troubleshooting in HPLC - řešení problémů s instrumentací, optimalizace separace. Moderní detekce v HPLC a spojení HPLC s hmotnostní spektrometrií. Příprava vzorku pro HPLC (extrakce, SPE, SFE, derivatizace). Kapilární elektroforéza a elektrochromatografie, porovnání s HPLC. HPLC ve farmaceutické a klinické praxi. Potravinářská analýza. Analýza (bio)polymerů (GPC, atd.). Separace izomerů a enantiomerů. Měření retenčních dat - využití pro identifikaci, optimalizaci separace, studium interakcí. Miniaturizace v HPLC, kapilární techniky (miniaturizace ve spojení s MS), CEC. Preparativní chromatografie. Aplikace HPLC na řešení analýzy reálných komplexních vzorků. Diskuse nad konkrétními analytickými úkoly. Literatura: 1. Churáček J., Analytická separace látek, SNTL, Praha 1990. 2. J. Churáček, P. Jandera, Úvod do vysokoúčinné kapalinové kolonové chromatografie, SNTL, Praha 1984. 3. Snyder L.R., Kirkland J.J., Glajch J.L., Practical Method Development, John Wiley & Sons, Inc., New York 1997. 4.Gratzfeld-Husgen A., Schuster R., HPLC for Food Analysis, A primer, Agilent Technologies Company, Germany 2001.
UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI
26.11.2014
24 / 93
PŘEDMĚTY - AKREDITAČNÍ SESTAVA 2014/15
ACH/AMS
Aplikovaná molekulová spektrometrie Applied Molecular Spectrometry
Statut:
Povinně volitelný
Počet kreditů:
4
Forma výuky:
Přednáška,Seminář
Rozsah výuky:
1 HOD/TYD + 1 HOD/TYD
Ukončení:
Kolokvium
Garant:
Ing. Marek Kuzma, Ph.D.
Obsah: Úvod do metod molekulové spektrometrie. Spektrální identifikace - interpretace spekter. Vibrační spektrometrie. Vztah mezi strukturou a polohou absorpčního pásu v IR spektrech. Oblasti absorpce funkčních skupin. IR a Ramanovo spektrum. Molekulární vibrace a symetrie molekul. Struktura, chemický posun, spin-spinová interakce a poloha absorpčních pásů v NMR spektrech. Analýza NMR spekter. Vícerozměrná NMR spektra a techniky jejich měření. Fragmentace hlavních skupin organických látek v MS. Analýza okolí molekulárního iontu v MS. MS a identifikace organických látek. Použití ORD a CD křivek pro řešení jemné struktury organických látek. Literatura: Böhm S., Smrčková-Voltrová S.: Strukturní analýza organických sloučenin. VŠCHT, Praha 1995. Buděšínský M., Pelnař J.: Fyzikálně-chemické metody - Nukleární magnetická rezonance. ÚOCHB, Praha 2000. Feinstein K.: Guide to Spectroscopic Identification of Organic Compounds. RSC, London 1995. Freeman R.: Magnetic rezonance in chemistry and medicine. Oxford University Press, Oxford 2003. Horák M., Papoušek D.: Infračervená spektra a struktura molekul. Academia, Praha 1976. Silverstein R.M., Bassler G.C., Morril T.C.: Spectrometric identification of organic compounds, 5. vyd. Wiley, New York 1991. Stužka V.: Spektrální identifikace organických látek.Příklady.Tabulky. UP, Olomouc 1997.
UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI
26.11.2014
25 / 93
PŘEDMĚTY - AKREDITAČNÍ SESTAVA 2014/15
ACH/APAS
Aplikovaná atomová spektrometrie Applied Atomic Spectrometry
Statut:
Povinně volitelný
Počet kreditů:
2
Forma výuky:
Přednáška
Rozsah výuky:
1 HOD/TYD
Ukončení:
Kolokvium
Garant:
Ing. David Milde, Ph.D.
Obsah: Příprava vzorků pro atomovou spektrometrii. Rozklady pevných vzorků, mikrovlnné rozklady. Aplikace AAS - klinické a biologické vzorky, environmentální vzorky.Aplikace AAS - analýza hornin a metalurgických materiálů. Analýza biologických a environmentálních vzorků pomocí ICP-OES a ICP-MS. Aplikace ICPOES a ICP-MS v geologii a geochemii. Analýzy v organických rozpouštědlech. Metody analýzy povrchu. Literatura: Broekaert J.A.: Analytical Atomic Spectrometry with Flames and Plasmas. WileyVCH, Weinheim 2004. Dean J.R.: Practical Inductively Coupled Plasma Spectroscopy. Wiley-VCH, Chichester 2005. Lajunen L.H.J.: Spectrochemical Analysis by Atomic Absorption and Emission. RSC, Cambridge 1992. Taylor H.E.: Inductively Coupled Plasma-Mass Spectrometry - Practices and Techniques. Academic Press, San Diego 2001. Welz B., Sperling M.: Atomic Absorption Spectrometry. Wiley-VCH, Weinheim 1999.
UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI
26.11.2014
26 / 93
PŘEDMĚTY - AKREDITAČNÍ SESTAVA 2014/15
ACH/ELM
Elektromigrační metody Electromigration Methods
Statut:
Povinně volitelný
Počet kreditů:
2
Forma výuky:
Přednáška
Rozsah výuky:
1 HOD/TYD
Ukončení:
Kolokvium
Garant:
Doc. RNDr. Vítězslav Maier, Ph.D.
Obsah: Pohyb iontů v elektrickém poli. Pohyblivost iontů. Pohyblivost limitní, aktuální , efektivní. Získávání a měření iontových pohyblivostí. Souvislosti s molární a specifickou vodivostí. Typy elektromigračních metod. Elektroforetický a elektroosmotický pohyb. Elektrická dvojvrstva, elektrokinetický potenciál. Ovlivnění elektroforetické rychlosti a pohyblivosti. Využití disociačního stupně u slabých kyselin a zásad, tvorba komplexů. Amfolyty, isoelektrický bod, optimální pH pro separaci amfolytů. Ovlivnění elektroosmózy. Vliv pH, materiálu, úpravy povrchu. Zónová elektroforéza, charakteristiky techniky. Rozšiřování zón a potlačení difúze stabilizací zón. Stabilizace nosičem, gelem, stěnou, elektrickým polem. Zonová elektroforéza v gelech. Analytická a preparativní elektroforéza v plošném uspořádání. Kapilární zónová elektroforéza (CZE). Účinnost a rozlišení. Vliv disipovaného tepla, osmózy, adsorpce, elektromigrační disperze na účinnost. Vliv chemické úpravy kapiláry radiálního napětí, volby základního elektrolytu, pracovní napětí. Dávkování v kapilární elektroforéze. Detekce, optické, elektrochemické a hmotnostní detektory. Separace neutrálních molekul. Micelární kapilární elektroforéza. Speciální ovlivnění efektivních pohyblivostí. Inkluzní komplexy, crown komplexy, afinitní komplexy, separace optických isomerů. Příklady CZE ve volných roztocích a v gelech. Speciální úpravy s proměnným složením základního elektrolytu. Technika pohyblivého rozhraní, charakteristika techniky a její využití. Izoelektrická fokusace, charakteristika techniky. Fokusace v gradientu pH, gradientu ligandu. Samozaostřující a koncentrační efekt. Vytváření pH gradientu přirozené a syntetické amfolyty. Spojení IEF a CZE. Kapilární izotachoforéza, charakteristika techniky. Samozaostřující efekt, izotachoforetická podmínka. Kohlrauschova regulační funkce-podmínka kontinuity. Vedoucí a koncové elektrolyty. Předpověď a výpočet optimálních podmínek separace. Spojení ITP a CZE. Praktické příklady ITP analýzy. Kapilární izotachoforéza a zónová elektroforéza. Aplikace metod na malé molekuly a makromolekuly. Literatura: 1. J. P. Landers, Handbook of capillary electrophoresis, CRC Press (1997). 2. D. R. Baker, Capillary electrophoresis, Wiley and sons, (1995). 3. F. Fore, L. Křivánková, P. Boček, Capillary zone electrophoresis, Wiley and sons, (1993). 4. R. Westermeier, Electrophoresis in Practice, A Guide to Methods and Applications of DNA and Protein Separartions, Wiley and sons, (2005). 5. R. Westermeier, Electrophoresis in Practice, A Guide to Methods and Applications of DNA and Protein Separartions, Wiley and sons, (2005).
UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI
26.11.2014
27 / 93
PŘEDMĚTY - AKREDITAČNÍ SESTAVA 2014/15
ACH/HSB
Hmotnostní spektrometrie biopolymerů Mass Spectrometry of Biopolymers
Statut:
Povinně volitelný
Počet kreditů:
2
Forma výuky:
Přednáška,Cvičení
Rozsah výuky:
2 HOD/TYD + 1 HOD/TYD
Ukončení:
Kolokvium
Garant:
Prof. Ing. Vladimír Havlíček, Dr.
Obsah: Předmět je určen zejména studentům analytické chemie, organické chemie, biochemie, mikrobiologie a genetiky a ukazuje moderní aplikace biologické hmotnostní spektrometrie posledních cca tří-pěti let v oblasti proteomiky, genomiky, metabonomiky a glykomiky. Část předmětu je interaktivní a zahrnuje i praktické měření na spektrometrech, de novo interpretace spekter a použití bioinformatiky. Pro úspěšné absolvování předmětu není předchozí znalost oboru nutná. Přehled probírané látky (bude doplňován podle nejnovějších literárních výsledků): Možnosti hmotnostní spektrometrie v analýze biopolymerů, historie a současný stav. Základní principy interpretace konvenčních a kolizních hmotnostních spekter: nízkomolekulární organika, metoda per analogiam, interpretace spekter biopolymerů. Standardní iontové zdroje využívané v analýze biopolymerů (ESI a MALDI), nevakuové techniky (DESI, DAPCI, JeDI, DART, DAPPI, EESI, DAPPI). Vysoce rozlišující analyzátory pro biomolekuly (cyklotron, orbitrap a UHR-TOF): principy, spektra, aplikace. Iontová mobilita. Miniaturizace spektrometrů. Kolizí indukovaná disociace a nejdůležitější aktivační techniky pro biopolymery (ECD, ETD). Analýza peptidů a proteinů, příprava vzorků, určení molekulové hmotnosti, dekonvoluce, fragmentace peptidů, mapování peptidů, studium posttranslačních modifikací, konformace proteinů, molekulárních interakcí, proteomika, databáze proteinů a vyhledávání v nich. Kvantifikace bílkovin. MS3D přístupy: vodíkdeuteriová výměna a chemické zesíťování. Proteinové čipy. Posttranslační modifikace. Analýza nebílkovinných biomolekul, praktické aspekty, analýza nukleotidů, nukleosidů, sacharidů a glykolipidů. Zobrazovací hmotnostní spektrometrie a její aplikace v medicíně. Metabolomika a proteomika v diagnostice infekčních a nádorových onemocnění. Analýza lipidů. Praktické cvičení: měření na iontovém cyklotronu, na MALDI-TOF/TOF, ukázka NMR a elektronové mikroskopie. měřit vlastní vzorky (je dobré předem odevzdat). Literatura: 1. Barker J.: Mass Spectrometry, Wiley, Chichester, 1999. 2. Cole, R. B. (editor): Electrospray ionization mass spectrometry, Wiley, Chichester, 1997. 3. Holčapek M. (editor): Spojení vysokoúčinné kapalinové chromatografie a hmotnostní spektrometrie, Spektroskopická společnost Jana Marca Marci a Univerzita Pardubice, Pardubice, 2001. 4. Kinter M., Sherman N. E.: Protein Sequencing and identification using tandem mass spectrometry, John Wiley and sons, New York, 2000. 5. Snyder A.P.: Interpreting protein mass spectra, American Chemical Society and Oxford University Press, Washington D.C., 2000. 2. Cole, R. B. (editor): Electrospray ionization mass spectrometry, Wiley Chichester, 1997.
UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI
26.11.2014
28 / 93
PŘEDMĚTY - AKREDITAČNÍ SESTAVA 2014/15
3. Holčapek M. (editor): Spojení vysokoúčinné kapalinové chromatografie a hmotnostní spektrometrie, Spektroskopická společnost Jana Marca Marci a Univerzita Pardubice, Pardubice, 2001. 4. Kinter M., Sherman N. E.: Protein Sequencing and identification using tandem mass spectrometry, John Wiley and Sons, New York, 2000. 5.Snyder A.P.: Interpreting protein mass spectra, American Chemical Society and Oxford University Press, Washington D.C., 2000. 6. P. Skládal a L. Macholán: Biosensory - Současný stav a perspektivy, Chem. Listy 91; 105-113 (1997). 7. Jegorov A, Hajduch M, Sulc M, Havlicek V. Nonribosomal cyclic peptides: specific markers of fungal infections. J. Mass Spectrom. 2006; 41: 563. 8. International Journal of Mass Spectrometry, Special Issue on Imaging Mass Spectrometry, Vol. 260, 2007.
UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI
26.11.2014
29 / 93
PŘEDMĚTY - AKREDITAČNÍ SESTAVA 2014/15
ACH/CHE2
Chemometrie 2 Chemometrics 2
Statut:
Povinně volitelný
Počet kreditů:
3
Forma výuky:
Cvičení
Rozsah výuky:
2 HOD/TYD
Ukončení:
Zápočet
Garant:
Ing. David Milde, Ph.D.
Obsah: Zabývá se statistickou analýzou vícerozměrných dat na praktických příkladech z chemické praxe. Dále se předmět věnuje nelineární regresi. Data vícerozměrných pozorování v chemické laboratoři: datová matice, objekty a proměnné, typy proměnných, odhady parametrů polohy a rozptýlení vícerozměrných dat. Exploratorní analýza vícerozměrných dat, vyhledávání odlehlých měření. Určování struktury vzájemných vazeb v proměnných - PCA, interpretace hlavních komponent. Určování struktury vzájemných vazeb v proměnných - FA, rotace faktorů, interpretace. Analýza shluků - používané metriky a postupy shlukování, dendogramy. Hierarchické a nehierarchické metody shlukování. Nelineární regrese. Formulace nelineárního regresního modelu. Nelineární regrese. Geometrie nelineární regrese, statistická analýza v nelineární regresi. Vybrané algoritmy odhadování parametrů nelineární regrese. Procvičování z oblasti výpočtu nejistoty měření, návaznosti výsledků a validace analytických metod. Využití programu EffiValidation. Literatura: Pytela O.. Chemometrie pro organické chemiky. UPCE Pardubice, 1993. Meloun M., Militký J.: Kompendium statistického zpracování dat. Academia, Praha 2002. Meloun M., Militký J.: Počítačová analýza vícerozměrných dat v příkladech. Academia Praha 2005. Prichard E., Barwick V. Quality Assurance in analytical chemistry. Wiley, Weinheim 2008.
UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI
26.11.2014
30 / 93
PŘEDMĚTY - AKREDITAČNÍ SESTAVA 2014/15
ACH/OA
Odborná angličtina Technical English
Statut:
Povinně volitelný
Počet kreditů:
2
Forma výuky:
Cvičení
Rozsah výuky:
2 HOD/TYD
Ukončení:
Zápočet
Garant:
Doc. RNDr. Petr Fryčák, Ph.D.
Obsah: Četba odborných anglických textů a jejich překlad založený na rozboru vět a souvětí spojený s osvojováním terminologie chemických oborů. Literatura: Doubravová CH. Angličtina pro posluchače VŠCHT. Vydavatelství VŠCHT Praha, 1996. Odborné zahraniční časopisy. R.A. Close. English we use for science. Longman, London, 1980. Rejtharová V. Příručka anglického odborného stylu. Praha ,Academia, 1981.
ACH/PKT
Prekoncentrační techniky Preconcentration Methods
Statut:
Povinně volitelný
Počet kreditů:
3
Forma výuky:
Přednáška
Rozsah výuky:
2 HOD/TYD
Ukončení:
Kolokvium
Garant:
Doc. RNDr. Petr Barták, Ph.D.
Obsah: Koncentrační postupy pro zpracování velkých objemů vzorku (PTV technika, parní chromatografie,vymrazování, adsorpce). Destilační postupy (destilace s vodní parou, destilace-extrakce). Využití membrán, Odběr ovzduší, aerosoly (absorpce a adsorpce, odběrové trubičky, denudery a scrubry). Příprava plynných směsí. Statická a dynamická head-space analýza. Extrakce tuhých vzorků (ultrazvuk, mikrovlny, tlaková extrakce). Kapalinová extrakce, zahušťování, Extrakce superkritickou kapalinou (SFE), extrakce tuhou fází (SPE, SPME). Vícerozměrné techniky (přepínání kolon, kombinace technik) Literatura: Methods for enviromental trace analysis , J.R. Dean, John Wiley & Sons, LTD 2003. Multidimensional chromatography , Ed. L. Mondello, A.C. Lewis, K.D. Bartle, John Wiley & Sons, LTD 2002.
UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI
26.11.2014
31 / 93
PŘEDMĚTY - AKREDITAČNÍ SESTAVA 2014/15
ACH/RAOS
Repetitorium analýzy organických sloučenin Repetition in analysis of organic compounds
Statut:
Povinně volitelný
Počet kreditů:
2
Forma výuky:
Seminář
Rozsah výuky:
2 HOD/TYD
Ukončení:
Zápočet
Garant:
Doc. RNDr. Petr Barták, Ph.D.
Obsah: Odběr, charakterizace a předúprava vzorků. Fyzikální konstanty pro identifikaci organických sloučenin a jejich vztah se strukturou látky. Instrumentální metody v organické analýze - metody spektrální, separační a elektrochemické, využití instrumentálních metod při identifikaci organických sloučenin, metody stanovení organických sloučenin, interpretace dat. Elementární analýza. Důkaz a stanovení funkčních skupin, chemické stanovení funkčních skupin, chemické metody identifikace organických sloučenin. Literatura: J.R. Mohrig, Ch.N. Hammond, P.F. Schatz. Techniques in Organic Chemistry. W.H. Freeman and Company, New York, 2010. Jureček M. Organická analysa I a II. Nakladatelství ČSAV Praha, 1957. Shriner R. a kol. The systematic identification of organic compounds. Wiley Hoboken, 2004. Stránský Z. a kol. Analýza organických sloučenin. RUP Olomouc, 1981.
UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI
26.11.2014
32 / 93
PŘEDMĚTY - AKREDITAČNÍ SESTAVA 2014/15
ACH/TAA
Teoretické aspekty analytické chemie Theoretical aspects of Analytical Chem.
Statut:
Povinně volitelný
Počet kreditů:
3
Forma výuky:
Přednáška
Rozsah výuky:
3 HOD/TYD
Ukončení:
Kolokvium
Garant:
Doc. RNDr. Petr Fryčák, Ph.D.
Obsah: Teoretické aspekty analytické chemie zahrnují teorii nejdůležitějších typů chemických reakcí a rovnováh, uplatňujících se při důkazech, dělení a stanovení látek v roztocích. Vysvětlovány jsou podmínky ustavování rovnováh na základě charakterizace složení roztoků, znalostí reakčních mechanismů a souvislostí mezi vlastnostmi látek a reakčního prostředí. Hlavní témata: termodynamika a kinetika chemických reakcí; protolytické rovnováhy ve vodném a nevodném prostředí, vliv relativní permitivity a složek prostředí na sílu kyselin a zásad, stupnice kyselosti v amfiprotních, aprotogenních a inertních rozpouštědlech, charakterizace a analytické využití barevnosti roztoků protolytů; teorie komplexotvorných, srážecích a oxidačně redukčních reakcí, ovlivňování rovnováh prostředím; metody pro zjištění rovnovážných konstant; rozdělení a kvantifikace složek v rovnovážných systémech a jejich grafické znázorňování. Literatura: Čermáková L., Němec I.: Vybrané kapitoly z teoretické analytické chemie. SPN Praha 1983. Harvey D.: Modern Analytical Chemistry. McGraw-Hill, New York 2000. Kellner R., Mermet J.-M., Otto M., Valcárcel M., Widmer, H. M.(eds.): Analytical Chemistry. Kotouček M., Skopalová J.: Příklady z analytické chemie. 4.vyd., UP Olomouc 1997. Kotouček M.: Teoretické aspekty analytické chemie, skriptum, PřF UP Olomouc 1989. Šůcha L., Kotrlý S.: Teoretické základy analytické chemie, SNTL, Praha 1971, resp. Solution Equilibria in Analytical Chemistry, Van Nostrand+Reinhold, London 1972. Čermáková L., Němec I.: Vybrané kapitoly teoretické analytické chemie, skriptum, Přírodovědecká fakulta UK Praha 1983. Kotouček M., Skopalová J.: Příklady z analytické chemie, skriptum, UP Olomouc 1997. Kotrlý S., Šůcha L.: Chemické rovnováhy v analytické chemii. SNTL Praha 1988. Šůcha L., Kotrlý S.: Solution Equilibria in Analytical Chemistry. Van Nostrand, London 1972. Šůcha L., Kotrlý S.: Teoretické základy analytické chemie. SNTL Praha 1971.
UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI
26.11.2014
33 / 93
PŘEDMĚTY - AKREDITAČNÍ SESTAVA 2014/15
ACH/VOLT
Aplikovaná voltametrie Applied Voltammetry
Statut:
Povinně volitelný
Počet kreditů:
4
Forma výuky:
Přednáška,Seminář
Rozsah výuky:
1 HOD/TYD + 1 HOD/TYD
Ukončení:
Kolokvium
Garant:
Doc. RNDr. David Jirovský, Ph.D. RNDr. Jana Skopalová, Ph.D.
Obsah: Přehled nejužívanějších voltametrických technik v praxi, legislativa pro používaní elektrochemických metod v roztokové analýze. Současná voltametrická instrumentace, senzory, voltametrické detektory. Voltametrické analyzátory v praxi. Analytická voltametrie biologických molekul - voltametrie v neurochemii, immunoassay, voltametrie makromolekul. Aplikace voltametrie a hybridních technik v analýze léčiv. Voltametrická analýza vybraných skupin medikamentů. Voltametrie v klinické analýze. Voltametrie v metalurgii; analýza nerostných surovin. Voltametrická analýza anorganických látek z oblasti životního prostředí. Voltametrická analýza organických látek z oblasti životního prostředí. Analytická aplikace modifikovaných elektrod. Amperometrické biosenzory. Literatura: " Acworth I. N., Naoi M., Parvez H. and Parvez S.: Coulometric electrode array detectors for HPLC, VSP Utrecht, 1997. " Henze G.: Polarographie und Voltammetrie. Grundlagen und analytische Praxis. Springer, Berlin, 2001. " Původní časopisecká literatura. " Smyth M.R., Vos J. G. (edits.): Analytical Voltammetry. Elsevier, AmsterdamLondon-New York-Tokyo, 1992. " Wang J.: Analytical Electrochemistry. Wiley-VCH, New York 2000. Cooper J. M., Cass E. G. (edits.): Biosensors. A Practical Approach. Oxford University Press, 2004. On-line katalogy knihoven. Wang J.: Electroanalytical Techniques in Clinical Chemistry and Laboratory Medicine. VCH, Weinheim, 1988.
UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI
26.11.2014
34 / 93
PŘEDMĚTY - AKREDITAČNÍ SESTAVA 2014/15
KFC/CHSX4
Současná chemie 2014 Current chemistry 2014
Statut:
Povinně volitelný
Počet kreditů:
3
Forma výuky:
Přednáška
Rozsah výuky:
2 HOD/TYD
Ukončení:
Kolokvium
Garant:
Prof. Ing. Pavel Hobza, DrSc.
Obsah: Jsou vybrány čtyři základní oblasti chemie, které nejsou zahrnuty v povinných a běžných přednáškách a které tvoří integrální a ucelené časti. Jsou důležité pro současnou praktickou aplikovanou chemii a často jsou opomíjené v osnovách chemických předmětů pro svůj interdisciplinárních charakter. Základní struktura přednášky zahrnuje následující oblasti (v závorce jsou uvedeny čeho se výuka převážně týká). 1. chemie fázových rozhraní (nové materiály, průmysl, denní provoz domácnosti) 2. nanochemie (chemická syntéza, katalýza, biochemie, biofyzika a ochrana životního prostředí) 3. reaktivita a vlastnosti radikálů a excitovaných stavů (chemie, biochemie, biofyzika, medicina) 4. topochemické reakce (fyzikální chemie) Historický úvod má ukázat studentům, že to, co znají nebylo objeveno tak, jak se třeba domýšlejí z klasicky postavených přednášek. Hlavním cílem je poukázat na interdisciplinární charakter všech oborů a dále, jejich uplatnění význam pro současnost a budoucnost. Výběr látky byl proveden tak, aby vhodně doplnil stávající soubor přednášek chemie a ukázal jejich provázanost s ostatními studijními programy. Přednáška není určena pouze studentů chemie, ale i studentům biologických a fyzikálních předmětů a biochemie. Součástí přednášek budou přednášky předních českých chemiků. Literatura: Hiementz P.C. Principles of colloid and surface chemistry. Marcel Dekker, 1986. Lasovský J. Světlo a hmota z pohledu chemie. Mikroskripta UP Olomouc, 2001. Mollin J. Heterogenní systémy. skripta UP Olomouc, 1988. Moore W. J. Fyzikální chemie. SNTL, Praha, 1979. Vold R. D., Vold M. J. Colloid and Interface Chemistry. Reading, Massachusets, 1983.
UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI
26.11.2014
35 / 93
PŘEDMĚTY - AKREDITAČNÍ SESTAVA 2014/15
AFC/BACH
Bioanorganická chemie Bioinorganic Chemistry
Statut:
Volitelný
Počet kreditů:
4
Forma výuky:
Přednáška
Rozsah výuky:
2 HOD/TYD
Ukončení:
Kolokvium
Garant:
Prof. RNDr. Zdeněk Trávníček, Ph.D.
Obsah: " vývoj bioanorganické chemie, její význam a perspektivy, výskyt a zastoupení anorganických prvků v organismech, biologická funkce anorganických prvků, biologické ligandy (makrocykly, proteiny, nukleové kyseliny, nukleosidy a nukleotidy) " formální oxidační stavy a koordinační geometrie biologicky důležitých kovových iontů, klasifikace kovových iontů a ligandů (hard/soft teorie kyselin a bází), význam tzv. modelových sloučenin " vybrané experimentální techniky využívané při studiu - elektronová, infračervená, Ramanova, NMR, EPR, hmotnostní a Moessbauerova spektroskopie, monokrystalová X-ray analýza, EXAFS, cyklická voltametrie, atd. " enzymy obsahující nikl (ureáza, Ni/Fe-hydrogenázy, CO-dehydrogenáza, proteiny obsahující měď, biologická funkce Mo, W, V a Cr), funkce a transport některých kationtů prvků 1. a 2. hl. skupiny " molekula O2 - její absorpce, transport a toxicita, hemoglobin, myoglobin. " biologická funkce nekovových anorganických prvků (B, Si, As, Br, I, ?), bioanorganická chemie typicky toxických kovů (Pb, Cd, Tl, Hg, Al, Be, Cr(VI)) " strukturní aspekty některých biologicky aktivních komplexů přechodných kovů (komplexy na bázi Pt(II, IV) - odvozené od cis-platiny, karboplatiny a oxaliplatiny, komplexy na bázi jiných kovů (Ru, Ti, Au, ?), komplexy na bázi derivátů cytokininů a vhodného přechodného kovu) " vybrané in vitro a in vivo biologické testy (cytotoxicita, antiradikálová aktivita, antidiabetická aktivita, ?) a interpretace výsledků Literatura: A. Sigel and H. Sigel. Metal Ions in Biological Systems, Vol. 32, Interactions of Metal Ions with Nucleotides, Nucleic Acids, and Their Constituents. Marcel Dekker, Inc., New York, 1996. G. L. Eichhorn and L.G. Marzilli, Editors. Advances in Inorganic Biochemistry. Models in Inorganic Chemistry. PTR Prentice-Hall, Inc., 1994. Gielen, M., Tiekink, E. R. T. Matallotherapeutic Drugs and Metal-based Diagnostic Agents. John Wiley & Sons, Ltd., 2005. I. Bertini, H. B. Gray, S. J. Lippard and J. S. Valentine. Bioinorganic Chemistry. University Science Books, Sausalito, California,, 1994. J. A. Cowan. Inorganic Biochemistry. An Introduction. VCH Publishers, Inc., 1993. W. Kaim and B. Schwederski. Bioinorganic Chemistry: Inorganic Elements in the Chemistry and Life. Wiley, Chichester, 1996.
UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI
26.11.2014
36 / 93
PŘEDMĚTY - AKREDITAČNÍ SESTAVA 2014/15
AFC/MGCH
Magnetochemie Magnetochemistry
Statut:
Volitelný
Počet kreditů:
3
Forma výuky:
Přednáška
Rozsah výuky:
2 HOD/TYD
Ukončení:
Kolokvium
Garant:
Ing. Radovan Herchel, Ph.D.
Obsah: " úvod do magnetochemie (historie, základní veličiny a jejich jednotky) " základní typy magnetického chování (diamagnetismus, paramagnetismus, feromagnetismus, antiferomagnetismus) " metody měření magnetické susceptibility a magnetizace (silové a indukční metody) " teoretický základ kvantové chemie pro interpretaci magnetických vlastností " termodynamické vztahy pro magnetické veličiny (Van Vleckova rovnice, Brillouinova funkce) " metody výpočtu magnetizace a susceptibility pro paramagnetické látky " vliv symetrie koordinačního polyedru na magnetické chování jednojaderných koordinačních sloučenin (jev štěpení energetických hladin v nulovém magnetickém poli) " elektronová paramagnetická rezonance a moderní spektroskopické metody (princip a analýza spekter pro jednojaderné koordinační sloučeniny) " jev křížení spinových stavů v komplexech přechodných prvků (teoretické modely, přehled technik vhodných na detekci tohoto jevu) " magnetické interakce ve vícejaderných koordinačních sloučeninách (izotropní a neizotropní interakce) " magnetické interakce v polymerních koordinačních sloučeninách " přehled a shrnutí současné situace v oblasti molekulových magnetů Literatura: D. Gatteschi, R. Sessoli, J. Villain. Molecular nanomagnets. Oxford University Press, New York, 2006. J. A. Weil, J. R. Bolton. Electron paramagnetic resonance. Wiley, New Jersey, 2007. K. H. J. Buschow, F. R. de Boer. Physics of magnetism and magnetic materials. Kluwer Academic Publisher, New York, 2004. O. Kahn. Molecular magnetism. Wiley-VCH, New York, 1993. R. Boča. Theoretical foundations of molecular magnetism. Elsevier, Amsterdam, 1999. R. L. Carlin. Magnetochemistry. Springer-Verlag, Berlin, 1986.
UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI
26.11.2014
37 / 93
PŘEDMĚTY - AKREDITAČNÍ SESTAVA 2014/15
AFC/RTGAX
Rentgenostrukturní analýza X-Ray Structural Analysis
Statut:
Volitelný
Počet kreditů:
2
Forma výuky:
Přednáška
Rozsah výuky:
2 HOD/TYD
Ukončení:
Zkouška
Garant:
Prof. RNDr. Zdeněk Trávníček, Ph.D.
Obsah: " krystalografie a internet, krystalografické časopisy " symetrie látek, vlastnosti krystalů, metody přípravy monokrystalů organických a komplexních sloučenin, výběr monokrystalu " zdroje rentgenového záření - konvenční zdroje vs. zdroje typu rotační anoda, synchrotronové záření, monochromatizace a kolimace rtg. záření " difrakce rtg. záření na krystalu, interakce rtg. záření s látkou (absorpce, Thompsonův a Comptonův rozptyl), interference rozptýlených vln, teplotní faktory " monokrystalové difraktometry, detekce difraktovaného rtg. záření (detektory), redukce dat, korekce, orientační matice " řešení struktury, fázový problém, Pattersonova funkce, Přímé metody " "vypřesnění" dat a jejich interpretace, R-faktory, ? " praktické ukázky krystalografického, vizualizačního a "konverzního" software (SHELX, SIR92, XFPA, CRYSTALS, ORTEP, XP, WinGX, BABEL, ?), příklad řešení struktury " srovnání experimentálních (X-ray) a teoretických (DFT-výpočty) výsledků (Gaussian03, PC Spartan Pro, HyperChem, ?) " práce s CSD (Cambridge Structural Database) Literatura: C. Giacivazzo. Fundamentals of Crystallography. Oxford University Press, IUCr, 1992. Fázový problém. G. H. Stout & L. H. Jensen. X-Ray Structure Determination : A Practical Guide. John Wiley & Sons, New York, 1989. H. Schenk. Direct Methods of Solving Crystal Structures. Plenum Press, New York, 1991. International Tables for Crystallography, Vol. A, Space Group Symmety. Dordrecht, 1983. International Tables for Crystallography, Vol. B, Reciprocal Space. Kluwer Academic Publishers, Dordrecht, 1993. International Tables for Crystallography, Vol. C, Mathematical, Physical and Chemical Tables. Kluwer Academic Publishers, Dordrecht, 1995. J. P. Glusker, M. Lewis & M. Rossi. Crystal Structure Analysis for Chemists and Biologists. VCH Publishers, New York, 1994. Kraus, I. Úvod do strukturní rentgenografie. Academia, Praha, 1995. Krystalografie malých molekul. L. A. Aslanov, G. V. Fetisov and J. A. K. Howard, Edited by J.A.K Howard. Crystallographic Instrumentation. International Union of Crystallography, Oxford University Press, 1998. V. Valvoda, M. Polcarová a P. Lukáč. Základy strukturní analýzy. Univerzita Karlova, Praha, 1992. Všeobecně krystalograficky zaměřená. W. Borchardt-Ott. Crystallography. Springer, 1995.
UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI
26.11.2014
38 / 93
PŘEDMĚTY - AKREDITAČNÍ SESTAVA 2014/15
AFC/SMVL
Spektrální a magnetické vlastnosti látek Spectral and Magnetic Properties of Matter
Statut:
Volitelný
Počet kreditů:
2
Forma výuky:
Přednáška
Rozsah výuky:
2 HOD/TYD
Ukončení:
Zkouška
Garant:
Ing. Ivan Nemec, Ph.D.
Obsah: " úvod do molekulové symetrie, bodové grupy a jejich maticové reprezentace, reprezentace G3N, Mullikenova symbolika " volný ion " ion v poli nekulové symetrie " úvod do CFT, LFT, Tanabe-Suganovy diagramy " elektronová spektroskopie komplexních sloučenin přechodných kovů " magnetické vlastnosti látek, magnetická susceptibilita a její měření, diamagnetismus, látky magneticky zředěné, paramagnetika " látky magneticky koncentrované, antiferromagnetická a ferrimagnetická interakce " přehled spektrálních a magnetických vlastností komplexních sloučenin prvků 1. přech. řady " elektronová paramagnetická rezonance, elementární úvod, popis experimentu " fotoelektronová spektroskopie v koordinační chemii (XPS, UPS) " Mössbauerova spektroskopie v koordinační chemii železa " ORD a cirkulární dichroismus ve studiu koordinačních sloučenin Literatura: F. Březina a kolektiv. Stereochemie a některé fyzikálně chemické metody studia anorganických látek. UP, Olomouc, 1994. J. Fišer. Úvod do molekulové symetrie (Aplikace teorie grup v chemii). SNTL, Praha, 1980. A. A. Vlček. Struktura a vlastnosti koordinačních sloučenin. ČSAV, Praha, 1966. A. B. P. Lever. Studies in physical and theoretical chemistry 33, Inorganic Electronic Spectroscopy. Sec. Ed. Elsevier, 1984. E. A. Boudroux, L. N. Mulay. Theory and applications of molecular paramagnetism. Wiley&Sons, New York, 1976. P. Pelikán, R. Boča. Kvantová chémia koordinačných zlúčenín. Veda, Bratislava, 1987. V. Prosser. Experimentální metody biofyziky. Academia, Praha, 1989.
UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI
26.11.2014
39 / 93
PŘEDMĚTY - AKREDITAČNÍ SESTAVA 2014/15
AFC/TA
Termická analýza Thermal Analysis
Statut:
Volitelný
Počet kreditů:
2
Forma výuky:
Přednáška
Rozsah výuky:
2 HOD/TYD
Ukončení:
Zkouška
Garant:
Prof. RNDr. Richard Pastorek, CSc.
Obsah: " historie termické analýzy, rozdělení termických metod " materiály a zařízení užívané v TA " termogravimetrie " využití TG při stanovení kinetických dat " zvláštní způsoby TG-analýzy " ostatní metody spojené se změnou hmotnosti vzorku " diferenční TA " využití DTA při určování kinetických dat a reakčního tepla " speciální postupy DTA a příbuzné metody " využití TG a DTA v chemii a technické praxi " metody spojené se změnou jiných vlastností vzorku " termické chování některých látek a důležitých minerálů Literatura: Blažek, A. Termická analýza. SNTL, Praha, 1972. F. Březina a kolektiv. Stereochemie a některé fyzikálně chemické metody studia anorganických látek. UP, Olomouc, 1994. J. Rosický. Termická analýza. Praha, 1989. K. Györyová, V. Bálek. Termická analýza. Košice, 1992. T. Hatakeyama, Zhenhai Liu. Handbook of thermal analysis. New York, 1998. Wendlandt, W. W. Termičeskije metody analiza. Moskva, 1978.
UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI
26.11.2014
40 / 93
PŘEDMĚTY - AKREDITAČNÍ SESTAVA 2014/15
ACH/AACZP
Analytické aplikace v chemii ŽP Analytical applications in environmental chemistry
Statut:
Volitelný
Počet kreditů:
4
Forma výuky:
Přednáška,Seminář
Rozsah výuky:
3 HOD/TYD + 1 HOD/TYD
Ukončení:
Zkouška
Garant:
Doc. RNDr. Petr Bednář, Ph.D.
Obsah: Kontrola složení půdy a chemická analýza v zemědělství (struktura půdy, anorganické komponenty, humus, pH půdy, eroze půdy, rostlinné nutrienty, hnojiva, nové odrůdy zemědělských plodin); Atmosféra planety (složení atmosféry, analýza vzduchu a jeho znečištění, monitoring složek souvisejících s globálním oteplováním); Zdroje vody, její úprava a znečištění (složení přírodních vod, hydrologický cyklus, kyselé deště, kontrola kvality vod); Fosilní paliva (petrochemický průmysl - kontrola složek ropy, uhlí a zemního plynu); Zdroje energie pro budoucnost (vliv jednotlivých zdrojů energie na životní prostředí složení biomasy, životnost fotovoltaických a palivových článků, dopad na životní prostředí, kontrola složení použitých materiálů); Toxikologie (druhy expozice organismu, testování toxicity (LD50)); Organické a anorganické polutanty (analýza polycyklických aromatických uhlovodíků, prioritních organických polutantů, dioxinů a furanů; toxické kovy a studium jejich bioakumulace); Insekticidy a herbicidy (analýza organofosfátů, karbamátů - vybrané příklady; alternativní postupy kontroly hmyzu); Azbesty (struktura a fyzikálně-chemické vlastnosti azbestů, analytické metody pro identifikaci azbestových vláken); Nakládání s nebezpečnými odpady (definice nebezpečných odpadů, vybrané příklady kontroly jejich složení). Literatura: J.E. Girard, Principles of Environmental Chemistry, Jones and Bartlett Publishers, Canada 2005. M. Horáková, P. Lischke, A. Grunwald, Chemické a fyzikální metody analýzy vod, SNTL, Praha 1986.
UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI
26.11.2014
41 / 93
PŘEDMĚTY - AKREDITAČNÍ SESTAVA 2014/15
ACH/AET
Aplikace elektromigračních technik Applications of Electromigration Methods
Statut:
Volitelný
Počet kreditů:
2
Forma výuky:
Přednáška
Rozsah výuky:
1 HOD/TYD
Ukončení:
Kolokvium
Garant:
Doc. RNDr. Vítězslav Maier, Ph.D.
Obsah: Elektroforéza v plošném uspořádání. PAGE, dvourozměrné techniky, blotovací techniky, semipreparativní techniky, autofokusace, demonstrace praktických aplikací.Elektroforéza v kapilárním uspořádání. Volba elektrolytických systémů, elektrochromatografie, nepřímá detekce, on-line derivatizace, nástin off-line a on-line elektromigračních prekoncentračních technik, používané metody a techniky v analýze chirálních látek, biopolymérů (DNA, nízkomolekulární peptidy, oligosacharidy), anorganických iontů, hydrofóbních a lipofilních látek.HPCE v laboratořích klinické biochemie, soudního lékařství a toxikologie, farmaceutického a potravinářského průmyslu, hygienické stanice, v laboratořích základního a aplikovaného výzkumu.Tvorba home-made elektroforetických zařízení, miniaturizace, pokroky a výhledy v HPCE. Literatura: Ferenčík M., Škárka B.: Biochemické laboratórne metódy. ALFA Bratislava 1981. Deyl. Z., Mikšík I., Tagliaro F., Tesařová E.: Advanced Chromatographic and Electromigration Methods in BioSciences. Journal of Chromatography Library 60, Elsevier Amsterodam, 1998. Chrambach A., Dunn M.J., Radola B.J. (eds.): Advances in Electrophoresis 6, VCH Verlagsgesellschaft Weinheim, 1993. Chrambach A., Dunn M.J., Radola B.J. (eds.): Advances in Electrophoresis 7, VCH Verlagsgesellschaft Weinheim, 1994. Rothe G.M.: Electrophoresis of Enzymes. Springer Verlag Berlin, 1994. Sorensen H., Sorensen S., Bjergegaard C., Michaelsen S.: Chromatography and Electrophoresis in Food Analysis. MPG Books Ltd, Bodmin Cornwall 1999. 1. S.M. Palfrey, Clinical Applications of Capillary Electrophoresis, Humana Press, (1999). 2. K. D. Altria, Capillary Electrophoresis Guidebook: Principles, Operation, and Applications, Humana Press (1996).
UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI
26.11.2014
42 / 93
PŘEDMĚTY - AKREDITAČNÍ SESTAVA 2014/15
ACH/ANMR
NMR spektroskopie pro organickou chemii a biochemii NMR Spectroscopy for Organic Chemistry and Biochemistry
Statut:
Volitelný
Počet kreditů:
3
Forma výuky:
Přednáška,Seminář
Rozsah výuky:
1 HOD/TYD + 1 HOD/TYD
Ukončení:
Kolokvium
Garant:
Ing. Marek Kuzma, Ph.D.
Obsah: NMR spektroskopie představuje jednu z nejvýznamnějších spektrálních metod pro řešení struktury molekul. Za padesát let svého vývoje se stala vyspělou metodikou nejen pro studium struktury v kapalné i pevné fázi, ale i pro výzkum chování molekul v kapalné fázi. Zejména možnost postihnout chování dynamického systému v kapalné fázi dělá z NMR spektroskopie jednu z předních metod pro studium molekulárního rozpoznávání v biologických systémech za fyziologických podmínek. Je tak možné studovat vazbu léčiv na receptory, interakci proteinů a DNA nebo RNA, atd. Tento předmět si klade za cíl rozšířit a prohloubit znalosti studentů týkající se metodických postupů při určování struktury organických molekul a biomakromolekul. To by mělo dovolit pochopit postupy, které se využívají při studiu vlastností a chování organických molekul a biomakromolekul pomocí NMR. 1. Jev nukleární magnetické rezonance, základní pojmy. 2. Vznik NMR signálu, praktické provedení NMR experimentu, Fourierova transformace, základní pulsní sekvence (spinové echo). 3. Jaderná relaxace, NOE a jeho význam, chemická výměna. 4. NMR parametry - chemický posun, interakční konstanta J a multiplicita signálu, dipolární interakce D, NOE. 5. Charakterizace struktury organických látek: - 1H NMR spektra, homonukleární korelace - J-resolved, COSY, TOCSY - 13C NMR, heteronukleární korelace - HMQC, HSQC, HMBC - selektivní a band-selektivní experimenty. 6. Interpretace spekter. Řešení konformace pomocí NMR - aplikace NMR parametrů závislých na konformaci. 7. Biomakromolekuly- nukleové kyseliny a proteiny, značení stabilními izotopy 13C, 15N a 2H 8. NMR biomakromolekul - základní strategie. 9. Studium nevazebných interakcí biomakromolekul s ligandy. Literatura: Buděšínský M., Pelnař J. Cyklus Organická chemie, svazek 25 - Fyzikálně-chemické metody (Nukleární magnetická rezonance). Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, Praha, 2000. Derome A. E. Modern NMR techniques for chemistry research. Pergamon Press, 1997. Freeman R. Magnetic resonance in chemistry and medicine. Oxford University Press, New York, 2003.
UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI
26.11.2014
43 / 93
PŘEDMĚTY - AKREDITAČNÍ SESTAVA 2014/15
ACH/APFOR
Analytické aplikace ve fornzních vědách Analytical applications in forensic sciences
Statut:
Volitelný
Počet kreditů:
4
Forma výuky:
Přednáška,Seminář
Rozsah výuky:
3 HOD/TYD + 1 HOD/TYD
Ukončení:
Zkouška
Garant:
Doc. RNDr. Vítězslav Maier, Ph.D.
Obsah: 1. Úvod do předmětu forenzní chemie, definice základních pojmů - důkaz, průkaz, identifikace, chemická expertíza apod. 2. Odběr vzorků, stop a doličných předmětů k forenzní analýze. Analýza a chemická expertíza na místě činu. Konzervace stop a vzorků. Vzorky biologické a nebiologické povahy. Využití klasických a instrumentálních metod pro forenzní analýzu, imunochemické a chemické testy. Mikroskopie a chemická mikroskopie. 3. Chemie výbušnin a spalování. Termodynamika a kinetika výbuchu a hoření, přenos tepla a přenos hmoty při hoření. Síla exploze. Silné a slabé výbušniny. Paliva. Chemická expertíza výbušnin a pyrotechnických složí. Chemická expertíza paliv. Residua střeliv a střelného prachu. Elementární anorganická analýza střelného prachu, organická analýza střelného prachu. 4. Chemie barev a barviv. CIE systém barev. Barvy a barviva, inkousty, náplně do tiskových hlav. Aditiva barev, barvy maleb, historické barvy. Chemická analýza a expertíza barviv, inkoustů, tiskových náplní. Využití mikroskopie a instrumentálních analytických technik pro forenzní analýzu inkoustů, barev a barviv. Datace historických artefaktů na základně forenzní analýzy použitých barev. 5. Chemie polymerů. Polysacharidy, přírodní vlákna. Cellulosové polymery. Semisyntetické a syntetické polymery. Forenzní analýza papíru, polymerů, vláken a vlasů. 6. Drogy a farmaka a zneužívané látky. Rozdělení drog a zneužívaných látek podle účinku, způsobu užívání. Nelegální výroba drog a omamných látek. Forenzní expertíza nelegálních varen drog, zajištění stop a odběr vzorků. Anabolické steroidy, forenzní analýza anabolik. 7. Analýza drog, farmak, omamných látek a jejich metabolitů v tělních tekutinách a orgánech člověka a zvířat. Obecný postup při průkazu a identifikací neznámé látky v tělních tekutinách a orgánech. Forenzní expertíza anorganických a organických jedů. Abůzus alkoholu z forenzního hlediska. 8. Identifikace drog a omanných látek v lidských vlasech, umělých vláknech, tkaninách apod. Distribuce alkoholu v tělních tekutínách a tkáních. Forenzní metody pro stanovení alkoholu v tělních tekutinách 9. Analýza DNA v biologickém materiálu, sérologická analýza. 10. Analýza skla a identifikace typů skel pomocí IR spektrometrie a AAS. 11. Nedestruktivní mikroinstrumentální techniky - mikrospektrofotometrie, mikro - ATR, mikro - Raman. 12. Metody odhalování otisků prstů - parami jodu, kyanoakrylátová metody a prášky kovů. Odhalování krevních stop. Chromatografické metody určení stáří otisků prstů. 13. Řešení vybraných problémů z forenzní chemie. Interpretace výsledků. Spolupráce chemiků s ostatními složkami vyšetřování trestních činů. Znalecké posudky. Literatura: A. C. Moffat, M. D. Osselton, B. Widdop: Clarke´s Analysis of Drugs and Poisons, 3rd ed., The Pharmaceutical Press, London, 2004. A. C. Moffat, M. D. Osselton, B. Widdop: Clarke´s Analysis of Drugs and Poisons, 3rd ed., The Pharmaceutical Press, London, 2004.
UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI
26.11.2014
44 / 93
PŘEDMĚTY - AKREDITAČNÍ SESTAVA 2014/15
H. Lüllmann, K. Mohr, M. Wehling: Farmakologie a toxikologie. Grada Publ., Praha 2002. H. Lüllmann, K. Mohr, M. Wehling: Farmakologie a toxikologie. Grada Publ., Praha 2002. J. Večerková: Biotransformace léčiv a její význam pro toxikologickou praxi. Karolinum, Praha 1997. J. Večerková: Biotransformace léčiv a její význam pro toxikologickou praxi. Karolinum, Praha 1997. M. Balíková: Forenzní a klinická toxikologie. Laboratorní toxikologická vyšetření. Galén, Praha 2004. M. Balíková: Forenzní a klinická toxikologie. Laboratorní toxikologická vyšetření. Galén, Praha 2004. M. Johll: Investigating Chemistry: A Forensic Science Perspective, W. H. Freeman; Second Edition edition, USA. M. Johll: Investigating Chemistry: A Forensic Science Perspective, W. H. Freeman; Second Edition edition, USA. S. Bell: Drugs, Poisons, and Chemistry (Essentials of Forensic Science), Facts on File; 1 edition (November 2008), USA. S. Bell: Drugs, Poisons, and Chemistry (Essentials of Forensic Science), Facts on File; 1 edition (November 2008), USA.
ACH/APP
Analýza potravin a přírodních produktů Analysis of the food and natural products
Statut:
Volitelný
Počet kreditů:
2
Forma výuky:
Přednáška
Rozsah výuky:
2 HOD/TYD
Ukončení:
Zkouška
Garant:
Obsah: Stanovení vody, Analýza aminokyselin, peptidů a proteinů, Analýza tuků a mastných kyselin, Analýza sacharidů, Analýza vitaminů, Analýza minerálních látek, Analýza těkavých, aromatickcých a chuťových látek, Analýza barviv, Analýza aditiv, antinutrientů a kontaminujících látek Literatura: J. Davídek a kol. Analýza potravin. J. Davídek a kol. Laboratorní příručka analýzy potravin. V.Kubáň, P. Kubáň: Analýzy potravin. Analýza potravin. MZLU Brno, 2007.
UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI
26.11.2014
45 / 93
PŘEDMĚTY - AKREDITAČNÍ SESTAVA 2014/15
ACH/CFC
Cvičení z forenzní chemie Practicals in Forensic Chemistry
Statut:
Volitelný
Počet kreditů:
2
Forma výuky:
Cvičení
Rozsah výuky:
3 HOD/TYD
Ukončení:
Zápočet
Garant:
Doc. RNDr. Vítězslav Maier, Ph.D.
Obsah: 1. Metody analytické chemie při zajišťování a vyšetřování kriminalistických stop - metody odběru a zviditelnění otisků prstů (práškové metody, jodová metoda, kyanoakrylátová metoda, ninhydrinová metoda, využití dusičnanu stříbrného) identifikace lidských krevních stop a jejich odlišení od stop lidskou krev neobsahující (luminolový test, Teichmanova metoda), obnovení embosovaných čísel na kovových materiálech. 2. Stanovení alkoholu v krvi metodou head-space plynové chromatografie s plamenově ionizačním detekorem a Widmarkovou metodou. 3. Izolace, zakoncentrování a identifikace post blast (povýbuchových zplodin) metodou kapalinové chromatografie s DAD detektorem. 4. Identifikace barviv pomocí Ramanovy spektrometrie - forenzní posouzení pravosti a falšování rukopisů. 5. Analýza skelných střepů a jejich identifikace - identifikace typů skla na základě refraktivního indexu a stopového obsahu hořčíku s pomocí AAS. 6. Detekce a identifikace hořlaviny - detekce příčiny a ohniska požáru. 7. Identifikace drog v pevném stavu pomocí spektrálních metod, analýza dolarových bankovek na přítomnost drog, barevné reakce vedoucí k průkazu drogy. Imunochemické diagnostické testy na přítomnost drog v biologickém materiálu. 8. Stanovení budivých návykových látek (amfetamin, efedrin, extáze..) pomocí LCMS GC-MS a CE-MS. 9. Identifikace původu barviv uměleckých děl (obrazu) - odhalení padělků obrazů pomoci mikroskopie a hmotnostní spektrometrie. 10. Analýza vlasů na přítomnost drog s pomocí LC-MS a GC-MS. Literatura: Bell, S. Forensic Chemistry. Prentice Hall, 2nd edition, USA, 2012. Bogusz, J., Smith, R., Eds.. Forensic Science. Elsevier Scince, 2nd edition, USA, 2000. Lüllmann, H., Mohr, K., Wehling, M. Farmakologie a toxikologie. Grada Publishing, Praha, 2002. Stuart, B. H. Forensic Analytical Techniques. Wiley, 1st edition, USA, 2013. Večerková, J. Biotransformace léčiv a její význam pro toxikologickou praxi. Karolinum, Praha, 1997.
UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI
26.11.2014
46 / 93
PŘEDMĚTY - AKREDITAČNÍ SESTAVA 2014/15
ACH/ECHI
Elektronika a chemická instrumentace Electronics and Chemical Instrumentation
Statut:
Volitelný
Počet kreditů:
2
Forma výuky:
Přednáška,Seminář
Rozsah výuky:
1 HOD/TYD + 1 HOD/TYD
Ukončení:
Kolokvium
Garant:
Prof. RNDr. Milan Kotouček, CSc.
Obsah: Významnou část moderní analytické instrumentace tvoří elektrické měřicí přístroje. Elektrické signály, které nesou požadovanou informaci, je většinou nutno před jejich měřením vhodně matematicky upravit pro další zpracovaní a využití počítačem. Pro úpravu a měření signálů jsou výhodné operační zesilovače. Využívány jsou i jako zdroje proudu či napětí, vkládané na měřený chemický systém. Kombinací operačních zesilovačů lze laboratorně sestavit různá elektrochemická zařízení a jsou i komerčně využívány pro konstrukci chemické instrumentace. Analogové a číslicové obvody a jejich převodníky mají pro laboratorní techniku velký význam především ve spojení s tiskárnou a počítačem. Počítač může sloužit jako měřicí zařízení nebo může být použit on-line k řízení experimentu nebo chemického procesu. 1. Obecné schéma měřicího přístroje - měřená soustava, sensor (snímač sledované vlastnosti), převodník , vyhodnocovací část, regulační obvod. 2. Měření signálů; úprava signálu před jeho zpracováním počítačem. Základní zapojení operačního zesilovače - invertující, neinvertující, základní vlastnosti. 3. Převodník I/E, sčítací obvody, komparátor, derivační a integrační obvod, sledovač napětí. Realizace obvodů v laboratoři, stavebnice OZ. Video - "Malá instrumentace v chemické laboratoři". 4. Parametry důležité pro použití OZ - drift, offset, šum, frekvenční a dynamické vlastnosti OZ. 5. Přesné zdroje napětí a proudu, potenciostat, ampérostat. Využití OZ k potenciometrickým a jednoduchým polarografickým měřením, v elektrogravimetrii a coulometrii. 6. Filtry. Obvody pro převod analogového signálu na digitální a opačně (převodník A/D, D/A, napětí/frekvence, napětí/šířka impulsu). 7. Počítače jako měřicí přístroj v chemické laboratoři. Automatizace v analytické laboratoři. Literatura: Kalvoda R.: Použití operačních zesilovačů v chemické instrumentaci. SNTL, Praha 1974 Malmstadt H.V., Enke C.G., Crouch S.R.: Microcomputer and Electronic Instrumentation; Making the Right Connections. ACS, Washington, DC, 1994. Jílek J., Kalvoda R.: Mikroelektronické obvody v chemické instrumentaci. Univerzita Palackého, Olomouc 1989 (skriptum). Šťastný M.: Automatizace v analytické laboratoři. VŠCHT Praha 1995 (skriptum). .
UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI
26.11.2014
47 / 93
PŘEDMĚTY - AKREDITAČNÍ SESTAVA 2014/15
ACH/FKTO
Forenzní a klinická toxikologie Forensic and clinical toxicology
Statut:
Volitelný
Počet kreditů:
2
Forma výuky:
Přednáška
Rozsah výuky:
2 HOD/TYD
Ukončení:
Zkouška
Garant:
Doc. RNDr. Vítězslav Maier, Ph.D.
Obsah: 1. Úvod do klinické a forenzní toxikologie. 2. Cíle toxikologických a forenzních vyšetření a expertýz. Farmakokinetika, metabolismus (Absorpce - Distribuce - Eliminace - Akumulace nox). Farmakodynamika 3. Biotransformace. Otrava, předávkování; toxické hladiny; interakce nox. Obecné přístupy k terapii akutních otrav. 4. Laboratorní diagnostika otrav, abúzu drog; volba vzorků; limity detekce a časové detekční okno. Vývojové trendy v analytické toxikologii (Současné toxikologické metody, přednosti a omezení - Validace metod, potřebný rozsah v toxikologii) 5. Noxy v akutních otravách (Kyseliny a zásady - Kovy - Plyny - Těkavé látky Alkoholy, glykoly - Pesticidy - Předávkování léčivy, návykovými látkami - Otravy způsobené rostlinami, houbami - Abúzus drog, toxikomanie). 6. Alternativní materiály se zřetelem na průkaz drog (Sliny - Mekonium - Vlasy) 7. Legislativa ve vztahu k návykovým látkám 8. Praktické informace týkající se akutních otrav 9. Hlavní typy drogových a lékových závislostí (Kanabinoidy, Centrální stimulancia, Látky s centrálně-tlumivým účinkem, Solvencia, Opiáty/opioidy, Analgetické směsi, Tabák, Alkohol) 10. Toxikologie organických kolorantů (barviv a organických pigmentů) meziproduktů (výchozí suroviny a barvářské produkty). Toxikologie polymerních materiálů a nátěrových hmot. Toxikologie ostatních významných produktů průmyslové a technické chemie. 11. Toxikologické testy - testy na zvířatech, testy na akutní toxicitu, subakutní toxicitu, teratogenitu, subchronickou toxicitu, chronickou toxicitu. 12. Přehled nejdůležitějších specifických otrav a podávaných antidot Literatura: M. Johll: Investigating Chemistry: A Forensic Science Perspective, W. H. Freeman; Second Edition edition, USA. M. Johll: Investigating Chemistry: A Forensic Science Perspective, W. H. Freeman; Second Edition edition, USA. S. Bell: Drugs, Poisons, and Chemistry (Essentials of Forensic Science), Facts on File; 1 edition (November 2008), USA. S. Bell: Drugs, Poisons, and Chemistry (Essentials of Forensic Science), Facts on File; 1 edition (November 2008), USA. S. Bell: Forensic Chemistry, Prentice Hall; 2 edition 2012, USA. S. Bell: Forensic Chemistry, Prentice Hall; 2 edition 2012, USA. V. Vondráček, O. Riedl, Klinická toxikologie, Avicenum, 1971, Praha. V. Vondráček, O. Riedl, Klinická toxikologie, Avicenum, 1971, Praha.
UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI
26.11.2014
48 / 93
PŘEDMĚTY - AKREDITAČNÍ SESTAVA 2014/15
ACH/CHA1
Chemická angličtina 1 English for Chemists 1
Statut:
Volitelný
Počet kreditů:
2
Forma výuky:
Cvičení
Rozsah výuky:
2 HOD/TYD
Ukončení:
Zápočet
Garant:
Doc. RNDr. Petr Fryčák, Ph.D.
Obsah: Četba odborných anglických textů a jejich překlad založený na rozboru vět a souvětí spojený s osvojováním terminologie chemických oborů. Literatura: Charlotte Doubravová: angličtina pro posluchače VŠCHT,Vydavatelství VŠCHT Praha. Odborné zahraniční časopisy. Rejtharová V: Příručka anglického odborného stylu. Praha ,Academia 1981 R.A. Close: English we use for science. Longman, London, 1980. .
ACH/CHA2
Chemická angličtina 2 English for Chemists 2
Statut:
Volitelný
Počet kreditů:
2
Forma výuky:
Cvičení
Rozsah výuky:
2 HOD/TYD
Ukončení:
Kolokvium
Garant:
Doc. RNDr. Petr Fryčák, Ph.D.
Obsah: Četba odborných anglických textů a jejich překlad založený na rozboru vět a souvětí spojený s osvojováním terminologie chemických oborů. Překlad z českého do anglického jazyka. Literatura: Rejtharová V: Příručka anglického odborného stylu. Praha ,Academia 1981 R.A. Close: English we use for science. Longman, London, 1980.
UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI
26.11.2014
49 / 93
PŘEDMĚTY - AKREDITAČNÍ SESTAVA 2014/15
ACH/CHO
Chemie ovzduší Chemistry of Atmosphere
Statut:
Volitelný
Počet kreditů:
2
Forma výuky:
Přednáška
Rozsah výuky:
1 HOD/TYD
Ukončení:
Zkouška
Garant:
Doc. RNDr. Lubomír Čáp, CSc. Doc. RNDr. Vítězslav Maier, Ph.D.
Obsah: 1. Atmosféra, složení atmosféry, atmosférické jevy. 2. Přenos energie v atmosféře, skleníkové plyny. 3. Ozónová vrstva. 4. Chemické reakce v atmosféře. 5. Analýza plynů-základní operace ( měření teploty, tlaku, průtoku). 6. Odběr vzorků ovzduší. 7. Analýza anorganických složek ( sloučeniny dusíku, síry). 8. Využití absorpčních technik pro analýzu ovzduší. 9. Gravimetrické, volumetrické a spektrofotometrické stanovení složek ovzduší. 10. Stanovení organických sloučenin v ovzduší. 11. Informační systémy a legislativa ČR. 12. Exkurze (stanice měření čistoty ovzduší ČHMÚ). Literatura: 1. Barbara J. Finlayson-Pitts, Chemistry Of The Upper And Lower Atmosphere: Theory, Experiments, and Applications, Academic Press (1999. 2. John H. Seinfeld, Spyros N. Pandis, Atmospheric Chemistry and Physics: From Air Pollution to Climate Change, Wiley-Interscience (2006). 3. Colin Baird, Michael Cann, Environmental Chemistry, W. H. Freeman (2004).
UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI
26.11.2014
50 / 93
PŘEDMĚTY - AKREDITAČNÍ SESTAVA 2014/15
ACH/CHP
Chemie potravin
Statut:
Volitelný
Počet kreditů:
4
Forma výuky:
Přednáška,Seminář
Rozsah výuky:
3 HOD/TYD + 1 HOD/TYD
Ukončení:
Zkouška
Garant:
Doc. RNDr. Petr Barták, Ph.D.
Obsah: Aminokyseliny, peptidy, bílkoviny, mastné kyseliny, homolipidy, heterolipidy, sacharidy, vitaminy, minerální látky, voda, aromatické a chuťové látky, barviva, antinutriční a toxické látky, aditiva, kontaminující látky Literatura: Straka I., Malota L.:. Chemické vyšetření masa. Ossis, Tábor, 2006. Velíšek J., Cejpek K.:. Biosynthesis of Food Components. Ossis, Tábor, 2008. Velíšek J., Hajšlová J.:. Chemie potravin I,II. Ossis, Tábor, 2009. Velíšek J. Chemie potravin. OSSIS, Tábor, 1999.
UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI
26.11.2014
51 / 93
PŘEDMĚTY - AKREDITAČNÍ SESTAVA 2014/15
ACH/CHV
Chemie vody Chemistry of Water
Statut:
Volitelný
Počet kreditů:
2
Forma výuky:
Přednáška
Rozsah výuky:
1 HOD/TYD
Ukončení:
Kolokvium
Garant:
Doc. RNDr. Vítězslav Maier, Ph.D.
Obsah: Úvod do problematiky chemie vody, fyzikálně-chemické vlastnosti vody, izotopické složení vody, anomálie vody, vliv magnetického a elektrického pole, organoleptické vlastnosti, rozpustnost látek, fyzikální-chemie v chemii vody, termodynamika, acidobazické rovnováhy, grafické vyjadřování rovnováh, hydrolýza, rovnováha oxidu uhličitého, komplexotvorné rovnováhy v chemii vod, srážecí rovnováhy v chemii vod, redoxní rovnováhy v chemii vod, děje na rozhraní atmosféra - voda, pevné látky - voda, koloidní látky ve vodách, vlastnosti koloidů, obecné složení vod, rozpuštěné látky, minerální vody, odpadní vody, nerozpuštěné látky, skupinová stanovení, speciace látek, vybrané anorganické látky ve vodách, vybrané organické látky ve vodách, druhy vod, pitná voda, odpadní vody, analytická chemie vod, metody analytické chemie, vzorkování vod, extrakce, titrační metody stanovení, stanovení vybraných anorganických a organických látek Literatura: M. Horáková et al.: Analytika vody. Vydavatelství VŠCHT Praha 2003. M. Horáková et al.: Analytika vody. Vydavatelství VŠCHT Praha 2003. Pitter P.:. Hydrochemie. Popl M., Fähnrich J. :. Analytická chemie životního prostředí VŠCHT Praha 1992. S. E. Manahan: Environmental Chemistry. CRC Press, Boca Raton 2010. S. E. Manahan: Environmental Chemistry. CRC Press, Boca Raton 2010. W. Stumm, Aquatic Chemistry, John Wiley & Sons; 3rd edition (1996).
UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI
26.11.2014
52 / 93
PŘEDMĚTY - AKREDITAČNÍ SESTAVA 2014/15
ACH/IMCHA
Imunochemie a imunoanalýza Immunochemistry and Immunoanalysis
Statut:
Volitelný
Počet kreditů:
2
Forma výuky:
Přednáška
Rozsah výuky:
1 HOD/TYD
Ukončení:
Kolokvium
Garant:
Obsah: " Obecný základ imunochemie a imunoanalýzy. Nomenklatura, chemická rovnováha, typy interakcí, monoklonální protilátky, rekombinantní protilátky, izolace a purifikace protilátek. " Typy radioimunoanalýz (radioizotopické, enzymatické, fluorescenční, chemiluminiscenční, ostatní). Formy imunoanalýz (homogenní - heterogenní, kompetetivní-nekompetetivní). Separační systémy optimalizace a charakterizace vyvinuté imunoanalytické metody. " Zpracování a interpretace analytického signálu, výhody a limitace imunoanalytických metod, nástin možných aplikací ve výzkumu, klinické biochemii, toxikologii, analýzy potravin. " Imunoanalytický screening, specifita nízkomolekulární haptenů, strategie návrhu a přípravy haptenu ke tvorbě cílené protilátky, diskuze nejčastěji používaných konjugačních technik. Metody značení antigenu a protilátky. Příprava reálného vzorku pro imunoanalýzu, vliv matricových efektů. " Příbuzné techniky a technologie. Imunoafinitní chromatografie, spojení imunoanalýzy se separačními technikami (elektroforetické techniky, HPLC). Imunosenzory. Předpokládaný vývoj imunoanalytických technik. " Demonstrace vývoje enzymatických imunoanalýz pro detekci a stanovení triazinových herbicidů, multianalytová imunoanalýza. Literatura: Alan P. Johnstone, Robin Thorpe, Immunochemistry in Practice, Blackwell Publishing Limited (1996). E. Day, Advanced Immunochemistry, John Wiley & Sons (1990).. Ferenčík M.: Imunochémia, Alfa Bratislava, 1989.
UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI
26.11.2014
53 / 93
PŘEDMĚTY - AKREDITAČNÍ SESTAVA 2014/15
ACH/INL
Imunoanalýza nízkomolekulárních látek Immunoanalysis of Low-Molecular Compounds
Statut:
Volitelný
Počet kreditů:
1
Forma výuky:
Přednáška
Rozsah výuky:
1 HOD/TYD
Ukončení:
Kolokvium
Garant:
Doc. RNDr. Vítězslav Maier, Ph.D.
Obsah: Obecný základ imunochemie a imunoanalýzy. Nomenklatura, chemická rovnováha, typy interakcí, avidita, imunogen, imunitní odpověď, imunizace, tvorba polyklonálních protilátek, monoklonální protilátky, rekombinantní protilátky, izolace a purifikace protilátek, typy imunoanalýz (radioizotopické, enzymatické, fluorescenční, chemiluminiscenční, ostatní), formy imunoanalýz (homogénníheterogenní, kompetitivní-nekompetitivní), separační systémy, optimalizace a charakterizace vyvinuté imunoanalytické metody, zpracování a interpretace analytického signálu, výhody a limitace imunoanalytických metod, nástin možných aplikací ve výzkumu, klinické biochemii a analýze životního prostředí. Imunoanalýza malých molekul. Imunoanalytický screening, specifita nízkomolekulárních haptenů, strategienávrhu a přípravy haptenu ke tvorbě cílené protilátky, diskuse nejčastěji používaných konjugačních technik, metody značení antigenu a protilátky, komerčně přístupné konjugační činidla a markry, příprava reálné vzorky pro imunoanalýzu, vliv matricových efektů, přesnost a validita rutinních aplikací.Použití imunoanalýzy pro screening a monitorování polutantů v životním prostředí. Demonstrace vývoje enzymatických imunoanalýz pro detekci a stanovení triazínových herbicidů, demonstrace vývoje skupinové protilátky pro imunoanalýzu pesticidů odvozených od metafenoxybenzoové kyseliny, stručný přehled imunoanalytických postupů vyvinutých pro analýzu jednotlivých tříd polutantů v potravinovém a životním prostředí, multianalytová imunoanalýza. Příbuzné techniky a technologie. Imunoafinitní chromatografie, spojení imunoanalýzy se separačními technikami (elektroforetické techniky, HPCE, HPLC), imunosenzory, předpokládaný vývoj imunoanalytických technik. Literatura: 1.Ferenčík M.: Imunochémia, Alfa Bratislava, 1989. 2. Alan P. Johnstone, Robin Thorpe, Immunochemistry in Practice, Blackwell Publishing Limited (1996). 3. E. Day, Advanced Immunochemistry, John Wiley & Sons (1990).
UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI
26.11.2014
54 / 93
PŘEDMĚTY - AKREDITAČNÍ SESTAVA 2014/15
ACH/KLCH
Klinická analytická chemie Clinical analytical chemistry
Statut:
Volitelný
Počet kreditů:
4
Forma výuky:
Přednáška,Seminář
Rozsah výuky:
2 HOD/TYD + 2 HOD/TYD
Ukončení:
Zkouška
Garant:
Doc. RNDr. Jan Petr, Ph.D.
Obsah: 1. Klinická analytická chemie, organismus a jeho celky, patologické stavy organismu, terminologie v medicíně, biologická variabilita, preanalytické ovlivnění vyšetření 2. Analytické techniky v klinické chemii, automatizace, certifikace laboratoří, management kvality, Point-of-Care Testing, interpretace dat, klinické studie 3. Imunitní systém, imunologická vyšetření, molekulárně genetická a molekulárně biologická diagnostika, mikrobiologie, sérologie, kultivační techniky 4. Hematologie, hematologická vyšetření v diagnostice, imunohematologie erytrocytů, trombocytů a leukocytů, krevní skupiny, principy histologického hodnocení 5. Analýza aminokyselin, poruchy metabolismu, funkce proteinů, patologické stavy, stanovení celkových proteinů a plazmatických proteinů, analýza proteinů v moči 6. Enzymy, aktivita enzymů, faktory ovlivňující aktivitu enzymů, klinicky významné enzymy, jejich význam a stanovení 7. Sacharidy, metabolismus, hormonální regulace hladiny glukosy, stanovení klinicky významných sacharidů, struktura a funkce lipidů, analýza lipidů v tělních tekutinách 8. Funkce jater, metabolismus v játrech, analýza indikátorů metabolických funkcí jater, klinické aplikace, stanovení bilirubinu 9. Funkce ledvin, transportní procesy, stanovení látek dusíkaté povahy, kreatinin a jeho význam, clearance, moč a její charakteristika 10. Elektrolyty, distribuce vody a elektrolytů v plazmě, stanovení vybraných iontů, celkový oxid uhličitý, osmomolalita, regulace pH, poruchy acido-bazické rovnováhy 11. Hormony, obecná endokrinologie, hormony v těhotenství, analytika hormonů, regulace činnosti svalů, srdce, kardiomarkery, ostatní regulační dráhy, cytokiny, vitaminy 12. Dědičné metabolické poruchy, detekce genetických onemocnění, poškození a zánik buňky, nádorová onemocnění, tumorové markery 13. Využití analytické chemie v klinické farmakologii, farmakokinetika, farmakodynamika, terapeutické monitorování léčiv, analytické metody v evropském lékopise Obsah seminářů: Řešení praktických problémů, vyhodnocování výsledků, statistické rozhodování, referenční meze, certifikace klinických laboratoří, žádanka o klinické vyšetření, informační systémy, screeningové testy, STATIM vyšetření, preanalytická fáze, hladiny markerů a jejich monitoring v průběhu nemoci a ve fázi léčby, návrhy postupů pro klinické hodnocení, praktické ukázky výsledků z klinické analytické chemie, interpretace dat, výpočty v oblasti acidobazické rovnováhy, výpočty a hodnocení clearance, souvislost markerů, legislativa, SÚKL, exkurze na pracoviště klinické analytické chemie Literatura: Bishop M. L., Fody E. P., Schoeff L. E. Clinical Chemistry: Techniques,
UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI
26.11.2014
55 / 93
PŘEDMĚTY - AKREDITAČNÍ SESTAVA 2014/15
Principles, Correlations. Lippincott W&W 2009. Marshall W. J., Bangert S. K. Clinical Biochemistry: Metabolic and Clinical Aspects. Churchill Livingstone 2008. Novák F. Úvod do klinické biochemie. Karolinum, Praha 2002. Racek J. a kol. Klinická biochemie. Galén, Praha 2006. Schneiderka P. a kol. Kapitoly z klinické biochemie. Karolinum, Praha 2004. Zima T. a kol. Laboratorní diagnostika. Galén, Praha 2007.
ACH/KOCHL
Kontrola chemických léčiv
Statut:
Volitelný
Počet kreditů:
4
Forma výuky:
Přednáška,Seminář
Rozsah výuky:
3 HOD/TYD + 1 HOD/TYD
Ukončení:
Zkouška
Garant:
RNDr. Barbora Papoušková, Ph.D.
Obsah: Úvod do farmaceutické výroby léčiv se zaměřením na technologii výroby léčiv. Analytické a fyzikální metody používané ve farmacii (chromatografie, titrační metody, spektrální metody, specifický povrch, sypná a setřesná hustota, ...). Validace a verifikace analytických metod. Stabilita léčiv. Správná laboratorní praxe, oddělení jištění jakosti a registrace léčiv. Lékopis, požadavky státních autorit. Literatura: Český lékopis - SÚKL. European Pharmacopoeia (EP). J. Klimeš. Kontrola léčiv I. a II. J.Klimeš. Kontrolně-analytické hodnocení léčiv lékopisnými metodami. U.S. Pharmacopoeia (USP).
UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI
26.11.2014
56 / 93
PŘEDMĚTY - AKREDITAČNÍ SESTAVA 2014/15
ACH/KRIM
Kriminalistika Criminalistics
Statut:
Volitelný
Počet kreditů:
2
Forma výuky:
Přednáška
Rozsah výuky:
2 HOD/TYD
Ukončení:
Zkouška
Garant:
Doc. RNDr. Vítězslav Maier, Ph.D.
Obsah: Úvod do kriminalistiky Kriminalistická technika Kriminalistická taktika Kriminalistická metodika Úvod do kriminalistiky Cílem je seznámit studenty s teoretickými základy kriminalistiky, historickými kořeny a vývojem samostatné vědní disciplíny, jejichž uplatnění v praxi umožňuje efektivně vyšetřovat jednotlivé kriminalisticky relevantní události. Předmět seznamuje studenty s teorii stop, kriminalistickou dokumentací, kriminalistickou identifikací a jejich významem. Kriminalistická technika Cílem je zdůraznit význam materiálních kriminalistických stop, jejich vyhledávání, fixování, zajišťování a vyhodnocování a seznámit studenty se základy vybraných odvětví kriminalistických disciplín - zejména chemie, biologie, daktyloskopie, trasologie, odorologie. Kriminalistická taktika Cílem je seznámení s pojmy kriminalistická taktika, kriminalistická verze; řízení, organizace a plánování odhalování a vyšetřování; kriminalistická expertiza, ohledání, výslech, konfrontace, prověrka výpovědi na místě, kriminalistická rekognice, kriminalistický experiment, kriminalistická rekonstrukce, prohlídka, pátrání, zadržení a informatika v kriminalistice. Kriminalistická metodika Cílem je seznámit studenty z obecnými teoretickými otázkami metodik vyšetřování jednotlivých druhů trestných činů, s metodikou vyšetřování krádeží, podvodů, loupeží, vražda, sexuálních trestných činů, trestných činů proti měně, drogové kriminality, požárů, výbuchů a havárií, silničních dopravních nehod, hospodářské kriminality, metodika vyšetřování protiprávních činů páchaných mládeží, počítačové kriminality a metodikou vyšetřování organizované kriminality. Literatura: MUSIL, J., KONRÁD, Z., SUCHÁNEK, J. Kriminalistika. Praha: C.H. BECK, 2001. MUSIL, J.. Kriminalistika. Praha: Naše vojsko, 1994. PORADA, V. Kriminalistika. Brno: CERM, 2001. Kriminalistika. Brno: CERM, 2001. PORADA, V. Kriminalistika I. a II. Olomouc : PF UP, 1995. STRAUS, J. Kriminalistická metodika. Plzeň. Nakladatelství A.Čeněk, s.r.o. 2006. STRAUS, J. Kriminalistická taktika. 2. Rozšířené vydání. Plzeň. Nakladatelství A.Čeněk, s.r.o. 2008. STRAUS, J. Kriminalistická technika. 2. Rozšířené vydání. Plzeň. Nakladatelství
UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI
26.11.2014
57 / 93
PŘEDMĚTY - AKREDITAČNÍ SESTAVA 2014/15
A.Čeněk, s.r.o. 2008. STRAUS, J. Kriminalistika, kriminalistická technika. Praha. Kriminalistický ústav Praha.2006. STRAUS, J. Úvod do kriminalistiky. Plzeň. Nakladatelství A.Čeněk, s.r.o. 2004. ŠIMOVCEK, I. Kriminalistika. 2. vyd. Bratislava: Akadémia PZ, 1999. BÁRTA, B., POLÁCEK, J., POUPE, J. Metodika vyšetřování vražd, sebevražd a. CHMELÍK, J. Ohledání místa činu. 2. Vydání. Praha: MV CR, 1999. CHMELÍK, J. Znalecké dokazování. Praha: Policie CR, Úřad vyšetřování pro CR, 2001. KROULÍK, P., STREJC, P., ZEMEK, P., FALTUS, P., VOCHYNA, K. Odhalování a objasňování závažných trestných činu proti zdraví a životu. Praha: Kriminalistický. MUSIL, J.. Metodika vyšetřování jednotlivých druhu trestných činu. Praha:Univerzita Karlova, 1993. MUSIL, J. Některé otázky znaleckého dokazování v trestním řízení a teorie kriminalistické expertizy. Praha: AUC IURIDICA MONOGRAPHIA XX, 1974, 92 s. NEMEC, B.. Učebnice kriminalistiky. Praha: Naše vojsko, 1959-1968. NEMEC, M.. Kriminalistická taktika. Praha: Policejní akademie CR, 1995. NEMEC, M. Organizovaný zločin. Praha: Naše vojsko, 1995. NESVADBA, A. Vyšetrovanie trestných činov vrážd. Bratislava: Akadémia PZ, 2001. PORADA, V., STRAUS, J. Kriminalistický experiment. Soudní inženýrství c.5, 2000. PORADA, V. Teorie kriminalistických stop a identifikace. Praha: Academia, 1987. PRERAD, V. Experiment. Praha: Ústav kriminalistiky PF UK, 1992. PRERAD, V., VYCHODIL, M. Experiment a rekonstrukce trestného činu. Praha:. PRERAD, V., VYCHODIL, M. Vyšetřovací experiment a rekonstrukce trestného činu. PROTIVÍNSKÝ, M., PRERAD, V. Taktika výslechu obviněného a svědka v přípravném řízení. Praha: SNP, 1978. STRAUS, J.. Forenzní biomechanika. Praha: PA CR, 1999. ŠIMOVCEK, I., HLAVA, J. Kriminalistická metodika I - II. Bratislava: Akademie PZ. ŠIMOVCEK, I. Teória kriminalistiky. Bratislava: Iura edition, 2000. TIPLICA, M. Kriminalistická taktika. 2. vyd. Praha: PA CR, 1997. VENHAC, R. Prověrka výpovědi na místě. Praha: Kriminalistický ústav Federální. VYCHODIL, M. Rekonstrukce trestného činu. Praha: Ústav kriminalistiky Právnické.
UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI
26.11.2014
58 / 93
PŘEDMĚTY - AKREDITAČNÍ SESTAVA 2014/15
ACH/MONLH
Monitorování lékových hladin Therapeutic Drug Monitoring
Statut:
Volitelný
Počet kreditů:
2
Forma výuky:
Přednáška
Rozsah výuky:
2 HOD/TYD
Ukončení:
Kolokvium
Garant:
Doc. RNDr. Petr Fryčák, Ph.D.
Obsah: V rámci kurzu je studentům přednášena problematika stanovení léčivých látek v tělních tekutinách za účelem individualizace lékové terapie nastavením vhodného dávkování medikamentu. Důraz je kladen zejména na léčiva s úzkým rozsahem terapeutických koncentrací. Součástí kurzu je jak přehled nejužívanějších postupů předúpravy biologického vzorku, případné separace analytu od matrice a metod následného stanovení, tak i základní informace týkající se klinických aspektů nasazení sledovaných léčiv. Metody předúpravy vzorku. Kapalinová extrakce. Extrakce pevnou fází. Mikroextrakční techniky. Separační metody. Plynová chromatografie, GC/MS. Kapalinová chromatografie, LC/MS. Kapilární elektroforéza. Imunoanalýza. Základy farmakologie, farmakokinetika, ADME model, farmakodynamika. Monitorování hladin " léčiv v chemoterapii zhoubného bujení " antibiotik " antiepileptik " antidepresiv a antipsychotik " imunosupresiv Základy farmokogenomiky. Literatura: Amitava Dasgupta (Ed.). Handbook of Drug Monitoring Methods: Therapeutics and Drugs of Abuse, Humana Press, 2007. Georg Hempel (Ed.). Drug Monitoring and Clinical Chemistry (Handbook of Analytical Separations), Elsevier Science, 2004.
UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI
26.11.2014
59 / 93
PŘEDMĚTY - AKREDITAČNÍ SESTAVA 2014/15
ACH/MTAC
Mikrotechniky v analytické chemii Microtechniques in Analytical Chemistry
Statut:
Volitelný
Počet kreditů:
2
Forma výuky:
Přednáška
Rozsah výuky:
2 HOD/TYD
Ukončení:
Zkouška
Garant:
Doc. RNDr. Jan Petr, Ph.D.
Obsah: 1. Mikroskopie, fluorescenční mikroskopie (derivatizace, imunochemické barvení, vyhodnocování obrazu), histochemie 2. Průtoková cytometrie, laserová mikropreparace 3. Mikroskopie atomárních sil (AFM, SPM), Ramanova spektrometrie a mikroskopické techniky, mechanické operace v nanoměřítku 4. Senzory, mikrosenzory, nanopóry, stochastické senzory 5. Totální mikroanalytické systémy ("microTAS"), laboratoř na čipu ("lab-on-achip"), mikrofluidika, fyzika miniaturizovaných systémů 6. Výroba mikrofluidických zařízení - materiály a technologie 7. Mikrofluidika - tok kapaliny, dávkování látek, separace látek 8. Mikrofluidika - detekční techniky, spojení s MS, regulace toku 9. Aplikace mikrofluidiky - tvorba kapiček ("droplet chemistry"), PCR, sekvenátory, proteomika, 10. Aplikace mikrofluidiky - diagnostika chorob, imunochemie 11. Nízkonákladové čipy (papírové technologie), elektrosmáčení na dielektriku, digitální mikrofluidika 12. Nanočástice a mikročástice v analytické chemii Literatura: C. H. Li. Microfluidic Lab-on-a-Chip for Chemical and Biological Analysis and Discovery. CRC Press, 2005. E. M. Goldys. Fluorescence Applications in Biotechnology and Life Sciences. Wiley-Blackwell, 2009. J. P. Landers. Handbook of Capillary and Microchip Electrophoresis and Associated Microtechniques. CRC Press, 2007. P. Tabeling. Introduction to Microfluidics. Oxford University Press, 2006.
UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI
26.11.2014
60 / 93
PŘEDMĚTY - AKREDITAČNÍ SESTAVA 2014/15
ACH/PP
Základy práva Fundamentals of law
Statut:
Volitelný
Počet kreditů:
2
Forma výuky:
Přednáška,Seminář
Rozsah výuky:
1 HOD/TYD + 1 HOD/TYD
Ukončení:
Kolokvium
Garant:
Obsah: Předmět obsahově zahrnuje základní pojmy a instituty platné ve veřejné správě a hlubší orientaci v právním odvětví zejména práva správního, ale i dalších souvisejících právních odvětvích. Předmětem zájmu tedy budou jak teoretická východiska, tak i praktické pohledy na fungování veřejné správy v ČR.Přednášky budou doplňovány i praktickými právními případy zaměřenými na následnou schopnost absolventa aplikovat příslušný právní předpis na konkrétní právní situaci tak, aby zejména v rozhodovací praxi na úseku veřejné správy byl vytvořen předpoklad kvalifikované tvorby správního aktu, a to jak charakteru konkrétního, tak charakteru normativního. Obsahově bude předmět strukturován do tří základních bloků, které budou zahrnovat teoretická východiska, orientaci v organizaci a fungování veřejné správy v ČR a v neposlední řadě i právní orientaci na vybraných konkrétních usecích veřejné správy. 1. Úvod do předmětu, základní pojmy a instituty, prameny právní úpravy, ústavní a zákonný rámec fungování veřejné správy v ČR. 2. Veřejná správa a správní právo, postavení práva správního v rámci právního řádu. Norma správního práva, její působnost věcná, osobní, územní a časová. 3. Veřejná správa, její členění. Státní správa. Samospráva, typy samosprávy v ČR. 4. Organizace veřejné správy v ČR. 5.Územní samospráva, základní znaky. Evropská charta místní samosprávy. 6. Obec jako základní územní samosprávný celek. Obec a její území, obec a občan, obec a její ekonomický základ. Orgány obce. 7. Samostatná působnost obce. Přenesená působnost obce, správní obvod. 8. Kraj jako vyšší územní samosprávný celek, orgány a rozsah jeho působnosti. 9. Normotvorná pravomoc na úrovni místní (územní) veřejné správy, obecně závazná vyhláška, nařízení, legislativně technická pravidla. 10.Projevy činnosti veřejné správy. 11.Správní proces a veřejná správa. Správní řízení. Správní trestání. 12.Správní právo hmotné, zvláštní část, vybrané úseky právní úpravy veřejné správy. 13.Správní právo hmotné, zvláštní část, vybrané úseky právní úpravy veřejné správy. 14.Právní záruky zákonnosti ve veřejné správě. Veřejná správa a Evropské aspekty jejího fungování. Literatura: Kubů, L., Osina, P., Grygar, J. Teorie práva I. UP Olomouc, 2003. Pekárek. Právo životního prostředí.
UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI
26.11.2014
61 / 93
PŘEDMĚTY - AKREDITAČNÍ SESTAVA 2014/15
ACH/PTECH
Potravinářské technologie a biotechnologie Food Technologies and Biotechnologies
Statut:
Volitelný
Počet kreditů:
3
Forma výuky:
Přednáška
Rozsah výuky:
2 HOD/TYD
Ukončení:
Zkouška
Garant:
Doc. Ing. František Buňka, Ph.D.
Obsah: Úvod do potravinářských technologií. Základy procesů při výrobě potravin.Cereální suroviny a mlynářství, pekárenské technologie, výroba těstovin a trvanlivého pečiva.Technologie cukru, technologie čokoládových a nečokoládových cukrovinek, technologie škrobu a výrobků ze škrobu. Principy konzervárenských technologií, balení potravin. Zpracování ovoce, zeleniny a brambor.Sladařství a pivovarství.Lihovarství, výroba lihovin a droždí. Výroba vína, výroba nealkoholických nápojů.Technologie masa a masných výrobků.Technologie drůbeže a drůbežích výrobků, technologie zpracování ryb a rybích výrobků. Technologie zpracování vajec a výrobků z vajec. Technologie zpracování konzumního mléka, smetany, másla a fermentovaných mléčných výrobků. Technologie výroby sýrů a ostatních mléčných výrobků. Literatura: Kadlec, P. Co byste měli vědět o výrobě potravin?. Ostrava, Key Publishing, 2009. ISBN 978-80-7418-051-4. Kadlec, P. Technologie potravin I. Praha, VŠCHT, 2002. ISBN 80-7080-509-9. Kadlec, P. Technologie potravin II. Praha, VŠCHT, 2002. ISBN 80-7080-510-2.
UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI
26.11.2014
62 / 93
PŘEDMĚTY - AKREDITAČNÍ SESTAVA 2014/15
ACH/SEAN
Senzorická analýza Sensory analysis
Statut:
Volitelný
Počet kreditů:
1
Forma výuky:
Přednáška
Rozsah výuky:
1 HOD/TYD
Ukončení:
Kolokvium
Garant:
Obsah: Význam a principy senzorické analýzy potravin. Rozdělení smyslových orgánů významných pro analýzu potravin. Smysl chuťový - hodnocení chuti. Smysl čichový - hodnocení pachu. Smysl zrakový - hodnocení vzhledu, barvy aj. Smysl sluchový, hmatový, smyl pro chlad, smysl pro teplo. Dráždění receptorů, vedení a zpracování vzruchu.Vztahy mezi intenzitou podnětu a intenzitou vjemu, hedonické hodnocení vjemu.Požadavky a podmínky pro senzorickou analýzu. Výběr a výcvik hodnotitelů.Senzorické metody zkoumání a hodnocení potravin. Praktické ukázky z výběru a výcviku hodnotitelů Literatura: Hrabě J., Kříž O., Buňka F. Statistické metody v senzorické analýze potravin. Vyškov, VVŠPV, 2001. Ingr I., Pokorná J., Valentová H. Senzorická analýza potravin. Brno, MZLU, 1997. Jarošová A. Senzorické hodnocení potravin. Brno, MZLU, 2001. Neumann R.,Molnar P., Arnold S. Senzorické zkúmanie potravín. Bratislava, Alfa, 1990. Pokorný J. Metody senzorické analýzy potravin a stanovení senzorické jakosti. Praha, ÚZPI, 1993. ACH/SEI
Separace a identifikace izomerů Separation and Identification of Isomers
Statut:
Volitelný
Počet kreditů:
2
Forma výuky:
Přednáška
Rozsah výuky:
2 HOD/TYD
Ukončení:
Zkouška
Garant:
Doc. RNDr. Vítězslav Maier, Ph.D.
Obsah: Cílem předmětu je seznámit se s moderními analytickými, semipreparativními a preparativními technikami separace izomerů a technikami jejich identifikace. Literatura:
UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI
26.11.2014
63 / 93
PŘEDMĚTY - AKREDITAČNÍ SESTAVA 2014/15
ACH/SEIZ
Separace a identifikace izomerů
Statut:
Volitelný
Počet kreditů:
2
Forma výuky:
Přednáška
Rozsah výuky:
2 HOD/TYD
Ukončení:
Zkouška
Garant:
Doc. RNDr. Vítězslav Maier, Ph.D.
Obsah: Izomerie - druhy izomerií, fyzikálně chemické vlastnosti izomerů. Stereochemie a názvosloví izomerů. Úvod do problematiky separačních metod izomerů užívaných v průmyslovém a laboratorním měřítku.Separace izomerů v laboratorním měřítku. Separace optických izomerů. Přímé a nepřímé metody separace enantiomerů. Volba vhodné separační techniky pro separace enantiomerů.Úvod do chemie a fyzikálních vlastností chirálních selektorů. Volba vhodného chirálního selektoru. Imobilizace chirálních selektorů na vhodný nosič. Návrh a syntéza nových chirálních selektorů.Separace enantiomerů s využitím HPLC. Přímé a derivatizační metody. Výpočet optické čistoty. Volba vhodného chirálního selektoru. Detektory využívající polarizované elektromagnetické záření. Problematika identifikace separovaných enentiomerů v HPLC.Kapilární elektromigrační techniky v separaci enantiomerů. Přímé a nepřímé elektromigrační metody pro separaci enantiomerů. Srovnání HPLC a CE pro separaci enantiomerů. Technika částečného plnění kapiláry elektrolytem se selektorem. Plynová chromatografie a superkritická fluidní chromatografie v separaci enantiomerů. Derivatizace. Spektrální identifikační techniky izomerů - NMR, IR, Ramanova spektrometrie, Roentgenová spektrometrie, cirkulární dichroismus a optická rotační disperze.Studium energetických bariér vzájemné konverze izomerů.Separace polohových a geometrických izomerů. Techniky selektivní extrakce izomerů. Molecular imprinted technique. Enantioselektivní biosenzory.Cooksova kinetická metoda separace izomerů. Možnosti separace a identifikace izomerů s pomocí MS hmotnostní spektrometrie. Průmyslová separace izomerů. Příklady farmaceutických a dalších výrob užívající separace izomerů. Literatura: A. Berthod. Chiral recognition in separation methods: Mechanisms and Applications. 2010. ISBN 10: 3642124445. A. Van Eeckhaut. Chiral Separations by Capillary Electrophoresis, CRC Press (2009). B. Chankvetadze. Capillary Electrophoresis in Chiral Analysis (1997). E. W. Ciurczak. Molecular Spectroscopy Workbench: Advances, Applications, and Practical Advice on Modern Spectroscopic Analysis. 1998. ISBN 10: 0471180815. G. Subramanian. Chiral separation technique. 2006. ISBN ISBN-10: 35273150. I. W. Wainer. Drug Stereochemistry, Marcel Dekker (1993). K. Jinno. Chromatographic Separations Based on Molecular Recognition, Wiley-VCH (1997). M.S. Lee. Mass spectrometry Handbook. 2012. ISBN 10: 047053673X. R.W. Souter. Chromatographic Separations of Stereoisomers, CRC Press (1985). S. Ahuja. Chiral Separation Methods for Pharmaceutical and Biotechnological Products. 2010. ISBN 10: 0470406917. 5. Hassan Y. Aboul-Enein, Hassan Y. Aboul-Enein. Chiral Separations by Liquid Chromatography: Theory and Applications, CRC Press (2003).
UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI
26.11.2014
64 / 93
PŘEDMĚTY - AKREDITAČNÍ SESTAVA 2014/15
ACH/SFECH
Superkritická fluidní extrakce a chromatografie Supercritical Fluid Extraction and Chromatography
Statut:
Volitelný
Počet kreditů:
2
Forma výuky:
Přednáška
Rozsah výuky:
1 HOD/TYD
Ukončení:
Kolokvium
Garant:
Doc. RNDr. Lubomír Čáp, CSc.
Obsah: Superkritický bod a jeho okolí, superkritické kapaliny a jejich fyzikální vlastnosti(hustota, viskozita, difuzivita, rozpustnost). Chemické vlastnosti superkritických tekutin, reakce v superkritickém médiu. Teoretické a praktické aspekty superkritické fluidní extrakce a její ovlivňování (podstata vymývání, rozpustnost, modifikátory, derivatizace, vliv teploty a tlaku). Instrumentace SFE (extrakční cely, restriktory, záchyt). Aplikace SFE (průmyslové i laboratorní). Superkritická fluidní chromatografie SFC (srovnání s GC a HPLC, instrumentace, kolony, restriktory, detektory, aplikace) Literatura: Analytical Supercritical Fluid Extraction : M.D.L. De Castro, M. Valcárel, M.T. Tena, Springer-Verlag, Berlin Heideberg 1994. T.L. Chester, J.D. Pinkston, D.E. Raynie: Anal. Chem. 70, (1998) 301R-319R.
UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI
26.11.2014
65 / 93
PŘEDMĚTY - AKREDITAČNÍ SESTAVA 2014/15
ACH/ZCHEL
Základy chemie léčiv Basics of pharmaceutical chemistry
Statut:
Volitelný
Počet kreditů:
2
Forma výuky:
Přednáška
Rozsah výuky:
2 HOD/TYD
Ukončení:
Zkouška
Garant:
Doc. RNDr. Jan Petr, Ph.D.
Obsah: Úvod do chemie léčiv, definice pojmů, dělení farmakologie, úvod do farmakochemie, lékové formy, chiralita a léčiva, základy obecné farmakologie, farmakokinetika, farmakodynamika, metabolismus léčiv, problematika vývoje nových léčiv, vyhledávání biologicky aktivních látek, kombinatoriální přístupy, molekulární modelování, izolace látek z přírodních zdrojů, testování a hodnocení léčiv, registrace léčiv, správná výrobní praxe, kontrolní orgány, speciální farmakologie, analgetika, léčiva ovlivňující centrální nervovou soustavu, léčiva ovlivňující vegetativní nervový systém, lokální anestetika a myorelaxancia, antialergika a antihistaminika, léčiva oběhové soustavy, léčiva trávicí a vylučovací soustavy, antitusika a expektorancia, látky používané k prevenci a terapii infekčních a parazitárních chorob, cytostatika, vitaminy, hormony, moderní léčiva, bioléčiva, molekulární biologie ve vývoji léčiv, základy molekulární biologie, buněčná terapie, genová terapie Literatura: Český lékopis. MZ ČR, 2009. Fusek M., Vítek L., Blahoš J., Hajdúch M., Ruml T. a kol. Biologická léčiva. Grada, 2012. Hampl F., Rádl S., Paleček J. Farmakochemie. VŠCHT Praha, 2010. Komárek P., Rabišková a kol. Technologie léků. Galén, 2006. Lincová D., Farghali a kol. Základní a aplikovaná farmakologie. Galén, 2007. Lullman H., Mohr K., Hein L. Barevný atlas farmakologie. Grada, 2012. Martínková J. a kol. Farmakologie pro studenty zdravotnických oborů. Grada, 2007.
UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI
26.11.2014
66 / 93
PŘEDMĚTY - AKREDITAČNÍ SESTAVA 2014/15
EKO/ZEK
Základy ekologie Basic ecology
Statut:
Volitelný
Počet kreditů:
2
Forma výuky:
Přednáška
Rozsah výuky:
2 HOD/TYD
Ukončení:
Zkouška
Garant:
Mgr. Monika Mazalová, Ph.D.
Obsah: Úvod do studia ekologie: základní pojmy, definice, metody, proximální a ultimátní vysvětlení. Ekologické faktory a zdroje. Prostředí a organismy, adaptace, evoluce, konvergence, divergence, speciace. Populace, dynamika populací, interakce populací ve vztahu k prostředí. Společenstva, mezidruhové interakce, potravní sítě, diverzita, ekologické stabilita. Ekosystémy, tok energie a koloběh látek, biotocké a abiotické složky, funkční procesy, ekologické mechanismy, potravní vazby, produktivita, dekompozice. Aktuální problémy životního prostředí a ochrany přírody. Literatura: Begon, M., Harper, J., Townsend, C.R. Ekologie. Jedinci, populace, společenstva. Vydavatelství Univerzity Palackého. 949 pp., 1997. Laštůvka, Z., Krejčová, P. Základy ekologie,BRNO, 2000,184 s. Storch, D., Mihulka, S. Úvod do současné ekologie. KBB/MBMET
Molekulárně biologické vyšetřovací metody Molecular Biology Examination Methods
Statut:
Volitelný
Počet kreditů:
2
Forma výuky:
Přednáška,Seminář
Rozsah výuky:
1 HOD/TYD + 1 HOD/TYD
Ukončení:
Kolokvium
Garant:
Obsah: Izolace DNA, RNA, proteinů, Kvantifikace DNA, Polymerázová řetězová reakce (PCR), Southern blotting, Northern blotting, Sekvenování DNA, Western blotting, DNA typizace ? minisatelity, mikrosatelity, Klonování genů, Forenzní aplikace SNP, X-chromosom, mitochondriální DNA, Y-chromosom, profiling proteinů Identifikace neznámého pachatele pomocí DNA fingerprintingu Literatura: Carracedo A. Forensic DNA typing protocols (series: Methods in Molecular Biology, vol. 297). Tottowa, NJ, USA, 2005. ISBN 1-59259-867-6. Lincoln P.J., Thomson J. Forensic DNA profiling protocols (series: Methods in molecular biology, Volume 98). 1998. ISBN 978-0896034433. Rapley R., Whitehouse D. Molecular Forensics. 2007. ISBN 978-0470024959.
UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI
26.11.2014
67 / 93
PŘEDMĚTY - AKREDITAČNÍ SESTAVA 2014/15
KBC/BAM
Pokročilé biochemické a biotechnologické metody Advanced Biochemical and Biotechnological Methods
Statut:
Volitelný
Počet kreditů:
4
Forma výuky:
Přednáška
Rozsah výuky:
2 HOD/TYD
Ukončení:
Zkouška
Garant:
RNDr. Ondřej Plíhal, Ph.D.
Obsah: Rámcový program: Metody stanovení prostorové struktury proteinů. Úvod do metabolomiky. Úvod do analýzy proteomu. Glykomika a lipidomika. Biosenzory. Úvod do konfokální a elektronové mikroskopie. Základy klonování a genového inženýrství. Principy a využití qPCR. Buněčné kultury a produkce rekombinantních proteinů. Genetická transfomace obilovin. Geneticky modifikované organismy. Literatura: Dle doporučení přednášejících. .
UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI
26.11.2014
68 / 93
PŘEDMĚTY - AKREDITAČNÍ SESTAVA 2014/15
KBC/BIOS
Biosenzory Biosensors
Statut:
Volitelný
Počet kreditů:
3
Forma výuky:
Přednáška
Rozsah výuky:
2 HOD/TYD
Ukončení:
Zkouška
Garant:
Doc. RNDr. Ludmila Zajoncová, Ph.D.
Obsah: Definice biosenzoru, historie, rozdělení, typy biosenzorů, charakteristika ideálního biosenzoru, základní pojmy, podmínky měření s biosenzory. Elektrochemické biosenzory, enzymové elektrody, referentní, pomocná a pracovní elektroda, potencimetrické bioelektrody, ISFETy. Amperometrické biosenzory, měření kyslíku, peroxidu vodíku a NADH, biosenzory s oxidasami a dehydrogenasami, přímý přenos elektronů z enzymů na elektrodu pomocí mediátorů. Měření impedance a konduktometrické biosenzory. Voltametrické techniky. Optické biokatalytické sensory, bioluminiscence, světlovody a optická vlákna, kalorimetrické biosenzory. Enzymové biosenzory, stanovení substrátů, měření enzymových aktivit, inhibitory enzymových sensorů, aplikace, mikrobiální a tkáňové a receptorové sensory. Afinitní biosenzory s nepřímou detekcí pomocí značek, Imunosenzory, hybridizační biosenzory pro stanovení nukleových kyselin a detekci sekvencí nukleotidů. Přímé optické afinitní sensory, využití exponenciální vlny a resonance povrchových plasmonů ke sledování bioafinitních interakcí v reálném čase. Integrované optické systémy, interferometry a podobné techniky, oblast využití afinitních biosenzorů. Piezoelektrické systémy a jejich aplikace. Protilátky a imunosenzory. Imobilizace biomolekul při konstrukci biosenzorů, kovalentní vazba biomolekul, příprava membrán. Elektropolymerace. Aktivace povrchu sensorů, kovalentní vazba biomolekul, miniaturizace a masová produkce biosenzorů, sítotisk, litografie, biosenzory jako součást integrovaných analytických systémů, biočipy. Komerčně dostupné biosenzory, perspektivy. Literatura: Cass A.E.G. Biosensors. A Practical Approach, Oxford University Press, 1990. Cass T., Ligler F.S. Immobilized Biomolecules in Analysis A practical approach. Oxford University Press, 1998. Göpel W., Hesse J., Zemel J.N. A comprehensive Survey, Vols. 2,3, VCH, Weinheim. Skládal P. Biosensory. MU Brno,, 1999.
UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI
26.11.2014
69 / 93
PŘEDMĚTY - AKREDITAČNÍ SESTAVA 2014/15
KBC/BPOL
Struktura a funkce biomakromolekul Structure and Function of Biomacromolecules
Statut:
Volitelný
Počet kreditů:
3
Forma výuky:
Přednáška
Rozsah výuky:
2 HOD/TYD
Ukončení:
Zkouška
Garant:
Prof. RNDr. Ivo Frébort, CSc., Ph.D.
Obsah: Struktura proteinů. Primární a sekundární struktury. Fibrilární proteiny. Globulární proteiny. Terciární a kvarterní struktura. Určení prostorové struktury pomocí krystalografie a rentgenostrukturní analýzy a pomocí NMR. Skládání proteinů. Protein-protein interakce. Struktura nukleových kyselin. Interakce DNA/RNA-protein. Strukturní a zásobní polysacharidy. Glykoproteiny a proteoglykany. Neuraminová kyselina. Lipidy, lipidové agregáty a biologické membrány. Signální komplexy a signalizace na buněčných membránách. Literatura: Cooper G. M. The cell. A molecular approach. ASM Press, Washington DC, USA, 1997. Voet D., Voet J. G. Biochemie, Victoria Publishing Praha, 1995 (respektive anglická verze).
UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI
26.11.2014
70 / 93
PŘEDMĚTY - AKREDITAČNÍ SESTAVA 2014/15
KBF/BIOEN
Bioenergetika Bioenergetics
Statut:
Volitelný
Počet kreditů:
3
Forma výuky:
Přednáška
Rozsah výuky:
2 HOD/TYD
Ukončení:
Zkouška
Garant:
Prof. RNDr. Petr Ilík, Ph.D.
Obsah: Redoxní potenciál přenašečů elektronů v biologických systémech. Zavedení chemického potenciálu. Změna Gibbsovy energie při chemické reakci. Přeměna chemické energie na elektrickou. Nernstova rovnice. Definice standardního redoxního potenciálu. Redoxní potenciál membránových přenašečů elektronů. Jednoa dvouelektronové elektronové přenašeče v biologických systémech. Měření redoxního potenciálu. Přenos elektronů a protonů v chloroplastech a mitochondriích. Oxidativní a fotosyntetická fosforylace, Z-schéma fotosyntézy, cyklický a necyklický elektronový transport, spřažení elektronového a protonového transportu, tvorba ATP. Mitochondriální transport elektronů. Komplex I - IV, ATP-syntáza. Bakteriální respirace. Chemiosmotická hypotéza. Recepce světla v biologii. Oko a sítnice u obratlovců. Sítnice, tyčinky a čípky. Fotoreceptorní pigmenty. Cyklus rodopsinu. Molekulární mechanismus fotorecepce. Oko u bezobratlých. Fotorecepce u halobakterií, bakteriophodopsin. Detekce světla rostlinami. Fytochrom a jeho role v rostlinách. Kontraktilní systémy v biologii. Druhy svalů, struktura svalů a svalové buňky. Sarkomer, aktin, myosin, troponiny, tropomyosin. Molekulární mechanismus svalové kontrakce. Energetika svalové činnosti. Hillova rovnice. Cytoskelet. Mikrotubuly, mikrofilamenta, membránový a jaderný skelet. Recepce zvuku. Ucho - vnější, střední a vnitřní, jejich fyzikální funkce, Cortiho orgán, vnitřní a vnější vláskové buňky, mechanismus zúžení rezonanční křivky, teorie detekce zvuku. Generace zvuku hlasivkami. Smyslové orgány hmatu, čichu a chuti. Hlavní a přídavný čichový systém, čichová sliznice, čichové receptory, čichová signální dráha. Mechanoreceptory, rychle a pomalu se adaptující receptory. Chuťové pohárky. Molekulární mechanismus detekce chuti. Termogeneze. Hnědá tuková tkáň, molekulární mechanismus termogeneze, membránový UCP protein. Literatura: Buchanan BB, Gruissem W, Jones RL. Biochemistry & Molecular Biology of Plants. American Society of Plant Physiologists, Rockville, Maryland, 2000. Nicholls and Fergusson. Bioenergetics 4. Academic Press, 2013. Nobel, P.S. Physicochemical and Environmental Plant Physiology. Academic Press, San Diego et al., 1999. Silbernagl, S., Despopoulos, A. Atlas fyziologie člověka. Grada Avicenum, Praha, 2005.
UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI
26.11.2014
71 / 93
PŘEDMĚTY - AKREDITAČNÍ SESTAVA 2014/15
KEF/PRFA1
Přístrojová fyzika 1 Instrumental Physics 1
Statut:
Volitelný
Počet kreditů:
2
Forma výuky:
Přednáška,Cvičení
Rozsah výuky:
2 HOD/TYD + 1 HOD/TYD
Ukončení:
Zápočet
Garant:
Mgr. Dalibor Jančík, Ph.D. Prof. RNDr. Miroslav Mašláň, CSc.
Obsah: 1. Struktura měřícího řetězce. Převodníky fyzikálních veličin na elektrické. Jejich statické a dynamické charakteristiky a zmenšování chyb. Signály a jejich charakteristiky. 2. Senzory (detektory, převodníky) viditelného světelného záření. Tepelné a fotoelektrické detektory (fotonka, fotonásobič, fotorezistor, fotodioda). 3. Senzory teploty. Odporové, polovodičové, termoelektrické, pyroelektrické teploměry. Teplotní stupnice IT90. 4. Detekce ionizujícího záření. Scintilační, plynové a polovodičové detektory. Detekce nabitých částic, fotonů záření gama, neutronů. 5. Senzory mechanických veličin 6. Vakuová technika. Získávání vakua, typy vývěv. Měření nízkých tlaků. Konstrukce vakuových aparatur. 7. Nízkoteplotní měření. Získávání nízkých teplot. Specifika měření nízkých teplot. Kryostaty. Literatura: Ďad´o, S., Kreidl, M. Senzory a měřící obvody. ČVUT Praha, 1996. Dubravcová, V. Vákuová a ultra vakuová technika. Alfa Bratislava, 1992. Gerndt, J. Detektory ionizujícího záření. ČVUT Praha, 1994. Jelínek, J., Málek, Z. Kryogenní technika. Praha, SNTL, 1982. KAdlec, K., KMínek, M. Měřící a řídící technika. Pátý, L., Petr, J. Vakuová technika. ČVUT Praha, 1990. Ripka, P.,Ďado, S., Kreidl, M., Novák, J. Senzory a převodníky. ČVUT, 2005.
UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI
26.11.2014
72 / 93
PŘEDMĚTY - AKREDITAČNÍ SESTAVA 2014/15
KEF/PRFA2
Přístrojová fyzika 2 Instrumental Physics 2
Statut:
Volitelný
Počet kreditů:
3
Forma výuky:
Přednáška,Cvičení
Rozsah výuky:
2 HOD/TYD + 1 HOD/TYD
Ukončení:
Zkouška
Garant:
Mgr. Dalibor Jančík, Ph.D.
Obsah: 1. Analogové zpracování signálů z detektorů. Typy zesilovačů. Integrace a derivace signálů. Amplitudová a časová analýza signálů. 2. Číslicové zpracování signálů. Logické obvody. 3. Digitálně-analogové a analogově digitální převodníky. 4. Číslicové měřící přístroje. Digitální osciloskopy. Měření času, frekvence, fázového posunu. Spektrální analyzátory. 5. Automatizační měřící systémy CAMAC, NIM, VXI. Virtuální měřící přístroje. Literatura: Čejka, M. Elektronické měřicí systémy. VUT-FEKT, 2002. Haasz. V., Roztočil J., Novák J. Číslicové měřící systémy. ČVUT, 2002. Kesl, J. Elektronika 1 - analogová technika. BEN - technická literatura, 2004. Kesl, J. Elektronika 3 - číslicová technika. BEN - technická literatura, 2004. Mašláň, M., Žák, D. Analogové obvody. Olomouc, 1996. Mašláň, M., Žák, D. Logické obvody. Olomouc, 1994. Podroužek, V. Analogové obvody a převodníky. Skripta FEI VUT. UREL FEI VUT, Brno, 2000. Vedral, J. Fischer. Elektronické obvody pro měřící techniku. ČVUT Praha, 1999.
UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI
26.11.2014
73 / 93
PŘEDMĚTY - AKREDITAČNÍ SESTAVA 2014/15
KFC/FF
Fotochemie a fotoelektrochemie Photochemistry and Photoelectrochemistry
Statut:
Volitelný
Počet kreditů:
3
Forma výuky:
Přednáška,Seminář
Rozsah výuky:
2 HOD/TYD + 1 HOD/TYD
Ukončení:
Zkouška
Garant:
Doc. Mgr. Pavel Banáš, Ph.D. Doc. RNDr. Libor Kvítek, CSc.
Obsah: Kromě popisu chemických přeměn vyvolaných excitací je věnována pozornost i procesu opačnému, tj. tvorbě excitovaných stavů při chemických reakcích.Výklad reakčních mechanismů jednotlivých fotochemických reakcí je omezen ve prospěch obecných teoretických základů fotochemie a fyzikálně chemických experimentálních technik studia fotochemických procesů. Pro získání uceleného přehledu fotochemické problematiky jsou zařazeny i vybrané partie chemie volných radikálů, zejména kyslíkových. Probírány jsou přírodní fotochemické děje, řada aplikací v technologické praxi a fotodynamický jev (medicínská aplikace). Elektrochemická část přednášky zahrnuje teorii excitace polovodičových elektrod a novější aplikace těchto elektrod, jako jsou např. Grätzelovy články. 1. Tvorba a deaktivace excitovaných stavů2. Přenosy elektronové excitační energie a zhášení3. Teorie fotochemických reakcí4. Experimentální metody fotochemie, zdroje záření, reaktory, záblesková fotolýza,5. Přehled mechanismů fotochemických reakcí6. Reaktivní formy kyslíku a jejich reaktivita singletový kyslík, superoxidový, peroxidový a hydroxylový radikál7. Chemiluminiscence teorie, mechanismy a použití chemiluminiscenčních reakcí8. Fotochemie beze světla9. Fotochemické procesy v technické praxi,fotografické a fotolitografické postupy10. Medicinské a environmentální aspekty fotochemie, fotosyntéza, degradace polymerů11. Polovodičové elektrody - typy, vlastnosti a fotoexcitace polovodičových elektrod12. Fotoelektrochemické procesy- štěpení vody, Grätzelovy články13. Elektrogenerovaná chemiluminiscence- využití ve fyzikální a analytické praxi Literatura: 1. Lapčík L., Pelikán P., Čeppan M.:. Fotochemické procesy, . Alfa Bratislava, 1989. 2. Adam W., Cilento G.:. Chemical and biological generation of excited states. Academic Press New York, 1982. 3. Kopecký J., Pancíř J.:. Organická fotochemie v obrázcích, schematech a tabulkách. Academia Praha, 1987. 4. Klán P.:. Organická fotochemie. Skripta Masarykovy Univerzity Brno, 2001.
UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI
26.11.2014
74 / 93
PŘEDMĚTY - AKREDITAČNÍ SESTAVA 2014/15
KFC/HS
Heterogenní systémy Heterogenous Systems
Statut:
Volitelný
Počet kreditů:
2
Forma výuky:
Přednáška
Rozsah výuky:
2 HOD/TYD
Ukončení:
Zkouška
Garant:
Doc. RNDr. Libor Kvítek, CSc.
Obsah: Na základě podrobného rozboru pojmu povrchová energie je vystavěn popis povrchových jevů a jejich praktických aplikací včetně základních měřících metod. Důležitá část přednášky je věnována problematice adsorpce a povrchově aktivních látek. Další část přednášky se zabývá základy problematiky vzniku a růstu nové fáze a kinetiky heterogenních reakcí. Poslední část je věnována aplikaci získaných poznatků na popis vzniku a fyzikálně chemických vlastností koloidních soustav.Povrchová energie a mezimolekulární interakce v kondenzované fázi. Vliv zakřivení povrchu na rovnováhu v jednosložkové soustavě. Metody stanovení povrchové energie. Termodynamika adsorpce - Gibbsova rovnice, struktura a vlastnosti adsorpčních vrstev. Adsorpce na povrchu pevné fáze, izoterma BET, rtuťová porozimetrie. Povrchová energie v třífázové soustavě, smáčení. Klasifikace povrchově aktivních látek a jejich využití při řízení procesu smáčení. Homogenní nukleace a heterogenní nukleace, kinetika vzniku zárodků nové fáze. Základy kinetiky heterogenních reakcí. Termodynamika tvorby micel, solubilizace. Vznik a stabilita koloidních soustav. Molekulárně kinetické, optické, elektrické a reologické vlastnosti koloidů. Literatura: 1. E. D. Ščukin, A.V. Percov, E. A. Amelinová :. Koloidní chemie. Academia Praha, 1992. 2. J. Mollin :. Heterogenní systémy II., skripta UP Olomouc. Olomouc. 3. P. C. Hiemenz :. Principles of colloid and surface chemistry, . Marcel Dekker, 1988. 4. R. Brdička, J. Dvořák :. Základy fysikální chemie. Academia, Praha, 1977. 5. R. J. Hunter :. Foundations of Colloid Science. Oxford, 2001.
UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI
26.11.2014
75 / 93
PŘEDMĚTY - AKREDITAČNÍ SESTAVA 2014/15
KFC/CHS
Chemický software Software for Chemistry
Statut:
Volitelný
Počet kreditů:
3
Forma výuky:
Cvičení
Rozsah výuky:
2 HOD/TYD
Ukončení:
Kolokvium
Garant:
Prof. RNDr. Michal Otyepka, Ph.D.
Obsah: Studenti se vedle software na kreslení chemických struktur, tvorbu reálných modelů molekul, výpočet fyzikálně chemických vlastností seznámí i s programy, které umožňují pojmenování chemické struktury, databázovými programy určenými pro chemiky atp. Část kurzu je věnována i chemickým zdrojům na Internetu. Obsah cvičení se bude dynamicky vyvíjet a sledovat nejmodernější trendy v dané oblasti. 1. Kreslení chemických vzorců a rovnic 2. Kreslení chemických aparatur 3. Popis a zobrazení molekuly v 3D prostoru 4. Tvorba reálného modelu molekuly 5. Databáze struktur molekul 6. Výpočty fyzikálně chemických vlastností 7. Chemicky orientované databáze 8. Chemické zdroje na Internetu 9. Zobrazení a tisk 3D modelů molekul Literatura: http://antas.agraria.uniss.it/software.html. http://chem.yonsei.ac.kr/~lsk/software.html. http://www.chem.swin.edu.au/chem_ref.html. www.claessen.net/chemistry/soft_en.html.
UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI
26.11.2014
76 / 93
PŘEDMĚTY - AKREDITAČNÍ SESTAVA 2014/15
KFC/MOMO
Molekulární modelování Molecular Modeling
Statut:
Volitelný
Počet kreditů:
2
Forma výuky:
Seminář
Rozsah výuky:
2 HOD/TYD
Ukončení:
Kolokvium
Garant:
Prof. RNDr. Michal Otyepka, Ph.D.
Obsah: Během semináře řeší studenti samostatně pod vedením instruktorů řadu praktických příkladů. I Teorie 1 Co je výpočetní chemie? 2 Metody výpočetní chemie (velmi stručný úvod) 2.1 Ab initio výpočty 2.2 Semiempirické metody 2.3 Molekulová mechanika 2.4 Molekulové simulace 2.5 Statistická termodynamika (extrémně stručně) II Praktické úlohy 3 Úvod do PES, formáty zápisu souřadnic systému (PDB, XYZ, Z-matice) 4 Úlohy z kvantové chemie 4.1 Stavba molekul 4.2 Optimalizace vs. Single Point 4.3 Sken povrchu potenciální energie 4.4 Mezimolekulové komplexy 4.5 Výpočet frekvencí a termodynamických veličin 5 Úlohy z molekulové mechaniky 5.1 Vliv solventu na strukturu peptidu 5.2 Sken povrchu potenciální energie podle jednoho parametru - malé molekuly (HOOH, aceton, ...) 5.3 Sken povrchu potenciální energie podle dvou parametrů (Ramachandran, peptidy) 5.4 Rafinace struktury biomolekul - dostavení vodíků, jejich optimalizace, optimalizace postranních řetězců, constrain vs. restrain 6 Úlohy z molekulové simulace 6.1 Hledání globálního energetického minima organické molekuly 6.2 Fluktuační veličiny - Cp boxu explicitních vod 6.3 Krátká simulace molekulové dynamiky peptidu či proteinové domény 7 Úlohy z bioinformatiky 7.1 Databáze proteinů a nukleových kyselin RCSB 7.2 Visual Molecular Dynamics 7.3 PyMOL 7.4 Přiřazení - párové, vícenásobné (podobnost peptidových sekvencí) 7.5 Dostavování chybějících částí systému (proteiny i NA) 8 Bimolekulární kanály 8.1 MOLE Literatura: Leszczynski J. (ed.). Computational Molecular Biology. Elsevier, Amsterdam, 1999. Vinter J.G., Mark G. (eds.). Molecular Modelling and Drug Design. CRC Press, Boca Raton, 1994.
UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI
26.11.2014
77 / 93
PŘEDMĚTY - AKREDITAČNÍ SESTAVA 2014/15
Burket U., Alinger N. Molecular Mechanics. ACS, Washington 1982, 1982. Leach A.R. Molecular Modelling, Principles and Applications. Longman, Singapore, 1996. Rapaport D.C. The Art of Molecular Dynamics Simulation. Cambridge UP, Cambridge, 1995. Skála L. Kvantová teorie molekul. Karolinum, Praha, 1994.
KFC/MSK
Metody studia koloidních systémů Methods of Study of Colloidal Systems
Statut:
Volitelný
Počet kreditů:
1
Forma výuky:
Přednáška
Rozsah výuky:
1 HOD/TYD
Ukončení:
Kolokvium
Garant:
Doc. RNDr. Libor Kvítek, CSc.
Obsah: Základní popis koloidních soustav, jejich definice, charakteristika, příprava a stabilita. Molekulárně kinetické vlastnosti koloidních soustav - Brownův pohyb, difuze, osmóza. Sedimentační analýza, využití osmózy při čištění a analýze makromolekulárních látek. Optické vlastnosti koloidních soustav - rozptyl světla - statický a dynamický. Metody studia koloidů založené na rozptylu světla. Mikroskopické metody studia koloidů. Elektrokinetické jevy - elektrokinetický potenciál a jeho měření, elektrokapilární jevy. Elektroforéza a elektroosmóza, vliv el. vlastností na stabilitu koloidů. Reologie koloidních soustav, viskozita a využití viskozitních měření ke studiu koloidů. Povrchové napětí a jeho měření. Povrchově aktivní látky v koloidní chemii, flotace. Uplatnění koloidů a jejich specifických vlastností v průmyslové a výzkumné praxi. Literatura: 1. S. S. Vojuckij :. Kurs koloidní chemie. SNTL Praha, 1984. 2. E. D. Ščukin, A.V. Percov, E. A. Amelinová :. Koloidní chemie. Academia Praha, 1990. 3. M. Takeo. Disperse systems. , Wiley-VCH, Weinheim, 1999. 4. R. Hunter :. Foundations of colloid science. Oxford, 2004.
UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI
26.11.2014
78 / 93
PŘEDMĚTY - AKREDITAČNÍ SESTAVA 2014/15
KFC/MSKX
Metody studia koloidních soustav Methods of Study of Colloid Systems
Statut:
Volitelný
Počet kreditů:
2
Forma výuky:
Přednáška
Rozsah výuky:
2 HOD/TYD
Ukončení:
Zkouška
Garant:
Doc. RNDr. Libor Kvítek, CSc.
Obsah: Základní popis koloidních soustav, jejich definice, charakteristika, příprava a stabilita. Molekulárně kinetické vlastnosti koloidních soustav - Brownův pohyb, difuze, osmóza. Sedimentační analýza, využití osmózy při čištění a analýze makromolekulárních látek. Optické vlastnosti koloidních soustav - rozptyl světla - statický a dynamický. Metody studia koloidů založené na rozptylu světla. Mikroskopické metody studia koloidů. Elektrokinetické jevy - elektrokinetický potenciál a jeho měření, elektrokapilární jevy. Elektroforéza a elektroosmóza, vliv el. vlastností na stabilitu koloidů. Reologie koloidních soustav, viskozita a využití viskozitních měření ke studiu koloidů. Povrchové napětí a jeho měření. Povrchově aktivní látky v koloidní chemii, flotace. Uplatnění koloidů a jejich specifických vlastností v průmyslové a výzkumné praxi. Literatura: 1. S. S. Vojuckij :. Kurs koloidní chemie. SNTL Praha, 1984.
UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI
26.11.2014
79 / 93
PŘEDMĚTY - AKREDITAČNÍ SESTAVA 2014/15
KFC/MSRM
Metody studia reakčních mechanismů Methods of Study of Reaction Mechanisms
Statut:
Volitelný
Počet kreditů:
2
Forma výuky:
Přednáška
Rozsah výuky:
2 HOD/TYD
Ukončení:
Zkouška
Garant:
Doc. RNDr. Aleš Panáček, Ph.D.
Obsah: 1. Význam kinetiky a mechanismu chemických reakcí. 2. Experimentální metody studia rychlosti chemických reakcí. 3. Techniky pro studium kinetiky reakcí v plynné fázi. Moderní experimentální techniky. 4. Postupy při stanovování rychlostních konstant Určování reakčních produktů a meziproduktů. 5. Vliv reakčních podmínek na rychlost reakce. Určování kinetické rovnice. 6. Bodensteinova aproximace kvazistacionárního stavu. Následné reakce. Předřazené rovnováhy. 7. Stanovení aktivačních parametrů chemické reakce. 8. Studium katalyzovaných reakcí Acidobazická katalýza. Specifická a obecná kyselá, resp. bazická katalýza. 9. Primární a sekundární kinetický izotopový efekt. Izotopový efekt rozpouštědla. 10. Enzýmová katalýza. 11. Vliv prostředí na chemickou reakci. Vliv solí na reakční rychlost. 12. Klasifikace rozpouštědela jejich vliv na chemickou reaktivitu. Empirické a semiempirické parametry polarity rozpouštědel. 13. Reakce v silně kyselém a silně zásaditém prostředí. 14. Lineární vztahy Gibbsovy energie (LFER). Literatura: Hine j.:. Structural Effects on equilibria in Organic Chemistry. Wiley&Sons, N.Y., 1975. Jungers, J.C. a kol.:. Chemická kinetika. ČSAV, Praha, 1963. Logan, S.R.:. Fundamentals of Chemical Kinetics. Longman, Edinburg, 1996. Masel J.:. Chemical Kinetics and Catalysis. John Wiley, N.Y., 2001. Nevěčná, T., Bekárek, V. Rozpouštědlové vlivy v chemii a jejich hodnocení. Academia Praha, 1992. Štěrba, V., Panchartek, J. Kinetické metody při studiu reakcí organických sloučenin, SNTL, Praha. SNTL Praha, 1985.
UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI
26.11.2014
80 / 93
PŘEDMĚTY - AKREDITAČNÍ SESTAVA 2014/15
KFC/QCH
Kvantová chemie Quantum Chemistry
Statut:
Volitelný
Počet kreditů:
3
Forma výuky:
Přednáška
Rozsah výuky:
3 HOD/TYD
Ukončení:
Zkouška
Garant:
Doc. RNDr. Petr Jurečka, Ph.D.
Obsah: Výklad začíná u Hartree-Fockovy metody a je dále rozšiřován na metody zahrnující elektronovou korelaci. Zvýšená pozornost je věnována i tzv. bázovým funkcím. Dále jsou zevrubně rozebnány metody funkcionálu hustoty. Následně je výklad více zaměřen na aplikace a některé vybrané partie a problémy kvantově chemických metod. 1. HF metody I.adiabatická a Bornova-Oppenheimerova aproximace, SCF teorie, Slaterův determinant, Koopmansův teorém, bázové funkce (basis set) 2. HF metody II.RHF a UHF metody, techniky SCF, semiempirické metody 3. Metody zahrnující elektronovou korelacipojem elektronové korelace, excitované Slaterovy determinanty, konfigurační interakce - CI, poruchové metody - MP, metoda vázaných klastrů - CC 4. Basis set - bázeSTO a GTO funkce, kontrahované báze - Poplovy báze, Dunning Huzinagovy báze, ANO báze, cc - báze, ECP báze, BSSE - superpoziční chyba bází 5. DFT metodymetody lokální hustoty, gradientově korigované metody, hybridní metody 6. Analýza vlnové funkcepopulační analýzy, přirozené orbitaly NO a NBO analýza 7. Hyperplocha potenciální energie a výpočet vlastností molekulpojem PES, identifikace minim, interakce s externími poli, výpočet IR spekter 8. Srovnání kvality metodsrovnání ab-initio metod a DFT metod z hlediska konvergence geometrie, výpočtu IR spekter a dipólových momentů 9. Statistická mechanikavýpočty termodynamických funkcí na základě kvantově mechanických výpočtů 10. Solvatace a solvatační modelykontinulání solvatační modely a model supermolekuly 11. Aplikaceukázky aplikací - slabé mezimolekulové interakce, nepravá vodíková vazba, vliv solvatace na konformační chování Literatura: A.Szabo, N.S.Ostlund. Modern Quantum chemistry. C.J.Cramer. Essentials of Computational Chemistry. J.Wiley, N.Y. Polák R., Zahradník R. Kvantová chemie. Academia, Praha, 1989. Skála J. Kvantová teorie molekul. Karolinum, Praha, 1998.
UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI
26.11.2014
81 / 93
PŘEDMĚTY - AKREDITAČNÍ SESTAVA 2014/15
KFC/STD
Statistická termodynamika Statistical Thermodynamics
Statut:
Volitelný
Počet kreditů:
2
Forma výuky:
Přednáška
Rozsah výuky:
2 HOD/TYD
Ukončení:
Zkouška
Garant:
Mgr. František Karlický, Ph.D. Prof. RNDr. Michal Otyepka, Ph.D.
Obsah: Nejprve se výklad soustředí na postuláty statistické termodynamiky, statistické soubory a význam partiční funkce a výpočty termodynamických funkcí z ní. Dále jsou probírány jednotlivé formy hmoty z hlediska statistické termodynamiky: ideální a reálný plyn, kapaliny a ideální krystal. Posléze se výklad soustředí na problematiku adsorpce a chemických aplikací statistické termodynamiky. Zcela na závěr je zařazena kapitola, která ukazuje moderní možnosti výpočtu probíraných veličin na základě počítačových simulací. 1. Úvod, axiomy, základní pojmy a vztahy fenomenologické termodynamiky 2. Statistické soubory, postuláty statistické termodynamiky, mikrostav a jeho váha, pravděpodobnost v mikrokanonickém a kanonickém souboru 3. Soustava identických částic, Maxwellova-Boltzmannova, Fermiho-Diracova a Boseova-Einsteinova statistická termodynamika 4. Partiční a termodynamické funkce, Boltzmannův vztah pro entropii, fluktuace 5. Ideální plyn, partiční funkce, translační, rotační, vibrační a elektronické příspěvky 6. Ideální krystal, Einsteinova teorie, Debyeova teorie, fonony, elektronový plyn 7. Mezimolekulární síly, jejich podstata, párové a vícečásticové potenciály 8. Reálný plyn, konfigurační integrál, viriálová stavová rovnice, viriální koeficienty 9. Kapaliny, vnitřní struktura, párová distribuční funkce, tekutiny, van der Waalsova rovnice, buňkové teorie, poruchové teorie, teorie integrálních rovnic 10. Adsorpce, Langmuirova izoterma a izoterma BET, interakce plyn-povrch 11. Chemické aplikace statistické termodynamiky, chemická kinetika, chemická rovnováha 12. Počítačová chemie a statistická termodynamika, metoda molekulární dynamiky a metoda Monte Carlo Literatura: A. Malijevsky. Lekce ze statistické termodynamiky, 3. vyd.; Vydavatelství VŠCHT: Praha, 2009. ISBN 978-80-7080-710-1 (http://vydavatelstvi.vscht.cz/katalog/uid_isbn-978-80-7080-710-1/). Vřešťál, J., Otyepka, M. Statistická termodynamika, stručný úvod, MU: Brno, 2004. ISBN 80-210-3372-X. Atkins P., de Paula J. Fyzikální chemie, Vydavatelství VŠCHT: Praha, 2013. ISBN: 978-80-7080-830-6 (http://vydavatelstvi.vscht.cz/katalog/uid_isbn-978-80-7080830-6/). Boublík, T. Statistická termodynamika, Academia: Praha, 1996. ISBN 80-200-05668.
UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI
26.11.2014
82 / 93
PŘEDMĚTY - AKREDITAČNÍ SESTAVA 2014/15
KFC/VRCH
Využití radioizotopů v chemii Applications of Radioisotopes in Chemistry
Statut:
Volitelný
Počet kreditů:
2
Forma výuky:
Přednáška
Rozsah výuky:
2 HOD/TYD
Ukončení:
Kolokvium
Garant:
Prof. RNDr. Radek Zbořil, Ph.D.
Obsah: Radioaktivní indikátory (stopovací metody), princip, požadavky na radioaktivní indikátory, využití ve výzkumu kinetiky, mechanismu chemických reakcí a katalýzy. Indikátorová metoda v chemické analýze. Radiometrické titrace. Radiometrická mikroanalýza. Metoda izotopového zřeďování. Metoda radioaktivních činidel. Metody založené na uvolňování radioaktivity. Využití izotopních indikátorů při studiu difúzních dějů a v elektrochemii. Analytické využití jaderných reakcí. Analýza s okamžitým měřením produktů reakce. Aktivační analýza. Princip, neutronová aktivační analýza, aktivační analýza nabitými částicemi, fotoaktivace. Radioizotopová rtg-fluorescenční analýza. Princip, přístrojové vybavení, příklady aplikací. Analytické využití rozptylu a absorpce jaderného záření. Rutherfordův zpětný rozptyl urychlených iontů. Rozptyl záření beta, gama a neutronů. Využití absorpce jad. záření. Analytické využití jaderných rezonančních jevů - Mössbauerův jev, fyzikální podstata, experimentální pozorování, parametry Mössbauerových spekter. Interpretace Mössbauerových spekter. Příklady aplikací Mössbauerovy spektroskopie v chemii sloučenin železa a cínu. Jaderné metody v analýze molekul a krystalů. Metody izotopové indikace a izotopové výměny. Metoda syntézy a rozkladu značené sloučeniny. Metoda postupné substituce. Neutronová difrakce - princip, exp. pozorování, využití. Radiační syntéza a modifikace látek. Radiační oxidace, sulfooxidace, halogenace, radiační vulkanizace. Radiačně-chemické efekty v jaderné technice. Vliv záření na katalytické reakce a makromolekulární látky. Literatura: A. Gosman, Č. Jech. Jaderné metody v chemickém výzkumu. Academia, Praha,, 1989. G. Földiak. Industrial Application of Radioisotopes. Akademiai Kiado, Budapest,, 1986. J. F. Duncan, G. B. Cook. Isotopes in Chemistry. Clarendon Press, Oxford, 1968. L. Musílek. Využití ionizujícího záření ve výzkumu. ČVUT, Praha, 1992. M. Mašláň. Mössbauerova spektroskopie. UP Olomouc,, 1992. O. Navrátil a kol.. Jaderná chemie. Academia, Praha,, 1985.
UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI
26.11.2014
83 / 93
PŘEDMĚTY - AKREDITAČNÍ SESTAVA 2014/15
KGE/GECH
Geochemie Geochemistry
Statut:
Volitelný
Počet kreditů:
3
Forma výuky:
Přednáška
Rozsah výuky:
2 HOD/TYD
Ukončení:
Zkouška
Garant:
Doc. RNDr. Jiří Zimák, CSc.
Obsah: 1. Geochemie - zaměření, vznik, význam. Kosmická geochemie. Vznik Země. 2. Stavba Země - geochemický model. Chemické složení zemské kůry. Geochemická klasifikace prvků. 3. Geochemie atmosféry a hydrosféry. 4. Geochemie endogenních procesů - 1. část. 5. Geochemie endogenních procesů - 2.část. Geochemie exogenních procesů. 6. Geochemie prvků - 1. část: prvky s atomovými čísly 1 až 10. 7. Geochemie prvků - 2. část: prvky s atomovými čísly 11 až 18. 8. Geochemie prvků - 3. část: prvky s atomovými čísly 19 až 28. 9. Geochemie prvků - 4. část: prvky s atomovými čísly 29 až 43. 10. Geochemie prvků - 5. část: prvky s atomovými čísly 44 až 46, 76 až 78 a 47 až 56. 11. Geochemie prvků - 6. část: prvky s atomovými čísly 57 až 75 a 79 až 92. 12. Aplikovaná geochemie. Geochemické metody vyhledávání ložisek nerostných surovin. Literatura: Bouška, V. - Jakeš, P. - Pačes, T. - Pokorný, J. Geochemie. Academia Praha, 1980. Brownlow, A., H. Geochemistry. 2nd ed. Prentice Hall, 1996. Faure, G. Inorganic geochemistry. Macmillan Publishing Company. New York, 1991. Gregerová, M. - Hovorka, D. - Suk, M. Geochemie geologických procesů v litosféře II. Metody a interpretace. PřF MU Brno, 1995. Holland, H., D. - Turkenian, K., K. (execut. eds.). Treatise on Geochemistry, Vol. 1-10. Elsevier, 2005. Polański, A. - Smulikovski, K. Geochémia. SPN Bratislava, 1978. Zeman, J. Základy fyzikální geochemie I. Magmatické a metamorfní systémy. PřF MU Brno, 1990. Zeman, J. Základy strukturní a chemické krystalografie. PřF UJEP Brno, 1989.
UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI
26.11.2014
84 / 93
PŘEDMĚTY - AKREDITAČNÍ SESTAVA 2014/15
OCH/CBL1
Chemie přírodních a biologicky aktivních látek 1 Chemistry of Natural and Biologically Active Compounds 1
Statut:
Volitelný
Počet kreditů:
2
Forma výuky:
Přednáška
Rozsah výuky:
2 HOD/TYD
Ukončení:
Kolokvium
Garant:
Prof. Ing. Pavel Hradil, CSc.
Obsah: V úvodu se studenti seznámí s náplní předmětu, významem, základními pojmy, metodami hodnocení biologické aktivity. V první větší části budou probrány vybrané biologicky aktivní látky vyskytující se v přírodě - bakterie, plísně a houby, rostliny a živočichové. Jejich struktura, biologické vlastnosti, historie jejich používání, způsoby izolace případně syntézy. Přednostně budou vybírány sloučeniny jejichž deriváty jsou významné - např. nalezly praktické použití jako pesticidy či léčiva, jsou kontaminanty potravy apod. Jedná se např. o látky ze skupiny derivátů kumarinu, aflatoxinu, alkaloidy - výskyt, rozdělení a použití, glykosidy apod. Samostatná část bude věnována přírodním barvivům. Na praktických příkladech budou ukázány změny biologické aktivity se změnou struktury a změněné použití (např. dikumarol - warfarin, bromadiolon - ethylbiskumacetát; epibatidin imidacloprid - ABT-594, apod.) Tyto souvislosti bude znovu zdůrazněny při probírání pesticidů i léčiv. V druhé polovině semestru budou probírány pesticidy a bojové chemické látky - základní skupiny, nejdůležitější zástupci, syntéza. Budou probrány hlavní sloučeniny v dané skupině, mechanismus účinku vybraných látek a jejich metabolismus v živých organismech. Důraz bude kladen na látky moderní a dnes používané. Vedle ekologických hledisek se studenti seznámí rovněž s historickými souvislostmi. Literatura: Betina V. Mykotoxíny - chémia, biológia, ekológia. Alfa Bratislava, 1990. Cremlyn R. Pesticidy. SNTL Praha, 1985. Djerassi C. a kol. Dictionary of Natural Products. Chapman & Hall, London, 1994. Harborne J.B., Baxter H. Dictionary of Plant Toxins. 1997. Hrdina V., Hrdina R., Jahodář L., Martinec Z., Měrka V. Přírodní toxiny a jedy. Galén Praha, 2004. Mann J. Jedy, drogy, léky. Academia Praha, 1996.
UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI
26.11.2014
85 / 93
PŘEDMĚTY - AKREDITAČNÍ SESTAVA 2014/15
OCH/CBL2
Chemie přírodních a biologicky aktivních látek 2 Chemistry of Natural and Biologically Active Compounds 2
Statut:
Volitelný
Počet kreditů:
2
Forma výuky:
Přednáška
Rozsah výuky:
2 HOD/TYD
Ukončení:
Zkouška
Garant:
Prof. Ing. Pavel Hradil, CSc.
Obsah: Předmět navazuje na CBL 1. V této části budou probrány hlavní skupiny přírodních a syntetických látek působících na CNS, látek působících na vegetativní nervový systém, analgetika, látky působící na oběhovou soustavu, látky působící na trávicí a vylučovací soustavu, analgetika, kancerostatika atd. Bude probrány základní vztahy mezi strukturou a farmakologickou skupinou a rovněž v každé skupině pak dále vztah mezi strukturou a biologickou aktivitou. Na konkrétních příkladech pak budou ukázány metodiky studia SAR a QSAR. Vedle hlavních sloučenin, metod jejich syntézy či získávání z přírodních zdrojů a biologických účinků bude důraz kladen především na souvislosti mezi biologickou aktivitou látek a jejich strukturou. Budou probrány základní vztahy mezi strukturou a farmakologickou skupinou, i detailnější vztahy biologické aktivity a jejich změn v závislosti na struktuře látek uvnitř této skupiny sloučeniny (například u skupiny barbiturátů, chinolonů, sulfonamidů apod.). Rovněž budou probrány i nežádoucí účinky léčiv a možnosti jejich ovlivnění změnou struktury (např. terfenadin, thalidomid). V přednáškách budou rovněž budou průběžně zmiňovány ekonomické a historické pohledy na jednotlivé skupiny přírodních či syntetických léčiv. Budou rovněž probrány metody používané při výzkumu nových látek (kombinatoriální chemie, robotizace), základní dokumentace a legislativa platná pro výzkum a výrobu léčivých látek i současný trend ve světovém farmaceutickém průmyslu. Literatura: Copeland R. A. Evaluation of Enzyme Inhibitors in Drug Discovery. John Wiley & Sons, Inc. Hoboken, 2005. Hampl F., Paleček J. Farmakochemie. VŠCHT Praha; vydání 2., 2002. Katzung B. G. Základní & klinická farmakologie. Nakladatelství a vydavatelství H &H, 1994. Kleemann A., Engel J. Pharmaceutical Substances. Thieme, Stutgart-New York, 2001. Lüllmann, H., Mohr, K., Wehling, M. Farmakologie a toxikologie. Grada Publishing, Praha, 2002. Melichar a kol. Chemická léčiva. Avicenum, 1986. Sweetman S. C. Martindale - The complete drug reference, 33th edition. Pharmaceutical Press, 2002.
UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI
26.11.2014
86 / 93
PŘEDMĚTY - AKREDITAČNÍ SESTAVA 2014/15
OCH/CHHS
Chemie heterocyklických sloučenin Chemistry of Heterocyclic Compounds
Statut:
Volitelný
Počet kreditů:
3
Forma výuky:
Přednáška
Rozsah výuky:
3 HOD/TYD
Ukončení:
Zkouška
Garant:
Doc. RNDr. Miroslav Soural, Ph.D.
Obsah: Obecná část - Rozdělení heterocyklů. Názvosloví nekondenzovaných i kondenzovaných heterocyklů. Principy syntéz heterocyklů. Cyklizace. Cykloadice. Transformace heterocyklů. Reaktivita aromatických heterocyklů. SE a SN reakce. Adiční reakce, hydrogenace, cykloadice. Oxidační reakce. Reaktivita nearomatických heterocyklů a jejich vztah ke kyslíkatým, sirným, dusíkatým a jiným funkčním derivátům. Reakce probíhající na heteroatomu. Reakce probíhající na atomech uhlíku. Syntézy, vlastnosti a reaktivita nejdůležitějších heterocyklů a jejich derivátů - Nekondenzované 5-členné heterocykly. Furan, Thiofen, Pyrrol a jejich nejdůležitější deriváty. 5-členné heterockl.Pyrazol, imidazol, isoxazol, isothiazol, oxazol, [1,2,3]triazol. [1,2,4]triazol, tetrazol a tetrazoliové soli, pentazol, [1,2,3]oxadiazol, [1,2,4]oxadiazol a [1,2,4]thiadiazol a jejich deriváty Benzoderiváty 5-členných heterocyklů - benzo[b]furan, benzo[b]thiofen, tryptofan, tryptamin, indazol, benzimidazol, benztriazol, benzo[1,2,5]thiadiazol, karbazol. Nekondenzované 6-členné heterocykly - Pyran , thiopyran, pyridin a jejich deriváty. Pyridazin a jeho deriváty. Uracil a ostatní pyrimidinové báze, nukleosidy a nukleotidy, kyselina barbiturová, alloxan. Pyrazin, piperazin a deriváty. Oxaziny a thiaziny. [1,2,3]Triazin. [1,2,4]Triazin. [1,3,5]Triazin a jeho deriváty. Benzoderiváty 6-členných heterocyklů - Chromen, kumarin, flavonoidy, anthoyanová barviva, chinolin , cinnolin, ftalazin, chinazolin, chinoxalin a jejich deriváty. Heterocykly s 3-členným cyklem. Oxiran . Thiiran. Azirin. Heterocykly s 4-členným cyklem. Oxetan. Azet. Heterocykly se 7-členným cyklem. Literatura: A. Weissberger. The Chemistry of Heterocyclic Compounds I-XXV (1950-1972). A.R. Katrizky, A.F. Pozharskii. Handbook of Heterocyclic Chemistry. Pergamon Press, Oxford, 2000. Červinka O. a kol. Chemie organických sloučenin (kapitola: Janda M. Nukleové kyseliny, str. 678-720). SNTL, Praha, 1987. J. Kováč, A. Krutošíková, R. Kada. Chémie heterocyklických zlúčenin. Bratislava, 1982. R.C. Elderfield. Heterocyclic Compounds I-IX (1950-1967).
UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI
26.11.2014
87 / 93
PŘEDMĚTY - AKREDITAČNÍ SESTAVA 2014/15
OCH/KBCH
Kapitoly z bioorganické chemie Lectures in Biooganic Chemistry
Statut:
Volitelný
Počet kreditů:
3
Forma výuky:
Přednáška
Rozsah výuky:
3 HOD/TYD
Ukončení:
Zkouška
Garant:
RNDr. Lucie Brulíková, Ph.D.
Obsah: 1. Cíle chemoterapie. Základy fyziologie a patologie imunitního systému. Přehled přístupů k léčbě infekčních a imunitních chorob. Přehled nejvýznamnějších infekčních a imunitních chorob. 2. Virové infekce. Struktura virů a jejich životní cyklus. Rozdělení virů a přehled významných virových infekcí. Vakciny. 3. Vývoj léčiv. Základní postup ve vývoji nových léčiv. Problematika sledování toxicity a nežádoucích interakcí nových léčiv. Základy patentové legislativy. 4. Protiinfekční a protinádorová léčiva I. Inhibitory prenylace proteinů. Inhibitory glyoxylasy. Inhibitory dihydropyrimidin reduktasy. Inhibitory dihydroorotát dehydrogenasy. 5. Protiinfekční a protinádorová léčiva II. Inhibitory dihydrofolát reduktasy. Inhibitory thymidylát synthasy. Klasické a neklasické antifoláty. 6. Protiinfekční a protinádorová léčiva III. Inhibitory IMP dehydrogenasy. Inhibitory NDP reduktasy. 7. Kancerostatika a antileukemika na bázi antimetabolitů. Inhibitory adenosinkinasy. Aza a deaza analoga purinových a pyrimidinových bazí. Klinicky používaná cytostatika. 8. Syntézy analog purinových a pyrimidinových bazí I. Chránění skupin. Zavedení báze do molekuly. Modifikace bazí. Aspekty syntézy chirálních léčiv. 9. Syntézy analog purinových a pyrimidinových bazí II. Hilbert-Johnsonova reakce. Výstavba kruhu. Transformace pyrimidinových a purinových bazí. Dimrothův přesmyk. 10. Syntézy analog purinových a pyrimidinových bazí III. Transformace cukerných částí léčiv. Ukázka totální syntézy některých léčiv. Průmyslové aspekty syntéz. 11. Nukleosidová antibiotika. 7-deazaadeninové deriváty. Pyrimidinové deriváty. Inhibitory adenosindeaminasy. 12. Inhibitory virových DNA a RNA polymeras. Inhibitory DNA polymeras. Acyklické nukleosidy. Interkalátory. 13. Inhibitory retrovirů. Mechanismus účinku. Příklady syntéz. Nukleosidové a nenukleosidové inhibitory reverzní transkriptázy. 14. Terapie závažných retrovirálních infekcí. Inhibitory HIV-1 integrasy. Inhibitory glykosylace. Pokroky v terapii AIDS a infekční hepatitis. Literatura: A. Holý. Principy bioorganické chemie ve vývoji antivirotik a cytostatik, kancerostatik a virostatik. UP Olomouc, 2004. Blackburn, G.M. et al. Nucleic Acids in Chemistry and Biology. Wenke, Hynie. Farmakologie pro lékaře I, II. Aviccenum, Praha, 1985.
UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI
26.11.2014
88 / 93
PŘEDMĚTY - AKREDITAČNÍ SESTAVA 2014/15
OCH/MOR
Mechanismy organických reakcí Mechanisms of Organic Reactions
Statut:
Volitelný
Počet kreditů:
5
Forma výuky:
Přednáška,Cvičení
Rozsah výuky:
3 HOD/TYD + 1 HOD/TYD
Ukončení:
Zkouška
Garant:
Doc. RNDr. Jan Hlaváč, Ph.D.
Obsah: Klasifikace a charakteristika organických reakcí - homolytické reakce, heterolytické reakce, reakce s cyklickým průběhem, energetika organických reakcí, metody zjišťování reakčního mechanismu. Heterolytické reakce - substituce nukleofilní na nasycených systémech (mechanismus, charakteristika karbokationtů, kinetika, sterický průběh, faktory ovlivňující průběh). Elektrofilní aromatická substituce - mechanismus, vliv substituentů na směr, snadnost a poměr o- a p- isomerů, charakteristika známých reakcí. Aromatická nukleofilní substituce - mechanismus, faktory ovlivňující průběh, charakteristika známých reakcí, reakce heterocyklických sloučenin. Adice k nenasyceným systémům - elektrofilní adice k izolovaným vazbám C=C, elektrofilní adice ke konjugovaným systémům, charakteristika známých reakcí. Nukleofilní adice k vazbám karbonylovým, iminovým , nitrilovým, nukleofilní adice u konjugovaných systémů, nukleofilní adice k izolované uhlíkaté dvojné vazbě, charakteristika známých reakcí. Eliminační reakce - mechanismus a kinetika, souvislost mezi substitucí nukleofilní a eliminací, faktory ovlivňující průběh stereochemický průběh, orientační pravidla. Eliminační reakce - charakteristika známých reakcí vedoucích ke vzniku vazby C=C, eliminace za vzniku trojné vazby mezi uhlíky. Eliminační reakce - eliminace za vzniku dvojné vazby mezi uhlíkem a heteroatomem, eliminace s nesousedními substituenty, štěpné heterolytické reakce. Molekulární přesmyky - přesmyky v nasycených systémech - nukleofilní přesmyky charakteristika známých reakcí, jejich mechanismus, sterický průběh. Nukleofilní přesmyky - pokračování. Elektrofilní přesmyky - charakteristika známých reakcí, jejich mechanismus, sterický průběh. Přesmyky v nenasycených a aromatických systémech. Homolytické reakce - substituční reakce - mechanismus, faktory ovlivňující průběh, sterický průběh, charakteristika známých reakcí. Homolytické adice - charakteristika, orientace, příklady. Homolytické reakce aromatických sloučenin - charakteristika, příklady. Literatura: Červinka O. Mechanismy organických reakcí. SNTL, Praha, 1981. Moloney M. G. Reaction Mechanisms at a Glance. Blackwell Science Ltd., England, 2000. Smith M. B. Organic Synthesis. McGraw-Hill, Inc., New York, 1994.
UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI
26.11.2014
89 / 93
PŘEDMĚTY - AKREDITAČNÍ SESTAVA 2014/15
OCH/SCH
Stereochemie Stereochemistry
Statut:
Volitelný
Počet kreditů:
4
Forma výuky:
Přednáška,Seminář
Rozsah výuky:
2 HOD/TYD + 1 HOD/TYD
Ukončení:
Zkouška
Garant:
Doc. RNDr. Jan Hlaváč, Ph.D.
Obsah: Pozornost je věnována optickým a geometrickým isomerům, jejich vlastnostem, nomenklatuře, metodám rozlišení a dělení s využitím moderních analytických metod zejména NMR spektrometrie. Dále se přednáška zabývá vztahem reaktivity a konformace organických sloučenin. Studenti jsou rovněž seznámeni s principem stereoselektivních reakcí. 1. Molekulární geometrie, vazebné poměry - délka vazby, vazebný úhel, dihedrální úhel, deformace vazebného úhlu, vodíková vazba, rotace kolem vazby. Molekulární symetrie a chiralita - operace symetrie, prvky symetrie, klasifikace. 2. Stereoisomerie a centrum chirality - molekuly s jedním chirálním centrem, konfigurační nomenklatura, molekuly s více chirálními centry. 3. Axiální a planární chiralita - princip, stereochemie allenů, spiranů, bifenylů, cyclophanů, helicita, nomenklatura. 4. Topicita a prostereoizomerie - homotopicita, enanciotopicita, diastereotopicita, nomenklatura, projev v NMR, chemické a biochemické transformace. 5. Racemizace a metody dělení - mechanismy racemizace, asymetrická transformace a mutarotace, metody dělení, optická čistota. 6. Určování konfigurace - určování absolutní konfigurace, korelační metody pro určování konfigurace, konfigurace a vlastnosti geometrických isomerů. 7. Konformace acyklických molekul - molekulární mechanika a konformace, KlynePrelogova terminologie torzních úhlů, fyzikální metody konformační analýzy, konformace kolem sp3 - sp3, sp3 - sp2, sp3 - sp2 vazeb a kolem vazby uhlíkheteroatom. Vlastnosti konformerů. 8. Konformace cyklických molekul - konformace cyklohexanu, mono-, di- a polysubstituovaných cyklohexanů, cyklohexanový kruh s sp2 uhlíky. 9. Konformace cyklických sloučenin - kruhy jiné než cyklohexan, heterocykly. 10. Konformace kondenzovaných a můstkových cyklických systémů - tvorba, stabilita, reaktivita, vlastnosti. 11. Molekulární disymetrie a chirooptické vlastnosti - polarizované světlo a jeho vlastnosti, ORD a CD - charakteristika a aplikace. 12. Dynamická stereochemie - konformace a reaktivita rigidních a mobilních diastereoizomerů, kvantitativní korelace mezi konformací a reaktivitou, konformace a reaktivita acyklických sloučenin. 13. Konformace a reaktivita cyklických sloučenin, atropoizomerů. 14. Stereoselektivní reakce - princip, klasifikace, terminologie, stereoselektivní reakce acyklických a cyklických sloučenin, enancioselektivní reakce. Seminář: Seminář ze stereochemie má za cíl procvičit dosažené teoretické znalosti na konkrétních příkladech. Studenti si za pomoci modelů zdokonalují prostorovou představivost a snaží se pochopit vztahy mezi stereoizomery. Na konkrétních příkladech se pak učí porovnávat analytická data se studovanou strukturou. Procvičováno je rovněž názvosloví v oblasti stereoisomerie a prostereoisomerie. Literatura: Eliel E.L.: Stereochemie uhlíkatých sloučenin, Academia Praha 1970. Potapov V.M.: Stereochemie, SNTL 1986.
UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI
26.11.2014
90 / 93
PŘEDMĚTY - AKREDITAČNÍ SESTAVA 2014/15
VCJ/AK3
Anglická konverzace pro pokročilé 3 Upper-intermediate English Conversation 3
Statut:
Volitelný
Počet kreditů:
2
Forma výuky:
Cvičení
Rozsah výuky:
2 HOD/TYD
Ukončení:
Zkouška
Garant:
Mgr. Marian Siedloczek, M.A.
Obsah: Název lekce 1. Introductions 2. Reporting (first impressions) 3. Family customs and traditions 4. Small talk 5. Money talks 6. Music and art 7. Discussing your area of expertise with a non-expert 8. Handling questions after presentation 9. Gadgets and gizmos (mobile phone mania) 10. Travel 11. Food and eating 12. Revision Literatura: Sue Kay, Jon Hird, Peter Maggs. Move Upper-Intermediate. Oxford, 2006. ISBN 140500341-3.
UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI
26.11.2014
91 / 93
PŘEDMĚTY - AKREDITAČNÍ SESTAVA 2014/15
VCJ/AK4
Anglická konverzace pro pokročilé 4 Upper-intermediate Eng. Conversation 4
Statut:
Volitelný
Počet kreditů:
2
Forma výuky:
Cvičení
Rozsah výuky:
2 HOD/TYD
Ukončení:
Zkouška
Garant:
Mgr. Marian Siedloczek, M.A.
Obsah: Název lekce - Jazykové zaměření 1. Introductions and getting familiar: Personality tests and their validity 2. Personal qualities and types of intelligence 3. Flawed scientific endeavours: Eugenics and other influencial theories 4. Nature versus Nurture 5. The world of dreams: Lucid dreaming 6. Health and medicine 7. Hurry sickness: Is technology the primary cause of stress? 8. Life without death: Implications of extending human life span 9. The idea of sport 10. Sport terminology in everyday English 11. Leisure and relaxation 12. Erring is human Literatura: VCJ/ATPC1
Chemická terminologie a prezentace v anglickém jazyce 1 English Terminology and Presentations - Chemistry 1
Statut:
Volitelný
Počet kreditů:
2
Forma výuky:
Cvičení
Rozsah výuky:
2 HOD/TYD
Ukončení:
Zápočet
Garant:
Mgr. Eva Karasková
Obsah: 1. English for specific purposes 2. Working with a dictionary 3. Presentations 4. Chemical aspects of the world 5. Chemistry as a subject 6. History of chemistry 7. Atomic structure 8. Chemical structure
Literatura:
UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI
26.11.2014
92 / 93
PŘEDMĚTY - AKREDITAČNÍ SESTAVA 2014/15
VCJ/ATPC2
Chemická terminologie a prezentace v anglickém jazyce 2 English Terminology and Presentations - Chemistry 2
Statut:
Volitelný
Počet kreditů:
4
Forma výuky:
Cvičení
Rozsah výuky:
2 HOD/TYD
Ukončení:
Zkouška
Garant:
Mgr. Eva Karasková
Obsah: 1. Presentations 2. Numbers 3. Graphs and charts 4. Chemical nomenclature 5. The periodic table 6. Group VII-halogens 7. Nanochemistry 8. Environmental chemistry
Literatura: VCJ/AW1
Academic Writing 1 Upper-intermediate Academic Writing 1
Statut:
Volitelný
Počet kreditů:
4
Forma výuky:
Cvičení
Rozsah výuky:
2 HOD/TYD
Ukončení:
Zkouška
Garant:
Mgr. Marian Siedloczek, M.A.
Obsah: Obsah předmětu* 1. Introduction to Writing 2. Brainstorming and Free writing 3. Mapping, Organization and Editing 4. Paragraphs 5. Supporting your ideas 6. Peer Review and Editing 7. Descriptive writing 8. Process Writing 9. Process Writing II 10. Opinion Writing 11. Cause-Effect Writing * Může se podle potřeby měnit Literatura: Zemach, Rumisek. Academic Writing from paragraph to essay. Oxford, 2003. ISBN 978-1-4050-8606-6.
UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI
26.11.2014
PŘEDMĚTY - AKREDITAČNÍ SESTAVA 2014/15
VCJ/AW2
Academic Writing 2 Upper-intermediate Academic Writing 2
Statut:
Volitelný
Počet kreditů:
4
Forma výuky:
Cvičení
Rozsah výuky:
2 HOD/TYD
Ukončení:
Zkouška
Garant:
Mgr. Marian Siedloczek, M.A.
Obsah: 1. English syntax: sentence length 2. Concision 3. Avoiding ambiguity and vagueness 4. Linking words 5. Paraphrasing 6. Quoting 7. Providing information for non-experts 8. Writing an abstract 9. Introductions and conclusions 10. Hedging and criticizing 11. Expressing disagreement and making logical connections between other authors´ findings and ours 12. Dealing with the limitation of our research Literatura: Zemach and Rumisek. Academic Writing.
93 / 93