Druh dokkumentu:
LP Cellkový počet stran: 36
L LABO ORA ATOR RNÍ PŘÍR P RUČK KA
Zpracoval:
Uvolnil pro o SK: Jana Rejtharová R manažer kvality
Ja ana Rejtharrová manažer m kvallity
Schválil:
10. Výtisk V č.:
Platn nost od: 30.44.2015 MUDr. Petr P Lošan Vedoucí Genettického pracooviště
Vydání:
V Vydání: 10.
Laborratorní přříručka
P Platnost od: 330.4.2015
H OBSAH 1. 2. 3.
Úvvod ........................................................................................................................................ 3 Záákladní inforrmace o labboratoři ............................................................................................. 3 Zaaměření labooratoře a spektrum nabízených slu užeb ............................................................ 6 3.1. Seznam nabízených n l laboratorníc ch vyšetřeníí ................................................................. 7 3.2. Smluvní laboratoř l ............................................................................................................. 9 4. Proohlášení o souhlasu s .............................................................................................................. 9 5. Maanuál pro oddběr primárrních vzorkůů.................................................................................. 10 5.1. Základní informace i p uživatelle laboratorn pro ních služeb genetické llaboratoře ........... 10 5.2. Identifikaační označenní primárníhho vzorku .................................................................... 22 5.3. Průvodka na laboratoorní vyšetřenní ................................................................................ 22 5.3.1. Požadavvky na urgeentní vyšetření .............................................................................. 23 5.3.2. Ústní požadavky na n vyšetření ................................................................................... 23 5.3.3. Důvodyy pro odmítnnutí vzorkůů pro zpraco ování ......................................................... 23 5.3.4. Způsobb řešení neshhod na příjm mu materiálu u .............................................................. 24 5.4. Informacee pro odběr biologickéhho materiálu u včetně miinimálního m množství ............ 24 5.4.1. Odběroové nádoby ................... . .................................................................................... 24 5.4.2. Odběr plodové p voddy – amnioccentéza ........................................................................ 26 5.4.3. Odběr choriových c klků .............................................................................................. 26 5.4.4. Odběr periferní p krvve pro geneetické vyšetřření .......................................................... 26 5.4.5. Odběr potracené p tkkáně ............................................................................................... 27 5.4.6. Odběr spermatu s (ejjakulátu)........................................................................................ 27 5.4.7. Odběr slizničního s stěru z dutinny ústní (bu ukální stěr) ................... . ........................... 28 5.4.8. Protokoolární odběrr k DNA patternitní exp pertíze s possudkem soudního znalcce ...... 28 5.4.9. Odběr ovulačního o sekretu (hleenu) ............................................................................. 28 5.5. Informacee a návody předávané p p pacientům před p odběreem primárníího vzorku (inforrmované soouhlasy) ............................................................................................................. 29 5.6. Příjem vzorku do labboratoře .......................................................................................... 29 5.7. Transportt a manipulaace s biologgickým mateeriálem (se vzorky)................................. 30 6. Fázze po vyšetřření ................................................................................................................... 31 6.1. Bezpečnéé odstraňováání materiálů použitých h při odběruu............................................. 31 6.2. Manipulace a skladovvání materiálu .............................................................................. 31 6.2.1. Skladovvání před a v průběhu vlastního v vy yšetření .................................................... 31 6.2.2. Skladovvání po vyšetření ............................................................................................. 31 6.3. Dodatečná vyšetření a časový innterval pro jejich požaddování .................................... 32 6.4. Opakovánní vyšetření stejného prrimárního vzorku v ....................................................... 32 7. Vyydávání výsledků a kom munikace s laboratoří ................................................................... 33 7.1. Informacee o formáchh vydávání výsledků v ..................................................................... 33 7.2. Změny výýsledků a náálezů .............................................................................................. 33 7.3. Intervaly od dodání materiálu m k vydání výslledků ....................................................... 33 7.4. Konzultačční činnost laboratoře l ...................................................................................... 34 7.5. Způsob řeešení stížnosstí .................................................................................................. 34 7.6. Obecné záásady laboratoře na ochhranu osobn ních inform mací ........................................ 34 8. Příílohy ................................................................................................................................... 35
LP
sttr.:2/35
V Vydání: 10.
Laborratorní přříručka
P Platnost od: 330.4.2015
1. Úvvod Cílem dokumentu d je informoovat lékaře a žadatele o laboratorrní vyšetřenní o nabídce našich služeb, poskytnouut zdravottnickým pracovníkům p m potřebnéé informacce před vlastním v vyšetřenním, z jeho průběhu a po p vyšetření (informace o vydávánní výsledků)). Tato přříručka je jeedním z proostředků prro komunikaci mezi léékaři a geneetickou labo oratoří a v neposslední řadě je prezentaací naší prááce. Obsahu uje požadaavky pro prrovedení sp právného odběru vzorků, jejjich manipuulaci a sklaadování tak,, aby nebyll negativně ovlivněn výsledek v d pookyny pro pacienty, p laboratoorních vyšetření. Žadattelé o vyšettření mají k příručce dostupné formulááře pro inforrmovaný soouhlas a průvvodky pro všechna v labboratorní vyšetření. Soubbor nabízenýých laboratoorních vyšeetření a meto od je vytvořřen a inovovván dle požžadavků klientů s přihlédnuttím k odborrnému vývooji v oblasteech klinické genetiky a reprodukčn ní imunoloogie. Laborattorní příručkka je součásstí řízené dookumentacee laboratořee, je pravideelně aktualizzována a žadatelůům o vyšeetření je doostupná na webových h stránkách laboratořee – www.g genetikaplzen.czz. Žadatelé o vyšetřeníí jsou inform mování o zm měnách a aktualizacích a h. V tištěnéé podobě je k disppozici u maanažera kvallity Geneticckého pracoviště.
2. Základní in nformacce o labooratoři Geneticcké pracovviště „Geneetika Plzeeň, s.r.o.“ má v souuladu se ssvým přístrojovým vybavenním a odboornými možžnostmi staanoven soub bor metod laboratorního vyšetřen ní, který může realizovat. r Personální obsazení zaměstnanc z ců laboratooří i ambullancí splňuj ují svým vzdělánním podmínkky odborné způsobilossti. Č in nstitutem prro akreditaaci, o.p.s. pod číslem 8034 8 dle Laboraatoř je akreditována Českým normy ČSN EN ISO 151 89. 8 Dále má m povolen ní činnosti diagnosticcké labora atoře od Státníh ho ústavu pro kontrolu u léčiv.
LP
sttr.:3/35
V Vydání: 10.
Laborratorní přříručka
P Platnost od: 330.4.2015
Kon ntaktní úd daje Adrresa Geneetického pracoviště p ě „Genetik ka Plzeň, s.r.o.“
Provozzní doba am mbulancí a laborattoří Telefoon:
Pa arková 1254/11a, 3226 00 Plzzeň-Černiice
Po - Páá: 6,30 – 116,00 Od dběry: po celou praacovní dob bu 377 7 241 529,, 377 452 322
Statutární zástup pce: D MUD Doc. Dr. Frantiišek Lošan n, CSc., Jednatel J MUD Dr. Petr Loošan, Jed dnatel
Vedou ucí Genettického prracoviště:: M MUDr. Petr Lošan
Vedoucí geenetické laboratoř V l ře, vedou ucí cytogeenetického o úseku: Mggr. Sabina Planeto ová Telefoon: Mobil: E-mail:
377 7 241 529,, 377 451 971 604 4 106 586 pla
[email protected]
Vedoucí úseku ú rep produkčn ní imunoloogie: Prrof. MUD Dr. Zdeňk ka Ulčová-Gallová,, DrSc. Telefoon: Mobil: E-mail:
LP
377 7 452 038 605 5 536 845 ulcova-galloova@geneetika-plzen n.cz
sttr.:4/35
V Vydání: 10.
Laborratorní přříručka
P Platnost od: 330.4.2015
Soud dní znalecc, vedouccí úseku molekulár m rní genetik ky: I Ing. Ivana Vobrub bová Telefoon: Mobil: E-mail:
377 7 452 324 731 1 433 566 vob brubova@ @genetikaa-plzen.czz
Manažžer kvality y: Jana Rejtharová R á Telefoon: Mobil: E-mail:
377 7 452 059 737 7 650 158 rejttharova@ @genetikaa-plzen.czz
Vrchní laboranttka: Eva Kohoutov K vá
Telefoon: Mobill: E-maiil:
Kon nzultujícíí lékaři
LP
377 7 243 383 731 1 433 564 koh houtova@ @genetikaa-plzen.cz
Docc. MUDr.. Františeek Lošan, CSc. MU UDr. Petrr Lošan Pro of. MUDrr. Zdeňkaa Ulčová– Gallová, DrS Sc. MU UDr. Dagm mar Štenglová MU UDr. Olgaa Slunečk ková
sttr.:5/35
V Vydání: 10.
Laborratorní přříručka
P Platnost od: 330.4.2015
3. Zaměření laborato l oře a speektrum nabízený n ých služeeb Geneticcká laborattoř je rozděělena na 3 úseky ú • cytogenetic c cký • molekulárn m ně-genetickýý • reprodukčn r ní imunologiie Zde proovádí speciaalizovaná cyytogenetickká, molekuláárně geneticcká a imunoologická vyšetření a to z prim márních materiálů: m • plodové p voddy • periferní p krvve • fetální f krvee stěru z dutiiny ústní • slizničního s • potracené p tkkáně klků • choriových c • blastomer b • spermatu s (kkvalitativní a kvantitativní vyšetřen ní u neplodnných párů) • ovulačního o hlenu
d prováděn ných vyšetření: Přehled • genetické g v vyšetření děttí a dospělýých s vrozen nou vadou • vyšetření v roodin s výskyytem nádoroového onem mocnění v několika genneracích • vyšetření v m manželských h párů s poruuchou plodn nosti a s opaak. spontánnními potraty y • vyšetření v m mužské ploddnosti – sperrmiogram • předmanžel p lské vyšetřeení pokrevněě příbuznýcch partnerů • screening vrozených v vývojových vad v plodu v I. a II. trim mestru těhottenství • 3 D (4 D) – ultrazvukoové vyšetřenní plodu • prenatální p genetické vyšetření – odběr plodové p voody event.. choriovýcch klků s vyšetřením m karyotypuu plodu • u indikovanných případdů rychlé vyyšetření plod dové vody nebo n chorioových klků metodou m Q – PCR QF R (do 24 hod.). h Vyšeetření prov vádíme i jaako nadstanndardní (neehrazené p pojišťovnou u) • chromozom c mální vyšetřření klasickkými cytogeenetickými metodami m vvčetně FISH H metod ( (mikrodeleč ční syndrom my) • chromozom c mální vyšetření potracenných plodů • STR analýzza k ověřeníí příbuzenskkých vztahů ů • molekulárn m ně genetickké vyšetřeení dědičn nosti sklonnu k trom mbózám (v vyšetření t trombofilní ích stavů), cystické c fibbrózy, mikrodelece Y chromozom mu a nesynd dromové h hluchoty ( GJB2 G ) • vyšetření v ceeliakie • vyšetření v geenu (BRCA A1,2) souvissejících s heereditálním CA C prsu a oovarií
LP
sttr.:6/35
V Vydání: 10.
Laborratorní přříručka
P Platnost od: 330.4.2015
•
stanovení protilátek p prroti spermiíím v séru, ejakulátu, e ovvulačním seekretu, folik kulární i p peritoneáln í tekutině • vyšetření v prrůniku sperm mií ovulačnním hlenem • vyšetření v inntrakrozom málních enzyymů v lidský ých spermiíích • vyšetření v ovvulačního hlenu h • vyšetření v anntizonálníchh protilátek stannovení protiilátek proti profilu fossfolipidů: annexinu V,, phosphatiddil (ph)-serrinu, phinossitolu, ph-ettanolamínu, ph- D glyccerolu,proti kyselině foosfatidové, kardiolipin nu a β2 glykkoproteinu I • konzultační k í činnost V naší laboratoři l jee možné proovést pouzee izolaci DN NA a zprosstředkovat vvyšetření prrováděná ve speciializovanýcch centrech molekulárn m ní genetiky (např. ( Lynchhův syndrom m, FAP apo od.).
3.1.
Seznam nabízenýc n ch laborattorních vy yšetření
netiky 816 - Laaboratoř léékařské gen •
SOP 01
Cytogen netické vyššetření kary yotypu z lid dských bun něk
•
SOP 08
Detekcee mutace 355delG v gen nu pro Con nnexin 26 p pomocí alellově specifick ké PCR
•
SOP 09
Detekcee mikrodeleecí na chro omozómu Y pomocí m multiplex PC CR analýzyy
•
SOP 10
Určován ní otcovstvví pomocí STR analýzyy
•
SOP 11
Vyšetřeení aneuplooidií, mikro odelecí a strrukturálnícch změn chromozomů metoodou fluoreescenční in situ hybrid dizace (FIS SH)
•
SOP 12
Vyšetřeení aneuplooidií chrom mozomů 13, 18, 21, X a Y pomocíí STR analýzyy metodou QF PCR (A Amnio QF PCR)
•
SOP 14
Detekcii predispozičních alel k celiakii za z pomoci aalelově speccifické PCR
•
SOP 16
Stanoveení mutací zodpovědn ných za vroozené tromb bofilní stav vy pomocí Real R Time
LP
sttr.:7/35
V Vydání: 10.
Laborratorní přříručka
P Platnost od: 330.4.2015
•
SOP 17
Vyšetřeení expanzee CGG repeetice ve FM MR1 genu m metodou PC CR s násled dnou fragm mentační an nalýzou
•
SOP 18
1) Mutačn ní analýza/sscreening genů g metoodou Sangeerova sekveenování
•
SOP 19
Vyšetřeení mutací CFTR C genu u metodou multiplex PCR s násllednou fragmeentační anaalýzou
•
SOP 20
Vyšetřeení počtu koopií CNV metodou m koomparativn ní genomov vé hybridiizace na čip pu (ARRAY Y CGH)
•
SOP 21
1) Mutačn ní analýza genů g metodou NGS /platformaa MiSeq, Illlumina)
813-Lab boratoř rep produkční imunologiee •
SOP 31
Stanoveení protiláttek proti ka ardiolipinu u ve třídách h IgG a IgM M metodou u ELISA
•
SOP 32
Stanovvení protiláátek proti annexinu a V ve třídách h IgG a IgM M metodoou ELISA
•
SOP 33
•
SOP 34
Stanoven ní antisperm matických protilátek ve třídě IggAa IgG v ejakuláátu a ovulaačním hlenu u hemagluttinační mettodou – příímý a nepřímýý MAR testt ⃰
•
SOP 37
Určováníí akrosomů ů spermií Lektinem L z Pisum Satiivum označenýým FITC im munofluorrescenční metodou⃰ m
•
SOP 38
Průkaz anti-sperma a atozoidálních protiláteek v séru aaglutinační metodou
•
SOP 39
Stanoven ní antizonállních protillátek hemaaglutinačním m testem
•
SOP 03
Vyšetření spermioggramu mikrroskopickou technikou
Stanoveení protiláttek proti beeta2-Glykoproteinu I ve třídách IgA a IgG meetodou ELIISA
1) gen BRCA1, B BRCA22
Metodyy označené ⃰ nejsou ak kreditoványy.
LP
sttr.:8/35
V Vydání: 10.
Laborratorní přříručka
3.2.
P Platnost od: 330.4.2015
Smluvní laboratořř
Laborattoř lékařskké genetikyy spolupraccuje s akreditovanou laboratoří Centrum lékařské v kritickýcch situacích genetikyy s.r.o. České Č Buděějovice ve smyslu výpomoci v h a ke konzultaacím. Dopravuu zajišťuje odesílající o l laboratoř. Ve výslledkovém listu je jasnně uvedeno, která laborratorní vyšeetření byla provedena smluvní laboratooří nebo konnzultantem.
4. Proohlášeníí o souhlaasu ná v rámci Genetickéhho pracoviště patří Některéé odběry prro laboratorrní vyšetřenní prováděn mezi invazivní a léékař odebíraající materiiál je povineen informovvat pacientyy a pořídit písemný p souhlas o tomto informovánní na záklaadě platné legislativyy. Pacient jje vždy seeznámen s účelem m, povahou a důsledkeem prováděnného vyšetřření. Svým podpisem p sstvrzuje, že souhlasí s odběreem, geneticckým a imuunologickým m vyšetřením m a případnným uchovááváním odeebraného genetickkého materriálu (je vždy v uveddeno v info ormovaném souhlasu DNA). V případě nesouhllasu paciennta s uchováváním DN NA je po odebrání identifikace i likvidován na, jako biologiccký materiál.
Samosstatnou přílohou p této příručky jsou formuláře prro inform movaný souhlaas: • •
Souhlas s provedením S p m amniocen ntézy/odběrru choriovýých klků S Souhlas v vyšetřované é/ho (zákoonného zá ástupce) s genetickýým labora atorním v vyšetřením m
•
Nesouhlas vyšetřovan N né osoby (zzákonného zástupce) s genetick kým labora atorním v vyšetřením m – negativn ní revers I Informova ný souhlas a informace o ultratrrazvukovém m vyšetření 3D (4D)
•
Těhotnáá pacientka je vždy infformována a seznámenaa o modernním ultratrazzvukovém vyšetření v D3 (D4), kdy je pooučena o tom m, že touto metodou nelze rozpozznat všechnyy vrozené vývojové v m podpisem ztvrzuje, z žee s touto sku utečností byyla seznámena. vady ploodu a svým
LP
sttr.:9/35
V Vydání: 10.
Laborratorní přříručka
P Platnost od: 330.4.2015
5. Maanuál prro odběr primárn ních vzorků V této kapitole k jsoou všechny specifické pokyny tý ýkající se správného s oodběru a zaacházení s primárrními vzorkky. Tyto pokkyny jsou důležité d nejeenom pro pracovníky p llaboratoře, ale i pro pracovn níky odpovvědné za odběry o prim márních vzzorků. Praacovník odebírající primární p vzorky vždy ručí za z jejich od dběr, označčení a transport. Svým m podpisem m na průvo odce pro dané vyyšetření stvvrzuje, že primární vzorek v byl odebrán dle d pokynů ů této Labo oratorní příručk ky!!!
Ovlivn nění výsleedků vyšetření: 1. N Nedodrženíí zásad a prravidel pro odběr, ulo ožení a trannsport do geenetické lab boratoře, k které jsou uvedené u v následujícíchh kapitolách h, ovlivňuje výsledky vvyšetření. 2. Nedodržení N í doby dodáání materiáluu do laborattoře. 3. Nedostatečn N né nebo nečitelné popisy biologickkého mateeriálu odeeslaného k laboratornnímu vyšetřření. 4. Neúplné N vyyplnění průvvodky bioloogického maateriálu. 5. Dodání D konntaminovanéého biologicckého mateeriálu. 6. Dodání D neddostatečnéhoo množství biologickéh ho materiáluu. U jednootlivých vyššetření jsou popsány neegativní vliv vy na výsleddek vyšetřenní.
5.1.
Základníí informaace pro uživatele laboratoorních sllužeb gen Z netické l laboratoř ře
5.1.1. Cytogene tické mettody C Cytogen netické vyyšetření jee provedenno po indiikaci genettikem a řáádném gen netickém poradennství.
• Chromozzomální vyyšetření Slouží k určení karryotypu klassickými cytogenetickým mi metodam mi. Vyšetřeení se prováádí : Z plodoové vody/ch horiových klků k Důvodeem odběru plodové vody v je požžadavek naa chromozoomální vyšeetření buněěk plodu (tz. amnniocytů) neebo vyšetřeení jednotliivých genů ů k vyloučeení vývojovvých vad u plodu. Zároveňň lze vyšetřřit hladinu alfafetoprote a einu v plod dové vodě. Jedná J se o iinvazivní vy yšetření, kdy riziiko komplikkací se pohyybuje okoloo 0.5- 1% . Proto P musí být jasná inndikace k prrovedení odběru plodové vody v (amniiocentéze). Plodová voda v obsahhuje kožní a slizničn ní buňky z povrchhu plodu. Tyto T buňky se v laborattorních pod dmínkách, v kultivačním m mediu dáále dělí a dalším zpracováním z m je možné z nich vyšeetřit chromo ozomy ploduu a jeho gennetickou vý ýbavu. LP
sttr.:10/35
V Vydání: 10.
Laborratorní přříručka
P Platnost od: 330.4.2015
Změny v počtu nebbo ve strukttuře chromoozomů doprrovázejí závvažné vrozeené vývojov vé vady, které vee většině příípadů nelze po porodu léčit. Amnioccentéza se provádí p nejjčastěji meezi 16. - 18.. týdnem gravidity, g lzze ho však provést již od 14. týdne grravidity. Oddběr choriovvých klků se s provádí mezi m 9. - 13.. týdnem gravidity. V přípaadě odběru provedenéhho ve vyššších týdnech h gravidityy, je potřebba brát v úv vahu, že ukončenní těhotensttví z důvoduu poškozenní plodu je až na výjim mky povoleno pouze do d konce 24. týdnne těhotensttví. Vlastníí kultivace a zhodnoccení preparrátu se poh hybuje mezzi 9 – 16 dny, prroto je důleežitý termínn provedenní odběru. Je J nutné poočítat s dosstatečnou lh hůtou na kultivacci, zpracováání a odečtenní vzorku. Indikacce k vyšetřeení : • předchozí p narození plodu s chromozom c mální abnoormalitou nebo s vro ozenými v vývojovým mi vadami • narození n mrrtvého ploddu nebo úmrrtí novorozeence • nosičství n chhromozomální přestavbby • opakované o spontánní potraty p pohlavních • výskyt v mozzaiky nebo aneuploidie a h chromozom mů u jednohho z rodičů • pozitivní p sccreening maateřského sééra • věk v matky nad n 35 let • patologický p ý nález na ultrazvuku • pozitivní p sccreening I. trrimestru • další d méně časté indikaace
Z perife ferní krve Důvodeem odběru je j určení kaaryotypu vyyšetřovanéh ho pacienta.. Při cytogeenetickém vyšetření v karyotyypu z krve kultivujem me T-lymfoccyty. Dělen ní T-lymfoocytů stimuulujeme rosstlinným lektinem m Phytohem maglutinineem (PHA). Pod mikrroskopem sledujeme počet a strukturu s jednotlivých chroomozomů. Odběr nepprovádíme po transffúzi a proovedené in nfuzi (u novorozzence) a po alogenní trransplantacii kostní dřeeně z důvoddů vlivu na výsledky vy yšetření. Karyotyyp by odpovvídal karyottypu dárce, ne pacientaa. Indikacce k vyšetřeení : • abnormální a fenotypickké příznaky u pacienta • problémy p růůstu a vývojje u pacientta • mentální m rettardace pacienta nebo v rodině paccienta • narození n mrrtvého ploddu a úmrtí noovorozencee • opakované o spontánní potraty p • problémy p s fertilitou • pozitivní p roodinná anam mnéza chrom mozomálnícch přestavebb
LP
sttr.:11/35
V Vydání: 10.
Laborratorní přříručka
P Platnost od: 330.4.2015
Z potraacené tkáněě Důvodeem odběru je j určení kaaryotypu pootraceného plodu. p K vyyšetření je nnutné dodat sterilně odebrannou tkáň o velikosti 0,5 x 0,5 cm m (minimállně), která se s vloží doo sterilní zk kumavky s médieem (nebo fyyziologickýým roztokem m) a v co neejkratší dobbě dopravit nna vyšetřen ní. Indikacce k vyšetřeení : • stanovení s k karyotypu pootraceného plodu • vyloučení v v vrozené chroomozomovéé aberace u plodu • odběr o se neprovádí po transfuzi, infuzi (u novorozence) – karyootyp, by od dpovídal k karyotypu d dárce, ne paacienta
Ovlivněění výsledk ků vyšetřen ní: • kvalita k provvedení odběěru a uchováání biologicckého materriálu • medikace m p pacienta s dllouhodobouu léčbou • životní ž styl (kouření, stres)
5.1.2. Molekulá M árně-cytoggenetické metody •
FISH vyššetření
Fluoresccenční hybrridizace in situ (FISH H) je založena na naváázání fluoreescenčně zn načených DNA sond s ke koomplementáárním úsekkům cílovéé DNA chhromozomů nebo inteerfázních buněčnýých jader fixovaných na n mikroskoopickém preeparátu. Ty jsou následdně vizualizzovány a detekovvány pomoccí epifluoresscenčního mikroskopu. m FISH vyšetření v s používá k upřesněnní a dopln se nění chrom mozomálníhho vyšetřen ní, popř. verifikaaci nálezu zjištěného zj běžným cytoogenetickým m rozborem m. V některýých případecch může FISH annalýza nahradit běžný cytogenetic c ký rozbor (selhání kulttivace, časoový stres). Metodaa FISH se dáále používáá při preimpplantační genetické diaggnostice. V Vyšetření jed dné nebo dvou buuněk (blastoomer) odebrraných z vyyvíjejícího se s embrya je tak možnné odhalit slledované genetickké abnormaality (aneuopploidie, nebbalancovanéé translokacce) budoucíího plodu. Po P tomto vyšetřenní lze k trannsferu do děělohy vybratt pouze emb brya s norm málním nálezzem. Používaané FISH sondy: s Centrom merické soondy • lokalizace: l hybridizují s repetitivnními satelitn ními sekvenncemi především v centromerrických oblastech
LP
sttr.:12/35
V Vydání: 10.
Laborratorní přříručka •
P Platnost od: 330.4.2015
ú účel: slouuží k diaagnostice numerickýc n ch chromoozomálních aberací, detekci chroomozómů neznámého n původu
Lokus-sspecifické sondy s • lokalizace: l hybridizují s jedinečnýými sekvenccemi DNA • účel: ú sloužíí k diagnostiice numericckých chrom mozomálnícch aberací, k vyšetření mikroodelecí u miikrodelečnícch syndrom mů (např. Prader-Willi//Angelman n sy., DiGeoorge sy.), zjištění zj ampllifikace onk kogenů a něěkterých speecifických translookací Celochrromozomovvé sondy hybridizujíí s mnohačeetnými chro • lokalizace: l omozomovýými sekvenccemi, označčují celý chromozom m •
ú účel: slouží k vyšetřření chrom mozomálnícch přestaveb a anaalýze komp plexních transslokací, k detekci půůvodu mark ker chromozzomů Podrobnnosti metoddy FISH jsouu uvedeny v SOP 11. Indikacce k vyšetřeení : Vyššetření preim mplantační genetické diagnostice d předchází podrobná p geenetická ko onzultace obouu partnerů, jejímž vyúústěním je podepsaný p informovan i ný souhlas, který dokum mentuje, že pár p dostatečnně porozum měl problem matice a moh hl se svoboddně rozhodnnout, zda prroceduru podstoupí. PGD (p preimplantaační diagnoostika transllokací) • páry, p kdy jeeden z partnnerů je nosittelem chrom mozomální přestavby, jjejíž nebalaancované f formy vedoou k časným m potratům, či vývoji po ostiženého plodu p PGS (preimplantaační geneticcký screeniing nejčastějších aneu uploidií) • páry p s norm málním karyyotypem a opakovaným o mi časnýmii SAB. Nutnno vzít v úv vahu, že p páry se SAB B mají vysookou pravděěpodobnost přirozenéhoo početí. • páry p s opakkovaným selháním IVF F (více než 3 embryotransfery bezz pozitivního nálezu g gestačního u) váčku 5 týddnů po embrryotransferu • vyšší v věk žeeny nad 36 let Sexing (volba poh hlaví) • X – vázanáá onemocnnění (Ducheennova/Beckerova muskulární dyystrofie, hem mofilie), p pokud není dostupné cílené PCR vyšetření v Ovllivnění výslledků vyšettření: při preimplanta p ační genetické diagnosttice se nedo oporučuje: • pokud p má žena ž nízký počet p folikuulů • špatnou kvaalitu embryíí • BMI B nad 300
LP
sttr.:13/35
V Vydání: 10.
Laborratorní přříručka • •
P Platnost od: 330.4.2015
vvěk nad 45 let b bazální FSH H větší než 15 IU/l
Vyšetřření metodou arrayy CGH Array CGH C (kom mparativní genomová g h hybridizace na čipu) je j molekullárně cytog genetické vyšetřenní celého geenomu. Prim márně sloužží k odhalen ní nebalanccovaných abberací (ztrátt a zisků sekvenccí), jejichž umístění u v genomu neení předem známé. Hlaavním princcipem je ko ompetice fluoresccenčně znaačené refereenční DNA A se značeenou DNA A pacienta o komplem mentární sekvencce rozprostřřené na čiipu. Intenziitu každého o spotu pooté zachytí speciální scanner, pomocí něhož můůžeme anallyzovat pom měr obou fluorochrom mů. Metoddou nelze prokázat p balancoované chrom mozomální odchylky, o n nízkofrekven nční mozaiccismus a bodové mutacce. Indikacce k vyšetřeení : Metodaa array CG GH se pouužívá v diaagnostice postnatální, p prenatální i preimpllantační. Vyšetřeení je indikoované u paccientů s poddezřením na vrozenouu vývojovouu vadu s gen netickou aberací,, u kterých klasickými cytogenetiickými a mo olekulárně genetickým mi metodam mi nebyly prokázáány žádné zm měny genettické výbavyy.
Postnattální diaggnostika (normální ( karyoytyp p, normállní molek kulárně geenetická vyšetření, např. vyyloučení syyndromu frragilního X) X a bez vysvětlené přííčiny: • • • • • • •
ppsychomotoorická retarddace / stigm matizace p problémy růůstu a vývojje m mnohočetné é vrozené vady v z zdánlivě baalancovaná aberace, a upřřesnění naleezené aberaace (marker chromozom m, de n novo aberacce apod.) v vyšetření obbou rodičů současně s s vyšetřením v plodu, pokuud jeho stářří překročilo o 20. t týden gravidity a nepřeesáhlo ukonnčený 24. tý ýden těhotennství v vyšetření obbou rodičů v případě čiipového nállezu u ploduu nebo dítětte k objasněění, zda s jedná o aberaci se a de novo n nebo zdděděnou neebo pro posoouzení patoggenity nálezzu n nelze vyšetřřit karyotypp (nemožnosst kultivace, nedostatekk materiálu apod.)
Prenatáální diagnoostika (norm mální karyotyp a záro oveň): • • •
a abnormální í ultrazvukoový nález vvýznamně vyšší v NT naad 3 mm n nosičství chhromozomální přestavbby a to i zděěděné od roddiče (vylouččení de nov vo m mikrodelecí í nebo mikrroduplikací v místech zlomů) z • nelze n vyšetřřit karyotypp (nemožnosst kultivace, nedostatekk materiálu,, nedostateččné lhůta p provedeení do ukonnčeného 24. týdnu těhottenství apodd.) pro Metoduu a – CGH lzze použít i u prenatálníích vyšetřen ní, ale s věddomím, že vvýsledky mo ohou být neinform mativní nebbo nejasné. LP
sttr.:14/35
V Vydání: 10.
Laborratorní přříručka
P Platnost od: 330.4.2015
Preimp plantační diiagnostika:: • • • •
vvyšší věk žeeny - nad 355 let v doběě očekávanéého porodu o opakované neúspěchy předchozíchh cyklů asisstované reprrodukce - m min. 2× o opakované potrácení po vyloučeníí ostatních možných m přříčin - min. 2× p početní gonnosomové abberace (nappř. 47,XXX,, 47,XYY) a malé gonoosomové mo ozaiky d detekované z periferní krve - nad 10% • andrologick a ký faktor (naapř. těžká oligo-asteno o o-teratosperm mie) nebo ppoužití sperm mií z získaných m metodou ME ESA/TESE v asistovan né reprodukci • porod p nebo potrat dítětte (plodu) s chromosom movou aneuuploidií • chemoterap c pie nebo raddioterapie u jednoho j či obou partneerů v anamnnéze Ovlivn nění výsledk ků vyšetřen ní: • kvalita k provvedení odběěru biologicckého materriálu
5.1.3. Molekulá M árně-genettické metody Moleku ulárně geneetické vyšettření je proovedeno po indikaci geenetikem a řřádném gen netickém poradennství, nebo hematologe h m. k ke všem metodám m molekulární m í genetiky. Izolace DNA je výýchozí krok Laborattoř provádí : • izolaci i DNA A ze vzorku u periferníí krve a plo odové vodyy • izolaci i DNA A z kultivoovaných bu uněk buněččných kultu ur • izolaci i DNA A ze slizniččních stěrů • izolaci i DNA A z tkáně potracených p h plodů
QF PCR R vyšetřen ní • Rychlá R diaagnostika (do ( 24 hood od dod dání vzorkuu do laborratoře) aneeuploidií a autozomáln ních chromoozomů 13, 18, 1 21 a poh hlavních chrromozomů X X, Y analýzzou STR l lokusů na automatické a m genetickéém analyzáttoru (sekvennátoru). • Detekce D d dědičných onemocněnní zahrnujíící syndrom my Downn, Edward, Patau, K Klinefelter, , Turner, Jaccob(superm male), triple X (superfem male) a polyyploidie. Indikacce k vyšetřeení:
LP
•
r riziko biochhemického screeningu s I. a II. trimeestru vyšší než n 1:100.
•
c celkové gennetické rizikko nad 10% %.
sttr.:15/35
V Vydání: 10.
Laborratorní přříručka •
a abnormální í ultrazvukoový nález.
•
k kombinace více rizikovvých faktorůů.
P Platnost od: 330.4.2015
Vyšetřeení mutací v CFTR geenu pro cysstickou fibrrózu • • •
Laboratoř provádí vyyšetření 333 mutací CFTR L C genuu a stanovvení polym morfismu v intronu 8 ( Tn variannty ) pomocíí OLA kitu (Celera Diaagnostic). V Vyšetřovan né mutace zaachytí 91,7% % všech mu utací CTFR genu v českké populacii. T je schoopen zachyytit jak asym Test mptomatickéé přenašečee (heterozyggoty), tak postižené p j jedince (hom mozygoty).
Indikacce k vyšetřeení : • • • • •
u pacienta s příznaky cystické c fibrrózy. u příbuznýcch pacienta s cystickouu fibrózou a detekovanýými mutacem mi v CFTR R. u partnera nosiče mutace m předd plánovan ným těhoteenstvím, ppřípadně v průběhu t těhotenství. . u dospělýchh mužů s pooruchou ploddnosti. p prenatální d diagnostika v případě partnerů p heteerozygotů pro p mutaci v CFTR gen nu.
Vyšetřeení nečastějjších mikroodelecí AZF F oblasti na a Y chromozomu • •
aanalýza AZ ZF oblasti (aazoospermiccký faktor) na n dlouhém m rameni Y cchromozom mu j jsou vyšetřoovány oblassti AZFa, AZFv, A AZFcc a z každé oblast jsou vyšetřován ny 2 STS l lokusy
Uvedenný postup zaachytí cca 90% delecí v AZF oblasstech Indikacce k vyšetřeení •
P Porucha ploodnosti u mužů m – azosppermie nebo o těžká oligoospermie.
Vyšetřeení na přítoomnost trom mbofilních h variant : • • •
ggen pro koagulační faaktor V – varianta v FV V Leiden – G1691A (A AGR506Thrr) g protrombin (koaggulační fak gen ktor II) – vaarianta G20210A g pro meethylentetrahydrofoláát reduktázzu – MTHF gen FR – variantta C677T variannta A1298C
Indikacce k vyšetřeení
LP
sttr.:16/35
V Vydání: 10.
Laborratorní přříručka • • • • • • •
P Platnost od: 330.4.2015
žžilní trombóóza (emboliie) u jedincee pod 50 lett t trombóza na neobvykléém místě t tromboemb bolická chorroba u pacieenta se zatížženou rodinnnou anamnéézou ž žilní trombóóza v průběěhu těhotensství nebo v souvislosti s užíváním hormonáln ní terapie n nebo antikooncepce p pacient předd plánovanýých chirurgiickým výko onem s rodinnnou anamnnézou p pacientka s opakovanýými potratyy v II nebo o III trimestru těhotennství bez ob bjasněné p příčiny i indikace kliinickým hem matologem
Vyšetřření mutacee 35delG v genu pro connexin c 26 6: • Detekce D prrevalentní mutace v genu pro connexin 26. Vyšettřovaná mu utace je n nejčastější p příčinou ztrráty sluchu • vyšetřením v je možnéé zachytit jak postižžené jedincce (homozzygoti), tak k slyšící p přenašeče (heterozygotti) Indikacce k vyšetřeení • vrozená v preelinguální zttráta sluchuu • vrozená v preelinguální zttráta sluchuu v rodině • vyšetření v vrrozené ztrátty sluchu přřed kochleárrní implantaací • testování t přřítomnosti mutace m u paartnerů v přřbuzenském m svazku, poopř. u novo orozenců n narozených h z incestnícch vztahů • vyšetřování v í slyšících příbuzných p v rodinách, kde již bylaa mutace zjištěna
DNA urrčování otccovství pom mocí STR markerů: m • multiplex m P PCR 16-ti STR markerůů s následnou fragmenntační analýýzou, za pou užití kitu A AmpFLSTR R ® Identifiiler® Kit • s posudkem m soudního znalce se musí m vyšetřiit domnělý otec, matkka a dítě (po opř. více d domnělých otců, či vícce dětí) • pokud p je požadován n posudek soudního znalce muusí být vzoorky odebrrány dle p protokolár rního odběrru (viz kap. 5.4.5) • pokud p posudek není požadován n, lze provéést analýzu jen j otce a ddítěte bez vyšetření v m matky, v toomto případdě se neproovádí proto okolární od dběr (tyto analýzy pro ovádíme p pouze ve vyyjímečných případech s ohledem na n zájmy neezletilého díítěte) Vyšetřeení provád díme na záákladě objeednávky žadatelů ž o vyšetření (soukroméé osoby, soudy, státní s zastu upitelstva, popř. p jiné orgány o činn né v trestníím řízení).
LP
sttr.:17/35
V Vydání: 10.
Laborratorní přříručka
P Platnost od: 330.4.2015
DNA vyyšetření prredispozičních alel k celiakii: c • vyšetření v see provádí zaa účelem deetekce HLA alel predisppozičních k celiakii Vyšetřoované alely se vyskytují u více nežž u 99% paccientů s celiakií a u 20% % zdravých kontrol. Přítomnnost predisppozičnách allel zvyšuje 50x 5 riziko onemocnění o í celiakií opproti populaci. Indikacce k vyšetřeení: • • • •
nneprospívánní u dětí z zažívací potíže v výskyt celiaakie v rodinně a anemie neznámého půvvodu
Vyšetřeení syndrom mu fragilníího X chrom mozómu - FRAXA F PCR vyyšetření ke stanovení s poočtu opakovvání CGG reepetice v geenu FMR1. Syndrom m fragilníhoo X chromoozomu je nej ejčastější přííčinou menttální retardaace u chlapcců, může být přiččinou menttální retarddace i u dívek. d Nosičky premuutace mohoou trpět přeedčasým ovariálnním selháním m. U nosičůů (mužů) prremutace se může vyskkytovat preseenilní tremo or. Indikacce k vyšetřeení: • PMR, P autism mus v OA nebo n v RA • předčasné p o ovariální sellhání • presenilní p trremor u muužů
Vyšetřeení BRCA11 a BRCA2 genu Sekvenaace exonů a přilehlých intronovýcch oblastí geenu BRCA11 a BRCA2.. Nádor prsuu je jedno z nejčastěji n diiagnostikovaaných maliggních onemo ocnění u žen. V některýcch rodinách lze vysledovvat výskyt nádoru n prsu v několika generacích. g Takové T příppady, způsobbeny geneticckou predispoozicí, tvoří asi a 5-10% z celkového počtu p diagno ostikovanýchh. V současnné době jsou u známy dva hlavvní geny BR RCA1 a BRC CA2, které jssou v mutov vaném stavu zodpovědnéé za většinu hereditáárních karcinnomů prsu a vaječníků – asi v 70% BRCA1, B ve 20% BRCA A2 (syndrom my hereditáárního ovariáálního karcinnomu, heredditárního karrcinomu prsuu a ovarií a hhereditárníh ho karcinom mu prsu). Indikacce k vyšetřeení – sekvenace celéhoo genu: • 3x 3 diagnosttikovaná CA A prsu nebo ovarií u příbuzných p 1. - 2. stuppně, diagnostikován v jakémkoliiv věku • 2x 2 diagnosstikovaná CA C prsu neebo ovarií u příbuznýých 1.stupnně (nebo 2.. Stupně z paternálníím strany), alespoň jedden diagnosttikován předd 50-tým rookem • Sporadickýý výskyt LP
sttr.:18/35
V Vydání: 10.
Laborratorní přříručka
P Platnost od: 330.4.2015
bilatterální CA prsu p diagnoostikován přřed 50-tým rokem r bilatterální CA ovárií o diagnnostikován před p 50-tým m rokem duplicita CA prrsu a ovarií unillaterální CA A prsu nebo ovárií diagn nostikován před 40-tým m rokem mužžský paciet s CA prsu meddulární a atyypicky meduulární CA prsu, p vhodnéé do 50 let vvěku CA prsu tripple negativvní (negattivita estroogenových, progestero onových receeptorů a HE ER2), vhodnné do 50 let věku v výskyt BRC CA genu u příbutných p 1. Stupně o o o o o o o
•
U paciientek a pacientů, p ktteří nesplňňují výše uvedená u krritéria, vyššetřujeme pouze p 5 nejčastěějších mutaccí. Těchto 5 mutací zauujímá 52% mutačního m s spektra v čeeské populaci.
Vlivy na n výsledkyy molekulárrně genetick kého vyšetřření: • kvalita k prim márního vzoorku
5.1.4 Metody reproduk r kční imunoologie Jsou zaaměřeny na vyšetření buněčné odeezvy v podobě protilátkkových aktivvit namířený ých proti poohlavním buuňkám, sperrmiím a povvrchu oocytů ů, dále protii časným záárodkům. Vyšetřeení protiláttek proti fosfolipidům m ům fosfolippid-protein (aPL) je spojován s Výskyt protilátek proti fosfoolipidům a komplexů u (APS). AP PS zahrnuje i velmi početnou p s klinickkým obrazeem antifosffolipidovéhoo syndromu skupinuu nemocí auutoimunitníhho původu. Přítomnnost vysokýých hladin protilátek proti fosffolipidům u těhotnýchh žen je důvodem d zvýšenéé péče o paacientku, neboť n je nebezpečí sam movolného potratu, niitroděložníh ho úmrtí plodu nebo chorobnného sráženní krve (trom mbóza) se všemi v nežaddoucími účinnky. Vyšetřu ujeme: • protilátky p proti kardiiolopinu vee třídě IgG,, IgM • protilátky p proti annexxinu V ve třídě t IgG, IgM I • protilátky p proti beta22-glykoprotteinu I ve třídě IgA, IgG • protilátky p proti phosp phatidil (ph h) – serinu ve třídě IggG, IgM • protilátkyy proti ph-in nositolu ve třídě IgG, IgM • protilátky p proti ph-ettanolamínu u ve třídě Ig gG, IgM • protilátky p proti kysellině fosfatid dové ve tříd dě IgG, IgM M • protilátky p proti ph- D glycerinu u ve třídě Ig gG, IgM
LP
sttr.:19/35
V Vydání: 10.
Laborratorní přříručka
P Platnost od: 330.4.2015
Indikacce k vyšetřeení: • primární p steerilita u ženny • opakované o doposud neevysvětlené potrácení • opakované o doposud neevysvětlené neúspěchy při oplodněění ve zkum mavce (IVF)) • pacientky p se základním m autoimunnitním onem mocněním • pacientky p s anamnézouu preeklamppsie- eklamp psie
Vyšetřeení antizonálních prottilátek Protilátkky zaměřenné proti antiigenům zonna pellucida v séru mohhou způsoboovat u žen primární p i sekunndární sterilitu i tím, že nedojdde ke splyn nutí spermiie s vajíčkkem. Jsou obrazem o autoimuunitní reaktiivity k povrrchu oocytu, k zoně pelllucidě. Indikacce k vyšetřeení: • prim mární sterilitta u ženy • opakkované dopposud nevyssvětlené pottrácení • opakkované dopposud nevyssvětlené neú úspěchy při oplodnění vve zkumavcce (IVF) • paciientky se záákladním auutoimunitníím onemocnněním • paciientky s anaamnézou preeeklampsie-- eklampsiee
Vyšetřeení antisperrmatozoidáálních prottilátek Protilátkky proti speermiím bránní přirozenéé kapacitačn ní a akrozom mální reakcci spermií, stávají s se překážkkou pro splyynutí sperm mie s oocyteem. Vlastníí průnik speermií genitáálním trakteem ženy bývá naarušen příttomnými prrotilátkami proti sperm miím jednaak v ovulaččním sekretu hrdla děložníhho, jednak přítomným mi ve vlastnním ejakuláátu. Také vzájemné v vzztahy mezi obalem vajíčka,, zonou pelllucidou a následné n sppojení s mužskou pohlavní buňkoou může bý ýt těmito protilátkkami ztíženno. Protilátkky proti speermiím vyšeetřujeme v séru, s ejakuláátu a ovulaččním hlenu. Indikacce k vyšetřeení : • • • • • •
LP
pprimární steerilita u ženny o opakované doposud neevysvětlené potrácení o opakované doposud neevysvětlené neúspěchy při oplodněění ve zkum mavce (IVF)) p pacientky se základním m autoimunnitním onem mocněním p pacientky s anamnézouu preeklamppsie- eklamp psie u mužů z pááru pro snížženou plodnnost
sttr.:20/35
V Vydání: 10.
Laborratorní přříručka • •
P Platnost od: 330.4.2015
eejakuláty přřed kryokonnzervací sppermií z dův vodu závažnného onemoocnění, dlou uhodobé n např. služebbní pracovnní cesty apodd. u mužů- dárrců spermií
Vyšetřeení intraak krozomálnícch enzymů Intraakrrozomální enzymy e jsoou velmi důůležité v přřímě reakci povrchu sppermie s po ovrchem oocytu, zonou pelluucidou. Jejich množstvví (%) dotvááří i celkovvou kvalitu ejakulátu. Indikacce k vyšetřeení: • muži m z páruu pro snížennou plodnosst • ejakuláty e přřed kryokonnzervací sppermií z dův vodu závažnného onemoocnění, dlou uhodobé n např. služebbní pracovnní cesty apodd. • u mužů- dárrců spermií Průnik spermií ovvulačním hllenem peneetrační mettodou (Kreemerův testt) Kremerrův test pattří mezi traadiční, osvěědčené testy y penetračnní (test proonikání) a současně s vyhledáávácí (screeeningové). Úkolem je posoud dit vzdálenost, kteroou urazí spermie v ovulaččním hlenu za jednotkuu času. Navvíc sledujem me počet speermií s proggresivním po ohybem, posuzujeme charakkter spermiee a popřípaddě změny na n hlavičkácch spermií. Kremerův test t patří mezi neejpoužívanějjší testy v reprodukční imunologiii, protože jee přesnější a citlivější než n např. klasickýý test po necchráněném pohlavním styku (posttkoitální testt). Indikacce k vyšetřeení : • u všech ženn s ovulací a jinak snížeenou plodno ostí: • primární p steerilita u ženny • opakované o doposud neevysvětlené potrácení • opakované o doposud neevysvětlené neúspěchy při oplodněění ve zkum mavce (IVF)) • pacientky p se základním m autoimunnitním onem mocněním
Vyšetřeení spermioogramu : • Vyšetření V s spermií (sppermiogram m) – mikrosk kopické vyššetření ejakuulátu (sperm matu) na j jehož základě se orienttačně posuzzuje plodnosst muže. • Vyšetřovan V né parameetry jsou: objem, visskozita, příítomnost ciizorodých součástí, s k koncentrace e, pohyblivoost a morfollogie. • Kapacitace K e spermií (separace, Swim-up) S – ejakulát se upraví na optimální množství m s spermií a oddělí se živé sperrmie od mrtvých. m U Upravený vvzorek lze použít k inseminaaci AIH.
LP
sttr.:21/35
V Vydání: 10.
Laborratorní přříručka
P Platnost od: 330.4.2015
Indiikace k vyššetření : • porucha p ploodnosti • genetická g inndikace Ovlivněění výsledk ků vyšetřen ní reproduk kční imunollogie: • před p odběreem periferníí krve omezzit na 24 hod din příjem tuků t • nedodržení n předepsané pohlavní abstinence a
5.2.
I Identifika ační oznaačení prim márního vzorku v
Každý biologický b m materiál muusí být oznaačen štítkem m s uvedením m minimáln ně: 1. jméno a příjmení pacienta p 2 rodné číslo 2. č paciennta (pokud je to možn né) případnně jiný kódd (např. dattum, rok narozenní apod.) d, vždy musí být zajišštěna jedno označná U samooplátců (naapř. cizincii) je uveden jiný kód identifiikace vzork ku a dokum mentů. Poznám mka: Kód - je j uváděn u neznámýchh osob, ciziinců apod. u nichž nejssou k dispozzici informaace o r.č. nebo poouze v částeečném rozsaahu. Za jednnoznačné ozznačení průůvodky a materiálu m od dpovídá žaddatel o vyššetření. Vžd dy musí zajistit nezaměnitelnost mateeriálu a dokumentacee.
5.3.
P Průvodka a na laborratorní vyyšetření
Do labboratoře je přijímán materiál doprovázený d ý průvodkoou genetické laborato oře, dle požadovvaného vyššetření (cyytogenetickoou, moleku ulárně-genettickou, imuunologickou u) nebo adekváttní, která muusí obsahovvat: Povinnéé údaje: • jednoznačn j ná identifikaaci pacienta o jménno a příjmeení o rodnné číslo (čísslo pojištěncce) o datuum narozeníí o pohlaví
LP
sttr.:22/35
V Vydání: 10.
Laborratorní přříručka • • • • • •
P Platnost od: 330.4.2015
iidentifikaci žadatele o vyšetření – IČP lékařee, adresa a kontakt na žadatele (m může být u uvedeno naa razítku žaddatele) d diagnóza d druh primárrního vzorkku – vyšetřovaný materiál p požadovaná á vyšetření d datum a čass odběru priimárního vzzorku, identifikace praccovníka provádějící odb běr d datum a čass přijetí vzoorku laboratoří (je uvád děn v Laboratorním infformačním systému/ s L Laboratorní í knize)
Nepovin nné údaje : • bydliště b paccienta • telefon t paciienta 5.3.1.
Požadavk ky na urgen ntní vyšetřření
Požadavvky na vyšeetření STATIM (akuttní vyšetřen ní) se do laaboratoře doodávají na stejných průvodkkách jako pro ostatníí běžná vyyšetření a jsou j navíc označeny červeným slovem STATIM M. Průvoodka mussí obsahoovat stejné povinnéé údaje jako u běžného cytogennetického, molekulárně m ě-genetickéého nebo imunologickkého vyšetřření. Vzoreek bude přednostně zpracoován a odečtten. dukční imun nologie STA ATIMOVÉ É vyšetřeníí neprovádíí. Laboraatoř reprod Samosttatnou příllohou jsou u průvodkyy k labora atorním vyyšetřením p poskytovan ných na Geneticckém pracoovišti a na našich n stráánkách www w.genetika--plzen.cz
5.3.2. Ústní požžadavky naa vyšetření V době,, kdy je biollogický matteriál či prim mární vzoreek uchováváán v laborattoři pro požžadované vyšetřenní, je možnné přijmouut ústní požžadavek k dodatečném d mu dovyšetřření. Požad davek je přijímánn od lékaře nebo sestryy, nikoli od pacientů (s výjimkou samoplátců) s ). Externí žadatel je požádánn o dodání nové n průvoddky na doorrdinované vyšetření. v
5.3.3.
Důvody pro p odmítn nutí vzorků ů pro zpracování
Odmítn nout lze: • průvodku p s biologickým m materiáleem, na kteréé chybí nebo jsou nečittelné základ dní údaje ( Průvoddka na lab.vvyšetření) (viz • průvodku p n nebo odběrovou nádobuu znečištěno ou biologickkým materiáálem
LP
sttr.:23/35
V Vydání: 10.
Laborratorní přříručka • •
•
• •
P Platnost od: 330.4.2015
nnedostatečnné množstvví biologicckého materiálu nutnného pro zpracováníí (např. z důvodu roozlití či rozbbití během transportu) t n nádobu s biiologickým m materiálem m, kde není způsob ideentifikace m materiálu z hlediska n nezaměnite lnosti dostaatečný, za dostatečnou d identifikacii materiálu se považujee splnění u uvedených pokynů o nezbytné n ideentifikaci biiologického materiálu ((kapitola 5.2 2) n nádobu s biiologickým materiálem m, kde zjevn ně došlo k porušení p dopporučení „ffáze před v vyšetřením“ “ (výsledkyy vyšetření by byly negativně n o ovlivněny kkvalitou maateriálu n například nedodržení času č pro zprracování speermiogramuu, nevhodnáá odběrová nádoba) n b biologický m materiál bezz průvodkyy (bez uvedeení požadavvků oprávněné osoby) p průvodku d dospělého pacienta od o zdravotn nického subbjektu s odborností pediatrie p ( (pokud nem má zároveňň odbornostt lékařská genetika), g p průvodku m muže od su ubjektu s o odborností gynekologgie, pokud není souv vislost s diaagnózou paartnerky, průvodku p a ambulantníh ho pacientaa od subjektuu s odborno ostí lůžkovéého oddělenní
5.3.4. Způsob řešení ř neshod na příjm mu materiá álu • N Neúplnost údajů ú na průůvodce - ihnned se kom munikuje se žadatelem o vyšetření a zajistí s veškeré informace se i p možnostt zpracován pro ní materiálu a uvolnění výsledků. • Pokud P je doodán materiiál bez průvvodky, nebo o není jednooznačně ideentifikovaný ý a jedná s o nenahrraditelný vzzorek (napřříklad potracená tkáň) laboratoř zzačne tento materiál se v vždy zpracoovávat, ale výsledky nebudou n uv volněny dokkud žádajíccí lékař neb bo osoba o odebírající materiál neepřevezmouu odpovědno ost za doplnnění správnných identiffikačních ú údajů. Labborantka Genetického G o pracovišttě doplní informace do laborratorního i informačníh ho systémuu (příslušné Laboratorn ní knihy) s uvedením jména pracovníka, k který poskyytl doplňujíccí informacee. • V případě chybějící c d dokumentac ce je extern ní žadatel požádán o zaslání příslušné p p průvodky. • V případě, že vzorek nelze n zpraccovat (zneh hodnocen, porušení p fázze před vyššetřením, n neoprávněn ný požadaveek, nedostattečné množství) je zapsán do LIS s uvedením m – data, i identifikace e pacienta, pracovníka p laboratoře a důvod oddmítnutí, koomu bylo odmítnutí h hlášeno. Praacovník labboratoře infoormuje teleffonicky žaddatele a požáádá o nový odběr.
5.4.
IInformacce pro od dběr bioologického o materiáálu včetn ně minim málního množstvíí
V této kapitole k jsoou uvedeny požadavkyy a pokyny pro odběr zpracovávaaných biolo ogických materiállů - doporuučené odběěrové nádobby, minimáální odebíraané množstvví a požad davků na transporrt a případnné zvláštní načasování n o odběru. 5.4.1.
LP
Odběrové nádoby
sttr.:24/35
V Vydání: 10.
Laborratorní přříručka
P Platnost od: 330.4.2015
Materiáál musí býýt dodáván n do laborratoře ve sterilních s o odběrových h nádobkácch nebo zkumavvkách, pokuud možno na n jedno pouužití.
Doporuučujeme užívvat níže uveedené odběrrové systém my, minimállně konzervvační látky y: •
Plodová vooda P o zkuumavky Vaccuette: žlutéé víčko. Odb běr do zkum mavek bez kkonzervačníí látky
•
Choriové klky C k o zkum mavky Vacuette: zelenné víčko. Od dběr do zkuumavek s lithhium Heparrin
•
Potracená tkáň P o zkum mavka s meediem Bio AMF (med dium na poožádání labboratoř dodá), nebo fyziiologickým roztokem Spermie o Sterrilní kontejnner s červenným víčkem m
•
•
Bukální stěěry B o Sterrilní zkumavvka s kartáččkem nebo sterilní s nyloonové výtěrkky k PCR vyšetření v
•
Periferní krev P k o na chromozom c mální vyšetřření: zkumavvky Vacuettte (zelené víčko) v s náplní lithium m Heparin o na molekulárn m ně – geneticcké vyšetřeení: zkumavvky Vacuettte (fialové víčko) s ná áplní K3ED DTA o na imunologic i cké vyšetřen ní: zkumavvky Vacuettte (červenéé víčko) se separačním m gelem
•
Ovulační hlen O h o sterrilní skleněn né kapiláryy
Při odběěru je nutnéé vždy odběrové nádobky vhodně označit (dlee výše uvedených praviidel). Pozor na n záměnu biologického materiáálu! Nestand dardní odb běr je nutnoo specifikovvat na prův vodce.
LP
sttr.:25/35
V Vydání: 10.
Laborratorní přříručka
P Platnost od: 330.4.2015
5.4.2. Odběr O plod dové vody – amniocen ntéza Po ultraazvukovém vyšetření a náběru krvve se těhotn né pacientcee provede oodběr plodo ové vody pod konntrolou ultraazvuku a zaa sterilních podmínek. p Vlastní V odbběr plodové vody prováádí lékař gynekollog punkcí přes p stěnu břišní b při koontrole ultraazvukem, abby nedošlo k poranění plodu p Těhotnáá leží na lůůžku, břišnní stěnu dezzinfikujemee a poté ulltrazvukovoou sondou hledáme vhodné místo pro vpich jehloou (průměrr 0, 53 mm m-menší nežž na odběr kkrve!), na kterou k se nasadí sterilní vaakuová zkuumavka. Pooloha hrotu u při vpicchu je neuustále kontrrolována ultrazvuukem. • Specifika odběěru: p vyšetřen ní je 10 ml Minimáální odebranné množstvíí potřebné pro Při stanndardním oddběru je odssáto do tří zkumavek z celkem 20 ml m plodové vvody, tj. po ouze 5 % celkovéého množstvví plodové vody. v Odsááté množstvíí se do někoolika málo hhodin opět doplní. d Bolestivvost výkonuu je srovnatelná s běžnou injekcí nebo n odběreem krve. Poo výkonu, pokud p se těhotná cítí dobře, může m s dopprovodem oddejít domů. Pro odbběr plodovéé vody na Genetickém m pracovištti je nutné objednání na naší am mbulanci. Pokud se s odběr neeprovádí naa našem prracovišti je nutné zajisstit transporrt do laborratoře co nejdřívee, nejpozděěji však do 24 2 hodin po odběru.
O choriových klk ků 5.4.3. Odběr Po ultrrazvukovém m vyšetření se těhotnné pacientce provede odběr chooriových klků pod kontroloou ultrazvukku a za sterrilních podm mínek. Vlasstní odběr prrovádí lékaař gynekolog g punkcí přes stěnnu břišní přři kontrole ultrazvukem u m, aby nedoššlo k poraněění plodu. Těhotnáá leží na lůůžku, břišnní stěnu dezzinfikujemee a poté ulltrazvukovoou sondou hledáme vhodné místo pro vpich v jehlouu, na kterouu se nasadí sterilní vakkuová zkum mavka. Poloha hrotu při vpicchu je neustáále kontroloována ultrazzvukem. • Specifika odběěru: p vyšetřen ní je jeden chhoriový klkk. Minimáální odebranné množstvíí potřebné pro Při stanndardním oddběru je proovedena kuultivace tkán ně i vyšetřeení QF PCR R. Pokud je získáno odběrem m jen minim mální množsství, prováddí se pouze vyšetření v QF F PCR a arrray - CGH. Po výkoonu, pokud se těhotná cítí c dobře, může m s doprrovodem oddejít domů. Pro odbběr choriovýých klků na Genetickém m pracovištii je nutné obbjednání naa naší ambullanci. 5.4.4. Odběr O periiferní krve pro genetiické vyšetřeení m n cytogenetické i molekulárně na m Odběr materiálu genetické vyšetření nnevyžaduje žádnou speciálnní přípravu pacienta. p Pro odb běr na imunologické vyšetření v see doporuču uje snížit přříjem tuků na minimu um.
LP
sttr.:26/35
V Vydání: 10.
Laborratorní přříručka
P Platnost od: 330.4.2015
Krev see odebírá z periferní žííly v loketnní jamce. Paže se volnně položí, ddezinfikuje se místo vpichu (např. ( Cutasept, Braunnoderm) – nesmí n se používat deziinfekce s ob bsahem jod du, které by mohly být příčinnou neúspěššné kultivacce. Po stabillizování pollohy proveddeme vpich jehlou s nasazenným nástavccem a po té t se na násstavec nasaadí příslušnná zkumavkka. Místo vp pichu se zakryje čtverečkem m z buničinny, opatrněě se přitlaččí a vytáhnne jehla a přelepíme náplast. Vyzvem me pacientaa, aby si tissknul místoo vpichu (ccca 2-5 minnut) a po ccca 20 min nutách si náplast odstranil. • Specifika odběěru: Optimállní množstvví je 4 – 5 ml krve, minimálně m však 2 ml (nnapř. u mallých dětí). Ihned I po odběru je j nutné zkuumavku proomíchat. Pro cytoogenetické vyšetření jee zelené víččko (heparrin), pro moolekulárně ggenetické jee fialové (K3EDT TA). Pro im munologickéé vyšetření je j červené víčko v (separrační gel) Odebranná krev se uchovává v lednici, přři teplotě 4 - 8º C. Je nutné zabrránit zmrzn nutí nebo přehřátíí krve, aby se s zachovalyy živé buňkky. Při trannsportu je vhhodné užívaat transporttní nádobu – „termostaatická taškaa“ nebo „terrmoska“. Transpoort do laboraatoře je nutnno zajistit co c nejdříve, nejpozdějii do 48 hodin. O potrracené tkán ně 5.4.5. Odběr z Oddebraný maateriál za sterilních s Provádíí vždy lékaař-gynekolog ve zdravvotnickém zařízení. podmínnek vloží doo sterilní, označené o zkkumavky, čii nádobky s mediem nnebo fyziolo ogickým roztokem m a s řádněě vyplněnouu průvodkouu dopraví do o laboratořee. • Specifika odběěru: k je nutné co c nejdřívee po odběru u dopravit do laborattoře (nejdéle do 24 Odebraaný vzorek hodin po odběru)
5.4.6. Odběr O sperrmatu (ejak kulátu) Odebíráá se po třídeenní pohlavvní abstinennci a pečlivém dodrženní hygieny. Odběr je proveden p masturbbací (za pom moci erotickkých časoppisů, videa nebo n partneerky) do sppeciálního sterilního kontejneeru. V rámcii Genetickkého pracovviště se oddběr prováádí v odběěrové místnnosti do sterilního kontejneeru s červenným víčkem m. • Specifika odběěru: V případě odběru mimo m ambuulanci (dom mácí prostřeedí) je nutnno biologickký materiál doručit do půl hodiny h do laboratoře l a zabránit podchlazen p ní, či zmrzn nutí! Materiiál se musí udržovat u v teple (cca ( teplotaa těla). Vzorrek musí osoobně odevzdat muž nebbo jeho parttnerka.
LP
sttr.:27/35
V Vydání: 10.
Laborratorní přříručka
P Platnost od: 330.4.2015
5.4.7. Odběr O slizn ničního stěru z dutinyy ústní (buk kální stěr) Odběr provádí p sestra, kdy pacientovi p v vytře sliznice dutiny ústní steriilním kartáččkem či výtěrkou (např. Disspolab) a výýtěr vloží doo označené zkumavky. V rámcii Genetickéého pracovišště je paciennt předem objednán o na naší ambullanci. • Specifika odběěru: - º C, po téé je nutno skkladovat v mrazáku m Materiáál je možno uchovávat v lednici přři teplotě 4 -8 při teplootě - 18º až -22º C. P rní odběr k DNA pateernitní expeertíze s posudkem sou udního znallce 5.4.8. Protokolár Protokoolární odběrr probíhá za přítomnostti soudního znalce a jeddnoho svědkka a je nutn né objednáání odběru v naší ambuulanci nebo u soudního znalce. • během b protokolárního odběru se ověřuje o toto ožnost pomoocí platnýchh dokladů (O OP, pas, r rodný list, nebo n jiný pllatný dokladd totožnosti) • součástí odbběru je otiskk pravého palce p • žadatel ž o vyyšetření si může m zvolit druh primáárního vzorkku (bukální stěr nebo periferní k krev) • během b odběěru se sepisuje protokool o odběru, jehož součástí je – jmééno, rodné číslo, č a adresa, otiskky palců a dále d prohláášení domnělého otce a matky : o prrohlášení o správném s o označení odeebraného vzzorku o prrohlášení o správnosti s u uvedené toto ožnosti o prrohlášení o tom, t zda byyla či nebylaa provedenaa alogenní trransplantace kostní dřřeně a zda byla b či nebylla v době 6 týdnů před odběrem podána transsfuze krrve o soouhlas pro zpracování z a použití priimárního vzzorku k provvedení paterrnitní exxpertízy o soouhlas či nessouhlas s ucchováváním m nespotřeboovaných vzorků DNA v DNA baance Genetika Plzeň, s.r.o. v podep pisují matka a, domnělýý otec, v příípadě zletilosti Tato prrohlášení a souhlasy vždy dítěte taaké dítě a v případě nezletilosti n matky nebo otce jejicch zákonnýý zástupce. Do prottokolu se dáále zaznameenává, kdo provedl p odb běr a kdo byyl přítomen jjako svědek k, včetně všech podpisů zúčaastněných. • Specifika odběru: o Odebranný vzorek je j nutné uloožit v lednici (4 - 8º C) C a dopravvit do laboratoře nejpo ozději do týdne. 5.4.9. Odběr ovu ulačního seekretu (hlen nu) Před oddběrem je nuutný pohlavvní styk pouuze za použití kondomuu od skončenní poslední menstruuace. Ovulační sekret odebíráme o o obvyklým léékařským poostupem do sterilních kapilár k pomocí vakuovanéé stříkačky v gynekologgické polozee v ambulannci reprodukkční imunollogie. Jeho mnnožství záviisí na aktuállní hormonáální hladiněě. LP
sttr.:28/35
V Vydání: 10.
Laborratorní přříručka
P Platnost od: 330.4.2015
o • Specifika odběru: Odebranný ovulačníí sekret je nutno skladoovat při teplotě nižší neež -18 °C (vv boxu na leedu) nebo ihnned transpoortovat do laaboratoře.
5.5.
IInformacce a návod dy předávvané pacieentům přřed odběrrem prim márního v vzorku (informovaané souhlasy)
Většinaa odběrů proo genetická vyšetření see provádí am mbulantně. Po odběěrech pro prenatální p v vyšetření see nedoporu učuje fyzickká námaha a těhotná žena ž má nárok na 7- denní pracovní p neschopnost. Odběry biologickéhho materiálu před plánnovaným gen netickým vyyšetřením nnevyžadují speciální s přípravuu pacienta, základní z infformace jsoou uvedenu u konkrétníích odběrů. Žádný z odběrů nenní potřeba provádět p nallačno, jídlo ani pití neoovlivňují výýsledky vyšeetření. Před odběrem o pllodové voddy podepissují pacien ntky popř. zákonný zástupce souhlas s proveedením am mniocentézyy/choriovýcch klků. Při odbběru biologiického matteriálu k DNA D vyšetřření podepisuje paciennt souhlas případně p nesouhllas s molekuulárně genettickým vyšeetřením. • •
Souhlas vyšetřované S v é/ho (zák konného zástupce) z s genetickýým labora atorním v vyšetřením m N Nesouhlas vyšetřovan né osoby (zákonného ( o zástupce)) s genetick kým labora atorním v vyšetřením m – negativn ní revers
Požadoované form muláře jsou součástí příloh Labo oratorní přříručky (jsoou volně přřístupné ke stažeení)
5.6.
P Příjem vzzorku do laboratořře
Při příjm mu vzorku do laborattoře laboranntka ihned zkontrolujee, zda je oodběrová zk kumavka (nádobkka, pod.) čitelně č a vhhodně oznaačena a zd da připojenáá průvodkaa obsahuje veškeré potřebnné údaje k prrovedení poožadovanéhoo vyšetření.. Po provvedené konttrole je vzoorek a průvodka označčena přiřazeeným laboraatorním číslem a je zapsánaa dle požadovaného vyšetření do d laborato orního infoormačního systému (p příslušné Laborattorní knihy)) s uvedením m: • dataa a času příjmu, požadaavky, identiffikace praco ovníka, kterrý vzorek přřijal • jménno, příjmenní a rok naroození paciennta • labooratorní číslo na požadoovaná vyšettření Vždy je zajištěnaa dohledateelnost veškkerých info ormací souuvisejících s příjmem vzorku. Laborattorní číslo se přiřazuuje nezaměěnitelně jed dnotlivému biologickéému materriálu dle interních pravidel laboratoře. l
LP
sttr.:29/35
V Vydání: 10.
Laborratorní přříručka
P Platnost od: 330.4.2015
Označeení požadaavku: • na průvodce, p kdde jsou vypsány požaddavky, křížk kem do patřiičného okénnka • na průvodce, p kdde nejsou poožadavky definovány, d je nutno je vypsat ručnně nebo přess PC • pokuud je třeba uvést i někkteré další údaje, ú tak jee doplnit, jaako (např. vváha pacientta, délka gravvidity, posleední menstruuace apod.)) Vždy musí m být požžadavek naa vyšetření jednoznaččný a údaje psané ruk kou čitelné. Příjem biologického materiáálu probíháá po celou pracovní p doobu laborattoře. V přípaadě zjištěn né neshodyy mezi prrůvodkou a materiáálem, praccovník přiijímající materiáál postupujje dle kapittoly 5.3 Lab boratorní příručky. p
5.7.
T Transpor rt a manip pulace s biologický b ým materiálem (se vzorky)
Informace k doprravě : • za z zajištěníí transportuu a zajištěnní bezpečno osti přepravvce (vhodnný způsob balení b a o označení) v vždy odpovíídá lékař poožadující vyšetření • doprava d m materiálu m být šetrrná, rychlá má á a musí být dodrržovány sp pecifické p podmínky – uvedenéé v rámci kapitoly k (5 5.4), zejmén na dodržen n čas a po odmínky t transportu u • s materiálem m se nessmí během m přepravy y prudce manipulovvat, aby nedošlo k mechanicckému poškkození – vhodná v přep prava v traansportních boxech (u určených p pouze pro přepravu p vzorků) • průvodky p m musí být um místěny v saamostatném m obalu, nappř. v igelitovvém sáčku tak, aby n nemohlo přři náhodném m vylití bioloogického materiálu m dojjít k jejich ppotřísnění. • při p transporrtu je důležiité chránit biologický b materiál m předd extrémní teplotou a světlem s • je j nutné zabbránit zmrznnutí nebo přehřátí, p aby y se uchovalla schopnosst kultivace buněk a r růstu in vitrro • v případě, že ž nelze přeepravit mateeriál ihned po p odebráníí uchovámee jej v lednicci při 4 8° C
Upozoornění: Pokud je materiál během b transsportu vylittý nebo rozb bitý, laborattoř Vám to telefonicky y oznámí a požáddá Vás o novvý odběr.
LP
sttr.:30/35
V Vydání: 10.
Laborratorní přříručka
P Platnost od: 330.4.2015
6. Fázze po vyyšetření 6.1.
B Bezpečné é odstraňoování matteriálů po oužitých při p odběru u
Materiáál použitý při p odběru primárníchh vzorků je považován za poteencionálně infekční (vatové tampony nebo n buničité čtverce,, rukavice) ukládá se do nepropustného ob balu a je likvidovván dle dokkumentovanné platné legislativy. V rámci praccoviště je ppostup speccifikován v internní dokumenttaci. Použité jehly se oddhazují do plastových uzavíratelný u ých kontejneerů k tomu uurčených a jsou j rovněž likvidovány l y výše zmínněným způsoobem. Skladovvání laborattorních vzorrků a používvaného matteriálu probbíhá v souladdu dle ustan novení § vyhláškky 6 MZD č. 440/2000 Sb. ve zněnní pozdějšícch předpisů.
6.2.
M Manipula ace a sklaadování materiálu m
Neprodlleně po odbběru zajistí odebírající o p pracovník jeho transpoort do laboratoře ke zprracování tak, abyy nedošlo k jeho j znehoddnocení fyzzikálními vlivy a k ohroožení fyzickkých osob. V průběěhu zpracovvání je matteriál uchovváván dle podmínek p u uvedených v jednotlivý ých SOP pro vyšeetření a tak,, aby nedošllo k jeho znnehodnocení. S materriálem se maanipuluje s ohledem naa bezpečnosst práce a occhrany zdravví pracovníka. 6.2.1. Skladování před a v průběhu p vlastního vyššetření V průběěhu vyšetřeení až do doby d vydánní výsledků se část bioologického materiálu skladuje v lednicci nebo mrazzáku. Bukální stěry přeed vlastním m vyšetřením m jsou uložeeny 7 dní v lednici l a v případdě dalšího uchovávání u j jsou uloženny v mrazák ku. Konkréttní specifikaa jsou uvádděna v SOP pro dané vy yšetření.
6.2.2. Skladování po vyšetřeení Materiáál může být použit pro opakovanou o u kultivaci nebo n dodateečná vyšetřeení. Primárrní vzorky • Periferní P k krev – po doobu zpracovvání, až do doby d vydánní výsledku ((cca 7 dnů) • Plodová P vooda – po dobbu zpracováání, až do doby d vydáníí výsledku (cca 21dní) • Ovulační O h hlen – po doobu zpracovvání, až do doby d vydání výsledků ((cca 21 dní))
LP
sttr.:31/35
V Vydání: 10.
Laborratorní přříručka
P Platnost od: 330.4.2015
Po vydáání výsledkků jsou prim mární vzorkky likvidov vány jako nebezpečný n ý odpad a pro p další možná dovyšetření d í je uchovávván zpracovvaný vzorek k po níže deffinovanou ddobu. Sekund dární vzork ky • izolovaná i DNA je dále uchováávána v mraazáku, při -20 º C (--18º až -22 2º C) se souhlasem pacienta p • suspenze s ( (suspenze k kultivivaný ých lymfocy ytů) – se uchovává u v mrazáku, po p dobu m minimálně 1 měsíce • fluorescenč f čí značenýý PCR amp plifikát je uchováván u na tmavém m místě v leednici do v vydání výslledků • Sérum z peeriferní krvve se uchovvávána v mrazáku, při -20 - º C (-18ºº až -22º C)) Trvalé preparáty - jsou rozděěleny: na patoologické - s dobou uch hování 10 leet na norm mální - s dobou uch hování 10 let FISH preparáty p
6.3.
patologgické - v mrazáku, m po o dobu max. 1 roku (dlee intenzity signálu) s
D Dodatečn ná vyšetřeení a časovvý interva al pro jejiich požad dování
Dodateččná vyšetřeení jsou lim mitována vllastností, množstvím m a uchováníím zpracov vávaného biologicckého materriálu. Dodateččná vyšetřenní nelze proovést u sperm mií a chorio ových klků. U ploddové vody je požadavvek na dovvyšetření možné m žádaat do dobyy vydání výsledků. v V případě vzorkuu periferní krve je možné do odatečně poožadovaná vyšetření provést z opakoované kultivvace. Kvalita případnéhoo dalšího opakovanéh o ho vyšetřen ní nebo dovvyšetření m může být ov vlivněna dobou a metodou skladování, s která je uveedena výše. Dodatečnáá vyšetření jje možné po ožadovat telefonicky, ale extterní žadateel vždy doddá průvodku u k požadovvanému dovvyšetření.V případě, že pro konečné k vyddání výsledkků je nutné dovyšetřen ní nebo příppadný nový odběr biolo ogického materiállu komunikkuje s žadateelem o vyšeetření vedou ucí laboratořře nebo veddoucí úseku..
6.4.
Opakování vyšetřeení stejnéého primá árního vzoorku
Je-li pootřeba opakoovat vyšetřeení z důvoddu podezřen ní na nespráávně vydanné výsledky y, takové vyšetřenní provede laboratoř l naa vlastní nákklady. V příípadě, že jižž primární vvzorek není k dispozzici komuniikuje s žadaatelem vždyy lékař Gen netického prracoviště, o potřebě zo opakovat vyšetřenní okamžitěě informuje žadatele, tj.. indikujícíh ho lékaře.
LP
sttr.:32/35
V Vydání: 10.
Laborratorní přříručka
P Platnost od: 330.4.2015
7. Vydávání výsledků v ů a komu unikace s laborattoří 7.1.
I Informac ce o formáách vydávvání výsleedků
Geneticcké pracovišště používá v současnéé době jeden n způsob vyydávání výssledků a tím m je tisk výsledk kových listů ů přes laborratorní inforrmační systéém nebo Meedicalc. Výsledkky musí býtt čitelné a beez přepisů. Před vydáním v jsou všechnny výsledkyy kontrolo ované dvěm ma pracovnníky a po odepsány oprávněěným pracovvníkem (vedoucím úseeku) a vedou ucím laboraatoře nebo léékařem. Interprretaci výsledků provád dí vždy lék kař (genetik k nebo imunolog). Tištěné výsledky jssou rozdělenny a poté roozeslány pošštou. Je-li výssledek pozitivní je pacient pozvánn na ambulaanci Geneticckého pracooviště, kde mu m lékař vždy ossobně výsleddky sdělí, vysvětlí v a dooporučí příp padná další dovyšetření d í, či další řešení. oporučení oddborných sppolečností a platnou Při interrpretaci výssledků, je důůležité brát v úvahu do legislatiivu (napříkllad dobu proo ukončení těhotenství)). Komuniikace teleffonem je užívána u jenn v případěě nebezpečíí z prodlenní, řešení nějakého n vznikléhho problémuu, k zajištěnní potřebnýcch chybějících informaací apod. Pracovnník, který hlásí h výsleddky telefonnem je pov vinen se přesvědčit, že výsledky y sděluje oprávněěnému lékařři (dle praviidel pracoviiště).
7.2.
Z Změny výýsledků a nálezů
b k němu došlo d je zaaznamenán datum a Ke změěně výsledkků by neměělo docházeet. Pokud by jméno osoby, o kteráá změnu doodatečně proovedla. V případě, p že laboratoř l zjjistí chybněě vydaný nález, komunikuje k s žadatelem m vždy vedooucí Genetiického pracooviště neboo vedoucí laaboratoře nebo ússeku. Žadatelii o vyšetřeení (ošetřujjícímu lékaaři) je dod dán nový výsledkový v list se sp právnými výsledkky.
7.3.
I Intervaly y od dodán ní materiálu k vyd dání výsled dků
Vzorky jsou průběěžně zpracovvávány poddle požadov vaného vyšeetření v pořřadí, ve kterrém jsou přijímánny do laboraatoře. Doba požadovanéhho vyšetřenní od příjmuu vzorku do vydání závěrečné zpprávy pro nabízené n diagnózzy, při běžnéém provozuu by nemělaa přesáhnoutt časový intterval 3 týdnnů. • • • LP
cchromozom mální vyšettření plodovvé vody/choriových klků: k 2-3 týýdny c chromozom mální vyšettření perifeerní krve: 2-3 2 týdny v vyšetření p potracené tk káně: 3-4 týýdny sttr.:33/35
V Vydání: 10.
Laborratorní přříručka • • •
•
7.4.
P Platnost od: 330.4.2015
molekulárn m ně-genetick ké vyšetřen ní (obecně): 1-2 týdny (individuáln ( ně dle vyšettření) s spermiogra am: do 2 hoodin v vypracován ní znaleckéého posudk ku: do 3 týdnů - vyššetření nen ní hrazeno žádnou p pojišťovno ou, proto si žadatel plnně hradí veeškeré náklaady i vyšetřření sám. Částka Č je d dána, dle akktuálního ceeníku i imunologic cká vyšetřeení: 2-3 týdnny
K Konzulta ační činnoost laboratoře
m a žadatellům o geneetická a imuunologické vyšetření jssou poskytoovány konzzultace a Lékařům návody v odborné oblasti souuvisející s laboratorníími vyšetřeeními. Konttakty jsou uvedeny u v kapitoole 2 Laboraatorní příruččky.
7.5.
Z Způsob ř řešení stížností
Stížnostt lékaře, paccienta a ostatních účastníků je pod dnětem pro zlepšení prráce na Gen netickém pracovišti a zabývááme se prošetřením kažždé uplatněn né stížnosti.. Stížnost lze podávvat na : • výsledky v laaboratorníchh vyšetření • způsob z jednnání pracovnníků • nedodržení n ujednání vyplívajícíích z uzavřřené dohoddy o provvedení vyšeetření a n nedodržení dohodnuté lhůty Způsob b podání stíížnosti: • písemně p (pooštou, faxem m, e-mailem m) • ústně ú (telefo fonicky, při osobním jeddnání) Termín ny pro vyřízzení stížnosstí: • Pokud P stížnnost není řeešena ihned, je termín na vyřízeníí stížnosti 330 dnů. Odp povědný p pracovník z zákazníkovi i telefonickyy sdělí výsleedek šetřeníí.
7.6.
Obecné zásady z lab boratoře na n ochran nu osobníích inform mací
Laborattoř nakládáá s osobním mi a citlivýými údaji pacientů p takk, aby nem mohlo dojít k jejich neoprávvněnému příístupu, změěně nebo znneužití. Obeecné zásady pro ochrannu osobních údajů: 1. O Organizační opatření: • Osobní O a ciitlivá data pacientů p jsoou vedena v listinné foormě v příruučních spiso ovnách a v elektroniccké formě v programu ENVIS E LIM MS/MEDIC CALC.
LP
sttr.:34/35
V Vydání: 10.
Laborratorní přříručka •
Listinná forrma záznam L mu je zabezppečena uzamčením vsttupu do gennetické labo oratoře a ř řízením vsttupu cizích osob. Pro zabezpečen ní dat v EN NVIS LIMS S/MEDICAL LC mají p pracovníci p přidělena přřístupová prráva s ohled dem na jejicch kompetennce. P Pracovníci mají ve svvé pracovníí náplni po odepsanou mlčenlivost m t a jsou seznámeni p prokazateln ně s vnitřním mi předpisyy, ve kterýcch jsou stannovena pravvidla pro nakládání s osobními údaji.
•
2.
8.
P Platnost od: 330.4.2015
Teechnická oppatření: • Technická T opatření jsou stanovvena na úrrovni mechhanického zabránění přístupu n neoprávněn ných osob do d míst, kde je uložen na zdravotniická dokum mentace. Jed dná se o ř řízený vstupp do geneticcké laboratooře. • Zdravotnick Z ká dokumenntace uloženná v prograamu ENVIS S LIMS/ME EDICALC jee v době n nepřítomno osti zdravotnnického praacovníka chrráněna heslem pro vstuup do PC a systému E ENVIS LIM MS/MEDIC CALC. Kažždý pracovník má přiidělený rozzsah oprávn nění pro p přístup do ENVIS E LIM MS/MEDICA AL.
P Přílohy
Nejsou
LP
sttr.:35/35