Příloha je nedílnou součástí osvědčení o akreditaci č.: 247/2016 ze dne: 26.04.2016
List 1 z 24 Akreditovaný subjekt podle ČSN EN ISO 15189:2013: Státní zdravotní ústav Laboratoře Centra epidemiologie a mikrobiologie (LCEM) Šrobárova 48, 100 42 Praha 10 Pracoviště zdravotnické laboratoře: 1.
Národní referenční laboratoř pro HIV/AIDS (NRL/HIV/AIDS) Šrobárova 48, 100 42 Praha 10
2.
Národní referenční laboratoř pro antibiotika (NRL/ATB) Šrobárova 48, 100 42 Praha 10
5.
Národní referenční laboratoř pro mykobakterie (NRL/M) Šrobárova 48, 100 42 Praha 10
6.
Národní referenční laboratoř pro lymeskou borreliozu (NRL/LB) Šrobárova 48, 100 42 Praha 10
7.
Národní referenční laboratoř pro virové hepatitidy (NRL/VH) Šrobárova 48, 100 42 Praha 10
8.
Národní referenční laboratoř pro meningokokové nákazy (NRL/MEN) Šrobárova 48, 100 42 Praha 10
9.
Národní referenční laboratoř pro hemofilové nákazy (NRL/HEM) Šrobárova 48, 100 42 Praha 10
10.
Národní referenční laboratoř pro streptokokové nákazy (NRL/STR) Šrobárova 48, 100 42 Praha 10
11.
Národní referenční laboratoř pro chřipku a nechřipková respirační virová onemocnění (NRL/CH a NCH) Šrobárova 48, 100 42 Praha 10
12.
Národní referenční laboratoř pro diagnostiku syfilis (NRL/SYF) Šrobárova 48, 100 42 Praha 10
13.
Národní referenční laboratoř pro průkaz agens elektronovou mikroskopií (NRL/ELM) Šrobárova 48, 100 42 Praha 10
14.
Národní referenční laboratoř pro enteroviry (NRL/ENT) Šrobárova 48, 100 42 Praha 10
15.
Národní referenční laboratoř pro herpetické viry (NRL/HV) Šrobárova 48, 100 42 Praha 10
16.
Národní referenční laboratoř pro zarděnky, spalničky, parotitidu a parvovirus B19 (NRL/ZSP) Šrobárova 48, 100 42 Praha 10
Příloha je nedílnou součástí osvědčení o akreditaci č.: 247/2016 ze dne: 26.04.2016
List 2 z 24 Akreditovaný subjekt podle ČSN EN ISO 15189:2013: Státní zdravotní ústav Laboratoře Centra epidemiologie a mikrobiologie (LCEM) Šrobárova 48, 100 42 Praha 10 17.
Národní referenční laboratoř pro chlamydie (NRL/CHLA) Šrobárova 48, 100 42 Praha 10
18.
Národní referenční laboratoř pro leptospiry (NRL/LEPT) Šrobárova 48, 100 42 Praha 10
19.
Národní referenční laboratoř pro toxoplasmosu (NRL/TOX) Šrobárova 48, 100 42 Praha 10.
21.
Národní referenční laboratoř pro stafylokoky (NRL/ST) Šrobárova 48, 100 42 Praha 10
22.
Národní referenční laboratoř pro salmonely (NRL/SA) Šrobárova 48, 100 42 Praha 10
23.
Národní referenční laboratoř pro E.coli a shigely (NRL/ECS) Šrobárova 48, 100 42 Praha 10
24.
Národní referenční laboratoř pro pertusi a difterii (NRL/DIPE) Šrobárova 48, 100 42 Praha 10
Příloha je nedílnou součástí osvědčení o akreditaci č.: 247/2016 ze dne: 26.04.2016
List 3 z 24 Akreditovaný subjekt podle ČSN EN ISO 15189:2013: Státní zdravotní ústav Laboratoře Centra epidemiologie a mikrobiologie (LCEM) Šrobárova 48, 100 42 Praha 10 Národní referenční laboratoř pro HIV/AIDS (NRL/HIV/AIDS)
1. Vyšetření: Pořadové číslo
Přesný název postupu vyšetření
Identifikace postupu vyšetření
Předmět vyšetření
802 - Lékařská mikrobiologie, 804 – Lékařská parazitologie, 805 – Lékařská virologie, 822 – Lékařská mykologie
1.1
1.2
1.3 1.4
1.5
1.6
1.7
Současné stanovení protilátek HIV-1/2 a HIV-1 p24 antigenu metodou EIA Současné stanovení protilátek HIV-1/2 a HIV-1 p24 antigenu metodou ELFA Stanovení HIV-1 p24 antigenu metodou ELFA Současné stanovení protilátek HIV-1/2 a HIV-1 p24 antigenu metodou CMIA Stanovení protilátek HIV-1/ /HIV-2 metodou Western blot Kvantitativní stanovení HIV nukleových kyselin metodou Real Time PCR – Roche TaqMan HIV-1 Test Určení genotypu HIV sekvenováním – Abbott Viroseq HIV-1 Genotyping System
SOP-NRL/AIDS-03
Lidské sérum, plazma
SOP-NRL/AIDS-05
Lidské sérum, plazma
SOP-NRL/AIDS-06
Lidské sérum, plazma
SOP-NRL/AIDS-21
Lidské sérum, plazma
SOP-NRL/AIDS-07
Lidské sérum, plazma
SOP-NRL/AIDS-19
Lidská plazma
SOP-NRL/AIDS-15
Lidská plazma
Odběr primárních vzorků: Pořadové číslo
1
Přesný název postupu odběru primárního vzorku
Odběr venózní krve v odběrové místnosti LCEM SZÚ
Identifikace postupu odběru primárního vzorku
SOP-NRL/HIV/AIDS-22
Primární vzorek
Venózní krev
Příloha je nedílnou součástí osvědčení o akreditaci č.: 247/2016 ze dne: 26.04.2016
List 4 z 24 Akreditovaný subjekt podle ČSN EN ISO 15189:2013: Státní zdravotní ústav Laboratoře Centra epidemiologie a mikrobiologie (LCEM) Šrobárova 48, 100 42 Praha 10
Národní referenční laboratoř pro antibiotika (NRL/ATB)
2. Vyšetření: Pořadové číslo
Přesný název postupu vyšetření
Identifikace postupu vyšetření
Předmět vyšetření
802 - Lékařská mikrobiologie, 804 – Lékařská parazitologie, 805 – Lékařská virologie, 822 – Lékařská mykologie
2.1
2.2
2.3 2.4
Agarová diluční metoda vyšetření citlivosti baktérií k antibiotikům Disková difuzní metoda vyšetření citlivosti baktérií k antibiotikům Nitrocefinová metoda průkazu β-laktamázy bakterií Bujónová diluční mikrometoda (BDM) vyšetření citlivosti baktérií k antibiotikům
SOP-NRL/ATB-01
Bakteriální kmeny
SOP-NRL/ATB-02
Bakteriální kmeny
SOP-NRL/ATB-03
Bakteriální kmeny
SOP-NRL/ATB-20
Bakteriální kmeny
Příloha je nedílnou součástí osvědčení o akreditaci č.: 247/2016 ze dne: 26.04.2016
List 5 z 24 Akreditovaný subjekt podle ČSN EN ISO 15189:2013: Státní zdravotní ústav Laboratoře Centra epidemiologie a mikrobiologie (LCEM) Šrobárova 48, 100 42 Praha 10
5.
Národní referenční laboratoř pro mykobakterie (NRL/M)
Vyšetření: Pořadové číslo
Přesný název postupu vyšetření
Identifikace postupu vyšetření
Předmět vyšetření
802 - Lékařská mikrobiologie, 804 – Lékařská parazitologie, 805 – Lékařská virologie, 822 – Lékařská mykologie 5.1 Mikroskopický průkaz SOP-NRL/M-01 Lidské sputum, punktát, krev, mykobakterií stolice, laryngální výtěr, aspirát, BAL, žaludeční výplach, bioptický a sekční materiál, výtěry a stěry z píštělí hnisavých procesů a ran, mykobakteriální kmen 5.2 Kultivační průkaz mykobakterií SOP-NRL/M-02 Lidské sputum, punktát, krev, - klasicky menstruační krev, stolice, laryngální výtěr, pleurální výpotek, BAL, žaludeční výplach, bioptický a sekční materiál, výtěry a stěry z píštělí hnisavých procesů a ran, moč, mozkomíšní mok, mykobakteriální kmen 5.3 Stanovení buněčné imunitní SOP-NRL/M-15 Lidská plná heparinizovaná krev odpovědi u tuberkulózy metodou ELISA 5.4 Identifikace mykobakterií SOP-NRL/M-06 Mykobakteriální kmeny biochemickými metodami 5.5 Testy citlivosti na SOP-NRL/M-08 Patogenní nebo potencionálně antituberkulotika (dle Canettiho) patogenní druhy mykobakterií 5.6 Testy citlivosti na SOP-NRL/M-09 Patogenní nebo potencionálně antituberkulotika (mikrometoda) patogenní druhy mykobakterií 5.7 Identifikace mykobakterií SOP-NRL/M-10 Mykobakteriální kmeny metodou Geno Type® 5.8 Stanovení rezistence SOP-NRL/M-11 Mykobakteriální kmeny mykobakterií metodou Geno Type®
Příloha je nedílnou součástí osvědčení o akreditaci č.: 247/2016 ze dne: 26.04.2016
List 6 z 24 Akreditovaný subjekt podle ČSN EN ISO 15189:2013: Státní zdravotní ústav Laboratoře Centra epidemiologie a mikrobiologie (LCEM) Šrobárova 48, 100 42 Praha 10
Národní referenční laboratoř pro lymeskou borreliozu (NRL/LB)
6. Vyšetření: Pořadové číslo
Přesný název postupu vyšetření
Identifikace postupu vyšetření
Předmět vyšetření
802 - Lékařská mikrobiologie, 804 – Lékařská parazitologie, 805 – Lékařská virologie, 822 – Lékařská mykologie
6.1
6.2
6.3
6.4
Průkaz specifických protilátek proti borreliím metodou ELISA Stanovení protilátek proti Borrelia burgdorferi sensu lato metodou Western blot Průkaz DNA Borrelia burgdorferi sensu lato metodou PCR
SOP-NRL/LB-01
Průkaz specifických protilátek proti Anaplasma phagocytophilum metodou IFA
SOP-NRL/LB-08
SOP-NRL/LB-02
SOP-NRL/LB-03
Lidské sérum, citrátová plazma, mozkomíšní mok, synoviální tekutina Lidské sérum, citrátová plazma, mozkomíšní mok, synoviální tekutina Mozkomíšní mok, synoviální tekutina, biopsie, moč, plazma (s ACD, nebo s EDTA) Lidské sérum
Příloha je nedílnou součástí osvědčení o akreditaci č.: 247/2016 ze dne: 26.04.2016
List 7 z 24 Akreditovaný subjekt podle ČSN EN ISO 15189:2013: Státní zdravotní ústav Laboratoře Centra epidemiologie a mikrobiologie (LCEM) Šrobárova 48, 100 42 Praha 10
Národní referenční laboratoř pro virové hepatitidy (NRL/VH)
7. Vyšetření: Pořadové číslo
Přesný název postupu vyšetření
Identifikace postupu vyšetření
Předmět vyšetření
802 - Lékařská mikrobiologie, 804 – Lékařská parazitologie, 805 – Lékařská virologie, 822 – Lékařská mykologie
7.1
7.2
7.3
7.4
Stanovení antigenů nebo protilátek proti antigenům virů hepatitid neautomatizovanou metodou EIA [HBsAg, HBsAg konfir., HBeAg, anti-HBc celk., IgM anti-HBc, anti-HBe, antiHBs, anti-HCV, anti-HAV celk., IgM anti-HAV, IgM anti-HDV, anti-HDV celk., IgG anti-HEV, IgM antiHEV] Stanovení RNA virů hepatitidy C a DNA virů hepatitidy B metodou Real Time PCR – přístroje AmpliPrep a TaqMan Automatizované stanovení antigenů a protilátek proti antigenům virů hepatitid metodou MEIA na analyzátoru Architect [HBsAg, HBsAg konfir., HBeAg, anti-HBc celk., IgM anti-HBc, anti-HBe, antiHBs, anti-HCV, anti-HAV celk., IgM anti-HAV] Stanovení protilátek proti antigenům virů hepatitid metodou LIA
SOP-NRL/VH-01
Lidské sérum, plazma a jejich deriváty
SOP-NRL/VH-16
Lidské sérum, plazma a jejich deriváty
SOP-NRL/VH-05
Lidské sérum, plazma a jejich deriváty
SOP-NRL/VH-06
Lidské sérum, plazma a jejich deriváty
Příloha je nedílnou součástí osvědčení o akreditaci č.: 247/2016 ze dne: 26.04.2016
List 8 z 24 Akreditovaný subjekt podle ČSN EN ISO 15189:2013: Státní zdravotní ústav Laboratoře Centra epidemiologie a mikrobiologie (LCEM) Šrobárova 48, 100 42 Praha 10 Národní referenční laboratoř pro meningokokové nákazy (NRL/MEN)
8. Vyšetření: Pořadové číslo
Přesný název postupu vyšetření
Identifikace postupu vyšetření
Předmět vyšetření
802 - Lékařská mikrobiologie, 804 – Lékařská parazitologie, 805 – Lékařská virologie, 822 – Lékařská mykologie
8.1
8.2
8.3
8.4
8.5
Identifikace species rodu Neisseria biochemickými a mikroskopickými metodami Identifikace kapsulárního antigenu Neisseria meningitidis aglutinací Průkaz DNA meningokoka, hemofila a pneumokoka v klinickém materiálu seminested metodou PCR Sekvenční typizace genu por A a fet A Neisseria meningitidis Multilokusová sekvenční typizace genů abcZ,adk,aroE,fumC,gdh,pdh C,pgm,penA Neisseria meningitidis
SOP-NRL/MEN-01
Bakteriální kmeny
SOP-NRL/MEN-02
Bakteriální kmeny
SOP-NRL/MEN-04
Lidský mozkomíšní mok, krev, sérum, BAL
SOP-NRL/MEN-39
Kmeny Neisseria meningitidis
SOP-NRL/MEN-40
Kmeny Neisseria meningitidis
Příloha je nedílnou součástí osvědčení o akreditaci č.: 247/2016 ze dne: 26.04.2016
List 9 z 24 Akreditovaný subjekt podle ČSN EN ISO 15189:2013: Státní zdravotní ústav Laboratoře Centra epidemiologie a mikrobiologie (LCEM) Šrobárova 48, 100 42 Praha 10
Národní referenční laboratoř pro hemofilové nákazy (NRL/HEM)
9. Vyšetření: Pořadové číslo
Přesný název postupu vyšetření
Identifikace postupu vyšetření
Předmět vyšetření
802 - Lékařská mikrobiologie, 804 – Lékařská parazitologie, 805 – Lékařská virologie, 822 – Lékařská mykologie
9.1
9.2
Identifikace Haemophilus influenzae biochemickými testy Identifikace kapsulárních antigenů Haemophilus influenzae sklíčkovou aglutinací
SOP-NRL/HEM-04
Bakteriální kmeny
SOP-NRL/HEM-08
Bakteriální kmeny
Příloha je nedílnou součástí osvědčení o akreditaci č.: 247/2016 ze dne: 26.04.2016
List 10 z 24 Akreditovaný subjekt podle ČSN EN ISO 15189:2013: Státní zdravotní ústav Laboratoře Centra epidemiologie a mikrobiologie (LCEM) Šrobárova 48, 100 42 Praha 10
10.
Národní referenční laboratoř pro streptokokové nákazy (NRL/STR)
Vyšetření: Pořadové číslo
Přesný název postupu vyšetření
Identifikace postupu vyšetření
Předmět vyšetření
802 - Lékařská mikrobiologie, 804 – Lékařská parazitologie, 805 – Lékařská virologie, 822 – Lékařská mykologie
10.1
10.2
10.3
10.4
10.5
10.6
10.7
Stanovení titru antistreptolyzinu O neutralizační metodou Identifikace species streptokoků a enterokoků biochemickými a fyziologickými testy a citlivostí k antibakteriálním látkám Identifikace skupinových antigenů streptokoků a enterokoků latexaglutinací Identifikace typových antigenů Streptococcus agalactiae latexaglutinací Identifikace typových antigenů Streptococcus pneumoniae latexaglutinací Identifikace typových Streptococcus pneumoniae quellung reakcí Typizace kmenů Streptococcus pyogenes metodou sekvence emm genu pro M protein
SOP-NRL/STR-01
Lidské sérum
SOP-NRL/STR-03
Bakteriální kmeny
SOP-NRL/STR-04
Bakteriální kmeny
SOP-NRL/STR-17
Bakteriální kmeny
SOP-NRL/STR-07
Bakteriální kmeny
SOP-NRL/STR-08
Bakteriální kmeny
SOP-NRL/STR-09
Bakteriální kmeny
Příloha je nedílnou součástí osvědčení o akreditaci č.: 247/2016 ze dne: 26.04.2016
List 11 z 24 Akreditovaný subjekt podle ČSN EN ISO 15189:2013: Státní zdravotní ústav Laboratoře Centra epidemiologie a mikrobiologie (LCEM) Šrobárova 48, 100 42 Praha 10
11.
Národní referenční laboratoř pro chřipku a nechřipková respirační virová onemocnění (NRL/CH a NCH)
Vyšetření: Pořadové číslo
Přesný název postupu vyšetření
Identifikace postupu vyšetření
Předmět vyšetření
802 - Lékařská mikrobiologie, 804 – Lékařská parazitologie, 805 – Lékařská virologie, 822 – Lékařská mykologie
11.1
11.2
11.3
Hemaglutinačně inhibiční SOP-NRL/CH-01 test (HIT) pro identifikaci virového antigenu (virus chřipky, viry parainfluenzy) Hemaglutinačně inhibiční SOP-NRL/CH-02 test (HIT) pro průkaz antivirových protilátek (virus chřipky, viry parainfluenzy) Průkaz kmenů viru chřipky SOP-NRL/CH-03 izolací v tkáňových kulturách
11.4
Průkaz kmenů nechřipkových SOP-NRL/NCH-08 respiračních virů (RS virus, adenoviry,viry parainfluenzy) izolací v tkáňových kulturách
11.5
Průkaz kmenů viru chřipky izolací v kuřecích embryích
SOP-NRL/CH-04
11.6
Průkaz RNA viru chřipky typu A a B včetně subtypů H1, H3, H5 a H1pdm2009 metodou PCR s detekcí v reálném čase s použitím hydrolyzačních sond
SOP-NRL/CH-56
Izobát viru
Lidské sérum
Lidský aspirát z dýchacích cest, výtěr nosohltanu, krční výplach, BAL, autoptický a bioptický materiál, suspenze virů Lidský aspirát z dýchacích cest, výtěr nosohltanu, krční výplach, BAL, autoptický a bioptický materiál, výtěr ze spojivkového vaku, seškrab rohovky, moč, suspenze virů Lidský aspirát, výtěr nosohltanu, krční výplach, BAL, autoptický a bioptický materiál, suspenze virů Biologický materiál odebraný z horních a dolních cest dýchacích (nazofaryngeální výtěr, aspiráty, BAL, sputum), buněčné kultury a kultivační média (z buněčných kultur při izolaci virů nebo při přípravě vakcín), bioptický materiál, sekční materiál
Příloha je nedílnou součástí osvědčení o akreditaci č.: 247/2016 ze dne: 26.04.2016
List 12 z 24 Akreditovaný subjekt podle ČSN EN ISO 15189:2013: Státní zdravotní ústav Laboratoře Centra epidemiologie a mikrobiologie (LCEM) Šrobárova 48, 100 42 Praha 10 Pořadové číslo
11.7
Přesný název postupu vyšetření
Identifikace postupu vyšetření
Průkaz DNA a RNA SOP-NRL/CH-57 infekčních agens RSV, ADV a hMPV metodou multiplex PCR s detekcí v reálném čase a s použitím hydrolyzačních sond
Průkaz DNA a RNA SOP-NRL/CH-58 respiračních a střevních infekčních agens (virus chřipky typu A,B bez další subtypizace, RSV, ADV, PIV 1/2/3/4, hMPV, koronaviry NL 63, 229E a OC43, rhinoviry A/B/C, enteroviry, BOCA viry A1/2/3/4 RV) pomocí DPO sond, amplikonové knihovny a následné mutliplex detekce metodou PCR s detekcí v reálném čase 11.9 Průkaz antivirových SOP-NRL/NCH-02 protilátek u viru chřipky, nechřipkových respiračních virů (RS virus, adenoviry) a M. pneumoniae metodou EIA 11.10 Průkaz antivirových SOP-NRL/NCH-04 protilátek u viru chřipky, nechřipkových respiračních virů (RS virus, adenoviry) a M. pneumoniae komplement fixačním testem (KFR) 11.8
Předmět vyšetření
Biologický materiál odebraný z horních a dolních cest dýchacích (nazofaryngeální výtěr, aspiráty, BAL, sputum), výtěr ze spojivkového vaku, buněčné kultury a kultivační média (z buněčných kultur při izolaci virů nebo při přípravě vakcín), bioptický materiál, sekční materiál Biologický materiál odebraný z horních a dolních cest dýchacích (nazofaryngeální výtěr, aspiráty, BAL, sputum), buněčné kultury a kultivační média (z buněčných kultur při izolaci virů nebo při přípravě vakcín), bioptický materiál, sekční materiál
Lidské sérum
Lidské sérum
Příloha je nedílnou součástí osvědčení o akreditaci č.: 247/2016 ze dne: 26.04.2016
List 13 z 24 Akreditovaný subjekt podle ČSN EN ISO 15189:2013: Státní zdravotní ústav Laboratoře Centra epidemiologie a mikrobiologie (LCEM) Šrobárova 48, 100 42 Praha 10
12.
Národní referenční laboratoř pro diagnostiku syfilis (NRL/SYF)
Vyšetření: Pořadové číslo
Přesný název postupu vyšetření
Identifikace postupu vyšetření
Předmět vyšetření
802 - Lékařská mikrobiologie, 804 – Lékařská parazitologie, 805 – Lékařská virologie, 822 – Lékařská mykologie
12.1
12.2
12.3
12.4
12.5
12.6
Stanovení antikardiolipinových protilátek flokulačně Stanovení antitreponemových protilátek metodou nepřímé pasivní aglutinace na nosičích Stanovení antitreponemových protilátek metodou EIA Stanovení antitreponemových protilátek metodou nepřímé imunofluorescence Stanovení antitreponemových protilátek metodou western blot Stanovení antitreponemových protilátek ve tř. IgM metodou Solid phase haemadsorption
SOP-NRL/SYF-02
Lidské sérum, plazma, mozkomíšní mok
SOP-NRL/SYF-03
Lidské sérum, plazma, mozkomíšní mok
SOP-NRL/SYF-04
Lidské sérum, plazma
SOP-NRL/SYF-05
Lidské sérum, plazma, mozkomíšní mok
SOP-NRL/SYF-07
Lidské sérum, plazma
SOP-NRL/SYF-06
Lidské sérum, plazma, mozkomíšní mok
Příloha je nedílnou součástí osvědčení o akreditaci č.: 247/2016 ze dne: 26.04.2016
List 14 z 24 Akreditovaný subjekt podle ČSN EN ISO 15189:2013: Státní zdravotní ústav Laboratoře Centra epidemiologie a mikrobiologie (LCEM) Šrobárova 48, 100 42 Praha 10 13. Národní referenční laboratoř pro průkaz agens elektronovou mikroskopií (NRL/ELM) Vyšetření: Pořadové číslo
Přesný název postupu vyšetření
Identifikace postupu vyšetření
Předmět vyšetření
802 - Lékařská mikrobiologie, 804 – Lékařská parazitologie, 805 – Lékařská virologie, 822 – Lékařská mykologie
13.1
Přímý průkaz virů pomocí elektronové mikroskopie
SOP-NRL/ELM-01
Lidská stolice, moč, plazma, sérum, mozkomíšní mok, vesikulární tekutiny, laváže horních a dolních dýchacích cest, bioptický a autoptický materiál
Příloha je nedílnou součástí osvědčení o akreditaci č.: 247/2016 ze dne: 26.04.2016
List 15 z 24 Akreditovaný subjekt podle ČSN EN ISO 15189:2013: Státní zdravotní ústav Laboratoře Centra epidemiologie a mikrobiologie (LCEM) Šrobárova 48, 100 42 Praha 10 14.
Národní referenční laboratoř pro enteroviry (NRL/ENT)
Vyšetření: Pořadové číslo
Přesný název postupu vyšetření
Identifikace postupu vyšetření
Předmět vyšetření
802 - Lékařská mikrobiologie, 804 – Lékařská parazitologie, 805 – Lékařská virologie, 822 – Lékařská mykologie 14.1
14.2 14.3
14.4 14.5
Průkaz enterovirů izolací v tkáňových kulturách
SOP-NRL/ENT-01
Neobsazeno Průkaz protilátek proti SOP-NRL/ENT-04 antigenům enterovirů virus neutralizačním testem (VNT) Průkaz protilátek proti SOP-NRL/ENT-05 enterovirům metodou ELISA Průkaz protilátek proti SOP-NRL/ENT-20 hantavirům metodou ELISA
Lidská stolice, mozkomíšní mok, výtěr z nosohltanu, výpotek z kolene, plodová voda Lidské sérum Lidské sérum Lidské sérum
Příloha je nedílnou součástí osvědčení o akreditaci č.: 247/2016 ze dne: 26.04.2016
List 16 z 24 Akreditovaný subjekt podle ČSN EN ISO 15189:2013: Státní zdravotní ústav Laboratoře Centra epidemiologie a mikrobiologie (LCEM) Šrobárova 48, 100 42 Praha 10
15.
Národní referenční laboratoř pro herpetické viry (NRL/HV)
Vyšetření: Pořadové číslo
Přesný název postupu vyšetření
Identifikace postupu vyšetření
Předmět vyšetření
802 - Lékařská mikrobiologie, 804 – Lékařská parazitologie, 805 – Lékařská virologie, 822 – Lékařská mykologie 15.1 Stanovení protilátek proti SOP-NRL/HV-01 Lidské sérum, plazma,
15.2
15.3
15.4
antigenům herpetických virů metodou EIA [IgG anti-VCA EBV, IgM anti-VCA EBV, IgA anti-VCA EBV, IgG antiEBNA1 EBV, IgM antiEBNA1 EBV, IgG anti-EA-D EBV, IgG anti-HSV, typ. specifické IgG anti-HSV2, IgG anti-VZV, IgG antiCMV, avidita IgG anti-CMV, IgM anti-CMV] Stanovení protilátek proti SOP-NRL/HV-03 herpetickým virům metodou nepřímé imunofluorescence [IgG anti-VCA EBV, IgM anti-VCA EBV, IgG antiEA(D+R) EBV, IgM antiHSV, IgG anti-HSV, IgM anti.VZV, IgG anti-VZV, IgM anti-HHV6, IgG anti-HHV6] Průkaz nukleových kyselin SOP-NRL/HV- 06 HSV1 a 2, VZV, CMV, EBV, HHV6 a 8 metodou PCR s detekcí amplikonu v gelu
Průkaz nukleových kyselin CMV, EBV, HHV6, HSV 1 a 2, VZV metodou Real Time PCR
SOP-NRL/HV- 07
mozkomíšní mok
Lidské sérum, plazma
Lidská krev, mozkomíšní mok, stěr z léze, moč, BAL, aspirát, výtěr ze spojivky, leukocyty, autopsie, infikované tkáňové kultury, oční tekutina, punktáty, kostní dřeň, plodová voda Lidská krev, mozkomíšní mok, stěr z léze, moč, BAL, aspirát, výtěr ze spojivky, leukocyty, autopsie, infikované tkáňové kultury, oční tekutina, punktáty, kostní dřeň, plodová voda
Příloha je nedílnou součástí osvědčení o akreditaci č.: 247/2016 ze dne: 26.04.2016
List 17 z 24 Akreditovaný subjekt podle ČSN EN ISO 15189:2013: Státní zdravotní ústav Laboratoře Centra epidemiologie a mikrobiologie (LCEM) Šrobárova 48, 100 42 Praha 10
16.
Národní referenční laboratoř pro zarděnky, spalničky, parotitidu a parvovirus B19 (NRL/ZSP)
Vyšetření: Pořadové číslo
Přesný název postupu vyšetření
Identifikace postupu vyšetření
Předmět vyšetření
802 - Lékařská mikrobiologie, 804 – Lékařská parazitologie, 805 – Lékařská virologie, 822 – Lékařská mykologie
16.1
16.2
Stanovení protilátek tříd IgG SOP-NRL/ZSP-01 a IgM proti virům zarděnek, spalniček, příušnic a parvoviru B 19 a avidity zarděnkových IgG protilátek metodou ELISA Kvantitativní průkaz DNA SOP-NRL/ZSP-12 parvoviru B19 metodou realtime PCR
Lidské sérum, plazma
Lidská nesrážlivá krev, sérum, kostní dřeň, plodová voda, biopsie
Příloha je nedílnou součástí osvědčení o akreditaci č.: 247/2016 ze dne: 26.04.2016
List 18 z 24 Akreditovaný subjekt podle ČSN EN ISO 15189:2013: Státní zdravotní ústav Laboratoře Centra epidemiologie a mikrobiologie (LCEM) Šrobárova 48, 100 42 Praha 10
17.
Národní referenční laboratoř pro chlamydie (NRL/CHLA)
Vyšetření: Pořadové číslo
Přesný název postupu vyšetření
Identifikace postupu vyšetření
Předmět vyšetření
802 - Lékařská mikrobiologie, 804 – Lékařská parazitologie, 805 – Lékařská virologie, 822 – Lékařská mykologie
17.1
17.2
17.3
17.4
17.5
Stanovení protilátek proti antigenům chlamydií metodou EIA Stanovení protilátek proti antigenům chlamydií metodou nepřímé imunofluorescence Průkaz DNA Chlamydophila pneumoniae a Chlamydia trachomatis metodou Real time PCR na Light Cycleru Roche Průkaz DNA Chlamydia trachomatis metodou Real time PCR na Cobas TaqMan Roche
SOP-NRL/CHLA-02
Lidské sérum, plazma
SOP-NRL/CHLA-04
Lidské sérum, plazma
SOP-NRL/CHLA-14
Lidská moč, uretrální, cervikální, nasofaryngeální, konjunktivální výtěry, BAL, sputum, kloubní výpotky, plná krev, mozkomíšní mok Lidská moč, cervikální výtěry
SOP-NRL/CHLA-15
Stanovení protilátek proti SOP-NRL/CHLA-06 Chlamydia trachomatis, Chlamydia pneumoniae a Chlamydia psittaci v lidském séru nebo plazmě metodou western blot
Lidské sérum, plazma
Příloha je nedílnou součástí osvědčení o akreditaci č.: 247/2016 ze dne: 26.04.2016
List 19 z 24 Akreditovaný subjekt podle ČSN EN ISO 15189:2013: Státní zdravotní ústav Laboratoře Centra epidemiologie a mikrobiologie (LCEM) Šrobárova 48, 100 42 Praha 10
18.
Národní referenční laboratoř pro leptospiry (NRL/LEPT)
Vyšetření: Pořadové číslo
Přesný název postupu vyšetření
Identifikace postupu vyšetření
Předmět vyšetření
802 - Lékařská mikrobiologie, 804 – Lékařská parazitologie, 805 – Lékařská virologie, 822 – Lékařská mykologie
18.1
Mikroskopický aglutinační test (MAT) pro průkaz antileptospirových protilátek
SOP-NRL/LEPT-01
Lidská krev, sérum
Příloha je nedílnou součástí osvědčení o akreditaci č.: 247/2016 ze dne: 26.04.2016
List 20 z 24 Akreditovaný subjekt podle ČSN EN ISO 15189:2013: Státní zdravotní ústav Laboratoře Centra epidemiologie a mikrobiologie (LCEM) Šrobárova 48, 100 42 Praha 10
19.
Národní referenční laboratoř pro toxoplasmosu (NRL/TOX)
Vyšetření: Pořadové číslo
Přesný název postupu vyšetření
Identifikace postupu vyšetření
Předmět vyšetření
802 - Lékařská mikrobiologie, 804 – Lékařská parazitologie, 805 – Lékařská virologie, 822 – Lékařská mykologie
19.1
19.2
19.3
19.4
Stanovení protilátek proti Toxoplasma gondii komplementfixační reakcí Stanovení protilátek proti Toxoplasma gondii tříd IgA, IgE, IgG a IgM metodou ELISA Stanovení avidity protilátek IgG proti Toxoplasma gondii modifikovanou metodou ELISA Analýza protilátek proti Toxoplasma gondii metodou Western blot
SOP-NRL/TOX-01
Lidské sérum, plazma
SOP-NRL/TOX-02
Lidské sérum, plazma
SOP-NRL/TOX-03
Lidské sérum, plazma
SOP-NRL/TOX-04
Lidské sérum, plazma
Příloha je nedílnou součástí osvědčení o akreditaci č.: 247/2016 ze dne: 26.04.2016
List 21 z 24 Akreditovaný subjekt podle ČSN EN ISO 15189:2013: Státní zdravotní ústav Laboratoře Centra epidemiologie a mikrobiologie (LCEM) Šrobárova 48, 100 42 Praha 10
21.
Národní referenční laboratoř pro stafylokoky (NRL/ST)
Vyšetření: Pořadové číslo
Přesný název postupu vyšetření
Identifikace postupu vyšetření
Předmět vyšetření
802 - Lékařská mikrobiologie, 804 – Lékařská parazitologie, 805 – Lékařská virologie, 822 – Lékařská mykologie
21.1
21.2
21.3
Identifikace kmenů rodu SOP-NRL/ST-04 Staphylococcus biochemickými testy Průkaz faktorů virulence u SOP-NRL/ST-05 kmenů Staphylococcus aureus fenotypovými metodami Průkaz genů kódujících SOP-NRL/ST-45 produkci enterotoxinů (sea, seb, sec, sed, see, seg, seh, sei, sej), exfoliativních toxinů (eta, etb, etd), toxinu syndromu toxického šoku (tst), Pantonova-Valentinova leukocidinu (lukS-PV, lukFPV) u kmenů Staphylococcus aureus metodou PCR
Bakteriální kmeny Bakteriální kmeny
Bakteriální kmeny
Příloha je nedílnou součástí osvědčení o akreditaci č.: 247/2016 ze dne: 26.04.2016
List 22 z 24 Akreditovaný subjekt podle ČSN EN ISO 15189:2013: Státní zdravotní ústav Laboratoře Centra epidemiologie a mikrobiologie (LCEM) Šrobárova 48, 100 42 Praha 10
22.
Národní referenční laboratoř pro salmonely (NRL/SA)
Vyšetření: Pořadové číslo
Přesný název postupu vyšetření
Identifikace postupu vyšetření
Předmět vyšetření
802 - Lékařská mikrobiologie, 804 – Lékařská parazitologie, 805 – Lékařská virologie, 822 – Lékařská mykologie
22.1
22.2
Identifikace kmenů rodu Salmonella aglutinační metodou Identifikace kmenů rodu Salmonella biochemickými testy
SOP-NRL/SA-04
Bakteriální kmeny
SOP-NRL/SA-05
Bakteriální kmeny
Příloha je nedílnou součástí osvědčení o akreditaci č.: 247/2016 ze dne: 26.04.2016
List 23 z 24 Akreditovaný subjekt podle ČSN EN ISO 15189:2013: Státní zdravotní ústav Laboratoře Centra epidemiologie a mikrobiologie (LCEM) Šrobárova 48, 100 42 Praha 10 23.
Národní referenční laboratoř pro E.coli a shigely (NRL/ECS)
Vyšetření: Pořadové číslo
Přesný název postupu vyšetření
Identifikace postupu vyšetření
Předmět vyšetření
802 - Lékařská mikrobiologie, 804 – Lékařská parazitologie, 805 – Lékařská virologie, 822 – Lékařská mykologie
23.1
23.2
23.3
23.4 23.5 23.6
Identifikace kmenů rodů Escherichia, Shigella a ostatních rodů z čeledi Enterobacteriaceae biochemickými testy Identifikace kmenů rodů Escherichia a Shigella aglutinační metodou – zjišťování somatického a bičíkového antigenu sklíčkovou aglutinací Identifikace kmenů Escherichia coli aglutinační metodou – zjištění produkce Shiga toxinů metodou RPLA Identifikace kmenů rodu Vibrio biochemickými testy Identifikace kmenů Vibrio cholerae aglutinační metodou Průkaz genů Shiga toxinů (stx1, stx2),) a O-antigenů (rfbEO157, O26wzy) u kmenů E. coli metodou PCR
SOP-NRL/ECS-04
Bakteriální kmeny, lidská stolice
SOP-NRL/ECS-06
Bakteriální kmeny, lidská stolice
SOP-NRL/ECS-20
Bakteriální kmeny, lidská stolice
SOP-NRL/ECS-07
Bakteriální kmeny
SOP-NRL/ECS-08
Bakteriální kmeny
SOP-NRL/ECS-51
Bakteriální kmeny, lidská stolice
Příloha je nedílnou součástí osvědčení o akreditaci č.: 247/2016 ze dne: 26.04.2016
List 24 z 24 Akreditovaný subjekt podle ČSN EN ISO 15189:2013: Státní zdravotní ústav Laboratoře Centra epidemiologie a mikrobiologie (LCEM) Šrobárova 48, 100 42 Praha 10
24.
Národní referenční laboratoř pro pertusi a difterii (NRL/DIPE) Šrobárova 48, 100 42 Praha 10
Vyšetření: Pořadové číslo
Přesný název postupu vyšetření
Identifikace postupu vyšetření
Předmět vyšetření
802 - Lékařská mikrobiologie, 804 – Lékařská parazitologie, 805 – Lékařská virologie, 822 – Lékařská mykologie
24.1
24.2
24.3
Identifikace Bordetella pertussis a Bordetella parapertussis aglutinací Stanovení protilátek proti Bordetella parapertussis metodou aglutinace Stanovení IgG proti pertusovému toxinu Bordetella pertusis metodou ELISA
SOP-NRL/DIPE-01
Bakteriální kmeny
SOP-NRL/DIPE-02
Lidské sérum
SOP-NRL/DIPE-03
Lidské sérum, plazma
Vysvětlivky: ACD - kyselina citrónová-citrát-dextróza (antikoagulační činidlo) BAL - bronchoalveolární laváž CMIA - chemiluminiscenční imunoanalýza na mikročásticích EA-D Early Antigen difuse EA-R Early Antigen restricted ECS – rody Escherichia a Shigella EDTA - etylendiamintetraoctová kyselina a její soli (antikoagulační činidlo) EIA - Enzyme Immunoassay ELFA - enzymová fluorescenční imunoanalýza ELISA - Enzyme Linked Immunosorbent Assay FTA-ABS – Fluorescent Treponemal Antibody - absorption IFA – imunofluorescenční test (assay) KFR – komplementfixační reakce LIA - line immunoassay (line blot) MEIA - enzymová imunoanalýza na mikročásticích MPN – Mycoplasma pneumoniae PCR - Polymerase Chain Reaction RPLA – reversed passive latex agglutination RPR – rapid plasma reagin SPHA – Solid phase haemadsorption TK – tkáňové kultury TPHA - Treponema pallidum haemagglutination TP-PA - Treponema pallidum particle agglutination assay VDRL – blood test for syphilis (VDRL stands for Venereal Disease Research Laboratory) VIB – Vibrio cholerae