ADLN – PERPUSTAKAAN UNIVERSITAS AIRLANGGA
SKRIPSI ISOLASI, SELEKSI DAN IDENTIFIKASI BAKTERI PENGHASIL ENZIM PROTEASE, LIPASE, DAN AMILASE DARI SALURAN PENCERNAAN UDANG VANAME (Litopenaeus vannamei) ASAL TAMBAK TRADISIONAL
SKRIPSI PROGRAM STUDI BUDIDAYA PERAIRAN
Oleh : MIKI WIKARETTA PATRIA SURABAYA – JAWA TIMUR
FAKULTAS PERIKANAN DAN KELAUTAN UNIVERSITAS AIRLANGGA SURABAYA 2016
SKRIPSI
ISOLASI, SELEKSI DAN ...
MIKI WIKARETTA PATRIA
ADLN – PERPUSTAKAAN UNIVERSITAS AIRLANGGA
SKRIPSI
ISOLASI, SELEKSI DAN ...
MIKI WIKARETTA PATRIA
ADLN – PERPUSTAKAAN UNIVERSITAS AIRLANGGA
SKRIPSI ISOLASI, SELEKSI DAN IDENTIFIKASI BAKTERI PENGHASIL ENZIM PROTEASE, LIPASE, DAN AMILASE DARI SALURAN PENCERNAAN UDANG VANAME (Litopenaeus vannamei) ASAL TAMBAK TRADISIONAL
Skripsi sebagai Salah Satu Syarat untuk Memperoleh Gelar Sarjana Perikanan pada Program Studi Budidaya Perairan Fakultas Perikanan dan Kelautan Universitas Airlangga
Oleh : MIKI WIKARETTA PATRIA NIM. 141111048
Menyetujui, Komisi Pembimbing
Pembimbing Utama
Pembimbing Serta
Dr. Woro Hastuti Satyantini, Ir., M.Si. NIP. 19610907 198903 2 001
Sudarno, Ir., M. Kes. NIP. 19550713 198601 1 001
SKRIPSI
ISOLASI, SELEKSI DAN ...
MIKI WIKARETTA PATRIA
ADLN – PERPUSTAKAAN UNIVERSITAS AIRLANGGA
SKRIPSI ISOLASI, SELEKSI DAN IDENTIFIKASI BAKTERI PENGHASIL ENZIM PROTEASE, LIPASE, DAN AMILASE DARI SALURAN PENCERNAAN UDANG VANAME (Litopenaeus vannamei) ASAL TAMBAK TRADISIONAL
Oleh : MIKI WIKARETTA PATRIA NIM. 141111048
Telah diujikan pada Tanggal : 05 Februari 2016 KOMISI PENGUJI SKRIPSI Ketua : Dr. Endang Dewi Masithah, Ir., MP. Sekretaris : Rahayu Kusdarwati, Ir., M.Kes. Anggota : Muhammad Arief, Ir., M. Kes. Dr. Woro Hastuti Satyantini, Ir., M.Si. Sudarno, Ir., M. Kes.
Surabaya, 05 Februari 2016 Mengetahui, Dekan Fakultas Perikanan dan Kelaut Universitas Airlangga
Dr. Mirni Lamid, drh., MP. NIP. 19620116 199203 2 001
SKRIPSI
ISOLASI, SELEKSI DAN ...
MIKI WIKARETTA PATRIA
ADLN – PERPUSTAKAAN UNIVERSITAS AIRLANGGA
RINGKASAN MIKI WIKARETTA PATRIA. Isolasi, Seleksi, dan Identifikasi Bakteri Penghasil Enzim Protease, Lipase, dan Amilase dari Saluran Pencernaan Udang Vaname (Litopenaeus vannamei) Tambak Tradisional. Dosen Pembimbing Dr. Woro Hastuti S, Ir., M.Si. dan Sudarno, Ir., M.Kes. Udang vaname merupakan komoditas perikanan yang memiliki potensi komersial tinggi dan perlu upaya peningkatan produksi. Salah satu aspek penting dalam budidaya adalah terpenuhinya kebutuhan nutrisi udang. Keberhasilan penyerapan nutrisi pakan bergantung pada proses pencernaan pakan tersebut. Proses pencernaan memerlukan peran kerja enzim ekstraseluler seperti protease, lipase, dan amilase. Mikroorganisme dalam saluran pencernaan yang dapat meghasilkan enzim ekstraseluler dibutuhkan untuk membantu proses pencernaan. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk memperoleh isolat bakteri penghasil enzim protease, lipase, dan amilase dari saluran pencernaan udang vaname asal tambak tradisional. Penelitian ini dilaksanakan di Laboratorium Gastroenteritis dan Salmonellosis, Tropical Disease Diagnostic Center Universitas Airlangga dan Laboratorium Bakteriologi, Balai Karantina Ikan Kelas 1 Perak. Kegiatan ini dilaksanakan pada bulan Juni 2015 sampai dengan September 2015. Metode kerja yang digunakan dalam penelitian ini adalah metode deskriptif. Isolat bakteri saluran pencernaan udang vaname dari tambak tradisional yang mampu menghasilkan enzim protease, lipase dan amilase terdapat 14 isolat yang terdiri dari satu isolat Kurthia, tujuh isolat Bacillus, tiga isolat Pseudomonas, dua isolat Vibrio, serta satu isolat Pasteurella.
SKRIPSI
ISOLASI, SELEKSI DAN ...
MIKI WIKARETTA PATRIA
ADLN – PERPUSTAKAAN UNIVERSITAS AIRLANGGA
SUMMARY MIKI WIKARETTA PATRIA. Isolation, Selection, and Identification Protease, Lipase, and Amylase Enzyme Producing Bacteria Isolates of White Shrimp (Litopenaeus vannamei) Digestive Tract from Traditional Pond. Academic Adviser Dr. Woro Hastuti S, Ir., M.Si. and Sudarno, Ir., M.Kes. White shrimp is a fishery commodities which has high commercial potential and require production enhancement. One of the important aspect of aquaculture is to fulfill the nutritional needs of shrimps. Successfulness of feed nutrients absorption depends on digestion process. Digestion process needs role of extracellular enzymes like protease, lipase, and amylase. Microorganism from digestive tract which able to produce protease, lipase, and amylase enzymes needed in helping the digestion process. The purpose of this study is to collect the protease, lipase, and amilase enzymes producing bacteria isolates of white shrimp digestive tract from traditional pond culture. This study was conducted at the Gastroenteritis and Salmonellosis Laboratory of Tropical Disease Diagnostic Center Universitas Airlangga, and the Bacteriology Laboratory of Balai Karantina Ikan Kelas 1 Perak. The activity was held on June 2015 until September 2015. Working methods used in is descriptive method. Bacteria isolates of white shrimp digestive tract from traditional pond which able to produce protease, lipase, and amylase enzymes found 14 isolates consisting of one isolate of Kurthia, seven isolates of Bacillus, three isolates of Pseudomonas, Two isolates of Vibrio, also one isolate of Pasteurella.
SKRIPSI
ISOLASI, SELEKSI DAN ...
MIKI WIKARETTA PATRIA
ADLN – PERPUSTAKAAN UNIVERSITAS AIRLANGGA
KATA PENGANTAR Segala puji dan syukur penulis panjatkan kehadirat Allah SWT atas limpahan rakhmat dan hidayah-Nya, sehingga Penelitian tentang Isolasi, Seleksi, dan Identifikasi Bakteri Penghasil Enzim Protease, Lipase, dan Amilase dari Saluran Pencernaan Udang Vaname (Litopenaeus vannamei) Asal Tambak Tradisional dapat dilaksanakan pada Juni 2015 sampai dengan September 2015. Pada kesempatan ini, tidak lupa pula penulis sampaikan terima kasih kepada: Ibu Dr. Woro Hastuti S, Ir., M.Si. dan Bapak Sudarno, Ir., M.Kes. selaku Dosen Pembimbing yang telah memberikan arahan, petunjuk dan bimbingan sejak penyusunan Usulan hingga Laporan Penelitian ini, serta semua pihak yang telah membantu penulis dalam pelaksanaan maupun penyelesaian Penelitian ini. Penulis menyadari bahwa Laporan Penelitian ini masih belum sempurna, sehingga kritik dan saran yang membangun sangat penulis harapkan demi perbaikan dan kesempurnaan Laporan ini. Akhirnya penulis berharap semoga Laporan ini bermanfaat dan dapat memberikan informasi bagi semua pihak.
Surabaya, 5 Februari 2016 Penulis
SKRIPSI
ISOLASI, SELEKSI DAN ...
MIKI WIKARETTA PATRIA
ADLN – PERPUSTAKAAN UNIVERSITAS AIRLANGGA
UCAPAN TERIMA KASIH
Penyusunan Laporan Penelitian ini dapat terselesaikan karena dukungan dari beberapa pihak yang selama ini telah banyak membantu. Pada kesempatan ini, penulis ingin menyampaikan terima kasih yang sebesar-besarnya kepada: 1. Ibu Dr. Mirni Lamid, drh., MP., selaku Dekan Fakultas Perikanan dan Kelautan Universitas Airlangga. 2. Ibu Dr. Woro Hastuti S, Ir., M.Si. dan Bapak Sudarno, Ir., M.Kes., selaku dosen pembimbing yang telah memberikan petunjuk, arahan, dan bimbingan kepada penulis sejak awal pelaksanaan hingga laporan ini dapat terselesaikan. 3. Bapak Agustono, Ir., M.Kes, selaku koordinator skripsi. 4. Ibu Dr. Endang Dewi Masithah, Ir., MP., Ibu Rahayu Kusdarwati, Ir., M.Kes., dan Bapak Muhammad Arief, Ir., M. Kes., selaku dosen penguji. 5. Ibu Yeni Kurniawati selaku pembimbing lapangan dan peneliti dari Balai Karantina Ikan Kelas 1 Perak yang telah memberikan bimbingan dan arahan kepada penulis selama penelitian. 6. Bapak Askat dan Ibu Dwi Sulistyowati selaku Orang Tua serta Agam Syahputra selaku Adik tercinta yang telah mendoakan dan memberikan dukungan moril maupun materiil yang sangat berarti bagi penulis. 7. Mbak Dita, Mbak Wahyu, Mas Deni, dan Mbak Wilda yang telah membantu dan menyediakan fasilitas selama penulis melaksanakan penelitian. 8. Kawan-kawan satu tim penelitian Ade Kurniawati, Surono, dan Purwita yang telah memberikan bantuan dan motivasi pada penulis.
SKRIPSI
ISOLASI, SELEKSI DAN ...
MIKI WIKARETTA PATRIA
ADLN – PERPUSTAKAAN UNIVERSITAS AIRLANGGA
9. Munjayana, Anggun Lutfianti, Gita Triananda, Uswatun Khasanah, Retno Tari, Fitrotuz Zaqiyah, Lita Dwi, dan Fa’izati Khasanah sebagai sahabat yang telah memberi dukungan semangat serta mendampingi penulis.
SKRIPSI
ISOLASI, SELEKSI DAN ...
MIKI WIKARETTA PATRIA
ADLN – PERPUSTAKAAN UNIVERSITAS AIRLANGGA
DAFTAR ISI Halaman RINGKASAN ..................................................................................................
iv
SUMMARY .....................................................................................................
v
KATA PENGANTAR .....................................................................................
vi
UCAPAN TERIMA KASIH ........................................................................... vii DAFTAR ISI ....................................................................................................
ix
DAFTAR TABEL ............................................................................................
xi
DAFTAR GAMBAR .......................................................................................
xii
DAFTAR LAMPIRAN ....................................................................................
xiii
I.
PENDAHULUAN ....................................................................................
1
1.1 Latar Belakang ....................................................................................
1
1.2 Perumusan Masalah ............................................................................
2
1.3 Tujuan ................................................................................................
2
1.4 Manfaat ..............................................................................................
2
II. TINJAUAN PUSTAKA ...........................................................................
3
2.1 Tinjauan Umum Udang Vaname (Penaeus vannamei) .......................
3
2.2 Pakan dan Kebiasaan Makan ..............................................................
4
2.3 Sistem Pencernaan ..............................................................................
6
2.4 Bakteri Penghasil Enzim Ekstraseluler ..............................................
7
2.5 Probiotik .............................................................................................
9
III. KERANGKA KONSEPTUAL DAN HIPOTESIS ..................................
11
3.1 Kerangka Konseptual .........................................................................
11
3.2 Hipotesis .............................................................................................
11
IV. METODOLOGI ........................................................................................
13
4.1 Tempat dan Waktu .............................................................................
13
SKRIPSI
ISOLASI, SELEKSI DAN ...
MIKI WIKARETTA PATRIA
ADLN – PERPUSTAKAAN UNIVERSITAS AIRLANGGA
4.2 Materi Penelitian ................................................................................. 4.2.1 Peralatan Penelitian ................................................................. 4.2.2 Bahan Penelitian ......................................................................
13 13 13
4.3 Metode Penelitian ............................................................................... 4.3.1 Rancangan Penelitian .............................................................. 4.3.2 Prosedur Kerja ......................................................................... A. Sterilisasi Alat dan Bahan ................................................... B. Pengambilan Sampel ........................................................... C. Isolasi Bakteri ..................................................................... D. Seleksi ................................................................................. E. Identifikasi ..........................................................................
14 14 14 14 15 15 16 17
V. HASIL DAN PEMBAHASAN .................................................................
23
5.1 Hasil .................................................................................................... 5.1.1 Isolasi Bakteri dari Sampel Saluran Pencernaan Udang Vaname Asal Tambak Tradisional ........................................... 5.1.2 Seleksi Bakteri Penghasil Enzim Protease, Amilase, dan Lipase................................................................................. 5.1.3 Identifikasi Bakteri Penghasil Enzim Protease, Amilase, dan Lipase.................................................................................
23
5.2 Pembahasan .........................................................................................
27
VI. KESIMPULAN DAN SARAN .................................................................
32
6.1 Kesimpulan .........................................................................................
32
6.2 Saran....................................................................................................
32
DAFTAR PUSTAKA ......................................................................................
33
LAMPIRAN .....................................................................................................
38
SKRIPSI
ISOLASI, SELEKSI DAN ...
23 24 25
MIKI WIKARETTA PATRIA
ADLN – PERPUSTAKAAN UNIVERSITAS AIRLANGGA
DAFTAR TABEL
Tabel
Halaman
1. Hasil pengamatan morfologi koloni bakteri pada media TSA ........
23
2. Hasil identifikasi bakteri penghasil enzim protease, amilase, dan lipase ................................................................................................
25
SKRIPSI
ISOLASI, SELEKSI DAN ...
MIKI WIKARETTA PATRIA
ADLN – PERPUSTAKAAN UNIVERSITAS AIRLANGGA
DAFTAR GAMBAR Gambar
Halaman
1. Udang vaname ..................................................................................
4
2. Anatomi udang vaname ....................................................................
6
3. Kerangka konsep penelitian .............................................................
12
4. (a) zona hidrolisis susu skim, (b) zona hidrolisis starch, (c) zona hidrolisis Tween 80 .........................................................................
24
5. Diagram batang diameter zona bening dari aktivitas bakteri saluran pencernaan ....................................................................................... 25 6. Alat yang digunakan ……………………………………………...
45
7. Bahan yang digunakan …………………………………………….
46
8. Kegiatan penelitian ………………………………………………... 46
SKRIPSI
ISOLASI, SELEKSI DAN ...
MIKI WIKARETTA PATRIA
ADLN – PERPUSTAKAAN UNIVERSITAS AIRLANGGA
DAFTAR LAMPIRAN Lampiran
Halaman
1. Diagram Alur Penelitian ..................................................................
38
2. Hasil uji hidrolisis protein, karbohidrat, dan lemak ........................
39
3. Data zona hidrolisis protein, lemak, dan karbohidrat.......................
43
4. Hasil identifikasi bakteri …………………………………………..
44
5. Gambar alat, bahan, dan kegiatan …………………………… .......
45
SKRIPSI
ISOLASI, SELEKSI DAN ...
MIKI WIKARETTA PATRIA