SEZNAM OTÁZEK Z LÉKAŘSKÉ CHEMIE A BIOCHEMIE KE ZKOUŠCE V AKADEMICKÉM ROCE 2009/2010. I. Základy fyzikální, bioanorganické a bioorganické chemie 1.
Voda a její fyzikální a chemické vlastnosti, význam v organismu
2.
Disperzní soustavy, rozpustnost látek, pravé a koloidní roztoky, difuze, osmóza, osmotický a onkotický tlak, dialýza, příklady z biochemie
3.
Energetika chemických reakcí, Gibbsova energie a entropie, aplikace na metabolické děje.
4.
Kinetika a energetika následných a vratných reakcí, chemická rovnováha, Guldbergův – Waageův zákon, aplikace v enzymologii
5.
Základní separačně detekční metodiky pro makromolekuly (elektroforéza, chromatografie) a jejich využití v klinické praxi
6.
Spektrofotometrie, princip a využití v klinické biochemii
7.
Elektrolytická disociace, disociační konstanta, silné a slabé elektrolyty, příklady z biochemie
8.
Brönstedova teorie kyselin a zásad, rovnováha v protolytických reakcích, příklady z biochemie. Iontový součin vody, pH a jeho význam v medicíně
9.
Amfolyty, jejich vlastnosti, příklady z biochemie
10. Pufry, výpočet pH, význam v organismu 11. Oxidace a redukce, oxidoredukční potenciál, závislost na koncentraci reaktantů a pH, příklady z biochemie 12. Srážecí reakce, součin rozpustnosti, tvorba komplexů, příklady a jejich význam v biochemii a medicíně 13. Chemické vlastnosti hlavních biogenních prvků 14. Kyslík a jeho reaktivní formy. Peroxidace lipidů 15. Biologicky a toxikologicky významné prvky periodického systému mimo základních biogenních prvků, mechanismus působení vybraných toxických sloučenin (CO,KCN,HCN,H2S,těžké kovy) 16. Biologický a metabolický význam stopových prvků 17. Struktura organických sloučenin, izomerie, příklady z metabolických drah 18. Halogen- a nitroderiváty uhlovodíků, příklady toxikologicky a lékařsky významných sloučenin 19. Sirné deriváty uhlovodíků, příklady lékařsky významných sloučenin 20. Aminy, význam v biochemii 21. Alkoholy, fenoly, aldehydy a ketony, uplatnění v metabolismu 22. Karboxylové kyseliny, funkční a substituční deriváty karboxylových kyselin, uplatnění v biochemii 23. Dusíkaté, kyslíkaté a sirné heterocykly, význam
1
24. Strukturní charakteristiky aminokyselin, dělení, reakce význam, peptidy, peptidová vazba, příklady biologicky významných peptidů 25. Bílkoviny, struktura, vlastnosti a funkce 26. Sacharidy, rozdělení, struktura, stereochemie, biologický význam 27. Reakce a deriváty monosacharidů, disacharidy, O- a N- glykosidová vazba, příklady 28. Homopolysacharidy a heteropolysacharidy, struktura, výskyt a význam v organismu 29. Proteoglykany, glykoproteiny, struktura, vlastnosti, příklady 30. Lipidy, definice, klasifikace, struktura, vlastnosti, funkce v organismu 31. Fosfolipidy a sfingolipidy, struktura, vlastnosti a význam 32. Steroly, žlučové kyseliny a steroidní hormony, struktura, funkce a význam v organismu II. Základy metabolismu 1. Struktura enzymů (kofaktory, koenzymy, oligomerní struktura); mnohočetné enzymové formy a isoenzymy. Využití enzymologie v medicíně 2. Enzymová aktivita, fyzikálně chemické vlivy, regulace (exprese, allosterické vlivy, kovalentní modifikace).Detekce enzymové aktivity – metody měření (teplota, kinetika, endpoint ) 3. Dýchací řetězec. Oxidativní fosforylace 4. Makroergní sloučeniny, fosforylace na substrátové úrovni, pohon endergonních reakcí. 5. Citrátový cyklus, amfibolický charakter, průběh, regulace 6. Obecné mechanismy přeměny aminokyselin, deaminace, transaminace, dusíková bilance 7. Tvorba amoniaku, jeho detoxikace, ureosyntetický cyklus a jeho regulace, hyperamonémie 8. Metabolismus uhlíkového skeletu aminokyselin skupiny pyruvátu, oxalacetátu ,2-oxoglutarátu , sukcinyl CoA , s rozvětveným řetězcem, zapojení aminokyselin do metabolických procesů 9. Metabolismus aromatických aminokyselin, poruchy 10. Metabolismus sirných aminokyselin 11. Biosyntéza, biodegradace a funkce nejdůležitějších biogenních aminů. 12. Konverze aminokyselin do specializovaných produktů (kreatin - přeměny, význam, clearence, S-adenosylmethionin a jeho význam) 13. Glykolýza, regulace 14. Glukoneogenese, regulace 15. Syntéza a degradace a glykogenu, regulace, poruchy 16. Pentózový cyklus, regulace 17. Metabolismus galaktózy a fruktózy, poruchy 18. Metabolismus kyseliny glukuronové a její význam v organismu 19. Biosyntéza mastných kyselin 20. Tvorba ketolátek z acetyl-CoA, metabolické příčiny, význam 21. Karnitinový systém, oxidace mastných kyselin, energetický výtěžek
2
22. Triacylglyceroly, biosyntéza, degradace 23. Biosyntéza fosfolipidů a sfingolipidů 24. Syntéza a degradace eikosanoidů, cyklooxygenázová a lipoxygenázová cesta. 25. Biosyntéza cholesterolu a její regulace, úloha HMG-CoA reduktázy, transport endogenního a exogenního cholesterolu 26. Přeměna a vylučování cholesterolu, žlučové kyseliny 27. Biosyntéza a degradace steroidních hormonů 28. Transport lipidů, úlohy lipoproteinů, struktura lipoproteinové částice (vznik, přeměna a úloha chylomiker, VLDL, LDL a HDL lipoproteinů). Elektroforéza lipoproteinů. 29. Biosyntéza a degradace tetrapyrrolů – hemu a její poruchy 30. Významné proteiny krevní plazmy, význam v organismu (albumin, Ig, komplement, proteiny akutní fáze, transportní proteiny) 31. Metabolismus pyrimidinových nukleotidů, regulace, inhibitory, poruchy 32. Metabolismus purinových nukleotidů, regulace, inhibitory, poruchy III. Základy biochemie orgánů a funkcí 1.
Regulace a koordinace metabolismu sacharidů a ostatních živin
2.
Glykemie, regulace, diagnostika (oGTT, glykovaný hemoglobin)
3.
Metabolismus tukové tkáně
4.
Regulace biosyntézy hemu, rozdíly mezi hepatocytem a erythroidní buňkou, metabolismus železa
5.
Hormonální regulace vodního a minerálního metabolismu
6.
Regulace kostního metabolismu
7.
Hormonální regulace energetického metabolismu
8.
Biochemické pochody při trávení živin
9.
Biochemické funkce hepatocytů a jater, možnosti biochemické diagnostiky poškození hepatocytů a jaterních funkcí
10. Biotransformace endogenních a exogenních látek, typy biotransformačních procesů, toxické a kancerogenní látky v životním prostředí 11. Ústojné systémy organismu, funkce a význam pro acidobazickou rovnováhu 12. Metabolismus erytrocytů 13. Hemokoagulace, kaskáda koagulačních faktorů, úloha trombocytů 14. Moč – fysiologické a patologické součásti. 15. Kolagen – struktura, vlastnosti, metabolismus. 16. Biochemie pojiva (chrupavka, kost) 17. Biochemie kůže. Biochemický výklad hmatu.
3
18. Kontraktilní aparát, řízení kontrakce hladké a kosterní svaloviny. Markery poškození svalové tkáně, význam, stanovení. 19. Biochemie vidění, Waldův cyklus, transducinový cyklus 20. Biochemie smyslů (sluch, chuť, čich) 21. Biochemie nervových synapsí; neurotransmitery. 22. Steroidní hormony a jejich funkce v regulačních dějích 23. Peptidové hormony a jejich funkce v endokrinních regulačních dějích 24. Lokální mediátory,cytokiny 25. Hormony štítné žlázy a jejich funkce v regulačních dějích 26. Molekulární základy humorální imunitní odpovědi 27. Molekulární základy buněčné imunitní odpovědi 28. Vitamíny rozpustné v tucích 29. Vitamíny rozpustné ve vodě 30. Struktura, složení a vlastnosti buněčných membrán 31. Transport látek přes membrány 32. Kompartmentace biochemických procesů na úrovni buňky IV. Základy buněčné a molekulární biologie 1.
Membránové receptory a jejich ligandy, G-proteiny
2.
Typy a úloha druhých poslů v přenosu signálu
3.
Signálně transdukční kaskády cytokinů a růstových faktorů
4.
Aktivace fosfolipáz a signalizace využívající deriváty lipidů
5.
Signalizace NO. Přehled signálních cest a význam
6.
Intracelulární receptory a jejich ligandy, HSP, interakce intracelulárních receptorů s DNA
7.
Vzájemná komunikace signálně transdukčních drah
8.
Struktura a funkce DNA
9.
Struktura a funkce RNA
10. Organizace prokaryontního, eukaryontního a mitochondriálního genomu 11. Replikace eukaryontní DNA, replikační aparát a jeho regulace 12. Reparace DNA 13. Transkripce eukaryontní genomové DNA 14. mRNA, struktura, syntéza, posttranskripční úpravy 15. Metabolismus RNA a RNA interference 16. Regulace genové exprese na úrovni transkripce 17. Genetický kód a jeho vlastnosti 18. Eukaryontní, prokaryontní a mitochondriální translace a její regulace
4
19. Posttranslační úpravy proteinů. Třídění a transport proteinů, úpravy a třídění proteinů v Golgiho aparátu. Biosyntéza glykoproteinů 20. Restrikční enzymy a jejich využití, úpravy DNA a konstrukce rekombinantních molekul. Klonování DNA 21. DNA diagnostika, techniky (RFLP, hybridizace) 22. Metody frakcionace buňky, elektroforéza nukleových kyselin a proteinů 23. Polymerázová řetězová reakce, uplatnění PCR v klinické diagnostice, RT-PCR a využití této techniky, Techniky sekvenování DNA 24. Povaha genových mutací, mutace dědičné a získané, polymorfismy, mini- a mikrosatelitové markery, metody detekce 25. Retroviry a pararetroviry, struktura a replikace 26. DNA a RNA viry, replikace 27. Úloha protoonkogenů a tumor supresorových genů 28. Buněčný cyklus, úloha komplexů cyklinů a cdks 29. Regulace buněčného cyklu, úloha tumor supresorových genů 30. Ubikvitinace a proteazomální degradace proteinů 31. Biochemie apoptózy 32. Epigenetika, modifikace histonů, metylace DNA, význam
5
6
