Zdravotní ústav se sídlem v Ústí nad Labem Oddělení virologie Praha

Zdravotní ústav se sídlem v Ústí nad Labem Oddělení virologie Praha Název postupu:

Laboratorní příručka

Identifikace postupu:

SP 003

Vydání číslo:

5

Výtisk číslo:

1

Vypracoval:

Jméno Mgr. Naděžda Sojková

Funkce Vedoucí oddělení

Datum 16.6.2015

Přezkoumal:

Marcela Kocmanová

MKO

16.6.2015

Schválil:

Mgr. Naděžda Sojková

Vedoucí oddělení

16.6.2015

Rozdělovník: Výtisk číslo Pracoviště 1 Oddělení virologie Praha-vedoucí oddělení 2 Oddělení virologie Praha-příjem materiálu 3 Centrální příjem pavilonu 8, Nemocnice Na Bulovce

1

Podpis

Název funkce/ Jméno MKO/Marcela Kocmanová MKO/Marcela Kocmanová MKO/Marcela Kocmanová

Zdravotní ústav se sídlem v Ústí nad Labem Oddělení virologie Praha SP 003 Laboratorní příručka

Strana č. 2 Počet stran: 16 Datum vydání: 2.11.2012

LABORATORNÍ PŘÍRUČKA

Oddělení virologie Praha Zdravotní ústav se sídlem v Ústí nad Labem

www.zuusti.cz Budínova 67/2 Nemocnice Na Bulovce, pavilon č. 8 180 81 Praha 8 Tel.: +420 266 082 637

Platný je pouze dokument na sdíleném disku Oddělení virologie Praha, v okamžiku vytištění se stane neřízenou kopií.

2



Obsah:

strana

1. Kontakty a provozní informace

4

2. Informace o vyšetřeních (odběr - pokyny doplňující vlastní odběr, doporučené odběrové soupravy, uchovávání vzorků, transport vzorků, dostupnost výsledku vyšetření-doba odezvy)

5

2.1 Virologická vyšetření – přímý průkaz

8

2.2 Sérologická vyšetření - virologie

9

2.3 Sérologická vyšetření – bakteriologie

10

2.4 Diagnostika infekčních agens metodou PCR (detekce nukleových kyselin)

11

3. Nadstandardní a doplňkové služby

16

4. Obecné zásady laboratoře

16

5.

Vyřizování stížností

16

6.

Přílohy

16


3



1. Kontakty a provozní informace Oddělení virologie Praha Budínova 67/2, pavilon č. 8 180 81 Praha 8 Jméno Mgr. Sojková Naděžda

Telefon 266082666

E-mail [email protected]

Pozn. Vedoucí oddělení Odborná konzultace

MUDr. Kurhan Hnat MUDr. Poláková Anna

266082618

[email protected]

266082613

[email protected]

Zástupce vedoucí Odborná konzultace Lékař Odborná konzultace

Horyna Pavel

266082638

[email protected]

Vedoucí laborant

Kocmanová Marcela

266082638

[email protected]

Manažer kvality

Jana Hladíková Příjem materiálu, distribuce výsledků Laboratoř sérologie 1 Laboratoř sérologie 2, hepatitidy Laboratoř PCR

266082622

[email protected]

Správce měřidel Příjem materiálu

266082637 266082631 266082612 266082622

Příjem vzorků: nepřetržitý provoz Provozní doba Pondělí-pátek

6.00 – 15.30

Odběrová centra Praha:

Ordinační doba:

1. Dittrichova 17, 128 01 Praha 2, tel.: 234 118 504 2. Sokolovská 60, 180 00 Praha 8 , tel.: 224 815 941

Po-Pá: 7.30 - 11.30 Po-Pá: 7.00 - 8.30

Odběrové centrum Kladno: Františka Kloze 2316, 272 01 Kladno, tel.: 312 292 111

Po-Pá: 6.00 - 9.00

Odběrové centrum Kolín: U nemocnice, 280 02 Kolín, tel.: 321 739 014 (mimo ordinační dobu na telefonické objednání)

Po: 8.00 – 13.00


4



2. Informace o vyšetřeních (odběr, doporučené odběrové soupravy, uchovávání vzorků, transport vzorků, dostupnost výsledku vyšetření-doba odezvy)

Odběr

stručný popis získání vzorku, doporučená odběrová souprava

OS sérologie

OS médium

sterilní vakuovaná zkumavka s umělohmotnou zátkou (červená) bez aditiv (srážlivá venózní krev) sterilní zkumavka s umělohmotnou zátkou bez aditiv (srážlivá venózní krev, mozkomíšní mok, plodová voda a jiné tekutiny popř. tkáně) sterilní zkumavka s umělohmotnou zátkou s aditivy - EDTA (plná krev) sterilní kontejner umělohmotný průhledný se šroubovacím víčkem (BAL, aspirát, sputum, moč) sterilní flokovaný tampon na tyčince v transportní zkumavce bez transportního média (regular typ) výtěr nos, krk, spojivkový vak sterilní flokovaný tampon na tyčince v transportní zkumavce bez transportního média (mini typ) výtěr – uretra, vagína, cervix, leze odběrová souprava (médium) pro vyšetření infekčních agens metodou PCR

OS stolice

kontejner (s lopatičkou)

Uchovávání h

maximální délka a podmínky uchovávání vzorku před transportem pokud není možný okamžitý transport hodiny

m

minuty

pt

teplota pokojová (15 - 30º C)

cht

teplota chladničková (2 - 8º C)

OS univerzální OS - EDTA Kontejner Tampon RES Tampon STD

Na Oddělení virologie Praha lze rozšířit objednaná vyšetření i na základě tzv. ústního (telefonického) požadavku na vyšetření vzorku. Kvalifikovaný pracovník v laboratoři posoudí množství vzorku z hlediska jeho dostatečnosti pro další požadované vyšetření. Pokud je vzorku dostatečné množství, je realizováno vyšetření a výsledky jsou běžným způsobem předány zadavateli. V případě, že je vzorku nedostatek, je informován lékař (zadavatel) o této skutečnosti a pověřený pracovník s ním domluví náhradní řešení. Urgentní vzorky. Na žádost lékaře (zadavatele) lze po telefonické domluvě s vedoucím nebo zástupcem oddělení provést některá vyšetření v co nejkratším termínu.Vzorek je při příjmu oddělen od ostatních, ihned předán ke zpracování dle příslušného SOP, následuje telefonické sdělení lékaři, které je zaznamenáno v počítačovém systému LIMS. V odběrových centrech Zdravotního ústavu jsou pracovníci poučeni o provádění odběru materiálu (příprava pacienta před odběrem , pokyny pro odběr ve vztahu k požadovaným vyšetřením, vydávání výsledku pacientovi). Za odběrové místo a odběrové pracovníky odpovídá lékař nebo jiný odborný pracovník. Žádanka z odběrového centra musí obsahovat tyto údaje: - jméno a příjmení, včetně čísla pojištěnce, data narození nebo jinou identifikaci pacienta (v případě anonymního vyšetření HIV) - identifikaci odběrového místa-uvedení lékaře, razítko a podpis pracovníka, který odběr provedl - datum a čas odběru, druh primárního vzorku - požadované vyšetření (souhlas pacienta) Přepravu vzorků z odběrových centrech zajišťují smluvní řidiči Zdravotního ústavu. Platný je pouze dokument na sdíleném disku Oddělení virologie Praha, v okamžiku vytištění se stane neřízenou kopií.

5



Způsob a podmínky transportu vzorků na Oddělení virologie Praha Klinické materiály jsou do laboratoří Oddělení virologie Praha předávány elektronickým systémem SDV (systém distribuce vzorků) z Centrálního příjmu (CP) Nemocnice na Bulovce (NNB), popř. osobním převzetím pověřenými pracovníky. Smluvní řidiči ZÚ Ústí nad Labem jsou řádně proškoleni v rámci ZÚ a sanitární pracovníci a řidiči NNB se řídí předpisy uvedenými ve příslušném Standardním postupu NNB. Řidiči byli poučeni o způsobu přepravy biologických materiálů, aby nedošlo k jejich biologickému znehodnocení. Důležitá je rychlost dopravení materiálů do laboratoří a současné dodržení pokynů pro bezpečnost dopravce i veřejnosti. Automobily jsou vybaveny chladničkami a teplota je během přepravy monitorována. Vzorky jsou v dobře uzavřených zkumavkách uloženy ve schránkách, které zabraňují jejich zvrhnutí, rozbití, příp. vylití. V menším množství případů svážejí vzorky řidiči odesílajících zdravotnických zařízení, kteří postupují podle vlastních předpisů a pravidel, která zaručují jak biologickou kvalitu přepravovaného materiálu, tak bezpečnost. Podmínky pro doručování klinických materiálů poštou (popř. PPL) naše oddělení nemá. Zdravotnické zařízení, které nám touto cestou biologický materiál zasílá se řídí platnými předpisy pošt. Prosíme, na žádance o vyšetření uvádějte vždy skutečný čas a datum odběru! Dodržování doporučených podmínek preanalytické fáze odebraných materiálů má významný vliv na kvalitu výsledku!

Kriteria validity vzorku Jako nevalidní lze označit vzorky, kde je: 1) Nedostatečná identifikace - objednavatele (minimální identifikace při úhradě ZP: IČP, odbornost, jmenovka a podpis lékaře) - pacienta (minimální identifikace: jméno a příjmení, číslo pojištěnce nebo obdobný numerický identifikátor) - způsobu úhrady vyšetření - vzorku (minimální identifikace na štítku: příjmení, číslo pojištěnce, datum, druh vzorku, objednavatel) 2) Nejednoznačná vazba vzorku a objednávky vyšetření (nedostatečné značení, odlepení štítků atd.) 3) Poškozená, netěsnící nádobka/ objednávka. 4) Nečitelná objednávka nebo štítek. 5) Důvodná pochybnost o vhodných podmínkách (teplota, mechanická zátěž) transportu. 6) Nevhodný odběr nebo transport, nevhodný druh vzorku nebo jeho objem vzhledem k požadavku. 7) Stáří vzorku vzhledem k transportní soupravě a požadavku. 8) Nedostatečné množství primárního vzorku Ve většině případů pracovník příjmu řeší situaci okamžitě s ohledem ve prospěch pacienta s odborným lékařem na pracovišti nebo s lékařem, popřípadě jiným odpovědným pracovníkem oddělení uvedeným na žádance. Při nevalidním vzorku–bod 1 je ve zprávě o výsledku laboratorního vyšetření vždy vložen příslušný komentář.


6



Přehled vyšetření ODDĚLENÍ VIROLOGIE PRAHA DOBA ODEZVY (pracovní dny) Sérologická vyšetření Četnost vyšetření denně 2x týdně

Maximálni doba odezvy 1 6

2x týdně

5

2x týdně 2x týdně 1x týdně (sezóna-denně) 1x týdně

5 5 1 7 6

1x týdně

10

Chikungunya, Dengue, Hantaviry, Phlebovirus

1x týdně

5

Hepatitidy A, B a C

denně

1

HBsAG, HCV -7

HIV, Treponema pallidum

denně

1

SZÚ

Hepatitida E

2x týdně

5

Hepatitida E - 7

Metoda Rubeola, Morbilli, Parotitis HSV, VZV, CMV, EBV Influenza A, B, PIV 1-3, Adenoviry, RS viry Mycoplasma pneumonie, Bordetella pertussis, parapertussis Chlamydie Parvovirus B19 Klíšťová meningoencefalitida Enteroviry Mycobacterium tuberculosis, Poliovirus 1-3, HHV6, Rickettsie, Polyomaviry (JC), LCM, Coxiella b.-Q horečka, Mycoplasma hominis, Ureaplasma urealyticum, Bartonella

Doba odezvy-konfirmace Morbilli-SZÚ

8

Přímý průkaz patogenů Enteroviry,Rotaviry, Adenoviry, Astroviry a Noroviry HSV-1, HSV-2, VZV

denně

1

denně

1

Stanovení DNA/RNA metodou PCR Influenza A, B; AdenoV, RSV, CoV, hMPV, HBoV, PIV, Rhinoviry

denně

2

Enteroviry, Clostridium difficile

denně

2

Mycoplasma pn, Chlamydia pn., Bordetella pertussis, parapertussis

2x týdně

5

Chlamydia trachomatis, Parvovirus B19

2x týdně

5

HSV, CMV, VZV, EBV

3

Hepatitida B,C a E, HCV genotypizace Neisseria gonorrhoeae, Mycoplasma hominis, Ureaplasma urealyticum Mycobacterium tuberculosis, genotypizace Legionella pn.

1x týdně

6

1x týdně

6

1x týdně

6

Borrelie, Polyomaviry (JC-BK)

1x týdně

6

Aspergillus sp. Dengue, Chikungunya

1 x týdně 1x týdně

6 6


7



2.1 Virologická vyšetření – přímý průkaz HSV T1, T2 (Human herpes simplexvirus T1, T2) a VZV (Human herpes 3varicellovirus) (přímý průkaz virů) Odběr

stěr z léze s abrazí buněk epitelu

Odběrová souprava

nátěr na podložním sklíčku

Uchovávání

24 h/ cht

Transport

materiál co nejrychleji transportovat do laboratoře při doporučené teplotě

Poznámka k odběru

Návod k odběru na požádání zašleme, popř. viz.: www.zuusti.cz

popř. lze zmrazit: 3 dny/-20°C

Gastrointestinální trakt (přímý průkaz adenovirů , rotavirů , astrovirů, norovirů a enterovirů ve stolici) Odběr

cca 1 ml tekuté nebo 1 cm3 formované stolice

Odběrová souprava

kontejner

Uchovávání

24 h / pt , ≤ 3 dny / cht , nemrazit!

Transport


Poznámka k odběru

Prosíme, uvádějte na žádance o vyšetření správný čas a datum odběru


8



2.2 Sérologická vyšetření - viry HAV (Virus hepatitidy A) - průkaz protilátek IgM anti-HAV a IgG anti-HAV enzymovou imunoanalýzou HBV (Virus hepatitidy B) - průkaz protilátek anti HBs, IgM anti-HBc, anti-HBc, anti-HBe a antigenu HBsAg (australský antigen) a HBeAg enzymovou imunoanalýzou, konfirmace HBsAg HCV (Virus hepatitidy C) - průkaz celkových protilátek anti-HCV enzymovou imunoanalýzou, konfirmace IgG anti-HCV WB HEV (Virus hepatitidy E) - protilátky IgM, IgG enzymovou imunoanalýzou, konfirmace protilátek IgM, IgG WB HIV 1, 2 (Human immunodeficiency virus) - současný průkaz antigenu HIV p24 v časném stadiu infekce a celkových protilátek proti HIV 1 a HIV 2 enzymovou imunoanalýzou HSV T1,T2 (Human herpes simplexvirus) - celkové Ig – KFR, protilátky HSV 1/2 IgM, HSV 1 IgG, HSV 2 IgG enzymovou imunoanalýzou CMV (Human herpes 5 cytomegalovirus) - celkové Ig – KFR, průkaz protilátek IgM, IgG, avidita IgG enzymovou imunoanalýzou EBV (virus Epsteinův – Barrové, Human herpes 4 lymphocryptovirus) - průkaz protilátek IgM, IgG antiEBNA-1, IgM, IgG anti-EA enzymovou imunoanalýzou, průkaz protilátek IgM, IgG, IgA anti-VCA nepřímou imunofluorescencí a chemiluminiscencí VZV (Human herpes 3 virus varicelly a zosteru) - celkové Ig – KFR, protilátky IgM, IgG - enzymovou imunoanalýzou, protilátky IgM, IgG a avidita IgG - nepřímou imunofluorescencí HHV6 (Human herpes 6 roseolovirus) - protilátky IgG, IgM – nepřímá imunofluorescence Influenza A, B (virus chřipky A, B) - celkové Ig – KFR, protilátky IgM - enzymovou imunoanalýzou Parainfluenza T1-T3 (virus parachřipky T1-T3) - protilátky IgA, IgG - enzymovou imunoanalýzou RSV (respirační syncytiální virus) - celkové IgG – KFR, protilátky IgM, IgG - enzymovou imunoanalýzou Adenoviry - celkové IgG – KFR, protilátky IgM, IgG - enzymovou imunoanalýzou Rubivirus (virus zarděnek-rubeoly) - protilátky IgM, IgG - enzymovou imunoanalýzou Morbillivirus (virus spalniček), protilátky IgM, IgG - enzymovou imunoanalýzou Virus epidemické parotitidy (virus příušnic) –- protilátky IgM, IgG - enzymovou imunoanalýzou Lidský parvovirus B19 - protilátky IgM, IgG - enzymovou imunoanalýzou Virus evropské klíšťové encefalitidy - protilátky IgM a IgG - enzymovou imunoanalýzou Virus LCM (virus lymfocytární choriomeningitidy) - celkové Ig – KFR Coxsackie A, B - celkové Ig – KFR, protilátky IgM – nepřímou imunofluorescencí Echoviry - celkové Ig – KFR, protilátky IgM – nepřímou imunofluorescencí Enteroviry - protilátky IgM, IgA, IgG - enzymovou imunoanalýzou Polyomavirus (JC virus) - celkové Ig – KFR Virus horečky dengue - protilátky IgM, IgG a antigen NS 1 - enzymovou imunoanalýzou Virus chikungunya - protilátky IgM, IgG - enzymovou imunoanalýzou Phleboviry-protilátky IgM, IgG - enzymovou immunoblottovou analýzou - IB Hantaviry- protilátky IgM, IgG - enzymovou immunoblottovou analýzou - IB


9



Sérologická vyšetření – viry – doporučený způsob odběru Odběr

venepunkce k získání srážlivé krve (5 – 10 ml) *provádíme také stanovení v mozkomíšním moku-lumbální punkce (1 - 3 ml)

Odběrová souprava

sterilní odběrová zkumavka na krev bez aditiv

Uchovávání

Do 24 h/pt nebo maximálně 3 dny/cht pro delší uchování doporučujeme separaci séra: při cht maximálně 5 dnů, po zmražení je možné dlouhodobé skladování sér při -20°C (+/- 5°C) separované sérum je možné v ochranném obalu zaslat i poštou

Transport

2.3 Sérologická vyšetření - bakterie Bordetella pertussis (černý kašel) - protilátky, IgG, IgA - enzymovou imunoanalýzou Bordetella parapertussis - protilátky IgG, IgA - nepřímou imunofluorescencí Poliovirus 1, 2 a 3 (po očkování) - průkaz protilátek IgG enzymovou imunoanalýzou Chlamydia pneumonie - průkaz protilátek IgG, IgA a IgM enzymovou imunoanalýzou, nepřímou imunofluorescencí, WB Chlamydia psittaci - průkaz celkových protilátek – KFR, protilátky IgM, IgG, IgA - enzymovou imunoanalýzou, nepřímou imunofluorescencí, WB Chlamydia trachomatis - průkaz protilátek IgG, IgA a IgM enzymovou imunoanalýzou, nepřímou imunofluorescencí, WB Mycobacterium tuberculosis (TBC) - protilátky IgM, IgG, IgA - enzymovou imunoanalýzou Mycoplasma pneumonie - průkaz celkových protilátek – KFR, protilátek IgA, IgM a IgG enzymovou imunoanalýzou Mycoplasma hominis - protilátky IgM, IgG - nepřímou imunofluorescencí Treponema pallidum (syfilis) – RPR aglutinace - stanovení nespecifických protilátek, stanovení celkových specifických Ig - enzymovou imunoanalýzou Ureaplasma urealyticum - protilátky IgM, IgG - nepřímou imunofluorescencí Bartonella henselae (nemoc kočičího škrábnutí) - protilátky IgM, IgG - nepřímou imunofluorescencí Rickettsia conori (středozemní horečka) - protilátky IgM, IgG - nepřímou imunofluorescencí Coxiella burneti (Q horečka) - celkové Ig – KFR, protilátky IgM, IgA IgG - nepřímou imunofluorescencí proti Ag I. a II. fáze Odběr

venepunkce k získání srážlivé krve (5 – 10 ml)

Odběrová souprava

sterilní odběrová zkumavka na krev bez aditiv

Uchovávání

Do 24 h/pt nebo maximálně 3 dny/cht pro delší uchování doporučujeme separaci séra: při cht maximálně 5 dní, po zmražení je možné dlouhodobé skladování sér při -20°C (+/- 5°C) separované sérum je možné v ochranném obalu zaslat i poštou

Transport


10



2.4 Diagnostika infekčních agens metodou PCR (detekce nukleových kyselin) HCV (průkaz RNA metodou RT PCR – kvalitativně, kvantitativně, genotypizace) Odběr Odběrová souprava Uchovávání

Transport Poznámka k odběru

srážlivá krev z venepunkce pro separaci séra (3-5 ml) plná krev (EDTA) odběrová zkumavka na krev bez aditiv, , popř.EDTA ≤ 3 dny / cht od odběru krve, po separaci séra 5 dnů/ cht, -20°C týdny, dlouhodobě při -80°C , max 2 zmrazení a rozmrazení, po rozmrazení stabilita 6h / cht . Plnou krev nemrazit! materiál co nejrychleji transportovat do laboratoře při doporučené teplotě - vzhledem k citlivosti metody může i minimální kontaminace vést k falešně pozitivnímu výsledku a je tedy nutné klást velký důraz na provedení odběru za sterilních podmínek do sterilních zkumavek

HBV (průkaz DNA metodou RT PCR – kvalitativně, kvantitativně) Odběr Odběrová souprava Uchovávání Transport Poznámka k odběru

srážlivá krev z venepunkce pro separaci séra (3-5 ml) plná krev (EDTA) odběrová zkumavka na krev bez aditiv, popř.EDTA ≤ 3 dny / cht od odběru krve, po separaci séra dlouhodobě při -20°C, plnou krev nemrazit ! materiál co nejrychleji transportovat do laboratoře při doporučené teplotě - vzhledem k citlivosti metody může i minimální kontaminace vést k falešně pozitivnímu výsledku a je tedy nutné klást velký důraz na provedení odběru za sterilních podmínek do sterilních zkumavek

HSV-1, HSV-2 , VZV, CMV, *)EBV (průkaz DNA metodou Real Time PCR kvalitativně, CMV i kvantitativně) Odběr Odběrová souprava Uchovávání


srážlivá krev z venepunkce pro separaci séra (3-5 ml), *)plná krev (EDTA), mozkomíšní mok (0,5-1 ml), plodová voda (1 ml), tekutina z vezikul, biopsie, stěr z rohovky, stěr ze spojivky, moč (15-20 ml),*suspenze leuko-,lymfocytů odběrová zkumavka na krev bez aditiv, popř. EDTA odběrová souprava s dacronovým tampónem STD a odběrovým OS médiem ≤ 3 dny / cht po odběru krve, po separaci séra ≤ 5 dnů, dlouhodobě při -20°C ostatní materiály ≤ 3 dny/cht; plná krev EDTA ≤ 3 dny , nemrazit! Moč ≤ 7 dnů , nemrazit! materiál co nejrychleji transportovat do laboratoře při doporučené teplotě Na vyžádání odběrovou soupravu dodáme, rovněž instrukce pro správný odběr a transport, popř. viz.: www.zupraha.cz - vzhledem k citlivosti metody může i minimální kontaminace vést k falešně pozitivnímu výsledku a je tedy nutné klást velký důraz na provedení odběru za sterilních podmínek do sterilních zkumavek

Influenzavirus A (typizace), B; PIV, RSV , hMPV, Rhinoviry, Coronaviry, Bocaviry (průkaz RNA Real Time PCR jednotlivě nebo FilmArray-respirační panel) Odběr

výtěr z nosohltanu, výplach, aspirát, BAL (>1ml), mozkomíšní mok (1ml, děti 0,5 ml),


11



plodová voda (1 ml), pitevní a bioptický materiál Odběrová souprava Uchovávání Transport Poznámka k odběru

odběrová souprava se 2 dacronovými tampóny RES (1 na patrové oblouky a 1 na nosní dírky) a odběrovým OS médiem ≤ 3 dny / cht Delší skladování (chladící box -20°C n. -80°C, popř. konzultujte s garantem metody) materiál co nejrychleji transportovat do laboratoře při doporučené teplotě Na vyžádání odběrovou soupravu dodáme, rovněž instrukce pro správný odběr a transport, popř. viz.: www.zuusti.cz

Adenoviry (průkaz DNA Real Time PCR nebo v rámci respiračního panelu FilmArray) Odběr Odběrová souprava Uchovávání Transport Poznámka k odběru

výtěr z nosohltanu, výplach, aspirát, BAL (>1ml), mozkomíšní mok (1ml, děti 0,5 ml), perikardiální výpotek(1-2 ml), stěr ze spojivky, moč odběrová souprava se 2 dacronovými tampóny RES (1 na patrové oblouky a 1 na nosní dírky) a odběrovým OS médiem ≤ 3 dny / cht Delší skladování (chladící box -20°C n. -80°C, popř. konzultujte s garantem metody) materiál co nejrychleji transportovat do laboratoře při doporučené teplotě - na vyžádání odběrovou soupravu dodáme, rovněž instrukce pro správný odběr a transport, popř. viz.: www.zuusti.cz

Parvovirus B19 (průkaz DNA metodou Real Time PCR) Odběr

srážlivá venózní krev (3 ml), plodová voda (1 ml) , výtěr z nosohltanu

Odběrová souprava

odběrová zkumavka bez aditiv odběrová souprava se 2 dacronovými tampóny RES (1 na patrové oblouky a 1 na nosní dírky) a odběrovým OS médiem ≤ 3 dny / cht po odběru krve, po separaci séra ≤ 5 d/cht, dlouhodobě při -20°C materiál co nejrychleji transportovat do laboratoře při doporučené teplotě

Uchovávání Transport Poznámka k odběru

- na vyžádání odběrovou soupravu dodáme, rovněž instrukce pro správný odběr, popř. viz.: www.zuusti.cz

Enteroviry (průkaz RNA metodou multiplex PCR) Odběr Odběrová souprava

Uchovávání


výtěr z nosohltanu, výplach, aspirát, BAL (>1ml), mozkomíšní mok (1ml, děti 0,5 ml), moč, stolice odběrová zkumavka bez aditiv, sterilní zkumavka EDTA, odběrová souprava se 2 dacronovými tampóny RES (1 na patrové oblouky a 1 na nosní dírky) a odběrovým OS médiem ≤ 3 dny / cht po odběru krve a dalších materiálů . Mok a separované sérum až 5 d/cht. Delší skladování materiálů (chladící box -50°C n. -80°C, popř. konzultujte s garantem metody) materiál co nejrychleji transportovat do laboratoře při doporučené teplotě na vyžádání odběrovou soupravu dodáme, rovněž instrukce pro správný odběr a transport, popř. viz.: www.zuusti.cz

Polyomaviry – JCV, BKV (průkaz DNA metodou Real Time PCR) Odběr

plná krev (EDTA), moč - BKV, mozkomíšní mok – JCV (1ml, děti 0,5 ml)


12



Odběrová souprava

odběrová zkumavka EDTA, sterilní zkumavka , kontejner

Uchovávání

plná krev EDTA ≤ 3 dny/cht , nemrazit! Moč ≤ 7 d/cht , nemrazit! Mozkomíšní mok ≤ 5 d/cht materiál co nejrychleji transportovat do laboratoře při doporučené teplotě

Transport

Poznámka k odběru

- vzhledem k citlivosti metody může i minimální kontaminace vést k falešně pozitivnímu výsledku a je tedy nutné klást velký důraz na provedení odběru za sterilních podmínek do sterilních zkumavek

Mycoplasma pneumoniae, Chlamydia pneumoniae a Bordetella pertusis,Bordetella parapertussis (atypické pneumonie metodou multiplex PCR-FilmArray, popř. jednotlivě) Odběr Odběrová souprava Uchovávání Transport Poznámka k odběru

výtěr z nosohltanu, BAL, sputum, mozkomíšní mok (1ml, děti 0,5 ml), plodová voda (1 ml), kontejner, odběrová souprava se 2 dacronovými tampóny RES (1 na patrové oblouky a 1 na nosní dírky) a odběrovým OS médiem ≤ 3 dny / cht. Delší skladování (chladící box -20°C n. -80°C, popř. konzultujte s garantem metody) materiál co nejrychleji transportovat do laboratoře při doporučené teplotě - vzhledem k citlivosti metody může i minimální kontaminace vést k falešně pozitivnímu výsledku. Je tedy důležité provádět odběr za sterilních podmínek do sterilních zkumavek

Legionella pneumophila (průkaz DNA metodou Real Time PCR - kvalitativně) Odběr

výplach hrdla, výtěr z nosohltanu, BAL, aspirát, vzorky z bronchoskopie

Odběrová souprava

sterilní odběrová zkumavka, odběrová souprava se 2 dacronovými tampóny RES (1 na patrové oblouky a 1 na nosní dírky) a odběrovým OS médiem ≤ 3 dny / cht. Delší skladování (chladící box -20°C n. -80°C, popř. konzultujte s garantem metody) materiál co nejrychleji transportovat do laboratoře při doporučené teplotě


- vzhledem k citlivosti metody může i minimální kontaminace vést k falešně pozitivnímu výsledku. Je tedy důležité provádět odběr za sterilních podmínek do sterilních zkumavek


13



Mycobacterium tuberculosis komplex ( průkaz DNA metodou Real Time PCR - kvalitativně) Odběr Odběrová souprava Uchovávání Transport Poznámka k odběru

sputum, výtěr z nosohltanu, BAL, mozkomíšní mok (2ml), pleurální punktát, aspirát,moč,stolice, vzorky z bronchoskopie, etc. sterilní kontejner - sputovka či jiná sterilní odběrová zkumavka ≤ 3 d / cht Delší skladování (chladící box -20°C n. -80°C, popř. konzultujte s garantem metody). Moč a stolice nemrazit! materiál co nejrychleji transportovat do laboratoře při doporučené teplotě - vzhledem k citlivosti metody může i minimální kontaminace vést k falešně pozitivnímu výsledku. Odebírejte sterilně do sterilních zkumavek!

Atypická mykobakteria (metoda PCR genotypizace s hybridizační sondou – DNA-strip - M. avium ssp., kansasii, gordonae, intracellulare, fortuitum, etc.) Odběr

izolovaný kmen

Odběrová souprava

sterilní odběrová zkumavka

Uchovávání

≤ 24 h/ cht až pt , déle při cht

Transport


Poznámka k odběru

- stanovení genotypů se provádí pouze z kolonií mykobakterií narostlých v tekuté nebo na pevné půdě odebraných za přísně sterilních podmínek!

Aspergillus spp. (průkaz DNA metodou Real Time PCR: A. niger, A. nidulans, A. terreus, A. flavus, A. versicolor, A. glaucus) Odběr

BAL, výtěr z nosohltanu, aspirát, vzorky z bronchoskopie

Odběrová souprava

sterilní odběrová zkumavka, odběrová souprava s dacronovým tampónem RES a odběrovým OS médiem ≤ 3 dny / cht. Delší skladování (chladící box -20°C n. -80°C, popř. konzultujte s garantem metody) materiál co nejrychleji transportovat do laboratoře při doporučené teplotě



Virus horečky dengue 1-4 a chikungunya (průkaz RNA metodou Real Time PCR) Odběr

srážlivá nebo nesrážlivá krev z venepunkce (3-5 ml)

Odběrová souprava

odběrová zkumavka na plnou krev EDTA nebo bez aditiv

Uchovávání

≤ 3d / cht po odběru krve, po separaci séra 5d/cht, dlouhodobě při -20°C, plnou krev nemrazit! materiál co nejrychleji transportovat do laboratoře při doporučené teplotě

Transport Uchovávání



14



Chlamydia trachomatis, Mycoplasma hominis, Ureaplasma urealytica, Neisseria gonorrhoeae (průkaz DNA metodou Real Time PCR - kvalitativně) Odběr Odběrová souprava

výtěr z děložního hrdla, uretry s abrazí buněk epitelu, výtěr ze spojivkového vaku, první proud první ranní moče , sekret z prostaty, ejakulát kontejner, odběrová souprava s tampónem STD a odběrovým OS médiem ≤ 3 d / cht, moč ≤ 7 d/ cht, nemrazit!

Transport


Poznámka k odběru


Borrelia burgdorferi s.l. (průkaz DNA metodou Real Time PCR – kvalitativně) Odběr Odběrová souprava Uchovávání


plná krev nebo plazma (3-5 ml) EDTA, první proud první ranní moče (5 ml) synoviální tekutina (3 ml), kožní biopsie (2 mm 3) mozkomíšní mok odběrová zkumavka na krev bez aditiv , popř. EDTA , ACD (nesmí být přidán heparin, který je inhibitorem PCR) kontejner, sterilní zkumavka ≤ 3 d / cht, moč ≤ 7 d/ cht, nemrazit! Zamražené lze skladovat déle (kromě plné krve) při teplotě -20 °C. Případné delší skladování u jiných materiálů konzultujte telefonicky. materiál co nejrychleji transportovat do laboratoře při doporučené teplotě - vzhledem k citlivosti metody může i minimální kontaminace vést k falešně pozitivnímu výsledku a je tedy nutné klást velký důraz na provedení odběru za sterilních podmínek do sterilních zkumavek

Clostridium difficile (průkaz toxinů metodou PCR – kvalitativně) Odběr

čerstvá stolice 5 ml nebo 5g

Odběrová souprava

kontejner

Uchovávání

24 h / pt, delší skladování ≤ 3 d / cht , nemrazit!

Transport


Poznámka k odběru

vzorek slouží pro průkaz toxinu vyvolávajícího pseudomembranózní enterokolitídu v souvislosti s podáváním ATB a vzniklou rezistencí


15



3. Nadstandardní a doplňkové služby - Vlastní transport - Poskytování odběrových souprav - Vlastní odběrová centra - Odborné konzultace - Vystavování mezinárodních certifikátů - Elektronická žádanka a elektronická distribuce výsledků

4. Obecné zásady laboratoře na ochranu osobních dat. - Všechny informace zjištěné při vyšetřeních jsou předmětem ochrany informací. - Informace a záznamy z laboratorních vyšetření o pacientech jsou chápány jako informace důvěrné. - Výsledky laboratorních vyšetření jsou poskytovány pouze žádajícímu lékaři. - Pacientům se výsledek vyšetření podává výjimečně, většinou je to na žádost ošetřujícího lékaře (telefonická konzultace s ošetřujícím lékařem). Výsledek vyšetření je zabezpečen proti nahlédnutí. V případě vyšetření na vlastní žádost (samoplátci) je výsledek předáván klientovi osobně v příslušných odběrových centrech . - Pracovníci jsou zavázáni k dodržování zásad pro ochranu osobních dat-směrniceZU-00311 Pracovní řád, Práva a povinnosti zaměstnanců - Všichni pracovníci virologie jsou vázáni dodržováním pravidel stanovených v Etickém kodexu.

5. Vyřizování stížností Stížnosti klinických pracovníků nebo třetích stran jsou přijímány na adrese virologie nebo Zdravotního ústavu se sídlem v Ústí nad Labem. Stížnosti mohou být přijímány formou dopisu, e-mailu, osobní návštěvy nebo telefonicky. Vedoucí oddělení virologie neprodleně informuje stěžovatele o přijetí stížnosti , nejpozději do tří dnů od přijetí stížnosti. Stížnost se zaznamená do příslušného formuláře. Vedoucí oddělení virologie je povinen rozhodnout o oprávněnosti nebo neoprávněnosti stížnosti a toto rozhodnutí sdělit stěžovateli. V případě oprávněné stížnosti se sděluje i způsob řešení stížnosti. Podle závažnosti stížnosti je vedoucí oddělení virologie povinen informovat i ředitele ZÚ. Termín pro vyřešení stížnosti je stanoven do třiceti kalendářních dnů od přijetí stížnosti. Při poskytování informací jsou dodržovány zásady mlčenlivosti a důvěrnosti informací (je nutné si ověřit, komu se sdělují informace). Oboustranná komunikace - zpětná vazba - mezi zadavateli služeb a oddělením virologie je umožněna přímou komunikací při poskytování odborných konzultací, interpretací nebo prostřednictvím seminářů. Zadavatelé služeb mohou vyjádřit své připomínky k poskytovaným službám formou dopisu, prostřednictvím webových stránek Zdravotního ústavu, e-mailu, osobní návštěvy nebo telefonicky.

6. Přílohy - Žádanka na laboratorní vyšetření - Návod na odběr materiálu pro přímý průkaz herpetických virů - Návod na odběr vzorků pro virologické vyšetření


16

Zdravotní ústav se sídlem v Ústí nad Labem Oddělení virologie Praha

Recommend Documents