RANCANG BANGUN APLIKASI KEAMANAN BERBASIS DNA PADA JARINGAN GPRS DAN 3G
SKRIPSI
Oleh :
JUSRIL A. HIDAYAT 04 04 03 0563
DEPARTEMEN ELEKTRO FAKULTAS TEKNIK UNIVERSITAS INDONESIA GENAP 2007/2008
Rancang bangun aplikasi..., Jusril A. Hidayat, FT UI, 2008
RANCANG BANGUN APLIKASI KEAMANAN BERBASIS DNA PADA JARINGAN GPRS DAN 3G
SKRIPSI
Oleh :
JUSRIL A. HIDAYAT 04 04 03 0563
SKRIPSI INI DIAJUKAN UNTUK MELENGKAPI SEBAGIAN PERSYARATAN MENJADI SARJANA TEKNIK
DEPARTEMEN ELEKTRO FAKULTAS TEKNIK UNIVERSITAS INDONESIA GENAP 2007/2008
ii Rancang bangun aplikasi..., Jusril A. Hidayat, FT UI, 2008
PERNYATAAN KEASLIAN SKRIPSI
Saya menyatakan dengan sesungguhnya bahwa skripsi dengan judul :
RANCANG BANGUN APLIKASI KEAMANAN BERBASIS DNA PADA JARINGAN GPRS DAN 3G
yang dibuat untuk melengkapi sebagian persyaratan menjadi Sarjana Teknik pada Program Studi Teknik Elektro Departemen Teknik Elektro Fakultas Teknik Universitas Indonesia, sejauh yang saya ketahui bukan merupakan tiruan atau duplikasi dari skripsi yang sudah dipublikasikan dan atau pernah dipakai untuk mendapatkan gelar kesarjanaan di lingkungan Universitas Indonesia maupun di Perguruan Tinggi atau Instansi manapun, kecuali bagian yang sumber informasinya dicantumkan sebagaimana mestinya.
Depok, 25 Maret 2008
Jusril A. Hidayat NPM 04 04 03 0563
iii Rancang bangun aplikasi..., Jusril A. Hidayat, FT UI, 2008
PENGESAHAN
Skripsi dengan judul :
RANCANG BANGUN APLIKASI KEAMANAN BERBASIS DNA PADA JARINGAN GPRS DAN 3G dibuat untuk melengkapi sebagian persyaratan menjadi Sarjana Teknik pada Program Studi Teknik Elektro Departemen Teknik Elektro Fakultas Teknik Universitas Indonesia dan telah disidangkan pada tanggal 25 Maret 2008.
Depok, 25 Maret 2008
Dosen Pembimbing 1,
Dosen Pembimbing 2,
Muhammad Suryanegara, ST. MSc.
Prof. Dr. Ir. Dadang Gunawan, M.Eng.
NIK 040 705 018 9
NIP 131 475 421
iv Rancang bangun aplikasi..., Jusril A. Hidayat, FT UI, 2008
UCAPAN TERIMA KASIH Penulis mengucapkan banyak terima kasih kepada :
1. Muhammad Suryanegara, ST, M.Sc 2. Prof. Dr. Ir. Dadang Gunawan, M.Eng.
Selaku dosen pembimbing yang telah mencurahkan banyak waktunya untuk memberikan pengarahan, masukan, pengkoreksian, kritikan yang membangun, serta bimbingan selama masa pembangunan aplikasi hingga terselesaikannya penulisan skripsi ini. 3.
Refdinal, ST
Selaku teman sekaligus pembimbing teknis pemrograman yang telah banyak membantu dalam menyelesaikan berbagai permasalahan dan kebuntuan dalam melakukan pembangunan piranti lunak.
4.
Awaluddin, Toni, dan rekan-rekan admin jaringan UI
Selaku administrator jaringan Universitas Indonesia yang telah membantu dalam berbagai kesulitan di ruangan server UI.
5.
WASP Research Group Universitas Indonesia
Sebagai mediator dalam pendanaan, penyediaan sarana dan prasarana, forum berdiskusi seputar ICT, serta pengembangan aplikasi di bidang telekomunikasi.
v Rancang bangun aplikasi..., Jusril A. Hidayat, FT UI, 2008
DAFTAR ISI Halaman iii
PERNYATAAN KEASLIAN SKRIPSI PENGESAHAN
iv
UCAPAN TERIMA KASIH
v
ABSTRAK
vi viii
DAFTAR ISI DAFTAR GAMBAR
x
DAFTAR TABEL
xi
DAFTAR LAMPIRAN
xii
DAFTAR SINGKATAN
xiii
DAFTAR ISTILAH
xiv 1
BAB I PENDAHULUAN 1.1.
LATAR BELAKANG
1
1.2.
TUJUAN
2
1.3.
PEMBATASAN MASALAH
2
1.4.
SISTEMATIKA PENULISAN
3 5
BAB II DNA dan CODIS 13 2.1.
DNA (DEOXYRIBONUCLEIC ACID)
5
2.2.
CODIS 13 (COMBINED DNA INDEX SYSTEM 13)
8
2.2.1.
Sistem Forensik CODIS
8
2.2.2.
STR (Short Tandem Repeat) pada 13 lokus
9
BAB III PERANCANGAN DNA SECURE-MOBILE APPLICATION
12
3.1.
ARSITEKTUR WASP DNA SECURE-MOBILE
12
3.2.
DIAGRAM ALIR PIRANTI LUNAK
16
3.3.
PIRANTI LUNAK PENDUKUNG
20
3.4.
CLASS DARI SOURCE CODE PIRANTI LUNAK
21
3.5.
TAMPILAN PIRANTI LUNAK
22
viii Rancang bangun aplikasi..., Jusril A. Hidayat, FT UI, 2008
27
BAB IV ANALISIS DAN UJICOBA 4.1.
SKENARIO ANALISIS
27
4.2.
ANALISIS SETIAP SAMPLE DATA
32
4.3.
ANALISIS KESELURUHAN DATA
45
4.4.
PEMANFAATAN WASP DNA SECURE-MOBILE
50
BAB V KESIMPULAN
51
DAFTAR ACUAN
52
LAMPIRAN
54
ix Rancang bangun aplikasi..., Jusril A. Hidayat, FT UI, 2008
DAFTAR GAMBAR Gambar 2.1.(a) Peta hierarki Gen [wikipedia] dan (b) 23 pasang kromosom [5]
5
Gambar 2.2. Ilustrasi ATGC dan nucleotide [4]
6
Gambar 2.3. Deretan basa nucleotide antara individu yang berbeda [6]
6
Gambar 2.4. Ilustrasi lokasi kromosom yang ditunjukan lokus 7q31.2 [7]
7
Gambar 2.5. Ilustrasi allele yang berulang pada chromosome lain [11]
11
Gambar 3.1. Skema arsitektur rancang bangun aplikasi WASP DNA secure-mobile 13 Gambar 3.2. Topologi jaringan GPRS [12]
14
Gambar 3.3. Topologi jaringan 3G [13]
14
Gambar 3.4. Diagram alir WASP DNA secure-mobile
18
Gambar 3.5. Class verifikasi dari WASP DNA secure-mobile source code
21
Gambar 3.6. Tampilan konfigurasi Tomcat 6.0
22
Gambar 3.7. Tampilan konfigurasi MySQL Query Browser
23
Gambar 3.8. Tampilan jendela utama MySQL Query Browser
23
Gambar 3.9. Tampilan saat awal mulai piranti lunak
24
Gambar 3.10. Tampilan saat registrasi
24
Gambar 3.11. Tampilan peringatan yang muncul untuk berbagai kesalahan
25
Gambar 3.12. Tampilan saat menu verifikasi
26
Gambar 3.13. Tampilan saat menu bank ditampilkan setelah verifikasi berhasil
26
Gambar 4.1. Skema arsitektur rancang bangun aplikasi WASP DNA secure-mobile 29 Gambar 4.2. Skema arsitektur rancang bangun aplikasi WASP DNA secure-mobile 35 Gambar 4.3. Grafik jaringan terhadap waktu transmisi saat registrasi untuk setiap 46
sample Gambar 4.4. Grafik jaringan terhadap waktu transmisi saat verifikasi untuk setiap sample
48
Gambar 4.5. GPRS protocol stack [15]
49
x Rancang bangun aplikasi..., Jusril A. Hidayat, FT UI, 2008
DAFTAR TABEL Table 2.1. Tiga belas lokus pada sistem CODIS dan rekomendasi STR [9]
10
Tabel 2.2. Persebaran geografis allele dari lokus D3S1358
11
Tabel 3.1. Port yang digunakan piranti lunak pendukung WASP DNA secure-mobile 16 Tabel 4.2. Data yang akan dikirim untuk setiap sample saat registrasi
32
Tabel 4.3. Data yang akan dikirim untuk setiap sample saat verifikasi
32
Tabel 4.4. Delay waktu transmisi saat registrasi untuk sample DNA-CODIS 13 A
35
Tabel 4.5. Delay waktu transmisi saat verifikasi untuk sample DNA-CODIS 13 A 37 Tabel 4.6. Delay waktu transmisi saat registrasi untuk sample DNA-CODIS 13 B
37
Tabel 4.7. Delay waktu transmisi saat verifikasi untuk sample DNA-CODIS 13 B 38 Tabel 4.8. Delay waktu transmisi saat registrasi untuk sample DNA-CODIS 13 C 39 Tabel 4.9. Delay waktu transmisi saat verifikasi untuk sample DNA-CODIS 13 C 40 Tabel 4.10. Delay waktu transmisi saat registrasi untuk sample DNA-CODIS 13 D 41 Tabel 4.11. Delay waktu transmisi saat verifikasi untuk sample DNA-CODIS 13 D 42 Tabel 4.12. Delay waktu transmisi saat registrasi untuk sample DNA-CODIS 13 E 43 Tabel 4.13. Delay waktu transmisi saat verifikasi untuk sample DNA-CODIS 13 E 44 Tabel 4.14. Delay waktu transmisi saat registrasi keseluruhan sample
45
Table 4.15. Delay waktu transmisi saat verifikasi keseluruhan sample
47
Tabel 4.16. Delay total rata-rata registrasi dan verifikasi
48
xi Rancang bangun aplikasi..., Jusril A. Hidayat, FT UI, 2008
DAFTAR LAMPIRAN 54
LAMPIRAN 1 Data yang dikirim 1.
Sample DNA-CODIS 13 A
54
2.
Sample DNA-CODIS 13 B
56
3.
Sample DNA-CODIS 13 C
58
4.
Sample DNA-CODIS 13 D
60
5.
Sample DNA-CODIS 13 E
62
LAMPIRAN 2 Data terkirim melalui jaringan GPRS dan 3G
64
1.
Sample DNA-CODIS 13 A
64
2.
Sample DNA-CODIS 13 B
65
3.
Sample DNA-CODIS 13 C
66
4.
Sample DNA-CODIS 13 D
67
5.
Sample DNA-CODIS 13 E
68
xii Rancang bangun aplikasi..., Jusril A. Hidayat, FT UI, 2008
DAFTAR SINGKATAN 3G
Third Generation
B3G
Beyond Third Generation
CODIS 13
Combined DNA Index System 13
DNA
Deoxyribonucleic Acid
GPRS
General Packet Radio Service
ICT
Information and Communication Technology
J2EE
Java 2 Enterprise Edition
JRE
Java Runtime Environment
JDK
Java Development Kit
J2ME
Java 2 Micro Edition
STR
Short Tandem Repeat
QoS
Quality of Service
WASP
Wireless and Signal Processing
xiii Rancang bangun aplikasi..., Jusril A. Hidayat, FT UI, 2008
DAFTAR ISTILAH Allele
Kelompok index pengulangan STR yang terjadi pada deret DNA
Chromosome
Sekumpulan gene beserta intergenic yang terikat secara erat
CODIS 13
Sistem yang dikembangkan FBI dalam
melakukan proses
verifikasi tindak kejahatan kriminal, cukup dengan 13 lokus dari keseluruhan lokus DNA dapat merepresentasikan keunikan setiap data DNA untuk masing-masing individu. DNA
Asam nucleic yang mengandung instruksi genetik yang digunakan dalam perkembangan mahluk hidup. Berupa deret nucleotide yang menyusun gene
Exon
Bagian dari gene yang dapat dikodekan menjadi protein
False Negative
Total nucleotide di real exon, yang salah dengan dianggap intron
Gene (gen)
Tersusun atas deret DNA yang menyusun kromosom
Genome
Sekumpulan kromosom beserta gene-nya yang menyusun bagian tubuh mahluk hidup
Intron
Bagian dari gene yang tidak digunakan dalam protein coding
Lokus
Representasi posisi DNA pada kromosom
Nucleotide
Unsur dari DNA yang terdiri dari adenine, cytosine, guanine, dan tymine
STR
Deret nucleotide sepanjang 2-5 karakter yang mengalami pengulangan pada deret DNA
True Positive
Total nucleotide di real exon, yang benar dengan prediksi
xiv Rancang bangun aplikasi..., Jusril A. Hidayat, FT UI, 2008
