____________________________________________________________________________________ PŘÍLOHA
8 PŘÍLOHA Seznam příloh Příloha I FASTA formát sekvencí izolátů Colletotrichum acutatum Příloha II Porovnání sekvencí izolátů Colletotrichum acutatum programem ClustalW2 Příloha III Záznam z GenBank izolátu J1 Příloha IV Záznam z GenBank izolátu R1 Příloha V Porovnání sekvencí izolátů Colletotrichum acutatum programem ClustalW2 Příloha VI FASTA formát sekvencí izolátů Colletotrichum acutatum Příloha VII Porovnání sekvencí izolátů Colletotrichum acutatum programem ClustalW2
Seznam grafů Graf I: Teplota – Hustopeče, vegetační sezóna v letech 2009–2010 (dekádní průměry)
Graf II: Srážky – Hustopeče, vegetační sezóna v letech 2009–2010 (dekádní úhrny)
Graf III: Teplota – Troubsko, vegetační sezóna v letech 2009–2011 (dekádní průměry)
Graf IV: Srážky – Troubsko, vegetační sezóna v letech 2009–2011 (dekádní úhrny)
Graf V: Teplota – Žabčice, vegetační sezóna v letech 2009–2011 (dekádní průměry)
Graf VI: Srážky – Žabčice, vegetační sezóna v letech 2009–2011 (dekádní úhrny)
____________________________________________________________________________________ PŘÍLOHA
Seznam tabulek Tab I. Seznam izolátů Colletotrichum acutatum z GenBank použitých do fylogenetické analýzy Tab. II Vícefaktorová ANOVA pro Tab. 12 – síla choroby a četnost choroby – 1. hodnocení Tab. III Vícefaktorová ANOVA pro Tab. 12 – síla choroby a četnost choroby – 2. hodnocení Tab. IV Vícefaktorová ANOVA pro Tab. 13 – síla choroby a četnost choroby Tab. V Vícefaktorová ANOVA pro Tab. 15 Tab. VI Vícefaktorová ANOVA pro Tab. 17 – síla choroby a četnost choroby – soubor A Tab. VII Vícefaktorová ANOVA pro Tab. 19 – síla choroby a četnost choroby – soubor B Tab. VIII Vícefaktorová ANOVA pro Tab. 21 – síla choroby a četnost choroby – 1. časové opakování Tab. IX Vícefaktorová ANOVA pro Tab. 21 – síla choroby a četnost choroby – 2. časové opakování Tab. X Jednofaktorová ANOVA pro Tab. 22 – 1. měření Tab. XI Jednofaktorová ANOVA pro Tab. 22 – 2. měření Tab. XII Jednofaktorová ANOVA pro Tab. 23 – 1. měření Tab. XIII Jednofaktorová ANOVA pro Tab. 23 – 2. měření
____________________________________________________________________________________ PŘÍLOHA
Tab. XIV Jednofaktorová ANOVA pro Tab. 24 – 1. Měření Tab. XV Jednofaktorová ANOVA pro Tab. 24 – 2. měření Tab. XVI Jednofaktorová ANOVA pro Tab. 25 – 1. měření Tab. XVII Jednofaktorová ANOVA pro Tab. 25 – 2. měření Tab. XVIII Jednofaktorová ANOVA pro Tab. 26 – 1. měření Tab. XIX Jednofaktorová ANOVA pro Tab. 26 – 2. měření Tab. XX Jednofaktorová ANOVA pro Tab. 27 – 1. měření Tab. XXI Jednofaktorová ANOVA pro Tab. 27 – 2. měření Tab. XXII Jednofaktorová ANOVA pro Tab. 28 – 1. měření Tab. XXIII Jednofaktorová ANOVA pro Tab. 28 – 2. měření Tab. XXIV Jednofaktorová ANOVA pro Tab. 29 – 1. měření Tab. XXV Jednofaktorová ANOVA pro Tab. 29 – 2. měření Tab. XXVI Jednofaktorová ANOVA pro Tab. 30
____________________________________________________________________________________ PŘÍLOHA
Seznam obrázků Pokud není na obrázku uvedeno jinak, autorem fotografíí je B. Jílková. Obr. I Determinované patogeny na světlici barvířské Obr. II Kolonie izolátů Colletotrichum acutatum po 10 dnech kultivace Obr. III Konidie izolátů Colletotrichum acutatum Obr. IV Vizualizace PCR produktů izolátů rodu Colletotrichum – velikost produktu 490 bp pro C. acutatum, oblasti ITS1, ITS2 a gen 5.8S rRNA Obr. V Vizualizace PCR produktů izolátů Colletotrichum acutatum – velikost produktu 200 bp, oblast intron 2 G3PD (glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase) genu Obr. VI Uměle infikované plody jahodníku velkoplodého Colletotrichum acutatum po 4 dnech od inokulace Obr. VII Uměle infikované plody papriky roční Colletotrichum acutatum po 11 dnech od inokulace Obr. VIII Uměle infikované rostliny světlice barvířské Colletotrichum acutatum po 5 dnech od inokulace Obr. IX Nejvíce a nejméně citlivý izolát u jednotlivých účinných látek fungicidních přípravků
____________________________________________________________________________________ PŘÍLOHA
Graf I: Teplota (dekádní průměry)*
–
Hustopeče,
vegetační
sezóna
v letech
2009–2010
Graf II: Srážky – Hustopeče, vegetační sezóna v letech 2009–2010 (dekádní úhrny)*
Graf III: Teplota (dekádní průměry)*
–
Troubsko,
vegetační
sezóna
v letech
2009–2011
____________________________________________________________________________________ PŘÍLOHA
Graf IV: Srážky – Troubsko, vegetační sezóna v letech 2009–2011 (dekádní úhrny)*
Graf V: Teplota – Žabčice, vegetační sezóna v letech 2009–2011 (dekádní průměry)*
Graf VI: Srážky – Žabčice, vegetační sezóna v letech 2009–2011 (dekádní úhrny)*
* Data byla převzata z příslušných meteorologických statnic ČHMÚ
____________________________________________________________________________________ PŘÍLOHA
Příloha I FASTA formát sekvencí izolátů Colletotrichum acutatum Oblasti ITS1, ITS2 a gen 5.8S rRNA >1209 světlice CCACGGGGACGGGGCGCCCGCCGGAGGAAACCAAACTCTATTTACACGACG TCTCTTCTGAGTGGCACAAGCAAATAATTAAAACTTTTAACAACGGATCTCT TGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAAT TGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCTCGCCAGC ATTCTGGCGAGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTTCAACCCTCAAGCACCGCTT GGTTTTGGGGCCCCACGGCACACGTGGGCCCTTAAAGGTAGTGGCGGACCC TCCCGGAGCCTCCTTTGCGTAGTAACTAACGTCTCGCACTGGGATTCGGAGG GACTCTTGCCGTAAAACCCCCCAATTTTTTACAGGTTGACCTCGGATCAGGT AGGAATACCCG >1109 světlice CCACGGGGACGGGGCGCCCGCCGGAGGAAACCAAACTCTATTTACACGACG TCTCTTCTGAGTGGCACAAGCAAATAATTAAAACTTTTAACAACGGATCTCT TGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAAT TGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCTCGCCAGC ATTCTGGCGAGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTTCAACCCTCAAGCACCGCTT GGTTTTGGGGCCCCACGGCACACGTGGGCCCTTAAAGGTAGTGGCGGACCC TCCCGGAGCCTCCTTTGCGTAGTAACTAACGTCTCGCACTGGGATTCGGAGG GACTCTTGCCGTAAAACCCCCCAATTTTTTACAGGTTGACCTCGGATCAGGT AGGAATACCC >608 světlice CCACGGGGACGGGGCGCCCGCCGGAGGAAACCAAACTCTATTTACACGACG TCTCTTCTGAGTGGCACAAGCAAATAATTAAAACTTTTAACAACGGATCTCT TGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAAT TGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCTCGCCAGC ATTCTGGCGAGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTTCAACCCTCAAGCACCGCTT GGTTTTGGGGCCCCACGGCACACGTGGGCCCTTAAAGGTAGTGGCGGACCC TCCCGGAGCCTCCTTTGCGTAGTAACTAACGTCTCGCACTGGGATTCGGAGG GA >710 třezalka CCACGGGGACGGGGCGCCCGCCGGAGGAAACCAAACTCTATTTACACGACG TCTCTTCTGAGTGGCACAAGCAAATAATTAAAACTTTTAACAACGGATCTCT TGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAAT TGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCTCGCCAGC ATTCTGGCGAGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTTCAACCCTCAAGCACCGCTT GGTTTTGGGGCCCCACGGCACACGTGGGCCCTTGAAGGTAGTGGCGGACCC
____________________________________________________________________________________ PŘÍLOHA
TCCCGGAGCCTCCTTTGCGTAGTAACTAACGTCTCGCACTGGGATCCGGAGG GACTCTTGCCGTAAAACCCCCCAATTCTTTACAGGTTGACCTCGGATCAGGT AGGAAT >J1 jabloň CCGGCGCCGGCCCCGTCACGGGGGCGGAGCGCCCGCCGGAGGAAACCAAA CTCTATTTACACGACGTCTCTTCTGAGTGGCACAAGCAAATAATTAAAACTT TTAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGC GATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGC ACATTGCGCTCGCCAGCATTCTGGCGAGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTTCA ACCCTCAAGCACCGCTTGGTTTTGGGGCCCCACGGCCGACGTGGGCCCTTAA AGGTAGTGGCGGACCCTCCCGGAGCCTCCTTTGCGTAGTAACTAACGTCTCG CACTGGGATCCGGAGGGACTCTTGCCGTTAAACCCCCAAA >R1 rajče CTCCCGGCGCCGGCCCCGTCACGGGGGCGGAGCGCCCGCCGGAGGAAACCA AACTCTATTTACACGACGTCTCTTCTGAGTGGCACAAGCAAATAATTAAAAC TTTTAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAAT GCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAAC GCACATTGCGCTCGCCAGCATTCTGGCGAGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTT CAACCCTCAAGCACCGCTTGGTTTTGGGGCCCCACGGCCGACGTGGGCCCTT AA
Příloha II Porovnání sekvencí izolátů Colletotrichum acutatum programem ClustalW2 Oblasti ITS1, ITS2 a gen 5.8S rRNA 231 786 R1 J1 710 437 1209 1109 608
AACCAAACTCTATTTACACGACGTCTCTTCTGAGTGGCACAAGCAAATAATTAAAACTTT AACTAAACTCTATTTACACGACGTCTCTTCTGAGTGGCACAAGCAAATAATTAAAACTTT AACCAAACTCTATTTACACGACGTCTCTTCTGAGTGGCACAAGCAAATAATTAAAACTTT AACCAAACTCTATTTACACGACGTCTCTTCTGAGTGGCACAAGCAAATAATTAAAACTTT AACCAAACTCTATTTACACGACGTCTCTTCTGAGTGGCACAAGCAAATAATTAAAACTTT AACCAAACTCTATTTACACGACGTCTCTTCTGAGTGGCACAAGCAAATAATTAAAACTTT AACCAAACTCTATTTACACGACGTCTCTTCTGAGTGGCACAAGCAAATAATTAAAACTTT AACCAAACTCTATTTACACGACGTCTCTTCTGAGTGGCACAAGCAAATAATTAAAACTTT AACCAAACTCTATTTACACGACGTCTCTTCTGAGTGGCACAAGCAAATAATTAAAACTTT *** ********************************************************
60 60 60 60 60 60 60 60 60
231 786 R1 J1 710 437 1209 1109 608
TAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAAT TAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAAT TAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAAT TAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAAT TAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAAT TAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAAT TAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAAT TAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAAT TAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAAT ************************************************************
120 120 120 120 120 120 120 120 120
231 786 R1 J1
GTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCTCGCCAGCAT GTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCTCGCCAGCAT GTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCTCGCCAGCAT GTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCTCGCCAGCAT
180 180 180 180
____________________________________________________________________________________ PŘÍLOHA
710 437 1209 1109 608
GTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCTCGCCAGCAT GTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCTCGCCAGCAT GTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCTCGCCAGCAT GTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCTCGCCAGCAT GTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCTCGCCAGCAT ************************************************************
180 180 180 180 180
231 786 R1 J1 710 437 1209 1109 608
TCTGGCGAGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTTCAACCCTCAAGCACCGCTTGGTTTTGGGG TCTGGCGAGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTTCAACCCTCAAGCACCGCTTGGTTTTGGGG TCTGGCGAGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTTCAACCCTCAAGCACCGCTTGGTTTTGGGG TCTGGCGAGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTTCAACCCTCAAGCACCGCTTGGTTTTGGGG TCTGGCGAGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTTCAACCCTCAAGCACCGCTTGGTTTTGGGG TCTGGCGAGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTTCAACCCTCAAGCACCGCTTGGTTTTGGGG TCTGGCGAGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTTCAACCCTCAAGCACCGCTTGGTTTTGGGG TCTGGCGAGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTTCAACCCTCAAGCACCGCTTGGTTTTGGGG TCTGGCGAGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTTCAACCCTCAAGCACCGCTTGGTTTTGGGG ************************************************************
240 240 240 240 240 240 240 240 240
231 786 R1 J1 710 437 1209 1109 608
CCCCACGGCCGACGTGGGCCCTTAA CCCCACGGCCGACGTGGGCCCTTAA CCCCACGGCCGACGTGGGCCCTTAA CCCCACGGCCGACGTGGGCCCTTAA CCCCACGGCACACGTGGGCCCTTGA CCCCACGGCACACGTGGGCCCTTGA CCCCACGGCACACGTGGGCCCTTAA CCCCACGGCACACGTGGGCCCTTAA CCCCACGGCACACGTGGGCCCTTAA ********* ************ *
265 265 265 265 265 265 265 265 265
Příloha III Záznam z GenBank izolátu J1 Glomerella acutata isolate J1 internal transcribed spacer 1, partial sequence; 5.8S ribosomal RNA gene, complete sequence; and internal transcribed spacer 2, partial sequence GenBank: JN676198.1 LOCUS JN676198 400 bp DNA linear PLN 21-FEB-2012 DEFINITION Glomerella acutata isolate J1 internal transcribed spacer 1, partial sequence; 5.8S ribosomal RNA gene, complete sequence; and internal transcribed spacer 2, partial sequence. ACCESSION JN676198 VERSION JN676198.1 GI:375968585 KEYWORDS . SOURCE Glomerella acutata (anamorph: Colletotrichum acutatum) ORGANISM Glomerella acutata Eukaryota; Fungi; Dikarya; Ascomycota; Pezizomycotina; Sordariomycetes; Hypocreomycetidae; Glomerellales; Glomerellaceae; Glomerella. REFERENCE 1 (bases 1 to 400) AUTHORS Vichova,J., Stankova,B. and Pokorny,R. TITLE First report of Colletotrichum acutatum on tomato and apple fruits in the Czech Republic JOURNAL Unpublished REFERENCE 2 (bases 1 to 400) AUTHORS Vichova,J., Stankova,B. and Pokorny,R.
____________________________________________________________________________________ PŘÍLOHA
TITLE Direct Submission JOURNAL Submitted (13-SEP-2011) Department of Crop Science, Breeding and Plant Medicine, Mendel University in Brno, Zemedelska 1, Brno, CZ 613 00, Cz FEATURES Location/Qualifiers source 1..400 /organism="Glomerella acutata" /mol_type="genomic DNA" /isolate="J1" /host="apple" /db_xref="taxon:27357" /country="Czech Republic" /PCR_primers="fwd_name: caint2, fwd_seq: ggggaagcctctcgcgg, rev_name: its4, rev_seq: tcctccgcttattgatatgc" /note="anamorph: Colletotrichum acutatum" misc_RNA <1..96 /product="internal transcribed spacer 1" rRNA 97..253 /product="5.8S ribosomal RNA" misc_RNA 254..>400 /product="internal transcribed spacer 2" ORIGIN 1 ccggcgccgg ccccgtcacg ggggcggagc gcccgccgga ggaaaccaaa ctctatttac 61 acgacgtctc ttctgagtgg cacaagcaaa taattaaaac ttttaacaac ggatctcttg 121 gttctggcat cgatgaagaa cgcagcgaaa tgcgataagt aatgtgaatt gcagaattca 181 gtgaatcatc gaatctttga acgcacattg cgctcgccag cattctggcg agcatgcctg 241 ttcgagcgtc atttcaaccc tcaagcaccg cttggttttg gggccccacg gccgacgtgg 301 gcccttaaag gtagtggcgg accctcccgg agcctccttt gcgtagtaac taacgtctcg 361 cactgggatc cggagggact cttgccgtta aacccccaaa
Příloha IV Záznam z GenBank izolátu R1 Glomerella acutata isolate R1 internal transcribed spacer 1, partial sequence; 5.8S ribosomal RNA gene, complete sequence; and internal transcribed spacer 2, partial sequence GenBank: JN676199.1 LOCUS JN676199 311 bp DNA linear PLN 21-FEB-2012 DEFINITION Glomerella acutata isolate R1 internal transcribed spacer 1, partial sequence; 5.8S ribosomal RNA gene, complete sequence; and internal transcribed spacer 2, partial sequence. ACCESSION JN676199 VERSION JN676199.1 GI:375968586
____________________________________________________________________________________ PŘÍLOHA
KEYWORDS . SOURCE Glomerella acutata (anamorph: Colletotrichum acutatum) ORGANISM Glomerella acutata Eukaryota; Fungi; Dikarya; Ascomycota; Pezizomycotina; Sordariomycetes; Hypocreomycetidae; Glomerellales; Glomerellaceae; Glomerella. REFERENCE 1 (bases 1 to 311) AUTHORS Vichova,J., Stankova,B. and Pokorny,R. TITLE First report of Colletotrichum acutatum on tomato and apple fruits in the Czech Republic JOURNAL Unpublished REFERENCE 2 (bases 1 to 311) AUTHORS Vichova,J., Stankova,B. and Pokorny,R. TITLE Direct Submission JOURNAL Submitted (13-SEP-2011) Department of Crop Science, Breeding and Plant Medicine, Mendel University in Brno, Zemedelska 1, Brno, CZ 613 00, Cz FEATURES Location/Qualifiers source 1..311 /organism="Glomerella acutata" /mol_type="genomic DNA" /isolate="R1" /host="tomato" /db_xref="taxon:27357" /country="Czech Republic" /PCR_primers="fwd_name: caint2, fwd_seq: ggggaagcctctcgcgg, rev_name: its4, rev_seq: tcctccgcttattgatatgc" /note="anamorph: Colletotrichum acutatum" misc_RNA <1..99 /product="internal transcribed spacer 1" rRNA 100..256 /product="5.8S ribosomal RNA" misc_RNA 257..>311 /product="internal transcribed spacer 2" ORIGIN 1 ctcccggcgc cggccccgtc acgggggcgg agcgcccgcc ggaggaaacc aaactctatt 61 tacacgacgt ctcttctgag tggcacaagc aaataattaa aacttttaac aacggatctc 121 ttggttctgg catcgatgaa gaacgcagcg aaatgcgata agtaatgtga attgcagaat 181 tcagtgaatc atcgaatctt tgaacgcaca ttgcgctcgc cagcattctg gcgagcatgc 241 ctgttcgagc gtcatttcaa ccctcaagca ccgcttggtt ttggggcccc acggccgacg 301 tgggccctta a
____________________________________________________________________________________ PŘÍLOHA
Příloha V Porovnání sekvencí izolátů Colletotrichum acutatum programem ClustalW2 Oblasti ITS1, ITS2 a gen 5.8S rRNA 1209 1109 710 437 231 786
AACCAAACTCTATTTACACGACGTCTCTTCTGAGTGGCACAAGCAAATAATTAAAACTTT AACCAAACTCTATTTACACGACGTCTCTTCTGAGTGGCACAAGCAAATAATTAAAACTTT AACCAAACTCTATTTACACGACGTCTCTTCTGAGTGGCACAAGCAAATAATTAAAACTTT AACCAAACTCTATTTACACGACGTCTCTTCTGAGTGGCACAAGCAAATAATTAAAACTTT AACCAAACTCTATTTACACGACGTCTCTTCTGAGTGGCACAAGCAAATAATTAAAACTTT AACTAAACTCTATTTACACGACGTCTCTTCTGAGTGGCACAAGCAAATAATTAAAACTTT *** ********************************************************
60 60 60 60 60 60
1209 1109 710 437 231 786
TAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAAT TAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAAT TAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAAT TAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAAT TAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAAT TAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAAT ************************************************************
120 120 120 120 120 120
1209 1109 710 437 231 786
GTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCTCGCCAGCAT GTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCTCGCCAGCAT GTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCTCGCCAGCAT GTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCTCGCCAGCAT GTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCTCGCCAGCAT GTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCTCGCCAGCAT ************************************************************
180 180 180 180 180 180
1209 1109 710 437 231 786
TCTGGCGAGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTTCAACCCTCAAGCACCGCTTGGTTTTGGGG TCTGGCGAGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTTCAACCCTCAAGCACCGCTTGGTTTTGGGG TCTGGCGAGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTTCAACCCTCAAGCACCGCTTGGTTTTGGGG TCTGGCGAGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTTCAACCCTCAAGCACCGCTTGGTTTTGGGG TCTGGCGAGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTTCAACCCTCAAGCACCGCTTGGTTTTGGGG TCTGGCGAGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTTCAACCCTCAAGCACCGCTTGGTTTTGGGG ************************************************************
240 240 240 240 240 240
1209 1109 710 437 231 786
CCCCACGGCACACGTGGGCCCTTAAAGGTAGTGGCGGACCCTCCCGGAGCCTCCTTTGCG CCCCACGGCACACGTGGGCCCTTAAAGGTAGTGGCGGACCCTCCCGGAGCCTCCTTTGCG CCCCACGGCACACGTGGGCCCTTGAAGGTAGTGGCGGACCCTCCCGGAGCCTCCTTTGCG CCCCACGGCACACGTGGGCCCTTGAAGGTAGTGGCGGACCCTCCCGGAGCCTCCTTTGCG CCCCACGGCCGACGTGGGCCCTTAAAGGTAGTGGCGGACCCTCCCGGAGCCTCCTTTGCG CCCCACGGCCGACGTGGGCCCTTAAAGGTAGTGGCGGACCCTCCCGGAGCCTCCTTTGCG ********* ************ ************************************
300 300 300 300 300 300
1209 1109 710 437 231 786
TAGTAACTAACGTCTCGCACTGGGATTCGGAGGGACTCTTGCCGTAAAACCCCCCAATTT TAGTAACTAACGTCTCGCACTGGGATTCGGAGGGACTCTTGCCGTAAAACCCCCCAATTT TAGTAACTAACGTCTCGCACTGGGATCCGGAGGGACTCTTGCCGTAAAACCCCCCAATTC TAGTAACTAACGTCTCGCACTGGGATCCGGAGGGACTCTTGCCGTAAAACCCCCCAATTC TAGTAACTAACGTCTCGCACTGGGATCCGGAGGGACTCTTGCCGTTAAACCCCCAAATTC TAGTAACTAACGTCTCGCACTGGGATCCGGAGGGACTCTTGCCGTTAAACCCCCAAATTC ************************** ****************** ******** ****
360 360 360 360 360 360
1209 1109 710 437 231 786
TTTAC TTTAC TTTAC TTTAC TTTAC TTTAC *****
365 365 365 365 365 365
____________________________________________________________________________________ PŘÍLOHA
Příloha VI FASTA formát sekvencí izolátů Colletotrichum acutatum Oblast intronu 2 G3PD (glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase) genu > 1209 světlice CGCTGTGAGTATCACCCCACTTTACCCCTCCATGATATCACGTTTGCCACGA TAACACCAGCTCCGTCGATATCCACGGGAAAAGAGTCGGAGCTAGCACTCT CGATTCTTTTGCCCAAGGTTTCGATTGGGCTTGTTGTAACGACACGACGTGA CCCAGTCATGCAGAAACAGCCAAGACAAAACTTGCTGACAGACAATCCATC ACAGGCCTACATGCTCAAGAC > 1109 světlice CGCTGTGAGTATCACCCCACTTTACCCCTCCATGATATCACGTTTGCCACGA TAACACCAGCTCCGTCGATATCCACGGGAAAAGAGTCGGAGCTAGCACTCT CGATTCTTTTGCCCAAGGTTTCGATTGGGCTTGTTGTAACGACACGACGTGA CCCAGTCATGCAGAAACAGCCAAGACAAAACTTGCTGACAGACAATCCATC ACAGGCCTACATGCTCAAGAC > 710 třezalka CGCTGTGAGTATCACCCCACTTTACCCCTCCATCATGATATCACGTCTGCCA CGATAACACCAGCTTCGTCGGTACCCACGGCAAAAGAGTCAGAACTAGCAC CCTCGACTTTTTTGCCCCAAGGTTTCGATTGGGCTTGTTGTAATGACACGAC GTGACACAATCATGCCGAAACAGCCGAGACAAAACTTGCTGACAGACAATC ATCACAGGCCTACATGCTCAAGTAC Příloha VII Porovnání sekvencí izolátů Colletotrichum acutatum programem ClustalW2 Oblast intronu 2 G3PD (glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase) genu 1209 1109 710
CGCTGTGAGTATCACCCCACTTTACCCCTCCAT---GATATCACGTTTGCCACGATAACA 57 CGCTGTGAGTATCACCCCACTTTACCCCTCCAT---GATATCACGTTTGCCACGATAACA 57 CGCTGTGAGTATCACCCCACTTTACCCCTCCATCATGATATCACGTCTGCCACGATAACA 60 ********************************* ********** *************
1209 1109 710
CCAGCTCCGTCGATATCCACGGGAAAAGAGTCGGAGCTAGCACTCTCGATTCTTTTGCCC 117 CCAGCTCCGTCGATATCCACGGGAAAAGAGTCGGAGCTAGCACTCTCGATTCTTTTGCCC 117 CCAGCTTCGTCGGTACCCACGGCAAAAGAGTCAGAACTAGCACCCTCGACTTTTTTGCCC 120 ****** ***** ** ****** ********* ** ******* ***** * ********
1209 1109 710
-AAGGTTTCGATTGGGCTTGTTGTAACGACACGACGTGACCCAGTCATGCAGAAACAGCC 176 -AAGGTTTCGATTGGGCTTGTTGTAACGACACGACGTGACCCAGTCATGCAGAAACAGCC 176 CAAGGTTTCGATTGGGCTTGTTGTAATGACACGACGTGACACAATCATGCCGAAACAGCC 180 ************************* ************* ** ****** *********
1209 1109 710
AAGACAAAACTTGCTGACAGACAATCCATCACAGGCCTACATGCTCAAG-AC 226 AAGACAAAACTTGCTGACAGACAATCCATCACAGGCCTACATGCTCAAG-AC 227 GAGACAAAACTTGCTGACAGACAATC-ATCACAGGCCTACATGCTCAAGTAC 231 ************************* ********************** **
____________________________________________________________________________________ PŘÍLOHA
Tab I. Seznam izolátů do fylogenetické analýzy
Colletotrichum Země původu izolátu
acutatum
z GenBank
Vnitrodruhová skupina
použitých
Izolát
Hostitelská rostlina
AJ749675
Chrysanthemum L. Nizozemí
ITS1-5.8S rRNAITS2
AJ749681
Olea europaea L.
Portugalsko
ITS1-5.8S rRNAITS2
AJ749683
Olea europaea L.
Portugalsko
AJ749684
Olea europaea L.
Portugalsko
ITS1-5.8S rRNAITS2
AJ749687
Olea europaea L.
Portugalsko
ITS1-5.8S rRNAITS2
AJ301932
Fragaria L.
AJ301950
Fragaria L.
AJ301951
Fragaria L.
AJ301964
Lupinus albus L.
Portugalsko
AJ536199
Fragaria L.
Francie
A2 **
ITS1-5.8S rRNAITS2
AJ536201
Fragaria L.
Švýcarsko
A2**
ITS1-5.8S rRNAITS2
AJ536203
Fragaria L.
Kostarika
ITS1-5.8S rRNAITS2
AJ536202
Fragaria L.
USA
ITS1-5.8S rRNAITS2
EF622180
Fragaria × ananassa Duch.
Španělsko
C. simmondsii *
Sekvenovaná oblast
ITS1-5.8S rRNAITS2
ITS1-5.8S rRNAITS2 Německo
ITS1-5.8S rRNAITS2 ITS1-5.8S rRNAITS2 ITS1-5.8S rRNAITS2
A2**
ITS1-5.8S rRNAITS2
____________________________________________________________________________________ PŘÍLOHA
Pokračování Tab. I Izolát Hostitelská rostlina
Země původu izolátu
Vnitrodruhová skupina
Sekvenovaná oblast
EF694678
Fragaria × ananassa Duch.
Španělsko
A2**
ITS1-5.8S rRNAITS2
EU109739
Fragaria × ananassa Duch.
Španělsko
A2**
ITS1-5.8S rRNAITS2
EU109740
Fragaria × ananassa Duch.
Španělsko
A2**
ITS1-5.8S rRNAITS2
AJ749674
Lupinus L.
EF622192
Lupinus L.
Nizozemí
A1**
ITS1-5.8S rRNAITS2
AJ301933
Lupinus albus L.
Německo
A1**
ITS1-5.8S rRNAITS2
DQ991720
Vitis vinifera L.
Austrálie
A1**
ITS1-5.8S rRNAITS2
AF521196
Cyphomandra betacea (Cav.) Sendtn.
Kolumbie
A8**
ITS1-5.8S rRNAITS2
AF521205
Cyphomandra betacea (Cav.) Sendtn.
Kolumbie
A8**
ITS1-5.8S rRNAITS2
AJ301921
Capsicum L.
Indonésie
ITS1-5.8S rRNAITS2
AJ301920
Capsicum L.
Indonésie
ITS1-5.8S rRNAITS2
AJ749678
Cyclamen L.
Nizozemí
A9**
ITS1-5.8S rRNAITS2
AJ536207
Fragaria L.
Austrálie
A9**
ITS1-5.8S rRNAITS2
ITS1-5.8S rRNAITS2
____________________________________________________________________________________ PŘÍLOHA
Pokračování Tab. I Izolát Hostitelská rostlina
Země původu izolátu
Vnitrodruhová skupina
Sekvenovaná oblast
A9**
ITS1-5.8S rRNAITS2
AJ301926
Cyclamen persicum Mill.
Německo
AJ536206
Fragaria L.
Austrálie
AJ301924
Coffea arabica L.
EF622200
Fragaria × ananassa Duch.
Nizozemí
A5**
ITS1-5.8S rRNAITS2
AJ749694
Olea europaea L.
Portugalsko
C. acutatum*
ITS1-5.8S rRNAITS2
ITS1-5.8S rRNAITS2 ITS1-5.8S rRNAITS2
A5** EF622188
Rosa L.
AY376509
Malus Mill.
AF489566
Fragaria L.
AF489567
Nizozemí
A5**
ITS1-5.8S rRNAITS2
C. fioriniae*
ITS1-5.8S rRNAITS2
Francie
A3**
ITS1-5.8S rRNAITS2
Vaccinium L.
Francie
A3**
ITS1-5.8S rRNAITS2
AJ536217
Fragaria L.
Francie
ITS1-5.8S rRNAITS2
AJ301911
Vaccinium corymbosum L.
Nizozemí
ITS1-5.8S rRNAITS2
AJ301905
Vaccinium corymbosum L.
AJ749686
Olea europaea L.
Portugalsko
AJ536211
Fragaria L.
Velká Británie
ITS1-5.8S rRNAITS2 ITS1-5.8S rRNAITS2 A4**
ITS1-5.8S rRNAITS2
____________________________________________________________________________________ PŘÍLOHA
Pokračování Tab. I Izolát Hostitelská rostlina
Země původu izolátu
Vnitrodruhová skupina
Sekvenovaná oblast
AJ536210
Fragaria L.
Nizozemí
AJ536209
Fragaria L.
Španělsko
AJ301971
Prunus cerasus L.
ITS1-5.8S rRNAITS2
AJ301963
Lycopersicon Mill.
ITS1-5.8S rRNAITS2
AJ301917
Prunus cerasus L.
AJ301914
Fragaria L.
ITS1-5.8S rRNAITS2
AJ301913
Fragaria L.
ITS1-5.8S rRNAITS2
AJ749688
Olea europaea L.
Itálie
AJ749685
Olea europaea L.
Portugalsko
AF411766
Fragaria × ananassa Duch.
Velká Británie
AJ536212
Fragaria L.
Nový Zéland
A7**
ITS1-5.8S rRNAITS2
AJ536213
Fragaria L.
Nový Zéland
A7**
ITS1-5.8S rRNAITS2
AJ749700
Olea europaea L.
Portugalsko
A6**
ITS1-5.8S rRNAITS2
EU647324
kapradina
USA
ITS1-5.8S rRNAITS2
A4**
Nizozemí
ITS1-5.8S rRNAITS2
ITS1-5.8S rRNAITS2
ITS1-5.8S rRNAITS2 C. acutatum*
ITS1-5.8S rRNAITS2 ITS1-5.8S rRNAITS2
intron 2 G3PD
____________________________________________________________________________________ PŘÍLOHA
Pokračování Tab. I Izolát Hostitelská rostlina
Země původu izolátu
Vnitrodruhová skupina
Sekvenovaná oblast
EU647322
kapradina
USA
intron 2 G3PD
EU647320
Citrus aurantifolia USA (Christm.) Swingle
intron 2 G3PD
EU168906
Citrus aurantifolia Belize (Christm.) Swingle
intron 2 G3PD
EU647318
Citrus × sinensis (L.) Osbeck
USA
intron 2 G3PD
EU168905
Citrus × sinensis (L.) Osbeck
USA
intron 2 G3PD
EU647319
Citrus × sinensis (L.) Osbeck
USA
intron 2 G3PD
FJ972581
Carica papaya L.
Austrálie
intron 2 G3PD
DQ792848
Malus Mill.
EU647314
Vaccinium L.
USA
intron 2 G3PD
EU647313
Vaccinium L.
USA
intron 2 G3PD
EU647315
Fragaria L.
USA
intron 2 G3PD
EU647316
Fragaria L.
USA
intron 2 G3PD
EU647317
Fragaria L.
USA
intron 2 G3PD
HM575316
Citrus L.
Čína
intron 2 G3PD
intron 2 G3PD
*izoláty patřící do nového řazení dle SHIVAS a TAN (2009); **izoláty patřící do skupin A1–A9 dle GARRIDO et al. (2009a)
____________________________________________________________________________________ PŘÍLOHA
Tab. II Vícefaktorová ANOVA pro Tab. 12 – síla choroby a četnost choroby – 1. hodnocení Závisle proměnná: síla choroby Zdroj variability
Součet čtverců
St. vol.
Průměrný čtverec
Stat F
Významn.
Hlavní efekty
43,752
7
6,250
50,375
0,0000
Odrůda
22,001
2
11,001
88,662
0,0000
Koncentrace
0,068
2
0,034
0,274
0,7612
List
21,683
3
7,228
58,251
0,0000
Interakce 2. řádu
18,181
16
1,136
9,159
0,0000
Odrůda × Koncentrace
6,376
4
1,594
12,847
0,0000
Odrůda × List
11,557
6
1,926
15,525
0,0000
Koncentrace × List
0,248
6
0,041
0,334
0,9171
Interakce 3. řádu
1,621
12
0,135
1,089
0,3825
Odrůda × Koncentrace × List
1,621
12
0,135
1,089
0,3825
Vysvětleno
63,554
35
1,816
14,635
0,0000
Chyba
8,933
72
0,124
Celkem
72,488
107
0,677
Závisle proměnná: četnost choroby Zdroj variability
Součet čtverců
St. vol.
Průměrný čtverec
Stat F
Významn.
Hlavní efekty
83489,815
7
11927,116
53,897
0,0000
Odrůda
57985,185
2
28992,593
131,013
0,0000
Koncentrace
257,407
2
128,704
0,582
0,5616
List
25247,222
3
8415,741
38,029
0,0000
Interakce 2. řádu
33475,926
16
2092,245
9,454
0,0000
Odrůda × Koncentrace
16392,593
4
4098,148
18,519
0,0000
Odrůda × List
14644,444
6
2440,741
11,029
0,0000
Koncentrace × List
2438,889
6
406,481
1,837
0,1039
Interakce 3. řádu
3444,444
12
287,037
1,297
0,2393
Odrůda × Koncentrace × List
3444,444
12
287,037
1,297
0,2393
Vysvětleno
120410,185
35
3440,291
15,546
0,0000
Chyba
15933,333
72
221,296
Celkem
136343,519
107
1274,238
Tab. III Vícefaktorová ANOVA pro Tab. 12 – síla choroby a četnost choroby – 2. hodnocení Závisle proměnná: síla choroby Zdroj variability
Součet čtverců
St. vol.
Průměrný čtverec
Stat F
Významn.
Hlavní efekty
69,700
7
9,957
108,843
0,0000
Odruda
40,761
2
20,380
222,780
0,0000
Koncentrace
0,091
2
0,045
0,495
0,6117
List
28,848
3
9,616
105,116
0,0000
Interakce 2. řádu
21,731
16
1,358
14,847
0,0000
Odruda × Koncentrace
6,927
4
1,732
18,931
0,0000
Odruda × List
14,216
6
2,369
25,899
0,0000
____________________________________________________________________________________ PŘÍLOHA
Pokračování Tab. III Stat F
Významn.
6
Průměrný čtverec 0,098
1,071
0,3878
12
0,054
0,594
0,8401
0,652
12
0,054
0,594
0,8401
Vysvětleno
92,082
35
2,631
28,759
0,0000
Chyba
6,587
72
0,091
Celkem
98,669
107
0,922
Zdroj variability
Součet čtverců
St. vol.
Koncentrace × List
0,588
Interakce 3. řádu
0,652
Odruda × Koncentrace × List
Závisle proměnná: četnost choroby Zdroj variability
Součet čtverců
St. vol.
Průměrný čtverec
Stat F
Významn.
Hlavní efekty
112498,148
7
16071,164
105,834
0,0000
Odruda
93516,667
2
46758,333
307,921
0,0000
Koncentrace
622,222
2
311,111
2,049
0,1363
List
18359,259
3
6119,753
40,301
0,0000
Interakce 2. řádu
32553,704
16
2034,606
13,399
0,0000
Odruda × Koncentrace
19811,111
4
4952,778
32,616
0,0000
Odruda × List
11290,741
6
1881,790
12,392
0,0000
Koncentrace × List
1451,852
6
241,975
1,593
0,1615
Interakce 3. řádu
5181,481
12
431,790
2,843
0,0030
Odruda × Koncentrace × List
5181,481
12
431,790
2,843
0,0030
Vysvětleno
150233,333
35
4292,381
28,267
0,0000
Chyba
10933,333
72
151,852
Celkem
161166,667
107
1506,231
Tab. IV Vícefaktorová ANOVA pro Tab. 13 – síla choroby a četnost choroby Závisle proměnná: síla choroby Zdroj variability
Součet čtverců
St. vol.
Průměrný čtverec
Stat F
Významn.
Hlavní efekty
20,821
6
3,470
40,560
0,0000
Odrůda
19,803
1
19,803
231,458
0,0000
Izolát
1,018
5
0,204
2,380
0,0689
Interakce 2. řádu
0,696
5
0,139
1,627
0,1912
Odrůda × Izolát
0,696
5
0,139
1,627
0,1912
Vysvětleno
21,516
11
1,956
22,863
0,0000
Chyba
2,053
24
0,086
Celkem
23,570
35
0,673
Závisle proměnná: četnost choroby Zdroj variability
Součet čtverců
St. vol.
Průměrný čtverec
Stat F
Významn.
Hlavní efekty
1011,111
6
168,519
12,133
0,0000
Odrůda
277,778
1
277,778
20,000
0,0002
Izolát
733,333
5
146,667
10,560
0,0000
Interakce 2. řádu
855,556
5
171,111
12,320
0,0000
Odrůda × Izolát
855,556
5
171,111
12,320
0,0000
Vysvětleno
1866,667
11
169,697
12,218
0,0000
Chyba
333,333
24
13,889
Celkem
2200,000
35
62,857
____________________________________________________________________________________ PŘÍLOHA
Tab. V Vícefaktorová ANOVA pro Tab. 15 Závisle proměnná: Plocha skvrny Zdroj variability
Součet čtverců
St. vol.
Průměrný čtverec
Stat F
Významn.
Hlavní efekty
87056,208
6
14509,368
1010,166
0,0000
Odrůda
20013,147
1
20013,147
1393,349
0,0000
Izolát
67043,061
5
13408,612
933,530
0,0000
Interakce 2. řádu
36785,044
5
7357,009
512,207
0,0000
Odrůda × Izolát
36785,044
5
7357,009
512,207
0,0000
Vysvětleno
123841,252
11
11258,296
783,821
0,0000
Chyba
344,720
24
14,363
Celkem
124185,973
35
3548,171
Tab. VI Vícefaktorová ANOVA pro Tab. 17 – síla choroby a četnost choroby – soubor A Závisle proměnná: síla choroby Zdroj variability
Součet čtverců
St. vol.
Průměrný čtverec
Stat F
Významn.
Hlavní efekty
79,473
7
11,353
151,153
0,0000
Kmen
75,024
4
18,756
249,709
0,0000
Odrůda
0,361
1
0,361
4,806
0,0322
List
4,088
2
2,044
27,213
0,0000
Interakce 2. řádu
5,851
14
0,418
5,564
0,0000
Kmen × Odrůda
3,547
4
0,887
11,807
0,0000
Kmen × List
1,661
8
0,208
2,764
0,0114
Odrůda × List
0,643
2
0,321
4,278
0,0183
Interakce 3. řádu
0,331
8
0,041
0,550
0,8137
Kmen × Odrůda × List
0,331
8
0,041
0,550
0,8137
Vysvětleno
85,654
29
2,954
39,323
0,0000
Chyba
4,507
60
0,075
Celkem
90,161
89
1,013
Závisle proměnná: četnost choroby Zdroj variability
Součet čtverců
St. vol.
Průměrný čtverec
Stat F
Významn.
Hlavní efekty
108914,444
7
15559,206
112,930
0,0000
Kmen
107671,111
4
26917,778
195,371
0,0000
Odrůda
134,444
1
134,444
0,976
0,3272
List
1108,889
2
554,444
4,024
0,0229
Interakce 2. řádu
6208,889
14
443,492
3,219
0,0008
Kmen × Odrůda
5337,778
4
1334,444
9,685
0,0000
Kmen × List
468,889
8
58,611
0,425
0,9013
Odrůda × List
402,222
2
201,111
1,460
0,2404
Interakce 3. řádu
575,556
8
71,944
0,522
0,8352
Kmen × Odrůda × List
575,556
8
71,944
0,522
0,8352
Vysvětleno
115698,889
29
3989,617
28,957
0,0000
Chyba
8266,667
60
137,778
Celkem
123965,556
89
1392,871
____________________________________________________________________________________ PŘÍLOHA
Tab. VII Vícefaktorová ANOVA pro Tab. 19 – síla choroby a četnost choroby – soubor B Závisle proměnná: síla choroby Zdroj variability
Součet čtverců
St. vol.
Průměrný čtverec
Stat F
Významn.
Hlavní efekty
89,654
8
11,207
102,137
0,0000
Odrůda
0,089
1
0,089
0,811
0,3708
Izolát
68,008
5
13,602
123,964
0,0000
List
21,556
2
10,778
98,231
0,0000
Interakce 2. řádu
8,578
17
0,505
4,599
0,0000
Odrůda × Izolát
1,059
5
0,212
1,931
0,0997
Odrůda × List
0,027
2
0,014
0,125
0,8828
Izolát × List
7,491
10
0,749
6,828
0,0000
Interakce 3. řádu
0,483
10
0,048
0,440
0,9219
Odrůda × Izolát × List
0,483
10
0,048
0,440
0,9219
Vysvětleno
98,714
35
2,820
25,705
0,0000
Chyba
7,900
72
0,110
Celkem
106,614
107
0,996
Závisle proměnná: četnost choroby Zdroj variability
Součet čtverců
St. vol.
Průměrný čtverec
Stat F
Významn.
Hlavní efekty
146020,370
8
18252,546
64,421
0,0000
Odrůda
300,000
1
300,000
1,059
0,3069
Izolát
137851,852
5
27570,370
97,307
0,0000
List
7868,519
2
3934,259
13,886
0,0000
Interakce 2. řádu
4981,481
17
293,028
1,034
0,4338
Odrůda × Izolát
2711,111
5
542,222
1,914
0,1026
Odrůda × List
105,556
2
52,778
0,186
0,8304
Izolát × List
2164,815
10
216,481
0,764
0,6624
Interakce 3. řádu
1750,000
10
175,000
0,618
0,7940
Odrůda × Izolát × List
1750,000
10
175,000
0,618
0,7940
Vysvětleno
152751,852
35
4364,339
15,404
0,0000
Chyba
20400,000
72
283,333
Celkem
173151,852
107
1618,242
Tab. VIII Vícefaktorová ANOVA pro Tab. 21 – síla choroby a četnost choroby – 1. časové opakování Závisle proměnná: síla choroby Zdroj variability
Součet čtverců
St. vol.
Průměrný čtverec
Stat F
Významn.
Hlavní efekty
32,231
12
2,686
25,580
0,0000
Odrůda
31,003
10
3,100
29,526
0,0000
List
1,228
2
0,614
5,848
0,0067
Interakce 2. řádu
1,782
20
0,089
0,848
0,6444
Odrůda × List
1,782
20
0,089
0,848
0,6444
Vysvětleno
34,013
32
1,063
10,123
0,0000
Chyba
3,465
33
0,105
Celkem
37,478
65
0,577
____________________________________________________________________________________ PŘÍLOHA
Pokračování Tab. VIII Závisle proměnná: četnost choroby Zdroj variability
Součet čtverců
St. vol.
Průměrný čtverec
Stat F
Významn.
Hlavní efekty
56775,758
12
4731,313
39,033
0,0000
Odrůda
56748,485
10
5674,848
46,817
0,0000
List
27,273
2
13,636
0,113
0,8939
Interakce 2. řádu
1006,061
20
50,303
0,415
0,9792
Odrůda × List
1006,061
20
50,303
0,415
0,9792
Vysvětleno
57781,818
32
1805,682
14,897
0,0000
Chyba
4000,000
33
121,212
Celkem
61781,818
65
950,490
Tab. IX Vícefaktorová ANOVA pro Tab. 21 – síla choroby a četnost choroby – 2. časové opakování Závisle proměnná: síla choroby Zdroj variability
Součet čtverců
St. vol.
Průměrný čtverec
Stat F
Významn.
Hlavní efekty
61,606
12
5,134
89,877
0,0000
Odrůda
57,293
10
5,729
100,301
0,0000
List
4,313
2
2,157
37,753
0,0000
Interakce 2. řádu
1,560
20
0,078
1,366
0,2085
Odrůda × List
1,560
20
0,078
1,366
0,2085
Vysvětleno
63,167
32
1,974
34,557
0,0000
Chyba
1,885
33
0,057
Celkem
65,052
65
1,001
Závisle proměnná: četnost choroby Zdroj variability
Součet čtverců
St. vol.
Průměrný čtverec
Stat F
Významn.
Hlavní efekty
62427,273
12
5202,273
24,525
0,0000
Odrůda
57978,788
10
5797,879
27,333
0,0000
List
4448,485
2
2224,242
10,486
0,0003
Interakce 2. řádu
3784,848
20
189,242
0,892
0,5978
Odrůda × List
3784,848
20
189,242
0,892
0,5978
Vysvětleno
66212,121
32
2069,129
9,754
0,0000
Chyba
7000,000
33
212,121
Celkem
73212,121
65
1126,340
____________________________________________________________________________________ PŘÍLOHA
Tab. X Jednofaktorová ANOVA pro Tab. 22 – 1. měření Závisle proměnná: A1:1 Zdroj variability
Součet čtverců
St. vol.
Průměrný čtverec
Stat F
Významn.
Hlavní efekty
1,916
5
0,383
15,329
0,0001
Izolát
1,916
5
0,383
15,329
0,0001
Vysvětleno
1,916
5
0,383
15,329
0,0001
Chyba
0,300
12
0,025
Celkem
2,216
17
0,130
Zdroj variability
Součet čtverců
St. vol.
Průměrný čtverec
Stat F
Významn.
Hlavní efekty
0,258
5
0,052
1,428
0,2832
Izolát
0,258
5
0,052
1,428
0,2832
Vysvětleno
0,258
5
0,052
1,428
0,2832
Chyba
0,433
12
0,036
Celkem
0,691
17
0,041
Zdroj variability
Součet čtverců
St. vol.
Průměrný čtverec
Stat F
Významn.
Hlavní efekty
0,411
5
0,082
1,096
0,4114
Izolát
0,411
5
0,082
1,096
0,4114
Vysvětleno
0,411
5
0,082
1,096
0,4114
Chyba
0,900
12
0,075
Celkem
1,311
17
0,077
Závisle proměnná: A1:5
Závisle proměnná: A1:10
Tab. XI Jednofaktorová ANOVA pro Tab. 22 – 2. měření Závisle proměnná: A1:1 Zdroj variability
Součet čtverců
St. vol.
Průměrný čtverec
Stat F
Významn.
Hlavní efekty
3,765
5
0,753
17,377
0,0000
Izolát
3,765
5
0,753
17,377
0,0000
Vysvětleno
3,765
5
0,753
17,377
0,0000
Chyba
0,520
12
0,043
Celkem
4,285
17
0,252
Zdroj variability
Součet čtverců
St. vol.
Průměrný čtverec
Stat F
Významn.
Hlavní efekty
2,616
5
0,523
941,800
0,0000
Izolát
2,616
5
0,523
941,800
0,0000
Vysvětleno
2,616
5
0,523
941,800
0,0000
Chyba
0,007
12
0,001
Celkem
2,623
17
0,154
Závisle proměnná: A1:5
____________________________________________________________________________________ PŘÍLOHA
Pokračování Tab. XI Závisle proměnná: A1:10 Zdroj variability
Součet čtverců
St. vol.
Průměrný čtverec
Stat F
Významn.
Hlavní efekty
1,640
5
0,328
3,936
0,0241
Izolát
1,640
5
0,328
3,936
0,0241
Vysvětleno
1,640
5
0,328
3,936
0,0241
Chyba
1,000
12
0,083
Celkem
2,640
17
0,155
Tab. XII Jednofaktorová ANOVA pro Tab. 23 – 1. měření Závisle proměnná: 1:1 Zdroj variability
Součet čtverců
St. vol.
Průměrný čtverec
Stat F
Významn.
Hlavní efekty
1,584
5
0,317
5,762
0,0061
Izolát
1,584
5
0,317
5,762
0,0061
Vysvětleno
1,584
5
0,317
5,762
0,0061
Chyba
0,660
12
0,055
Celkem
2,244
17
0,132
Zdroj variability
Součet čtverců
St. vol.
Průměrný čtverec
Stat F
Významn.
Hlavní efekty
1,676
5
0,335
4,827
0,0119
Izolát
1,676
5
0,335
4,827
0,0119
Vysvětleno
1,676
5
0,335
4,827
0,0119
Chyba
0,833
12
0,069
Celkem
2,509
17
0,148
Zdroj variability
Součet čtverců
St. vol.
Průměrný čtverec
Stat F
Významn.
Hlavní efekty
1,811
5
0,362
7,011
0,0028
Izolát
1,811
5
0,362
7,011
0,0028
Vysvětleno
1,811
5
0,362
7,011
0,0028
Chyba
0,620
12
0,052
Celkem
2,431
17
0,143
Závisle proměnná: 1:5
Závisle proměnná: 1:10
____________________________________________________________________________________ PŘÍLOHA
Tab. XIII Jednofaktorová ANOVA pro Tab. 23 – 2. měření Závisle proměnná: 1:1 Zdroj variability
Součet čtverců
St. vol.
Průměrný čtverec
Stat F
Významn.
Hlavní efekty
2,063
5
0,413
7,006
0,0028
Izolát
2,063
5
0,413
7,006
0,0028
Vysvětleno
2,063
5
0,413
7,006
0,0028
Chyba
0,707
12
0,059
Celkem
2,769
17
0,163
Zdroj variability
Součet čtverců
St. vol.
Průměrný čtverec
Stat F
Významn.
Hlavní efekty
2,338
5
0,468
7,320
0,0023
Izolát
2,338
5
0,468
7,320
0,0023
Vysvětleno
2,338
5
0,468
7,320
0,0023
Chyba
0,767
12
0,064
Celkem
3,105
17
0,183
Zdroj variability
Součet čtverců
St. vol.
Průměrný čtverec
Stat F
Významn.
Hlavní efekty
3,056
5
0,611
20,374
0,0000
Izolát
3,056
5
0,611
20,374
0,0000
Vysvětleno
3,056
5
0,611
20,374
0,0000
Chyba
0,360
12
0,030
Celkem
3,416
17
0,201
Závisle proměnná: 1:5
Závisle proměnná: 1:10
Tab. XIV Jednofaktorová ANOVA pro Tab. 24 – 1. měření Závisle proměnná: 1:1 Zdroj variability
Součet čtverců
St. vol.
Průměrný čtverec
Stat F
Významn.
Hlavní efekty
0,798
5
0,160
2,159
0,1275
Izolát
0,798
5
0,160
2,159
0,1275
Vysvětleno
0,798
5
0,160
2,159
0,1275
Chyba
0,887
12
0,074
Celkem
1,684
17
0,099
Zdroj variability
Součet čtverců
St. vol.
Průměrný čtverec
Stat F
Významn.
Hlavní efekty
0,200
5
0,040
2,400
0,0994
Izolát
0,200
5
0,040
2,400
0,0994
Vysvětleno
0,200
5
0,040
2,400
0,0994
Chyba
0,200
12
0,017
Celkem
0,400
17
0,024
Závisle proměnná: 1:5
____________________________________________________________________________________ PŘÍLOHA
Pokračování Tab. XIV Závisle proměnná: A1:10 Zdroj variability
Součet čtverců
St. vol.
Průměrný čtverec
Stat F
Významn.
Hlavní efekty
0,080
5
0,016
2,400
0,0994
Izolát
0,080
5
0,016
2,400
0,0994
Vysvětleno
0,080
5
0,016
2,400
0,0994
Chyba
0,080
12
0,007
Celkem
0,160
17
0,009
Tab. XV Jednofaktorová ANOVA pro Tab. 24 – 2. měření Závisle proměnná: A1:1 Zdroj variability
Součet čtverců
St. vol.
Průměrný čtverec
Stat F
Významn.
Hlavní efekty
0,411
5
0,082
2,552
0,0853
Izolát
0,411
5
0,082
2,552
0,0853
Vysvětleno
0,411
5
0,082
2,552
0,0853
Chyba
0,387
12
0,032
Celkem
0,798
17
0,047
Zdroj variability
Součet čtverců
St. vol.
Průměrný čtverec
Stat F
Významn.
Hlavní efekty
0,164
5
0,033
1,518
0,2559
Izolát
0,164
5
0,033
1,518
0,2559
Vysvětleno
0,164
5
0,033
1,518
0,2559
Chyba
0,260
12
0,022
Celkem
0,424
17
0,025
Zdroj variability
Součet čtverců
St. vol.
Průměrný čtverec
Stat F
Významn.
Hlavní efekty
0,067
5
0,013
1,200
0,3660
Izolát
0,067
5
0,013
1,200
0,3660
Vysvětleno
0,067
5
0,013
1,200
0,3660
Chyba
0,133
12
0,011
Celkem
0,200
17
0,012
Závisle proměnná: A1:5
Závisle proměnná: A1:10
____________________________________________________________________________________ PŘÍLOHA
Tab. XVI Jednofaktorová ANOVA pro Tab. 25 – 1. měření Závisle proměnná: A1:1 Zdroj variability
Součet čtverců
St. vol.
Průměrný čtverec
Stat F
Významn.
Hlavní efekty
1,367
5
0,273
9,283
0,0008
Izolát
1,367
5
0,273
9,283
0,0008
Vysvětleno
1,367
5
0,273
9,283
0,0008
Chyba
0,353
12
0,029
Celkem
1,720
17
0,101
Zdroj variability
Součet čtverců
St. vol.
Průměrný čtverec
Stat F
Významn.
Hlavní efekty
0,451
5
0,090
2,578
0,0831
Izolát
0,451
5
0,090
2,578
0,0831
Vysvětleno
0,451
5
0,090
2,578
0,0831
Chyba
0,420
12
0,035
Celkem
0,871
17
0,051
Zdroj variability
Součet čtverců
St. vol.
Průměrný čtverec
Stat F
Významn.
Hlavní efekty
0,512
5
0,102
4,847
0,0117
Izolát
0,512
5
0,102
4,847
0,0117
Vysvětleno
0,512
5
0,102
4,847
0,0117
Chyba
0,253
12
0,021
Celkem
0,765
17
0,045
Závisle proměnná: A1:5
Závisle proměnná: A1:10
Tab. XVII Jednofaktorová ANOVA pro Tab. 25 – 2. měření Závisle proměnná: A1:1 Zdroj variability
Součet čtverců
St. vol.
Průměrný čtverec
Stat F
Významn.
Hlavní efekty
1,591
5
0,318
11,933
0,0003
Izolát
1,591
5
0,318
11,933
0,0003
Vysvětleno
1,591
5
0,318
11,933
0,0003
Chyba
0,320
12
0,027
Celkem
1,911
17
0,112
Zdroj variability
Součet čtverců
St. vol.
Průměrný čtverec
Stat F
Významn.
Hlavní efekty
0,496
5
0,099
4,700
0,0131
Izolát
0,496
5
0,099
4,700
0,0131
Vysvětleno
0,496
5
0,099
4,700
0,0131
Chyba
0,253
12
0,021
Celkem
0,749
17
0,044
Závisle proměnná: A1:5
____________________________________________________________________________________ PŘÍLOHA
Pokračování Tab. XVII Závisle proměnná: A1:10 Zdroj variability
Součet čtverců
St. vol.
Průměrný čtverec
Stat F
Významn.
Hlavní efekty
0,663
5
0,133
4,869
0,0115
Izolát
0,663
5
0,133
4,869
0,0115
Vysvětleno
0,663
5
0,133
4,869
0,0115
Chyba
0,327
12
0,027
Celkem
0,989
17
0,058
Tab. XVIII Jednofaktorová ANOVA pro Tab. 26 – 1. měření Závisle proměnná: A1:1 Zdroj variability
Součet čtverců
St. vol.
Průměrný čtverec
Stat F
Významn.
Hlavní efekty
8,314
5
1,663
8,413
0,0013
Izolát
8,314
5
1,663
8,413
0,0013
Vysvětleno
8,314
5
1,663
8,413
0,0013
Chyba
2,372
12
0,198
Celkem
10,686
17
0,629
Zdroj variability
Součet čtverců
St. vol.
Průměrný čtverec
Stat F
Významn.
Hlavní efekty
3,184
5
0,637
4,513
0,0151
Izolát
3,184
5
0,637
4,513
0,0151
Vysvětleno
3,184
5
0,637
4,513
0,0151
Chyba
1,693
12
0,141
Celkem
4,878
17
0,287
Zdroj variability
Součet čtverců
St. vol.
Průměrný čtverec
Stat F
Významn.
Hlavní efekty
5,146
5
1,029
5,705
0,0064
Izolát
5,146
5
1,029
5,705
0,0064
Vysvětleno
5,146
5
1,029
5,705
0,0064
Chyba
2,165
12
0,180
Celkem
7,311
17
0,430
Závisle proměnná: A1:5
Závisle proměnná: A1:10
____________________________________________________________________________________ PŘÍLOHA
Tab. XIX Jednofaktorová ANOVA pro Tab. 26 – 2. měření Závisle proměnná: A1:1 Zdroj variability
Součet čtverců
St. vol.
Průměrný čtverec
Stat F
Významn.
Hlavní efekty
10,945
5
2,189
25,258
0,0000
Izolát
10,945
5
2,189
25,258
0,0000
Vysvětleno
10,945
5
2,189
25,258
0,0000
Chyba
1,040
12
0,087
Celkem
11,985
17
0,705
Zdroj variability
Součet čtverců
St. vol.
Průměrný čtverec
Stat F
Významn.
Hlavní efekty
3,036
5
0,607
13,329
0,0001
Izolát
3,036
5
0,607
13,329
0,0001
Vysvětleno
3,036
5
0,607
13,329
0,0001
Chyba
0,547
12
0,046
Celkem
3,583
17
0,211
Zdroj variability
Součet čtverců
St. vol.
Průměrný čtverec
Stat F
Významn.
Hlavní efekty
4,431
5
0,886
10,706
0,0004
Izolát
4,431
5
0,886
10,706
0,0004
Vysvětleno
4,431
5
0,886
10,706
0,0004
Chyba
0,993
12
0,083
Celkem
5,424
17
0,319
Závisle proměnná: A1:5
Závisle proměnná: A1:10
Tab. XX Jednofaktorová ANOVA pro Tab. 27 – 1. měření Závisle proměnná: A1:1 Zdroj variability
Součet čtverců
St. vol.
Průměrný čtverec
Stat F
Významn.
Hlavní efekty
10,003
5
2,001
13,047
0,0002
Izolát
10,003
5
2,001
13,047
0,0002
Vysvětleno
10,003
5
2,001
13,047
0,0002
Chyba
1,840
12
0,153
Celkem
11,843
17
0,697
Zdroj variability
Součet čtverců
St. vol.
Průměrný čtverec
Stat F
Významn.
Hlavní efekty
1,564
5
0,313
2,695
0,0740
Izolát
1,564
5
0,313
2,695
0,0740
Vysvětleno
1,564
5
0,313
2,695
0,0740
Chyba
1,393
12
0,116
Celkem
2,958
17
0,174
Závisle proměnná: A1:5
____________________________________________________________________________________ PŘÍLOHA
Pokračování Tab. XX Závisle proměnná: A1:10 Zdroj variability
Součet čtverců
St. vol.
Průměrný čtverec
Stat F
Významn.
Hlavní efekty
1,640
5
0,328
3,644
0,0308
Izolát
1,640
5
0,328
3,644
0,0308
Vysvětleno
1,640
5
0,328
3,644
0,0308
Chyba
1,080
12
0,090
Celkem
2,720
17
0,160
Tab. XXI Jednofaktorová ANOVA pro Tab. 27 – 2. měření Závisle proměnná: A1:1 Zdroj variability
Součet čtverců
St. vol.
Průměrný čtverec
Stat F
Významn.
Hlavní efekty
9,523
5
1,905
21,293
0,0000
Izolát
9,523
5
1,905
21,293
0,0000
Vysvětleno
9,523
5
1,905
21,293
0,0000
Chyba
1,073
12
0,089
Celkem
10,596
17
0,623
Zdroj variability
Součet čtverců
St. vol.
Průměrný čtverec
Stat F
Významn.
Hlavní efekty
1,289
5
0,258
3,388
0,0386
Izolát
1,289
5
0,258
3,388
0,0386
Vysvětleno
1,289
5
0,258
3,388
0,0386
Chyba
0,913
12
0,076
Celkem
2,203
17
0,130
Zdroj variability
Součet čtverců
St. vol.
Průměrný čtverec
Stat F
Významn.
Hlavní efekty
3,051
5
0,610
17,163
0,0000
Izolát
3,051
5
0,610
17,163
0,0000
Vysvětleno
3,051
5
0,610
17,163
0,0000
Chyba
0,427
12
0,036
Celkem
3,478
17
0,205
Závisle proměnná: A1:5
Závisle proměnná: A1:10
____________________________________________________________________________________ PŘÍLOHA
Tab. XXII Jednofaktorová ANOVA pro Tab. 28 – 1. měření Závisle proměnná: A1:1 Zdroj variability
Součet čtverců
St. vol.
Průměrný čtverec
Stat F
Významn.
Hlavní efekty
8,905
5
1,781
8,157
0,0015
Izolát
8,905
5
1,781
8,157
0,0015
Vysvětleno
8,905
5
1,781
8,157
0,0015
Chyba
2,620
12
0,218
Celkem
11,525
17
0,678
Zdroj variability
Součet čtverců
St. vol.
Průměrný čtverec
Stat F
Významn.
Hlavní efekty
6,069
5
1,214
9,583
0,0007
Izolát
6,069
5
1,214
9,583
0,0007
Vysvětleno
6,069
5
1,214
9,583
0,0007
Chyba
1,520
12
0,127
Celkem
7,589
17
0,446
Zdroj variability
Součet čtverců
St. vol.
Průměrný čtverec
Stat F
Významn.
Hlavní efekty
6,812
5
1,362
11,904
0,0003
Izolát
6,812
5
1,362
11,904
0,0003
Vysvětleno
6,812
5
1,362
11,904
0,0003
Chyba
1,373
12
0,114
Celkem
8,185
17
0,481
Závisle proměnná: A1:5
Závisle proměnná: A1:10
Tab. XXIII Jednofaktorová ANOVA pro Tab. 28 – 2. měření Závisle proměnná: A1:1 Zdroj variability
Součet čtverců
St. vol.
Průměrný čtverec
Stat F
Významn.
Hlavní efekty
10,171
5
2,034
17,436
0,0000
Izolát
10,171
5
2,034
17,436
0,0000
Vysvětleno
10,171
5
2,034
17,436
0,0000
Chyba
1,400
12
0,117
Celkem
11,571
17
0,681
Zdroj variability
Součet čtverců
St. vol.
Průměrný čtverec
Stat F
Významn.
Hlavní efekty
3,756
5
0,751
8,451
0,0013
Izolát
3,756
5
0,751
8,451
0,0013
Vysvětleno
3,756
5
0,751
8,451
0,0013
Chyba
1,067
12
0,089
Celkem
4,823
17
0,284
Závisle proměnná: A1:5
____________________________________________________________________________________ PŘÍLOHA
Pokračování Tab. XXIII Závisle proměnná: A1:10 Zdroj variability
Součet čtverců
St. vol.
Průměrný čtverec
Stat F
Významn.
Hlavní efekty
2,092
5
0,418
10,606
0,0004
Izolát
2,092
5
0,418
10,606
0,0004
Vysvětleno
2,092
5
0,418
10,606
0,0004
Chyba
0,473
12
0,039
Celkem
2,565
17
0,151
Tab. XXIV Jednofaktorová ANOVA pro Tab. 29 – 1. měření Závisle proměnná: A1:1 Zdroj variability
Součet čtverců
St. vol.
Průměrný čtverec
Stat F
Významn.
Hlavní efekty
53,227
5
10,645
36,103
0,0000
Fungicid
53,227
5
10,645
36,103
0,0000
Vysvětleno
53,227
5
10,645
36,103
0,0000
Chyba
30,076
102
0,295
Celkem
83,302
107
0,779
Zdroj variability
Součet čtverců
St. vol.
Průměrný čtverec
Stat F
Významn.
Hlavní efekty
39,394
5
7,879
47,443
0,0000
Fungicid
39,394
5
7,879
47,443
0,0000
Vysvětleno
39,394
5
7,879
47,443
0,0000
Chyba
16,939
102
0,166
Celkem
56,333
107
0,526
Zdroj variability
Součet čtverců
St. vol.
Průměrný čtverec
Stat F
Významn.
Hlavní efekty
27,230
5
5,446
27,549
0,0000
Fungicid
27,230
5
5,446
27,549
0,0000
Vysvětleno
27,230
5
5,446
27,549
0,0000
Chyba
20,163
102
0,198
Celkem
47,393
107
0,443
Závisle proměnná: A1:5
Závisle proměnná: A1:10
____________________________________________________________________________________ PŘÍLOHA
Tab. XXV Jednofaktorová ANOVA pro Tab. 29 – 2. měření Závisle proměnná: A1:1 Zdroj variability
Součet čtverců
St. vol.
Průměrný čtverec
Stat F
Významn.
Hlavní efekty
41,396
5
8,279
25,345
0,0000
Fungicid
41,396
5
8,279
25,345
0,0000
Vysvětleno
41,396
5
8,279
25,345
0,0000
Chyba
33,319
102
0,327
Celkem
74,715
107
0,698
Zdroj variability
Součet čtverců
St. vol.
Průměrný čtverec
Stat F
Významn.
Hlavní efekty
26,423
5
5,285
35,214
0,0000
Fungicid
26,423
5
5,285
35,214
0,0000
Vysvětleno
26,423
5
5,285
35,214
0,0000
Chyba
15,307
102
0,150
Celkem
41,730
107
0,390
Zdroj variability
Součet čtverců
St. vol.
Průměrný čtverec
Stat F
Významn.
Hlavní efekty
22,022
5
4,404
29,487
0,0000
Fungicid
22,022
5
4,404
29,487
0,0000
Vysvětleno
22,022
5
4,404
29,487
0,0000
Chyba
15,235
102
0,149
Celkem
37,257
107
0,348
Závisle proměnná: A1:5
Závisle proměnná: A1:10
____________________________________________________________________________________ PŘÍLOHA
Tab. XXVI Jednofaktorová ANOVA pro Tab. 30 azoxystrobin
Varianta Opakování Residuum
dF
SS
MS
F
5 2 10
289,110 13,784 132,695
57,822 6,892 13,269
4,358 0,519
5 2 10
117,078 0,796 3,978
23,416 0,398 0,398
58,869 1,000
5 2 10
323,651 18,978 146,250
64,730 9,489 14,625
4,426 0,649
5 2 10
42,711 4,653 23,264
8,542 2,326 2,326
3,672 1,000
5 2 10
8,270 4,955 27,907
1,654 2,478 2,791
0,593 0,888
5 2 10
3476,580 19,810 394,682
695,316 9,905 39,468
17,617 0,251
5 2 10
481,320 48,779 139,161
96,264 24,390 13,916
6,917 1,753
captan Varianta Opakování Residuum
dithianon Varianta Opakování Residuum
folpet Varianta Opakování Residuum
mancozeb Varianta Opakování Residuum
metiram Varianta Opakování Residuum
thiram Varianta Opakování Residuum
Transformace: y' = arcsin√y/100
____________________________________________________________________________________ PŘÍLOHA
Obr. I Determinované patogeny na světlici barvířské
Alternaria spp. – symptomy na listech
Alternaria spp. – konidie
Botrytis cinerea – mycelium na květním lůžku
Colletotrichum acutatum – symptomy na rostlině
Colletotrichum acutatum – symptomy na rostlině
____________________________________________________________________________________ PŘÍLOHA
Pokračování Obr. I
Colletotrichum acutatum – symptomy na rostlině
Colletotrichum acutatum – skvrny na listu
Puccinia carthami
Colletotrichum acutatum – oranžové masy spor na stonku
Puccinia carthami
Puccinia carthami – teleutospory
____________________________________________________________________________________ PŘÍLOHA
Pokračování Obr. I
Ramularia carthamicola – symptomy na rostlině
Ramularia carthamicola – skvrny na listu a povlak mycelia
Ramularia carthamicola – konidie
Ramularia carthamicola – konidie
____________________________________________________________________________________ PŘÍLOHA
Obr. II Kolonie izolátů Colletotrichum acutatum po 10 dnech kultivace Averzní strana kolonie
Reverzní strana kolonie
Izolát 1109
Izolát 1109
Izolát 1209
Izolát 1209
Izolát CBS 786.86
Izolát CBS 786.86
____________________________________________________________________________________ PŘÍLOHA
Pokračování Obr. II Averzní strana kolonie
Izolát 710
Reverzní strana kolonie
Izolát 710
Izolát PCF 437
Izolát PCF 437
Izolát PCF 231
Izolát PCF 231
____________________________________________________________________________________ PŘÍLOHA
Obr. III Konidie izolátů Colletotrichum acutatum
Izolát 1109
Izolát 1209
Izolát CBS 786.86
Izolát 710
Izolát PCF 437
Izolát PCF 231
Izolát J1
Izolát R1
____________________________________________________________________________________ PŘÍLOHA
Obr. IV Vizualizace PCR produktů izolátů rodu Colletotrichum – velikost produktu 490 bp pro C. acutatum, oblast ITS1, ITS2 a gen 5.8S rRNA Vysvětlivky: 1 – 1209 2 – 1109 3 – 710 4 – PCF 231
1
2
3
4 Vysvětlivky: 5 – CCM 117* 6 – PCF 437 (špatná viditelnost proužku) 7 – CBS 786.86 8 – CCM 177* 9 – 608
5
6
7
8
9 Vysvětlivky: 10 – J1 11 – R1
10
11
* izolát C. gloeosporioides
____________________________________________________________________________________ PŘÍLOHA
Obr. V Vizualizace PCR produktů izolátů Colletotrichum acutatum – velikost produktu 200 bp, oblast intron 2 G3PD (glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase) genu Vysvětlivky: 1 – 1209 2 – 1109 3 – 710
1
2
3
Obr. VI Uměle infikované plody jahodníku velkoplodého Colletotrichum acutatum po 4 dnech od inokulace
Odrůda ´Pegasus´ – č. 1; odrůda ´Elkas´ – č. 2, izolát PCF 437
____________________________________________________________________________________ PŘÍLOHA
Pokračování Obr. VI
Odrůda ´Pegasus´ – izolát PCF 231
Odrůda ´Pegasus´ – izolát 710
Odrůda ´Elkas´ – izolát CBS 292.67
Odrůda ´Elkas´ – izolát 710
Obr. VII Uměle infikované plody papriky roční Colletotrichum acutatum po 11 dnech od inokulace
Odrůda ´Pirouet´ – izolát 710
Odrůda ´Pirouet´ – izolát PCF 231
____________________________________________________________________________________ PŘÍLOHA
Pokračování Obr. VII
Odrůda ´Cynthia´ – izolát 710
Odrůda ´Cynthia´ – izolát CBS 292.67
Obr. VIII Uměle infikované rostliny světlice barvířské Colletotrichum acutatum po 5 dnech od inokulace
Odrůda ´Sabina´ – izolát 710
Odrůda ´India´ – izolát 710
Odrůda ´Sabina´ – izolát 1209
Odrůda ´India´ – izolát 1209
____________________________________________________________________________________ PŘÍLOHA
Obr. IX Nejvíce a nejméně citlivý izolát u jednotlivých účinných látek fungicidních přípravků Nejvíce citlivý izolát
1:1
Nejméně citlivý izolát
1:5
1: 10
ú. l. azoxystrobin – izolát PCF 231
ú. l. azoxystrobin – izolát 1209
ú. l. captan – izolát 1209
ú. l. captan – CBS 786.86
ú. l. dithianon – izolát 710
ú. l. dithianon – CBS 786.86
____________________________________________________________________________________ PŘÍLOHA
Pokračování Obr. IX Nejcitlivější izolát
Nejméně citlivý izolát
ú. l. folpet – izolát PCF 437
1:1
1:5
ú. l. folpet – izolát 710
1:10
ú. l. mancozeb – PCF 437
ú. l. mancozeb – izolát 1209
ú. l. metiram – izolát PCF 231
ú. l. metiram – izolát 1109
____________________________________________________________________________________ PŘÍLOHA
Pokračování Obr. IX Nejcitlivější izolát
ú. l. thiram – izolát PCF 231
Nejméně citlivý izolát
ú. l. thiram – izolát 1209
