Příloha č.5 Seznam PCR vyšetření

Příloha č. 5 Laboratorní příručka Laboratoří MeDiLa, v05 - Seznam PCR vyšetření

Příloha č.5 Seznam PCR vyšetření Obsah Virus hepatitidy B - kvalitativní průkaz ..................................................................................................... 2 Virus hepatitidy B - kvantita ..................................................................................................................... 2 Virus hepatitidy C – kvalitativní průkaz.................................................................................................... 3 Virus hepatitidy C - kvantita ..................................................................................................................... 3 Virus hepatitidy C - genotypizace ............................................................................................................ 4 Virus herpes simplex typ 1 a 2 (HSV 1, HSV2) ....................................................................................... 4 Cytomegalovirus (CMV) .......................................................................................................................... 5 Epstein-Barr virus (EBV) ......................................................................................................................... 5 Varicella-zoster virus (VZV) ..................................................................................................................... 6 Enteroviry................................................................................................................................................. 6 Lidské papillomaviry nízkého a vysokého rizika (HPV HR/LR) ............................................................... 7 Chlamydia trachomatis ............................................................................................................................ 8 Chlamydia pneumoniae ........................................................................................................................... 9 Borrelia burgdorferi sensu lato ................................................................................................................ 9 Mycoplasma pneumoniae...................................................................................................................... 10 Mycobacterium tuberculosis komplex (M. tuberculosis a M. bovis) ...................................................... 10

Stránka 1 z 10


SEZNAM MOLEKULÁRNĚ BIOLOGICKÝCH VYŠETŘENÍ - PCR Virus hepatitidy B - kvalitativní průkaz kvalitativní průkaz DNA viru hepatitidy B v séru nebo plazmě Zkumavka/odběrovka: Vacutainer® K2E (ref 368841), Vacutainer® SST™ II Advance (ref 367957) Uchovávání:

Plná krev: 2 – 8 °C (do 4 h po odběru) Plasma, sérum: v mrazáku při teplotě nižší než -20 °C

Transport:

Plná krev: 2 – 8°C (do 4 h po odběru) Plasma, sérum: zamražené při teplotě nižší než -20 °C

Potřebné množství vzorku pro vyšetření: Poznámka: rpm)

Plná krev: 2 ml (tzn. cca 1 ml plasmy či séra)

Plasmu (sérum) je nutné do 4 hodin po odběru separovat centrifugací (10 minut/3500

Doba odezvy: 7 dní

Virus hepatitidy B - kvantita kvantitativní stanovení DNA viru hepatitidy B v séru nebo plazmě, výsledek udáván jako počet kopií DNA HBV v 1 ml vzorku Zkumavka/odběrovka: Vacutainer® K2E (ref 368841), Vacutainer® SST™ II Advance (ref 367957) Uchovávání:


Transport:





Stránka 2 z 10

Příloha č. 5 Laboratorní příručka Laboratoří MeDiLa, v05 - Seznam PCR vyšetření Virus hepatitidy C – kvalitativní průkaz kvalitativní průkaz RNA viru hepatitidy C v plazmě Zkumavka/odběrovka: Vacutainer® K2E (ref 368841), Vacutainer® SST™ II Advance (ref 367957) Uchovávání:


Transport:





Doba odezvy: 7-14 dní

Virus hepatitidy C - kvantita kvantitativní stanovení RNA viru hepatitidy C v plazmě nebo séru, výsledek udáván v IU/ml Zkumavka/odběrovka: Vacutainer® K2E (ref 368841), Vacutainer® SST™ II Advance (ref 367957) Uchovávání:


Transport:





Doba odezvy: 7-14 dní

Stránka 3 z 10


Virus hepatitidy C - genotypizace určení genotypu viru hepatitidy C (1a, 1b, 2, 3a) pro výběr terapie Zkumavka/odběrovka: Vacutainer® K2E (ref 368841), Vacutainer® SST™ II Advance (ref 367957) Uchovávání:


Transport:



Plná krev: 1 ml (tzn. cca 0,5 ml plasmy či séra)


Doba odezvy: do 1 měsíce

Virus herpes simplex typ 1 a 2 (HSV 1, HSV2) kvalitativní detekce DNA HSV 1, 2 v mozkomíšním moku, výtěrech z ústní dutiny, kožních stěrech a plazmě Zkumavka/odběrovka: Stěry: sterilní tampón (syntetický na plastové tyčince), vymáchat ve zkumavce s 0,5 ml fyziologickým roztokem Mozkomíšní mok: polypropylenová sterilní zkumavka bez úpravy Plná krev: Vacutainer® K2E (ref 368841) Uchovávání:

2 – 8 °C

Transport:

2 – 8 °C

Potřebné množství vzorku pro vyšetření:

Mozkomíšní mok: 0,5 ml Plná krev: 2 ml (tzn. cca 1 ml plasmy)

Poznámka: Plasmu je nutné do 4 hodin po odběru separovat centrifugací (10 minut/3500 rpm) Doba odezvy: 7 dní

Stránka 4 z 10


Cytomegalovirus (CMV) kvalitativní detekce DNA CMV v mozkomíšním moku, plazmě, moči a výtěru z krku Zkumavka/odběrovka: Výtěry: sterilní tampón (syntetický na plastové tyčince), vymáchat ve zkumavce s 0,5 ml fyziologickým roztokem Moč, mozkomíšní mok: polypropylenová sterilní zkumavka bez úpravy Plná krev: Vacutainer® K2E (ref 368841) Uchovávání:

2 – 8°C

Transport:

2 – 8°C


Mozkomíšní mok: 0,5 ml Plná krev: 2 ml (tzn. cca 1 ml plasmy)


Epstein-Barr virus (EBV) kvalitativní detekce DNA EBV v mozkomíšním moku, plné krvi a výtěru z krku Zkumavka/odběrovka: Výtěry: sterilní tampón (syntetický na plastové tyčince), vymáchat ve zkumavce s 0,5 ml fyziologickým roztokem Mozkomíšní mok: polypropylenová sterilní zkumavka bez úpravy Plná krev: Vacutainer® K2E (ref 368841) Uchovávání:

2 – 8°C

Transport:

2 – 8°C


Mozkomíšní mok: minimálně 0,5 ml Plná krev: 2 ml

Poznámka: Doba odezvy: 7 dní

Stránka 5 z 10


Varicella-zoster virus (VZV) kvalitativní detekce DNA varicella-zoster viru v mozkomíšním moku, ve stěrech z puchýřků a plazmě Zkumavka/odběrovka: Stěry: sterilní tampón (syntetický na plastové tyčince), vymáchat ve zkumavce s 0,5 ml fyziologickým roztokem Mozkomíšní mok: polypropylenová sterilní zkumavka bez úpravy Plná krev: Vacutainer® K2E (ref 368841) Uchovávání:

2 – 8°C

Transport:

2 – 8°C


Mozkomíšní mok: minimálně 0,5 ml Plná krev: 2 ml (tzn. cca 1 ml plasmy)


Enteroviry kvalitativní detekce RNA enterovirů v plazmě a mozkomíšním moku a výtěrech z krku Zkumavka/odběrovka: výtěry: sterilní tampón (syntetický na plastové tyčince), vymáchat ve zkumavce s 0,5 ml fyziologickým roztokem Mozkomíšní mok: polypropylenová sterilní zkumavka bez úpravy Plná krev: Vacutainer® K2E (ref 368841) Uchovávání:

Plná krev: 2 – 8 °C (do 24 h po odběru) Plasma: v mrazáku při teplotě nižší než -20 °C

Transport:

Plná krev: 2 – 8°C Plasma: zamražené při teplotě nižší než -20 °C


Mozkomíšní mok: minimálně 0,5 ml Plná krev: 2 ml (tzn. cca 1 ml plasmy)


Stránka 6 z 10

Příloha č. 5 Laboratorní příručka Laboratoří MeDiLa, v05 - Seznam PCR vyšetření Lidské papillomaviry nízkého a vysokého rizika (HPV HR/LR) kvalitativní detekce DNA HPV high risk (HR) a low risk (LR) kmenů v cervikálních stěrech a bioptátech, detekce celkem 18-ti kmenů HPV s vysokým a nízkým rizikem pro vznik karcinomu cervixu Zkumavka/odběrovka: digene HC2 DNA Collection Device (Cat. No. 619204) Uchovávání:

Stěr cervix: dva týdny při pokojové teplotě, příp. 2-8 °C Biopsie: do transportního média STM (součástí odběrové soupravy) - zamrazit při -20°C

Transport:

Stěr cervix: pokojová teplota, příp. 2-8 °C Biopsie: zamražené při teplotě nižší než -20 °C


-

Poznámka: Odběrovou soupravu dodává laboratoř lékařům na požádání. Doba odezvy: Do 1 měsíce

Stránka 7 z 10


Chlamydia trachomatis kvalitativní detekce DNA C. trachomatis v cervikálních stěrech, výtěrech z uretry, moči, stěrech z oční spojivky, punktátu z dutiny břišní Zkumavka/odběrovka: moč, punktát: do sterilní polypropylenové zkumavky bez konzervačních látek Stěr cervixu, uretry či spojivkového vaku: MicroTestTM M4RT® (remel) (cat. No. 04863593, 04863607) Uchovávání: Moč: do 24 h od odběru pokojová teplota, poté 2-8 °C Punktát: 2-8 °C Stěr cervixu, uretry či spojivkového vaku: 14 dní při pokojové teplotě, příp. 2-8 °C Transport:

Moč: do 24 h od odběru pokojová teplota, příp. 2-8 °C Punktát: 2-8 °C Stěr cervixu, uretry či spojivkového vaku: pokojová teplota, příp. 2-8 °C


Moč: 5 až 10 ml Punktát: 0,5 až 2 ml

Poznámka:

Moč: Vzhledem k povaze bakterie nutné odebrat první proud ranní moče – pacient by před odběrem neměl 3 hodiny močit. Stěr cervixu, uretry či spojivkového vaku: Provést stěr, tampón zalomit a nechat v mediu - zkumavku uzavřít.

Odběrové soupravy MicroTestTM M4RT® (remel) dodá laboratoř lékařům na požádání. Doba odezvy: 7 dní

Stránka 8 z 10


Chlamydia pneumoniae kvalitativní detekce DNA C. pneumoniae v plicním aspirátu, BAL, sputu, ve stěrech z oční spojivky a nasopharyngu, v kloubním punktátu Zkumavka/odběrovka: Sputum, plicní aspirát, BAL, punktát: sterilní zkumavka nebo sputovka Výtěry: sterilní tampón (na drátě), vymáchat ve zkumavce s 0,5 ml fyziologickým roztokem Uchovávání:

2-8 °C

Transport:

2-8 °C


Sputum: 10 až 30 ml Plicní aspirát, BAL: 5-10 ml Punktát: 0,5 až 2 ml

Poznámka:

Výtěr z nasopharyngu a spojivkového vaku je nutné provést razantně – zabezpečit tak

získání dostatečného množství buněk pro analýzu. Doba odezvy: 7 dní

Borrelia burgdorferi sensu lato kvalitativní detekce DNA B. burgdorferi s. l. v mozkomíšním moku, kloubním punktátu, kožním bioptátu, moči, krvi i klíštěti Zkumavka/odběrovka: Mozkomíšní mok, punktát,kožní bioptát, moč: sterilní zkumavka Plná krev: Vacutainer® K2E (ref 368841) Klíště: Sterilní zkumavka, jiná uzavřená nádoba Uchovávání:

2-8 °C, klíště i při pokojové teplotě

Transport:

2-8 °C, klíště i při pokojové teplotě


Mozkomíšní mok, kloubní punktát: 0,5 – 2 ml Plná krev: 2 ml Moč: 5-10 ml Kožní bioptát: terčík do průměru max 4 mm

Poznámka:

V krvi nízká pravděpodobnost záchytu. V primárním akutním stádiu onemocnění lze borelie prokázat v kožních bioptátech. Ve fázi hematogenního rozsevu (druhém stádiu) mohou být přítomny po krátkou dobu v periferní krvi vyšetření by mělo být požadováno pouze v případě teplot a akutní fáze onemocnění, v pozdním stádiu onemocnění v mozkomíšním moku (neuroborelióza) a kloubním punktátu. Doba odezvy: 7 dní

Stránka 9 z 10


Mycoplasma pneumoniae kvalitativní detekce DNA M. pneumoniae ve sputu, bronchiálním výplachu, aspirátu, BAL, hrudním punktátu Zkumavka/odběrovka: Sputum, bronchiální výplach, BAL, punktát: sterilní zkumavka nebo sputovka Výtěr: sterilní tampón (na drátě), vymáchat ve zkumavce s 0,5 ml fyziologickým roztokem Uchovávání:

2-8 °C

Transport:

2-8 °C


Sputum: 10 – 30 ml Bronchiální výplach, BAL, aspirát: 5 – 10 ml Punktát: 1- 2 ml

Poznámka: Výtěr z nasopharyngu je nutné provést razantně – zabezpečit tak získání dostatečného množství buněk pro analýzu. Doba odezvy: 7 dní

Mycobacterium tuberculosis komplex (M. tuberculosis a M. bovis) kvalitativní detekce DNA M. tuberculosis komplex ve sputu, BAL, punktátech, likvoru, biopsiích, moči

Zkumavka/odběrovka: Mozkomíšní mok, punktát, bioptát, moč, bronchiální výplach, BAL, punktát: sterilní zkumavka nebo sputovka Uchovávání:

2-8 °C

Transport:

2-8 °C


Sputum: 10 – 30 ml Bronchiální výplach, BAL, aspirát: 5 – 10 ml Mozkomíšní mok, punktát: 0,5 – 2 ml Moč: 5 – 10 ml Bioptát: terčík do průměru max 4 mm

Poznámka: Doba odezvy: 7 dní

Stránka 10 z 10

Příloha č.5 Seznam PCR vyšetření

Recommend Documents