Extracelulární enzymy ve vodě a mikrobiální rozklad polymerů p y Jaroslav Vrba • EKOTECH (CZ.1.07/2.3.00/09.0200 – BC AVČR Č. Budějovice)
molekuly polymerů nemohou být do buněk přenášeny membránovým transportem (ale mohou být pohlceny do vakuol! - fagocytoza) živé mikroorganismy g y vylučují y j na buněčný ýp povrch aktivní enzymy (hydrolázy), jež hydrolyzují polymery na jednotlivé monomery, které mohou být transportovány přes buněčnou membránu fagocytující i holozoické mikroorganismy vylučují hydrolázy do trávicích vakuol, kde probíhá hydrolýza polymerů u mnohobuněčných organismů plní analogickou funkci trávicí enzymy, vylučované do trávicího traktu
intracelulární enzymy
ektoenzymy
extracelulární
(exoenzymy)
extracelulární enzymy (volné, rozpuštěné)
trávicí enzymy volně rozpuštěné svlékací enzymy volně rozpuštěné
intracelulární enzymy
extracelulární
ektoenzymy
extracelulární enzymy (volné, rozpuštěné)
trávicí enzymy volně rozpuštěné svlékací enzymy volně rozpuštěné
EXTRACELULÁRNÍ ENZYMY VE VODNÍCH EKOSYSTÉMECH aktivita extracelulárního enzymu bývá vázána na částice sestonu = ektoenzymy bakterií nebo řas kromě primárně extracelulárních enzymů jsou do vody uvolňovány vnitrobuněčné enzymy při lyzi buněk, resp. somatické enzymy mnohobuněčných organismů (svlékání čl členovců, ů poranění ě í apod.) d) aktivita rozpuštěného (volného) enzymu bývá nízká (může být druhotně adsorbován na částice!) extracelulární enzymy mají někdy překvapivě dlouhou životnost, jsou různě chráněny před působením volných proteáz t á
endoenzymy
HYDROLÁZY polymery
oligomery
exoenzymy y y
monomery
umělé fluorogenní substráty
O
O
O
CH2OH O OH OH β-D-glukosidáza
CH3
O
O
OH
umělý (nefluorescenční) substrát 4-methylumbelliferyl 4 methylumbelliferyl β-D-glukosid β D glukosid 4-methylumbelliferyl fosfát
O
O
O — PO4
CH3 4-methylubelliferon y
fosfatáza CH3
(fosfomonoesteráza)
Princip funkce a regulace ektoenzymů (Ch ó t 1991) (Chróst
HMW ~ >1000 Da
LMW ~ <700 Da
Princip funkce EEA v planktonu (H (Hoppe 1991)
DEA (EEA)
2 různé enzymy štěpící MUF-GlcNAc
Princip metody stanovení EEA MUF fluorescence
(filtrace) inkubace
(in situ pH & teplota)
vzorek
(+ pufr) + HgCl2 (blank)
MUF substrát
alkalizace
+ HgCl2 + 2M NaOH & EDTA (blank)
Časový průběh hydrolýzy substrátu – časová kinetika 14000
Relative F R F.U. (cps s)
12000 5 µM
10000
Ohyb závislosti signalizuje vyčerpávání substrátu
8000 6000 4000 2000 0
0
10
20
30
40
50
60
70
time (min)
80
90
100 110 120
Časový průběh hydrolýzy substrátu – časová kinetika 14000
Relative F R F.U. (cps s)
12000 5 µM
10000 8000 6000
Sklon regresní přímky v oblasti lineární závislosti udává rychlost hydrolýzy substrátu
4000 2000 0
0
10
20
30
40
50
60
70
time (min)
80
90
100 110 120
Časový průběh hydrolýzy substrátu – časová kinetika 0.1 µM 0.5 µM 1 µM 2 µM 5 µM
14000
Relative F R F.U. (cps s)
12000 10000 8000 6000 4000 2000 0
0
10
20
30
40
50
60
70
time (min)
80
90
100 110 120
Časový průběh hydrolýzy substrátu – časová kinetika 0.1 µM 0.5 µM 1 µM 2 µM 5 µM
14000
Relative F R F.U. (cps s)
12000 10000 8000 6000 4000 2000 0
0
10
20
30
40
50
60
70
time (min)
80
90
100 110 120
Rychlost hydrolýzy při různé koncentraci substrátu – saturační kinetika
Rovnice Michaelise-Mentenové: v = Vmax × [S] / (KM + [S])
v (µ µmol l-11 h-1)
7 6 5 4 3 2 1 0
0
100
200
300
[S] (µmol l-1)
400
500
Rychlost hydrolýzy při různé koncentraci substrátu – saturační kinetika
Rovnice Michaelise-Mentenové: v = Vmax × [S] / (KM + [S])
v (µ µmol l-11 h-1)
7 6 5 4 3 2 1 0
0
100
200
300
[S] (µmol l-1)
400
500
Rychlost hydrolýzy při různé koncentraci substrátu – saturační kinetika
Rovnice Michaelise-Mentenové: v = Vmax × [S] / (KM + [S])
v (µ µmol l-11 h-1)
7 6
Vmax = 6.942 µmol l-1 h-1
5 4 3 2 1 0
0
100
200
300
[S] (µmol l-1)
400
500
Rychlost hydrolýzy při různé koncentraci substrátu – saturační kinetika
Rovnice Michaelise-Mentenové: v = Vmax × [S] / (KM + [S])
v (µ µmol l-11 h-1)
7 6
Vmax = 6.942 µmol l-1 h-1
5 4 v = 1/2 Vmax
3 2
KM = 3.898 3 898 µmol l-1
1 0
0
100
200
300
[S] (µmol l-1)
400
500
Wolf (Hobie-Wright)
Lineweaver-Burk 1/v = 1/Vmax + (KM/Vmax) (1/[S])
70 60
y = 0.6272 x – 0.2932
60
50
S//v
1/v v
y = 0.1398 x + 0.7464
50
40 30
40 30
20
20
10 0 -10
[S]/v = KM/Vmax + (1/V max) × [S]
70
10
1/Vmax
0
–KM
50
0
100
0
1/[S]
KM/Vmax
100 200 300 400 500
[S]
v
7 6
Transformace –
5
– lineární regrese:
Michaelis-Mentenová
4
v = Vmax × [S] / (KM + [S])
3 2 1 0
0
100
200
300
[S]
400
500
Vmax
KM
(µmol l-1 h-1) (µmol l-1)
Wolf (Hobie-Wright)
Lineweaver-Burk
Eadie
1/v = 1/Vmax + (KM/Vmax) (1/[S])
v = Vmax – KM (v/[S])
7
y = 0.2674 0 2674 x + 0 0.1710 1710
5
0.6
4
02 0.2
1/Vmax
0
1
20
Vmax/KM
10
1 2
3
0
4
40 30
2
–1/KM
-1
y = –1.937 x + 6.245
3
0.4
y = 0.1398 x + 0.7464
50
S//v
0.8
60
1/Vmax
6
v
1/v v
1.0
[S]/v = KM/Vmax + (1/Vmax) × [S]
70
–KM
0
1
1/[S]
2
3
4
0
0
v/[S] /[S]
KM/Vmax
100 200 300 400 500
[S]
v
7 6
Transformace –
5
– lineární regrese:
Michaelis-Mentenová
4
v = Vmax × [S] / (KM + [S])
3
Lineweaver-Burk
2 1 0
0
100
200
300
[S]
400
500
Vmax
KM
(µmol l-1 h-1) (µmol l-1)
5.8
1.7
Wolf (Hobie-Wright)
Lineweaver-Burk
Eadie
1/v = 1/Vmax + (KM/Vmax) (1/[S])
v = Vmax – KM (v/[S])
7
y = 0.2674 0 2674 x + 0 0.1710 1710
5
0.6
4
02 0.2
1/Vmax
0
1
20
Vmax/KM
10
1 2
3
0
4
40 30
2
–1/KM
-1
y = –1.937 x + 6.245
3
0.4
y = 0.1398 x + 0.7464
50
S//v
0.8
60
Vmax
6
v
1/v v
1.0
[S]/v = KM/Vmax + (1/Vmax) × [S]
70
–KM
0
1
1/[S]
2
3
4
0
v/[S] /[S]
0
KM/Vmax
100 200 300 400 500
[S]
v
7 6
Transformace –
5
– lineární regrese:
Michaelis-Mentenová
4
v = Vmax × [S] / (KM + [S])
3
Lineweaver-Burk Eadie
2 1 0
0
100
200
300
[S]
400
500
Vmax
KM
(µmol l-1 h-1) (µmol l-1)
5.8 6.2
1.7 1.9
Wolf (Hobie-Wright)
Lineweaver-Burk
Eadie
1/v = 1/Vmax + (KM/Vmax) (1/[S])
v = Vmax – KM (v/[S])
7
y = 0.2674 0 2674 x + 0 0.1710 1710
5
0.6
4
02 0.2
1/Vmax
0
1
20
Vmax/KM
10
1 2
3
0
4
40 30
2
–1/KM
-1
y = –1.937 x + 6.245
3
0.4
y = 0.1398 x + 0.7464
50
S//v
0.8
60
Vmax
6
v
1/v v
1.0
[S]/v = KM/Vmax + (1/Vmax) × [S]
70
–KM
0
1
1/[S]
2
3
4
0
KM/Vmax
0
v/[S] /[S]
100 200 300 400 500
[S]
v
7 6
Transformace –
5
– lineární regrese:
Michaelis-Mentenová
4
v = Vmax × [S] / (KM + [S])
3 2
Lineweaver-Burk Eadie Wolf (Hobie-Wright)
1 0
0
100
200
300
[S]
400
500
Vmax
KM
(µmol l-1 h-1) (µmol l-1)
5.8 6.2 7.2
1.7 1.9 5.3
Wolf (Hobie-Wright)
Lineweaver-Burk
Eadie
1/v = 1/Vmax + (KM/Vmax) (1/[S])
v = Vmax – KM (v/[S])
7
y = 0.2674 0 2674 x + 0 0.1710 1710
5
0.6
4
02 0.2
1/Vmax
0
1
20
Vmax/KM
10
1 2
3
0
4
40 30
2
–1/KM
-1
y = –1.937 x + 6.245
3
0.4
y = 0.1398 x + 0.7464
50
S//v
0.8
60
Vmax
6
v
1/v v
1.0
[S]/v = KM/Vmax + (1/Vmax) × [S]
70
–KM
0
1
1/[S]
2
3
4
0
KM/Vmax
0
100 200 300 400 500
v/[S] /[S]
[S]
v
7 6
Transformace –
5
– lineární regrese:
Michaelis-Mentenová
4
v = Vmax × [S] / (KM + [S])
3 2
(µmol l-1 h-1)
KM (µmol l-1)
5.8 6.2 7.2
1.7 1.9 5.3
6.9
3.9
Nelineární regrese:
1 0
Lineweaver-Burk Eadie Wolf (Hobie-Wright)
Vmax
Michaelis-Mentenová 0
100
200
300
[S]
400
500
Vmax – potenciální rychlost hydrolýzy substrátu ~ množství enzymových jednotek ve vzorku, ale l závisí á i í též na reakčních kč í h podmínkách d í ká h (teplotě, (t l tě pH H aj.)! j )!
Vmax = 16 Vmax = 8
KM – polosaturační (Michaelisova) konstanta nepřímo úměrná afinitě enzymu k substrátu Vmax = 6.942 µmol l-1 h-1
7
v (µmol l-1 h-1)
6 5 4
v = 1/2 Vmax
3
KM = 100 µmol l-1
2
KM = 38.98 38 98 µmol l-1
1 0
KM = 3.898 µmol l-1 0
100
200
300
[S] (µmol l-1)
400
500
Vliv kompetetivní p inhibice na afinitu enzymu y k substrátu pH = 4.5 45
AccPA (µm mol l-1 h-1)
5 4
KM = 10.1 µ µmol l-1
3 2
cAl = 0 (control)
1 0
0
10
20
30
40
50
60
MUFP (µmol l-1)
70
80
90
100
Vliv kompetetivní p inhibice na afinitu enzymu y k substrátu pH = 4.5 45
AccPA (µm mol l-1 h-1)
5 4
KM = 10.1 µ µmol l-1 KM = 11.5 µmol l-1
3 2
cAl = 0 (control) cAl = 100 µg l-11
1 0
0
10
20
30
40
50
60
MUFP (µmol l-1)
70
80
90
100
Vliv kompetetivní p inhibice na afinitu enzymu y k substrátu pH = 4.5 45
AccPA (µm mol l-1 h-1)
5 4
KM = 10.1 µ µmol l-1 KM = 11.5 µmol l-1
3 KM = 21.2 µmol l-1
2
cAl = 0 (control) cAl = 100 µg l-11 cAl = 300 µg l-1
1 0
0
10
20
30
40
50
60
MUFP (µmol l-1)
70
80
90
100
Vliv kompetetivní p inhibice na afinitu enzymu y k substrátu pH = 4.5 45
AccPA (µm mol l-1 h-1)
5 4
KM = 10.1 µ µmol l-1 KM = 11.5 µmol l-1
3 KM = 21.2 µmol l-1
2
cAl = 0 (control) cAl = 100 µg l-11 cAl = 300 µg l-1 cAl = 1000 µg l-1
KM = 30.4 µmol l-1
1 0
0
10
20
30
40
50
60
MUFP (µmol l-1)
70
80
90
100
Analýza dat saturační kinetiky Aeromonas hydrophila xosaminid dase activ ity -hex (µmol l-11 h-1)
5
T r = Vmax /KM = 0.1824 h-1
4
3
2
1
0
0
100
EGME
Model 1:
200
300
MUF-GlcNAc (µmol l-1)
v = Tr × [S]
při KM >> [S]
Analýza dat saturační kinetiky Aeromonas hydrophila xosaminid dase activ ity -hex (µmol l-11 h-1)
5
T r = Vmax /KM = 0.1824 h-1
4
3
2
Vmax = 5.248 µ µmol l-1 h-1 KM = 171 µmol l-1
1
0
0
100
EGME
200
MUF-GlcNAc (µmol l-1)
300
DMSO
Model 1:
v = Tr × [S]
při KM > [S]
M d l 2: Model 2
v = Vmax × [S] / (KM + [S])
Analýza dat komplexní saturační kinetiky
osaminida ase activity y -hexo (µmol l-1 h-1)
Aeromonas hydrophila & Cyclidium glaucoma 12 10 8 6 4 2 0
0
100
200
300
MUF-GlcNAc (µmol l-1)
Model 3:
v = Vmax(H)×[S]/(KM(H)+[S]) + Tr(L)×[S]
Analýza dat komplexní saturační kinetiky
osaminida ase activity y -hexo (µmol l-1 h-1)
Aeromonas hydrophila & Cyclidium glaucoma 12 10 8 6 4 2 0
0
100
200
300
MUF-GlcNAc (µmol l-1)
Model 3:
v = Vmax(H)×[S]/(KM(H)+[S]) + Tr(L)×[S]
Model 4:
v = Vmax(H)×[S]/(KM(H)+ S]) + Vmax(L)×[S]/(KM(L)+[S])
Analýza dat komplexní saturační kinetiky
osaminida ase activity y -hexo (µmol l-1 h-1)
Aeromonas hydrophila & Cyclidium glaucoma 12 10 8 6 4 2 0
0
100
200
300
MUF-GlcNAc (µmol l-1)
Model 3:
v = Vmax(H)×[S]/(KM(H)+[S]) + Tr(L)×[S]
Model 4:
v = Vmax(H)×[S]/(KM(H)+ S]) + Vmax(L)×[S]/(KM(L)+[S])
Analýza dat komplexní saturační kinetiky
osaminida ase activity y -hexo (µmol l-1 h-1)
Aeromonas hydrophila & Cyclidium glaucoma 12 10 8 6
Vmax(L) = 16.61 µmol l-1 h-1 -1 KM((L) (( ) = 241.0 µmol l
4 2 0
0
100
200
300
MUF-GlcNAc (µmol l-1)
Model 4:
v = Vmax(H)×[S]/(KM(H)+ S]) + Vmax(L)×[S]/(KM(L)+[S])
Analýza dat komplexní saturační kinetiky
osaminida ase activity y -hexo (µmol l-1 h-1)
Aeromonas hydrophila & Cyclidium glaucoma 12 10 8 6
Vmax(L) = 16.61 µmol l-1 h-1 -1 KM((L) (( ) = 241.0 µmol l
4
Vmax(H) = 3.399 µmol l-1 h-1 KM(H) = 0.1436 µmol l-1
2 0
0
100
200
300
MUF-GlcNAc (µmol l-1)
Model 4:
v = Vmax(H)×[S]/(KM(H)+ S]) + Vmax(L)×[S]/(KM(L)+[S])
1. den 0.14
Bodo saltans -hexosaminidase (µm mol/l h)
-hexosaminidase (µm mol/l h)
0.14 0.12 0.10 0.08 0.06 0.04 0.02 0.00
0
20
40
60
80
0.12 0.10 0.08 0.06 0.04 0.02 0.00
100
Bodo saltans
0
MUF-GlcNAc (µM)
hexosaminiidase -h (µmol/l h)
hexosaminiidase -h (µmol/l h)
0.04 0 02 0.02
0
20
40
60
MUF-GlcNAc (µM)
6
8
10 12
0.08 Cyclidium glaucoma
0.06
0.00
4
TGR (10 9 bact./l h)
Cyclidium glaucoma
0.08
2
80
100
0.06 0.04 0 02 0.02 0.00
0
1
2
3
4
5
TGR (10 9 bact./l h)
6
2. den 0.14
Bodo saltans -hexosaminidase (µm mol/l h)
-hexosaminidase (µm mol/l h)
0.14 0.12 0.10 0.08 0.06 0.04 0.02 0.00
0
20
40
60
80
0.12 0.10 0.08 0.06 0.04 0.02 0.00
100
Bodo saltans
0
MUF-GlcNAc (µM)
hexosaminiidase -h (µmol/l h)
hexosaminiidase -h (µmol/l h)
0.04 0 02 0.02
0
20
40
60
MUF-GlcNAc (µM)
6
8
10 12
0.08 Cyclidium glaucoma
0.06
0.00
4
TGR (10 9 bact./l h)
Cyclidium glaucoma
0.08
2
80
100
0.06 0.04 0 02 0.02 0.00
0
1
2
3
4
5
TGR (10 9 bact./l h)
6
4. den 0.14
Bodo saltans -hexosaminidase (µm mol/l h)
-hexosaminidase (µm mol/l h)
0.14 0.12 0.10 0.08 0.06 0.04 0.02 0.00
0
20
40
60
80
0.12 0.10 0.08 0.06 0.04 0.02 0.00
100
Bodo saltans
0
MUF-GlcNAc (µM)
hexosaminiidase -h (µmol/l h)
hexosaminiidase -h (µmol/l h)
0.04 0 02 0.02
0
20
40
60
MUF-GlcNAc (µM)
6
8
10 12
0.08 Cyclidium glaucoma
0.06
0.00
4
TGR (10 9 bact./l h)
Cyclidium glaucoma
0.08
2
80
100
0.06 0.04 0 02 0.02 0.00
0
1
2
3
4
5
TGR (10 9 bact./l h)
6
7. den 0.14
Bodo saltans -hexosaminidase (µm mol/l h)
-hexosaminidase (µm mol/l h)
0.14 0.12 0.10 0.08 0.06 0.04 0.02 0.00
0
20
40
60
80
0.12 0.10 0.08 0.06 0.04 0.02 0.00
100
Bodo saltans
0
MUF-GlcNAc (µM)
hexosaminiidase -h (µmol/l h)
hexosaminiidase -h (µmol/l h)
0.04 0 02 0.02
0
20
40
60
MUF-GlcNAc (µM)
6
8
10 12
0.08 Cyclidium glaucoma
0.06
0.00
4
TGR (10 9 bact./l h)
Cyclidium glaucoma
0.08
2
80
100
0.06 0.04 0 02 0.02 0.00
0
1
2
3
4
5
TGR (10 9 bact./l h)
6
9. den 0.14
Bodo saltans -hexosaminidase (µm mol/l h)
-hexosaminidase (µm mol/l h)
0.14 0.12 0.10 0.08 0.06 0.04 0.02 0.00
0
20
40
60
80
0.12 0.10 0.08 0.06 0.04 0.02 0.00
100
Bodo saltans
0
MUF-GlcNAc (µM)
hexosaminiidase -h (µmol/l h)
hexosaminiidase -h (µmol/l h)
0.04 0 02 0.02
0
20
40
60
MUF-GlcNAc (µM)
6
8
10 12
0.08 Cyclidium glaucoma
0.06
0.00
4
TGR (10 9 bact./l h)
Cyclidium glaucoma
0.08
2
80
100
0.06 0.04 0 02 0.02 0.00
0
1
2
3
4
5
TGR (10 9 bact./l h)
6
11. den 0.14
Bodo saltans -hexosaminidase (µm mol/l h)
-hexosaminidase (µm mol/l h)
0.14 0.12 0.10 0.08 0.06 0.04 0.02 0.00
0
20
40
60
80
0.12 0.10 0.08 0.06 0.04 0.02 0.00
100
Bodo saltans
0
MUF-GlcNAc (µM)
hexosaminiidase -h (µmol/l h)
hexosaminiidase -h (µmol/l h)
0.04 0 02 0.02
0
20
40
60
MUF-GlcNAc (µM)
6
8
10 12
0.08 Cyclidium glaucoma
0.06
0.00
4
TGR (10 9 bact./l h)
Cyclidium glaucoma
0.08
2
80
100
0.06 0.04 0 02 0.02 0.00
0
1
2
3
4
5
TGR (10 9 bact./l h)
6
Vysokoafinní β-N-acetylhexosaminidázy (KM < 1 µM) ~ trávicí enzymy bakterivorních prvoků
100
1000
González et al.1993 MUF-(GlcNAc)3 MUF-GlcNAc Vmax
100
10
10
1
1
01 0.1
01 0.1
0.01
0.01
0.001 0.0001
0.001
0.01
0.1
1
Total bacterivory
10
0.001 100
MUF-GlcN M NAc hydro olysis
MUF-(G GlcNAc)3 hydrolys sis
1000
Vysokoafinní trávicí enzym bakterivorních prvoků? ~ lysozym nebo β-N-acetylhexosaminidáza?
MUF-(G GlcNAc)3 hydrolysis
MUF-GlcNAc
32
MUF-(GlcNAc) ( )3
28
1:3
8
24 20 16
4
12 8 4
0
4
5
6
7
pH
8
9
0
MUF-GlcNAc hydrolysis M
1:3
36
12
Hydrolýza MUF-N-acetyl-β-D-glukosaminidu epilimnion – Římov, 10.9.1993 – metalimnion
-1
-1
Enzyme e activity [µ µmol l h ]
0.007
0.0008
Vmax(H) A
0.006 0.0004
2
Vmax(R)
0.005 0.004
1
B
0.0004
0 0
0.0008
0.006
Vmax(R)
0.005 0.004
0.007
3
0 0
0.003
0.003
0.002
0.002
0.001
0.001
0
1
2
3
0 0
10
20
30
40
50
60
70
80 -1
Substrate [µmol l ]
90 100
0
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 -1
Substrate [µmol] l
Vysokoafinní trávicí enzym bakterivorních prvoků Piburger See - 1994
0.6 0.4 0.2
3
1.5
2
1.0
1
0.5
0 4
0.0 2.0
3
1.5 5
2
1.0
1
0.5
0
0.0
2
Epilimnion
1
-1
0.0 1.0
Metalimnion
0.8 0.6 0.4 0.2 0.0 14
21 28 August
4
11 18 25 September
0 2
Metalimnion
1
0 1
8
15 22 May
29
5 June
-1
08 0.8
2.0
-1 1
Epilimnion
4
Pico oplanktivo ory [µg C l h ]
1.0
-1
Enzym me activity y [nmol l h ]:
Vmaax(H);
Vmaax(R)
Rímov Reservoir - 1993
20 µm
Hydrolýza MUF-N-acetyl-β-D-glukosaminidu Římov, 23.8.1993 – metalimnion 0.0006
0.020
Vmax(R)
0.0003
-1
-1
Enzyme e activity [µ µmol l h ]
0.025
0 015 0.015
0 0000 0.0000 0
1
2
3 LEA
0.010
0.005 Vmax(R) 0.000 0
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 -1
Substrate [µmol l ]
LEA = low-affinityy enzyme activity (KM(L) ( )>100 µM) (celková – Vmax(R))
Piburger See - 1994
Epilimnion
200 15
15
150
10
100
5
50
0 20
Metalimnion
150
10
100
5
50
0
0 14
21 28 August
4
11 18 25 September
10
100
5
50
0 0 200 15
15
150
Epilimnion
-1
20
Crusta acean zoo oplankton n [ind. l ]
Rímov Reservoir - 1993
-1
-1
En nzyme ac ctivity [nm mol l h ];
-1
Diatom biomass [mg l ]
Nízkoafinní enzymy rozsivek a perlooček
0 150
Metalimnion
10
100
5
50
0
0 1
8
15 22 May
29
5 June
Nízkoafinní enzymy rozsivek a perlooček 5
PIB
12
3
LEA
LEA
4
RIM rs= 0.578 *
2
8 4
1 0
0 0
1
2
3
20 30 40 50 60 70
Crustacean abundance
Diatom biomass 20
12
LEA
15 5
LEA
rs= 0.850 0 850 *
10 5
rs= 0.483
0 0
3
6
9 12 15
Diatom biomass
rs= 0.862 *
8 4 0 0
1
2
3
Diatom biomass
minidase -N-acetyylhexosam activityy [nmol l -11 h-1]
100
A
rs = 0.3529 ***
10
1
0.1 0.01
0.1
1
10
Diatom biomass [mm 3 l-11]
100
minidase, -N-acetyllhexosam Vmax(L) [nmol l-11 h-1]
Nízkoafinní ektoenzymy rozsivek (KM>150 µM) 20
B
r2 = 0.9870 15
pennate diatoms centric diatoms
10
r 2 = 0.9923
5
0
0
3
6
9
12
15
Di Diatom bi biomass [[mm 3 l-11]
18
ylhexosam minidase a activity -N-acety (nmol l-11 h-1 )
Svlékací enzym perlooček 3.5
0.8316 3.0
A
2.5 20 2.0
3
1.5
2
1.0
1
0.5 0.0 0.0
0.5
1.0
1.5
2.0
Body y length g ((mm))
• KM ~ 60 µmol l-1 • rozpuštěný (po svléknutí) • stabilní (> 2,5 dne
2.5
3.0
Příklad vyhodnocení saturační kinetiky extracelulárních β β-N-acetylhexosaminidáz N acetylhexosaminidáz v různých velikostních frakcích planktonu hexosaminidase --N-acetylh activity y [µmol l-1 h -1]
0 025 0.025
<100 µm <10 µm <4 µm, <0.2 µm
0.020 0.015 0.010 0 005 0.005 0.000 0
50
100
150
200
250
Substrate [µmol l-1]
St ý Vrbenský Starý V b ký ryb., b 11 11.4.1995: 4 1995 nálevníci, HNF, rozsivky, korýši, chitinolitické bakterie
300
Někdy lze v povrchových vodách odlišit různé enzymy y y štěpící p MUF–GlcNAc kineticky (0,01–300 µmol l-1) a frakcionačně • "Extracelulární" aktivita trávicího enzymu y bakterivorních p prvoků jje vždy y vázána na částice a vyznačuje se vysokou afinitou (KM<0.5 µmol l-1). • Ektoenzymy chitinolytických bakterií mají nízkou afinitu k substrátu (KM>100 µmol l-1), tyto bakterie velmi často přisedají na částice chitinu. • Chitinolytická aktivita s nízkou afinitou k substrátu je často vázána na výskyt rozsivek, kromě ektoenzymů přisedlých chitinolytických bakterií jde zřejmě j o ektoenzymy y y rozsivek ((KM>150 µ µmol l-1)). • Zvýšená aktivita rozpuštěných svlékacích enzymů korýšů (členovců) ve vodě je charakteristická pro období rychle rostoucích populací korýšů (KM~60 µmol l-1), a zřejmě také např. pro období výletu vodního hmyzu? • Ke zvýšené aktivitě rozpuštěných enzymů mohou přispívat trávicí enzymy mnohobuněčných živočichů (chitinázy – korýši, hmyz, ryby)? • Podílí se na hydrolýze MUF–GlcNAc virové lysozymy?
CHITIN = polymer N-acetyl-β-D-glukosaminu (GlcNAc–GlcNAc)n: členovci houby, členovci, houby měkkýši, měkkýši červi, červi nálevníci nálevníci, rozsivky rozsivky...
O
CH2OH O OH
O
CH2OH O OH
NH–CO–CH NH CO CH3
O
CH2OH O OH
NH–CO–CH NH CO CH3
O
NH–CO–CH NH CO CH3
chitinázy, y chitobiázy, y β β-N-acetylhexosaminidázy... y y
PEPTIDOGLYKAN = polymer kyseliny N-acetyl-β-D-muramové a N-acetyl-β-D-glukosaminu N t lβD l k i (MurNAc–GlcNAc) (M NA Gl NA )n: Prokaryota (bakterie, sinice)
CH2OH O
CH2OH O OH
O
O O
NH–CO–CH CO C 3
CH3CH–CONH–CH–COOH
CH2OH O O
O
NH–CO–CH CO C 3 O
NH–CO–CH CO C 3
CH3CH–COOH
CH3 lysozymy y y y ((muramidázy) y)
umělý (nefluorescenční) substrát 4-methylumbelliferyl 4 methylumbelliferyl N N-acetyl-β-D-glukosaminidid acetyl β D glukosaminidid
O
O
O
CH2OH O OH
O
NH–CO–CH NH CO CH3 CH3 ((extracelulární)) β β-N-acetylhexosaminidázy y y
Příjem fosfátu řasovými buňkami
Pi
Porg
Snížená dostupnost P pro fytoplankton
P limitace fytoplanktonu
Indukce extracelulárních alkalických fosfatáz fytoplanktonu Římov reservoir
60
SRP Chl a
50
2.5
40
2.0
30
15 1.5
20
1.0
10
0.5
0
0.0 J
F
M
A
M
J
J
2000
A
S
O
N
D
M UF [µmo ol l-1 h-1]
SRP & Chl a [µg l-1] S
3.0
Indukce extracelulárních alkalických fosfatáz fytoplanktonu Římov reservoir
60
SRP Chl a
50 40
2.5 2.0
MUF MUF > 2µm
30
15 1.5
20
1.0
10
0.5
0
0.0 J
F
M
A
M
J
J
2000
A
S
O
N
D
M UF [µmo ol l-1 h-1]
SRP & Chl a [µg l-1] S
3.0
P limitace fytoplanktonu: lokalizace aktivní extracelulární fosfatázy (ELF®97 fosfát) autofluorescence fytoplanktonu (LUCIA)
Eudorina
10µm 20µm
2000 © A. Štrojsová
Římov 31.5.00
O Cl
Jak ELFP funguje?
NH
Cl
N
HO O Cl
NH
pH < 8 (?)
Cl
N O -O
O Cl
O-
NH Cl
N H
P
O
rozpustný? (při nízkých koncentracích?)
O
O
O Cl
pH > 8 (?)
NH
Cl
NH
Cl
N
Cl
N
-O
HO O Cl
NH
pH < 8 (?)
Cl
N O -O
O Cl
O Cl
O
P
Cl O
O-
NH
NH O
Cl
NH O
Cl
N H
Cl
N
O
rozpustný? (při nízkých koncentracích?)
Cl
NNH
N NH Cl H O
H
H
Cl
O
N
Cl O O
NH
Cl
Cl
N
H O
H O
silně fluoreskující, nerozpustná sraženina
Plešné jezero (9.10.00)
50µm 2000 © A. Štrojsová
Autofluorescence fytoplanktonu, aktivní extracel. fosfatázy
Různé extracelulární fosfatázy planktonních mikrobů Lake Čertovo
Lake Plešné
20
1000
16 18
14
ELFP-fluorimeter
13
MUFP-fluorimeter
12 8 7 6
small bacteria vibrio-shaped filaments
5 4
Activity ((µmol l-1 h-11)
Activity ((µmol l-1 h-11)
15
ELFP on filter MUFP-fluorimeter
16 12
Monoraphidium
100
10 8 6
10
4
3 2
2
1
1
0
0
May Jun Jul Aug Sep Oct Nov
2003
May
Jun
Jul
Aug
Sep
2003
celoroční P limitace planktonu v šumavských jezerech (SRP < 1 µg/l)
Oct
Specific a activity (fmo ol Monorap phidium-1 h-1)
17
Diurnální změny fosfatáz v jednorázové kultuře Chlamydomonas y reinhardtii
7000
Relativ ve fluorrescenc ce
6000 5000 4000 3000 2000 1000 0 12
18
24
6
12
18
day time (hours)
24
6
12
Detekce jiných ektoenzymů v planktonu Fosfatázy
ß-Hexosaminiddázy
(ELF phosphate)
(ELF N-acetyl-ß-D-glucosaminide)
C ti Ceratium hi hirundinella di ll
Ankyra
Rhodomonas
Lipázy
(ELF palmiate)
A t i Asterionella ll fformosa
Hetero- & Mixotrofní bičíkovci
Planktonní vířníci: detekce & lokalizace enzymatických ý aktivit u různých ů ý druhů ů Trichocerca similis
K. cochlearis
K. cochlearis Synchaeta pectinata korona fosfatázy mastax
lipáza
ß-hexosaminidáza (v žaludku) trávení prokaryt?
12 druhů: Keratella spp., Polyarthra spp., Synchaeta spp., Kellicottia, Trichocerca, etc.)