LABORATOŘ KULTIVAČNÍCH TECHNIK - ORGANIZACE PŘEDMĚTU Výuka předmětu Laboratoř kultivačních technik a modelování bioprocesů bude probíhat dle následujícího harmonogramu (Tab. I). Výuka se skládá z bloku základních úloh, bloku speciálních úloh a bloku věnovaného modelování a řízení bioprocesů. Na závěr bude každá skupina prezentovat vybraný samostatný projekt. Tabulka I – Harmonogram úloh vyučovaných v rámci předmětu laboratoř KT 15.9. 22.9. 29.9. 6.10. 13.10.
20.10. 27.10. 3.11. 10.11. 24.11. 1.12. 8.12. 15.12.
Úvodní lekce a školení bezpečnosti práce BLOK ZÁKLADNÍCH ÚLOH 1. základní úloha Příprava médií a uchovávání produkčních kmenů 2. základní úloha Stanovení KLa a vsádková kultivace 1. základní úloha Příprava médií a uchovávání produkčních kmenů 2. základní úloha Stanovení KLa a vsádková kultivace 3.základní úloha Techniky molekulární biologie a jejich využití 4. základní úloha Kultivace na pevném substrátu 3.základní úloha Příprava médií a uchovávání produkčních kmenů 4. základní úloha Kultivace na pevném substrátu BLOK SPECIÁLNÍCH ÚLOH 1.speciální úloha dle vylosované specifikace 1. speciální úloha dle vylosované specifikace 2.speciální úloha dle vylosované specifikace 2.speciální úloha dle vylosované specifikace BLOK MODELOVÁNÍ A ŘÍZENÍ BIOPROCESŮ Inženýrský úvod a úvod do modelování Individuální příprava na prezentaci samostatných projektů Modelování bioprocesů, řízení a regulace bioprocesů PREZENTACE SAMOSTATNÝCH PROJEKTŮ ZÁKLADNÍ POŽADAVKY:
1. Aktivní účast na cvičeních - připouští se 2 omluvené absence 2. Včasný příchod do laboratoří - při pozdním příchodu překračujícím 10 min nebude student vpuštěn do laboratoře, úloha bude klasifikována stupněm F 3. Připravenost na cvičení - před začátkem každé úlohy student absolvuje krátký písemný test, případně ústní přezkoušení, nedostatečná připravenost vylučuje studenta ze cvičení a je klasifikována stupněm F. Po 2 nedostatečných je student z laboratoří vyloučen. 4. Včasné odevzdání protokolu (úvod, metodika, zpracované výsledky) nejpozději do 7 dnů od ukončení měření úlohy vedoucímu úlohy 5. Prezentace samostatného projektu, který zahrnuje zpracování dat naměřených všemi skupinami, které dané téma řešily, jejich diskuzi a jasné závěry. Podmínkou je aktivní účast na přípravě a prezentaci zadané úlohy od všech členů skupiny. 6. Na blok modelování bioprocesů bude mít každý student k dispozici vlastní notebook – ne tablet!
ČÍSLO SKUPINY
JMÉNA ČLENŮ SKUPINY
SPECIÁLNÍ ÚLOHY
ZÁVĚREČNÁ ÚLOHA
Zralá Nikola Doležalová Jana Vácha Martin
Mořské mikroorganismy Sladařství
Kultivace na pevném substrátu
Skupina 1
Lokajová Romana Nováková Marcela Holovatská Natalia
Pivovarství Charakteristika toku fází
Stanovení KLa
Skupina 2
Sembolová Eliška Zimola Michal Bandy David Novotný Jiří
Sladařství Kontinuální kultivace v náplňovém bioreaktoru
Kontinuální kultivace v náplňovém bioreaktoru
Mačaj Kryštof Korda Filip Pánek Tomáš
Charakteristika toku fází Pivovarství
Charakteristika toku fází
Skupina 4
Ruffer Jakub Pecháčková Zora Yeudakimenka Natallia
Kontinuální kultivace v náplňovém bioreaktoru Mořské mikroorganismy
Kultivace mořských mikroorganismů
Skupina 5
Skupina 3
ZÁKLADNÍ ÚLOHY - 22. 9.- 13. 10. 2015, začátek je vždy od 9 hodin v laboratoři 122 Výuka bloku základních úloh bude probíhat vždy celý jeden den (úterý) v případě úloh 1,2,3; úloha 4 bude navíc zahrnovat odběr vzorků během následujících dní dle harmonogramu určeného vedoucím úlohy. Všechny skupiny absolvují všechny základní úlohy.
Vyučované úlohy: Základní úloha 1 - Příprava médií a uchovávání produkčních kmenů Vedoucí úlohy: Ing. Richard Ježdík Vyučující: Ing. Paldrychová, Ing. Ježdík, Ing. Patrovský Základní úloha 2 - Stanovení koeficientu přestupu kyslíku a vsádková kultivace mikroorganismů Vedoucí úlohy: Ing. Tomáš Humhal Vyučující: Ing. Humhal, Ing. Raschmanová Základní úloha 3 - Techniky molekulární biologie a jejich využití v biotechnologiích Vedoucí úlohy: Mgr. Jan Kolek Vyučující: Mgr. Kolek, Ing. Urbanská, Ing. Raschmanová Základní úloha 4 - Kultivace na pevném substrátu a stanovení enzymové aktivity Vedoucí úlohy: Ing. Matěj Patrovský Vyučující: Ing. Patrovský, Ing. Pádrová, Ing. Koukalová
Základní blok úloh –přehled rozdělení skupin
22.9. Skupina 1 Úloha 1 - Příprava médií a uchovávání produkčních kmenů Vyučující: Ing. Ježdík Místnost A122 Skupina 2 Úloha 1 - Příprava médií a uchovávání produkčních kmenů Vyučující: Ing. Paldrychová Místnost A122 Skupina 3 Úloha 1 - Příprava médií a uchovávání produkčních kmenů Vyučující: Ing. Patrovský Místnost A122 Skupina 4 Úloha 2 - Stanovení KLa a vsádková kultivace Vyučující: Ing. Humhal Místnost A117 Skupina 5 Úloha 2 - Stanovení KLa a vsádková kultivace Vyučující: Ing. Raschmanová Místnost A117
29.9. Skupina 1 Úloha 2 - Stanovení KLa a vsádková kultivace Vyučující: Ing. Humhal Místnost A117 Skupina 2 Úloha 2 - Stanovení KLa a vsádková kultivace Vyučující: Ing. Kolek Místnost A117 Skupina 3 Úloha 2 - Stanovení KLa a vsádková kultivace Vyučující: Ing. Humhal Místnost A117 Skupina 4 Úloha 1 - Příprava médií a uchovávání produkčních kmenů Vyučující: Ing. Ježdík Místnost A122 Skupina 5 Úloha 1 - Příprava médií a uchovávání produkčních kmenů Vyučující: Ing. Patrovský Místnost A122
6.10. Skupina 1 Úloha 3 - Molekulární biologie Vyučující: Mgr.Kolek Místnost A115 Skupina 2 Úloha 3 - Molekulární biologie Vyučující: Ing. Urbanská Místnost A115 Skupina 3 Úloha 3 - Molekulární biologie Vyučující: Ing.Raschmanová Místnost A115 Skupina 4 Úloha 4 - Kultivace na pevném substrátu Vyučující: Ing. Patrovský Místnost A122 Skupina 5 Úloha 4 - Kultivace na pevném substrátu Vyučující: Ing. Koukalová Místnost A122
13.10. Skupina 1 Úloha 4 - Kultivace na pevném substrátu Vyučující: Ing. Patrovský Místnost A122 Skupina 2 Úloha 4 - Kultivace na pevném substrátu Vyučující: Ing. Pádrová Místnost I01 Skupina 3 Úloha 4 - Kultivace na pevném substrátu Vyučující: Ing. Koukalová Místnost A122 Skupina 4 Úloha 3 - Molekulární biologie Vyučující: Mgr.Kolek Místnost A115 Skupina 5 Úloha 3 - Molekulární biologie Vyučující: Ing. Urbanská Místnost A115
SPECIÁLNÍ ÚLOHY - 20. 10. - 10. 11. 2015, začátek a místo specifikováno u jednotlivých úloh Každá ze skupin si vylosuje kombinaci dvou úloh, na provedení každé úlohy bude mít 2 týdny, tj. práce bude zahrnovat více dní v týdnu dle pokynů vedoucího úlohy. V následujícím rozpisu je uveden čas začátku úloh v prvním týdnu, začátek práce v dalším týdnu bude upřesněn po domluvě s vedoucím dané úlohy. Vyučované úlohy: Speciální úloha 1 - Sladařství - místnost S57, začátek v 8 hodin Vedoucí úlohy: Ing. Lukáš Jelínek Vyučující: Ing. Jelínek, Ing. Brožová, Ing. Karabín Speciální úloha 2 - Pivovarství – místnost S55, začátek v 6:45 hodin Pozn: Na tuto úlohu je potřeba provést přípravu den předem – tj. během pondělka – po předchozí domluvě s panem Jungem – místnost S55, telefonní číslo 4078 Vedoucí úlohy: Ing. Marcel Karabín, PhD Vyučující: R.Jung, Ing. Karabín, Ing. Cejnar, Ing. Jelínek Speciální úloha 3 - Kontinuální kultivace a kinetika úbytku substrátu podél výšky lože náplňového reaktoru – místnost S55 b, začátek v 9 hodin Vedoucí úlohy: Ing. Martin Halecký, PhD Vyučující: Ing. Halecký, Ing. Strejc Speciální úloha 4- Kultivace mořských mikroorganismů – místnost K04, začátek v 8:30 hodin Vedoucí úlohy: Ing. Humhal Vyučující: Ing. Humhal, Ing. Ježdík, Ing. Kvasničková Speciální úloha 5 – Charakterisktika toku fází - rozložení dob prodlení, ideální tok, pístový tok, neideální tok v náplňovém bioreaktoru – místnost S55, začátek v 8:30 hodin Vedoucí úlohy: Ing. Jan Strejc Vyučující: Ing. Strejc, Ing. Čadková
Speciální úlohy – rozdělení skupin 20.10. Mořské mikroorganismy skupina 1 vyučující: Ing. Humhal, Ing. Ježdík místnost bude doplněna, začátek 8:30
27.10. Mořské mikroorganismy skupina 1 vyučující: Ing. Humhal, Ing. Ježdík
Pivovarství skupina 2 vyučující: R. Jung, Ing. Karabín místnost S55, začátek 6:45 Sladařství skupina 3 vyučující: Ing. Jelínek, Ing. Brožová místnost S57, začátek 8:00 Charakteristika toku fází skupina 4 Vyučující: Ing. Strejc, Ing. Čadková místnost S55, začátek 8:30 Kontinuální kultivace – náplňový reaktor skupina vyučující: Ing. Halecký, Ing. Strejc místnost S55 b, začátek 9:00
3.11. Sladařství
10.11. Sladařství
skupina 1 vyučující: Ing. Jelínek, Ing. Brožová místnost S57, začátek 8:00
skupina 1 vyučující: Ing. Jelínek, Ing. Brožová, Ing. Karabín
Pivovarství skupina 2 vyučující: Ing. Jelínek, Ing. Cejnar
Charakteristika toku fází skupina 2 Vyučující: Ing. Strejc, Ing. Čadková místnost S55, začátek 8:30
Charakteristika toku fází skupina 2 Vyučující: Ing. Strejc, Ing. Čadková
Sladařství
Kontinuální kultivace – náplňový reaktor skupina 3 vyučující: Ing. Halecký, Ing. Strejc místnost S55 b, začátek 9:00 Pivovarství skupina 4 vyučující: R. Jung, Ing. Karabín místnost S55, začátek 6:45
Kontinuální kultivace – náplňový reaktor skupina 3 vyučující: Ing. Halecký, Ing. Strejc
skupina 3 vyučující: Ing. Jelínek, Ing. Karabín Charakteristika toku fází skupina 4 Vyučující: Ing. Strejc Ing. Čadková Kontinuální kultivace – náplňový reaktor skupina vyučující: Ing. Halecký,Ing. Strejc
Mořské mikroorganismy skupina vyučující: Ing. Humhal, Ing. Kvasničková místnost bude doplněna, začátek 8:30
Pivovarství skupina 4 vyučující: Ing. Jelínek, Ing. Cejnar
Mořské mikroorganismy skupina vyučující: Ing. Humhal, Ing. Kvasničková
MODELOVÁNÍ BIOPROCESŮ - 24.11. a 8.12. 2015, začátek v 9 h, zasedací místnost FCHI Výuka bloku modelování a řízení bioprocesů bude probíhat formou přednášek a úloh, ve kterých budou data naměřená v předchozích úlohách využita pro modelování průběhu bioprocesů. Je nutné, aby měl každý student na tento blok k dispozici vlastní notebook (ne tablet). Vedoucími tohoto bloku jsou Ing. Martin Halecký, PhD a Ing. Jana Finkeová, CSc. Vyučované úlohy: Chemická kinetika Simulace dynamického chování chemostatu Identifikace parametrů matematického modelu Bilance tepla a regulace teploty SAMOSTATNÝ PROJEKT A JEHO PREZENTACE – 1.12. a 15. 12. 2015 1.12.2015 je volno na přípravu prezentace samostatného projektu. Vlastní prezentace proběhne dne 15.12.2015 v zasedací místnosti FCHI od 9 hodin Každá skupina si vylosuje jednu z dříve řešených úloh (základní nebo speciální), k této úloze si sežene od ostatních skupin, které dané téma řešily, naměřená data. Členové skupiny poté SPOLEČNĚ zpracují všechna naměřená data a připraví 15 min prezentaci, ve které se soustředí zejména na: a) Stručný a výstižný teoretický úvod k dané problematice b) Krátké shrnutí metodiky práce c) Souhrnnou prezentaci všech naměřených výsledků d) Jasné závěry z naměřených dat e) Porovnání naměřených dat s literárními údaji Prezentovat budou VŠICHNI ČLENOVÉ SKUPINY, ne pouze jeden zástupce. Po ukončené prezentaci bude následovat diskuze, členové skupiny musí mít o prezentované problematice přehled a být připraveni odpovědět na otázky členů komise i svých kolegů.
