FENOMENA GAGAL BERPISAH, EPISTASIS, DAN NISBAH KELAMIN PADA Drosophila melanogaster

Fenomena Gagal Berpisah, Epistasis, dan Nisbah.…

FENOMENA GAGAL BERPISAH, EPISTASIS, DAN NISBAH KELAMIN PADA Drosophila melanogaster Ahmad Fauzi1, Aloysius Duran Corebima2 1

Pascasarjana Pendidikan Biologi, Universitas Negeri Malang 2 Jurusan Biologi, Universitas Negeri Malang [email protected]

ABSTRAK Gagal berpisah, epistasis, dan nisbah kelamin merupakan tiga dari beberapa fenomena yang sering dikaitkan dengan bahasan pola pewarisan sifat. Berbagai fenomena tersebut dapat ditemukan pada persilangan berbagai strain D. melanogaster. Tujuan penelitian ini adalah untuk memperlihatkan fenomena gagal berpisah, epistasis, dan nisbah kelamin yang terjadi pada berbagai persilangan D. melanogaster. Persilangan N x w, se x w, serta N x N secara berturut-turut digunakan untuk memperlihatkan fenomena gagal berpisah, epistasis, dan nisbah kelamin. Hasil penelitian ini memperlihatkan kemunculan anakan produk gagal berpisah pada persilangan N x w, rasio anakan F2 berupa 9:4:3 pada persilangan se x w, serta rasio kelamin 1:1 pada persilangan N x N. Kata kunci: Drosophila melanogaster,

epistasis, gagal berpisah, nisbah kelamin

PENDAHULUAN Selama beberapa dekade terakhir, organisme model telah membantu para saintis dalam melakukan penelitiannya (Sengupta, 2014). Keberadaan dan pemanfaatan berbagai organisme model juga telah berperan besar dalam perkembangan ilmu, termasuk biologi. Melalui organisme model tersebut, berbagai proses biologi dapat dipelajari dan diungkap (Bolker, 1995). Karakteristik organisme model yang memiliki laju pertumbuhan yang cepat, genom yang sederhana, tidak menghabiskan banyak biaya dalam perawatan, mudah dalam perawatan dan perbanyakan, serta strukturnya yang sederhana memudahkan peneliti dan ilmuwan dalam mempelajari berbagai fenomena biologi (Bolker, 1995; Sengupta, 2014). Salah satu contoh organisme model yang cukup populer dalam perkembangan dan penelitian biologi adalah D. melanogaster. Contoh pemanfaatan D. melanogaster dalam perkembangan dan penelitian biologi adalah terkait pengkajian berbagai fenomena yang berkaitan dengan pola pewarisan sifat. Berbagai fenomena yang berkaitan dengan pola pewarisan sifat dikembangkan dan ditemukan oleh para ilmuwan melalui persilangan berbagai strain D. melanogaster. Berbagai fenomena yang dimaksud, antara lain pautan, pautan kelamin, pindah silang, gagal berpisah, dan polygene (Klug, dkk,, 2012; Snustad dan Simmons, 2012: Corebima, 2013). Di beberapa negara, D. melanogaster juga telah sering digunakan sebagai media dalam mempelajari berbagai konsep biologi, khususnya pewarisan sifat. Karena siklus hidupnya yang singkat, D. melanogaster dapat digunakan sebagai objek penelitian selama

Prosiding Seminar Nasional Biologi 2016_ ISBN: 978‐602‐0951‐11‐9

beberapa generasi hanya pada satu tahun akademik saja (Flannery, 1997; Sengupta, 2014; Sofer dan Tompkins, 1994). Selain itu, keuntungan teknis seperti biaya perawatan yang tidak terlalu mahal, ukurannya yang tidak memakan banyak tempat, dan mudah dalam perawatannya semakin mempopulerkan D. melanogaster sebagai media pembelajaran di sekolah-sekolah di beberapa negara (Flannery, 1997 Jeszenszky, 1997; Sengupta, 2014; Sofer & Tompkins, 1994). Pemanfaatan D. melanogaster dalam kegiatan pembelajaran perlu dilakukan mengingat D. melanogaster memiliki sejarah yang cukup panjang dengan perkembangan penelitian di dunia biologi (Sengupta, 2014). Terlebih lagi, dengan memanfaatkan D. melanogaster, peserta didik lebih diberdayakan untuk melakukan kegiatan inkuiri selama mempelajari berbagai konsep biologi. Pembelajaran yang memfasilitasi peserta didik untuk melakukan hal yang sama dengan apa yang telah dilakukan oleh para peneliti tedahulu, yaitu kegiatan inkuiri, adalah cermin pembelajaran sains yang sesungguhnya (Srisawasdi, 2012). Untuk mendukung pembelajaran seperti demikian, diperlukan adanya sumber-sumber informasi yang mendukung dan mendorong pendidik untuk melakukan pembelajaran tersebut. Salah satunya adalah melalui informasiinformasi tata cara pemanfaatan D. melanogaster dalam mengungkap berbagai fenomena biologi. Pada penelitian ini, peneliti bertujuan untuk memperlihatkan bahwa D. melanogaster dapat mendemonstrasikan beberapa fenomena yang berkaitan dengan pola pewarisan sifat. Beberapa fenomena yang dimaksud adalah gagal berpisah, epistasis, dan nisbah

283


kelamin. Pada fenomena gagal berpisah, kemunculan anakan yang tidak sesuai rekonstruksi persilangan dimungkinkan karena kegagalan berpisah kromosom saat gametogenesis. Pada fenomena epistasis, ekspresi suatu gen akan ditutupi oleh gen lain yang mengkodekan sifat yang sama. Di sisi lain, nisbah kelamin adalah perbandingan atau rasio jumlah jantan dibandingkan dengan betina pada suatu populasi. (Klug, dkk,, 2012; Snustad dan Simmons, 2012: Corebima, 2013). METODE PENELITIAN 1) Penyiapan organisme dan kondisi lingkungan D. melanogaster strain Normal (N), white (w), dan sepia eyes (se) dari Laboratorium Genetika FMIPA UM digunkana dalam penelitian ini (Gambar 1.). Lalat dikultur di dalam botol gelas berbentuk silinder bervolume 200 ml, dengan diameter 7 cm dan tinggi 9 cm. Botol tersebut diisi medium standard sebanyak 30 ml. Kultur lalat tersebut disimpan di ruang penelitian dengan kisaran temperatur lingkungan alami, yaitu 25-30 o C.

2) Komposisi medium Medium terdiri dari ± 2500 ml air, 700 g pisang (varietas Raja Mala), 200 g tape singkong, dan 100 g gula merah. Campuran tersebut di masak selama 45 menit. Medium tersebut cukup digunakan untuk mengisi 35 gelas kultur. 3) Gagal berpisah Persilangan strain N x w (P1) digunakan untuk memperlihatkan kemunculan fenomena gagal berpisah pada D. melanogaster. Anakan F1 yang muncul dicatat dan bila ada anakan yang tidak sesuai rekonstruksi kromosom, maka diasumsikan sebagai anakan produk gagal berpisah. 4) Epistasis Persilangan strain se x w (P1) digunakan untuk memperlihatkan keberadaan fenomena epistasis pada D. melanogaster. Anakan dari persilangan tersebut (F1) digunakan sebagai P2. Anakan dari P2 (F2) dicatat untuk dianalisis lebih lanjut menggunakan rekonstruksi kromosom dan uji chi square. 5) Nisbah kelamin Persilangan strain N x N digunakan untuk memperlihatkan nisbah kelamin pada D. melanogaster. Perbandingan antara anakan jantan dan betina dianalisis untuk mengetahui rasio kelamin pada persilangan tersebut. HASIL DAN PEMBAHASAN

A

B

C Gambar 1. D. melanogaster strain N (kiri), w (tengah),

dan se (kanan)


1) Gagal berpisah Hasil rekonstruksi kromosom persilangan D. melanogaster strain N x w tertera pada Gambar 2. Rekonstruksi kromosom tersebut telah melibatkan kejadian gagal berpisah saat gametogenesis pada parental betina mata putih. Data penelitian persilangan tertera pada Tabel 1. Berdasarkan data hasil persilangan yang tertera di Tabel 2, dapat diketahui bahwa ada beberapa anakan produk gagal berpisah yang muncul, yaitu pada persilangan ulangan 1 hingga 4. 2) Epistasis Hasil rekonstruksi kromosom persilangan se x w tertera pada Gambar 3. Berdasarkan rekonstruksi kromosom tersebut, dapat diketahui bahwa rasio fenotip F2 yang diharapkan adalah 9 (N) : 3 (se) : 4 (w). Rasio tersebut digunakan sebadai dasar frekuensi harapan pada uji chisquare. Hasil uji chi-square persilangan se x w tersebut tertera pada Tabel 2.

284


Tabel 1. Data persilangan D. melanogaster strain w x N Fenotip F2 Ulangan 1 Ulangan 2 Ulangan 3

Ulangan 4

Ulangan 5

Anakan normal

N♀

1

1

1

1

0

Total 4

w♂

68

64

13

40

98

283

Produk gagal berpisah

N♂

66

90

16

59

86

317

w♀

0

0

1

2

0

3

Gambar 2. Rekonstruksi kromosom persilangan D. melanogaster strain N x e

Tabel 2. Analisis data persilangan D. melanogaster strain se x w Persilangan se x w

F2

f0

fh

fo-fh

(fo-fh)2

Chi tabel

N

410

419,0625

-9,0625

82,12890625

0,195982476

se

131

139,6875

-8,6875

75,47265625

0,540296421

w

204

186,25

17,75

315,0625

1,691610738

745

745

Total

2,427889635

5,991465

Tabel 3. Analisis data persilangan D. melanogaster strain N x N Persilangan

Jenis Kelamin

NxN

♂

192

209,5

-17,5

306,25

1,46181384

♀

227

209,5

17,5

306,25

1,46181384

Total

f0

419

fh

fo-fh

419


(fo-fh)2

Chi tabel

2,923627685

3,84

285


= tanda kromosom y Gambar 3. Rekonstruksi kromosom persilangan D. melanogaster strain se x w

Gambar 4. Jalur biokimia pigmentasi warna mata pada D. melanogaster (sumber: Thiemann, 2001)

Berdasarkan hasil uji chi-square, dapat diketahui bahwa nilai chi hitung (2,42) < chi tabel (5,99). Dengan demikian, dapat disimpulkan bahwa hipotesis yang


berbunyi rasio anakan F2 berupa 9 (N) : 3 (se) : 4 (w) diterima. 3) Nisbah kelamin

286


Data hasil persilangan D. melanogaster strain N x N tertera pada Tabel 3. Berdasarkan hasil uji chi-square pada Tabel 3., dapat diketahui bahwa nilai chi hitung (2,92) < chi tabel (3,84). Dengan demikian, dapat disimpulkan bahwa hipotesis yang berbunyi nisbah kelamin D. melanogaster berupa perbandingan 1:1 diterima. Pada penelitian ini, D. melanogaster digunakan sebagai organisme model untuk menampilan fenomena gagal berpisah, epistasis, dan nisbah kelamin. Pada fenomena gagal berpisah, persilangan yang digunakan adalah antara strain N dengan w. Sesuai dengan data pengamatan, sebagian besar anakan adalah betina N dan jantan w. Kedua fenotip anakan tersebut merupakan anakan yang muncul secara normal. Sebagian kecil anakan yang muncul adalah jantan N dan betina w. Kedua fenotip anakan tersebut lah yang merupakan anakan hasil produk gagal berpisah. Kemunculan anakan hasil produk gagal berpisah disebabkan oleh terbentuknya gamet abnormal pada parental betina. Gamet abnormal yang dimaksud adalah gamet w/w dan 0. Arti kedua simbol tersebut adalah gamet w/w merupakan gamet yang membawa dua kromosom X sekaligus, sedangkan gamet 0 merupakan gamet yang tidak membawa kromosom X sama sekali. Terbentuknya dua gamet abnormal tersebut disebabkan oleh kegagalan kromosom berpisah saat pembelahan meiosis ketika pembentukan gamet, tepatnya saat anafase. Akibatnya, ada kutub yang menerima dua kromosom X sekaligus dan ada kutub yang tidak menerima kromosom X sama sekali. Hal tersebut menyebabkan ketika sel telah benar-benar membelah, ada sel yang membawa dua kromosom X dan ada sel yang tidak membawa kromosom X (Klug, dkk,, 2012; Snustad dan Simmons, 2012: Corebima, 2013). Selain dua genotip anakan normal dan dua genotip anakan produk gagal berpisah, ada dua genotip lain yang berpotensi terbentuk saat gagal berpisah terjadi. Dua genotip tersebut, yaitu www dan Y (pada rekonstruksi kromosom Gambar 2. disimbolkan dengan 0). Genotip anakan yang hanya mendapatkan kromosom Y saja akan mati. Hal tersebut disebabkan kromosom X membawa berbagai gen esensial yang dibutuhkan saat perkembangan D. melanogaster. Karena individu tersebut tidak membawa kromosom X, maka individu tersebut mati. Fenomena kedua yang ditunjukkan pada penelitian ini adalah epistasis. Epistasis adalah fenomena ketika ekspresi suatu gen tidak tampak karena tertutup ekspresi gen lain (Corebima, 2013). Fenomena tersebut ditampilkan melalui persilangan dihibrid antara strain se dengan w. Kedua strain tersebut mengalami mutasi pada gen yang mengatur karakter yang sama. Karakter yang


dimaksud adalah warna mata. Dalam mendemonstrasikan fenomena epistasis tersebut, diperlukan persilangan hingga generasi kedua. Berdasarkan hasil analisis data, dapat diketahui bahwa rasio anakan F2 yang dihasilkan dari persilangan antara strain se x w memenuhi perbandingan 9 (N) :3 (se) :4 (w). Genotip wse yang terbentuk akan berfenotip mata putih. Hal tersebut dikarenakan ekspresi mata sepia atau mata hitam tertutupi oleh ekspresi mata putih. Alasan mengapa hal tersebut dapat terjadi dapat dilihat berdasarkan jalur reaksi biokimia pigmentasi mata yang diilustrasikan pada Gambar 4. berikut. Berdasarkan jalur reaksi biokimia pigmentasi mata yang diilustrasikan pada Gambar 4., dapat diketahui bahwa kerja produk dari gen white berkaitan dengan transportasi GTP dan triptofan dari luar sel ke dalam sel mata. Di lain sisi, kerja produk gen sepia berkaitan dengan pengubahan tetrahydrobipterin menjadi pyrimododiazepine. Informasi lain yang dapat diambil dari Gambar 4. tersebut adalah kerja dari produk gen white mendahului kerja dari produk gen sepia ketika pigmentasi warna mata berlangsung. Artinya, bila gen white mengalami mutasi yang mengakibatkan produk gen white tidak terbentuk, seluruh reaksi biokimia setelahnya tidak akan terjadi. Hal tersebut dikarenakan substrat yang dibutuhkan selama pigmentasi warna mata tidak dapat masuk ke dalam sel. Akibatnya, ketika anakan F2 bergenotip w, baik individu tersebut membawa genotip se+ ataupun se, maka warna mata individu tersebut tetap akan berwarna putih. Fenomena lain yang ditampilkan pada penelitian ini adalah nisbah kelamin pada D. melanogaster. Sesuai dengan hasil analisis data, dapat diketahui bahwa nisbah kelamin D. melanogaster memenuhi rasio 1:1. Artinya, jumlah anakan jantan tidak berbeda dengan jumlah anakan betina. Nisbah kelamin anakan dari persilangan sesama strain N pada D. melanogaster yang memenuhi rasio 1:1 ini sesuai dengan laporan penelitian yang dilaporkan oleh Karmana (2010). Berkaitan dengan nisbah kelamin pada D. melanogaster, penentuan jenis kelamin pada serangga tersebut tidak hanya didasarkan pada keberadaan kromosom Y pada tubuh. Artinya, belum tentu individu bergenotip XY akan berfenotip sebagai jantan, begitu pula individu yang tidak membawa kromosom Y belum tentu berjenis kelamin betina. Sesuai penjelasan Baker dan Belote (1983), penentuan jenis kelamin D. melanogaster lebih ditentukan dari perbandingan jumlah kromosom X dengan jumlah set autosomnya (rasio X:A). Contoh perbandingan tersebut adalah individu yang hanya membawa satu kromosom X dengan jumlah set autosomnya 2 akan berfenotip jantan (rasio X:A adalah 1:2) , sedangkan individu yang membawa dua kromosom

287


X dengan jumlah set autosom 2 akan berfenotip betina (rasio X:A adalah 1:1) (Baker dan Belote, 1983). Hasil persilangan sesama strain N yang menghasilkan nisbah kelamin 1:1 pada penelitian ini dapat diterima karena secara normal, 50% anakan dari persilangan tersebut akan membawa kromosom XX dan 50% anakan membawa kromosom XY. Dengan demikian, 50% anakan membawa dua kromosom X dan 50% anakan membawa satu kromosom X. Secara normal, seluruh anakan D. melanogaster juga bersifat diploid. Artinya, anakan-anakan tersebut memiliki jumlah set autosom sebesar 2. Dengan menggunakan perbandingan X:A, maka dapat diketahui, 50% anakan akan memiliki perbandingan 1:1 dan 50% anakan memiliki perbandingan 1:2. Dengan demikian, nisbah kelamin anakan dari persilangan tersebut adalah 1 (jantan) : 1 (betina). Sesuai dengan data yang telah terkumpul dan analisis data yang telah dilakukan, terbukti bahwa fenomena gagal berpisah, epistasis, dan nisbah kelamin dapat didemonstrasikan dengan menggunakan D. melanogaster. Seperti yang telah dijelaskan di awal, pada fenomena gagal berpisah dan nisbah kelamin, persilangan sebanyak 1 generasi telah mampu mendemonstrasikan kedua fenomena tersebut. Pada fenomena epistasis, pendemonstrasian fenomena tersebut membutuhkan persilangan hingga generasi 2. Sesuai dengan penelitian yang telah dilakukan, waktu yang dibutuhkan untuk mendapatkan data hingga generasi 1 hanyalah sekitar 25 hingga 30 hari, sedangkan waktu yang dibutuhkan untuk mendapatkan data hingga generasi 2 hanyalah 40 hingga 50 hari. Penelitian ini merupakan langkah awal usaha peneliti untuk lebih mempopulerkan D. melanogaster sebagai organisme model yang tidak hanya digunakan di dunia penelitian, melainkan juga dalam dunia pendidikan. Penelitian-penelitian sejenis akan dilakukan dan penelitian pengembangan berbagai perangkat dan bahan ajar yang mendukung penggunaan D. melanogaster di dunia pendidikan akan dilakukan pada penelitian selanjutnya. Melalui langkah tersebut, diharapkan pemanfaatan D. melanogaster sebagai organisme model dalam pembelajaran semakin luas. SIMPULAN Berdasarkan penelitian yang telah dilakukan, dapat diketahui bahwa D. melanogaster merupakan organisme model yang mampu mendemonstraikan fenomena gagal berpisah, epistasis, dan nisbah kelamin.


DAFTAR PUSTAKA Baker BS dan Belote JM, 1983. Sex Determination and Dosage Compensation in Drosophila melanogaster. Ann. Rev. Genet. 17: 345-393. Bolker J A, 1995. Model systems in developmental biology. BioEssays, 17(5): 451-455. Corebima AD, 2013. Genetika Mendel. Surabaya: Airlangga University Press. Flannery CM, 1997. Models in biology. American Biology Teacher, 59(4): 244-248. Jeszenszky WA, 1997. Managing the fruit fly experiment. American Biology Teacher, 59(5): 292294. Karmana IW, 2010. Nisbah Kelamin pada Persilangan Homogami D. melanogaster Strain Normal (N), white (w), dan sepia (se). GeneC Swara, Edisi Khusus. 4(3): 13-19. Klug WS, Cummings MR, Spencer CA, dan Palladino, MA, 2012. Concepts of Genetics, Tenth Edition. San Francisco: Pearson Education, Inc. Sengupta S, 2014. Model Organisms: Living Laboratories. pp. 27-30 in Khan HJ (ed) Science Reporter Vol. 51. A CSIR Publication, NISCAIR, New Delhi. Snustad DP dan Simmons MJ. 2012, Principles of Genetics, Sixth Edition. New Jersey: John Wiley & Sons, Inc. Sofer W dan Tompkins L, 1994. Genetics in the classroom - drosophila genetics in the classroom. Genetics, 136, 417-422. Srisawasdi N, 2012. Introducing Students to Authentic Inquiry Investigation Using an Artificial Olfactory System. pp 93-106 in Tan and Kim (eds). Issues and Challenges in Science Education Research. Dordrecht: Springer. Thiemann TC, 2001. Genotype to Phenotype: Investigating Eye Color Mutations Using Chromatography. http://www.public.asu.edu/~thoffman/commonfiles/ lsc348/lsc348drosophilaeyepigment.pdf. Diunduh tanggal 13 Februari 2016.

288

FENOMENA GAGAL BERPISAH, EPISTASIS, DAN NISBAH KELAMIN PADA Drosophila melanogaster

Recommend Documents