Doktori iskola megnevezése. Biológiai és Sportbiológiai Doktori Iskola. Doktori iskola vezetője. Dr. Gábriel Róbert egyetemi tanár

Doktori iskola

Vezető

Biológiai és Sportbiológiai Doktori Iskola

Dr. Gábriel Róbert egyetemi tanár

Doktori iskola megnevezése Biológiai és Sportbiológiai Doktori Iskola Doktori iskola vezetője Dr. Gábriel Róbert egyetemi tanár Doktori iskola címe Biológiai Doktori Iskola PTE TTK Biológiai Intézet 7624 Pécs, Ifjúság u.6. Szakmai célok A Biológiai és Sportbiológiai Doktori Iskola tudományos képzést biztosít kiemelkedő képességű természettudományi, orvosi vagy agrár diplomával rendelkező fiatalok számára, akik pályájukat a tudományos kutatás vagy a felsőoktatás területén kívánják folytatni. Az Iskola célja, hogy korszerű elméleti és gyakorlati ismereteket nyújtson, és önálló kutatói tevékenységre készítse fel azokat a fiatalokat, akik a biológia és sporttudományok különböző területeinek művelése iránt éreznek elhivatottságot. Kutatási témák/témafelelősök A BDI keretében genetika, mikrobiológia, növénybiológia, ökológia, sportbiológia és szabályozásbiológia témacsoportok működnek, melyeken belül az alábbi kutatási témákban vehetnek részt PhD hallgatók: Genetika Természetes és mesterséges agrobaktérium rezisztencia szőlőben. (Dr. Putnoky Péter) A hazánkban előforduló virális zoonózisok vizsgálata: gyakoriságuk felmérése, molekuláris jellemzésük és potenciális klinikai szerepük megismerése (Dr. Jakab Ferenc) Vonuló madárfajok populációgenetikája a költő és telelőterületeken (Dr. Hoffmann Gyula, Dr. Mátics Róbert) Mikrobiológia Oxidatív stressz folyamatok szabályozási mechanizmusainak kutatása egysejtű gombáknál (Dr. Pesti Miklós) Gazda-parazita kölcsönhatás molekuláris vonatkozásai. (Dr. Fekete Csaba) Növénybiológia Az oxidatív stressz élettana növényekben (Dr. Hideg Éva) Az ultraibolya (UV) sugárzás hatásai növényekre (Dr. Hideg Éva) A foszfatidilglicerin szerepe a sejtosztódásban (Dr. Gombos Zoltán) Az indukált rezisztencia és a priming élettani és molekuláris háttere növény-kórokozó kölcsönhatásokban. (Dr. Jakab Gábor)

Növényi biotikus és abiotikus stresszválaszok (Dr. Jakab Gábor) Vegetációtan (Dr. Borhidi Attila) Trópusi növénytaxonok rendszertana (Dr. Borhidi Attila) Vegetációökológiai vizsgálatok nedves gyepeken (Salamonné dr. Albert Éva) Erdőtársulások cönológiai vizsgálata (Dr. Kevey Balázs Florisztikai és növényföldrajzi vizsgálatok (Dr. Kevey Balázs) Növényszövettani és –anatómiai vizsgálatok taxonómiai aspektusban (Dr. Darók Judit) Növényi szervek és szövetek morfometriája (Dr. Darók Judit) Molekuláris taxonómiai és filogenetikai vizsgálatok (Dr. Stranczinger Szilvia)

Gyümölcstermő fajok virág- és megporzásbiológiai vizsgálata (Dr. Farkas Ágnes) Méhészeti szempontból jelentős növényfajok nektár- és pollenprodukciójának vizsgálata, a nektár és a méz speciális komponenseinek meghatározása (Dr. Farkas Ágnes) Ökológia Vegetációökológia (Dr. Morschhauser Tamás) Vegetációtérképezés és -informatika (Dr. Morschhauser Tamás) Szüntaxonómiai és taxonómiai vizsgálatok (Dr. Csiky János) Szünbiológiai vizsgálatok városi-vidéki környezetben (Dr. Csiky János) Invázióbiológiai kutatások a növényvilágban (Dr. Pál Róbert) A szinantrop flóra és vegetáció vizsgálata (Dr. Pál Róbert) Vizi makrogerinctelen szervezetek vizsgálata (Dr. Csabai Zoltán) Költési és táplálkozási stratégiák (Dr. Purger Jenő) Szárazföldi gerinces fajok elterjedés-, szaporodás- és táplálkozásbiológiája (Dr. Purger Jenő) Táplálékforrások, szaporodási siker és predáció urbán környezetben (Dr. Purger Jenő) Társulásszerveződési folyamatok gyepekben (Dr. Bartha Sándor)

Kisemlős populációk tér és időbeli mintázata különböző erdős területeken (Dr. Horváth Győző) Az északi pocok (Microtus oeconomus) szubpopulációk természetvédelmi biológiája a KisBalatonon (Dr. Horváth Győző) A kisemlősök közösségek emberi beavatkozások hatására kialakuló változása különböző élőhelyeken (Dr. Horváth Győző) Sportbiológia Fittségi vizsgálatok (Dr. Wilhelm Márta) Stressz, sport, immunrendszer (Dr. Wilhelm Márta) Edzés hatására bekövetkező mikrosérülések és adaptációs mechanizmusok a disztrofiás izomban (Dr. Váczi Márk) Az emberi mozgások modellzése és mesterséges szabályozása, ember-gép kapcsolat az orvosi rehabilitációban (Dr. Laczkó József) Szabályozásbiológia Retina kutatás submammális állatokban. (Dr. Gábriel Róbert) Neurodegeneráció és neuroprotekció emlős retinában. (Dr. Gábriel Róbert) A prefrontális kéreg elektrofiziológiája (Dr. Hernádi István) In vivo neurofiziológiai és elektrokémiai vizsgálatok rágcsáló agyban (Dr. Hernádi István) Tanulási és memória-folyamatok farmakológiai befolyásolása rágcsálókban (Dr. Hernádi István) Kognitív folyamatok pszichofiziológiai korrelátumai humén és nem-humán főemlős agyban. (Dr. Hernádi István) Mechanikai és termális nocicepció magatartási és farmakológiai folyamatainak vizsgálata emlős modellben és emberben (Dr. Hernádi István)

Integratív folyamatok celluláris és molekuláris alapjai a szaglás folyamatában gastropodakban. (Dr. Elekes Károly) A táplálkozási magatartás efferens kapcsolatrendszerei, szinaptológiája és szinapatikus membránkompartmentalizációja gastropodakban.(Dr. Elekes Károly) Az agydúc regenerációja oligochaeta gyűrűsférgekben (Dr. Molnár László) Peptiderg neuronok, neuronhálózatok azonosítása gerinctelen modell-állatokban (Dr. Pollák Edit) Dopamin- és szerotonin-receptor egymásrahatás molekuláris mechanizmusának vizsgálata gerinctelem modelleken.(Dr. Kiss Tibor) Neuroimmun kölcsönhatások (Dr. Wilhelm Márta) Stressz indukált sejt szintű és molekuláris változások egyszerű neurális-hálózatokban (Dr. Pirger Zsolt) Xenobiotikumok kiváltotta neurodegenerációs változások egyszerű modell szervezetek központi és perifériás idegrendszerében (Dr. Pirger Zsolt) A nukleozidok megoszlása és funkciói a központi idegrendszerben (Dr. Kovács Zsolt) Hipofízis adenilát cikláz aktiváló polipeptid (PACAP) szerepe az emlős retina posztnatális fejlődésében (Dr. Dénes Viktória) Virális tracer alkalmazása retinális neuronhálózatok morfológiai és elektrofiziológiai vizsgálatára (Dr. Völgyi Béla) A felvételi általános és speciális feltételeit és a képzés tartalmi követelményeit a Biológiai és Sportbiológiai Doktori Iskola Szabályzata részletezi. A BDI az alábbi PhD kurzusokat hirdeti meg: I: Kötelezően teljesítendő kurzusok: Felelős Oktató Tematika

Dr. Gábriel Róbert

Elnevezés Szakirodalmi angol

Kredit 2

Oktató intézet Biológiai Intézet

Az angol szaknyelv kifejezésrendszerének, belső logikájának megismertetése és alkalmazása. Biztonságos kommunikációs készség kifejlesztése a résztvevő hallgatókban. Konferencia jellegű kommunikáció angol nyelven. A Science, Scientific American és Nature c. folyóiratok tudományos kommentárjainak, a National Geographic biológiai és környezettudományi tárgyú cikkeinek fordítása megbeszélése.

Felelős Oktató Tematika

Elnevezés Biostatisztika

Kredit 2


Dr. Csabai Zoltán Kutatás- és kísérlettervezési alapismeretek, mintavételi és adatfelvételi módszerek, mintavételi elrendezések, mintaszám és mintanagyság meghatározása, kísérleti elrendezések. Statisztikai alapfogalmak, adattípusok, skálatípusok, függő és független változók, nevezetes adateloszlások, standardizálás és adattranszformációk. Parametrikus és nem parametrikus döntéshozó próbák, regresszióanalízis, függetlenség, homogenitás és illeszkedés vizsgálat. Többváltozós módszerek: hierarchikus osztályozások és ordinációs módszerek (PCA, CCA, CoA,

CCoA, PCoA, NMDS). A statisztikai elemzések eredményeinek értelmezése és prezentálása. Felelős Oktató Tematika

Dr.Fekete Csaba

Elnevezés Kredit A 2 szakirodalmazás elmélete és gyakorlata


Irodalomgyűjtés, számítógépes szakirodalmazás. Publikáció stratégiák és publikációírás. Pályázatírás. Szakmai prezentációk. Külföldi szakmai utak. A kutatói pálya várható eseményei, egyéni karrierek a diplomamunkától az önálló kutatási tevékenységig. Alap és alkalmazott kutatás viszonya. Egyéni és csapatmunka viszonya. Munkahelyválasztás, váltás. Kutatóhelyek szakmai kultúrája. Témaválasztás jelentősége. Önéletrajzírás. Hazai és nemzetközi kapcsolatrendszer kialakítása. A szakma íratlan etikai, emberi törvényei. Pályázatírás kultúrája. A konzorciumi pályázatok kultúrája. A kutatás egyéb forrásai: szerződések, alapítványok, spin-off cégek.

Tematika

Felelős Oktató Elnevezés Kredit Oktató intézet Dr. Putnoky Bioinformatika 2 Biológiai Intézet Péter I. Nukleotidszekvencia adatbázisok, fehérjeszekvencia adatbázisok. Az adatbázis rekord felépítése. Szöveg alapú adatbázis-keresés. Génkereső programok, jellegzetes szekvenciamotívumok. Az ORF Finder és a GeneMark-HMM program használata. Elemzés szekvenciák összehasonlításával: a BLAST programcsalád használata, az eredmények értelmezése, E-érték (expect value), a hasonlóság és azonosság fogalma, DNS-szekvenciák elemzése, szekvenálási hibák és kódoló keretek azonosítása. Proteinszekvenciák elemzése: a helyettesítési táblázat (scoring matrix), az alacsony komplexitású szekvenciák. Több szekvencia egymáshoz illesztése, filogenetikai elemzések és megfontolások, a ClustalW program. Fehérjeszekvenciák elemzése: domének és fehérjemotívumok szekvenciáit tartalmazó adatbázisok, a pattern fogalma és a PROSITE pattern adatbázis, a profil fogalma és a PROSITE profile adatbázis, a Pfam (Protein families database), a BLOCKS és a PRINTS és az SBASE adatbázisok, transzmembrán doméneket valószínűsítő programok: a TMHMM, TopPred és a DAS, szignálpeptidek predikciója és a SignalP program.

II. Szabadon választható kurzusok: Felelős Oktató

Elnevezés

Kredit

Oktató intézet

Tematika



Dr. Atlasz A hypoxia/ 2 Sporttudományi Tamás hyperoxia Intézet hatása az ingerlékeny szövetekre A kurzus során a hallgatók elsajátítják a hypoxia/hyperoxia lehetséges sejtkárosító hatását emlős retinán. Ismeretet szerezhetnek a károsodott retina alapvető detektálási módszereiről. A kurzus során ugyancsak betekintést nyerhetnek a hallgatók a hiperglikémia szerepéről koraszülött retionopáthia esetén. A kurzus foglalkozik az inzulin lehetséges hatásával retinopáthiában. A hallgatók megismerhetik a hypoxia, valamint a dohányzás okozta károsodás komplex hatását. Aktuális szakirodalmi kitekintés a retinakárosodások témakörben, különös tekintettel hypoxia/hyperoxia esetén. Retinakárosodás létrehozása, lehetséges retinaprotekció alkalmazása állatkísérletben. Adatgyűjtési és adatfeldolgozási módszerek elsajátítása. Elnevezés Kredit Oktató intézet Dr. Borhidi Magyarország 2 Biológiai Intézet Attila fátlan növénytársulásai Vízi növánytársulások (Lemnetea, Utricularietea, Charetea fragilis, Potametea), Mocsári és lépi növényzet (Isoeto-Litorelletea, IsoetoNanojuncetea, Phragmiti-Magnocariceatea, Montio-Cardaminetea, Scheuchzerio-Caricetea fuscae, Oxycocco-Sphagnetea), Kaszálók és magasfűvű rétek (Molinio-Arrhenatherea) sovány legelők és törpecserjések (Calluno-Ulicetea)., kontinentális sziknövényzet (TheroSuaedetea, Festuco-Puccinellietea, Scorzonero-Juncetea gerardii), sziklahasadék növényzt (Asplenietea trichomanis), pionír és szárazgyepek (Koelerio-Corynephoretea), Száraz és félszáraz sziklai és pusztai gyepek (Festuco-Brometea)

Elnevezés Kredit Oktató intézet Dr. Borhidi Magyarország 2 Biológiai Intézet Attila erdőtársulásai Lomblevelű erdők: Folyóparti füzesek, (Salicetea purpureae,) Láperdők és lápcserjések (Alnetea glutiosae), Mezofil lombos erdők (Querco-Fagetea), Szubmediterrán és szubkontinentális xeroterm erdők (Quercetea pubescentis ), Tűlevelű erdők: Xeroterm fenyvesek (Erico-Pinetea), Kontinentális xeroterm fenyvesek (Pulsatillo-Pinetea), Hegyvidéki tűlevelű erdők (VaccinioPiceetea), Cserjések: száraz és mezofil csrjések (Rhamno-Prunetea), Erdei vágásnövényzet (Epilobitea angustifolii), Erdőszegély társulások (TrifolioGeranietea)

Felelős Oktató Dr. Borhidi

Elnevezés Virágos

Kredit 2


Tematika

Attila

növények rendszertana A virág fejlődése. A virágos növények főbb csoportjai, Nyitvatermőkzárvatermők. Mesterséges, természetes és fejlődéstörténeti rendszerek. A molekuláris evolúció a virágos növények rendszerében. Apomorfia és pleziomorfia, a kladisztika szerepe a rendszerezésben, a parszimónia. Az ősszárvatermők rendszertana, az gyszikűek, az őskétszikűek és a valódi kétszikűek, szabad- és forrtszirmúak. A homoplázia esetei és magyarázatai. A molekuláris taxonómia dilemmái a növények rendszerezésében.

Felelős Oktató Dr. Borhidi Attila Tematika

Elnevezés Kredit Szüntaxonómiai 2 nomenklatúra


A Nemzetközi Növényszociológiai Nevezéktan Törvénykönyve. A szüntaxonómiai kód érvényességi területe. Definíciók, (Szüntaxon, Hierarchia, tényleges és érvényes közlés. A név törvényessége. A nevezéktani típus, homonímok, szinonímok, baionímok. Szerzői nevek, Konzervált nevek. Alapelvek: Szabályos és szabálytalan név, prioritás, visszaható érvényesség Szabályok és ajánlások. Felelős Oktató Tematika


Elnevezés Kredit Oktató intézet Dr. Borhidi Taxonómiai 2 Biológiai Intézet Attila nomenklatúra A Botanika és a mikológia nemzetközi nevezéktanának törvénykönyve, a botanikai kód. Alapelvek. Nevezéktani típus, Prioritás, Hierarchia, visszaható érvényesség, a latin nyelv kizárólagos használata. Szabályok és ajánlások. Rang, tipusalkotás, a prioritás érvénye és határai a különböző nagy növénycsoportokra és gombákra. A különböző rangkatergóriák nevezéktana. A hibridek nevezéktana. A termesztett növények nevezéktana Tényleges és érvényes közlés. Az auktorok idézése. Illegitim nevek. Gombák nevezéktana. Elnevezés Kredit Oktató intézet Dr. Borhidi Dinamikus 2 Biológiai Intézet Attila növényföldrajz A Föld flórabirodalmai. A növényföldrajzi tájegységek hierarchikus rendje. Flóraterület, flóratartomány, flóravidék, flórajárás. A Holarktisz, Paleotropisz, Neotropisz, Azstralisz, Kapenzisz és Antarktisz növényvilága. A tárgyalás menete mindenütt a geológiai korok történésinek tükrében tárgyalja a jelenlegi flóra kialakulását, vagyis a kontinensvándorlás, hegyképződés, denudáció folyamatainak függvényében. Ezt jelenti a dinamikus jelző és agyúttal a ismeretek új szemléletű feldolgozás

Felelős Oktató Dr. Borhidi Tematika Attila,

Elnevezés Kredit Vegetációértékelési 2 módszerek


Salamonné dr. Albert Éva A vegetációfelvételezés módszerei: kvadrát módszerek, transzekt módszerek. A vegetációfelvételek elemzésének szempontjai: rendszertani elemzések, életforma elemzések, chorológiai elemzések, elterjedési mintázatok, endemikus és vikariáns taxonok értékelése. Ökológiai elemzések: ökológiai indikátorértékek rendszerei és alkalmazhatóságuk. Indikátorfajok szerepe, természetességi értékszámok. Cönoszisztematikai elemzések, társulástani csoportosítások. Természetességi elemzések, a szociális magatartástípusok és a természetességi értékszámok rendszerei. Sokváltozós és statisztikai módszerek, programcsomagok a vegetációértékelés többszempontú végrehajtásához. Felelős Oktató Tematika


Elnevezés Kredit Oktató intézet Dr. Borhidi Vegetációkutatás 2 Biológiai Intézet Attila elmélete és gyakorlata A növénytakaró összetétele és komplexitása eltérő a különböző biomokban. Ezért egységeinek és az egységek hierarchiájának ismérvei különböző elméleti megfontolásokat és azokhoz illő mintavételi és vizsgálati módszereket igényel. Ennek megfelelően alakultak ki a vegetációkutatás különböző iskolái és módszerei. A veetációkutatásban kialakult legfontosabb iskolák, az amerikai szukcessziós iskola (Clements, Weaver), a skandináviai-orosz szociációs iskola (Cajander, Morozov, Du Rietz), a középeurópai Zürich-Montpellier-i asszociációs iskola (Braun-Blanquet, Tüxen) és a trópusi erdővegetáció formációs iskolája (Richards, Tansley és Watts).

Elnevezés Kredit Oktató intézet Dr. Csiky János, Nagy 2 Biológiai Intézet Dr. Botta-Dukát adatbázisok Zoltán alkalmazása a cönológiában A kurzus a cönológiai adatbázisok kialakulásának történetét, az adatbázisok jelenlegi állapotát, struktúráját mutatja be. Tárgyalja az adatbázisok és adatbáziskezelő programok felépítését a cönológiai adatok jellemzőinek függvényében. Különös figyelmet szentel az Európában elterjedten használt Turboveg adatbáziskezelő szoftver bemutatására. Bevezet a nagy adatbázisok kiértékeléséhez szükséges elméletek és módszerek rejtelmeibe, segít a Juice nevű programcsomag megismerésében és a társulásdefiníciók létrehozásában. Kitér az adatbázisok egyenetlenségeinek, hibáinak kezelésére, a lokális és nagy területre kiterjedő elemzések összehasonlítására, valamint az így kapott eredmények interpretálására, publikálására.

Felelős Oktató Dr. Csiky János Tematika

Elnevezés Kredit Flóra és 2 vegetáció városi környezetben


A város, mint élőhely kialakulása, evolúciója és főbb jellemzői. A városok florisztikai feltártsága. Az urbán-rurális grádiens jellemzői. A fajgazdagság mintázata városokban. A rich get richer és a poor get richer elmélet érvényessége városokban. Vonalas létesítmények és a flóra kapcsolata. A flóra feltárásának általános és a városokban jellemző speciális nehézségei. Sikeres városi özönfajok: funkcionális sajátságok. A városi klíma és a globális klímaváltozás párhuzamai. A vegetáció változása urbán-rurális grádiens mentén. Felelős oktató

Tematika


Elnevezés Kredit Oktató intézet Dr. Csoknya Az 2 Biológiai Intézet Mária idegrendszer összehasonlító morfológiája A kurzus az idegrendszer megjelenését, típusait, szerkezetűket tárgyalja. Ismertetésre kerül az idegrendszert felépítő idegszövetet: a neuron felépítése és típusai, a glia sejtes elemei. A neurontan. Ismertetésre kerülnek a receptorok és effektorok, a szinapszisok és típusai. Részletes ismertetésre kerülnek az idegrendszer megjelenési formái. A diffúz és központosult dúcidegrendszer. A diffúz idegrendszernél külön kiemelésre kerülnek: „primitív ganglionjai”, az izopoláris neuronok, az oligovesicularis szinapszisok. A dúcidegrendszer típusai: szelvényes hasdúclánc-, módosult hasdúclánc és a testtájanként elhelyezkedő dúcokból felépülő idegrendszer. Típus állatonként ismertetésre kerül az agy, a garatalatti dúc és egy hasi ganglion szerkezete. Elnevezés Kredit Oktató intézet Dr. Elekes Gerinctelen 2 Biológiai Intézet Károly állatok összehasonlító neurobiológiája Az előadás sorozat tárgyalja a gerinctelen állatok nagy csoportjait érintve az idegrendszer makro- és mikroanatómiai szerveződését, a szelvényezettség és szimmetria kérdését, továbbá az idegsejtek egyes típusait, osztályozásukat anatómia, funkció és kémiai jellemzőik szerint. Különös figyelmet fordítunk az élővilágban egyedülálló óriásneuronok és óriásaxonok jellegzetességeire, szerepére. Részletesen foglalkozunk az interneuronális kapcsolatok (szinapszisok) különböző formáival, ultrastruktúrális jellemzőivel és hírvivő anyagaikkal. Végül tárgyaljuk a magatartásformákat és élettani folyamatokat meghatározó neuronhálózatok felépítését, kapcsolatrendszereit, az alkalmazkodó képességet meghatározó magatartásformákat és az ezek hátterében álló neuronális és tanulási-memória folyamatokat.

Felelős Oktató Dr. Farkas Ágnes Tematika

Elnevezés Kredit A pollen 2 morfológiája, fiziológiája és

Oktató intézet PTE ÁOK Farmakognóziai Intézet

taxonómiai jelentősége Palinológia és résztudományai. A pollen kialakulása, fejlődése. A pollen terjedési egységei. Spóra- és pollenmorfológia: sporomorfák mérete, polaritása, alakja, szimmetriája. NPC rendszer, apertúra típusok. A pollenfal felépítése, a pollen felszíne. A pollen fény- és elektronmikroszkópos vizsgálata. A pollen taxonómiai jelentősége, pollen-határozókulcsok. A pollen fiziológiája. Pollen-életképesség vizsgálati módszerei. Pollenallergia.

Felelős Oktató

Elnevezés Kredit Oktató intézet Növényi 2 PTE ÁOK mikrotechnikai Farmakognóziai módszerek Intézet A kurzus során a hallgatók elsajátítják a külünböző növényi szövetek és sejtek tanulmányozására leggyakrabban alkalmazott vizsgálati módszereket. Nyúzat, macerátum, kézi keresztmetszet készítése, hisztokémiai festékek használata. Levélderítés. Növényi minták fixálása, beágyazása paraplasztba és műgyantába. Fénymikroszkópos vizsgálatra alkalmas metszetek készítése, festése, tartósítása. Pollenpreparátumok készítése morfológiai és életképességi vizsgálatok céljára. Mikrofotók készítése digitális fototechnikai módszerekkel. Mikrofotók kvalitatív és kvantitatív kiértékelése, mérési technikák elsajátítása. Dr. Farkas Ágnes

Tematika



Elnevezés Kredit Oktató intézet Dr. Farkas Ágnes Virágés 2 PTE ÁOK megporzásbiológiai Farmakognóziai vizsgáló módszerek Intézet Az egyes növényfajokra és -fajtákra jellemző virágstruktúrát és az ivarlevelek működését terepen és laboratóriumi körülmények között egyaránt vizsgáljuk. Hangsúlyt fektetünk a struktúra és funkció változásaira a virág egyedfejlődése és a virágzás fenológiai fázisai során. A hallgatók a kurzus során elsajátítják a pollen életképességének vizsgálati módszereit, a különböző kontrollált megporzási technikákat, valamint a pollentömlőhajtás és megtermékenyítés nyomonkövetésének in vivo és in vitro technikáit. Elnevezés Kredit Oktató intézet Dr. Fekete Csaba Funkcionális 3 Biológiai Genomika Intézet A funkcionális genomika előzményei: a strukturális genomika elméleti háttere és technológiai fejlődése. Genomprogramok a prokariótáktól az emberig. A genomkutatás megközelítési módjai: klasszikus vs. globális. A funkcionális genomika vizsgálati stratégiái. Az OMIC törekvések rendszerbe foglalása: proteomika, metabolomika.

Responsible lecturer Title Dr. Csaba Fekete Molecular

bases

Credit of 2

Hosted Institute

of

Course description

Felelős oktató Tematika


microbial phatogenesis Biology The course is concerned with modern aspects of microbiology closely related to the field of molecular biology. Lectures will be focused on current theories related to virulence factors determination, diagnosis and treatment of The lecture component covers the molecular features of the interactions between pathogens and the host, including the role of the immune system and the use of antimicrobial drugs in combating.

Elnevezés Kredit Oktató Intézet Dr. A gomba-növény 2 Biológiai Intézet Fekete kölcsönhatás Csaba molekuláris háttere és vizsgálati módszerei A kurzus betekintést nyújt a gazda-parazita párbeszéd egymást követő szakaszainak molekuláris történéseibe. Számos példán keresztül részletesen tárgyalja a mikrobiális kórokozók - főként, de nem kizárólag mikrogombák - támadási, és a növény védekezési stratégiáit. A hallgatók megismerkednek a gazda-kórokozó kapcsolat molekuláris, genomikai és poszt-genomikai vizsgálati módszereivel. A tudományterületről kialakított modern, holisztikus kép lehetővé teszi, hogy a PhD hallgatók a megszerzett általános érvényű elméleti és gyakorlati ismereteket közvetlenül felhasználhassák saját kutatásaikban. Elnevezés Kredit Dr. Gazdag Antioxidáns 2 Zoltán enzimek és molekulák mérése


Tárgyaljuk a reaktív oxigén gyökök keletkezésének folyamatait és fajtáit, az enzimatikus és fehérje antioxidáns védelmi rendszereket, antioxidáns enzimeket és molekulákat, szerepüket az oxidatív stresszel szembeni védekezésben, az oxidatív stressz által okozott adaptációt, sejtsérüléseket, ezeknek a kijavítását, valamint a sejthalált, a reaktív oxigén gyökök detektálását, reaktív gyökök, mint hasznos biomolekulák funkcióját, nehézfémek okozta stressz elleni védekezését az élesztő sejteknek, kiemelten a kromát (Cr(VI)) toxikus hatását, a fitokelatinok és metallotioneinek szerepét a nehézfémek elleni védekezésben.


Elnevezés Dr. Gábriel A Róbert neurobiológia aktuális problémái

Kredit 2


Neuronok modern sejtbiológiája. Ioncsatornafunkciók. Szinapszisok komplex működése. Gliasejtek funkciói. Neuronális degeneráció, regeneráció. Plaszticitás. Ritmikus neuronális működések. Felelős Oktató Tematika

Elnevezés Kredit Dr. Gábriel A 2 Róbert hagyományos és digitális fototechnika alapjai


Fénymikroszkópos felvételek készítése. Elektronmikroszkópos felvételek készítése. Hagyományos fekete-fehér negatívok kidolgozása. Elektronmikroszkópos negatívok kidolgozása. Pozitív képek készítése normál, fluoreszcens mikroszkópos és elektronmikroszkópos negatívokról. Digitális kamerák típusainak ismertetése. Digitális felvételek készítése. Az ADOBE Photoshop program ismertetése, használatának gyakorlása. Felelős Oktató Tematika


Elnevezés Kredit Oktató intézet Dr. Gombos Lipid-fehérje 2 MTA SzBK Zoltán kölcsönhatások Növénybiológiai fotoszintetikus Intézet szervezetek sejtfunkcióiba n A kurzus a fotoszintetikus membrán lipidjeinek a sejtfunkciókban betöltött szerepét mutatja be. A lipidek közül az anionos lipidek szerepét hangsúlyozzuk ki az elektrontranszport folyamatokban, valamint a lipidek szerepét sejtosztódásban az osztódási gyűrű kialakításáért felelős membránszerkezeti elemek bemutatásával Bemutatunk olyan cianobaktérium mutánsokat, melyekben a lipidszintézisért felelős enzimeket inaktiválták, és segítségükkel kimutatható volt a lipidek szerepe a hőmérsékleti és fény stresszekben. Az egyes és kettes fotokémiai rendszerek szerkezetének kialakításában a foszfatidilglicerinnek meghatározó jelentősége van, ezt mutatjuk be magasabbrendű növények és fotoszintetikus prokarióták segítségével. Elnevezés Kredit Oktató intézet Neuroelektrofizi 2 Biológiai Intézet ológia A tantárgy átalános célja a neuroelektrofiziológia tudományterületeinek bemutatása, a főbb, elterjedt kutatási módszerek és azok alkalmazhatóságának elméleti és gyakorlati megismertetése. Fontosabb témák: A neuroelektrofiziológia tárgya, története, alapfogalmak. Az elektrofiziológia kutatási módszerei, helye az élettani és fizikai Hernádi István

tudományokban. A biológiai membránok biofizikája, feszültségaktivált ioncsatornák: Az intracelluláris technika, voltage-clamp. A szinaptikus transzmisszió. A patch-clamp technika és alkalmazásai. A neurofarmakológia alapjai: Neurotranszmitterek fogalma, hatásmechanizmusaik. Receptor-specifikus agonisták/antagonisták használata a neurotranszmisszió vizsgálatára. Egy-sejt tevékenység vizsgálata a gyakorlatban. Extracelluláris elvezetési technikák in vivo környezetben (egysejttevékynség, populációs aktivitás, EEG). Neuromorfológiai és neurofiziológiai technikák közös alkalmazása. A neuronok működésének vizsgálata ingerléses technikákkal: Ingerlés feszültséggel és árammal. In vivo neurofarmakológia és elektrokémia: különböző technikai megközelítések neurotranszmiterek működésének vizsgálata in vivo környezetben. Kísérlettervezés, adatgyűjtési és adatfeldolgozási módszerek, statisztika.

Tematika

Felelős Oktató Elnevezés Hernádi István Tanulás memória

Kredit és 2


A tantárgy általános célja a memóriakutatás neurobiológiai megközelítésű tudományterületeinek bemutatása, valamint a főbb, elterjedt kutatási módszerek és azok alkalmazhatóságának megismertetése. A tantárgy tartalma, tematikája: I.Konceptuális alapok, kísérletes háttér. Öröklött és szerzett magatartás. Belső reprezentációk. A tanulás újraértelmezése: az agy, mint “gépezet”. A tanulás kvantifikációja. Történeti alapok. Experimentális paradigmák áttekintése. II. Molekuláris és celluláris folyamatok. Celluláris “memória-szerkezetek” egyszerű élőlényekben: az Aplysia, valamint a Hermissenda vizsgálata. Celluláris “memóriaszerkezetek” emlősökben, a hosszútávú potenciáció. Neurogenetika. A “memória-molekulák” és életciklusuk. III. A memória-rendszerek architektúrája. A belső reprezentációk komplexitása. Az "engram" topográfiája: funkcionális lokalizációs eljárások. Memória-rendszerek a gerinces agyban: kondícionált (feltételes) reflexek neurobiológiája madarakban és emlősökben. A hipokampusz és a kognitív térkép kísérletes vizsgálata. Az amnéziák, mint további memória-vizsgálati "eszközök". IV. Aktuális szakirodalmi kitekintés a tanulás és memória neurbiológiája témakörben, különös tekintettel a tanulási folyamatok neurofiziológiai értelmezésére. Komplex belső reprezentációk látási/hallási információk alapján (főemlős kognitív neurofiziológia).

Tematika

Felelős Oktató Elnevezés Hernádi István Behavioral neuroscience (angol)

Kredit 2


The aim of the course is to introduce biological foundations of animal and human behavior and to provide a firm ground to experimental

psychological research concepts and methodology. Main topics of the course: 1. Functional Neuroanatomy: The Nervous System and Behavior. 2. Neurophysiology: Conduction, Transmission, and the Integration of Neural Signals. 3. The Chemical Bases of Behavior: Neurotransmitters and Neuropharmacology. 4. Hormones and the Brain. 5. Evolution of Brain and Behavior. 6. Life-Span Development of the Brain and Behavior. 7. General Principles of Sensory Processing, Touch, and Pain, Hearing, Vestibular Perception, Taste, and Smell. 8.Vision: From Eye to Brain. 9. Motor Control and Plasticity. 10. Sex: Evolutionary, Hormonal, and Neural Bases. 11. Homeostasis: Active Regulation of Internal States. 12. Biological Rhythms, Sleep, and Dreaming.

Tematika

Tematika

Felelős Oktató Hernádi István

Elnevezés Kredit Psychophysiology 2 (angol)

Oktató intézet PTE TTK Biológiai Intézet The aim of the course is to provide basic conceptual and methodological knowledge for understanding physiological correlates of psychological aspects of human behavior and cognition. The main topics of the course are: 1. Definition and methodology of psychophysiology. Analogue and digital signals. Data acquisition and analysis. 2. Limbic system and emotions. 3. Learning and memory. Simple learning paradigms. Cellular learning: the hippocampus and LTP. Associative learning and learning programs. Learning and memory disorders. 4. Biological rhythms. Electroencephalography (EEG). Psychophysiology of sleeping and wakefulness. Sleep polygraphy. 5. Event related brain potentials. 6. Technology of non-invasive methods in the neurosciences (MEG, TMS, CT, PET, SPECT, MRI). 7. Cardiovascular psychophysiology. 8. Skin potentials and electrodermal activity (EDA). Electrogastrography (EGG). 9. The skeletomotor system. Psychopysiology of the sensory systems. 10. Plasticity in the nervous system. Split brain. The function of the intrinsic neocortex. 11. Human-specific brain activity - speech, cognition. Psychophysiology in Psychopathology. Felelős Oktató Elnevezés Kredit Oktató intézet Hernádi István Neurology 2 Biológiai Intézet (angol) The main emphasis of the course is on providing basic applied human anatomical and physiological knowledge together with novel aspects of neurological ancillary diagnostic examination techniques. The main topics of the course are: 1. Fundamentals, history of neurology. 2. The clinical interview in neurology. The neurological examination. Topical diagnosis and differential diagnosis of neurological syndromes. 3. Diseases of the brain and meninges: Traumatic brain injury. Intracranial pressure and tumors. Circulatory disorders. Infectious diseases. Diseases of the basal ganglia. Cerebellar diseases. Dementing diseases.

Inflammatory diseases. Epilepsy. Sleep disorders. 4. Diseases of the spinal cord. Neuropathies. Diseases of the cranial nerves. Diseases of the spinal nerve roots and peripheral nerves. Pain and painful syndromes. 5. Diseases of the autonomic nervous system. Felelős Oktató Tematika


Felelős Oktató

Elnevezés Kredit Oktató intézet Dr. Hideg Éva Green English 2 Biológiai Intézet A kurzus célja a hallgatók meglevő angol nyelvi alapismeretire támaszkodva szókincsük, fordítási és fogalmazási képességük javítása a biológia (elsősorban a növénybiológia) angol nyelvű szakirodalmában. A kurzus elsősorban angol szakszövegek magyarra fordítására épül, de magyarról angolra fordítást is tartalmaz és sor kerül néhány tipikus, magyar anyanyelvű szerzők angol fogalmazására jellemző hiba elemzésére is. Elnevezés Kredit Oktató intézet Dr. Hideg Éva Fotoszintézis 2 Biológiai Intézet A kurzus a fotoszintézis mokeluláris mechanizmusainka éttekintése mellett magában foglalja a terület legújabb kutatási eredményeinek és aktuális kérdéseinek bemutatását, valamint mérési eljárásokat is bemutat. Témakörök: A fotoszintétis kutatás története, máig ható korai felfedezések; Pigmentek, antenna komplexek, energiaátadás; Elemi töltésszétválás és elektron transzport; Oxigén fejlesztő illetve vizbontást nem végző reakció centrumok; Kemiozmotikus csatolás és az ATP szintézis sajátosságai a fotoszintetizáló szervezetekben; Szénvegyületek metabolizmusa; A fotoszintetizáló szervezetek genetikája; A fotoszintézis eredete és evolúciója; A klorofill fluoreszcencia mérésen alapuló mérési módszerek áttekintése; Mesterséges fotoszintézis Elnevezés Kredit Oktató intézet Tudományos 2 Biológiai Intézet prezentációk / Speaking About Science A tudományos előadások előkészitése, szerkesztése és megtartésa; Az illusztrációk megválasztása és szerkesztése; A cim, és a kulcshelyzetű ábrák (nyitókép, “golden slide”, összefoglalás) megválasztása; Az előadás; Kérdések megválaszolása; Különböző prezentációk különböző alkalmakra (konferencia előadás, bemutatkozás, “radio talk” egyperces); A tanultakat a kurzus résztvevői a gyakorlatban is kipróbálják, a közös munka egymás prezentációinak értékelését is tartalmazza. A magyar nyelven kerül megtartásra, de tartalmaz angol nyelvű prezentációs gyakorlatokat is. Dr. Hideg Éva

Tematika

Felelős Oktató Dr.

Elnevezés Kredit Horváth Állatpopulációk 2

Oktató intézet Biológiai

Tematika

Győző

paramétereinek becslése és modellezése

Intézet

Az állatpopulációk becslésének alapjai. Jelölés-visszafogás és rokon módszerek alkalmazása. Zárt és nyílt populációk, hipotézisvizsgálat, statisztikai tesztek. Populációnagyság- és sűrűségbecslés. A távolsági mintaelemzéseken (distance sampling) alapuló becslések alkalmazása. A túlélés becslése és modellezése, a modellszelekció folyamata és statisztikai tesztjei. A populációk fogás-visszafogás adatmátrixait felhasználó számítógépes programok. A MARK program - a hipotézistesztelő modellezés alapjai. A populációk térbeli eloszlása – mintavételezés, a populáción belüli eloszlások meghatározása. A térbeli asszociáltság, mozgáskörzet becslések, élőhely és mikroélőhely preferencia vizsgálatok



Elnevezés Kredit Oktató intézet Dr. Jakab PCR: az 2 Biológiai Intézet Gábor alapoktól az Dr. Fekete alkalmazásig Csaba A kurzus áttekintést ad a polimeráz láncreakció (PCR) technika alkalmazási lehetőségeiről a biológiai kutatás különböző területein. Áttekintjük a PCR történetét, a technika optimalizálásához szükséges elemeket és lépéseket, pl. primer tervezés, enzim választás. Az alap alkalmazások mellett kiemelt figyelmet kapnak a speciális alkalmazások, úgymint grádiens, touch-down, TAIL-PCR, mutagenezis és rekombináció. Génexpresszió vizsgálata szemikvantitatív és valós idejű PCR segítségével. Elnevezés Kredit Oktató intézet Dr. Jakab Növényi 2 Biológiai Intézet Gábor stresszélettan Dr. Hideg Éva A kurzus áttekintést ad a reaktív oxigén származékok (ROS) létrejöttéről és szerepéről a növényi stressz kialakulásában. Megbeszéljük a fotodiámiás (fotodinamikus) hatást, a reaktív oxigén származékok (ROS) fényindukált és fényfüggetlen keletkezését, reaktivitását és károsító hatásukat. Fotoszintézis rövid, ismétlő áttekintése különös tekintettel az elektrontranszport folyamatokra, fotoszintézis mérés klorofill fluoreszcencia változások alapján, növények vizsgálata táv-érzékeléssel. Fotoszintézis stressz körülmények között: miért „veszélyes üzem” a fotoszintézis? fotodinámiás ROS keletkezés lehetőségei: I. típus, MAP (avagy „víz-víz”) ciklus, SOD, peroxidázok II. típus, fotoinhibíció ill. megelőzése, kivédése (antenna szabályozása, aszkorbát- tokoferol út, karotinoidok, D1 repair ciklus. ROS okozta biológia károsodás, az oxidatív stressz pro-oxidánsok és antioxidánsok egyensúlya, akklimáció ill. károsodás, stressz válaszok szabályozása, fotoinhibíció in vivo. A környezeti stresszek kapcsolata az oxidatív stresszel: UV stressz, szárazság és só stressz, ózon, hőmérsékleti stressz hatások (hideg, meleg, fagy), biotikus stressz. A szignálutak szerepe a stresszválaszokban.


Elnevezés Kredit Oktató intézet Dr. Kevey Cönológiai 2 Biológiai Intézet Balázs kutatási módszerek Hagyományos cönológiai kutatások módszerei: kvadrátmódszer, minimiarea fogalma, minimiarea meghatározása, minimiarea-vizsgálatok újabb eredményei erdőtársulásokban, hagyományos statisztikai számítások (csoportrészesedés és csoporttömeg meghatározása), Cönostat számítógépes programcsomag és használata. Cönológiai táblázatok típusai: egyszerű és összetett táblázatok, szintek szerint (nyers) és karakterfaj szerint csoportosított táblázatok, teljes, analitikus és szintetikus táblázatok. – A mikrocönológia kutatási módszerei: vonalfelvételezés, függőleges (szintezettség) és vízszintes (mintázat) struktúra vizsgálata. – Sokváltozós statisztikai elemzések: klasszifikációs és ordinációs műveletek, Syntax 2000 számítógépes programcsomag és használata.


Elnevezés Kredit Oktató intézet Dr. Kevey Magyarország 2 Biológiai Intézet Balázs növényföldrajza A magyar flóra kialakulásának története: történeti növényföldrajz és kutatási módszerei (ásatások, palinológia), vegetációtörténeti korok (harmadkor, jégkorszak, fenyő-nyír kor, mogyoró-kor, tölgy-kor, bükk III.-kor), az ősmátra-elmélet, a dolomit-jelenség és a közép-dunai flóraválasztó. –A magyar flóra összetétele: a magyar flóra összetételét befolyásoló éghajlati hatások, flóraelemek tájegységenkénti aránya, Magyarország klímazonális övei (klímazónák, klímadiagramok, csapadékjárási típusok). – Magyarország florisztikai-növényföldrajzi felosztása (flóratartományok, flóravidékek, flórajárások): Noricum, Carpaticum, Illyricum, Pannonicum.


Elnevezés Kredit Oktató intézet Dr. Kevey Az Alföld 2 Biológiai Intézet Balázs vegetációja Az Alföld vegetáció-történeténetének ismertetése: történeti növényföldrajz és kutatási módszerei (ásatások, palinológia), fenyő-nyír kor, mogyoró-kor, tölgy-kor, bükk I-II.-kor; az ősmátra-elmélet. – Lágyszárú növénytársulások: vízi növényzet (lebegő és gyökerező hínár), mocsári növényzet (nádasok és magas sásosok), lápi növényzet (sík-, átmeneti- és dagadó-lápok), nyílt és zárt löszgyepek, nyílt és zárt homoki gyepek, száraz és nedves szikesek. – Fás növénytársulások: bokorfüzesek és puhafás ligeterdők, lápi cserjések és láperdők, kiszáradó lápi cserjések és kiszáradó láperdők, mocsári cserjések és mocsárerdők, égerligetek és tölgy-kőris-szil ligetek, gyertyános-tölgyesek, zárt száraz tölgyesek (homokon, löszön, ártéren és sziken), nyílt száraz tölgyesek (homokon, löszön, ártéren és sziken), törpemandula- és kökény-galagonya-cserjések.

Az alföldi társulások zonalitása, dinamikája és szukcessziós viszonyai (szukcesszió-sémák és vegetáció-keresztmetszetek bemutatása). Felelős Oktató Tematika

Elnevezés Kredit Oktató intézet Dr. Kevey A Szigetköz 2 Biológiai Intézet Balázs erdei A Szigetköz kialakulásának rövid áttekintése. Erdőtársulások részletes ismertetése a termőhelyi viszonyok alapján: csigolya és mandulalevelű bokorfüzesek; fehérfűz-, feketenyár- és fehérnyár-ligetek, rekettyefüzes mocsári cserjések és égeres mocsárerdők, rekettyefüzes és égerlápok, kiszáradó lápi cserjések és kiszáradó égerlápok, égerligetek és tölgy-kőrisszil ligetek, gyertyános-tölgyesek, zárt és nyílt ártéri száraz tölgyesek, kökény-galagonya-cserjések. A szigetközi erdők zonalitása, dinamikája és szukcessziós viszonyai (szubasszociációkra lebontott szukcesszió-séma és vegetáció-keresztmetszetek bemutatása). A Szigetköz vegetációtörténeténetének áttekintése: az eredeti állapot, folyószabályozások hatása a Szigetköz erdeire. A Duna szlovákiai elterelésének hatása a Szigetköz erdeire. Az erdőgazdálkodás hatása a Szigetközben.

Felelős Oktató

Elnevezés Mozgáselemzés, Dr. Laczkó mozgások József neuromechanikája

Tematika

Kredit


2

Az emberi mozgások, mozgási feladatok helyes végrehajtása az idegizom-csont rendszerek együttműködésének jól koordinált szabályozását feltételezi. A mozgások külső körülmények, erőterek közott jönnek létre. A kurzus a mozgatórendszer kinematikai és dinamikai tulajdonságait tárgyalja, a mozgás során létrejővő belső és külső erőket, a motoros rendszer adaptációját külső körülményekhez, egy- és sokízületű rendszereket, a mozgató rendszer redundanciáját, optimalizálási feltételeket, a mozgás varianciáját, stabilitását. Az izmok együttműködése szinergiája, reflex folyamatok és szenori-motoros transzformációk szintén tárgyalásra kerülnek. A mozgáselemzés módsyerei és matematikai módszerek is ismertetésre kerülnek a mozgás, rejtett, kísérletileg nem mérhető tulajdonságainak felderítésére.


Elnevezés Kredit Oktató intézet Dr. Molnár Experimentális 2 Biológiai Intézet László neuroanatómia Az idegszövet előkészítése fény- és elektronmikroszkópos vizsgálatokra (immerziós és perfúziós fixálás, beágyazás, metszés, a metszetek kontrasztosítása, impregnáció). Endoneurális enzimek hisztokémiai kimutatása (kolinészteráz, monoamin-oxidáz, NADH– és NADPHdiaforáz, GABA-transzamináz, fluorid rezisztens savas foszfatáz, citokróm-oxidáz). Pre- és posztembedding immuncitokémia (egyes, kettős és többes jelölések módszertana). Neuronális nyomjelzők alkalmazása

(anterográd és retrográd tracer-ek) fény- és elektronmikroszkópos vizsgálatok céljaira. A neurális nyomjelzők és az immuncitokémiai módszerek kombinálása neuronhálózatok azonosítására. Felelős oktató

Elnevezés kredit Oktató intézet Térinformatika 2 Biológiai Intézet a vegetációtudom ányban A kurzus a térinformatika vegetációtudományban való alkalmazását tárgyalja a populációs szinttől a tájléptékig. Részletesen ismertetésre kerülnek a populáció-, vegetáció-, tájökológiai-, - természetvédelmi és egyéb ökológiai számítógéppel segített térképezési módszerek. A földi és távérzékeléses (műhold, légifelvételek stb.) geometriai adatnyerési módszerek, ökológiai háttéradat nyerési eljárások. A másodlagos adatnyerési módszerek. A térinformatikai adatbázisok építése és használata. Raszter és vektor alapú térinformatikai rendszerek bemutatása, alkalmazhatóságuk előnyei, hátrányai. Populációk térinformatikai modellezése és elemzése, ökológiai minták geoinformatikai elemzése. Vegetációs mintázatok térinformatikai elemzése. Vegetációs határok, ökológiai folyosók geoinformatikai elemzése. Tájökológai és a konzervációbiológiai értékelés térinformatikai eszközökkel Dr.Morschhau ser Tamás

Tematika



Elnevezés kredit Oktató intézet Dr. Vegetációtérké 2 Biológiai Intézet Morschhauser pezés Tamás A vegetáció térképezés elmélete. A társulástani alapú vegetációtérképezés. Az ÁNÉR térképezés. Távérzékelés- vegetációtérképezés. Műholdfelvétel alapú térképezés.Tájökológiai térképezés.Degradáltsági térképezés.Vegetáció-térképek feldolgozása..CORINE térképezés. Vegetáció-térképek terepi készítése.

Elnevezés kredit Oktató intézet Dr. GIS a 2 Biológiai Intézet Morschhauser vegetációtudo Tamás mány-ban A térinformatikai modellalkotás folyamata. Geometriai adatok vonatkoztatási és vetületi rendszerei. Térinformatikai adatnyerési eljárások. Adatbázisok kezelése a térinformatikában. Raszteres adatmodell. Vektoros adatmodell..Digitális képfeldolgozás. Térinformatikai értékelés.A térinformatika aktuális trendjeinek áttekintése. A vegetáció és térképezésének segítő adatbázisok.és távérzékelési anyagok ismerete. Esettanulmányok feldolgozása, értelmezése.



Elnevezés Kredit Oktató intézet Dr.Papp Gábor Mikotoxinok 2 Biológiai Intézet A mikotoxinok fonalasagombák másodlagos anyagcseretermékei, amelyek gazdasági jelentőségüket elsősorban az élelmiszerek és takarmányok minőségrontó hatásának köszönhetik. Jellemzően kis koncentrációban is hatékonyak, valamint a mintákban a koncentráció eloszlásuk nem egyenletes, ez megnehezít velük szemben a védekezést. Általában citotoxikus, genotoxikus (mutagén, karcinogén, teratogén) hatásúak, ezért nagy igény merült fel a detoxifikációs eljárások kifejlesztésére. Ehhez azonban a sejtre gyakorolt hatásnak széleskörű ismerete szükséges. A Ph.D. program keretében a mikotoxinok hatásmechanizmusának vizsgálatával foglalkozunk. A kísérletek során a Schizosaccharomyces pombe modellorganizmust használunk, amely a kutatás szempontjából számos kedvező tulajdonsággal rendelkezik. Ilyenek az egyszerű tenyésztési körülmények, a rövid generációs idő, a rendelkezésre álló széleskörű információs háttér, a klasszikus mikrobiológiai és molekuláris biológiai eszköztár. Mivel eukarióta szervezetről van szó, az alapvető sejtszintű élettani folyamatai jól reprezentálják a magasabb rendű élőlényekre jellemzőket. Előkísérleteink alapján számos mikotoxin vizsgálatát követően két mikotoxint, a patulint és a zearalenont választottuk a kutatás tárgyává. Az irodalmi adatok alapján a patulin kapcsolatot létesít a fehérjék –SH csoportjaival, amely alapján feltételezhető a membránkárosító hatás, amely egy sor sejtkárosító folyamat kiinduló pontja (oxidatív stressz, apoptózis, stb.). A zearalenon molekuláris hatásai között kiemelkedik a fehérje-, RNS-, és DNS-szintézis gátló hatása, a membránszerkezet megváltoztatása, oxidatív stressz generáló hatása, apoptotikus hatása. Vizsgálataink célja mindkét toxin esetében a sejtmembránra gyakorolt hatás pontos megismerése, valamint célunk továbbá a sejtek oxido-redukciós állapotának a feltérképezése a reaktív oxigéngyökök intracelluláris koncentrációjának a meghatározásával, valamint az oxidatív stressz kivédésében szerepet játszó molekulák, enzimek vizsgálatával. Célunk továbbá az apoptotikus markerek jelenlétének kimutatása a modellszervezetben.

Elnevezés Kredit Oktató intézet Dr. Pál Róbert Magyarország 2 Biológiai Intézet gyomnövényzete A gyomcönológia alapfogalmai és alapelvei. Az asszociáció fogalom értelmezései. Vetési gyomnövényzet (Violenea arvensis) bázikus talajuú őszi és tavaszi szántóföldi kultúrákban (Papaveretalia rhoeadis), szubatlantikus acidofil talajú szántóföldi gyomnövényzet (Sperguletalia arvensis), Ruderális egyéves és kontinentális vetési gyomnövényzet (Sisymbrienea), Kontinentális szántóföldi gyomnövényzet (Eragrostetalia), Ruderáűlis gyomnövényzet.

Alapasszociáció és származékasszociáció. Útszéli szikár gyomnövényzet (Sisymbrietalia), Útszéli gyomnövényzet (Artemisietea vulgaris), Rízsvetések gyomnövényzete (Oryzetea sativae), Mocsári és folyóhordaléki gyomnövényzet (Bidentetea tripartiti), Árnyas-nyirkos termőhelyek ruderális szeélytársulásai (Galio-Urticetea), Taposott gyomnövényzet (Polygono-Poetea annuae). Származéktársulások. Felelős oktató Tematika

Elnevezés Kredit Oktató intézet Dr. Pollák Fényés 2 Biológiai Intézet Edit elektronmikroszkópos mikrotechnika Az optikai vizsgáló eszközök működési elve, szerkezete és típusai (fénymikroszkóp, fáziskontraszt, fluoreszcens, és polarizációs mikroszkóp, pásztázó lézer mikroszkóp, transzmissziós és pásztázó elektronmikroszkóp). Mikroszkópos mérések. Mikroszkópos preparátumok készítése: Natív minták, vitális festések, rögzített minták. A rögzítés elve, gyakorlati fogásai. A fixált minták feldolgozása. A fénymikroszkópos metszetek kontrasztnövelésének lehetőségei: általános festések, impregnálások. Speciális festési módszerek (a citoplazma granuláris struktúráinak és a kötőszöveti rostok feltüntetése). Az elektronmikroszkópos mikrotechnika elve és gyakorlati fogásai. Az autoradiográfia elve és gyakorlati fogásai. A hisztokémia módszertani problémái és speciális módszerei. Klasszikus hisztokémiai módszerek: nukleinsavak, aminosavak és fehérjék, szénhidrátok, lipidek kimutatása. Az enzimhisztokémia elve és gyakorlati fogásai. A hisztokémiailag detektálható fontosabb enzimek jellemzése, hisztokémiai reakciói. Az immuncitokémia biológiai alapjai, alkalmazható antitestek és jelölő molekulák. Direkt és indirekt immuncitokémiai módszerek előnyei, hátrányai. Háttércsökkentés, a specifikus jel erősítése. Kettős és többes jelölések elve és gyakorlata. Az elektronmikroszkópos immuncitokémia módszertani problémái. Lektin hisztokémia. In situ hibridizáció.


Elnevezés Purger Biogeográfia

Kredit 2


Dr. Jenő Az área és árearendszerek kialakulása, szerkezete, nagysága, alakja, térképezése. Az áreák dinamikája: története és evolúciója (expanzió, regresszió diszjunkció, extinkció). Área gócok és szétterjedési centrumok. A negyedidőszaki flóra- és faunadinamizmus és evolúciós következményei. A vikariancia kialakulása és a filogenetikus biogeográfia. Szigetbiogeográfia és konzervációbiológia, a benszülött, őshonos és maradvány fajok jelentősége.

Felelős oktató Dr. Jenő

Elnevezés Kredit Oktató intézet Purger Az állatok 2 Biológiai Intézet elterjedésének ökológiai

Tematika


alapjai A szétterjedőképesség belső vonatkozásai: strukturális, fiziológiai, viselkedésbeli, életmódbeli és populációjellegek, valamint összhatásuk. A diszperzió, fluktuációk, diszperzál. A megtelepedés – kolonizáció – ökológiája. A megélhetést szabályozó külső tényezők valamint a belső tényezők összhatása. A limitáló tényezők és összhatásuk. A megtelepedő állatok szaporodása: citogenetikai rendszerek, speciális táplálék ill. habitat igény. Egyedek, csoportok, populációk beilleszkedési problémái. Elnevezés Kredit Purger Viselkedésökológia 2


Dr. Jenő A viselkedésbiológián, mint határtudományon keresztül vizsgáljuk a viselkedés (táplálkozás, szaporodást stb.) adaptív értékét, evolúciós hátterét a környezeti változók függvényében. A következő témákkal kapcsolatos aktuális folyóiratcikkeket dolgozzuk fel: adaptáció, táplálkozási viselkedés, Ragadozóellenes viselkedés, szexuális szaporodás és az utódgondozás, a hímek és a nőstények reproduktív taktikái, segítők, párzási rendszerek, társas viselkedés

Felelős Oktató

Elnevezés Dr. Putnoky Bioinformatika II. Péter

Tematika

A hallgatók az előadás anyagához kapcsolódó gyakorlati feladatokat kapnak az adatbázis kulcsszavas keresésétől kezdve, az ORF és génkereső alklamazásokon át a BLAST és a ClustalW programok használatáig. Megtanulják értékelni a szekvenáló automaták által létrehozott kromatogrammot és kiértékelni, illeszteni a részszekvenciákat. Végül feladatokon keresztül megtárgyaljuk a primertervezés elméletét és gyakorlatát.


Elnevezés

Kredit 2

Kredit



Dr. Putnoky Baktériumgenetika 2 Péter Mutáns izolálás: Spontán antibiotikum és bakteriofág rezisztens E.coli mutánsok izolálása (egyben a fluktuációs teszt demonstrálása). Transzpozonok és alkalmazásuk a mutagenezisnben (Tn5, TnphoA és TN10LK), speciális eszközök génfúziók izolálására. Expressziós génfúziók azonosítása X-P vagy X-gal segítségével. Génexpresszió vizsgálata: riporter génfúziók (lacZ, GFP) működésének vizsgálata fiziológiai kísérletekben (nod vagy vir gének indukciója)

Konjugáció és génizolálás: E. coli auxotróf mutánsok felhasználása géntár klónok komplementációval történő azonosítására. A kurzus keretén belül a különböző módzserek elméleténektárgyalása után a hallgatók kísérleteket is végeznek a fenti témákban.


Elnevezés Kredit Oktató intézet Salamonné Alacsonyabb 2 Biológiai Intézet dr. Albert rendű növények Éva taxonómiája Az alacsonyabb rendű növények taxonómiai helyzete, osztályozásuk történeti kérdései. Morfológiai, anatómiai, kémiai, citológiai, genetikai bélyegek és alkalmazhatóságuk a rendszerezésben. Lychenophyta: Ascolichenes, Basidiolichenes, Hepatophyta, Bryophyta, Lycophyta, Monilophyta, Ginkgophyta, Pinophyta, Cycadophyta, Gnetophyta és főbb csoportjaik. Problémás taxonok rendszerezési kérdéseinek megvitatása.


Dr. László

Elnevezés Szabó Allelopátiát előidéző speciális növényi metabolitok hatása

Kredit 2


Allelopátia az ökológiai fitokémiában. Allelopátia szerepe növénytársulásokban és a kompetícióban. Szekunder (speciális) növényi metabolitok allelopátiás potenciálja. A hatás in vitro igazolása, csírázási biotesztek, növekedésgátlás, organizációs indukció, produkcióbiológiai jellemzők. Allelopátia a természetben, hatóanyagok képződése, transzportja, lebomlása. Allelokémiai anyagok fitokémiai kimutatása. Hatóanyagok felszívódása, szöveti lokalizációja, sejtbiológiai hatása. Felelős Oktató Tematika

Elnevezés Kredit Oktató intézet Dr. Szabó T. Válogatott 2 Biológiai Attila fejezetek az Intézet evolúciós elmélet történetéből Az evolúciós gondolat korai előfutárai. A darwini gondolat megjelenése a 17-18. században. Elfelejtett magyar vonatkozások. Festetich György a genetika alaptörvényeinek megfogalmazója jóval Darwin és Mendel előtt. A Darwin-Wallace polémia társadalmi háttere. Utórezgések és utóhatások. Darwin és kortársainak munkássága a magyar könyvkiadásban.

Felelős Oktató Dr. Váczi Márk

Elnevezés Kredit A vázizom 2

Oktató intézet Sporttudományi

Tematika

működésének és Testnevelési biomechanikája Intézet A kurzus a harántcsíkolt izom működésének molekuláris és neuromechanikai alapjait mutatja be. A vázizom szerkezeti sajátosságain, valamint az izomkontrakció mechanizmusán kívül a hallgatók megismerik a különböző erőkifejtési módozatok sajátosságait. Az emberi erőkifejtést befolyásoló morfológiai, morfometriai, neurális és mechanikai paraméterek kerülnek tárgyalásra. A kurzus során a vázizom alkalmazkodási képességeit (edzés, fáradás, inaktivitás, öregedés) is megismerhetik a hallgatók. A kurzus tartalmazza az erőmérés módszertanának (dinamometria, EMG) tanítását, mely biomechanika laboratóriumi gyakorlat során valósul meg.

Felelős Oktató

Elnevezés Kredit Oktató intézet Dr. Virágh Klára Bevezetés a 2 MTA. ÖBKI szündinamikába A kurzus célja a dinamikai szemlélet kialakítása és olyan szündinamikai elméleti és gyakorlati ismeretek oktatása, amelyek nélkülözhetetlenek a dinamikai folyamatok megértéséhez, irányításához, ill. a természetes zavarások és az emberi beavatkozások következményeinek kvantitatív becsléséhez és előrejelzéséhez. Részletesen ismertetjük a paradigmaváltásokat a szündinamikában, az új dinamikai koncepció alapjait, pl. a komplexitást, a nemlinearitást, sztochaszticitást, valamint a hierarchia és foltdinamika elméletét, a mintázatok – folyamatok és skálák összefüggéseit, a kontextusfüggő dinamikákat és a predikálhatóság problámakörét. Kiemelt fontosságú témakörként tárgyaljuk a zavarások szerepét a vegetációdinamikában (elméletek, a zavarások és a vegetációdinamikai folyamatok kapcsolata, ökológiai stabilitás, invázió) és a természetvédelmi gyakorlatban (megőrzés – védelem – hosszú távú fenntartás, természetesség degradáltság, beavatkozások, monitorozási stratégiák).

Tematika


Felelős Oktató

Elnevezés Kredit Oktató intézet Dr. Virágh Klára Vegetációdinamika 2 MTA. ÖBKI A kurzus tárgya a vegetációdinamikai alapismereteknek (a folyamatok típusai és elválasztásuk kritériuma, a tér- és időlépték fontossága, a folyamatok menetét és sebességét befolyásoló tényezők, stb.) ill. napjaink kutatási irányzatainak és módszereinek az oktatása. Áttekintjük a vegetációfejlődés főbb irányzatait (holizmus, redukcionizmus, stb.), az új dinamikai paradigma kialakulását elősegítő tényezőket és koncepciókat, valamint a legújabb szündinamikai elméleteket. Esettanulmányok részletes elemzésével mutatjuk be a vegetációdinamikai folyamatokat leíró és a mechanizmusokat feltáró új módszertani megközelítéseket és kísérletes vizsgálatokat. Részletesen tárgyaljuk a növényközösségek szerveződését és e folyamat szabályszerűségeit, valamint a folyamatok irányíthatóságának és predikálhatóságának elméleti alapjait és ennek kutatási és gyakorlati vonzatait a restaurációs ökológiai és a természetvédelmi gyakorlatban.

Elnevezés

Kredit

Oktató intézet

Tematika


Dr. Wilhelm Stressz, sport, 2 Márta immunrendszer

Sporttudományi és Testnevelési Intézet A stressz fogalma, értelmezése. A mozgás, mint stressz és immunológiai következményei. Az adaptáció, annak folyamata és jellemzése. A mozgás, mint stressz és immunológiai következményei. Túledzés, megváltozott körülmények (magaslatok, időzónák). Pszichés elváltozások a túledzés hatására. A vérkép elváltozásai az edzésadaptáció és túledzés hatására. Az asztma és allergia immunológiai és funkcionális következményei. A szív immunológiája és a “sudden cardiac death” szindróma. A nemi hormonok hatása az immunfolyamatokra. Pszicho-neuro-endocrin ritmusok és immunfunkciók. Máladaptáció és az immunfunkciók változásai. A gasztro-intesztinális tractus hormonális és immunológiai vonatkozásai. Az anthropometria és a sport-anthropometria története. A sport-anthropometriai vizsgálatok jelentősége és módszerei. A különböző alkattípusok és a sport. Sportági kiválasztás. Elnevezés Dr. Wilhelm Fittségi Márta vizsgálatok

Kredit 2

Oktató intézet Sporttudományi és Testnevelési Intézet

-Az egészség fogalma, egészség edzés, fittség edzés - Növekedés, érés és motorikus teljesítmény. -A motoros képességek mérési lehetőségei különböző életszakaszokban és élettani állapotokban -A maximális pulzus becslése és mérése, terhelési célzónák különböző életkorokban és egészségi és edzettségi állapotokban - A kardio-vaszkuláris és pulmonális rendszer aktuális állapotának megállapítása pályatesztek és laboratóriumi tesztek, mérések segítségével -A túlsúly, a túlsúlyos ember terhelhetősége -A diabetes mellitus típusai, kialakulási valószínűsége az oktatási intézményekbe járó korosztályokban, felnőtt korosztályokban, terhelhetőségük -A spiro-ergometria lényege, gyakorlati jelentősége, alkalmazása -A spiro-ergometriai protokollok, az azokkal nyerhető adatok értelmezése

Doktori iskola megnevezése. Biológiai és Sportbiológiai Doktori Iskola. Doktori iskola vezetője. Dr. Gábriel Róbert egyetemi tanár

Recommend Documents