perpustakaan.uns.ac.id
digilib.uns.ac.id
DETEKSI GEN E-CADHERIN PADA KARSINOMA SEL SKUAMOSA RONGGA MULUT DARI SAMPEL BLOK PARAFFIN
SKRIPSI
Untuk Memenuhi Persyaratan Memperoleh Gelar Sarjana Kedokteran
NABIEL G.0010131
FAKULTAS KEDOKTERAN UNIVERSITAS SEBELAS MARET Surakarta 2013 commit to user
perpustakaan.uns.ac.id
digilib.uns.ac.id
ABSTRAK Nabiel, G0010131, 2013, Deteksi Gen E-Cadherin pada Karsinoma Sel Skuamosa Rongga Mulut dari Sampel Blok Paraffin. Skripsi Fakultas Kedokteran, Universitas Sebelas Maret, Surakarta Latar belakang : Kanker rongga mulut merupakan kanker yang banyak dijumpai di seluruh dunia. Pengobatan dan prognosis dari kanker ini sangat bagus tetapi tingkat metastasisnya cukup tinggi. Banyak kasus di jumpai telah mengalami metastasis. Penelitian ini bertujuan untuk melihat apakah adanya gen E-Cadherin yang berfungsi sebagai suppressor gene metastasis sel kanker pada sampel Blok paraffin. Metode : Produk DNA yang digunakan adalah hasil isolasi DNA dari 14 sampel Blok Paraffin. Kemudian produk diperbanyak mengunakan PCR menggunakan primer sebagai cetakan. Selanjutnya hasil produk dari PCR dilakukan elektroforesis untuk mengetahui gen E-Cadherin pada ke-14 sampel tersebut. Hasil : Berdasarkan 12 sampel yang didiagnosis karsinoma sel skuamosa, didapatkan hasil positif pada saat elektroforesis dilakukan dengan gel agarose 2%, dan didapatkan hasil negatif saat dilakukan dengan gel agarose 3%. Simpulan : Dari hasil elektroforesis yang dilakukan didapatkan hasil positif dan negatif, hasil ini bisa disebabkan kesalahan pada analisis molekuler maupun pada saat pengerjaan. Lebih lanjut, dibutuhkan penelitian yang lebih mendalam untuk mendeteksi adanya gen E-Cadherin pada karsinoma sel skuamosa lidah.
Kata Kunci : gen E-Cadherin, Blok Paraffin, karsinoma sel skuamosa
commit to user
perpustakaan.uns.ac.id
digilib.uns.ac.id
ABSTRACT Nabiel, G0010131, 2013, Detection of E-Cadherin gene in Oral Cavity Squamous Cell Carcinoma from Paraffin Blocks Sample. Mini Thesis. Faculty of Medicine, Sebelas Maret University Surakarta. Background : Oral Cavity cancer is a cancer that is found throughout the world. Treatment and prognosis of this cancer is very nice but quite high metastatic rate. Has encountered many cases of metastasis. This study aimed to see if the ECadherin gene that functions as a metastasis suppressor gene in cancer cell Paraffin Blocks samples. Methods : DNA product used was isolated from 14 samples of Paraffin Blocks. Then propagated using PCR products using primers as mold. Furthermore, the results of the PCR product was electrophoresis to determine the E-cadherin gene in all 14 samples. Results : Based on 12 samples diagnosed with squamous cell carcinoma, the positive results obtained when using 2% agarose gel, and obtained negative results when using 3% agarose gel. Conclusion : From the results obtained electrophoresis performed positive and negative results, these results could be due to errors in the analysis of molecular and workmanship at the time. Furthermore, a more in-depth research is needed to detect the presence of E-Cadherin gene in squamous cell carcinoma of the tongue.
Keywords : E-Cadherin gene, paraffin blocks, squamous cell carcinoma
commit to user
perpustakaan.uns.ac.id
digilib.uns.ac.id
PRAKATA Puji syukur penulis haturkan ke hadirat Allah SWT karena atas karunia-Nya penulis dapat menyelesaikan skripsi dengan judul ”Deteksi Gen E-Cadherin pada Karsinoma Sel Skuamosa Rongga Mulut dari Sampel Blok Paraffin”. Penelitian dan penulisan skripsi ini dapat terlaksana dengan baik berkat bantuan, bimbingan, dan petunjuk dari berbagai pihak. Untuk itu, penulis ingin mengucapkan terima kasih kepada: 1. Prof. Dr. Zainal Arifin A, dr., Sp.PD-KR-FINASIM selaku Dekan Fakultas Kedokteran Universitas Sebelas Maret, Surakarta. 2. Ari Natalia Probandari, dr., MPH,PhD selaku Ketua Tim Skripsi FK UNS. 3. Dr. Pradipto Subiyantoro, drg., SpBM selaku Pembimbing Utama yang telah menyediakan waktu untuk membimbing hingga terselesainya skripsi ini. 4. Vita Nirmala A., drg., SpPros., SpKG selaku Pembimbing Pendamping yang telah menyediakan waktu untuk membimbing hingga terselesainya skripsi ini. 5. Dr. Risya Cilmiaty AR, drg., M.Si., SpKG selaku Penguji Utama yang telah memberikan bimbingan, kritik dan saran demi kesempurnaan penulisan skripsi ini. 6. Widia Susanti, drg., M.Kes selaku Anggota Penguji yang telah memberikan bimbingan, kririk dan saran demi kesempurnaan penulisan skripsi ini. 7. Seluruh Dokter dan Staf dari SMF Gigi dan Mulut serta SMF Patologi Klinik RSUD Dr. Moewardi, Surakarta. 8. Seluruh Dosen dan Staf Laboratorium Biomedik FK UNS. 9. Bagian Skripsi FK UNS yang turut memberi kelancaran pembuatan skripsi ini. 10. Abi Abdul Choliq Muslih, Ummi Nur Rohmah serta adik-adikku (Mamduh, Nailufar, Nadaa, Maajida, Munaa, Zakiyya, Aziizah, Faathima) yang selalu mendewasakan, menginspirasi, memotivasi tanpa henti serta mendoakan penulis. 11. Rekan-rekan Giluters: Coraega, Jinan Fairuz, dan M Rama Anshorie yang setia berjuang bersama bahu membahu hingga selesainya skripsi ini. 12. Wisma Ngereuyeuh beserta penghuninya, Totok, Aryo, Gama, Hagung, Seno, Adi, terimakasih untuk semua dukungan yang diberikan selama ini. 13. Untuk keluarga Achilles, smoga kita bisa lulus bersama-sama, dan tetap mantap jaya. 14. Rekan-rekan dan pihak yang tidak dapat saya sebutkan satu-persatu yang turut mendukung skripsi ini. Penulis menyadari bahwa skripsi ini masih banyak kekurangan dan jauh dari kata sempurna. Penulis mengharapkan saran dan kritik yang membangun demi kebaikan skripsi ini. Akhir kata penulis berharap semoga skripsi ini dapat bermanfaat bagi dunia kedokteran umumnya dan pembaca khususnya. Surakarta, 14 November 2013 commit to user vi
Nabiel
perpustakaan.uns.ac.id
digilib.uns.ac.id
DAFTAR ISI Halaman PRAKATA .....................................................................................................
vi
DAFTAR ISI ..................................................................................................
vii
DAFTAR TABEL ..........................................................................................
ix
DAFTAR GAMBAR .....................................................................................
x
DAFTAR LAMPIRAN ..................................................................................
xi
BAB I PENDAHULUAN A. Latar Belakang ............................................................................
1
B. Perumusan Masalah ....................................................................
2
C. Tujuan Penelitian ........................................................................
3
D. Manfaat Penelitian ......................................................................
3
BAB II LANDASAN TEORI A. Tinjauan Pustaka .........................................................................
4
1.Anatomi, Fisiologi, dan Histologi Lidah..................................
4
2.Karsinoma Sel Skuamosa Rongga Mulut ................................
5
3.Karsinogenesis .........................................................................
10
4. Metastasis................................................................................
11
5. Gen E-Cadherin.......................................................................
14
B. Kerangka Pemikiran ....................................................................
15
BAB III METODE PENELITIAN A. Jenis Penelitian ............................................................................
16
B. Lokasi Penelitian .........................................................................
16
C. Subjek Penelitian.........................................................................
16
D. Objek Penelitian ..........................................................................
16
E. Alur Penelitian ............................................................................
17
F. Alat dan Penelitian ......................................................................
17
1. Alat Penelitian .........................................................................
17
2. Bahan Penelitian......................................................................
18
G. Cara Kerja ................................................................................... commit to user vii
18
perpustakaan.uns.ac.id
digilib.uns.ac.id
1.Preparasi Sampel ......................................................................
18
2.Isolasi DNA ..............................................................................
19
3.PCR ..........................................................................................
22
4. Elektroforesis..........................................................................
23
5. Analisis Data.......................................................................... .
24
BAB IV HASIL PENELITIAN A. Identifikasi Sampel......................................................................
25
B. Isolasi DNA .................................................................................
25
C. PCR .............................................................................................
25
D. Elektroforesis ..............................................................................
26
E. Analisis Hasil Elektroforesis .......................................................
28
BAB V PEMBAHASAN ..............................................................................
31
BAB VI PENUTUP A. SIMPULAN ................................................................................
35
B. SARAN .......................................................................................
35
DAFTAR PUSTAKA ....................................................................................
36
LAMPIRAN
commit to user viii
