Clostridium difficile in de Belgische ziekenhuizen: nog altijd aanwezig? Johan Van Broeck Laboratoire de référence C. difficile Referentielaboratorium Cliniques Universitaires St-Luc
UCL Brussel Bruxelles
Ja!
Johan Van Broeck Laboratoire de référence C. difficile Referentielaboratorium Cliniques Universitaires St-Luc
UCL Brussel Bruxelles
Faculteit Geneeskunde Tandheelkunde Farmacie Te Brussel
Cliniques Universitaires St-Luc 893 bedden Laboratoria
Revalidatiecentrum Cliniques Universitaires St-Luc
Clostridium difficile « Cela se passe près de chez vous »
Johan Van Broeck Laboratoire de référence C. difficile Referentielaboratorium Cliniques Universitaires St-Luc
UCL Brussel Bruxelles
Clostridium difficile
Cela se passe près de chez vous Cliniques Universitaires St-Luc
Fysiopathologie Therapie
Referentiecentrum Epidemiologie Nieuwe virulente stammen? Therapie NAP1/027 Perspectieven Diagnostiek
Cliniques Universitaires St-Luc
Fysiopathologie Bacil Gram + Sporuleert Groeit in anaerobe omstandigheden Sommige produceren toxines Kan diarrhee en eventueel Pseudomembranencolitis veroorzaken
Clostridia :
Cliniques Universitaires St-Luc
C tetani C botulinum C perfringens
Fysiopathologie
Clostridium difficile:
Cliniques Universitaires St-Luc
7/10 produceren toxines
Toxine A:
enterotoxine
Toxine B:
cytotoxine
Toxine A + Toxine B
diarree
Pseudo Membranen Colitis
Fysiopathologie
Cliniques Universitaires St-Luc
Pseudo-Membranous-Colitis
Cliniques Universitaires St-Luc
Fysiopathologie Pseudo-Membranen Colitis
Cliniques Universitaires St-Luc
Fysiopathologie
sporen Resistent aan: Alcohol Hitte Uitdroging Detergent Antiseptica
Cliniques Universitaires St-Luc
spores Fysiopathologie
Handhygiene!!!! Alcohol?
Cliniques Universitaires St-Luc
Fysiopathologie
Cliniques Universitaires St-Luc
Fysiopathologie Er moet een intestinale perturbatie zijn:
Cliniques Universitaires St-Luc
antibiotherapie chemotherapie radiotherapie
Fysiopathologie
Cliniques Universitaires St-Luc
Er moet een intestinale perturbatie zijn:
antibiotherapie chemotherapie radiotherapie
Natuurlijke barrières verstoord:
immunogedeprimeerden inname van anti-zuur middelen
Fysiopathologie Er moet een intestinale perturbatie zijn:
antibiotherapie chemotherapie radiotherapie
Natuurlijke barrières verstoord:
immunogedeprimeerden inname van anti-zuur middelen
omgeving die veel sporen bevat (nosocomiaal)
Cliniques Universitaires St-Luc
Fysiopathologie Er moet een intestinale perturbatie zijn:
antibiotherapie chemotherapie radiotherapie
Natuurlijke barrières verstoord:
immunogedeprimeerden inname van anti-zuur middelen
omgeving die veel sporen bevat (nosocomiaal)
Rust en revalidatiecentra
Cliniques Universitaires St-Luc
dieren
Fysiopathologie Er moet een intestinale perturbatie zijn:
antibiotherapie chemotherapie radiotherapie
Natuurlijke barrières verstoord:
immunogedeprimeerden inname van anti-zuur middelen
omgeving die veel sporen bevat (nosocomiaal)
Cliniques Universitaires St-Luc
Fysiopathologie Er moet een intestinale perturbatie zijn:
antibiotherapie chemotherapie radiotherapie
Natuurlijke barrières verstoord:
immunogedeprimeerden inname van anti-zuur middelen
omgeving die veel sporen bevat (nosocomiaal)
Leeftijd Cliniques Universitaires St-Luc
Fysiopathologie Er moet een intestinale perturbatie zijn:
antibiotherapie chemotherapie radiotherapie
Natuurlijke barrières verstoord:
immunogedeprimeerden inname van anti-zuur middelen
omgeving die veel sporen bevat (nosocomiaal) leeftijd
Cliniques Universitaires St-Luc
Therapie
Intestinale perturbatie
normale darmflora herstellen
-stopzetten van de antibiotherapie -behandeling tegen C. difficile : metronidazole vancomycine transplantatie
Cliniques Universitaires St-Luc
Serogroup C stammen geisoleerd bij epidemies in :
Belgie Frankrijk Zwitzerland Duitsland Canada Cliniques Universitaires St-Luc
Benin Zuid-Afrika
NAP1/027 een nieuw opduikende C. difficile stam In 2002
epidemies Canada ~2000 overlijdens verhoogde Morbiditeit verhoogde Mortaliteit USA, GB, Frankrijk, Nederland en België
Cliniques Universitaires St-Luc
Cliniques Universitaires St-Luc
Outbreaks due to Type 027
Sporadic cases due to Type 027
Cliniques Universitaires St-Luc
CD NAP1/027 in Europe
Cliniques Universitaires St-Luc
February – June 2004 outbreak at the Stoke Mandeville Hospital (UK) (CDR weekly 2005:15) (Eurosurveillance 2005:10;6) o 150 patients o 12 deaths o Almost all strains : NAP1/027 o Parallel with a change of AB regimen (moxifloxacin)
April - July 2005 outbreak in Hardewijk (Netherlands) (Eurosurveillance 2005:10;7) o Incidence : 4/10 000 pt admissions 83/10 000 o Typical NAP1/027
September 2005 outbreak in Ieper (Belgium) (Eurosurveillance 2005:10;10) o Incidence : 10/10 000 adm(Jan 05) 33/10 000 (Sep 05) o 4 patients (>70 y.) 1 death o Typical NAP1/027
First Australian isolation of epidemic Clostridium difficile PCR ribotype 027 Med J Aust. 2009 Jun 15;190(12):706-8 Riley TV, Thean S, Hool G, Golledge CL.
Cliniques Universitaires St-Luc
Cliniques Universitaires St-Luc
22 / 12 / 2009
Waarom is deze NAP1/027 stam zo virulent?
Cliniques Universitaires St-Luc
NAP1/027 isolate
Cliniques Universitaires St-Luc
o
Toxinotype III
o
18bp deletion tcdC
o
Mutation position 117 in tcdC
o
Increased production tox A and B
o
Ribotype 027/ PFGE NAP1
o
Binary toxin
o
FQ resistance
Waarom een referentiecentrum Clostridium difficile?
Cliniques Universitaires St-Luc
Hoe erg is het bij ons?
Cliniques Universitaires St-Luc
Surveillance Clostridium difficile in de belgische ziekenhuizen http://www.iph.fgov.be/nsih/download/CDIF/CDIF_SurvProt_v4_NL.pdf
Sinds 1-7-2006, verplicht bij K.B. sinds 1-7-2007 Minstens één semester / jaar « epidemiologische » surveillance « microbiologische» surveillance
Cliniques Universitaires St-Luc
2006
Cliniques Universitaires St-Luc
Cliniques Universitaires St-Luc
Evolutie sinds de surveillance 2 soorten data: -gebaseerd op microbiologische typering Data: Referentielaboratorium Clostridium difficile
-gebaseerd op epidemiologische statistieken Data: Dr Marie-Laurence Lambert WIV
Cliniques Universitaires St-Luc
-gebaseerd op microbiologische typering
% Lab’s
Cliniques Universitaires St-Luc
-gebaseerd op microbiologische typering
% strains
Cliniques Universitaires St-Luc
Clostridium difficile in bereide vleeswaren
Gould L H , Limbago B Clin Infect Dis. 2010;51:577-582 Cliniques Universitaires St-Luc
-gebaseerd op epidemiologische statistieken Brutto sterfgevallen, door Clostridium difficile infectie - België 1998-2008
Cliniques Universitaires St-Luc
Bron: overlijdensregister. Code CDI-10A047: CDI als doodsoorzaak Data: Dr Marie-Laurence Lambert WIV
-gebaseerd op epidemiologische statistieken
Healthcare-associated cases/10.000 hosp-days 0 1 2 3 4 5 6
Ziekenhuis-gerelateerde CDI
0 6/S 2
0 7 /S1
0 7 /S2
0 8 /S1
0 8/S 2
0 9 /S 1
0 9 /S 2
exc l udes out si de v al ues
Cliniques Universitaires St-Luc
Data: Dr Marie-Laurence Lambert WIV
1 0 /S1
-gebaseerd op epidemiologische statistieken
Cliniques Universitaires St-Luc
Data: Dr Marie-Laurence Lambert WIV
-gebaseerd op epidemiologische statistieken
CDIFals cause principaledoodsoorzaak du décès OUofcause associée CDIF voornaamste gerelateerd (en Flandre) (in Vlaanderen) 180 160 140 120 100 80 60 40 20 0
home hospital nursing home total
1998 1999 2000 2001 2002 2003 2004 2005 2006
Data: Dr Marie-Laurence Lambert WIV Cliniques Universitaires St-Luc
-gebaseerd op epidemiologische statistieken
Data: Dr Marie-Laurence Lambert WIV Cliniques Universitaires St-Luc
-gebaseerd op epidemiologische statistieken
Data: Dr Marie-Laurence Lambert WIV Cliniques Universitaires St-Luc
Evolutie sinds de surveillance In het buitenland Frankrijk Nederland
Cliniques Universitaires St-Luc
Cliniques Universitaires St-Luc
Bron:Institut de veille sanitaire
Surveillance in Frankrijk
Bron:Institut de veille sanitaire Cliniques Universitaires St-Luc
Eurosurveillance, Volume 14, Issue 45, 12 November 2009 Rapid communications Decrease of hypervirulent Clostridium difficile PCR ribotype 027 in the Netherlands M P Hensgens1, A Goorhuis1, D W Notermans2, B H van Benthem2, E J Kuijper
NAP1/O27
Cliniques Universitaires St-Luc
Andere therapie voor NAP1/027
Intestinale perturbatie--- normale darmflora herstellen
-Stopzetten van de antibiotherapie -behandeling tegen C. difficile : metronidazole vancomycine transplantatie
Cliniques Universitaires St-Luc
Behandeling NAP1/027
Cliniques Universitaires St-Luc
Cliniques Universitaires St-Luc
Kelly C and LaMont J. N Engl J Med 2008;359:1932-1940 Cliniques Universitaires St-Luc
Kelly C and LaMont J. N Engl J Med 2008;359:1932-1940 Cliniques Universitaires St-Luc
Kelly C and LaMont J. N Engl J Med 2008;359:1932-1940 Cliniques Universitaires St-Luc
c
Kelly C and LaMont J. N Engl J Med 2008;359:1932-1940 Cliniques Universitaires St-Luc
Both Oral Metronidazole and Oral Vancomycin Promote Persistent Overgrowth of Vancomycin-Resistant Enterococci during Treatment of Clostridium difficile-Associated Disease Wafa N. Al-Nassir,1 Ajay K. Sethi,2 Yuejin Li,3 Michael J. Pultz,3 Michelle M. Riggs,3 and Curtis J. Donskey3* ANTIMICROBIAL AGENTS AND CHEMOTHERAPY, July 2008, p. 2403–2406 Vol. 52, No. 7
Cliniques Universitaires St-Luc
Perspectieven 1 metagenomics
Cliniques Universitaires St-Luc
1 metagenomics Microbioom : cartografie van het darmstelsel totaal 1026 verschillende soorten bacteriën waarvan 60 species 80 à 90% uitmaken, en bij 50% van de totale wereldbevolking voorkomen
Cliniques Universitaires St-Luc
Therapie NAP1/027
Intestinale perturbatie--- normale darmflora herstellen
-Stopzetten van de antibiotherapie -behandeling tegen C. difficile : metronidazole vancomycine transplantatie
Cliniques Universitaires St-Luc
Darmflora voor een Clostridium difficile infectie
Darmflora bij:
C. difficile infectie
NAP1/027 infectie
Darmflora na:
C. difficile infectie
NAP1/027 infectie
Cliniques Universitaires St-Luc
Feces transplantatie
Changes in the Composition of the Human Fecal Microbiome After Bacteriotherapy for Recurrent Clostridium difficile-associated Diarrhea Khoruts, Alexander MD; Dicksved, Johan PhD; Jansson, Janet K. PhD; Sadowsky, Michael J. PhD Cliniques Universitaires St-Luc
Journal of Clinical Gastroenterology: May/June 2010 - Volume 44 - Issue 5 - pp 354-360
Cliniques Universitaires St-Luc
Pro
biotica
Post
biotica
Perspectieven 2 preventie perspectieven
Cliniques Universitaires St-Luc
Preventie perspectieven: -probiotica:
Sacharomyces boulardii Bacillus subtilis Clostridium difficile niet toxinogene stam
Passieve immunotherapie: gammaglobulines hyperimmune koe-melk monoclonale antistoffen Actieve immunotherapie: vaccin?
Intercell Oostenrijk (fase I) Acambis + Sanofi (fase II)
Antistoffen dosage: bio-Mérieux Cliniques Universitaires St-Luc
2 preventie perspectieven A -niet toxinogene Clostridium difficile ViroPharma (begin fase II) VP 20621
Cliniques Universitaires St-Luc
Preventie perspectieven: -probiotica:
Sacharomyces boulardii Bacillus subtilis Clostridium difficile niet toxinogene stam
Passieve immunotherapie: gammaglobulines hyperimmune koe-melk monoclonale antistoffen Actieve immunotherapie: vaccin?
Intercell Oostenrijk (fase I) Acambis + Sanofi (fase II)
Antistoffen dosage: bio-Mérieux Cliniques Universitaires St-Luc
2 preventie perspectieven B –hyperimmune koemelk MucoVax (fase II) werkt maar bankroet Mucomilk
Cliniques Universitaires St-Luc
Preventie perspectieven: -probiotica:
Sacharomyces boulardii Bacillus subtilis Clostridium difficile niet toxinogene stam
Passieve immunotherapie: gammaglobulines hyperimmune koe-melk monoclonale antistoffen Actieve immunotherapie: vaccin?
Intercell Oostenrijk (fase I) Acambis + Sanofi (fase II)
Antistoffen dosage: bio-Mérieux Cliniques Universitaires St-Luc
2 preventie perspectieven C –monoclonale antistoffen
Cliniques Universitaires St-Luc
Treatment of Clostridium difficile Infection with monoclonal antibodies
Time to Recurrence of Clostridium difficile Infection (CDI).
Lowy I et al. N Engl J Med 2010;362:197-205
2 preventie perspectieven C –monoclonale antistoffen
Cliniques Universitaires St-Luc
Preventie perspectieven: -probiotica:
Sacharomyces boulardii Bacillus subtilis Clostridium difficile niet toxinogene stam
Passieve immunotherapie: gammaglobulines hyperimmune koe-melk monoclonale antistoffen Actieve immunotherapie: vaccin?
Intercell Oostenrijk (fase I) Acambis + Sanofi (fase II)
Antistoffen dosage: bio-Mérieux Cliniques Universitaires St-Luc
2 preventie perspectieven d –vaccins? doelgroep? kostprijs? efficientie?
Cliniques Universitaires St-Luc
Perspectieven 3 diagnostiek
Cliniques Universitaires St-Luc
Toxigenic culture
Diagnostiek
Cult
+
+
+
and
CTA
-
+
-
CCFAT
CDI
+ Tox A/B on colonies +
CDI Cliniques Universitaires St-Luc
-
no CDI
CDI
-
-
no CDI
no CDI
Indien toxine bepaling in de stoelgang negatief blijft: “second
look” op de kolonies van de kweek
Laboratory diagnosis of Clostridium difficile-associated diarrhoea: a plea for culture Michel Delmée, Johan Van Broeck, Anne Simon, Michèle Janssens, and Véronique Avesani J Med Microbiol 2005. 54: 187-191.
Cliniques Universitaires St-Luc
1996 – 2008 results (13 years) 37915 stools
4001 C. difficile positive 2755 toxin positive (69%) prevalence: 7,2%
2755 toxin positive samples
1637 toxin in stool (59%) 1148 toxin on colonies (41%)
Cliniques Universitaires St-Luc
TAT voor CDIF diagnostiek in uren:
sensitivity
12345
24
48
96
99,50%
100%
100 %
99,50%
100%
100 %
Toxigenic culture
GDH +TOX A&B + Toxigenic culture 90 % PCR 90 %
100% GDH +TOX A&B + PCR + culture 99 %
100%
100 %
GDH +TOX A&B + PCR + culture on chromogenic medium 99 %
100%
100 %
PCR vs toxin detection Cytotoxicity
~ 70-80 % sens.
Immunoassays ~ 70-80 % sens. PCR
Cliniques Universitaires St-Luc
~ 85-95 % sens.
PCR vs toxin detection Cytotoxicity
~ 70-80 % sens.
Immunoassays ~ 60-70 % sens. PCR
Opgelet!
~ 85-95 % sens.
Gold standard: cytotoxicity toxigenic culture Prevalentie! Kwaliteit van de kweek!
Cliniques Universitaires St-Luc
Molecular biology tests author
Test
N. samples
Preval.
SENS
SPEC PPV NPV
Barbut 2009
BD GeneOhm
300
8.6
93.9
97.9
83.8
99.2
Tenover 2010
GeneXpert
2296
10.8
93.5
94.0
73.0
98.8
Van Broeck 2010
GeneXpert
231
9.7
87.0
96.7
74.1
98.6
Barbut 2010 Illumigene
470
10.2
94.1
100
68
99.8
296
7.4
85.7
99.6
94.7
98.9
Van Broeck 2011
Cliniques Universitaires St-Luc
Illumigene
Molecular biology tests GeneOhm
RT-PCR
tcdB
Semi-automated 2h
GenXpert
RT-PCR
tcdB, binary toxin, tcdC deletion
Automated, 1h
Illumigene*
LAMP
Tcd A
*Niet op ingevroren stalen!
Cliniques Universitaires St-Luc
Semi-automated 90min
Molecular biology tests
Probleem: prijs terugbetaling
Cliniques Universitaires St-Luc
Economisch algorithme
GDH and Tox A&B
+
+
CDI
-
-
+
no CDI
-
+
RT-PCR tcdB + CDI
Cliniques Universitaires St-Luc
-
-
no CDI
GDH as screening test Toxigenic culture +
-
GDH
+
16
21
GDH
-
2
161
Sensitivity : Specificity : PPV : NPV : Cliniques Universitaires St-Luc
Van Broeck et al. ECCMID Helsinki
88.9 % 88.5 % 43.2 % 98.8 %
GDH as screening test stool cytotoxin
toxigenic culture +
-
+
-
GDH
+
145
108
GDH
+
39
35
GDH
-
0
186
GDH
-
1
291
Sensitivity : Specificity : PPV : NPV :
Cliniques Universitaires St-Luc
100 % 63.3 % 57.3 % 100 %
Reller et al. J. Clin. Microbiol. 2007;45:3601-05
Sensitivity : Specificity : PPV : NPV :
97.5 % 90.5 % 52.7 % 99.7 %
Ticehurst et al. J. Clin. Microbiol. 2006;44:1145-9
GDH versus TC or CTA
Shetty JHI 2011 77 (1-6)
Cliniques Universitaires St-Luc
PCR versus screening GDH+Tox A&B >PCR
PCR
Author
test
Van Broeck
BD-GeneOhm
Van Broeck
GeneXpert
3°iCDS Bled
Van Broeck
illumigene
Icaac Chicago
Vandecandelaere
GeneXpert
Goldenberg
BD-GeneOhm
JHI
Larson
home-made
Novak
GeneXpert
Cliniques Universitaires St-Luc
year
N
GDH + ToxA&B >PCR
Gold st.
sens.
spec.
sens.
spec.
TC
91,7
96,5
90,5
99
2010 231
TC
87
96,7
82,6
98, 1
2011
TC
85,7
99,6
81
99,6
TC
-
-
96,2
99,8
2010 500
TC
-
-
94
99
JCM
2010 699
TC
97,5
99,7
83,8
99,7
JCM
2010 428
TC
94,4
96,3
86,1
94,4
ECCMID Vienna 2010 605
ECCMID Milano 2011 1137
Perspectieven Maldi Tof?
Cliniques Universitaires St-Luc
Maldi-Tof
Cliniques Universitaires St-Luc
Perspectieven: Chromogene voedingsbodem
Cliniques Universitaires St-Luc
Chromogene voedingsbodem voor CDIF (bio-Mérieux ) aflezen na 24 uur
Perry, J. D. et al. 2010. J. Clin. Microbiol. 48(11):3852-3858
Cliniques Universitaires St-Luc
Perspectieven: *Substraat detectie op Maldi-TOF *Biocartis joint venture met bio-Mérieux Volautomatisch RT-PCR systeem op stoelgang (Het Apollo project)
*Platelia (Biorad) *Liaison test (Diasorin) Cliniques Universitaires St-Luc
conclusie: -Incidentie is gestabiliseerd, maar hoger dan voor 2003 -NAP1/027 is gedaald -nieuw opduikende stammen -community CDAD in opmars -noodzakelijke surveillance -fysiopathologie voor NAP1/027 is verschillend -PCR testen, de toekomst voor snellere diagnose
Cliniques Universitaires St-Luc
dank aan
Prof. M. Delmée Véronique Avesani Michèle Janssens Nathalie de Fierlant
Wie zijn wij?
Cliniques Universitaires St-Luc
Dank u voor uw aandacht en dank aan
Prof. M. Delmée
Véronique Avesani Michèle Janssens Nathalie de Fierlant
Wie zijn wij?
Cliniques Universitaires St-Luc
NAP1/027 isolate
Cliniques Universitaires St-Luc
o
Toxinotype III
o
18bp deletion tcdC
o
Mutation position 117 in tcdC
o
Increased production tox A and B
o
Ribotype 027/ PFGE NAP1
o
Binary toxin
o
FQ resistance
NAP1/027 isolate
Cliniques Universitaires St-Luc
o
Toxinotype III
o
18bp deletion tcdC
o
Mutation position 117 in tcdC
o
Increased production tox A and B
o
Ribotype 027/ PFGE NAP1
o
Binary toxin
o
FQ resistance
Genes coding for toxins of C. difficile Het Paloc gene (Pathogenicity Locus) Rupnik et al.
tcd D
tcd B
up regulator
Cliniques Universitaires St-Luc
tcd E
tcd A
tcd C
down regulator
Het Paloc gene (Pathogenicity Locus) Rupnik et al.
tcd D
tcd B
tcd E
tcd A
deletion
Cliniques Universitaires St-Luc
tcd C
Het Paloc gene (Pathogenicity Locus) Rupnik et al.
tcd D
tcd B
tcd E
tcd A
deletion
Cliniques Universitaires St-Luc
tcd C
Toxinotyping Het Paloc gene (Pathogenicity Locus) Rupnik et al.
Cliniques Universitaires St-Luc
Toxinotyping 78 à 88 %
of all strains
toxinotype 0
3%
of all strains
toxinotype III
NAP 1/ 027 toxinotype III
Cliniques Universitaires St-Luc
Toxinotyping
NAP 1/ 027 Toxinotype III
Cliniques Universitaires St-Luc
NAP1/027 isolate
Cliniques Universitaires St-Luc
o
Toxinotype III
o
18bp deletion tcdC
o
Mutation position 117 in tcdC
o
Increased production tox A and B
o
Ribotype 027/ PFGE NAP1
o
Binary toxin
o
FQ resistance
Het Paloc gene (Pathogenicity Locus) Rupnik et al.
tcd D
tcd B
tcd E
tcd A
tcd C
deletion
Cliniques Universitaires St-Luc
NAP1/027 isolate
Cliniques Universitaires St-Luc
o
Toxinotype III
o
18bp deletion tcdC
o
Mutation position 117 in tcdC
o
Increased production tox A and B
o
Ribotype 027/ PFGE NAP1
o
Binary toxin
o
FQ resistance
Genes coding for toxins of C. difficile Het Paloc gen (Pathogenicity Locus) pointmutation at position 117
Rupnik et al.
tcd D
tcd B
up regulator
Cliniques Universitaires St-Luc
tcd E
tcd A
tcd C
down regulator
NAP1/027 isolate
Cliniques Universitaires St-Luc
o
Toxinotype III
o
18bp deletion tcdC
o
Mutation position 117 in tcdC
o
Increased production tox A and B
o
Ribotype 027/ PFGE NAP1
o
Binary toxin
o
FQ resistance
Toxine A
Toxine B
Cliniques Universitaires St-Luc
NAP1/027 isolate
Cliniques Universitaires St-Luc
o
Toxinotype III
o
18bp deletion tcdC
o
Mutation position 117 in tcdC
o
Increased production tox A and B
o
Ribotype 027/ PFGE NAP1
o
Binary toxin
o
FQ resistance
Pulsed Field Gel Electrophoresis Enzymatic restriction of the whole genome
electroforese 8 7
8
6 5 4 3
5
3
2 1 6
4
Restriction site
7
1
2
1a 1a
2a
1b
2a
2a 2a
2a
2a
2a
Pulsed Field Gel Electrophoresis The strain NAP 1/ 027 North America Pfge type 1
Warny et al.
Cliniques Universitaires St-Luc
Cliniques Universitaires St-Luc
Intergenic spacer region Primer 2
16 S Primer 1
Cliniques Universitaires St-Luc
23 s
Cliniques Universitaires St-Luc
NAP1/027 isolate
Cliniques Universitaires St-Luc
o
Toxinotype III
o
18bp deletion tcdC
o
Mutation position 117 in tcdC
o
Increased production tox A and B
o
Ribotype 027/ PFGE NAP1
o
Binary toxin
o
FQ resistance
Genes coding for toxins of C. difficile Het Paloc gene (Pathogenicity Locus) Rupnik et al.
tcd D
tcd B
up regulator
Cliniques Universitaires St-Luc
tcd E
tcd A
tcd C
down regulator
Locus binair toxine CDT
cdtA
1382 bp
cdtB
52 bp
2628 bp
CDTc CDTa Cliniques Universitaires St-Luc
CDTb
CDTc 4.3 kb ou 2.3 kb
NAP1/027 isolate
Cliniques Universitaires St-Luc
o
Toxinotype III
o
18bp deletion tcdC
o
Mutation position 117 in tcdC
o
Increased production tox A and B
o
Ribotype 027/ PFGE NAP1
o
Binary toxin
o
FQ resistance
Influence of antibiotics
Cliniques Universitaires St-Luc
Nombre Ribotype 197 027 80 16 52 16a 36 32 35 46 34 3 30 23 27 23b
Cliniques Universitaires St-Luc
dank aan
Prof. M. Delmée Véronique Avesani Michèle Janssens Nathalie de Fierlant
Wie zijn wij?
Cliniques Universitaires St-Luc
Dank u voor uw aandacht en dank aan
Prof. M. Delmée
Véronique Avesani Michèle Janssens Nathalie de Fierlant
Wie zijn wij?
Cliniques Universitaires St-Luc
This document was created with Win2PDF available at http://www.win2pdf.com. The unregistered version of Win2PDF is for evaluation or non-commercial use only. This page will not be added after purchasing Win2PDF.