Sejtbiológia kulcsszó lista 2005/2006 Az alábbi lista néhány fontos sejtalkotó, molekula és fogalom jegyzéke, melynek ismerete (mi az, hol és mikor található a sejtben, hogyan működik, mely molekulákkal kapcsolódik) alapvető sejtbiológiai tudásnak számít. Kibocsátás ideje: 2006. május 21. Bevezetés arche- és eubaktériumok Escherichia coli kompartmentalizáció exon, intron transzkripció, transzláció, splicing sejtkultura változékonyság szelekció fagocitózis heterotróf autotróf anaerób aerób ATP DNS RNS mRNS protein riboszómák genotipus fenotipus katalizis enzim trigger –elv kaszkád-elv feed-back szabályozások egysejtűek többsejtűek protozoa élesztő növények állatok fotoszintézis kemoszintézis oxidativ foszforiláció Sejtmembrán foszfolipid foszfatidilkolin koleszterol telített telítettlen hidrofób hidrofil amfipatikus detergens lipid kettősréteg plazmamebrán a membránok barrier funkciója membrane protein bakteriorodopszin sejt cortex szénhidrát réteg glycocalix membrán domén
1
Sejtbiológia kulcsszó lista 2005/2006 mikrodomén lipidraft makrodomén laterális diffúzió lipid flip-flop lipid rotáció Membrántranszporterek, ABC-transzporterek A részecskék szabad diffúziója a lipid kettősrétegen keresztül Elektrokémiai gradiens Megoszlási hányados Facilitált diffúzió Carrier mediálta traszport Passzív transzport Aktív transzport és fajtái Csatolt transzport és fajtái Na/glükóz csatolt transzport Na/Ca csatolt transzport Na/K pumpa Ca-pumpa glükóz uniport P-típusú és V-típusú transzporterek ABC transzporterek kategóriái expressziójuk az evolúció során expressziójuk a szervezetben működésük hiánya betegségekben szubsztrátjaik tulajdonságai szubsztrát spektrumuk mdr1/ABCB1/Pgp PC flippáz (foszfatidil-kolin) CFTR TAP Lipofil anyagok passzív diffúziója Henderson-Hasselbach egyenlet és jelentése Ampifil anyagok Intracelluláris membránrendszerek a sima felszínű endoplazmatikus retikulum funkciói az ER szignálszekvencia szerepe a fehérjék szortírozásában a klatrin burok kialakulása hogyan szelektálódnak a transzmembrán fehérjék receptor mediált endocitózis során; az AP-2 szerepe minőségellenőrzés az ER-ben a Golgi komplexum kompartmentumai protein szortírozás a transz Golgi hálózatban (lizoszómális útvonal, konstitutív és regulált szekréció) az endocitózis, a pinocitózis, a fagocitózis és a receptor mediált endocitózis definíciója a savas késői endoszómák funkciója az LDL receptor mediált endocitózis követő szortírozásában a lizoszómák szerepe (mit tartalmaznak, mi jellemző a luminális környezetre, hogyan kerülnek a lebontandó anyagok a lizoszómákba) Ionmilliő Ca2+ homeosztázis Molekulák: plazma membrán Na+/Ca2+ kicserélő plazma membrán Ca2+ ATP-áz plazma membrán Ca2+ csatorna (feszültség kapuzott) plazma membrán Ca2+ csatorna (ligand kapuzott) plazma membrán Ca2+ csatorna (másodlagos hírvivő kapuzott) plazma membrán Na+/K+ ATP-áz dihidropiridin (DHP) receptor SERCA ATP-áz
2
Sejtbiológia kulcsszó lista 2005/2006 IP3 receptor rianodin receptor kalretikulin kalszekvesztrin mitokondriális Na+/Ca2+ kicserélő mitokondriális H+/Ca2+ kicserélő mitokondriális független Ca2+ szállító troponin parvalbumin kalmodulin digoxin IP3 glikogén foszforiláz kináz miozin könnyű lánc kináz Ca2+-kalmudulin függő kináz II. Sejtalkotók: endoplazmatikus retikulum szarkoplazmatikus retikulum mitokondrium Ozmo- és volumenreguláció feszülés kapuzott Cl- csatorna depolarizáció aktivált K+ csatorna Na+/H+ antiport Cl-/HCO3 antiport szénsav anhidráz enzim organikus anion transzporter taurin pH szabályozás Na+/H+ antiport Cl-/HCO3 antiport Cl−/Na+, HCO3− transzporter Citoszkeleton Aktin filamentum Sejt kortex Centriólum Centroszóma Cilium Citoszkeleton Dinamikus instabilitás Dinein Filopodium Flagellum Intermedier filamentum Kinezin Lamellipódium Mikrotubulus Motor fehérjék Miofibrillum Miozin Nukleáris lamina Polaritás Rho fehérje család Szarkomer Tubulin Sejt és környezete
3
Sejtbiológia kulcsszó lista 2005/2006 Kollagén Fibronektin Integrin Kadherin N-CAM ICAM Szelektinek Extravazáció szoros junkció adherens junkció dezmoszóma hemidezmoszóma fokális adhézió rés junkció konnexin Energiaforgalom, mitokondrium ATP Glikolízis ATP szintetáz Kemiozmotikus elmélet Mátrix Kriszta Mitokondrium Kloroplasztisz oxidatív foszforiláció proton gradiens elektrokémiai potenciálja belső membrán külső membrán porin, kardiolipin mitokondriális DNS légzési lánc membránok közötti tér Sejtmag és kromatin szerkezet, magmembrán DNS replikáció DNS repair és rekombináció A diploid emberi sejt DNS tartalma repetitiv elemek kromatin eukromatin, heterokromatin magburok, magmembrán mag matrix, nukleoszkeleton nukleoplasma 30 nm-es rost A kromatin gyöngysorszerű szerkezete hisztonok, core-hisztonok, H1 hiszton nukleoszóma nukleoszóma “phasing” kromatin remodelling DNáz szenzitivitás DNáz hiperszenzitivitás, DNáz hiperszenzitiv helyek MAR/SAR szekvenciák (scaffold/matrix attached regions) kromatin hurkok interfázis és metafázis kromoszómák másodlagos befűződés, nucleolus organizator nucleolus replikációs, transzkripciós gyárak/fókuszok RNS polimeráz enzim nukleáris szuborganellumok, testek epigenom (hiszton-kód) regrutálás
4
Sejtbiológia kulcsszó lista 2005/2006 PEV (position effect variegation) promoter enhancer Az eukarióta génszabályozás repressziv természete nukleáris lamina magpórusok, NPC (nuclear pore complex) nukleoporinok importin beta Ran-GTP és Ran-GDP grádiens cargo NLS (nuclear localization signal) Ran-GAP, Ran-GEF (RCC1) A riboszóma biogenezisében szerepet játszó magi transzportfolyamatok Sejtciklus sejtciklus interfázis mitózis citokinézis G0, G1, S, G2, M sejtciklus fázisok Start (= committment = restriction) pont (sejtciklus) nucleozid-analóg inkorporáció DNS eloszlási hisztogram euploid és aneuploid sejtek hómérséklet-szenzitiv (temperature sensitive, ts) mutánsok Xenopus oocita topoisomeráz II mitózis fázisai (profázis, stb.) centroszóma, centriólum, centroszóma v. centriólum ciklus MTOC=centroszóma kinetochor osztódási orsó motor fehérjék kromoszómák nukleáris lamina osztódási barázda colchicin metafázis blokk anafázis promoveáló (elősegitő) komplex, anaphase promoting complex (APC) kinetochor, asztrális, poláris (overlap) microtubulusok dinamikus instabilitás ciklin dependens kináz (cdk) ciklin mitosis promoting factor, MPF aktiváló foszfatáz aktiváló kináz inaktiváló kináz ubiquitináció proteolizis proteaszómák laminok pozitiv feedback negativ feedback checkpointok, checkpoint mechanizmusok, checkpoint kontrol p53 p21, CDKI (cdk inhibitor) Jelátvitel 7 membrane spanning (7 transzmembrán receptor, G proteinhez kapcsolt receptorok) A típusú protein kináz (PKA) abl (Abelson leukaemia, onkogén) acetilkolin, acetilkolin receptor (muszkarinerg, nikotinerg)
5
Sejtbiológia kulcsszó lista 2005/2006 adapter (fehérje) adenilát cikláz ADP-riboziláció adrenalin adrenerg (receptor, beta, alfa) atriális natriuretikus faktor receptor autofoszforiláció / transzfoszforiláció autokrin (~hurok) cAMP (ciklikus AMP), cAMP foszfodieszteráz cGMP , cGMP foszfodieszteráz cGMP függő kináz (PKG) citokin receptor családok citoplazmatikus tirozin kináz CRE (cAMP Response Element) DAG (diacilglicerol) Death Domain (DD) defoszforiláció dimerizáció, oligomerizáció (receptor ...) DISC (sejthalált indukáló szignál komplexet, death inducing signal complex) domének (fehérje ...) D-vitamin EGF (epidermális növekedési faktor) epidermal growth factor (EGF) EGFR (EGF receptor, ErbB1) endokrin ErbB2 (receptor tirozin kináz) Fas (receptor) foszfatidilinozitol biszfoszfát (PIP2) foszfatidilinozitol-3-kináz (PI3K) foszfolipáz C (PLCβ, PLCγ) foszfotirozin G proteinek és csoportjaik GAP (GTP-áz aktivátor fehérje) gap junkció GEF (guanin nukleotid cserélő faktor) glikogén GLUT-4 (glükóz transzporter) GPI-kötött fehérjék GRB2 (adapter fehérje) Gt (fehérje, transzducin) GTP-áz guanilát cikláz (enzim) ideg-izom (kapcsolódás, kapcsolat) IL-2, IL-2 receptor (Interleukin-2 / receptor) immunszinapszis immunitás (celluláris, humorális) inozitol triszfoszfát (IP3) internalizáció intracelluláris receptor intrakrin inzulin receptor ioncsatorna működésű receptorok irányított szekréció JAK (kinázok) juxtakrin kalcium/kalmodulin függő kináz, foszfatáz kaszkád mechanizmusok kaszpáz (cisztein aszpartát savanyú proteáz) kináz klonális szelekció és expanzió kolera toxin koreceptor (CD4, CD8) limfocita (T, Th, CTL, B, plazmasejt, memóriasejt)
6
Sejtbiológia kulcsszó lista 2005/2006 limfocita differenciáció (antigén független és antigénfüggő fázis) lipid tutaj MAPK (mitogén aktivált protein kináz) MAPK kináz (MAPKK, vagy MEK) MHC I, MHC II (major hisztokompatibilitási komplex) membrán mikrodomén NO, NO szintáz onkogén parakrin PDGF (Platelet Derived Growth Factor) vérlemezke eredetű növekedési faktor) peptid prezentáció pertussis toxin Philadelphia kromoszóma PKC (protein kináz C) programozott sejthalál (programmed cell death , PCD) protein kináz B (Akt) protoonkogén Raf (kináz) Ras (fehérje) Rb (fehérje) receptor tirozin kináz (RTK) retinoidok Signal Transducers and Activators of Transcription (STAT) SMAC (Szupra-molekuláris aktivációs cluster) synaptobrevin + syntaxin, synaptotagmin + neurexin SOS (fehérje) SRC Homology domainek, SRC kináz család SRE (Serum Response Element) szinapszis (és típusai) szinaptikus jelátvitel (kémiai, elektromos) szteroid receptor szupercsalád TNF (tumor nekrózis faktor) T sejt receptor (TCR) transforming growth factor beta (TGFβ) Sejtsorsok Mitózis Citokinézis Sejtciklus fázisok Go állapot Start=commitment point=restriction point DNS eloszlási hisztogram Differenciáció Programozott sejthalál, apoptózis Nekrózis Sejt öregedés, immortalizáció Checkpoint-ok CDK inhibitorok Rb p53 p21 myc protoonkogének szupresszor (antionko)gének MyoD survival (túlélési) faktorok kontakt gátlás morfogén-gradiensek „anyai hatás” (ld. bicoid) activin bicoid
7
Sejtbiológia kulcsszó lista 2005/2006 Sonic hedgehog PML-RAR beta-catenine (FAP esetén) APC (FAP esetén) Hemopoézis Őssejt Felnőttkori őssejt Embrionális őssejt Sejtdifferenciáció Kolonia-stimuláló factor Eritropoetin Sejtvonulat Progenitor sejt Elkötelezett progenitor sejt Totipotens sejt Unipotens sejt Őssejt búvóhely Reproduktív klónozás Terápiás klónozás
8
