Wat heeft de veehouder aan Genomics

25/10/2010

Wat heeft de veehouder aan Genomics

Wat wil de veehouder?

Een goed inkomen halen van het bedrijf door het melken van koeien die:

Mario Calus en Johan van Arendonk

Animal Breeding & Genomics Centre Wageningen UR Livestock Research en Wageningen University

voldoende melk van goede kwaliteit produceren passen binnen het bedrijf prettig zijn om mee te werken goede gezondheid en vruchtbaarheid hebben

Fokkerij kan bijdragen aan het realiseren hiervan

Animal Breeding & Genomics Centre

Fokkerij op melkveebedrijf

Bepalen van het fokdoel: welke kenmerken zijn belangrijk bij selecteren van koeien en stieren

Stap 2:

beschikbaar Selecteren van de stieren op basis van fokwaarden, beschikbaarheid en prijs

Stap 3:

Stap 4:

Selecteren van koeien

Stap 4:

Stap 1:

Selecteren van de stieren op basis van fokwaarden, beschikbaarheid en prijs

Stap 3:

Bepalen van het fokdoel: welke kenmerken zijn belangrijk bij selecteren van koeien en stieren

Stap 2:

Fokkerij op melkveebedrijf: rol van Genomics

Stap 1:


Paring en hopen op een vaarskalf

Selecteren van koeien

toekomst

Paring en hopen op een vaarskalf



Voortplanting en genetische variatie

De rol van genomics: nader toegelicht

Door meiose: unieke combinaties van genen in elke nakomeling (variatie binnen-familie) Deze binnen-familie variatie vormt belangrijke bron voor genetische verbetering

Hoe


e en w vind

e de b

ste?


1

25/10/2010

Nakomelingenonderzoek: cruciale rol Metingen aan dieren in populatie

Genomic selection

Model genetische achtergrond

Familierelaties

3 0 0 2 5 0

Aantal (n)

2 0 0 1 5 0 1 0 0 5 0 0 0 .8

1 .2

1 .6

2

2 .4

2 .8

3 .2

3 .6

4

4 .4

4 .8

5 .2

V e tp e rc e n ta g e

5 .6

6

6 .4

6 .8

7 .2

7 .6

8

8 .4

8 .8

%

Fokstieren 60k SNP-chip



Genotype= typering van genetisch materiaal

Per dier zijn dan 54.001 SNP’s bekend, verdeeld over het hele genoom (alle chromosomen) SNP=verschil op 1 plaats in DNA

Zo ziet het er dan uit: dier 1 AAGTATTATCTT… A A G T A T T A T C T T …. dier 2

En

AAGTATTATCTT… AAGAATTATCTT

…


Genomic selection bij melkvee

01x 0 . 4 5 dan t a d


Betrouwbaarheid (r2IH) EBV jonge stieren (CRV, 2009)

Stap 1: Schatting van effecten van SNP Op basis van stieren met bekende fokwaarde en genotypen (=referentiepopulatie) Stap 2. Bereken fokwaarden voor jonge dieren op basis van SNP genotypen Som van geschatte SNP effecten

Voordeel

Fokwaarde met hoge betrouwbaarheid op jonge leeftijd (zonder nakomelingen onderzoek)



2

25/10/2010

Fokwaarden publicatie augustus 2010

Genomic fokwaarden

+350

Genomics is nieuwe informatie=bron

+300 +250 +200

Betrouwbaarheid genomics fokwaarde vergelijkbaar met ~15 melkgevende dochters

+150 NVI

Nationaal Interbull Genomic

+100 +50 +0 -50

0

20

40

60

80

100

120

-100 -150 -200



Betrouwbaarheid

Genomics fokwaarden

Verandering individuele fokwaarden (augustus) +80

Betrouwbaarheid op jonge leeftijd relatief hoog, maar lager dan van fokstieren

+60

Verandering in NVI

Kan eenzijdig gebruik van 1 jonge Genomics=stier leiden tot teleurstelling?

=> Welke verandering mogen we verwachten, gegeven de betrouwbaarheid???

Betrouwbaarheid

+40

Genomics stieren +20 +0 50

60

70

80

90

100

110

-20 -40 -60 Betrouwbaarheid



Verandering ‘gewone’ fokwaarden per groep

25

25

20

20

15

15

10 5

Gemiddeld

0 50

60

70

80

90

100

Verandering in NVI

Verandering in NVI


10

0 50

-5

-5

-10

-10

-15

Gemiddeld Gem abs diff

5

60

70

80

90

100

-15 Betrouwbaarheid

Betrouwbaarheid



3

25/10/2010

25 20

Verandering in NVI

15 10 Gemiddeld Gem abs diff

5 0 50

60

70

80

90

100

-5 -10 -15

Maximale verandering: 1 vs. team genomics=stieren Maximale verandering (NVI) voor 95% van de stieren


100 90 80 70 60 1 stier team met 5 stieren

50 40 30 20 10 0

Betrouwbaarheid

50

60

70

80

90

100

Betrouwbaarheid Animal Breeding & Genomics Centre

Genomics fokwaarden


Genomic fokwaarden: ontwikkelingen

Individuele fokwaarde kan redelijk wijzigen

Verhoging betrouwbaarheid door meer merkers+verbetering methoden

Genomic fokwaarden ook voor andere rassen mogelijk

Toepassing door meerdere organisaties (+omrekening via Interbull)

Betrouwbaarheid van een groep jonge GS=stieren is wel hoog => Gebruik van ‘team’ jonge GS=stieren voorkomt gemiddeld genomen teleurstellingen



Wat betekent Genomics voor ‘moeilijke’ kenmerken

Genomics op koeien binnen bedrijf?

Goedkope testen op basis van 3.000 merkers

Bijv. levensduur => gegevens pas laat beschikbaar

In de toekomst mogelijkheid om:

Met genomics:

Jongvee te testen: welke vaarzen aanhouden? Nauwkeuriger fokwaarde van koeien


Optimaal gebruik van informatie stieren met veel dochters Direct een fokwaarde met redelijke betrouwbaarheid voor jonge dieren grotere kans op selectie


4

25/10/2010

Selectie voor ‘nieuwe’ kenmerken

Conclusies

Genomic selection: niet langer nodig om dochtergegevens van iedere stier te verzamelen

Genomic fokwaarden zijn relatief nieuw: staan aan het begin van nieuw tijdperk

Mogelijkheden voor nieuwe kenmerken als:

Veelbelovende stieren komen sneller aan het licht

Voordeel veehouder: hogere genetische vooruitgang door

Voerefficiëntie Methaan=emissie Melkeiwitsamenstelling

Breder aanbod van stieren Testen van dieren op eigen bedrijf



Stelling 1

Stelling 2

Ik gebruik komend jaar 80% genomics=stieren

In Nederland is er behoefte aan een genomics test voor veehouders om koe= en stierkalveren te testen



Stelling 3 Unieke kans om te selecteren op verbetering van voerefficientie en verlaging methaanuitstoot


5

Wat heeft de veehouder aan Genomics

Recommend Documents