Seznam školitelů pro doktorský stupeň studia schválených VR od roku 2005: Program Botanika, obor Botanika Doc. PhDr. Jaromír Beneš, Ph.D. Dr. Francesco de Bello, Ph.D. Mgr. Jiří Doležal, Ph.D. RNDr. Libor Ekrt, Ph.D. Dr. Larse Götzenberger, Ph.D. RNDr. Tomáš Hauer, Ph.D. RNDr. Tomáš Hájek, Ph.D. Mgr. Štěpán Janeček, Ph.D. RNDr. Jana Jersáková, Ph.D. Ing. Jiří Kopecký, CSc. Mgr. Petr Koutecký, Ph.D. Mgr. Jan Kučera, Ph.D. RNDr. Jaromír Lukavský, CSc. Ing. Alena Lukešová, CSc. RNDr. Petr Macek, Ph.D. RNDr. Stanislav Mihulka, Ph.D. RNDr. Linda Nedbalová, Ph.D. RNDr. Jan Novák, Ph.D. RNDr. Klára Řehounková, Ph.D. Ing. Milan Štech, Ph.D. RNDr. Jakub Těšitel, Ph.D. Mgr. Martina Vašutová, Ph.D. Doc. Mgr. Jan Vondrák, Ph.D. Program Fyziologie a imunologie, obor Fyziologie a vývojová biologie RNDr. Kateřina Bišová, Ph.D. Mgr. Radmila Čapková Frydrychová, Ph.D. RNDr. Petr Doležal, Ph.D. Doc. Mgr. Tomáš Doležal, Ph.D. Mgr. David Doležel, Ph.D. RNDr. Milan Durchan, CSc. RNDr. Jana Fleischmannová, Ph.D. RNDr. Tomáš Hájek, Ph.D. RNDr. David Honys, Ph.D. Ing. Pavel Jedlička, Ph.D. Mgr. David Kaftan, Ph.D. RNDr. J. Kalina, Ph.D. Mgr. Radek Kaňa, Ph.D. Mgr. Michal Koblížek Ph.D. RNDr. Petr Kopáček, CSc. Doc. Mgr. Ivana Kutá Smatanová, Ph.D. RNDr. Radek Litvín, Ph.D.
RNDr. Aleš Tomčala, Ph.D. RNDr. Milada Vítová, Ph.D. Ing. Helena Zahradníčková, Ph.D. RNDr. Petr Šimek, CSc. Program Molekulární a buněčná biologie, obor Molekulární a buněčná biologie a genetika Mgr. Adam Bajgar, Ph.D. RNDr. Kateřina Bišová, Ph.D. Alexander Wiliam Bruce, Ph.D. John P. McCutcheon, Ph.D. Mgr. Radmila Čapková-Frydrychová, Ph.D. Doc. Mgr. Tomáš Doležal, Ph.D. Mgr. David Doležel, Ph.D. MUDr. Daniel Elleder, Ph.D. MSc. Pavel Flegontov, Ph.D. RNDr. Iva Fuková, Ph.D. Ing. Jana Fránová, Dr. RNDR. Ondřej Hajdušek, Ph.D. Mgr. Mir. Mohamod Hassan Hashimi, Ph.D. RNDr. David Honys, Ph.D. Mgr. Aleš Horák, Ph.D. Dr. Masako Asahina Jindrová, Ph.D. Mgr. Michal Koblížek, Ph.D. M.Sc. Michail Kotsyfakis, Ph.D. RNDr. Petr Kopáček, CSc. RNDr. Alena Krejčí Bruce, Ph.D. Ing. Václav Krištůfek, CSc. RNDr. Jiří Macas, Ph.D. RNDr. Jaroslav Matoušek, CSc. Mgr. Iva Mozgová, Ph.D. RNDr. Petr Nguyen, Ph.D. Ing. Pavel Neumann, Ph.D. Ing. Petr Novák, Ph.D. RNDr. Zdeněk Paris, Ph.D. Ing. Miroslav Petříček, CSc. prom. biol. Jaroslav Piálek, CSc. doc. RNDr. Daniel Růžek, Ph.D. Alexandra Schwarz, M.Sc., Ph.D. Ing. Roman Sobotka, Ph.D. RNDr. Martin Tichý, Ph.D. RNDr. Lukáš Trantírek, Ph.D. RNDr. Marie Vancová, Ph.D. RNDr. Magda Zrzavá, Ph.D. RNDr. Milada Vítová, Ph.D. RNDr. Alena Zíková Panicucci, Ph.D. Doc. PaedDr. Radka Závodská, Ph.D. PaedDr. Martina Žurovcová, Ph.D.
Program Biologie, obor Biologie ekosystémů RNDr. Petr Baldrian, Ph.D. Ing. Jiří Bárta, Ph.D. Dr. Francesco de Bello, Ph.D. Doc.PhDr. Jaromír Beneš, Ph.D. Doc.Ing. MgA. David Boukal, Ph.D. Doc.Ing. Luděk Berec, Dr. RNDr. Martin Čech, Ph.D. RNDr. Miloslav Devetter, Ph.D. Doc. Dr. Keith R. Edwards RNDr. Dana Elhottová, Ph.D. Ing. Jaroslava Frouzová, Ph.D. Mgr. Martin Hais, Ph.D. Mgr. Pavel Hrouzek, Ph.D. RNDr. Alica Chroňáková, Ph.D. RNDr. Jana Jersáková, Ph.D. Mgr. Eva Kaštovská, Ph.D. RNDr. Václav Krištůfek, CSc. RNDr. Zdenka Křenová, Ph.D. Doc. RNDr. Tomáš Kučera, Ph.D. RNDr. Jan Květ, CSc. Ing. Tomáš Picek, Ph.D. RNDr. Václav Pižl, CSc. RNDr. Ota Rauch, CSc. RNDr. Klára Řeháková, Ph.D. RNDr. Karel Tajovský, CSc. Program Ekologie, obor Ekologie RNDr. Petr Baldrian, Ph.D. Ing. Jiří Bárta, Ph.D. Dr. Francesco de Bello, Ph.D. PhDr. Jaromír Beneš, Ph.D. Ing. MgA. David Boukal, Ph.D. Ing. Luděk Berec, Dr. RNDr. Martin Čech, Ph.D. RNDr. Miloslav Devetter, Ph.D. Dr. Keith R. Edwards RNDr. Dana Elhottová, Ph.D. Ing. Jaroslava Frouzová, Ph.D. Mgr. Martin Hais, Ph.D. Mgr. Pavel Hrouzek, Ph.D. RNDr. Alica Chroňáková, Ph.D. RNDr. Jana Jersáková, Ph.D. Mgr. Eva Kaštovská, Ph.D. RNDr. Václav Krištůfek, CSc. RNDr. Zdenka Křenová, Ph.D.
RNDr. Tomáš Kučera, Ph.D. RNDr. Jan Květ, CSc. Ing. Tomáš Picek, Ph.D. RNDr. Václav Pižl, CSc. RNDr. Ota Rauch, CSc. RNDr. Klára Řeháková, Ph.D. RNDr. Karel Tajovský, CSc. Program Biologie, obor Parazitologie RNDr. Ivan Fiala, Ph.D. RNDr. Ondřej Hajdušek, Ph.D. Astrid Sibylle Holzer, MSc. Ph.D. Mgr. Miloslav Jirků, Ph.D. MVDr. Kateřina Jirků-Pomajbíková, Ph.D. M.Sc. Aneta Kostadinová, Ph.D. Mgr. Martin Kostka, Ph.D. RNDr. Roman Kuchta, Ph.D. MVDr. Jana Kvičerová, Ph.D. RNDr. Eva Nováková, Ph.D. Doc. RNDr. Daniel Růžek, Ph.D. RNDr. Bohumil Sak, Ph.D. RNDr. Jan Štefka, Ph.D. RNDr. Marie Vancová, Ph.D. RNDr. Alena Zíková Panicucci, Ph.D. Program Biologie, obor Hydrobiologie RNDr. Jakub Borovec, Ph.D. RNDr. Martin Čech, Ph.D. RNDr. Miloslav Devetter, Ph.D. Dr. Rohit Ghai Ing. Jaroslava Frouzová, Ph.D. Mgr. Pavel Hrouzek, Ph.D. Mgr. Michal Koblížek, Ph.D. RNDr. Jaroslava Komárková, CSc. RNDr. Jiří Macháček, CSc. RNDr. Jan Mareš, Ph.D. RNDr. Jiří Nedoma, CSc. RNDR. Marie Prchalová, Ph.D. RNDr. Klára Řeháková, Ph.D. RNDr. Jaromír Seďa, CSc. RNDr. Věra Straškrabová, DrSc. RNDr. Eliška Zapomělová, Ph.D. RNDr. Petr Znachor, Ph.D. Program Biologie, obor Entomologie
Yves Basset, Ph.D. Mgr. Lukáš Čížek, Ph.D. MPhil. Tom Maurice Fayle, Ph.D. RNDr. Zdeněk Fric, Ph.D. RNDr. Milan Janda, Ph.D. Mgr. Štěpán Janeček, Ph.D. RNDr. Petr Klimeš, Ph.D. RNDr. Zdeněk Mráček, DrSc. Dr. Simon Segar, Ph.D. RNDr. Pavel Sroka, Ph.D. RNDr. Robert Tropek, Ph.D. Štepán Janeček, Ph.D.
Program Biologie, obor Infekční biologie RNDr. Jindřich Chmelař, Ph.D. Mgr. Hana Sehadová, Ph.D. RNDr. Daniel Sojka, Ph.D. RNDr. Ján Štěrba, Ph.D.
Program Zoologie, obor Zoologie Ing. Luděk Bartoš, DrSc. Ing. Jitka Bartošová, Ph.D. Mgr. Michal Berec, Ph.D. RNDr. Martin Čech, Ph.D. Mgr. Lukáš Čížek, Ph.D. RNDr. Roman Fuchs, CSc. RNDr. Zdeněk Fric, Ph.D. RNDr. Milan Janda, Ph.D. Mgr. Štěpán Janeček, Ph.D. Mgr. Martina Konečná, Ph.D. Mgr. Stanislav Lhota, Ph.D. RNDr. Václav Pavel, Ph.D. RNDr. Věra Pavelková, Ph.D. Mgr. Jiří Peterka, Ph.D. Mgr. Ing. Lubomír Piálek, Ph.D. prom. biol. Jaroslav Piálek, CSc. RNDr. Radka Piálková, Ph.D. RNDr. Jan Pluháček, Ph.D. Mgr. Jan Riegert, Ph.D. RNDr. Pavla Robovská, Ph.D. RNDr. Jan Robovský, Ph.D. Mgr. Oldřich Říčan, Ph.D.
Ing. Martin Šálek, Ph.D. RNDr. Marek Špinka, CSc. ?? RNDr. Jan Štefka, Ph.D. RNDr. Petr Veselý, Ph.D. Program Biofyzika, obor Biofyzika Mgr. Marcel Fuciman, CSc. RNDr. Zdeněk Chval, Ph.D. Mgr. Michal Koblížek, Ph.D. Ing. Jiří Kopecký, CSc. Mgr. Josef Lazar, Ph.D. RNDr. Babak Minofar, Ph.D. Ali Hussain Reshak, Ph.D. Mgr. Julie Olejníčková, Ph.D. (pouze na dostudování stávajícího doktoranda) Ing. Štěpán Papáček, Ph.D. (pouze na dostudování stávajícího doktoranda) RNDr. Karel Roháček, CSc. (pouze pro studium Mgr. Radka Stránského)