PRAKTIKUM Z OBECNÉ GENETIKY

PRAKTIKUM Z OBECNÉ GENETIKY RNDr. Pavel Lízal, Ph.D. Přírodovědecká fakulta MU Ústav experimentální biologie Oddělení genetiky a molekulární biologie [email protected]

1) Praktikum z obecné genetiky 2) Praktikum z genetiky rostlin 3) Praktikum z genetiky populací

PRAKTIKUM Z OBECNÉ GENETIKY Vyučující: RNDr. Pavel Lízal, Ph.D.; doc. Jana Řepková, CSc.; Mgr. Aneta Mikulášová

• zájem se pohybuje v průměru kolem 200 studentů

• ~ 1/3 (78/245) má předmět povinný • Molekulární biologie a genetika • Lékařská genetika a mol. diagnostika • Antropologie

• ostatní si volí dobrovolně • Speciální biologie • Ekologická a evoluční biologie • Matematická biologie (2. ročník) • Biologie se zaměřením na vzdělávání (4. ročník)

PRAKTIKUM Z OBECNÉ GENETIKY

• rozdělení do seminárních skupin po 18 až 20 studentech

PRAKTIKUM Z OBECNÉ GENETIKY Podmínky splnění:

• • • •

80% docházka vyřešené zápočtové příklady odevzdaných 5 protokolů úspěšně složený zápočtový test (75 %)

PRAKTIKUM Z OBECNÉ GENETIKY Úspěšnost získání zápočtu: • v průměru kolem 85 %

PRAKTIKUM Z OBECNÉ GENETIKY Struktura praktika (2 h, 90 min) • úvodní prezentace tématu praktika

• experiment – praktický, simulovaný • řešení zápočtových příkladů na téma praktika

PRAKTIKUM Z OBECNÉ GENETIKY Experimenty především s využitím modelových organizmů • Arabidopsis thaliana • Drosophila melanogaster

PRAKTIKUM Z OBECNÉ GENETIKY Experimenty 1) Pozorování štěpení recesivně letálního znaku albina u monohybrida modelového organizmu Arabidopsis thaliana • seznámení se s výhodami genetického modelu • rozpoznávání vybraných mutantů

PRAKTIKUM Z OBECNÉ GENETIKY Experimenty • seznámení se s výhodami genetického modelu • rozpoznávání vybraných mutantů • založení pokusu pro sledování segregace znaku v potomstvu monohybrida

PRAKTIKUM Z OBECNÉ GENETIKY Experimenty • seznámení se s výhodami genetického modelu • rozpoznávání vybraných mutantů • založení pokusu pro sledování segregace znaku v potomstvu monohybrida

PRAKTIKUM Z OBECNÉ GENETIKY Experimenty

PRAKTIKUM Z OBECNÉ GENETIKY Experimenty 2) Pozorování dědičnosti s vazbou na pohlaví u modelového organizmu Drosophila melanogaster (mutace white) • • • •

seznámení s modelem nácvik manipulace rozpoznávání vybraných mutantů rozpoznávání pohlaví

PRAKTIKUM Z OBECNÉ GENETIKY Experimenty • založení pokusu • v lichých týdnech usmrcení rodičů

PRAKTIKUM Z OBECNÉ GENETIKY Experimenty • založení pokusu • v lichých týdnech usmrcení rodičů • v sudých týdnech vyhodnocování první a druhé generace potomků (celkem 1 měsíc s octomilkou)

PRAKTIKUM Z OBECNÉ GENETIKY Experimenty 3) Sledování dědičnosti kvantitativního znaku u modelového organizmu Drosophila melanogaster • základní charakteristika kvantitativních znaků • popis vzniku populace jedinců F2 pro vyhodnocení • stanovení počtu chloupků na vzorku 20 jedinců

PRAKTIKUM Z OBECNÉ GENETIKY Experimenty • vyhodnocení pokusu

PRAKTIKUM Z OBECNÉ GENETIKY „Experimenty“ 4) konstrukce vlastního rodokmenu • seznámení s pravidly tvorby rodokmenů • pokyny pro tvorbu

PRAKTIKUM Z OBECNÉ GENETIKY „Experimenty“ 4) konstrukce vlastního rodokmenu • seznámení s pravidly tvorby rodokmenů • pokyny pro tvorbu • v následujících 4 týdnech si zvolí znak, zjistí výskyt u příbuzných a namalují rodokmen

klepněte na obrázek pro přesměrování na video

Klepněte pro přímý odkaz do aplikace

PRAKTIKUM Z OBECNÉ GENETIKY „Experimenty“ 4) konstrukce vlastního rodokmenu

PRAKTIKUM Z OBECNÉ GENETIKY „Experimenty“ 5) sestavení karyotypu neznámého člověka • seznámení s pravidly pro identifikaci lidských chromozomů • obdrží vyfotografované chromozomy – polovina sestavených, polovina neidentifikovaných = mají zařadit do páru

http://is.muni.cz/elportal/?id=1317764

PRAKTIKUM Z OBECNÉ GENETIKY „Experimenty“ 5) sestavení karyotypu neznámého člověka • mohou si vyzkoušet také elektronicky klepněte na obrázek pro přesměrování na video



PRAKTIKUM Z OBECNÉ GENETIKY Další dovednosti 6) ověření znalostí pomocí animací z e-skript • segregace vloh, kombinace vloh, vazba genů klepněte na obrázek pro přesměrování na video



PRAKTIKUM Z OBECNÉ GENETIKY Další dovednosti 6) ověření znalostí pomocí animací z e-skript • genetické mapování



Elektronická skripta jsou volně k dispozici přes elportál MU


Elektronická skripta jsou volně k dispozici přes elportál MU





PRAKTIKUM Z OBECNÉ GENETIKY Koncepce • vzhledem k zájmu (200 a více studentů) praktika navržena tak, aby: • nebyla finančně nákladná • byla realizovatelná ve standardních prostorách • a přitom byla pro studenty přínosná a zajímavá

Ohlasy

PRAKTIKUM Z GENETIKY ROSTLIN Vyučující: doc. Jana Řepková, CSc.

Zaměření na metody genetické analýzy rostlin a problematiku genetických markerů

1. Genetická analýza a identifikace počtu genů odolnosti k padlí u planého ječmene Hordeum vulgare subsp. spontaneum. 2. Určení mikrosatelitních DNA markerů v genetické vazbě s genem odolnosti k padlí travnímu u ječmene. 3. Genetické mapování genů odolnosti k padlí travnímu u ječmene. Využití softwaru pro mapování. 4. Identifikace transgenních rostlin Arabidopsis thaliana prostřednictvím genu rezistence k antibiotiku. 5. Expresní analýza genu pro polyfenoloxidázu u jetele lučního pomocí RT-PCR.

PRAKTIKUM Z GENETIKY POPULACÍ Vyučující: RNDr. Pavel Lízal, Ph.D.

• zájem se pohybuje v průměru kolem 60 studentů • úspěšnost kolem 92 % • má dvě části: • výpočtovou • praktickou (pro omezený počet zájemců) - obvykle 15 až 20 studentů

54

PRAKTIKUM Z GENETIKY POPULACÍ Výpočtová část • řešení populačně-genetických příkladů • formou e-learningu

PRAKTIKUM Z GENETIKY POPULACÍ Výpočtová část • řešení populačně-genetických příkladů • formou e-learningu


PRAKTIKUM Z GENETIKY POPULACÍ Praktická část • pracují v 5 členných týmech 1) Celosemestrální pokus s octomilkou

Sledování ustavení Hardy-Weinbergovy rovnováhy pro znak vázaný na pohlaví

PRAKTIKUM Z GENETIKY POPULACÍ Praktická část • vyhodnocování populace v generacích t+1 až t+4 • odevzdání týmových protokolů

PRAKTIKUM Z GENETIKY POPULACÍ Praktická část 2) Vyhodnocení dotazníků z populačního výzkumu v populaci člověka Stanovení Snyderových podílů, ověření HW rovnováhy pro dva znaky v populaci člověka a výpočet podílů heterozygotů mezi fenotypově dominantními jedinci

PRAKTIKUM Z GENETIKY POPULACÍ Praktická část • každá skupina pracuje s 50 dotazníky

PRAKTIKUM Z GENETIKY POPULACÍ Praktická část 3) Stanovení shody v profilu DNA



PRAKTIKUM Z GENETIKY POPULACÍ

4) Exkurze na Ústavu soudního lékařství a v Laboratoři forenzní genetiky

Děkuji za pozornost

PRAKTIKUM Z OBECNÉ GENETIKY

Recommend Documents