Přínos molekulární genetiky pro diagnostiku a terapii malignit GIT v posledních 10 letech
Minárik M. Centrum aplikované genomiky solidních nádorů (CEGES), Genomac výzkumný ústav, Praha
XXIV. JARNÍ SETKÁNÍ LOKET 2015 7. POSTGRADUÁLNÍ KURZ SPOLEČNOSTI PRO GASTROINTESTINÁLNÍ ONKOLOGII
27. března 2014 Hrad Loket u Karlových Varů
Nejčastěji vyšetřované typy molekulárních markerů Molekulární marker: Alterace v genové sekvenci, změny hladin exprese nebo struktury proteinů vedoucí k nekontrolovatelnému buněčnému dělení a růstu Genové mutace – bodové (in/del), ztráty alel (LOH) Chromozomální mutace – genové amplifikace, fúze Poruchy metylace DNA
Poruchy exprese RNA (mRNA, miRNA)
Vznik a průběh onkologického onemocnění Příležitosti pro využití molekulárních technik Zdravý jedinec
Primární nádor
Operace Adjuvantní léčba
Predispozice
Screening
Neoadjuvantní léčba
Operace
Metastázy
Operace
Paliativní léčba
Adjuvantní léčba
Relaps/rekurence
Adjuvantní léčba
Vyšetřování predispozic hereditárních syndromů
X Nemoci mladého věku (<40)
Autosomálně dominantní = stačí postižení jednoho z rodičů = postižena polovina všech jeho potomků
Hereditární syndromy Detekce zárodečných mutací Familiární adenomová polypóza mutace genu APC mutace genu MUTYH (MAP)
Nesrážlivá krev
Hereditární nepolypózní kolorektální karcinom (Lynchův syndrom) Mutace genů MSH2, MLH1 ... (a dalších)
Nádorová tkáň
Nesrážlivá krev
www.veselius.com,
Mikrosatelitová nestabilita
Mutace v genu
Hereditární syndromy - žaludek Hereditární difúzní karcinom žaludku -mutace v genu CDH1 -riziko nádoru žaludku je 67% (muži) a 83% (ženy) -pravidelné gastroskopie , gastrektomie
Blair at al. 2006
Molekulární screening nádorových onemocnění CT/MR/UZ + biopsie Invazivita
Diagnostické molekulární markery Kolorektální karcinom - Epi proColon - Cologuard
Molekulární screening kolorektálního karcinomu
Epi proColon
Metylace SEPTIN9 Real-time PCR
Cologuard
Metylace NDRG4, BMP3 Mutace KRAS Real-time PCR (QuARTS™)
Molekulární screening kolorektálního karcinomu
Epi proColon
Cologuard
Citlivost
71%
92%
Specificita
81%
87%
Typ testu
Molekulární klasifikace nádorových onemocnění Určení nádorových subtypů
Volba cílené léčby
Odhad prognózy
Cílená biologická léčba Metastatický kolorektální karcinom
RAS - mutace
Cílená biologická léčba Karcinom žaludku
Her2 amplifikace
Gómez-Martin C et al. J Clin Pathol 2012;65:751-757
Gastrointestinální stromální tumory
Gastrointestinální stromální tumory
c-kit mutace
Molekulární klasifikace nádorových onemocnění Kolorektální karcinom
CIN
KRAS+ NRAS+
CIMP
BRAF+
MSI
Molekulární histologie
Neg.
Molekulární klasifikace nádorových onemocnění Karcinom žaludku
Molekulární histologie
AJ Bass et al. Nature 000, 1-8 (2014)
Molekulární klasifikace nádorových onemocnění Karcinom žaludku
Molekulární histologie
Minarikova et al. ASCO GI 2014 poster P1649
Sledování úspěšnosti léčby Zpřesnění radikality chirurgické léčby Přítomnost ctDNA před- a po- operaci
Sledování progrese onemocnění Kvantifikace hladin ctDNA Minimální residuální choroba
Detekce rezistence Kolorektální karcinom - klonální expanze RAS (anti EGFR terapie)
Sledování úspěšnosti léčby R2 resekce jaterních metastáz
Levy M, Benesova L, Lipska L, Belsanova B, Minarikova P, Veprekova G, Zavoral M, Minarik Anticancer Research, 2012, 32, 1621 - 1626
Získaná rezistence na léčbu Anti-EGFR biologická léčba (erbitux)
Klonální expanze
KRAS mut KRAS wt
Získaná rezistence na léčbu
Eduardo Vilar & Josep Tabernero, Nature, 486, 482–483
Aplikace vyšetření molekulárních markerů Odhalení predispozice u hereditárních syndromů
Časná diagnostika malignit
Predikce léčebné odpovědi
Odhad prognózy
RNDr. Lucie Benešová, Ph.D. Bc.Barbora Belšánová Mgr. Tereza Hálková Ing. Lucie Fantová
Andrea Krajčová Kateřina Kramperová Lucie Náhunková
Spolupracující klinická pracoviště Interní klinika 1.LF UK a ÚVN, Praha Chirurgická klinika 2.LF UK a ÚVN, Praha Chirurgická klinika LF UK, FN v Plzni II. Interní gastroenterologická klinika, FN Hradec Králové Klinika transplantační chirurgie IKEM, Praha Chirurgická klinika 1.LF UK, FTNsP, Praha Klinika pneumologie a ftizeologie, FN Plzeň Masarykův onkologický ústav, Brno
