Příloha č. 4 Laboratorní příručka Laboratoří MeDiLa, v05 - Seznam mikrobiologických vyšetření - bakteriologie
Příloha č.4 Seznam mikrobiologických vyšetření - bakteriologie Obsah Dýchací cesty ...................................................................................................................................... 2 Močová soustava ................................................................................................................................. 2 Trávicí soustava .................................................................................................................................. 2 Pohlavní soustava ............................................................................................................................... 2 Klinický materiál ................................................................................................................................... 2 Odběry na kultivační vyšetření ............................................................................................................ 3 Chyby při odběru materiálů: .............................................................................................................. 12
Stránka 1 z 12
Příloha č. 4 Laboratorní příručka Laboratoří MeDiLa, v05 - Seznam mikrobiologických vyšetření - bakteriologie Vyšetření prováděna v Laboratorním a diagnostickém centru MeDiLa Pardubice Dýchací cesty Kultivace výtěru z krku Kultivace výtěru z nosu Kultivace výtěru z krku + mykologicky Kultivace výtěru z hrtanu Kultivace výtěru z tonzil Kultivace výtěru z levé tonzily Kultivace výtěru z pravé tonzily Kultivace výtěru z nasopharyngu Kultivace stěru z jazyka Močová soustava Moč Cévkovaná moč Moč z permanentní cévky Moč – URICULT Moč – Ag. Chlamydia trachomatis Moč – urogenitální mykoplazmata (Mycoplasma hominis, Ureaplasma urealyticum) Trávicí soustava Kultivace výtěru z rekta - návrat z ciziny Kultivace výtěru z rekta Kultivace výtěru z rekta děti do 3 let Grahamův stěr - vyšetření na enterobiózu Stolice na rotaviry a adenoviry Stolice na rotaviry Stolice na adenoviry Pohlavní soustava Kultivace výtěru z pochvy Výtěr z pochvy - Ag. Chlamydia trachomatis Výtěr z pochvy – urogenitální mykoplazmata (Mycoplasma hominis, Ureaplasma urealyticum) Kultivace výtěru z vulvy Kultivace výtěru z labií Kultivace výtěru z hrdla děložního Výtěr z hrdla děložního - Ag. Chlamydia trachomatis Výtěr z hrdla děložního – urogenitální mykoplazmata (Mycoplasma hominis, Ureaplasma urealyticum) Mikrobiální obraz poševní = MOP Kultivace výtěru z pochvy na Streptococcus agalactiae Kultivace stěru z penisu Kultivace z ejakulátu Ejakulát na chlamydie Ejakulát – urogenitální mykoplazmata (Mycoplasma hominis, Ureaplasma urealyticum)
Klinický materiál Kultivace stěru z rány Kultivace stěru z ložiska Kultivace stěru z defektu Kultivace stěru z dekubitu Kultivace hnisu Kultivace stěru z abscesu Kultivace stěru z bércového vředu Kultivace tkáně Kultivace stěru z kůže Stránka 2 z 12
Příloha č. 4 Laboratorní příručka Laboratoří MeDiLa, v05 - Seznam mikrobiologických vyšetření - bakteriologie Kultivace z mateřského mléka Kultivace stěru z oka Kultivace stěru z pravého oka Kultivace stěru z levého oka Kultivace kloubního punktátu Kultivace kloubního punktátu anaerobně Kultivace punktátu Kultivace punktátu anaerobně Kultivace stěru z pupku Kultivace stěru z dutiny ústní Kultivace stěru: Kultivace tekutiny: Kultivace tekutiny anaerobně Kultivace tekutiny z puchýře Kultivace výtěru z uretry Výtěr z uretry na chlamydie Výtěr z uretry – urogenitální mykoplazmata Kultivace z vedlejších nosních dutin Kultivace výtěru ze zvukovodu Kultivace výtěru z pravého zvukovodu Kultivace výtěru z levého zvukovodu Stěr ze spojivkového vaku na chlamydie Kultivace stěru z perinea Kultivace punktátu burza Kultivace punktátu burza anaerobně Kultivace stěru z tracheostomie Kultivace výtěru z vulvy - dítě Kultivace stěru z pahýlu Kultivace stěru ze sliznice Kultivace ze sputa
Odběry na kultivační vyšetření
Stránka 3 z 12
Příloha č. 4 Laboratorní příručka Laboratoří MeDiLa, v05 - Seznam mikrobiologických vyšetření - bakteriologie
Odběry provádějte před zahájením antibiotické terapie (pokud je pacient léčen antibiotiky je nutné je vypsat na průvodní list)
Odběry provádějte za sterilních podmínek do sterilních souprav
Provádějte odběry typické části (hnis apod.), jen z postiženého místa
Odběry provádějte ve vhodnou dobu (např. v období teplot)
Materiál odešlete do laboratoře co nejrychleji
Odběry dle možností a potřeby opakujte
Provádějte kontrolní odběry po 48 hod po ukončení antibiotické léčby
V případě, že pacient bude odběry provádět sám, poučte ho o přesném postupu při odběru materiálu
Výtěr z krku: Typ výtěrovky: sterilní výtěrovka plastová bez transportního média nebo s transportním médiem (Amies) Dřevěnou špachtlí stlačíme jazyk, sterilní plastovou výtěrovkou válivým pohybem setřeme povrch obou tonzil a současně setřeme zadní stěnu faryngu. Výtěrovku opatrně vyjmeme, aby nedošlo k její kontaminaci např. kontaktem s jazykem. U pacientů po tonzilektomii provedeme výtěr pouze ze zadní stěny faryngu. Po odběru zasuneme výtěrovku zpátky do plastové zkumavky. Uchovávání:
24 hod při teplotě 18 – 25 °C
Transport:
při teplotě 18 – 25 °C
Poznámka: Vysoké procento povlakových angín je vyvoláno viry (70%), menší část bakteriemi (do 30%), převážnou část bakteriálních infekcí způsobuje Streptococcus pyogenes. Haemophilus infl ezae, Streptococcus pneumoniae, Staphylococcus aureus, Moraxella catarrhalis patří do tvz. re zidentní mikroflóry, která se přirozeně vyskytuje na sliznicích horních cest dýchacích zdravých jedinců a nemá etiologický význam u povlakových angín. Indikace antibiotik u těchto nálezů záleží na posouzení celkového stavu pacienta a vyhodnocení dalších zánětlivých ukazatelů (CRP, FW, počet leukocytů). Doba odezvy: 2 – 5 dní
Stránka 4 z 12
Příloha č. 4 Laboratorní příručka Laboratoří MeDiLa, v05 - Seznam mikrobiologických vyšetření - bakteriologie
Výtěr z nosu: Typ výtěrovky: sterilní výtěrovka plastová bez transportního média nebo s transportním médiem (Amies) Sterilní plastovou výtěrovkou vytřeme obě nosní dírky krouživým pohybem. Po odběru zasuneme výtěrovku zpět do plastové zkumavky. Uchovávání:
24 hod při teplotě 18 – 25 °C
Transport:
při teplotě 18 – 25 °C
Poznámka:
Infekční rýma je vyvolána viry.
Doba odezvy: 2 – 5 dní
Výtěr z laryngu: Typ výtěrovky: sterilní výtěrovka na drátě bez transportního média nebo s transportním médiem (Amies) Odběr provádíme sterilní výtěrovkou na drátě, kterou před použitím zahneme cca do úhlu 120-150°. Jazyk stlačíme dřevěnou špachtlí a výtěrovku zavedeme do laryngu a provedeme výtěr. Po odběru zasuneme výtěrovku zpět do plastové zkumavky. Uchování:
24 hod při teplotě 18 – 25 °C
Transport:
při teplotě 18 – 25 °C
Poznámka:
Onemocnění Laryngitis acuta je převážně vyvoláno respiračními viry, průběh je většinou
samoúzdravný a léčba antibiotiky není indikována. Doba odezvy: 2 – 5 dní
Odběr vzorku sputa: Odběrová souprava: sterilní plastová nádobka 30 ml se šroubovacím uzávěrem Materiál:
Sputum (1 ml) vykašlané hlubokým zakašláním Sliny a vzorky z nosních dutin nejsou vhodné Bronchoalveolární laváž (BAL) Bronchiální výplachy Bronchiální aspiráty
Odběr podle metodického návodu pro obor TRN. Ke klasickému bakteriologickému vyšetření odeslat 5 ml BAL. Uchování:
24 hod při 2 – 8°C
Transport:
při teplotě 18 – 25 °C
Poznámka :
DŮLEŽITÉ je zabránit kontaminaci odebraného materiálu flórou horních cest
dýchacích, kontaminace může být důvodem k odmítnutí vzorku nebo příčinou zkreslení nálezu ve vyšetřovaném materiálu. Neprovádíme vyšetření na Mycobacterium tuberculosis a parazitární infekce DCD. Doba odezvy: 2 – 5 dní
Stránka 5 z 12
Příloha č. 4 Laboratorní příručka Laboratoří MeDiLa, v05 - Seznam mikrobiologických vyšetření - bakteriologie
Výtěr z ucha: Typ výtěrovky: sterilní výtěrovka plastová nebo na drátě s transportním médiem (Amies) Výtěr ze zvukovodu provádíme u externích otitid, kdy opatrným šroubovitým pohybem zavedeme sterilní výtěrovku na drátě do vnějšího zvukovodu a provedeme výtěr. Po odběru zasuneme výtěrovku zpět do plastové zkumavky. Uchování:
24 hod při teplotě 18 – 25 °C
Transport:
při teplotě 18 – 25 °C
Poznámka: Validním materiálem pro kultivační vyšetření u dg. Otitis media acuta je středoušní sekret, získaný punkcí nebo snadněji výtěrem po paracentéze, kde je však vyšší riziko kontaminace vzorku mikroflórou ze zevního zvukovodu. Středoušní sekret odebíráme do výtěrovky s transportní půdou. Doba odezvy: 2 – 5 dní
Výtěr spojivkového vaku: Typ výtěrovky: sterilní výtěrovka plastová s transportní půdou Amies Sterilní výtěrovkou vytřeme spojivkový vak šroubovitým pohybem. Nabíráme sekret nebo materiál z vřídků. Po odběru zasuneme výtěrovku zpět do plastové zkumavky s transportní půdou. Uchování:
24 hod při teplotě 18 – 25 °C
Transport:
při teplotě 18 – 25 °C
Doba odezvy: 2 – 5 dní
Stěry z ran a povrchových defektů kůže: Typ výtěrovky: sterilní výtěrovka plastová s transportní půdou Amies Sterilní výtěrovkou setřeme místo infekce nebo setřeme tkáň na spodině rány po odstranění odumřelého pojiva. Při rozsáhlejších defektech doporučujeme provést současně několik odběrů na různých místech - pro každou lokalitu použijeme nový tampón. Po odběru zasuneme výtěrovku zpět do plastové zkumavky s transportním médiem. Uchování:
24 hod při teplotě 18 – 25 °C
Transport:
při teplotě 18 – 25 °C
Doba odezvy: 2 – 5 dní
Hnisy, punktáty, exudáty, drény a ostatní klinický materiál: Typ výtěrovky: sterilní plastová výtěrovka s transportní půdou, sterilní plastová sterilní zkumavka Tekutý infekční materiál odebíráme sterilní punkční stříkačkou a obsah převedeme do sterilní plastové zkumavky, kterou ihned po odběru uzavřeme. Pokud je materiál hustý, odebereme jej sterilní výtěrovkou, kterou po odběru vložíme zpět do plastové zkumavky s transportní půdou. Drény vložíme sterilní pinzetou do sterilní zkumavky a ihned ji uzavřeme.
Stránka 6 z 12
Příloha č. 4 Laboratorní příručka Laboratoří MeDiLa, v05 - Seznam mikrobiologických vyšetření - bakteriologie V případě požadavku anaerobní kultivace u tekutých materiálů tyto vzorky necháme v injekční stříkačce, jehlu odstraníme a stříkačku uzavřeme Kombi zátkou. Uchování: 24 hod při teplotě 18 – 25 °C – materiál na výtěrovce, tekuté materiály při teplotě 2 – 8°C Transport: při teplotě 18 – 25 °C, materiál na anaerobní kultivaci dodáme do laboratoře ihned po odběru Doba odezvy: 2 – 5 dní
Výtěr z rekta: Typ výtěrovky: sterilní výtěrovka plastová s transportní půdou U pacienta zavedeme sterilní výtěrovku šroubovitým pohybem do konečníku tak, aby došlo ke znečištění výtěrovky stolicí. Výtěrovku z konečníku opatrným pohybem vytáhneme a uložíme zpět do plastové zkumavky s transportní půdou. Uchování:
24 hod při teplotě 18 – 25 °C
Transport:
při teplotě 18 – 25 °C
Poznámka :
není-li výtěr v transportní půdě, vzorek nelze vyšetřit na přítomnost Campylobacter
jejuni Doba odezvy: 3 – 5 dní
Stránka 7 z 12
Příloha č. 4 Laboratorní příručka Laboratoří MeDiLa, v05 - Seznam mikrobiologických vyšetření - bakteriologie
Odběr stolice pro přímý průkaz Adenovirů, Rotavirů a Norovirů: Odběrová souprava: sterilní zkumavka s lopatičkou Stolici nabereme pomocí lopatičky, která je připevněna zespodu k víčku odběrové soupravy, stolici na lopatičce vložíme do nádobky nádobku uzavřeme. Nádobku zašleme do laboratoře. Uchovávání:
7 dní při 2 - 8°C ( lednice ), NEMRAZÍME!
Transport:
při teplotě 18 – 25 °C
Poznámka :
Maximální vylučování Rotavirů je 3. – 5. den od začátku klinických příznaků, u
Adenovirů 3. – 13. den po začátku klinických příznaků. Doba odezvy: 24 - 48 hodin
Provedení Grahamova stěru na průkaz Enterobius vermicularis: Odběrová souprava: podložní sklíčko + průhledná izolepa šíře podložního sklíčka Grahamův stěr se provádí pomocí průhledné izolepy velikosti a šíře podložního sklíčka, která se přitiskne k análnímu otvoru a konečníkovým řasám a poté se přilepí na podložní sklíčko. Vyhodnocení se provádí mikroskopicky. Odběr se provádí ráno před defekací a omýváním konečníku. Uchování:
24 hod při teplotě 18 – 25 °C
Transport:
při teplotě 18 – 25 °C
Poznámka :
odběr se provádí ráno, před provedením osobní hygieny. Nelepit identifikační štítky
doprostřed podložního sklíčka!!! Doba odezvy: 24 - 48 hodin
Vaginální výtěry na kultivační vyšetření: Typ výtěrovky: sterilní výtěrovka plastová s transportní půdou Sterilní výtěrovkou se provede stěr ze zadní klenby poševní a po odběru se výtěrovka umístí zpět do plastové zkumavky s transportní půdou. Uchování:
24 hod při teplotě 18 – 25 °C
Transport:
při teplotě 18 – 25 °C
Doba odezvy: 2 – 5 dní
Mikrobiální obraz poševní = MOP Odběrová souprava: podložní sklíčko Vyhodnocení: mikroskopicky. Uchování:
při teplotě 18 – 25 °C
Transport:
při teplotě 18 – 25 °C
Poznámka :
Stěr provádí lékař v ordinaci a přímo natírá na řádně označené podložní sklíčko.
Doba odezvy: 24 hodin
Stránka 8 z 12
Příloha č. 4 Laboratorní příručka Laboratoří MeDiLa, v05 - Seznam mikrobiologických vyšetření - bakteriologie
Endocervikální nebo vaginální stěr na vyšetření přítomnosti Chalmydia trachomatis: Typ výtěrovky: sterilní tampón Dacron nebo z umělého hedvábí Před odběrem vzorku odstraňte hlen z oblasti cervixu bavlněným tampónem a znehodnoťte jej. Sterilní odběrový tampón má být vložen do endocervikálního kanálu co nejhlouběji, až není vidět jeho špička. To umožní získání columnárních nebo cuboidálních epitelií, které jsou zásobárnou chlamydií. Jemně otáčejte tampónem jedním směrem o 360°, ponechte v klidu 15 vteřin a potom vyjměte. Uchování:
4 – 6 hodin při teplotě 18 – 25 °C, 24 hod při teplotě 2 – 8 °C. Vzorek se nesmí zmrazit!
Transport:
při teplotě 18 – 25 °C do 6 hodin, poté při teplotě 2 – 8 °C
Doba odezvy: 24 - 48 hodin
Výtěr z uretry na vyšetření přítomnosti Chalmydia trachomatis: Typ výtěrovky: sterilní úzký tampón Dacron nebo z umělého hedvábí Pacient má být poučen, aby nemočil nejméně jednu hodinu před odběrem. Vsuňte tampón do uretry na 2 až 4 cm a jemně jím otáčejte jedním směrem o 360°, ponechte v klidu 15 vteřin a potom vyjměte. Uchování:
4 – 6 hodin při teplotě 18 – 25 °C, 24 hod při teplotě 2 – 8 °C. Vzorek se nesmí zmrazit!
Transport:
při teplotě 18 – 25 °C do 6 hodin, poté při teplotě 2 – 8 °C
Doba odezvy: 24 - 48 hodin
Endocervikální nebo vaginální stěr na vyšetření přítomnosti Ureaplasma urealyticum a Mycoplasma hominis: Odběrová souprava: sterilní tampón Dacron (popř. z umělého hedvábí) UMMt transportní médium Cervix je nejprve opatrně otřete tampónem kvůli odstranění sekretu a tampón znehodnoťte. Sterilním dacronovým tampónem otřete silně slizniční stěnu tak, abyste získali vzorek bohatý na epiteliální buňky. Umístěte tampón do lahvičky s UMMt transportním médiem a konec zastřihněte nebo zalomte. UMMt transportní médium se vzorkem řádně označte jménem a rodným číslem pacienta. Uchování:
24 hod při teplotě 18 – 25 °C , 48 hodin při teplotě 2 – 8 °C
Transport:
při teplotě 18 – 25 °C do 2 hodin, poté při teplotě 2 – 8 °C
Doba odezvy: 24 - 48 hodin
Stránka 9 z 12
Příloha č. 4 Laboratorní příručka Laboratoří MeDiLa, v05 - Seznam mikrobiologických vyšetření - bakteriologie
Výtěr z uretry na vyšetření přítomnosti Ureaplasma urealyticum a Mycoplasma hominis: Odběrová souprava: sterilní tampón Dacron (popř. z umělého hedvábí) UMMt transportní médium Očistěte močovod, zanořte tampón do hloubky min. 4 cm a pomalým krouživým pohybem otřete nebo seškrábněte oblast, abyste získali buňky. Umístěte tampón do lahvičky s UMMt transportním médiem a konec zastřihněte nebo zalomte. UMMt transportní médium se vzorkem řádně označte jménem a rodným číslem pacienta. Uchování:
24 hod při teplotě 18 – 25 °C , 48 hodin při teplotě 2 – 8 °C
Transport:
při teplotě 18 – 25 °C do 2 hodin, poté při teplotě 2 – 8 °C
Doba odezvy: 24 - 48 hodin
Odběr moče na kultivační vyšetření: Odběrová souprava: sterilní plastová zkumavka Na kultivační vyšetření se odebírá ranní moč. Před odběrem si muži po stažení předkožky umyjí glans mýdlem a vodou. Ženy si umyjí vnější genitál po oddálení labií mýdlem a potom provedou opláchnutí vodou. Přímo do sterilní zkumavky se poté provede zachycení středního proudu ranní moče o objemu 5–10 ml. Zkumavka se poté ihned uzavře víčkem. Uchování:
24 hod při 2 – 8 °C
Transport:
při teplotě 18 – 25 °C do 2 hodin, poté při teplotě 2 – 8 °C
Doba odezvy: 2 – 5 dní
Odběr moče do soupravy URICULT: Odběrová souprava: URICULT Před odběrem provedeme hygienu genitálií stejným způsobem jako u odběru moče do plastové sterilní zkumavky. Do sterilní odběrové nádobky soupravy URICULT zachytíme střední proud ranní moče. Do nádobky s močí ponoříme nosič se živnými půdami a cca po 1 min nosič vyndáme, moč vylijeme do odpadu a nosič s půdami zašroubujeme zpět do prázdné odběrové nádobky. Doručíme do laboratoře. Uchování:
řídí se pokyny výrobce odběrové soupravy
Transport:
při teplotě 2 – 8°C
Doba odezvy: 2 – 5 dní
Stránka 10 z 12
Příloha č. 4 Laboratorní příručka Laboratoří MeDiLa, v05 - Seznam mikrobiologických vyšetření - bakteriologie
Odběr moče a spermatu na vyšetření přítomnosti Ureaplasma urealyticum a Mycoplasma hominis: Odběrová souprava: sterilní plastová zkumavka s červeným uzávěrem Odebírá se min.1 ml ze středního proudu ranní moče nebo spermatu. Zkumavka se poté ihned uzavře víčkem. Uchování:
48 hod při 2 – 8 °C
Transport:
při teplotě 18 – 25 °C do 4 hodin, poté při teplotě 2 – 8 °C
Doba odezvy: 24 - 48 hodin
Odběr moče na vyšetření přítomnosti Chalmydia trachomatis: Odběrová souprava: sterilní plastová zkumavka s červeným uzávěrem Odebírá 15 - 30 ml ze první porce ranní moče. Zkumavka se poté ihned uzavře víčkem. Uchování:
24 hod při 2 – 8 °C
Transport:
při teplotě 18 – 25 °C do 4 hodin, poté při teplotě 2 – 8 °C
Doba odezvy: 24 - 48 hodin
Screening MRSA: Typ výtěrovky: sterilní výtěrovka plastová s transportním médiem (Amies) Provede se stěr z oblasti určevé ke screeningu – krk, nos, perineum, moč, dekubitus, rána atd. Uchovávání:
24 hod při teplotě 18 – 25 °C
Transport:
při teplotě 18 – 25 °C
Poznámka: jedná se o cílené vyhledávání Methicilin/oxacilin rezistentního kmene Staphylococcus aureus s následným stanovením citlivosti na ATB. Ostatní kmeny se netestují. Doba odezvy: 2- 5 dní
Screening ESBL: Typ výtěrovky: sterilní výtěrovka plastová s transportním médiem (Amies) Provede se stěr z oblasti určevé ke screeningu – krk, nos, perineum, moč, dekubitus, rána atd. Uchovávání:
24 hod při teplotě 18 – 25 °C
Transport:
při teplotě 18 – 25 °C
Poznámka: jedná se o cílené vyhledávání Enterobacteriaceae kmenů produkujících širokospektrou betalaktamázů typu AmpC a ESBL Ostatní kmeny se netestují. Doba odezvy: 2- 5 dní
Stránka 11 z 12
Příloha č. 4 Laboratorní příručka Laboratoří MeDiLa, v05 - Seznam mikrobiologických vyšetření - bakteriologie
Chyby při odběru materiálů:
nedodržení aseptických podmínek při odběru, následná kontaminace vzorku jinou mikroflórou
odběry jsou prováděny až po zahájení léčby antibiotiky, vyšetření vzorku v průběhu léčby nebo po léčbě neodhalí skutečného původce infekce, jeho výsledek může být zavádějící a může vést k chybné indikaci antibiotik s vážnými důsledky pro stav nemocného
nevhodné skladování vzorku před transportem do laboratoře, např. v lednici, kdy nižší teplota může usmrtit některé na teplotu citlivé bakteriální původce infekcí a výsledek poté neodpovídá skutečnosti
odběr je prováděn z nevhodného místa, např. při zánětu středouší ze zevního zvukovodu
výtěr je prováděn nevhodnou odběrovou soupravou, např. anální výtěr je prováděn výtěrovkou bez transportní půdy, poté nemůže být provedena cílená kultivace na průkaz Campylobacter jejuni
odběr je prováděn v nevhodnou dobu, viz Odběr pro přímý průkaz Rotavirů, Adenovirů a Norovirů
Stránka 12 z 12