BiochemNet ‐ vytvoření sítě pro podporu spolupráce biomedicínských pracovišť a zvýšení uplatnitelnosti absolventů biochemických oborů v praxi
Laboratorní workshop s teoreticko‐praktickou ukázkou molekulárně biologických technik ve spolupráci s firmou ROCHE Termín:
28. května 2013 (úterý, mezi 8:00‐15:00 hod.) a 29. května 2013 (středa, mezi 8:00‐15:00 hod.)
Místo konání: Ústav biochemie pavilon A15 místnost 227, Kampus MU Brno‐Bohunice, Masarykova Univerzita, Přírodovědecká fakulta, Kamenice 5, Brno Program: Stanoviště 1 (Mgr. Lucie Vondráčková): Ukázka automatické a manuální izolace DNA ‐ Roche umožní izolaci DNA z plné krve na automatickém izolátoru nukleových kyselin MagNA Pure Compact ‐ viz www.magnapure.com pomocí izolačního kitu MPC total NA isolation kit I) resp. manuální izolaci DNA z plné krve pomocí kolonkové izolační soupravy High Pure PCR Template Preparation Kit. Výstupem bude vyeluovaná lidská DNA. Stanoviště 2 (Ing. Viktor Horváth, Ph.D.): Demonstrační diagnostická real‐time qPCR detekce trombofilních mutací – Roche dodá real‐time PCR přístroj LightCycler 2.0 www.lightcycler.com, dále kit pro molekulární PCR detekci trombofilní mutace Leidenský faktor V. V rámci experimentu se naprogramuje PCR profil dle doporučení výrobce kitu, napipetuje se PCR reakce do reakčních kapilár (master mix, kontrolní DNA, beztemplátová kontrola) a uskuteční se real‐time qPCR detekce s vyhodnocením genotypu pomocí analýzy křivek tání (což je v dnešní době standard v oblasti molekulární PCR diagnostiky) Stanoviště 3 (Mgr. Petr Lněnička): Ukázka analýzy detekce genové exprese housekeepingového genu pomocí real‐time PCR – Roche zabezpečí real‐time PCR přístroj LightCycler 96 resp. LightCycler Nano, lidskou cDNA, dále master mix pro real‐time qPCR pro detekci genové exprese s „TaqMan“ sondami a UPL detekční systém např. pro vybraný housekeepingový gen (sonda + primery). Výstupem kvantifikační analýzy bude stanovení cq hodnot u detekovaného genu pomocí analyzačního software dodávaného s přístrojem Předpokládaný čas teoretické přednášky o prováděné metodice a experimentální práce u každého stanoviště je 1,5 hod.
http://orion.chemi.muni.cz/BiochemNet
Pro koho je laboratorní workshop určen: Laboratorní workshop je určen zejména studentům biochemických oborů partnerských univerzit. Tito studenti budou na workshop registrováni přednostně. První den workshopu (28. 5. 2013) bude zaměřen na studenty, kteří jsou v daných technikách začátečníky nebo o nich mají pouze základní povědomí. Druhý den (28. 5. 2013) se zaměří na studenty, kteří se s problematikou již setkali a mají o ní pokročilejší znalosti. Počet míst: Počet míst na každém laboratorním workshopu je 18. Časový harmonogram: 28. května 2013 a 29. května 2013 (8 ‐ 15:00 hod.) 8.00 hod. – 8.15 hod. Registrace účastníků 8.15 hod. – 8.40 hod. Úvodní slovo o Roche s.r.o. (Mgr. Dalimil Žůrek, Roche s.r.o.) 8.40 hod. – 8.50 hod. Úvod do organizace dne, rozdělení účastníků do skupin, krátké seznámení s programem na jednotlivých stanovištích a představení vedoucích stanovišť) odchod do laboratoří, přechody mezi jednotlivými laboratořemi zajistí zaměstnanci PřF MU Brno. 8.50 hod. – 10.20 hod. Práce v skupinách na jednotlivých stanovištích (viz program). Teoretický výklad metodiky kombinovaný s praktickým experimentem. 10.20 hod. – 10.40 hod. Coffee break 10.40 hod. – 12.10 hod. Práce v skupinách na jednotlivých stanovištích (viz program). Teoretický výklad metodiky kombinovaný s praktickým experimentem. 12.10 hod. – 12.55 hod. Přestávka na oběd (oběd formou bufetu zajištěn) Práce v skupinách na jednotlivých stanovištích (viz program). Teoretický 13.00 hod. – 14.30 hod. výklad metodiky, kombinovaný s praktickým experimentem. 15.00 hod. Ukončení akce
http://orion.chemi.muni.cz/BiochemNet
Životopisy vedoucích jednotlivých stanovišť
Mgr. Petr Lněnička Datum narození:
13. 6. 1977
Vzdělání: 1991 – 1995
Gymnázium Na vítězné pláni, Praha
1997 – 2003
Přírodovědecká fakulta, Univerzita Karlova, magisterské studium
Obor: biologie – odborná, Specializace: molekulární biologie Téma diplomové práce: Analýza funkce proteinu OrfI a serin / threoninových proteinkinas Streptomyces granaticolor
Praxe:
1999 – 2003
Laborant, student Laboratoř buněčné signalizace MBÚ AV ČR, Vídeňská 1083, Praha 4, PSČ 142 20
2003 – 2007
Vědecký pracovník
Laboratoř buněčné signalizace MBÚ AV ČR, Vídeňská 1083, Praha 4, PSČ 142 20 2007 – 2012
Klinický bioanalytik pro lékařskou genetiku; vědecký pracovník Laboratoř molekulární genetiky ÚBLG 1LF UK a VFN, Albertov 4, Praha 2, PSČ 228 00
2012 ‐ dosud
KAM – AS a aplikační specialista pro sekvenaci Roche s.r.o.
http://orion.chemi.muni.cz/BiochemNet
Ing. Viktor Horváth, Ph.D. Datum narození:
5. 8. 1978
Vzdělání: 1992 – 1996
Gymnázium L.Novomeského, Bratislava, SR
1996 – 2001
Chemickotechnologická fakulta STU v Bratislava, SR ‐ inžinierske štúdium
Obor: biochemie a mikrobiologie Téma diplomové práce: Biologický účinok chinazolínových derivátov in vitro
2001 – 2002
Virologický ústav, Slovenská Akadémia Vied, Bratislava, SR – doktorandské štúdium
2002 – 2006
Biofyzikální ústav AV ČR, Brno a Přírodovědecká fakulta MU, Brno – doktorandské studium
Obor: Fyziologie živočichů
Téma dizertační práce: Protinádorový účinek platinových adamantanových derivátů in vitro
Praxe:
2002 – 2006
Laboratoř cytokinetiky Biofyzikální ústav AV ČR, Královopolská 135, Brno, 612 65
2006 ‐ 2009
Key Account Manager – Roche Applied Science, Roche s.r.o., Praha
2009 ‐ dosud
Senior Key Account Manager – Roche Apllied Science, Roche s.r.o. , Praha
http://orion.chemi.muni.cz/BiochemNet
Mgr. Lucie Vondráčková Datum narození:
16. 2. 1977
Vzdělání: 1991 – 1995
Gymnázium Voděradská, Praha
1995 – 2000
Přírodovědecká fakulta, Univerzita Karlova, magisterské studium
Obor: biologie – odborná, Specializace: genetika Téma diplomové práce: Chromozomální změny u pacientů s chronickou myeloidní leukémií
Praxe:
2000 – 2001
Studentka, Laboratoř molekulární biologie Biologický ústav 1. LF UK, Praha
2002 – 2008
Key Account Manager , Sigma‐ Aldrich, s.r.o., Praha
2008 – dosud
Key Account Manager , Roche, s.r.o., Praha
http://orion.chemi.muni.cz/BiochemNet
