GENETIKA
© Joalis s.r.o. Všechna práva vyhrazena
1
Z HISTORIE GENETIKY
Zakladatel genetiky Gregor Mendel (1822 - 1884)
Zdroj: Kronika medicíny, Fortuna Press 1994
© Joalis s.r.o. Všechna práva vyhrazena
Mendelovi nástupci v roce 1910 T. H. Morgan vyslovil hypotézu, že geny jsou uloženy na specifických útvarech – chromozomech v roce 1941 G. Bedle a E. Tatum ukázali, že mutace na specifických místech genomu způsobují chyby v metabolických drahách; navrhli postulát jeden gen = jeden enzym v roce 1944 O. Avery, C. Macleod a M. McCarty objevili, že molekula DNA nese genetickou informaci © Joalis s.r.o. Všechna práva vyhrazena
Zdroj: Kronika medicíny, Fortuna Press 1994
Thomas H. Morgan
3
OBJEV STRUKTURY DNA v roce 1953 James D. Watson a Francis Crick představili strukturu molekuly DNA. Společně formulovali centrální dogma molekulární biologie: proteiny se vyrábějí v organismu z RNA, která se přepisuje z DNA toto dogma má některé výjimky © Joalis s.r.o. Všechna práva vyhrazena
www.achievement.org 4
Human Genom Project byl zahájen v roce 1990 pod vedením J. Watsona jde o projekt sponzorovaný vládou USA samotné rozklování genomu bylo započato v roce 2000 a dokončeno v roce 2003 výsledky se stále zpracovávají a průběžně se publikují nové články paralelní projekt byl proveden soukromou společností Celere Genomics © Joalis s.r.o. Všechna práva vyhrazena
5
Velikosti genomů organismus
velikost genomu (páry bází)
poznámka
virus, bakteriofág MS2
3 569 první rozluštěný RNA genom
virus SV40
5 224
virus, fág Φ–X174
5 386 první rozluštěný DNA genom
virus, fág λ bakterie Haemophillus influenzae
50 000 1 830 000
první genom živého organismu, červenec 1995
bakterie Carsonella rudii
160 000 nejmenší nevirový genom
bakterie Buchnera aphidicola
600 000
bakterie Wigglesworthia glossinida
700 000
bakterie Escherichia coli
4 000 000
prvok Amoeba dubia
670 000 000 000 6
© Joalis s.r.o. Všechna práva vyhrazena
pokračování tabulky rostlina Arabidopsis thaliana
157 000 000
první rostlinný genom, prosinec 2000
rostlina Genlisea margaretae
63 400 000
dosud nejmenší genom kvetoucí rostliny, 2006
rostlina Frittilaria assyrica rostlina Populus trichocarpa
130 000 000 000 480 000 000 první genom stromu, září 2006
kvasinka Saccharomyces cerevisiae
20 000 000 pivní kvasinka
plíseň Emericella (Aspergillus) nidulans
30 000 000
hlíst Caenorhabditis elegans
98 000 000
první genom mnohobuněčného živočicha, prosinec 1998
hmyz Drosophila melanogaster
130 000 000 octomilka
hmyz Bombyx mori
530 000 000 bourec morušový
hmyz Apis mellifera
1 770 000 000 včela medonosná
© Joalis s.r.o. Všechna práva vyhrazena
7
pokračování tabulky
ryba Tetraodon nigroviridis
savec Homo sapiens
ryba Protopterus aethiopicus
© Joalis s.r.o. Všechna práva vyhrazena
385 000 000
čtverzubec, nejmenší známý genom obratlovce
3 200 000 000 130 000 000 bahník východoafrický, největší 000 známý genom obratlovce
8
LIDSKÝ GENOM zpočátku vědci odhadovali, že se v lidském genomu nachází až na 150 tisíc genů podle harvardské bioinformatičky Michele Clampové je to 20.488 genů do budoucna by jich mohla přibýt nanejvýš stovka © Joalis s.r.o. Všechna práva vyhrazena
i61.photobucket.com
9
Lidské chromozomy
Buněčné jádro je jako knihovna, která obsahuje 23 párů knih - chromozómů. V každém buněčném jádru každé buňky je celý lidský genom. © Joalis s.r.o. Všechna práva vyhrazena
10
Struktura DNA
DNA kóduje proteiny. Jsou to fyzické součástky a nástroje, ze kterých je utvořen lidský organismus. © Joalis s.r.o. Všechna práva vyhrazena
11
Kódované aminokyseliny
12 © Joalis s.r.o. Všechna práva vyhrazena
Chromozomy a geny Jednotlivé geny jsou napsány na chromozomech jeden za druhým.
Platí pravidlo 1 gen = 1 protein (součástka) 13 © Joalis s.r.o. Všechna práva vyhrazena
Člověk potřebuje k realizaci svých výtvorů pracovní nástroje a pomůcky. Stejně tak tomu je v lidském organismu. Pracovními nástroji jsou zde enzymy – geneticky kódované kyseliny. 14 © Joalis s.r.o. Všechna práva vyhrazena
Příklady některých proteinů – geneticky naprogramovaných součástek
15 © Joalis s.r.o. Všechna práva vyhrazena
Zjednodušený model lidské protilátky IgG1 (kappa)
Základní čtyřřetězcová struktura v oblasi (Vh, Ch1 atd.). V značí variabilní, C konstantní oblast. Jsou znázorněna místa štěpení pepsinem a papainem. Za povšimnutí stojí pozice inter- a intrařetězcových disulfidových vazeb
16 © Joalis s.r.o. Všechna práva vyhrazena
Svalové bílkoviny aktin a myozin
Svalové vlákno je složeno z aktinu a myozinu 17 © Joalis s.r.o. Všechna práva vyhrazena
Svalový stah Model posunujících se vláken vysvětluje svalový stah
Cyklus změn, pomocí nichž dochází ke „kráčení“ molekul myozinu podél aktinového filamenta © Joalis s.r.o. Všechna práva vyhrazena
18
Vedení nervového vzruchu
acetylcholinový receptor
Acetylcholinový receptor blokovaný kobřím jedem © Joalis s.r.o. Všechna práva vyhrazena
19
Hemoglobin Model molekuly hemoglobinu
© Joalis s.r.o. Všechna práva vyhrazena
20
Iontové kanály v buněčné membráně otevřený a zavřený draslíkový kanál
iontové kanály v buněčné membráně – tzv. Na-K pumpa
draslíkový kanál K+ © Joalis s.r.o. Všechna práva vyhrazena
21
Inzulin – jeho struktura
22 © Joalis s.r.o. Všechna práva vyhrazena
Inzulin – variabilita struktury u savčích druhů odchylné aminokyseliny (od lidské sekvence) živočišný druh
řetězec A, pozice 8 9 10
řetězec B, pozice 30
člověk
Thr-Ser-Ile
Thr
prase, pes vorvaň
Thr-Ser-Ile
Ala
králík
Thr-Ser-Ile
Ser
skot, koza
Ala-Ser-Val
Ala
ovce
Ala-Gly-Val
Ala
kůň
Thr-Gly-Ile
Ala
velryba
Ala-Ser-Thr
Ala
© Joalis s.r.o. Všechna práva vyhrazena
23
Sekrece inzulinu a hladovění Relativní změny metabolických parametrů během začátku hladovění
Inzulin je v každém sekrečním váčku skladován ve vysoce koncentrované formě a je uvolněn, jen pokud buňka dostane signál k sekreci v podobě zvýšení hladiny glukózy v krvi 24 © Joalis s.r.o. Všechna práva vyhrazena
Proteiny jsou v organismu poměrně hojně zastoupeny Přibližné složení bakteriální buňky (složení živočišné buňky je podobné)
Tři skupiny makromolekul: každá z nich je vytvořena z malých molekul spojených kovalentními vazbami 25 © Joalis s.r.o. Všechna práva vyhrazena
Proteiny mají adresní sekvence – štítky, podle nichž jsou dopravovány do předem určených oblastí Některé typické adresové sekvence
© Joalis s.r.o. Všechna práva vyhrazena
26
Na tomto místě si uvědomme, jak je co v organismu velké
Velikosti buněk a jejich částí; jednotky, ve kterých se tyto velikosti měří
27 © Joalis s.r.o. Všechna práva vyhrazena
Názorné srovnání velikostí živých buněk a atomů Ani s použitím nejsilnějších elektronových mikroskopů není možné vidět jednotlivé atomy, ze kterých jsou tvořeny molekuly © Joalis s.r.o. Všechna práva vyhrazena
28
Různé živočišné druhy sdílejí tytéž genetické mechanismy
Různé živočišné druhy sdílejí tytéž genetické mechanismy. Dítě i myš na obrázku mají stejnou bílou skvrnu na čele. Oba mají poškozený stejný gen (zvaný „kit“), který je potřebný pro vývoj a udržování 29 pigmentových buněk.
© Joalis s.r.o. Všechna práva vyhrazena
GENETICKÉ CHYBY při přepisování informace z DNA na DNA vznikají chyby; většina jich v lidském organismu tolik nevadí – říkáme jim polymorfismy; zapříčiňují, že každý člověk je originál řada genetických chyb určuje genetické choroby, některé genetické chyby jsou neslučitelné s životem loni byla udělena Nobelova cena za experimenty prováděné na myších; postupně se klonovaly myši s jedním genem vypnutým; zjišťovalo se, jaké mají anomálie; některé brzy zemřely na rakovinu, jiné byly obézní, některé byly nápadně svalnaté, ale velká většina se jich ale vůbec nenarodila; tyto myši byly nazvány knock out myši 30 © Joalis s.r.o. Všechna práva vyhrazena
Druhy genetických chyb
31 © Joalis s.r.o. Všechna práva vyhrazena
Druhy genetických chyb
32 © Joalis s.r.o. Všechna práva vyhrazena
Druhy genetických chyb
33 © Joalis s.r.o. Všechna práva vyhrazena
Druhy genetických chyb
34 © Joalis s.r.o. Všechna práva vyhrazena
Druhy genetických chyb
35 © Joalis s.r.o. Všechna práva vyhrazena
Onemocnění vyvolaná genovou mutací Dnes je známo mnoho monogenových chorob, kdy s jednou mutací je spojena jedna typická choroba. Jde o choroby jako například cystická fibróza, srpkovitá anemie, Duschenova a Beckerova svalová dystrofie, Leidenův syndrom ad. © Joalis s.r.o. Všechna práva vyhrazena
36
Léčba genových mutací
Dosud navrhované terapie jsou pomocí „naočkovaných“ virových nosičů 37 © Joalis s.r.o. Všechna práva vyhrazena
Vznik nového organismu Poslední, 23. pár chromozomů určuje pohlaví člověka. Chlapci jsou mnohem náchylnější na dědičné mutace od matek, které jsou na X chromozomu, protože se vliv těchto genů nemůže vykompenzovat druhým párem chromozomu. To je třeba případ barvosleposti. Vajíčko a spermie jsou jediné dvě buňky lidského organismu, které obsahují pouze jednu sadu chromozómů a nikoliv dvě, jako je tomu u všech ostatních buněk. © Joalis s.r.o. Všechna práva vyhrazena
38
MEIÓZA – vznik pohlavní buňky MEIÓZA MÁ DVĚ FÁZE První meiotické dělení: protože rozchod maternálních a paternálních chromozomů do gamet je náhodný, jsou původní mater. a pater. chromozomy smíšeny v různých kombinacích. Zatím není známo, jak se mohou homologní chromozomy navzájem rozpoznat.
U některých buněk může meióza trvat mnohem déle než mitóza (např. u lidských oocytů to může být až 50 let 39 © Joalis s.r.o. Všechna práva vyhrazena
MEIÓZA A MITÓZA Mitóza je dělení, při němž vznikají dvě buňky s identickou genetickou výbavou. Je typické pro buňky různých tkání.
Meióza je dělení, při něm vznikají dvě buňky s polovičním počtem chromozomů – gamety, pohlavní buňky Občas meióza probíhá a homology se od sebe neoddělí. Některé vzniklé haploidní buňky pak mají určitý chromozom nadbytečný zatímco jiným chybí. © Joalis s.r.o. Všechna práva vyhrazena
40
METABOLISMUS výrobní software organismu
Citrátový cyklus – střed metabolismu © Joalis s.r.o. Všechna práva vyhrazena
Metabolismus je popis výrobních procesů v organismu. Na přeměňování jedné molekuly na druhou slouží enzymy – přesně naprogramované proteinové nástroje v genomu. 41
GLYKOLÝZA A CITRÁTOVÝ CYKLUS Poskytují výchozí látky pro syntézu mnoha důležitých biologických molekul. Aminokyseliny, nukleotidy, lipidy a sacharidy – zde jako produkty – pak dále slouží jako výchozí látky pro mnoho makromolekul buňky. Černé šipky = jednotlivé enzymem katalyzované reakce. Červené šipky = dráhy s mnoha kroky, které jsou nutné k tvorbě uvedených produktů. © Joalis s.r.o. Všechna práva vyhrazena
42
Katabolické a anabolické dráhy Zatímco jeden druh enzymů a metabolických drah rozebírá molekuly na menší a lépe využitelné součásti, druhý druh enzymů a metabolických drah slouží pro sestavování molekul nových podle řízených potřeb organismu.
Schématické znázornění vztahu mezi katabolickými a anabolickými dráhami v metabolismu. Velká část energie uložené v chemických vazbách unikne jako teplo, a proto je hmotnost potravy, kterou organismus čerpající energii z katabolismu potřebuje, mnohem větší než hmotnost molekul, které mohou být vytvořeny v anabolismu.
© Joalis s.r.o. Všechna práva vyhrazena
Naproti tomu živé buňky nejenže udržují pořádek na každé úrovni, ale dokonce ho samy vytvářejí: od makroskopické stavby motýla či květiny až po uspořádání atomů v molekulách, z nichž se tyto organismy 43 skládají.