ADLN-PERPUSTAKAAN UNIVERSITAS AIRLANGGA

ADLN-PERPUSTAKAAN UNIVERSITAS AIRLANGGA

PEMERIKSAAN GENEXPERT MTB/RIF DAN KULTUR DAHAK MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS DALAM MENEGAKKAN DIAGNOSIS TUBERKULOSIS PARU DAN RESISTENSI RIFAMPISIN PADA ANAK DENGAN DUGAAN TUBERKULOSIS PARU DI RSUD DR SOETOMO Karya Ilmiah Akhir Untuk memenuhi persyaratan dalam menyelesaikan Program Pendidikan Dokter Spesialis I Ilmu Kesehatan Anak

Oleh: Berlian Beatrix Rarome, dr.

Pembimbing: Retno Asih Setyoningrum, dr., SpA(K) Deddy Iskandar, dr., SpA Prof. Dr. Ni Made Mertaniasih , dr., MS, SpMK(K) Ir. Mahmudah, M.Kes

DEPARTEMEN/ SMF ILMU KESEHATAN ANAK FAKULTAS KEDOKTERAN UNIVERSITAS AIRLANGGA RSUD DR. SOETOMO SURABAYA 2015

KARYA ILMIAH AKHIR

PEMERIKSAAN GENEXPERT MTB…

BERLIAN BEATRIX R


KARYA ILMIAH AKHIR


BERLIAN BEATRIX R


KARYA ILMIAH AKHIR


BERLIAN BEATRIX R


KARYA ILMIAH AKHIR


BERLIAN BEATRIX R


KARYA ILMIAH AKHIR


BERLIAN BEATRIX R


KATA PENGANTAR

Diagnosis Tuberkulosis (TB) pada anak lebih sulit dibandingkan pada pasien dewasa karena terdapat beberapa keterbatasan. Kondisi ini menyebabkan

under

dan

over

diagnosis

TB

anak

sehingga

mengakibatkan morbiditas dan mortalitas yang tinggi. Tahun 2010 WHO telah merekomendasikan penggunaan GeneXpert MTB/RIF sebagai alat bantu diagnosis TB karena mempunyai nilai sensitivitas dan spesifisitas yang tinggi, namun penelitian pada anak masih jarang. Penelitian ini membandingkan pemeriksaan GeneXpert MTB/RIF dengankultur dahak MTB dalam menegakkan diagnosis TB paru dan resistensi Rifampisin pada anak dengan dugaan TB paru di RSUD dr Soetomo. Meskipun dalam pelaksanaan penelitian karya ilmiah akhir ini penulis telah berupaya semaksimal mungkin, namun penulis menyadari bahwa makalah ini masih belum sempurna. Oleh karena itu setiap saran maupun kritik yang konstruktif demi perbaikan akan diterima dengan terbuka dan senang hati. Akhir kata, semoga penelitian karya ilmiah akhir ini dapat memberikan manfaat bagi kita semua. Penulis

KARYA ILMIAH AKHIR


BERLIAN BEATRIX R


UCAPAN TERIMA KASIH

Puji Syukur ke hadirat Tuhan Yang Maha Kuasa karena atas berkat dan rahmat-Nya, laporan penelitian ini dapat saya selesaikan sebagai salah satu persyaratan untuk menerima tanda keahlian di bidang Ilmu Kesehatan Anak Fakultas Kedokteran Universitas Airlangga/RSUD dr. Soetomo Surabaya. Pada kesempatan ini, saya menghaturkan terimakasih yang sebesar-besarnya

dan

penghargaan

yang

setinggi-tingginya

kepada guru-guru saya, Landia Setiawati, dr., SpA(K) (alm); Retno Asih Setyoningrum, dr., SpA(K); Deddy Iskandar, dr., SpA; Prof. Dr. Ni Made Mertaniasih , dr., MS, SpMK (K). Beliau semua

telah membimbing saya

dengan penuh

kesabaran,

kesungguhan dan ketelitian dalam membekali, mengarahkan dan membimbing saya sejak pembuatan naskah usulan penelitian hingga penyelesaian karya ilmiah akhir ini. Rasa hormat dan terimakasih yang sebesar-besarnya juga saya sampaikan kepada yang terhormat : -

Prof. Dr. Agung Pranoto, dr., M.Kes, SpPD-KGEH, selaku Dekan Fakultas Kedokteran Universitas Airlangga dan Prof. Dr. Muhammad Amin, dr., SpP(K), selaku mantan

KARYA ILMIAH AKHIR

Dekan

Fakultas

Kedokteran,


Universitas

BERLIAN BEATRIX R


Airlangga, yang telah memberi kesempatan kepada saya untuk menempuh Pendidikan Dokter Spesialis Ilmu Kesehatan Anak. -

Dodo Anondo, dr., MPH, selaku Direktur RSUD Dr. Soetomo Surabaya dan H. Slamet Riyadi Yuwono, dr., DTM&H, MARS, selaku mantan Direktur RSUD Dr. Soetomo Surabaya yang telah memberikan kesempatan dan fasilitas selama masa pendidikan keahlian saya serta memberikan kemudahan dalam melakukan penelitian.

-

Prof. Dr. Triyono, dr., SpR(K), selaku Ketua Tim Koordinasi

Pelaksana,

Program

Pendidikan

Dokter

Spesialis,Fakultas Kedokteran, Universitas Airlangga / RSUD Dr. Soetomo yang telah memberikan kesempatan dan fasilitas selama masa pendidikan keahlian saya. -

H. Sjamsul Arief, dr., MARS, SpA(K), selaku Ketua Departemen Ilmu Kesehatan Anak, Fakultas Kedokteran, Universitas Airlangga / RSUD Dr. Soetomo,yang telah berkenan memberikan kesempatan kepada saya untuk memperdalam pengetahuan di bidang Ilmu Kesehatan Anak, serta atas bimbingan dan pengarahannya selama saya mengikuti pendidikan keahlian.

-

Dr. I Dewa Gede Ugrasena, dr., SpA(K), selaku Ketua Program Studi Ilmu Kesehatan Anak, Departemen Ilmu Kesehatan

KARYA ILMIAH AKHIR

Anak,

Fakultas

Kedokteran,


Universitas

BERLIAN BEATRIX R


Airlangga / RSUD Dr. Soetomo, dan Hj. Siti Nurul Hidayati, dr., M.Kes, SpA(K) selaku Sekretaris Program Studi Ilmu Kesehatan Anak, Departemen/SMF Ilmu Kesehatan

Anak,

Fakultas

Kedokteran,

Universitas

Airlangga / RSUD Dr. Soetomo, atas segala bimbingan yang amat berharga yang senantiasa diberikan kepada saya selama mengikuti pendidikan keahlian. -

H. Mahrus A. Rachman, dr., SpA(K), selaku Koordinator Litbang Departemen Ilmu Kesehatan Anak, Fakultas Kedokteran, Universitas Airlangga / RSUD Dr. Soetomo yang bersedia mendukung konsep penelitian ini sehingga karya akhir saya dapat terwujud, serta saran dan kritik yang menggugah saya untuk terus membaca.

-

Ir Mahmudah M.Kes. selaku pembimbing statistik yang telah

membantu

dalam

hal

penyusunan

metode

penelitian dan pengolahan data. -

Dr. Ninik Asmaningsih Soemyarso, dr., MM Paed, SpA(K);

Prof.

Parwati

SB,

dr.,

DTM&H,

MSc(CTM),SpA(K), Siti Nurul Hidayati, dr.,SpA(K), M.Kes, Dr.Anang Endaryanto, dr., SpA(K), Martono Tri Utomo,dr.,SpA(K) selaku tim penguji atas asupan konstruktif yang berharga untuk perbaikan karya ilmiah penelitian ini.

KARYA ILMIAH AKHIR


BERLIAN BEATRIX R


-

Seluruh staf pengajar di Departemen Ilmu Kesehatan Anak, Fakultas Kedokteran Universitas Airlangga/RSUD Dr. Soetomo, Surabaya yang telah membimbing dan membantu dalam menyelesaikan studi di bagian Ilmu Kesehatan Anak sekaligus memberikan ilmu baru yang sangat bermanfaat.

-

Seluruh staf pengajar Mata Kuliah Dasar Umum (MKDU), Fakultas Kedokteran, Universitas Airlangga yang telah memberi bekal untuk menempuh pendidikan di Program Studi Ilmu Kesehatan Anak, Fakultas Kedokteran, Universitas Airlangga / RSUD Dr. Soetomo Surabaya.

-

drg Febria Rachmanita selaku Direktur RS dr Soewandi dan Kepala Dinas Kesehatan Kota Surabaya dan Radix Hadriyanto,dr., SpA, Retna Hastuti, dr., SpA, Ariani, dr., SpA, Hendarti, dr., SpA selaku staf medik SMF Anak RS dr Soewandhi, drg I Made S.D, Nina Apriyanti,dr.,

Novi Milawati, Amd Kep selaku staf

medik Pusksmas Gunung Anyar yang telah membantu dalam pengumpulan sampel penelitian karya akhir saya -

dr. Sigit Prihutomo, MPH, selaku direktur PPML, Kemenkes RI,dr Retnokusuma selaku staf kelompok kerja TB Anak Depkes RI, Sri Puji, dr., SpP(K) selaku ambasador WHO untuk program TB Depkes RI, dr Setyo

KARYA ILMIAH AKHIR


BERLIAN BEATRIX R


Budionoselaku Kepala Seksie

P2 Dinas Kesehatan

Proponsi Jatim, Ibu Satitistaf P2 Dinas kesehatan Propinsi Jatim,Darsono, dr., SpP (K) selaku kepala TB DOTS RS dr Seotomo, Bu Sri beserta perawat poli TB DOTS RSUD dr Soetomo, dr Koesprijani SpPK dan Ibu Ratna Handayani S.Si beserta seluruh petugas lab BBLK Surabaya yang telah membantu kelancaran penelitian saya -

Seluruh rekan sejawat PPDS-1 Ilmu Kesehatan Anak, Fakultas Kedokteran, Universitas Airlangga / RSUD Dr. Soetomo Surabaya yang telah bersama-sama dalam suka dan duka menempuh pendidikan spesialis anak.

-

Rekan

PPDS-1

Ilmu

Kesehatan

Anak,

Fakultas

Kedokteran, Universitas Airlangga / RSUD Dr. Soetomo periode Juli 2011, yaitu Devi Emawanti, dr., Putu Dian Saraswati dr., Hakimah Maimunah dr., IDAA Shinta Kamaya., Natalia Kristanti dr., Kristina Natalia Marbun dr., Siti Nur Azizah dr., Heru setiawan dr., Septria Erlita Soejito dr., Ilham Bondan dr.atas kekompakan dan kerjasamanya selama menempuh pendidikan dokter spesialis anak. -

Andi Cahyadi, dr., SpA., M Riza Kurniawan, dr., selaku Sie Ilmiah PPDS yang telah meluangkan waktu lebih demi

KARYA ILMIAH AKHIR

kemajuan

masyarakat

ilmiah


PPDS-1

Ilmu

BERLIAN BEATRIX R


Kesehatan

Anak,

Fakultas

Kedokteran,

Universitas

Airlangga / RSUD Dr. Soetomo. -

Teman-teman yang akan bersama mengikuti ujian board bulan Febuari 2016 yaitu Hidayati Utami Dewi, dr.,Yeni Kusumawati, dr., Areta Indarto, dr., IDAA Shinta Kamaya, dr.semoga kita bisa lulus mendapat hasil terbaik dan tidak mengecewakan seluruh pihak.

-

Seluruh paramedis di Instalasi Rawat Jalan Anak dan Instalasi

Rawat

Inap

Anak,

RSUD

Dr.

Soetomo,

Surabaya yang telah membantu saya selama masa pendidikan. -

Mbak Timur, Mbak Didi, Mbak Nita, Bu Win, Mbak Dian, Mbak Yuni dan Mbak Indri terima kasih atas bantuannya mengurusi PPDS selama ini.

-

Semua pihak yang telah membantu saya sampai lulus pendidikan dokter spesialis anak yang tidak dapat saya sebutkan satu persatu.

Saya sungguh bersyukur karena memiliki keluarga yang luar biasa, yang senantiasa mendukung dan memberi kesempatan kepada saya untuk mewujudkan apa yang saya inginkan, saya sampaikan rasa hormat dan kasih sayang kepada: -

Suami saya, Denny Christupel Tupamahu AP, M.Si, M.Mis, MH, dan anak-anak saya tersayang Michael Joshua

KARYA ILMIAH AKHIR

Kalendesang

Tupamahu,


Gloria

Miracle

BERLIAN BEATRIX R


Buligang Tupamahu

atas kesabaran dan ketabahan

mendampingi selama saya menempuh pendidikan serta doa yang selalu dipanjatkan demi keselamatan dan keberhasilan

saya.

Maafkan

saya

karena

sering

meninggalkan kewajiban sebagai istri dan ibu untuk beberapa waktu dalam menunaikan tugas-tugas sebagai PPDS. -

Kedua orang tua saya tercintaIr John W Rarome dan Bernadette Maria Tiwa (alm) atas dukungan moral, dukungan material dan doa yang selalu dipanjatkan untuk saya agar saya dapat mencapai cita-cita menjadi dokter spesialis anak.

-

Kedua mertua saya,Bpk Jonny Tupamahu (alm) dan Ibu Yoke Tupamahu yang telah memberikan dukungan material

dan

spiritual

sehingga

saya

dapat

menyelesaikan pendidikan saya. -

Kakak, kakak ipar, adik ipar saya, Nova Rarome dan keluarga,

dra

Mutiara

Anna

Rarome

Apt,

dan

keluarga, Andreas IP Rarome dan keluarga, Melati Ester dr dan keluarga, Ketty Katharina Tupamahu SE dan keluarga, Kenny P Tupamahu STP dan keluarga. atas dukungan dan doanya. -

Seluruh keluarga besar saya yang tidak dapat saya sebutkan satu persatu atas bantuannya selama ini.

KARYA ILMIAH AKHIR


BERLIAN BEATRIX R


Semoga penelitian ini bermanfaat bagi penulis khususnya dan bagi pembaca pada umumnya. Peneliti juga berharap semoga

hasil

yang

didapat

dapat

perkembangan

ilmu

kedokteran

dan

bermanfaat pada

bagi

akhirnya

bermanfaat bagi kesehatan anak-anak Indonesia. Semoga Tuhan Yang Maha Kuasa senantiasa melimpahkan berkah dan rahmat-Nya kepada kita semua.

Peneliti

KARYA ILMIAH AKHIR


BERLIAN BEATRIX R


Abstrak

PEMERIKSAAN GENEXPERT MTB/RIF DAN KULTUR DAHAK MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS DALAM MENEGAKKAN DIAGNOSIS TUBERKULOSIS PARU DAN RESISTENSI RIFAMPISIN PADA ANAK DENGAN DUGAAN TUBERKULOSIS PARU DI RSUD DR SOETOMO Berlian Beatrix, Deddy Iskandar, Retno Asih Setyoningrum, Ni Made Mertaniasih, Mahmudah

Latar belakang : Menegakkan diagnosis Tuberkulosis (TB) pada anak sampai saat ini masih sulit dikerjakan. GeneXpert MTB/RIF adalah suatu metode diagnostik baru yang dapat mengidentifikasi Mycobacterium tuberculosis (MTB) dengan cepat. Walaupun metode ini telah direkomendasikan pada anak-anak, namun penelitian tentang GeneXpert MTB/RIF dalam mendiagnosis TB paru anak di lingkungan Rumah Sakit (RS) belum pernah dikerjakan di Indonesia Tujuan : Membandingkan hasil pemeriksaan GeneXpert MTB/RIF dengan kultur dahak MTB pada media Lowenstein Jensen (LJ) dalam menegakkan diagnosis TB paru pada anak yang diduga TB paru Metode : Consecutive sampling mengumpulkan 27 anak usia 3 bulan sampai 14 tahun yang diduga TB paru antara Juni sampai Agustus 2015 pada penelitian cross sectional di RSUD dr Soetomo. Pada setiap anak dilakukan pengambilan dahak dengan cara induksi dahak kemudian dilakukan tiga metode pemeriksaan sekaligus yaitu secara mikroskopis, GeneXpert MTB/RIF dan kultur yang dilanjutkan dengan uji kepekaan MTB bagi spesimen yang terdeteksi ada pertumbuhan MTB Hasil : Sensitivitas GeneXpert MTB/RIF adalah 100% (95% CI 100-100) dan spesifisitas 95% (95% CI 85-100). Nilai duga positif GeneXpert MTB/RIF adalah 89% (95% CI 68-100), sedangkan nilai duga negatifnya adalah 100% (95% CI 100-100) dan Likelihood positive nya adalah 20 (95%CI 2,82-128) Kesimpulan :GeneXpert MTB/RIF mampu mendeteksi semua spesimen yang terdeteksi positif MTB oleh Kultur dahak MTB namun dalam waktu yang lebih singkat dan dengan spesifisitas yang tinggi Kata Kunci : TB paru anak. Sensitifitas, spesifisitas, GeneXpert MTB/RIF

KARYA ILMIAH AKHIR


BERLIAN BEATRIX R


Abstract

GENEXPERT MTB/RIF AND MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS SPUTUM CULTURE IN ESTABLISHING THE DIAGNOSIS OF PULMONARY TUBERCULOSIS AND RIFAMPICIN RESISTANCE IN SUSPECTED CHILDHOOD PULMONARY TUBERCULOSIS IN SOETOMO HOSPITAL

Berlian Beatrix, Deddy Iskandar, Retno Asih Setyoningrum, Ni Made Mertaniasih, Mahmudah

Background: The diagnosis of childhood tuberculosis remains a challenge worldwide. The GeneXpert MTB/RIF test, a rapid Mycobacteria tuberculosis diagnostic tool, was recommended for use in children. No pediatric studies of GeneXpert MTB/RIF assessing pulmonary tuberculosis with hospital base have been done in Indonesia Objective : We evaluated the performance of the GeneXpert MTB/RIF test compared with sputum culture on Lowenstein-Jensen (LJ) for the diagnosis of childhood pulmonary tuberculosis. Methods: We consecutively enrolled 27 children aged 3 months to 14 years with suspected pulmonary tuberculosis between June and August 2015 into a cross-sectional diagnostic study at Soetomo Hospital a tertiary care facility in Surabaya. Sputum collection was performed by induced sputum then three examination methods were performed, microscopic, GeneXpert MTB/RIF and sputum culture simultaneously. Followed by Drug sensitivity test for specimens detected with MTB growth Results: The GeneXpert MTB/RIF test had a sensitivity of 100% (95% CI 100- 100) and a specificity of 95% (95% CI 85-100). Positive predictive value for diagnosing pulmonary TB was 89% (95% CI 68-100), negative predictive value was 100% (95% CI 100-100), positive likelihood ratio was 20 (95% CI 2,82-128) Conclusion: The GeneXpert MTB/RIF test on one sputum sample rapidly and correctly identified all children with culture confirmed pulmonary tuberculosis with high specificity. Keywords: Childhood Pulmonary tuberculosis, Sensitivity, Specificity, GeneXpert MTB/RIF

KARYA ILMIAH AKHIR


BERLIAN BEATRIX R


RINGKASAN

Diagnosis Tuberkulosis (TB) pada anak yang sulit menyebabkan under dan over diagnosis TB anak, hal ini mengakibatkan morbiditas dan mortalitas yang tinggi. Menegakkan diagnosis dini TB pada anak sangat penting dalam rangka pengendalian kejadian penyakit TB. Namun pendekatan diagnosis yang ada saat ini kurang sensitif. GeneXpert MTB/RIF adalah uji molekuler dengan metode Polymerase chain reaction (PCR) memberikan sensitivitas tinggi dengan cara melipatgandakan deoxyribonucleic

acid

(DNA)

Mycobacterium

tuberculosis

(MTB).

Penelitian untuk mengevaluasi hasil pemeriksaan GeneXpert MTB/RIF dalam menegakkan diagnosis TB paru anak belum pernah dikerjakan di Indonesia. Tujuan penelitian ini adalah membandingkan hasil pemeriksaan GeneXpert MTB/RIF dengan kultur dahak MTB dalam menegakkan diagnosis TB paru anak di lingkungan Rumah Sakit. Penelitian ini dilakukan di poli respirologi anak dan bangsal respirologi anak RSUD dr Soetomo. Subyek penelitian adalah anak yang mempunyai kontak erat dengan penderita TB dewasa dan menunjukkan gejala TB paru. Jumlah sampel pada penelitian ini adalah 27 anak. Spesimen yang digunakan adalah dahak yang akan melalui tiga metode pemeriksaan sekaligus yaitu mikroskop, GeneXpert MTB/RIF dan kultur yang dilanjutkan dengan uji kepekaan MTB pada spesimen yang terdeteksi ada pertumbuhan kuman MTB. Hasil

analisa

statistik

menunjukkan

GeneXpert

MTB/RIF

mempunyai sensitifitas dan spesifisitas yang tinggi dalam menegakkan diagnosis TB paru anak. Terdapat kesepadanan hasil antara GeneXpert MTB/RIF dan kultur dahak berdasarkan kelompok umur dan kelompok manifestasi klinis TB.

KARYA ILMIAH AKHIR


BERLIAN BEATRIX R


DAFTAR ISI

LEMBAR KEPUTUSAN TIM PENGUJI..............................................

i

LEMBAR PENGESAHAN.............................................. .....................

ii

LEMBAR PERNYATAAN .............................................. ....................

iii

LEMBAR PENGESAHAN BUKTI KEPEMILIKAN...............................

iv

KATA PENGANTAR .............................................. ............................

v

UCAPAN TERIMAKASIH .............................................. ....................

vi

ABSTRAK .............................................. ............................................

xiv

ABSTRACT .............................................. .........................................

xv

RINGKASAN .............................................. .......................................

xvi

DAFTAR ISI.........................................................................................

xvii

DAFTAR GAMBAR…………………………………………….………….

xxi

DAFTAR TABEL……………………………………………………..…....

xxii

DAFTAR LAMPIRAN…………………………………………….............

xxiv

DAFTAR SINGKATAN……………………………………………………

xxv

BAB 1 PENDAHULUAN…………………………………………..………

1

1.1

Latar Belakang…………………………………..……...

1

1.2

Identifikasi Masalah……………………………………

4

1.3

Rumusan Masalah……………………………………...

4

1.4

Tujuan Penelitian……………………………………….

5

1.4.1

Tujuan Umum………………………………….

5

1.4.2

Tujuan Khusus………………………………...

5

KARYA ILMIAH AKHIR


BERLIAN BEATRIX R


Manfaat Penelitian……………………………………..

5

1.5.1

Manfaat Teori………………………………….

5

1.5.2

Manfaat Praktis……………………………….

6

BAB 2 TINJAUAN KEPUSTAKAAN……………………………………..

7

1.5

2.1

Mycobacterium tuberkulosis…………………………..

2.2

Patogenesis dan Perjalanan Alamiah

2.3

2.4

Tuberkulosis…………………………………………….

8

Diagnosis Tuberkulosis Anak…………………………

13

2.3.1

Pendekatan Dignosis TuberkulosisAnak…..

13

2.3.2

Kesulitan Diagnosis TuberkulosisAnak…….

20

Tuberkulosis-Multiple drug resistance……….………

22

2.4.1

Epidemiologi Tuberkulosis-Multiple Drug Resistance………………………………..……

2.4.2

2.4.3

23

Pendekatan Diagnosis Tuberkulosis-Multiple Drug Resistance………………………………

26

Penggunaan GeneXpert MTB/RIFuntuk Diagnosis Tuberkulosis Anak dan Resistensi Rifampisin……...

27

2.5.1

Sistem GeneXpert MTB/RIF…………………

27

2.5.2

Pemeriksaan Molekuler Mycobacterium tuberculosis dengan GeneXpert MTB/RIF….

2.5.3

Penelitian tentang penggunaan GeneXpertMTB/R.

KARYA ILMIAH AKHIR

29

Pengumpulan Spesimen Pemeriksaan GeneXpert MTB/RIF………………………….

2.6

22

Patogenesis Tuberkulosis-Multiple Drug Resistance……………………………………

2.5

7


33 35

BERLIAN BEATRIX R


2.6.1

Penelitian tentang GeneXpert MTB/RIFpada TB paru…………………………………………

2.6.2

36

Penelitian tentang GeneXpert MTB/RIF pada Diagnosis Resistensi Rifampisin……...

40

Bab 3KERANGKA KONSEPTUAL………………………………………

42

3.1

Kerangka Konseptual Penelitian……………………...

41

3.2

Penjelasan Kerangka konsep penelitian……………..

43

3.3

Hipotesis………………………………………….……..

44

Bab 4 METODE PENELITIAN………………………………….....……..

45

4.1

Jenis Penelitian…………………………………..……..

45

4.2

Waktu dan Tempat Penelitian……………….....……..

46

4.2.1

Waktu Penelitian………………………………

46

4.2.3

Tempat Penelitian……………………….…….

46

4.3

Populasi danSampel Penelitian………………..…….

46

4.3.1

Populasi Penelitian……………………………

46

4.3.2

Sampel Penelitian………………………..……

46

4.3.3

Kriteria Inklusi dan Eksklusi……………..……

46

4.3.4

Estimasi Besar Sampel…………………..…...

47

4.3.5

Teknik Pengambilan Sampel…………………

48

4.4

Variabel Penelitian……………………………………...

48

4.5

Definisi Operasional Penelitian…………………..……

48

4.6

Teknik Pengumpulan Data……………………..……...

55

Pemilihan Subyek Penelitian………….……..

55

4.6.1

KARYA ILMIAH AKHIR


BERLIAN BEATRIX R


Pengumpulan Data Dasar Penelitian………..

55

4.7

Teknik Analisis Data……………………………………

57

4.8

Etika Penelitian…………………………………………

57

4.9

Alur Penelitian………………………………......………

57

Bab 5 HASIL PENELITIAN DAN ANALISIS……………………………

59

5.1

Karakteristik Sampel……………………………………

59

5.2

Diagnosis TB Paru Anak dengan GeneXpert

4.6.2

MTB/RIF………………………………………………… 5.3

Deteksi Resistensi Rifampisin pada TB Paru Anak dengan GeneXpert MTB/RIF………………………….

5.4

65

66

Pemeriksaan GeneXpert MTB/RIF dan Kultur Dahak Mycobacterium tuberculosis berdasarkan Kelompok Umur.…………………………...........……..

5.5

67

Pemeriksaan GeneXpert MTB/RIF dan Kultur Dahak Mycobacterium tuberculosis berdasarkan Status Gizi……..…………………………...........……..

5.6

69

Pemeriksaan GeneXpert MTB/RIF dan Kultur Dahak Mycobacterium tuberculosis berdasarkan Manifestasi Klinis………………………...........……….

73

BAB 6 PEMBAHASAN………………………………......................……

76

6.1

Karakteristik Sampel………………………...........…...

76

6.2

Diagnosis TB Paru dengan GeneXpert MTB/RIF......

80

6.3

Deteksi Resistensi Rifampisin pada TB paru Anak dengan GeneXpert MTB/RIF………................………

KARYA ILMIAH AKHIR


84

BERLIAN BEATRIX R


6.4

Pemeriksaan GeneXpert MTB/RIF dan Kultur Dahak Mycobacterium tuberculosis berdasarkan Kelompok Umur..…………………………............……

6.5

86

Pemeriksaan GeneXpert MTB/RIF dan Kultur Dahak Mycobacterium tuberculosis berdasarkan Status Gizi……...…………………………............……

6.6

88

Pemeriksaan GeneXpert MTB/RIF dan Kultur Dahak Mycobacterium tuberculosis berdasarkan Manifestasi klinis.…………………………............……

89

BAB 7 PENUTUP………………………………………………………….

93

7.1

Simpulan ………………………………………………..

93

7.2

Saran…………………………………………………….

93

Daftar Pustaka……………………………………………………………..

94

Lampiran…………………………………………………………..……….

102

KARYA ILMIAH AKHIR


BERLIAN BEATRIX R


DAFTAR GAMBAR

Gambar 2.1

Kuman Mycobacterium tuberculosis pada pemeriksaan mikroskopis………………………..………………………..

Gambar 2.2

Gen rpoB enzym RNA polymerase yang mengalami mutasi………………………………………………………..

Gambar 2.3

7

25

Primer GeneXpert MTB/RIF pada Rifampisin Resistance Determining Region…...……………………………………

29

Gambar 2.4

Perangkat pemeriksaan GeneXpert MTB/RIF..…………

31

Gambar 2.5

Hasil pemeriksaan GeneXpert MTB/RIF…………………

33

Gambar 2.6

Alur penggunaan Mesin GeneXpert MTB/RIF..…………

35

Gambar 3.1

Kerangka Konsep Penelitian……………………..……….

42

Gambar 4.1

Pembacaan hasil TST…………………………….……….

50

Gambar 4.2

Alur Penelitian……………………………………..……….

58

KARYA ILMIAH AKHIR


BERLIAN BEATRIX R


DAFTAR TABEL

Tabel 2.1

Average age specific risk for disease development following primary infection…………………………….........

12

Tabel 2.2

Sistem skoring diagnosis Tuberkulosis anak………........

14

Tabel 2.3

Factors

causing

false-negative

Tuberculin

Skin

Tests……………………………...…………………………… Tabel 2.4

Factors

causing

false-positive

Tuberculin

Skin

Tests…………………………………………………………… Tabel 2.5

16

Penelitian tentang penggunaan GeneXpert MTB/RIF pada Tuberkulosis paru……………………………….........

Tabel 2.6

15

38

Perbandingan Hasil pemeriksaan GeneXpert MTB/RIFdengan pemeriksaan mikroskopis dan kultur …………………………………………………………..

Tabel 2.7

39

Penelitian tentang penggunaan GeneXpert MTB/RIF untuk deteksi kuman MTB yang resisten terhadap Rifampisin. ……………………………………………………

41

Tabel 4.1

Interpretasi hasil Tuberculin Skin Test…………………….

50

Tabel 4.2

Penentuan status gizi menurut kriteria Waterlow, WHO 2006 dan CDC 2000………………………………………….

Tabel 4.3

52

Standard Nasional Pencatatan Hasil Kultur Dahak MTB. ……………………………………………………....................

54

Tabel 5.1

Karakteristik Sampel………………………………………….

60

Tabel 5.2

Perbandingan Hasil Pemerksaan TST dengan GeneXpert MTB/RIF ………………………….……………………………

62

Tabel 5.3

Pemeriksaan Dahak...........……..…………….…………….

62

Tabel 5.4

Perbandingan

Pemeriksaan

Mikroskopis

BTA

dan

GeneXpert MTB/RIF…………………………………………. Tabel 5.5

Tabel 5.6

63

Perbandingan Pemeriksaan Mikroskopis BTA, dan Kultur Dahak MTB......………………………………………………..

64

Pemeriksaan Uji Kepekaan MTB……………………………

65

KARYA ILMIAH AKHIR


BERLIAN BEATRIX R


Tabel 5.7

Perbandingan Pemeriksaan GeneXpert MTB/RIF dan Kultur Dahak MTB ……………………………………………

Tabel 5.8

Perbandingan

GeneXpert

MTB/RIF

berdasarkan

Kelompok Umur...... …………………………….…….......... Tabel 5.9

66

67

Perbandingan Kultur dahak MTB berdasarkan Kelompok Umur.......…………………………….……..........................

Tabel 5.10

Kesepadanan Hasil GeneXpert MTB/RIF dan Kultur Dahak MTB berdasarkan Kelompok Umur......................

Tabel 5.11

Pemeriksaan

GeneXpert

MTB/RIF

73

Perbandingan Kultur dahak MTB berdasarkan Manifestasi Klinis……………………..…………......………………………

Tabel 5.16

71

berdasarkan

Manifestasi Klinis………………………………......………… Tabel 5.15

70

Kesepadanan GeneXpert MTB/RIF dan Kultur Dahak MTB berdasarkan Status Gizi ….……...……....................

Tabel 5.14

70

Pemeriksaan Kultur dahak MTB berdasarkan Status Gizi.......…….…………………………….……...……...........

Tabel 5.13

69

Pemeriksaan GeneXpert MTB/RIF berdasarkan Status Gizi.......…….…………………………….…….....................

Tabel 5.12

68

74

Kesepadanan GeneXpert MTB/RIF dan Kultur Dahak MTB berdasarkan Manifestasi Klinis……………………….

KARYA ILMIAH AKHIR


BERLIAN BEATRIX R

75


DAFTAR LAMPIRAN Lampiran 1

Jadwal Kegiatan Penelitian…………………….………..

102

Lampiran 2

Lembar Pengumpul Data………………………………...

103

Lampiran 3

Informasi Penelitian untuk peserta…………….………..

107

Lampiran 4

Permohonan Menjadi Subyek Penelitian………………

112

Lampiran 5

Surat pernyataan kesediaan mengikuti penelitian…….

113

Lampiran 6

Etik Penelitian………………………………........……….

114

Lampiran 7

Hasil Penghitungan SPSS……………………..………...

115

KARYA ILMIAH AKHIR


BERLIAN BEATRIX R


DAFTAR SINGKATAN AFB

:

Acid Fast Bacili

BB

:

Berat Badan

BTA

:

Basil Tahan Asam

DNA

:

Deoxyribonucleic acid

DL

:

Darah lengkap

DST

:

Drug Susceptibility Testing

IMT

:

Indeks Masa Tubuh

LED

:

Light Emitting Diode

LR

:

Likelihood ratio

LJ

:

Lowenstein Jensen

MODS

:

Microscopic Observation Drug Susceptibility

MTB

:

Mycobacterium tuberculosis

NPV

:

Negative Predictive Value

RIF

:

Rifampisin

RNAP

:

Ribonucleic acid polymerase

RRDR

:

Rifampisin-Resistance Determining Region

Sen

:

Sensitifitas

Sp

:

Spesifisitas

SPC

:

Sample Processing Control

PPC

:

Probe Processing Control

PPD

:

Purified Protein Derivative

PPV

:

Positive Predictive Value

TB

:

Tuberkulosis

TB-HIV

:

Tuberculosis-Human Immunodeficiency Virus

TB-MDR

:

Tuberculosis-Multiple Drug Resistance

Tb

:

Tinggi badan

TBM

:

Tuberculous Meningitis

TST

:

Tuberculin skin test

TU

:

Tuberculin Unit

WHO

:

World Health Organization

ZN

:

Ziehl-Neelsen

KARYA ILMIAH AKHIR


BERLIAN BEATRIX R

ADLN-PERPUSTAKAAN UNIVERSITAS AIRLANGGA

Recommend Documents