Katedra biologie PřF UJEP Nabídka témat závěrečných prací
Aktuální nabídka témat závěrečných prací
Doc. RNDr. Jaromír Hajer, CSc. ................................................................................................ 2 RNDr. Jan Ipser, CSs. ................................................................................................................ 4 Doc. RNDr. Karel Kubát, CSc. .................................................................................................. 7 Mgr. Jan Malý, PhD. .................................................................................................................. 9 Doc. MUDr. Vladislav Mareš, DrSc.. ...................................................................................... 11 RNDr. Lenka Němcová, CSc. .................................................................................................. 14 Mgr. Kateřina Řeháková .......................................................................................................... 16 Mgr. Marcel Štofik ................................................................................................................... 18 Mgr. Karina Šondová, Ph.D. .................................................................................................... 19
Katedra biologie PřF UJEP Nabídka témat závěrečných prací
Doc. RNDr. Jaromír Hajer, CSc. „Využití hedvábí při lovu potravy pavouky čeledi Theraphosidae (Araneae: Mygalomorphae)“. Using the silk by catching of prey by spider family Theraphosidae (Araneae: Mygalomorphae). Mygalomorfní pavouci čeledi Theraphosidae mají redukovaný snovací aparát a při spřádání pavučinových vláken a stavbě sítí nepoužívají končetin. Cílem diplomové práce je popsat využití hedvábí jak při lovu, tak při manipulaci s kořistí. Mikropreparáty ve výuce zoologie a jejich optimální využití při vyučování biologie na ZŠ. Microslides and microscopic sections: a role by zoology teaching and optimization of their sets. Cílem práce je navrhnout sadu trvalých preparátů, která přispěje ke zlepšení názorné výuky zoologie na základních školách. Komerčně vyráběné sady preparátů jsou nekvalitně zhotovené a jejich skladba je ovlivněna především snadnou dostupností objektů, nikoliv reálnou potřebou školy. Součástí diplomové práce bude popis mikropreparátů, včetně jejich perokreseb a popsaných mikrofotografií. Skleníkoví červci ( Homoptera: Pseudococcidae) a jejich biologie. Greenhouse mealybugs (Homoptera : Pseudococcidae) and their biology. Cílem práce bude studium biologie červců, významných škůdců skleníkových rostlin. Studovaným materiálem budou červci, parazitující na kolekci rostlin ve sklenících katedry biologie Přírodovědecké fakulty UJEP. Při výzkumu bude užívána moderní mikroskopická technika včetně elektronové mikroskopie. Součástí studie budou rovněž etologická pozorování jak červců, tak predátorů, kteří mohou být využíváni při biologické kontrole těchto parazitů. Role hedvábí při disperzi pavouků vzduchem. The balooning dispersal using silk by spiders. Šíření juvenilních stádií členovců, produkujících hedvábí, vzduchem se v průběhu evoluce vyvinulo u pavouků (Araneae), roztočů (Acari) a také u některých larev motýlů (Lepidoptera). U pavouků je tento jev klíčový při osidlování nových, mnohdy extrémních biotopů a šíření na velké vzdálenosti. Cílem práce je zjistit a zdokumentovat která část snovacího ústrojí produkuje hedvábná vlákna, na kterých pavouci „ cestují“ vzduchem a detailně popsat chování pavouků při tkaní vláken a při opouštění pevného podkladu. Avifauna odkalovacích nádrží plynárny Úžín. The avifauna of tailing ponds by the Úžín gasworks (Ústí nad Labem distrikt, Northern Bohemia). V průběhu práce bude proveden průzkum ptačí fauny na soustavě rybníčků, které byly vybudovány poblíž plynárny Úžín (okr. Ústí nad Labem) a které cca 30 let sloužily jako odkalovací nádrže. Po zastavení provozu plynárny zde vzniklo pozoruhodné refugium vodních ptáků z nichž některé druhy patří mezi ohrožené. Lokalita je dostupná městskou hromadnou dopravou. Snovací aktivita pavouka Theridiosoma gemmosum: sítě, kokony, jejich zhotovování a vývoj. The spinning aktivity of the spider Theridiosoma
strana 2 / 19
Katedra biologie PřF UJEP Nabídka témat závěrečných prací
gemmosum (Araneae, Theridiosomatidae): web, cocoon, cocoon handling behaviour and development. Předmětem výzkumu bude snovací aktivita jediného evropského druhu čeledi Theridiosomatidae (křižáčkovití). Převážně etologická studie bude zaměřena na zhotovování hedvábných zámotků (kokonů), ve kterých se vyvíjejí vajíčka, na embryonální vývoj uvnitř kokonů a na juvenilní stádia ontogenetického cyklu. Měkkýši odkalovacích nádrží plynárny Úžín. Moluscs of tailing ponds by the Úžín gasworks (Ústí nad Labem distrikt, Northern Bohemia). Práce je zaměřena na studium měkkýšů, obývajících soustavu nádrží, které byly přibližně před 30 lety vybudovány poblíž plynárny Úžín (okr. Ústí nad Labem). Provoz plynárny je v současné době zastaven a malé vodní nádrže, které mají být v příštích letech zasypané, slouží jako refugium mnoha vzácných a ohrožených živočichů. Výzkum měkkýšů na této lokalitě dosud prováděn nebyl. Místo je dostupné městskou hromadnou dopravou. Biologie pavouků čeledi Dysderidae. The biology of the spider family Dysderidae. Práce bude zaměřena na tyto tři druhy: a) Harpactea herodis Brignoli, 1978 b) Dysdera sp. – jedná se o velký a dosud nepopsaný, endemický druh, nalezený na území Galileje c) Tedia abdominalis Deeleman-Reinhold, 1988 Studium biologie každého ze tří druhů je chápáno, jako samostatná diplomová práce. Výzkum bude převážně orientován na lov potravy (potravní specializaci), tkaní hedvábných sítí, životní cyklus, páření a předpokládanou partenogenezi. Biologie pavouků rodu Steatoda Sundevall, 1833. The biology of the spider genus Steatoda Sundevall, 1833. Výzkum bude zaměřen na druhy Steatoda nobilis (Thorell, 1875), Steatoda triangulosa (Walckenaer, 1802), případně na druh Steatoda grossa (C.L. Koch, 1838). Téma je vypisováno pro dva spolupracující diplomanty , kteří se zaměří na tyto okruhy: a) ontogenetický cyklus, lov potravy, kopulaci, kokony a embryonální vývoj b) morfologie snovacího aparátu se zaměřením na vlastní snovací žlázy a jejich funkci. Hedvábí pavouků čeledi Theraphosidae (Araneae, Mygalomorphae) a jeho využití při lovu potravy. The silk of spiders of the family Theraphosidae (Araneae, Mygalomorphae) and its role role by prey capture. Cílem práce je objasnění role hedvábí sklípkanů čeledi Theraphosidae při lovu potravy a manipulaci s kořistí. Práce je chápana především, jako etologická studie.
strana 3 / 19
Katedra biologie PřF UJEP Nabídka témat závěrečných prací
RNDr. Jan Ipser, CSs. A. BAKALÁŘSKÉ PRÁCE Mutagenní, genotoxické a embryotoxické účinky vybraných komponent zevního prostředí u modelových organizmů.Mutagenic, genotoxic and embryotoxic effects of selected komponents of the environment. Zaměření: Zpracovat co nejkomplexnější rešerši týkající se vlivu vybraných komponent zevního prostředí na modelové organizmy (Drosophila melanohaster, Arabidopsis thaliana). Téma lze rozpracovat v práci diplomovou. Numerické a strukturální změny chromozomů. Numerical and structural changes of the chromosomes. Zaměření: Vypracovat komplexní přehled mechanizmů vzniku numerických a strukturních změn chromozomů, jejich význam v genetice rostlin, živočichů a člověka. Téma lze rozpracovat jako diplomovou práci zaměřenou na karyologickou charakteristiku maligně transformovaných buněk. GMO a GMP. Genetically modified organisms (GMO) and genetically modified products (GMP). Zaměření: Vypracovat komplexní přehled metod aplikovaných při genových manipulacích, charakteristiku geneticky manipulovaných organizmů a potravin. Teoretické poznatky doplnit empirickým šetřením na reprezentativním vzorku populace. Genetická struktura populací. Genetic structure of the populations. Zaměření: Charakterizovat strukturu populací organizmů vzhledem ke způsobu jejich rozmnožování, popsat mechanizmy změn ve struktuře populací a vypracovat matematický model strukturních změn populace (vybraného taxonu) způsobených vlivem působení systematických procesů (mutace, selekce, migrace). Toto téma lze dále rozpracovat jako diplomovou práci na základě výsledků experimentů s mutanty Drosophila melanogaster, resp. jiným modelovým organizmem. Aplikace molekulárně genetických metod identifikace biologického materiálu ve forenzních vědách. Application of the molecular genetic methods for identification of the biological material in the forensic science. Zaměření: Vypracovat přehled forenzně genetických metod identifikace biologického materiálu, jejich aplikace ve forenzní praxi včetně matematického zpracování získaných experimentálních výsledků a jejich interpretace. Toto téma je možné rozpracovat jako diplomovou práci na základě experimentálních výsledků distribuce STR v náhodném vzorku populace ČR. Matematické modely vývoje genetické struktury lidských populací. Mathematical models of the human populations genetic structure in evolution. Zaměření: Na základě dostupných údajů, především molekulárně-genetických, populačně genetických a antropogenetických, vypracovat matematické modely vývoje genetické struktury lidských populací při různých stupních idealizace. Modely by měly umožňovat predikci vývoje změn ve struktuře populací při zadání hodnot strana 4 / 19
Katedra biologie PřF UJEP Nabídka témat závěrečných prací
příslušných proměnných veličin (rychlost migrace, selekční koeficient, mutační rychlost). Toto téma je možné rozpracovat v širších teoretických souvislostech jako práci diplomovou. Genetický a molekulárně-biologický atlas. Genetics and molecular biology atlas. Zaměření: Vypracovat ucelený komentovaný atlas genetických a molekulárně biologických procesů na základě dostupných recentních poznatků. Těžiště práce bude spočívat v tvorbě původních obrázků, schémat a případně fotografií opatřených komentářem a zpracovaných v digitální podobě. Pro vybrané genetické a molekulárně-biologické procesy vytvořit animace. Toto téma je možné rozpracovat v širších teoretických souvislostech jako práci diplomovou. Biotermodynamika buňky jako otevřeného systému. Cell as an open system and its biothermodynamics. Zaměření: Vypracovat ucelený přehled pojetí buňky jako otevřeného systému z pozice biotermodynamiky s akcentem na tzv. nerovnovážnou termodynamiku. K tomu využít a interpretovat stávající matematické a biokybernetické modely, nové poznatky teorie informace, teorie řízení a teorie systémů. Toto téma je možné rozpracovat v širších teoretických souvislostech jako práci diplomovou. Biologické a zdravotní aspekty životního stylu mládeže. Biological and health aspects of the youth life styles. Zaměření: Provést empirické šetření u reprezentativního vzorku zvolené (věkové, socioprofesní) skupiny mládeže zaměřené na posouzení úlohy vybraných biologických a zdravotních ukazatelů (stravovací režim, spánkový režim, hygienické návyky, sexuální chování, preventivní péče o zdraví apod.). Zjištěné údaje adekvátně zpracovat, vyhodnotit a interpretovat v kontextu s obecnými charakteristikami životních stylů mládeže. Téma může být řešeno více studenty a to i jako práce diplomová. Filozoficko-etické a metodologické problémy biologie. Philosophical, ethic and methodological problems of the biology. Zaměření: Rozpracovat do ucelené podoby dílčí biologickou problematiku z hlediska filozoficko-etického nebo metodologického. Konkrétní zadání bude upřesněno s vedoucím práce v rámci následujících tématických okruhů: a) Člověk jako objekt a subjekt evoluce; antropogenetické důsledky globalizace a multikulturality ve vývoji populací Homo sapiens. b) Bioetické aspekty eugeniky, eutanázie a prenatální diagnostiky; kvalita života, právo na život a na smrt. c) Vývoj pojetí pohybu, času a prostoru jako bytných charakteristik v biologii. d) Informace v biologii jako filozofický problém. d) Evoluce jako ontologický problém; moderní teorie biologické evoluce versus kreacionismus.
strana 5 / 19
Katedra biologie PřF UJEP Nabídka témat závěrečných prací
B. DIPLOMOVÉ PRÁCE Distribuce krátkých tandemových repeticí (STR) v populaci ČR. Distribution of the short tandem repeats (STR´s) in the Czech population. Zaměření: V náhodném vzorku populace ČR stanovit genové a genotypové četnosti vybraných STR. Experimentální výsledky porovnat s teoreticky očekávanými četnostmi pro populaci v Hardy-Weinbergově rovnováze. Případně zjištěné statisticky významné rozdíly mezi teoreticky očekávanými a nalezenými hodnotami interpretovat v termínech procesů narušujících rovnováhu ve velké panmiktické populaci. Charakteristika mutantních populací Drosophila melanogaster. Characterization of the Drosophila melanogaster mutant populations. Zaměření: V populacích vybraných mutantních kmenů Drosophila melanogaster charakterizovat fáze reprodukčního procesu v termínech relativní vitality, relativní fertility, letality, reprodukční zdatnosti a adaptivních hodnot v komparaci s údaji, získanými v populacích standardního kmene. Vývojová antropologie dětí. Developmental antropology of children. Zaměření: Provést antropologické měření na náhodném reprezentativním souboru osob (dětí) určité věkové kategorie a stanovit somatotyp. Formou dotazníků realizovat šetření zaměřené na předem stanovené faktory životního stylu. Získané výsledky adekvátním způsobem vyhodnotit a porovnat s dostupnými literárními údaji obdobných výzkumů. Interpretovat případně zjištěné statisticky signifikantní rozdíly, resp. longitudinální vývojové tendence. Somatologická charakteristika a životní styl dětí etnických menšin v ČR. Somatological characteristics and life styles of the children from ethnical minorities living in the Czech republic. Zaměření: Na základě vybraného souboru ukazatelů provést na reprezentativním vzorku základní antropometrický průzkum, stanovit somatotyp a charakterizovat zvláštnosti životního stylu dětí zvolené etnické menšiny. Mikromorfologická charakteristika trichologického materiálu a jeho změny způsobené keratinofilními mikroorganizmy. Zaměření: Popsat a detailně charakterizovat zkoumaný trichologický materiál (vlasy, chlupy) a analyzovat jeho patologické změny způsobené činností keratinofilních mikroorganizmů. Matematické modelování reprodukčního procesu ve smíšených populacích Drosophila melanogaster. Mathematical modeling of the reproduction process in mixed populations of Drosophila melanogaster. Zaměření: Ve smíšených populacích vybraných mutantních kmenů Drosophila melanogaster charakterizovat fáze reprodukčního procesu v termínech relativní vitality, relativní fertility, letality, reprodukční zdatnosti a adaptivních hodnot v kontextu se zjištěnými genovými a genotypovými četnostmi v několika po sobě následujících generací. Na základě získaných výsledků vytvořit matematický model umožňující predikovat vývoj genetické struktury populací s ohledem na relativní zastoupení jednotlivých mutantních genotypů v počáteční generaci.
strana 6 / 19
Katedra biologie PřF UJEP Nabídka témat závěrečných prací
Doc. RNDr. Karel Kubát, CSc. Současný stav populací topolu černého na dolní Ohři. Actual condition of the Populus nigra populations in the Ohře river basin Populus nigra je zařazen mezi silně ohrožené druhy květeny ČR. Dolní Poohří je jedním z mála území v Čechách, kde dosud roste větší množství vzrostlých stromů. Cílem práce je zjistit současný stav (počet exemplářů, jejich rozměry a přibližné stáří, zdravotní stav) a případně schopnost generativního a vegetativního rozmnožování. Pokusit se vytipovat optimální stanovištní podmínky pro tento druh. Chromozomové počty vybraných druhů květeny ČR. Chromosome numbers in selected plants of the Czech flora Počty chromozomů jsou významným kvalitativním znakem pro studium některých rodů nebo skupin druhů. Cílem práce bude zjistit chromozomové počty a porovnat výsledky s dosud publikovanými údaji, případně se pokusit nalézt morfologické znaky, odlišující taxony různých ploidií. Floristický výzkum vybraného území Floristic investigation of selected territory Cílem práce je podrobně zpracovat floristické poměry vybraného území. Základem jsou seznamy zjištěných druhů na jednotlivých lokalitách. Jejich porovnáním s literaturou zjistit změny ve flóře území a jejich předpokládané trendy. Vyhodnocení nejvýznamnějších nálezů (obvykle se zaměřením na ohrožené, zvláště chráněné a invazní rostliny). Současný stav flóry břehů Labe v úseku Ústí n. L. – Těchlovice Actual flora in the Elbe river shores between Ústí n. L. and Těchlovice Současný stav flóry břehů Labe v úseku Těchlovice – Děčín Actual flora in the Elbe river shores between Těchlovice and Děčín Po povodni 2002 došlo k výrazným změnám ve flóře a vegetaci labských břehů. Cílem práce bude mimo jiné zjistit: 1. aktuální stav flóry a vegetace v místech po vykácených břehových porostech, 2. současný stav populací vybraných vzácných a ohrožených druhů rostlin (Corrigiola litoralis, Leersia oryzoides, Nasturtium officinale atd.), 3. současný stav populací a rozšíření vybraných invazních druhů (Echinocystit lobata, Eragrostis sp., Ambrosia sp. atd.). Získané výsledky porovnat s dostupnými údaji z doby před rokem 2002. Rozlišení topolu černého a t. kanadského na základě morfologických a anatomických znaků Topol černý je v ČR zařazen mezi silně ohrožené druhy. Jeho populace v dolním Poohří patří k nejpočetnějším v Čechách. Topol kanadský patří k velmi často vysazovaným dřevinám u vodních toků a nádrží, ale i na jiných alespoň mírně vlhkých místech. Cílem práce bude zjistit 1. které ze znaků, uváděných v určovacích klíčích, mohou nejspolehlivěji sloužit k odlišení obou taxonů a zda se jejich spolehlivost nemění v průběhu vegetační sezóny,
strana 7 / 19
Katedra biologie PřF UJEP Nabídka témat závěrečných prací
2. zda existují nějaké další dosud nepoužívané znaky (např. tvar a velikost pokožkových buněk a průduchů, stavba řapíku listů, plodů, osemení, chmýr na semenech apod.).
strana 8 / 19
Katedra biologie PřF UJEP Nabídka témat závěrečných prací
Mgr. Jan Malý, PhD. Magisterské a bakalářské experimentální práce Témata jsou rámcová, jedno téma může souběžně řešit více studentů, pochopitelně s individuální specifikací. Konjugace biomolekul s nanočásticemi kovů a polymerů Cílem diplomové práce je příprava nanočástic kovů a kompozitních polymerů a jejich konjugace s různými typy biomolekul (malé molekuly, nukleové kyseliny, proteiny). Uvedené konjugáty budou charakterizovány optickými (UV-VIS, FTIR), mikroskopickými (Fluorescenční mikroskopie, AFM, TEM), povrchově-analytickými (SPR) a imunoanalytickými (ELISA) metodami. Student se seznámí se základy moderních laboratorních technik a postupů s využitím přístrojového vybavení katedry biologie. Vhodné pro studenty vyšších ročníků a v omezené míře i pro studenty bakalářského stupně. Charakterizace vazebných interakcí biomolekul metodou povrchové rezonance plasmonů Cílem práce bude optimalizovat postupy stanovení vazebných afinit vybraných biologických ligandů (protilátka-antigen, umělé vazebné proteiny, nukleové kyseliny, malé molekuly) metodou povrchové resonance plasmonů (SPR). Student bude mít možnost pracovat na špičkovém zařízení a spolupracovat s výzkumnými pracovišti v AVČR. Vhodné pro studenty magisterského i bakalářského stupně. Využití techniky koloidní litografie pro přípravu nanostrukturovaných povrchů pro biologické aplikace Cílem diplomové práce je výzkum postupů pro přípravu nanostrukturovaných povrchů technikou koloidní litografie a metod selektivní imobilizace biomolekul na povrchu vytvořené nanostruktury. Získané povrchy budou charakterizovány pomocí mikroskopie atomárních sil a elektronové mikroskopie. Student bude pracovat se základními fotolitografickými postupy, seznámí se s principy selektivních imobilizací biomolekul a moderními biotechnologickými trendy. Vhodné pro studenty magisterského i bakalářského stupně. Využití metody fluorescenční mikroskopie ve výuce fyziologie rostlin a molekulární biologie Cílem práce je vytvořit souhrn jednoduchých laboratorních úloh z oblasti fluorescenční mikroskopie využitelných pro laboratorní výuku ve fyziologii rostlin, popř. v molekulární a buněčné biologii. Předpokládá se samostatná rešeršní práce studenta v odborné literatuře, experimentální ověření úloh, příprava protokolů a podpůrných materiálů (např. obrazový materiál). Vhodné pro studenty magisterského i bakalářského stupně. Využití metody elektronové mikroskopie ve výuce fyziologie rostlin a molekulární biologie (od léta 2009) Cílem práce je vytvořit souhrn jednoduchých laboratorních úloh z oblasti elektronové mikroskopie využitelných pro laboratorní výuku ve fyziologii rostlin, popř. v molekulární a buněčné biologii. Předpokládá se samostatná rešeršní práce studenta strana 9 / 19
Katedra biologie PřF UJEP Nabídka témat závěrečných prací
v odborné literatuře, experimentální ověření úloh, příprava protokolů a podpůrných materiálů (např. obrazový materiál). Vhodné pro studenty magisterského i bakalářského stupně. Rešeršní zpracování vybraných témat z oblasti biosensorů, biotechnologie a fyziologie rostlin po dohodě se studentem. Výsledkem práce by měl být ucelený odborný text rešeršního charakteru, pojednávající o jasně vymezeném tématu, s rozsáhlým citačním souhrnem odborných textů v dané oblasti. Student bude pracovat s odborným textem, prohledávat informační databáze a naučí se základům odborné komunikace. Vhodné pro studenty bakalářského stupně studia. Předpokladem je znalost anglického jazyka.
strana 10 / 19
Katedra biologie PřF UJEP Nabídka témat závěrečných prací
Doc. MUDr. Vladislav Mareš, DrSc.. Didaktické využití systému PowerLab pro výuku fyziologie živočichů a člověka. Didactic applications of the PowerLab system for teaching of human and animal physiology Cílem DP je vypracovat vzorové protokoly pro sledování vybraných tělesných funkcí (svalových, srdečních, respiračních a nervových) nově zakoupeným přístrojem PowerLab System. Protokoly mají umožnit VŠ studentům fyziologie živočichů a člověka funkční monitoraci uvedených orgánů za klidových podmínek a po vybrané funkční zátěži, a to v časovém limitu vymezeném jedné hodiny praktického cvičení. Práce vyžaduje zájem o práci s počítačově řízeným přístrojem a problematiku fyziologie. DP se bude realizovat na Katedře biologie PřF UJEP. Možnost konsultace ve Fyziologickém ústavu AV ČR. Vhodné pro studenty 3. a vyššího ročníku. Školitel: Doc. MUDr Vladislav.Mareš, DrSc Didaktické využití počítačových systémů SimThieme pro pokročilou výuku fyziologie živočichů a člověka ve virtuální realitě. Didactic applications of computer systems SimThieme for advanced teaching of human and animal physiology Cílem DP je vypracovat vzorové protokoly pro sledování vybraných tělesných funkcí (svalových, srdečních, respiračních a nervových) ve virtuální realitě pomocí programů SimNerve, SimHeart a SimMuscle (fy Thieme, NSR). Protokoly mají umožnit VŠ studentům fyziologie živočichů a člověka monitoraci buněčných a orgánových funkčních projevů těchto orgánů za klidových podmínek a po vybraných farmakologických zátěžích, a to s ohledem na časové limity vymezené pro praktická cvičení. Práce vyžaduje zájem o práci s počítačem a problematiku buněčné a orgánové fyziologie. DP se bude realizovat na Katedře biologie PřF UJEP s možností konsultací ve Fyziologickém ústavu AV ČR. Vhodné pro studenty již od 2. ročníku Školitel: Doc. MUDr Vladislav.Mareš, DrSc
Návrhy bakalářských prací Témata pro zpracování formou literárního přehledu: Regulace buněčného cyklu Molekulové motory buňky Úloha plazmatické membrány v příjmu signálů z okolí Kmenové buňky a jejich fyziologická úloha v živočišném organizmu Tvorba a funkce reaktivních kyslíkových radikálů v buňce Mechanizmy rozkladu bílkovin v buňce Metabolizmus lipidů a jeho úloha v udržování hladiny cholesterolu v krvi Krevní skupiny, jejich typy u člověka a dalších živočišných species Molekulární mechanizmy příjmu potravy a obezita Extracelulární matrix živočišných tkání a poruchy její molekulární stavby Kostní tkáň a její přestavba v různých fázích ontogeneze člověka Historický vývoj molekulární stavby plazmatické membrány
Témata s možností zpracování archivních mikroskopických preparátů Změny růstu gliových buněk v kultuře vyvolané cytostatikem Cisplatinou strana 11 / 19
Katedra biologie PřF UJEP Nabídka témat závěrečných prací
Distribuce dělících se buněk v embryu laboratorního potkana Aktivita gama glutamyltransferázy a možnosti její experimentální alterace v gliových buňkách v kultuře Buněčná smrt v mozku myši vyvolaná ionizujícím zářením Buněčná smrt v mozku myši vyvolaná cytostatiky
ANOTACE BAKALÁŘSKÉ PRÁCE pro kombinované studium biologie Cyto- a chemoarchitektonika kostní tkáně člověka v dospělosti Cíl. Formou přehledového článku shrnut starší a nové poznatky o buněčné a molekulární stavbě lamelární kostní tkáně člověka v dospělosti a fyziologické přestavbě osteonů, vč. jejich biomechanických vlastností. Zhotovit vlastní mikroskopickou fotodokumentaci kostní tkáně z komerčních preparátů a provést základní morfometrickou a statistickou analýzu tohoto materiálu. Požadavky. Zpracovat základní údaje týkající se zadaného tématu z českých a zahraničních monografií učebnicového typu. Přehledový materiál doplnit o novějších údaje z původních domácích a zahraničních primárních časopiseckých prací. Pasivní znalost angličtiny.Znalost práce s webovými biologickými databázemi a potřebnými PC programy, vč. Analýzy obrazu bude zajištěno. Mikroskopickou dokumentaci je třeba uskutečnit do konce roku 2009. Vedoucí práce: Doc. Vlad. Mareš, v.r.
ANOTACE BAKALÁŘSKÉ PRÁCE pro kombinované studium biologie Tvorba kostní tkáně v časných vývojových stádiích člověka Cíl. Formou přehledového článku shrnut starší a nové poznatky o procesu tvorby kostní tkáně na bazi chrupavčitých a vazivových základů. Hlavní pozornost soustředit na buněčné a molekulární procesy za fyziologických podmínek. Shrnout časový průběh tohoto procesu a jako doplněk uvést příčiny a důsledky některé z vývojových poruch osifikace. Zhotovit vlastní mikroskopickou fotodokumentaci chondrogenní osifikace z komerčních embryonálních preparátů a na tomto materiálu, případně publikovaných obrazových mikroskopických dokumentech, provést základní morfometrickou a statistickou analýzu tohoto procesu Požadavky. Zpracovat základní údaje týkající se zadaného tématu z českých a zahraničních monografií učebnicového typu. Přehledový materiál doplnit o novějších údaje z původních domácích a zahraničních primárních časopiseckých prací. Pasivní znalost angličtiny.Znalost práce s webovými biologickými databázemi a základními PC programy, vč. Analýzy obrazu (úvodní školení zajištěno). Mikroskopickou dokumentaci je vhodné uskutečnit do konce roku 2009. Vedoucí práce: Doc. Vlad. Mareš, v.r.
ANOTACE BAKALÁŘSKÉ PRÁCE pro kombinované studium biologie Buněčná stavba tukové tkáně, její časná cytogeneze a vztah ke vzniku obezity Cíl. Formou přehledového článku shrnout starší a nové poznatky o buněčné stavbě tukové tkáně a jejím chemickém složení, časné vývojové cytogenezi adipocytů a jejího vtahu ke vzniku obezity. Přehled doprovodit základní mikroskopickou fotodokumentaci tukové tkáně zhotovené z komerčních histologických preparátů a provést základní morfometrickou a statistickou analýzu tohoto materiálu.
strana 12 / 19
Katedra biologie PřF UJEP Nabídka témat závěrečných prací
Požadavky. Zpracovat starší údaje týkající se zadaného tématu z českých a zahraničních monografií učebnicového typu. Přehledový materiál doplnit novějších údaji z původních domácích a zahraničních časopiseckých prací. Zvládnout digitální mikroskopickou dokumentaci a základy počítačové morfometrické analýzy mikroskopických obrazů. Pasivní znalost angličtiny a práce s obrazovou analýzou. Školení v užití webových biologických databází a analýzy obrazu bude zajištěno v úvodem. Mikroskopickou dokumentaci je třeba uskutečnit do konce roku 2009 Vedoucí práce: Doc. Vlad. Mareš, v.r.
ANOTACE BAKALÁŘSKÉ PRÁCE pro kombinované studium biologie Humorální funkce tukové tkáně Cíl. Formou přehledového článku stručně shrnout starší poznatky o funkci tukové tkáně v organizmu a podrobně rozvést sekreci bioaktivních peptidů- adipokinů- a jejich dopad na celotělové funkce za fyziologických podmínek a při vzniku vybraných poruch metabolismu, příjmu potravy, funkci kardiovaskulárního aparátu apod. Požadavky. Zpracovat základní údaje týkající se zadaného tématu z českých a zahraničních monografií učebnicového typu a primárních časopiseckých zdrojů. Pasivní znalost angličtiny nezbytná. Podmínkou úspěšná zkouška z Obecné Zoologie a Fyziologie živočichů a člověka. Znalost práce s webovými biologickými a zdravotnickými databázemi (zaškolení bude zajištěno). Vedoucí práce: Doc. Vlad. Mareš, v.r.
strana 13 / 19
Katedra biologie PřF UJEP Nabídka témat závěrečných prací
RNDr. Lenka Němcová, CSc. Floristická studie mechorostů vybraného území The bryofloristic study of the selected territory Bryofloristické studie jsou důležitým přínosem pro poznání celkového rozšíření mechorostů (včetně nastalých změn) na území České republiky. Cílem práce je zhodnotit bryoflóru vybraného území z hlediska historického a současného stavu, charakterizovat nejvýznamnější biotopy a vybrat lokality nejhodnotnější z hlediska ochrany přírody. Součástí práce je rešerše dostupných pramenů o přírodních poměrech studovaného území. Dále budou z regionální floristické literatury excerpovány dostupné údaje o výskytu mechorostů. Bude proveden podrobný terénní průzkum území tak, aby všechny významnější lokality a biotopy byly navštíveny vícekrát, nejlépe v různých obdobích vegetační sezóny. Přitom bude zaznamenáván výskyt všech druhů mechorostů a budou sbírány doklady pro herbář, který je nezbytnou součástí diplomové práce. Poznámka: Studované území se zpravidla vybírá v blízkosti bydliště diplomanta. Toto téma si může zvolit více studentů v ročníku - jednotlivé práce se budou lišit volbou různých území. Téma je vhodné pro studenty 2. i 3. stupně. Spektrum hub na venkovních plochách katedry biologie PřF UJEP The occurrence of Fungi in the outdoor places at the surrounding of the Department of Biology Faculty of Science UJEP Úkolem je sledování výskytu veškerých druhů hub (parazitických, saprofytických i mykorhizních) během celé vegetační sezóny na zahradě katedry biologie. Oproti floristické studii, kde je možno zaznamenávat i rostliny ve sterilním stavu, zde je výzkum striktně vázán na období tvorby fruktifikačních stádií. Je proto nutné navštěvovat lokalitu během sezóny alespoň jedenkrát za dva týdny. Přitom budou sbírány doklady pro herbář, který je nedílnou součástí DP. Výsledkem bude zhodnocení mykoflóry tohoto území a vyhledání didakticky nejvhodnějších objektů pro demonstraci představitelů jednotlivých skupin hub. Téma je vhodné pro studenta 3. stupně. Sledování epifytických mechorostů na vybraném území The monitoring of the epiphytic Bryophytes in the selected territory V posledních letech dochází k opětovnému šíření epifytických druhů mechorostů i v oblastech, kde se díky silnému imisnímu zatížení v minulých desetiletích téměř nevyskytovaly. Proto je nutné jejich šíření nadále dlouhodobě sledovat. Znalosti o autekologii konkrétních druhů jsou většinou jen útržkovité a nekompletní. V mnoha případech není ani zcela jasná příčina jejich ústupu z přírody. Cílem diplomové práce je vytipování vhodných substrátů a sledování výskytu kortikolních mechorostů na vybraném území. Výskyt mechorostů bude dokumentován v podobě herbářových položek a zároveň studována jejich autekologie, tedy ekologické aspekty na úrovni jedince zahrnující získání přesných informací o způsobech rozmnožování (vegetativní, generativní), preferenci substrátu
strana 14 / 19
Katedra biologie PřF UJEP Nabídka témat závěrečných prací
(zhodnoceni, zda druhy preferují stejné dřeviny jako v dobách minulých nebo zda se spektrum dřevin výrazně mění), nárocích na stanoviště, doprovodných druzích. Poznámka: Studované území se zpravidla vybírá v blízkosti bydliště diplomanta. Toto téma si může zvolit více studentů v ročníku - jednotlivé práce se budou lišit volbou různých území. Téma je vhodné spíše pro studenty 3. stupně. Aktuální rozšíření mechu Pleurochaete squarrosa (Brid.) Lindb. v severozápadních Čechách V posledních letech dochází ke změnám ve flóře a vegetaci mechorostů, zejména v oblastech, které byly v minulosti vystaveny silnému imisnímu zatížení. Je nutné tyto změny v současnosti intenzívně sledovat. Znalosti o autekologii konkrétních druhů jsou většinou jen útržkovité a nekompletní. V mnoha případech není ani zcela jasná příčina ústupu těchto druhů z přírody. Cílem diplomové práce je jednak porovnat historické údaje s aktuálním výskytem druhu Pleurochaete squarrosa, který je hodnocen jako blízký ohrožení. Kromě toho je úkolem práce získání přesných informací o způsobech rozmnožování (vegetativní, generativní), životních strategií a dalších autekologických charakteristikách (např. sezónní dynamika, přečkávání nepříznivých klimatických period, schopnost šíření, citlivost k negativním faktorům prostředí, konkurenční schopnost atd.). Volné téma Je dána možnost studentům, kteří mají hlubší zájem o určitou problematiku a jistou představu, jaké téma z Fylogeneze a systému nižších rostlin nebo Didaktiky biologie by chtěli zpracovávat, aby si zvolili vlastní téma diplomové práce. Konkrétní obsah a forma bude konzultována s vyučující. Tato nabídka platí pro studenty 2. i 3. stupně.
Bakalářské práce Témata stejná, ale práce bude pojata stručněji, bude zvoleno pro výzkum menší uzemí a počítá se s tím, že terénní práce budou probíhat po jednu vegetační sezónu.
strana 15 / 19
Katedra biologie PřF UJEP Nabídka témat závěrečných prací
Mgr. Kateřina Řeháková Diplomové práce (pro studenty se zaměřením na učitelství): Interaktivní PC program pro výuku tematického celku „BUŇKA“ na SŠ. The interactive PC programme for the education unit „THE CELL“ used on a secondary school. Náměty a realizace přírodopisných exkurzí v lokalitách Ústí nad Labem dostupných MHD.The topics and executions of a biological field days in localities of Ústí nad Labem available by an urban mass transportaion. (LZE APLIKOVAT I NA JINÉ LOKALITY!) „Interakce mezi organismy“ – projektové vyučování na SŠ. „The organism interactions “ – the project education on a secondary school.
Diplomové práce (výzkumné): Biologie a životní cyklus pavouka druhu Nigma walckenaeri (Roewer 1951). The biology and the life cycle of the spider order Nigma walckenaeri (Roewer 1951). Variabilita stanoviště pavouka druhu Meta menardi (Latreille 1804). The variability of Meta menardi (Latreille 1804) habitat.
Bakalářské práce (pro studenty se zaměřením na vyučování): Predace – zpracování ekologického tématu pro výuku na základní škole. The predation - the theme processing for an education on a primary school. Mutualismus - zpracování ekologického tématu pro výuku na základní škole. The mutualism – the theme processing for an education on a primary school. Sociální hmyz - zpracování tématu pro výuku na základní škole. The social insect - the theme processing for an education on a primary school.
Bakalářské práce (rešeršní): Evoluční aspekty a souvislost funkce a struktury kruhovitých pavučinu taxonu Araneoidae. The evolution aspects and the relation to function and structure of Araneoidae orb-webs. Strategie lovu potravy u taxonu Araneoidea . The prey capture strategy of Araneoidea. Zámotky, jejich umístění na síti a přidružené chování samic u taxonu Araneoidae. Cocoons, their web placements and related female behavior of araneoidae. Sociální pavouci (řád Araneae). The social spiders (Araneae).
strana 16 / 19
Katedra biologie PřF UJEP Nabídka témat závěrečných prací
Bakalářské (rešeršní) a navazující magisterské (výzkumné) práce: Preference domácích mazlíčků u různých skupin lidí. Metody výzkumu agresivity u lidí a jejich aplikace. (Bc.) Preference divokých/domestikovaných forem živočichů lidmi v závislosti na míře jejich agresivity. (Mgr.)
strana 17 / 19
Katedra biologie PřF UJEP Nabídka témat závěrečných prací
Mgr. Marcel Štofik Diplomové práce Od studenta se vyžaduje zájem o danou problematiku, samostatnost a schopnost pracovat v laboratorních podmínkách. Konstrukce mikrofluidního systému pro použití v bioanalýze Diplomová práce má experimentální charakter. Cílem práce je konstrukce mikroofluidní cely, kterou bude možné použít v imunostanoveních. Student se seznámí se základními postupy (soft litografie a fotolitografie) pro přípravu mikrofluidních systémů. Hlavním úkolem bude optimalizovat podmínky přípravy mikrofluidních systémů pomocí fotolitografie v prostředí Laboratoře biosenzorů Katedry biologie PřF. Mikrofluidní detekční systém pro imunostanovení Diplomová práce má experimentální charakter. Cílem práce je optimalizace parametrů mikrofluidního detekčního systému. Student se zaměří na detekci nanokompozitních biokonjugátů, které budou použity jako detekční značky v imunostanoveních. Výsledky detekce budou srovnávány s parametry imunostanovení za použití těchto značek. Získaná data mohou být srovnávána s imunostanoveními pomocí ELISA testů.
Bakalářské práce Cílem bakalářských prací bude vypracování uceleného přehledu zadaného tématu do podoby tzv. review. Hlavní činností studenta bude rešeršní práce. Student bude pracovat samostatně s dostupnými primárními literárními zdroji s využitím informačních systémů dostupných na naší univerzitě. Předpokládá se samostatná práce s cizojazyčnou literaturou. Témata budou zaměřena na oblast biosenzorů, bioanalytických detekčních metod, imobilizačních postupů pro biorekogniční prvky a mikrofluidních systémů v oblasti biologických věd. Příklady témat: Použití mikrofluidních systémů v biologickém výzkumu Imobilizace biomolekul prostřednictvím sol-gel materiálů Nové analytické postupy a detekční značky pro imunostanovení
strana 18 / 19
Katedra biologie PřF UJEP Nabídka témat závěrečných prací
Mgr. Karina Šondová, Ph.D. Diplomové práce Výskyt a prevalence škrkavky psí (Toxocara canis) v okolí pískovišť a dětských hřišť (The occurrence and prevalence of Toxocara canis on sandpits and surroundings) Škrkavka psí (Toxocara canis) je významným střevním parazitem psů, kterým se může nakazit i člověk a prodělat onemocnění nazývané larvální toxokaróza. Cílem diplomové práce je odběr a následné koprologické vyšetření vzorků trusu psů (pomocí tzv. flotační metody) z vybraných lokalit, kde se často pohybují děti (pískoviště, dětská hřiště, atd.). Cílem bude rovněž vyhodnocení prevalence výskytu Toxocara canis a vyhodnocení potenciálního rizika humánní nákazy larvální toxokarózou. Diplomová práce bude rovněž doplněna o vlastní analýzu a zhodnocení parazitární léčby (odčervení psů). Sledování výskytu a sezónní dynamiky střevních parazitů psů (Canis familiaris) (The monitoring of the occurence and seasonal dynamic of intestinal parasites of dogs) Cílem diplomové práce je získání vzorků trusů psů za účelem koprologického vyšetření pomocí flotační metody na diagnostiku vývojových stadií parazitů, především helmintů. Za tímto účelem je třeba kontaktovat veterinární ordinace, útulky či zájmové chovy psů. Cílem je především sledovat výskyt parazitů v rámci sezónního výskytu po celý rok a následně adekvátními statistickými metodami vyhodnotit prevalenci výskytu střevních parazitů psů v jednotlivých ročních obdobích. Diplomová práce bude rovněž doplněna o porovnání výskytu střevních parazitů u štěňat a dospělých psů. Toxoplazmóza (Toxoplasma gondii) – současná problematika, diagnostika a léčba (Toxoplasmosis – current problems, diagnosis and treatment) Toxoplazmóza (Toxoplasma gondii) je onemocnění, které se řadí mezi zoonózy, což jsou nákazy přenosné ze zvířat na člověka. K nákaze je vnímavá celá řada volně žijících i doma chovaných zvířat, která se mohou stát zdrojem onemocnění člověka. V České republice se séropozitivita (přítomnost protilátek v krvi) pohybuje kolem 20 40%. Cílem diplomové práce je shrnout současnou problematiku a znalosti toxoplazmózy, spolupracovat s příslušnými hygienickými stanicemi či nemocnicemi v rámci České republiky, zaměřit se na onemocnění jako zoonózu a zmapovat možnosti diagnostiky a léčby především u imunodeficitních pacientů.
strana 19 / 19