První testový úkol – aminokyseliny a jejich vlastnosti Vysvětlete co znamená pojem α-aminokyselina Jaký je rozdíl mezi D a L řadou aminokyselin Kolik je základních stavebních aminokyselin a z čeho jsou odvozeny Napište vzorec libovolné D a L aminokyseliny Jaké je názvosloví aminokyselin a jak se tvoří Vysvětlete co značí triviální název Které aminokyseliny obsahují ve své molekule síru Které aminokyseliny obsahují ve své molekule aromatický kruh Jaké jsou nejdůležitější fyzikální vlastnosti aminokyselin Popište amfoterní charakter aminokyselin Vysvětlete pojem izoelektrický bod Na čem závisí hodnota pH izoelektického bodu Napište obecnou rovnici reakce aminokyseliny v kyselém prostředí Napište obecnou rovnici reakce aminokyseliny v zásadité prostředí Vysvětlete co jsou α, β, γ, δ a ε aminokyseliny, obecně popište jejich strukturu Popište rovnicí reakci aminokyseliny s kyselinou a se zásadou Co vzniká kondenzací aminokyselin Napište vznik peptidické vazby Co jsou esenciální aminokyseliny Popište eukaryotickou a prokaryotickou buňku Napište disociační konstanty aminokyselin v kyselém a zásaditém prostředí Napište vztah pro výpočet hodnoty pI K čemu se používá ninhydrin K čemu slouží Ellmanovo činidlo Jaké znáte další biologicky významné aminokyseliny Co znamená označení oligopeptid, polypeptid Napište rovnici disociace leucinu Hodnota pKa1 glycinu je 2.34 a pKa2 9.60. Určete hodnoty disociačnícho konstant a izoelektrický bod Proč není glycin opticky aktivní, a ostatní aminokyseliny ano Jak jsou v přírodě rozšířeny D a L-aminokyseliny
Napište pomocí zkrate a pomocí vzorců všechny možné tripeptidy tvořené L-alaninem, Lserinem, a L-prolinem, pojmenujte je Jakým způsobem se spolu vážou dvě molekuly glutathionu (γ-glutamylcysteinylglycin). Jaký to má biologický význam Napište rovnice disociace aparagové kyseliny a asparaginu a vyjádřete z nich disociační konstanty. Rozpustí-li se tyto látky ve vodě na roztoky stejných koncentrací, který bude zásaditější Porovnejte helikální strukturu a strukturu skládaného listu proteinu Jaký je rozdíl mezi vratnou a nevratnou denaturací proteinu Co jsou to molekulové chaperony Vysvětlete co je terciární a kvartérní struktura proteinů Vysvětlete princip biuretové reakce, napište rovnici vzniku biuretu Popište xanthoproteinovou reakci, napište základní rovnici Vysvětlete kyselou a alkalickou hydrolýzu aminokyselin Jak se určí primární sekvence proteinu Co je izoelektrická fokusace Popište postup při metodě ELISA Co jsou imunochemické metody Jaký je princip syntézy oligopeptidů
Druhý testový úkol vitamíny, koenzymy a nukleové kyseliny (základní znalosti) 1. Co jsou histony a kde je najdete 2. Charakterizujete nukleoproteiny, lipoproteiny, metaloproteiny, chrromoproteiny a glykoproteiny 3. Jaký mají nukleové kyseliny význam 4. Jaké je hlavní rozdělení NK 5. Popište primární strukturu NK 6. Popište složení nukleotidů DNA a RNA 7. Jaký je rozdíl mezi nukleotidem a nukleosidem 8. Charakterizujte sekundární strukturu DNA 9. Jaké další vazby se uplatňují ve stabilizaci dvoušroubovice DNA 10. Jaké znáte konformace DNA a v za jakých podmínek se vyskytují 11. Jaké jsou rozdíly mezi DNA a RNA 12. Charakterizujte různé RNA (mRNA, rRNA, tRNA) 13. K čemu slouží polymeráza 14. Jaký je rozdíl mezi DNA a RNA polymerázou 15. K čemu jsou dobré enzymy 16. Co je kofaktor, charakterizujte prosthetickou skupinu a koenzym 17. Co je holoenzym a apoenzmy 18. Mohou být kofaktory kovy, kam se váží 19. Jaké znáte podmínky enzymové aktivity 20. Charakterizujte koenzym, vyberte si 4 koenzymy a popište přenášenou skupinu 21. Co jsou vitaminy 22. Jaká je biochemická funkce vitamínů 23. Charakterizujte vitamíny rozpustné v tucích, jejich fyziologický význam a místo v metabolizmu 24. Charakterizujte vitamíny rozpustné ve vodě, jejich fyziologický význam a místo v metabolizmu 25. Nikotinamidové koenzymy, popište chemickou strukturu a význam v organizmu 26. Flavinové koenzymy, popište chemickou strukturu a význam v organizmu 27. Čím se liší enzymy od běžných katalyzátorů. Vyvoďte srovnání s průmyslovým katalyzátorem a enzymem
28. Jaké koenzymy se uplatňují u enzymů, které katalyzují oxidačně-redukční děje 29. Co je to glutathion a jaké je jeho role v oxidačně-redukčních dějích. Který enzym je důležitý pro jeho obnovu. 30. Co znamená denaturace a renaturace DNA, jak docílíte zpětné renaturace. 31. K čemu slouží ethidum bromid 32. Popište princip sekvencování NK 33. Co je PCR a k čemu se využívá 34. Co jsou cytochromy, kde je najdete
Třetí testový úkol – principy vybraných technik používaných v biologii (základní znalosti) 1. Vysvětlete co je chromatografie 2. Popište rozdíly mezi jednotlivými druhy chromatografických technik (papírová, vysoko tlaká, nízko tlaká, plynová) 3. Stanovení obsahu aminokyselin (kyselá a alkalická hydrolýza) 4. Určení sekvence proteinů (fragmentace, uspořádaní fragmentů) 5. Barevné reakce proteinů (Biuretova, Xanthoproteininová, Paulyho, Sakaguchiho reakce) 6. Důkaz síry v proteinech 7. Využití hmotové spektrometrie pro stanovení proteinů 8. Principy imunochemických metod, ELISA 9. Syntéze polypeptidů 10. Princip Fehlingovy reakce 11. Rozdělení lipoproteinů (VLDL, IDL, LDL, HDL) 12. Obecný princip centrifugace (otáčky, zrychlení) 13. Jakým způsobem budete studovat enzymovou kinetiku 14. Princip elektroforézy nukleových kyselin 15. Princip elektroforézy proteinů 16. Typy gelů pro analýzu NK a proteinů 17. Metody barvení gelů
18. Southernův přenos NK 19. Co jsou sondy, jak mohou být značené 20. Co je restrikční štěpení NK 21. Sekvenace NK (chemické štěpení, metoda terminace řetězce) 22. Syntéza oligonukleotidů 23. PCR 24. Co jsou adsorpční spektra, princip spektrometru 25. Vlnové délky důležité pro práci s biologickými systémy 26. Jak můžete pomocí spektrálních metod určit koncentraci NK a proteinů 27. Popište absorpční spektra chlorofylů a karotenoidů 28. Popište přípravu biologického vzorku (homogenizace, extrakce) 29. Mrazová sublimace (lyofilizace) 30. Princip refraktometrie a polarimetrie 31. K čemu se v biologii používají pufry, popište jejich přípravu 32. Izoelektrická fokusace 33. Kapilární elektroforéza 34. Izotachoforéza
