Laboratorní příručka Oddělení lékařské mikrobiologie
A – Obsah B - Informace o laboratoři ............................................................................................................................................................. 3 1. Identifikace laboratoře a důležité údaje ................................................................................................................................ 3 2. Podmínky převzetí vzorku v mikrobiologické laboratoři ........................................................................................................ 4 3. Kritéria pro přijetí/odmítnutí vzorků ..................................................................................................................................... 4 4. Postup při chybné identifikaci pacienta na průvodním listu .................................................................................................. 5 5. Zásady práce s biologickým materiálem, bezpečnost práce................................................................................................... 5 6. Hlášení nálezů významných patogenů ................................................................................................................................... 5 C - Bakteriologie: informace o vyšetřeních ................................................................................................................................... 6 1. Obecné zásady odběru vzorků na bakteriologické vyšetření ................................................................................................. 6 2. Legenda k tabulkám............................................................................................................................................................... 7 3. Bakteriologie.......................................................................................................................................................................... 8
Horní cesty dýchací .................................................................................................................................................................................. 8 Dolní cesty dýchací ................................................................................................................................................................................ 10 Ucho ............................................................................................................................................................................................................. 11 Oko ............................................................................................................................................................................................................... 12 Zažívací ústrojí ........................................................................................................................................................................................ 13 Močové ústrojí ......................................................................................................................................................................................... 15 1
Pohlavní ústrojí muže ........................................................................................................................................................................... 17 Pohlavní ústrojí ženy ............................................................................................................................................................................. 18 Kůže a tkáně ............................................................................................................................................................................................. 20 Rány a hluboké defekty........................................................................................................................................................................ 20 Hnis a obsah patologických dutin..................................................................................................................................................... 21 Primárně sterilní tělesné tekutiny.................................................................................................................................................... 22 Centrální nervový systém .................................................................................................................................................................... 23 Krev (hemokultura) ............................................................................................................................................................................... 24 Cizorodý materiál (cévní katétry, drény, shunty, implantáty, elektrody,…) ................................................................... 25 Další poskytované služby OLM .......................................................................................................................................................... 25 D - Sérologie – informace o vyšetřeních...................................................................................................................................... 26 1. Legenda k tabulkám............................................................................................................................................................. 26 2. Sérologie - tabulky............................................................................................................................................................... 26 E - Vyšetření zajišťovaná nebo konfirmovaná v jiných laboratořích ........................................................................................... 32
2
B - Informace o laboratoři
1. Identifikace laboratoře a důležité údaje Název laboratoře: Předmět činnosti: Okruh působnosti:
Oddělení lékařské mikrobiologie Vsetínská nemocnice a.s. Laboratorní vyšetření v lékařské mikrobiologii Poskytování služby pro ambulantní a lůžková zdravotnická zařízení
Adresa:
Nemocnice Vsetín Nemocniční 955 755 32 Vsetín
Pracovní tým Vedoucí oddělení: Vysokoškoláci:
Vedoucí laborantka:
Provoz Příjem materiálu:
RNDr. Anna Sekáčová Mgr. Andrea Baranová Ing. Jitka Macečková
telefon 571 490 280 / 737 251 969 571 490 283 571 490 283
Dana Vojtášková
571 490 282
pondělí – pátek sobota neděle a svátky pondělí – pátek sobota neděle a svátky pondělí - pátek
provozní doba 6.00-15.30 6.00-13.00 6.00-11.30 6.00-16.00 6.00-14.30 6.00-12.30 10.00-15.00
dny
Provozní doba laboratoře:
Antibiotické středisko: (pro nemocnici i externí klientelu) Výsledky vyšetření, konzultace: Příjem vzorků, expedice výsledků: Sérologická laboratoř:
571 490 285 571 490 284
3
Antibiotické středisko (konzultační služba):
571 490 280
2. Podmínky převzetí vzorku v mikrobiologické laboratoři validní vzorek biologického materiálu dodržení zásad odběru, transportu a uchovávání vzorku, dodržení časových parametrů označení vzorku odpovídající dokumentace s čitelnými údaji (průvodní list k materiálu) - jméno a příjmení - rodné číslo - kód pojišťovny - požadované vyšetření, event. požadavky na cílenou kultivaci - druh vzorku a lokalizace odběru - odpovídající klinická diagnóza k požadovanému vyšetření - ATB léčba - datum odběru vzorku - čas odběru (u hemokultur, mozkomíšního moku, moči, sputa, aspirátu, ...) - razítko odesílatele (IČZ pracoviště, jméno lékaře) označení vzorku (čitelné údaje na štítku odběrové soupravy, které souhlasí s údaji v dokumentaci) - jméno a příjmení - rodné číslo - druh vzorku Špatné nebo scházející údaje negativně ovlivňují kvalitu mikrobiologického vyšetření. V jeho průběhu provádí mikrobiolog diferenciálně diagnostickou rozvahu, při které se řídí druhem materiálu, diagnózou, lokalizací infekčního procesu, antibiotickou terapií a kultivačním nálezem.
3. Kritéria pro přijetí/odmítnutí vzorků Přijaty ke zpracování budou vždy jen správně odebrané, viditelně nepoškozené a řádně označené vzorky, dodané s vyplněným průvodním listem. Odmítnout lze vzorek v následujících případech: není-li možná jednoznačná identifikace vzorku, neoznačená odběrová souprava chybí-li nebo jsou nečitelné základní údaje o pacientovi pokud je zřejmá kontaminace vzorku 4
špatně zvolená odběrová a transportní souprava žádanka nebo odběrová souprava znečištěná biologickým materiálem Odmítnutí vzorků je neprodleně telefonicky oznámeno odesílajícímu žadateli. Vzorky jinak poškozené (např. hemolytické sérum) jsou podle možnosti zpracovány. V komentáři k nálezu je uvedeno upozornění na možnost ovlivnění výsledku. 4. Postup při chybné identifikaci pacienta na průvodním listu Je-li chybně identifikován pacient na průvodním listu postupuje se následovně: Chybné rodné číslo, jméno pacienta, pojišťovna, odbornost žadatele - telefonicky je ověřena správnost uvedených údajů a laboratoř provede opravu chybného údaje. Není-li k dispozici údaj o odesílajícím oddělení, razítko a podpis lékaře - odesílatel je telefonicky upozorněn a je vyžádána správně vyplněná žádanka. 5. Zásady práce s biologickým materiálem, bezpečnost práce Každý vzorek biologického materiálu je považován za potenciálně infekční. Při transportu a manipulaci se vzorky je třeba se řídit bezpečnostními aspekty (viz Vyhláška MZ č. 440/2000 Sb.). K přepravě používat uzavřené transportní nádoby. Ochrana vzorků před znehodnocením a kontaminací povrchu odběrových souprav i dokumentace (důvod k odmítnutí vzorku). V případě rozlití vzorku je třeba se řídit platnými zásadami dezinfekce a dekontaminace. 6. Hlášení nálezů významných patogenů Hlášení nálezů patogenů potvrzujících infekční etiologii onemocnění je prováděno podle Vyhlášky č.195/2005
5
C - Bakteriologie: informace o vyšetřeních Zásady odběru, transportu, uchovávání vzorku před dodáním do laboratoře.
1. Obecné zásady odběru vzorků na bakteriologické vyšetření
doba odběru: odběr je nutné vhodně načasovat z hlediska patofyziologického průběhu infekčního procesu optimální je odběr před zahájením ATB léčby místo odběru: typická část biologického materiálu způsob odběru: odběr musí být proveden asepticky, nutná přesná identifikace vzorku a jeho lokalizace uchovávání: není-li možný okamžitý transport do laboratoře, nutné dodržování parametrů (viz tabulky) transport: viz podmínky transportu v tabulkách odběrové soupravy s transportní půdou: umožňují přežití většiny citlivých a kultivačně náročných bakterií odběrové soupravy: OS- mycoplasma, OS-chlamydia, hemokultivační lahvičky BACTEC - vydádá OLM
6
2. Legenda k tabulkám odběr adjustace
stručný popis získání vzorku biologického materiálu popis odběrového materiálu
t-TPA tampon d-TPA tampon kontejner anaer. S sterilní zkumavka OS-mycoplasma OS-chlamydia BACTEC+Aerobic BACTEC+Anaerobic BACTEC PEDS+ URICULT
sterilní tampon na tyčince ve zkumavce s transportní půdou podle Amiese sterilní tampon na drátě ve zkumavce s transportní půdou podle Amiese sterilní kontejner z umělé hmoty se šroubovacím víčkem ("sputovky") jednorázová sterilní injekční stříkačka (5 ml) s nasazenou jehlou zapíchnutou do sterilní gumové zátky uzavřená sterilní zkumavka z umělé hmoty s uzávěrem odběrová souprava pro vyšetření urogenitálních mykoplasmat odběrová souprava pro vyšetření Chlamydia trachomatis aerobní hemokultivační lahvička anaerobní hemokultivační lahvička pediatrická hemokultivační lahvička odběrová a kultivační souprava (obsahuje sterilní odběrovou nádobku a nosič s kultivačními půdami)
uchovávání
způsob uchovávání vzorku před transportem při dodržení doporučené teploty (pouze není-li možný okamžitý transport) podmínky transportu (maximální doba přepravy vzorku při dodržení doporučené teploty) Č (čas): maximální doba transportu (h – hodiny, m – minuty) T (teplota): pt – pokojová teplota (15-25°C), cht – chladničková teplota (2-8°C)
transport
časová odezva
průměrný časový interval pro sdělení pozitivního výsledku od dodání do laboratoře (t – týdny, d – dny, h – hodiny, m – minuty)
7
3. Bakteriologie
Horní cesty dýchací
Vyšetření Základní mikrobiologické vyšetření výtěru z krku
odběr výtěr z krku (patrové oblouky, tonzily, hltan)
adjustace t-TPA tampon
uchovávání Č: 24 h T: pt
transport Č: 2 h T: pt
časová odezva 2-4 d
Základní mikrobiologické vyšetření klinického materiálu z paranazálních dutin Cílený kultivační průkaz Arcanobacterium haemolyticum z výtěru z krku Cílený kultivační průkaz Neisseria gonorrhoeae z výtěru z krku Průkaz Neisseria meningitidis, Bordetella sp., Haemophilus influenzae b
tekutina získaná punkcí nebo odsátím z paranazální dutiny
anaer. S
Č: 24 h T: pt
Č: 2 h T: pt
2-6 d
kontejner
Č: 4 h T: pt Č: 24 h T: pt
Č: 2 h T: pt Č: 2 h T: pt
výtěr z krku (patrové oblouky, tonzily, hltan)
t-TPA tampon
výtěr z krku (patrové oblouky, tonzily, hltan)
t-TPA tampon
Č: 24 h T: pt
výtěr z nosohltanu
d-TPA tampon
nedoporučuje se
výtěr z hrtanu
komentář
2-4 d
Požadavek je nutné vyznačit do průvodního listu.
Č: 2 h T: pt
2-4 d
Požadavek je nutné vyznačit do průvodního listu.
Č: 2 h T: pt
2-5 d
Požadavek je nutné vyznačit do průvodního listu. Průkaz Bordetella sp. po předchozí domluvě s laboratoří !
8
Cílený kultivační průkaz nosičství Staphylococcus aureus z výtěru z krku a z nosu vč. MRSA Průkaz patogenních korynebakterií
výtěr z krku (patrové oblouky, tonzily, hltan) výtěr z nosu
t-TPA tampon
Č: 24 h T: pt
Č: 2 h T: pt
2-4 d
Požadavek je nutné vyznačit do průvodního listu.
výtěr z krku (patrové oblouky, tonzily, hltan)
t-TPA tampon
Č: 24 h T: pt
Č: 2 h T: pt
2-4 d
Požadavek je nutné vyznačit do průvodního listu.
Průkaz Candida sp. a plísní
výtěr z krku výtěr z nosu
t-TPA tampon
Č: 24 h T: pt
Č: 2 h T: pt
2-7-14 d
Požadavek je nutné vyznačit do průvodního listu.
Kultivační vyšetření pro surveillance v intenzivní péči
výtěr z krku (patrové oblouky, tonzily, hltan) hluboký výtěr z nosu, výtěr z úst
t-TPA tampon
Č: 24 h T: pt
Č: 2 h T: pt
2-4 d
9
Dolní cesty dýchací Vyšetření Základní mikrobiologické vyšetření sputa Základní mikrobiologické vyšetření endotracheálního aspirátu Základní mikrobiologické vyšetření bronchiálního aspirátu Základní mikrobiologické vyšetření bronchoalveolární laváže Základní mikrobiologické vyšetření výtěru z tracheostomie Mikroskopický průkaz acidorezistentních bakterií Kultivační průkaz mykobakterií
odběr sputum získané vykašláním (pod dohledem odborného personálu) endotracheální aspirát získaný odsátím z inkubace nebo tracheostomie
adjustace kontejner
uchovávání Č: 24 h T: cht
transport Č: 2 h T: pt
časová odezva 2-4 d
kontejner
Č: 24 h T: cht
Č: 2 h T: pt
2-4 d
aspirát z bronchů získaný bronchoskopicky
kontejner
Č: 24 h T: cht
Č: 2 h T: pt
2-4 d
BAL
kontejner
Č: 24 h T: cht
Č: 2 h T: pt
2-4 d
výtěr z tracheostomie
t-TPA tampon
Č: 24 h T: cht
Č: 2 h T: pt
2-4 d
sekret z dolních cest dýchacích
kontejner
Č: 24 h T: cht
Č: 2 h T: pt
48 h (příp.dle dohody statim)
komentář U těžkých pneumonií odebrat současně hemokultury.
Požadavek je nutné vyznačit do průvodního listu.
3-6-9 t
10
Ucho Vyšetření Základní mikrobiologické vyšetření výtěru ze zevního zvukovodu
odběr výtěr ze zevního zvukovodu
adjustace t-TPA tampon
uchovávání Č: 24 h T: pt
transport Č: 2 h T: pt
časová odezva 2-4 d
Základní mikrobiologické vyšetření klinického materiálu ze středního ucha
tekutina ze středouší získaná punkcí nebo po paracentéze, zachycená asepticky na tampon
d-TPA tampon
Č: 24 h T: pt
Č: 2 h T: pt
2-4 d
komentář Požadavek cíleného kultivačního průkazu mykotických agens je nutné vyznačit do průvodního listu, u mykotických agens časová odezva až 14 dnů.
11
Oko Vyšetření Základní mikrobiologické vyšetření výtěru ze spojivkového vaku
odběr výtěr ze spojivkového vaku
adjustace t-TPA tampon
uchovávání Č: 24 h T: pt
transport Č: 2 h T: pt
časová odezva 2-4 d
Základní mikrobiologické vyšetření výtěru z rohovkového vředu
výtěr z rohovkového vředu
t-TPA tampon
Č: 24 h T: pt
Č: 2 h T: pt
2-4 d
Průkaz Chlamydia trachomatis ve výtěru ze spojivkového vaku enzymovou imunoanalýzou
razantní výtěr ze spojivkového vaku se zachycením epiteliálních buněk
OS-chlamydia
Č: 24 h T: cht
Č: 2 h T: pt
7-14 d (příp.dle dohody)
Základní mikrobiologické vyšetření klinického materiálu z nitroočního prostoru
tekutina z nitroočního prostoru získaná punkcí nebo peroperačně
anaer. S
Č: 24 h T: pt
Č: 2 h T: pt
2-6 d
komentář
t-TPA tampon
12
Zažívací ústrojí Vyšetření Základní kultivační vyšetření stolice (průkaz Salmonella sp., Shigella sp., enteropatogenní E.coli,…) Cílený kultivační průkaz Escherichia coli O157 ze stolice Cílený kultivační průkaz Campylobacter sp. ze stolice Cílený kultivační průkaz Yersinia sp. ze stolice Průkaz toxinu A,B Clostridium difficile ve stolici Cílený kultivační průkaz patogenních vibrií ze stolice
Kultivační vyšetření stolice pro surveillance v intenzivní péči
odběr výtěr z rekta
adjustace t-TPA tampon
uchovávání Č: 24 h T: pt
transport Č: 2 h T: pt
časová odezva 2-5 d
komentář Enteropatogenní E.coli vyšetřujeme do 3 let věku automaticky.
výtěr z rekta
t-TPA tampon
Č: 24 h T: pt
Č: 2 h T: pt
2-5 d
výtěr z rekta
t-TPA tampon
Č: 24 h T: pt
Č: 2 h T: pt
3-5 d
výtěr z rekta
t-TPA tampon
Č: 24 h T: pt
Č: 2 h T: pt
2-5 d
stolice
kontejner min. 1-4ml
Č: 24 h T: cht
Č: 2 h T: pt
3-4 h (statim)
výtěr z rekta
t-TPA tampon
Č: 24 h T: pt
Č: 2 h T: pt
2-5 d
Požadavek musí být vyznačen do průvodního listu. Vyšetření se provádí se základním kultivačním vyšetřením stolice! Požadavek musí být vyznačen do průvodního listu Požadavek musí být vyznačen do průvodního listu. Požadavek musí být vyznačen do průvodního listu. Nutné předem informovat laboratoř !
výtěr z rekta
t-TPA tampon
Č: 24 h T: pt
Č: 2 h T: pt
2-5 d
13
anaer S
Č: 24 h T: pt
Č: 2 h T: pt
2-6 d
Pro kultivační průkaz mykotických agens platí časová odezva až 14 d!
Průkaz přítomnosti Rotaviru/Adenoviru
obsah žlučových cest získaný punkcí či aspirací, peroperačně, při ERCP, z drenáže stolice min.1-4 ml
kontejner
Č: do 6 h po odběru T: pt
Č: 2 h T: pt
2-4 h (statim)
Průkaz antigenu Helicobacter pylori
stolice min. 1-4 ml
kontejner
Č: do 72 h T: cht
Č: 2 h T: pt
24-48 h (příp.dle dohody)
Požadavek musí být vyznačen do průvodního listu. Požadavek musí být vyznačen do průvodního listu.
Základní kultivační vyšetření obsahu žlučových cest
14
Močové ústrojí Vyšetření Základní kultivační vyšetření moči
odběr střední proud moči, cévkovaná moč, moč z permanentního katétru, moč z adhezivních dětských sáčků,z arteficielních vývodů,moč získaná suprapubickou punkcí hluboký výtěr z uretry s abrazí buněk epitelu
adjustace kontejner, uzavřená sterilní zkumavka
uchovávání Č: 24 h T: cht
transport Č: 2 h T: pt
časová odezva 2-4 d
d-TPA tampon
Č: 24 h T: pt
Č: 2 h T: pt
2-4 d
Průkaz urogenitálních mykoplasmat z moči
první porce ranní moče
Č: 24 h T: cht
Č: 2 h T: pt
2-4 d
Průkaz urogenitálních mykoplasmat z výtěru z uretry Průkaz Chlamydia trachomatis z výtěru z uretry enzymovou imunoanalýzou Průkaz antigenu Legionella pneumophilla v moči enzymovou imunoanalýzou URICULT
hluboký výtěr z uretry komerční odběrovou soupravou hluboký výtěr z uretry s abrazí buněk epitelu komerční odběrovou soupravou střední proud moči, cévkovaná moč, moč z permanentního katétru
kontejner, uzavřená sterilní zkumavka OS-mycoplasma
Č: 48 nebo 72 h T: pt nebo T: cht
Č: 2 h T: pt
2-4 d
OS-chlamydia
Č: do 7 dnů T: cht
Č: 2 h T: pt
7-14 d (příp.dle dohody)
kontejner, uzavřená sterilní zkumavka
Č: 24 h T: pt
Č: 2 h T: pt
do 24 h (příp. dle dohody)
komerční odběrová souprava URICULT
Č: 24 h T: pt
Č: 2 h T: pt
2-4 d
Základní kultivační vyšetření výtěru z uretry včetně průkazu Neisseria gonorrhoeae
střední proud moči
komentář
Pro mikroskopické vyšetření sekretu z uretry je nutné provést nátěr na podložní sklo jiným tamponem. Požadavek musí být vyznačen do průvodního listu.
Požadavek musí být vyznačen do průvodního listu.
15
Průkaz antigenu Streptococcus pneumoniae v moči imunochromatograficky Průkaz antigenu Legionella pneumophila sérotyp 1 v moči imunochromatograficky
střední proud moči, cévkovaná moč, moč z permanentního katétru
kontejner, uzavřená sterilní zkumavka
Č: 24 h, T: pt
Č: 2h, T: pt
denně
hodnocení pozitivní/negativní
střední proud moči, cévkovaná moč, moč z permanentního katétru
kontejner, uzavřená sterilní zkumavka
Č: 24 h, T: pt
Č: 2h, T: pt
denně
hodnocení pozitivní/negativní
16
Pohlavní ústrojí muže Vyšetření Základní mikrobiologické vyšetření sekretu prostaty, včetně průkazu Neisseria gonorrhoeae Průkaz urogenitálních mykoplasmat v sekretu prostaty Průkaz Chlamydia trachomatis v sekretu prostaty enzymovou imunoanalýzou Základní mikrobiologické vyšetření ejakulátu, včetně průkazu Neisseria gonorrhoeae Průkaz urogenitálních mykoplasmat v ejakulátu
Odběr výtěr z uretry
adjustace t-TPA tampon
uchovávání Č: 24 h T: pt
transport Č: 2 h T: pt
časová odezva 2-4 d
výtěr z uretry
OS-mycoplasma
Č: 48 h nebo 72 h T: pt T: cht
Č: 2 h T: pt
2-4 d
výtěr z uretry
OS-chlamydia
Č: 7d T: cht
Č: 2 h T: pt
7-14 d (příp.dle dohody)
Ejakulát
kontejner
Č: 24 h T: pt
Č: 2 h T: pt
2-4 d
Ejakulát
OS-mycoplasma
Č: 48 h nebo 72 h T: pt T: cht
Č: 2 h T: pt
2-4 d
komentář
17
Pohlavní ústrojí ženy Vyšetření Mikroskopický obraz poševní (MOP) Základní mikrobiologické vyšetření výtěru z pochvy, včetně průkazu Neisseria gonorrhoeae, Gardnerella vaginalis
Průkaz urogenitálních mykoplasmat ve výtěru z pochvy Základní mikrobiologické vyšetření výtěru z děložního hrdla Průkaz urogenitálních mykoplasmat ve výtěru z děložního hrdla Průkaz Chlamydia trachomatis ve výtěru z děložního hrdla Základní mikrobiologické vyšetření sekretu z Bartholiniho žlázy Základní mikrobiologické vyšetření tekutiny z adnex
Odběr poševní sekret rozetřený na podložním skle výtěr z pochvy
adjustace podložní sklo v uzavřené krabičce (po zaschnutí) t-TPA tampon
uchovávání Č: 48 h T: pt
transport Č: 2 h T: pt
Č: 24 h T: pt
Č: 2 h T: pt
výtěr z pochvy
OS-mycoplasma
Č: 48 h nebo 72h T: pt T: cht
Č: 2 h T: pt
2-4 d
výtěr z děložního hrdla
t-TPA tampon
Č: 24 h T: pt
Č: 2 h T: pt
2-4 d
výtěr z děložního hrdla
OS-mycoplasma
Č: 48 h nebo 72h T: pt T:cht
Č: 2 h T: pt
2-4 d
výtěr z děložního hrdla s abrazí buněk epitelu tekutina získaná punkcí
OS-chlamydia
Č: 7 d T: cht
Č: 2 h T: pt
7-14 d (příp. dle dohody)
anaer. S
Č: 24 h T: pt
Č: 2 h T: pt
2-6 d
anaer. S
Č: 24 h T: pt
Č: 2 h T: pt
2-6 d
tekutina z adnex získaná při invazivním výkonu
časová odezva 1-4 d (příp.dle dohody statim) 2-4 d
komentář
18
Základní mikrobiologické vyšetření obsahu dutiny děložní a reziduí (lochie) Základní mikrobiologické vyšetření intrauterinního tělíska Vyšetření GBS – kultivační průkaz Streptococcus agalactiae
aspirát
anaer. S
Č: 24 h T: pt
Č: 2 h T: pt
2-6 d
intrauterinní tělísko
kontejner
nedoporučuje se
Č: 2 h T: pt
7-10 d
výtěr z pochvy
t-TPA tampon
Č: 24 h T: pt
Č: 2 h T: pt
2d
19
Kůže a tkáně Vyšetření Základní mikrobiologické vyšetření klinického materiálu z kožní léze a povrchových ran Základní mikrobiologické vyšetření tkání Kontrola sterility kožního povrchu před lumbální punkcí, odběrem hemokultur, okolí kanyl, apod.
odběr stěr z kožní léze
adjustace t-TPA tampon
uchovávání Č: 24 h T: pt
transport Č: 2 h T: pt
časová odezva 2-6 d
komentář
excize částí tkání
kontejner
nedoporučuje se
Č: 2 h T: pt
2-6 d
stěr z kůže po desinfekci kožního povrchu
t-TPA tampon
Č: 24 h T: pt
Č: 2 h T: pt
2-4 d
Lokalizaci odběru vyznačit do průvodního listu.
odběr výtěr z rány
adjustace t-TPA tampon
uchovávání Č: 24 h T: pt
transport Č: 2 h T: pt
časová odezva 2-6 d
komentář
výtěr z hlubokého defektu
t-TPA tampon
Č: 24 h T: pt
Č: 2 h T: pt
2-6 d
Rány a hluboké defekty Vyšetření Základní mikrobiologické vyšetření klinického materiálu z rány Základní mikrobiologické vyšetření klinického materiálu z hlubokého defektu
20
Hnis a obsah patologických dutin Vyšetření Základní mikrobiologické vyšetření hnisu nebo obsahu patologické dutiny
odběr punkce abscesu nebo patologické dutiny
adjustace anaer. S
Základní mikrobiologické vyšetření tkáně z patologické dutiny
excize tkáně, atp.
kontejner
uchovávání Č: 24 h T: pt
transport Č: 2 h T: pt
časová odezva 2-10 d
nedoporučuje se
Č: 2 h T: pt
2-10 d
t-TPA tampon
komentář Aspiráty nebo punktáty jsou preferovány před výtěrem pro možnost mikroskopického vyšetření.
21
Primárně sterilní tělesné tekutiny Vyšetření Základní mikrobiologické vyšetření pleurální, peritoneální, kloubní tekutiny Základní mikrobiologické vyšetření ascitu, obsahu Douglasova prostoru, plodové vody Základní mikrobiologické vyšetření primárně sterilních tekutin v automatickém hemokultivačním systému BACTEC Základní mikrobiologické vyšetření peritoneálního dialyzátu Základní mikrobiologické vyšetření peritoneálního dialyzátu v automatickém hemokultivačním systému BACTEC Základní mikrobiologické vyšetření mateřského mléka
odběr punktát, aspirát (1-5 ml)
adjustace anaer. S
uchovávání Č: 24 h T: pt
transport Č: 2 h T: pt
časová odezva 2-7 d
punktát, aspirát (1-5 ml)
anaer. S
Č: 24 h T: pt
Č: 2 h T: pt
2-7 d
punktát, aspirát (1-5 ml)
Hemokultivační lahvička aerobní + anaerobní
Č: 24 h T: pt
Č: 2 h T: pt
7-9 d
peritoneální dialyzát (1-5 ml)
anaer.S
Č: 24 h T: pt
Č: 2 h T: pt
2-7 d
peritoneální dialyzát
Hemokultivační lahvička aerobní + anaerobní
Č: 24 h T: pt
Č: 2 h T: pt
2-10 d
mateřské mléko
uzavřená sterilní zkumavka
Č: 24 h T: pt
Č: 2 h T: pt
komentář
22
Centrální nervový systém Vyšetření Základní mikrobiologické vyšetření mozkomíšního moku
odběr lumbální punkce
adjustace kontejner, uzavřená sterilní zkumavka
uchovávání Č: 24 h T: pt
transport Č: 2 h T: pt
časová odezva 2-5 d mikroskopie do 2 h (statim)
Mikrobiologické vyšetření mozkomíšního moku v hemokultivačním systému BACTEC Průkaz volných bakteriálních antigenů: Neisseria meningitidis A,C,Y/W135,B/E.coli K1, Haemophilus influenzae b, Streptococcus pneumoniae, Streptococcus agalactiae
lumbální punkce
Hemokultivační lahvička aerobní + anaerobní
Č: 24 h T: pt
Č: 2 h T: pt
2-10 d
lumbální punkce
kontejner, uzavřená sterilní zkumavka
Č: 24 h T: pt
Č: 2 h T: pt
2-4 h
komentář Součástí mikrobiologického vyšetření je mikroskopie mozkomíšního moku. U podezření na meningokokovou meningitidu současně odebrat krev na hemokultivaci.
23
Krev (hemokultura) Vyšetření Hemokultivační vyšetření
odběr aseptická venepunkce= standardní odběr
adjustace Hemokultivační lahvičky: BACTEC+Aerobic (5-10 ml krve)
tři (nejméně dva) časově oddělené odběry
BACTEC+Anaerobic (8-10 ml krve)
jeden odběr = 10-20 ml krve (rozdělit do 1 aerobní a 1 anaerobní lahvičky)
BACTEC PEDS+ (0,5-3 ml krve)
uchovávání Č: 24 h T: pt
transport Č: 2 h T: pt
časová odezva 2-10 d pozitivní mikroskopie se hlásí ihned lékaři
komentář Jedna hemokultura = časově definovaný odběr (z jedné venepunkce) definovaného množství krve rozděleného do 2 lahviček (aerobní+anaerobní). Frekvence a časování odběrů hemokultur se řídí charakterem klinického obrazu a teplotní křivky. Odběr hemokultur podléhá přísnému aseptickému režimu s cílem minimalizovat riziko kontaminace vzorku.
jeden odběr u malých dětí = 0,5-3 ml krve odběr z cévního katétru pouze při podezření na katétrovou infekci Upozornění: Nepřelepujte čárový kód lahviček !
24
Cizorodý materiál (cévní katétry, drény, shunty, implantáty, elektrody,…) Vyšetření Mikrobiologické vyšetření cévních katétrů Mikrobiologické vyšetření chirurgických drénů Mikrobiologické vyšetření ortopedických implantátů
odběr asepticky odstřižená distální špička vyjmutého katétru (5 cm) asepticky odstřižená koncová část drénu (5 cm) ve sterilní gumové rukavici bez přístupu vzduchu
adjustace kontejner, uzavřená sterilní zkumavka nasucho! kontejner, uzavřená sterilní zkumavka nasucho! nádoba s víkem
uchovávání Č: 24 h T: cht
transport Č: 2 h T: pt
časová odezva 2-5 d
komentář Na průvodním listu označit druh materiálu a jeho lokalizaci.
Č: 24 h T: cht
Č: 2 h T: pt
2-5 d
Na průvodním listu označit druh materiálu a jeho lokalizaci.
nedoporučuje se
Č: 2 h T: pt
2-5 d
Po předchozí telefonické dohodě s laboratoří. Na průvodním listu označit druh materiálu a jeho lokalizaci.
Další poskytované služby OLM
Kultivační průkaz mykobakterií z biologických materiálů (moč, punktáty, výtěry, hnisy, likvor, sekční materiály,…) Zásady odběru, uchovávání a transportu biologických materiálů jsou identické s kapitolou BAKTERIOLOGIE. Časová odezva: 3-6-9 týdnů Mykotická vyšetření kůže a adnex - kožní šupiny, vzorky nehtů, odběr na rozhraní mezi zdravou a postiženou tkání (seškrab nasucho do sterilní zkumavky nebo kontejneru) Časová odezva: 7-14-21d Vyšetření prováděná z indikace hygienicko-epidemiologického oddělení ZÚ Zlín, pracoviště Vsetín Kontrola sterility - stěry z prostředí, kontrola sterility z centrální sterilizace Odběry, uchovávání, transport identické s kapitolou BAKTERIOLOGIE, adjustace t-TPA tampon. Časová odezva: 4-7d Zasílání bakteriálních kultur k přípravě autovakcín do ZÚ Ostrava Zásady odběru, uchovávání a transportu biologických materiálů jsou identické s kapitolou BAKTERIOLOGIE.
25
D - Sérologie – informace o vyšetřeních
1. Legenda k tabulkám ELISA RRR TPHA IM test ERICSON test PAUL BUNNEL test
enzymová imunoanalýza rychlý reaginový test (aglutinace - průkaz nespecifických protilátek) Treponema pallidum hemaglutinační test (průkaz specifických protilátek) hemaglutinační test komplementfixační test hemaglutinační test
odběr adjustace uchovávání
stručný popis získání vzorku popis odběrového materiálu způsob uchovávání vzorku před transportem (pouze pokud není možný okamžitý transport na OLM) Č(čas): maximální délka transportu (h - hodiny, m - minuty) T(teplota): pt (pokojová teplota: 15-25°C), cht (chladničková teplota: 2-8°C) podmínky transportu Č(čas): maximální délka transportu (h - hodiny, m - minuty) T(teplota): pt (pokojová teplota: 15-25°C), cht (chladničková teplota: 2-8°C)
transport
2. Sérologie - tabulky
Níže uvedené tabulky obsahují informace o jednotlivých sérologických vyšetřeních.
26
Vyšetření Kvantitativní stanovení Antistreptolysinu O (ASLO) Kvantitativní stanovení Revmatoidního faktoru (RF)
odběr venepunkce k získání srážlivé krve
adjustace sterilní zkumavka bez aditiv
uchovávání Č: 24 h T: cht
transport Č: 2 h T: pt/cht
dostupnost 1x týdně
venepunkce k získání srážlivé krve
sterilní zkumavka bez aditiv
Č: 24 h T: cht
Č: 2 h T: pt/cht
1x týdně
Kvantitativní stanovení C-reaktivního proteinu Průkaz protilátek (IgM,IgG) Legionella
venepunkce k získání srážlivé krve
sterilní zkumavka bez aditiv
Č: 24 h T: cht
Č: 2 h T: pt/cht
denně (příp. dle dohody statim)
venepunkce k získání srážlivé krve
sterilní zkumavka bez aditiv
Č: 24 h T: cht
Č: 2 h T: pt/cht
dle dohody
pneumophila, Mycoplasma pneumoniae, Chlamydophila pneumoniae, Chlamydophila psittaci, Coxiella burnetii
komentář neutralizace hodnocení: <200m.j./ml negativn >200m.j./ml pozitivní Pokud je latex aglutinace pozitivní, pak metoda ELISA : hodnocení ELISA IgM, IgG, IgA: <0,9 negativní 0,9-1,1 hraniční >1,1 pozitivní turbidimetrie hodnocení: <8 mg/l negativní >8 mg/l pozitivní nepřímá imunofluorescence hodnocení: negativní, pozitivní
Stanovení protilátek (IgM, IgG) Borrelia sp. Konfirmační test k průkazu protilátek (IgM) Borrelia sp.
venepunkce k získání srážlivé krve, likvor venepunkce k získání srážlivé krve, likvor
sterilní zkumavka bez aditiv
Č: 24 h T: cht
Č: 2 h T: pt/cht
sterilní zkumavka bez aditiv
Č: 24 h T: cht
Č: 2 h T: pt/cht
Kvantitativní
venepunkce
sterilní zkumavka bez
Č: 24 h
Č: 2 h
1 x za 14 dní (příp. dle dohody) dle potřeby
ELISA hodnocení: negativní, pozitivní rekombinantní imunoblot hodnocení: negativní, pozitivní
do 2 dnů
aglutinace
27
stanovení protilátek Listeria monocytogenes Stanovení protilátek (IgA, IgM, IgG) Helicobacter pylori
k získání srážlivé krve
aditiv
T: cht
T: pt/cht
venepunkce k získání srážlivé krve
sterilní zkumavka bez aditiv
Č: 24 h T: cht
Č: 2 h T: pt/cht
1 x za 14 dní (příp. dle dohody)
Kvantitativní stanovení protilátek Yersinia enterocolitica O3, O9, Yersinia pseudotuberculosis Sérologie salmonelóz (Widalova reakce)
venepunkce k získání srážlivé krve
sterilní zkumavka bez aditiv
Č: 24 h T: cht
Č: 2 h T: pt/cht
1 x týdně (příp. dle dohody)
venepunkce k získání srážlivé krve
sterilní zkumavka bez aditiv
Č: 24 h T: cht
Č: 2 h T: pt/cht
do 2 dnů
hodnocení: < 1:160 negativní > 1:160 pozitivní ELISA Hodnocení IgA, IgG: <0,8 indexu pozitivity(IP) negativní 0,8-1,2 IP hraniční >1,2 IP pozitivní aglutinace hodnocení: < 1:160 negativní > 1:160 pozitivní
aglutinace anti O, H, Vi hodnocení: < 1:40 hraniční > 1:80 pozitivní
28
Vyšetření Treponema pallidum (sérologie lues )
odběr venepunkce k získání srážlivé krve
adjustace sterilní zkumavka bez aditiv
uchovávání Č: 24 h T: cht
transport Č: 2 h T: pt/cht
dostupnost minimálně 3x týdně (příp. dle dohody)
Průkaz heterofilních protilátek virus Epsteina a Barrové (EBV) Paul Bunnelova reakce
venepunkce k získání srážlivé krve
sterilní zkumavka bez aditiv
Č: 24 h T: cht
Č: 2 h T: pt/cht
1 x týdně
komentář RRR, TPHA hodnocení: negativní, pozitivní (pozitivní séra jsou předána ke konfirmaci do NRL pro syfilis) hodnocení: IM test < 1:40 negativní >1:40 pozitivní Ericson test <1:30 negativní >1:30 pozitivní Paul Bunnel test <1:40 negativní >1:40 pozitivní
29
Vyšetření odběr adjustace Kvantitativní stanovení venepunkce k získání sterilní zkumavka protilátek (IgA, IgM, srážlivé krve bez aditiv IgG - včetně určení indexu avidity ) Toxoplasma gondii
uchovávání Č: 24 h T: cht
transport Č: 2 h T: pt/cht
dostupnost 1 x za 14 dní (příp. dle dohody)
Průkaz HIV Ag-Ab
venepunkce k získání sterilní zkumavka srážlivé krve bez aditiv
Č: 24 h T: cht
Č: 2 h T: pt/cht
Průkaz celkových protilátek anti HAV (anti HAV total) Průkaz protilátek anti HAV IgM
venepunkce k získání sterilní zkumavka srážlivé krve bez aditiv
Č: 24 h T: cht
Č: 2 h T: pt/cht
1 x týdně (příp. dle dohody)
venepunkce k získání sterilní zkumavka srážlivé krve bez aditiv
Č: 24 h T: cht
Č: 2 h T: pt/cht
1 x týdně (příp. dle dohody)
Průkaz HBsAg
venepunkce k získání sterilní zkumavka srážlivé krve bez aditiv
Č: 24 h T: cht
Č: 2 h T: pt/cht
1 x týdně (příp. dle dohody)
Průkaz HBeAg
venepunkce k získání sterilní zkumavka srážlivé krve bez aditiv
Č: 24 h T: cht
Č: 2 h T: pt/cht
1 x za 14 dní (příp. dle dohody)
Průkaz protilátek anti HBe
venepunkce k získání sterilní zkumavka srážlivé krve bez aditiv
Č: 24 h T: cht
Č: 2 h T: pt/cht
1 x za 14 dní (příp. dle dohody)
1 x týdně
komentář ELISA hodnocení IgA, IgM: <0,9 Indexu pozitivity/IP/ negativní 0,9-1,1 IP hraniční >1,1 IP pozitivní hodnocení IgG: <0,8 IP negativní 0,8-1,0 IP hraniční >1,0 IP pozitivní ELISA hodnocení: negativní, pozitivní (pozitivní séra jsou předána ke konfirmaci do NRL pro AIDS) ELISA hodnocení: negativní, pozitivní ELISA hodnocení: negativní, pozitivní ELISA hodnocení: negativní, pozitivní ELISA hodnocení: negativní, pozitivní ELISA hodnocení: negativní, pozitivní
30
Vyšetření odběr adjustace Kvantitativní venepunkce k získání sterilní zkumavka stanovení protilátek srážlivé krve bez aditiv anti HBs
uchovávání Č: 24 h T: cht
transport Č: 2 h T: pt/cht
dostupnost 1 x týdně (příp. dle dohody)
komentář ELISA hodnocení: negativní, pozitivní
Průkaz protilátek (IgM, celkové protilátky) anti HBc Průkaz protilátek HCV
venepunkce k získání sterilní zkumavka bez aditiv srážlivé krve
Č: 24 h T: cht
Č: 2 h T: pt/cht
1 x za 14 dní (příp. dle dohody)
ELISA hodnocení: negativní, pozitivní
venepunkce k získání sterilní zkumavka srážlivé krve bez aditiv
Č: 24 h T: cht
Č: 2 h T: pt/cht
1 x týdně (příp. dle dohody)
HBsAg konfirmační test
venepunkce k získání sterilní zkumavka srážlivé krve bez aditiv
Č: 24 h T: cht
Č: 2 h T: pt/cht
dle potřeby
Průkaz protilátek EBV
venepunkce k získání sterilní zkumavka srážlivé krve bez aditiv
Č: 24 h T: cht
Č: 2 h T: pt/cht
1x za 14 dní
Průkaz protilátek CMV
venepunkce k získání sterilní zkumavka srážlivé krve bez aditiv
Č: 24 h T: cht
Č: 2h T: pt/cht
ELISA hodnocení: negativní, pozitivní ELISA hodnocení: negativní, pozitivní hodnocení ELISA EBV EBNA-1 IgM, IgG ; VCA IgM, IgG < 0,9 IP negativní 0,9-1,1 IP hraniční >1,1 IP pozitivní ELISA CMV IgM, IgG < 0,9 IP negativní 0,9-1,1 IP hraniční >1,1 IP pozitivní AVIDITA CMV IgG (v %) <40 nízká 40-60 hraniční >60 vysoká (více než 18 týdnů po nákaze)
1x za 14 dní
31
E - Vyšetření zajišťovaná nebo konfirmovaná v jiných laboratořích
Laboratoř ZÚ se sídlem v Ostravě Oddělení pro diagnostiku mykobakterií ZÚ se sídlem v Ostravě Oddělení imunomodulátorů Všeobecná VN NRL pro diagnostiku syfilis NRL pro antibiotika
NRL pro E.coli a shigely NRL pro meningokokové nákazy NRL pro salmonely NRL pro stafylokoky NRL pro streptokoky a enterokoky NRL pro toxoplazmózu NRL pro virové hepatitidy NRL pro hemofilové nákazy NRL pro legionely
NRL pro tkáňové helmintózy
Zaměření
Adresa
Konzultanti
Tel. kontakt
tuberculosa mykobakteriologie
Partyzánské nám.7 728 92 Ostrava Partyzánské nám.7 728 92 Ostrava Dermatovenerologická klinika, U Nemocnice 2 128 08 Praha 2 SZÚ Šrobárova 48 100 42 Praha 2
RNDr. Holec Vladislav
596 200 236
MUDr. Rutová Jana
596 200 235
MUDr. Zákoucká Hana
224 962 402
MUDr. Urbášková Pavla MUDr. Lhotová Hana
267 082 238 267 082 741
bakteriologie bakteriologie bakteriologie
MUDr. Křížová Pavla MUDr. Dědičová Daniela RNDr. Petráš Petr
267 082 259 267 082 200 267 082 264
bakteriologie parazitologie sérologie bakteriologie
RNDr. Motlová Jitka RNDr. Kodym Petr RNDr. Němeček Vratislav MUDr. Lebedová Věra
267 267 267 267
MUDr.Drašar Vladimír
517 333 401
RNDr. Kolářová Libuše
271 019 254
příprava autovakcín
TPHA, RRR
bakteriologie bakteriologie
bakteriologie parazitologie
ZÚ se sídlem v Brně Gorkého 6 602 00 Brno IPVZ Katedra mikrobiologie Ruská 85 100 05 Praha 10
082 082 082 082
260 105 398 241
32
Vyšetření prováděná v ZÚ se sídlem v Ostravě Z OLM je organizován jednou týdně odvoz vzorků do ZÚ se sídlem v Ostravě s požadavky na vyšetření, která se v naší laboratoři neprovádí. Odvoz probíhá většinou v úterý (přesný čas po domluvě s dispečinkem). Vzorky odebrané v ostatní dny jsou připraveny k odvozu v nejbližším termínu (pokud to stabilita příslušného biologického materiálu dovoluje).
Spektrum laboratorních vyšetření:
buněčná imunita diagnostika monoklonálních gamapatií humorální imunita alergie potravinové intolerance autoprotilátky bakteriologická sérologie (brucela, tularémie, pertusse, parapertusse,…) parazitologie (larv. toxokaróza) průkaz nukl. kyselin (PCR) Noroviry, Astroviry, Enteroviry herpetické viry (EBV, CMV, HZV, VZV, HHV-6) Parvovirus B-19, Morbilli v., Rubeola v., Parotitis v. Respirační agens: Influenza A, B virus, Parainfluenza v., Adenoviry, RSV, Mycoplasma pneumoniae, Chlamydophila pneumoniae, Chlamydia trachomatis Papilomaviry Klíšťová encefalitis v., Dengue v., West Nile v., Žlutá zimnice v., Japonská B encefalitis v. Coxsackie v. B1-6, Hantaviry Lymfocytární choriomeningitis v. (LCM)
Telefonický kontakt: ZÚ se sídlem v Ostravě 596 200 111 (spojovatelka) Informace o celém spektru Národních referenčních laboratoří (NRL) v České republice je k dispozici na Oddělení lékařské mikrobiologie (OLM).
33