Zvyšování konkurenceschopnosti studentů oboru botanika a učitelství biologie CZ.1.07/2.2.00/15.0316
Aplikovaná botanika BOT/ABP ZS 2011/2012 1. Zpracování sběrových protokolů – příklad databáze www.vurv.cz, ILDB 2. Popis morfologických znaků genových zdrojů Lactuca spp. 3. Příprava vzorků semen k dlouhodobému uložení
Sběr nažek L. serriola - areál Olomouc Holice, rok 2010
Sběrové protokoly - ZS 2011 (cv. 1)
Informace o sběrových lokalitách v databázích VÚRV, v.v.i. Základní údaje
Úvodní stránka
Databáze 21.03.2005
VÚRV, v.v.i.
Výzkumný ústav rostlinné výroby, v.v.i. ( v.v.i. - veřejná výzkumná instituce)
Semináře – podzim 2010
Adresa:
Drnovská 507, 161 06 Praha 6 – Ruzyně
Telefon:
233022111
Fax:
233310636
E-mail:
[email protected]
IČO:
00027006
Agrometeorologická stanice - graf
O ústavu Struktura ústavu Zřizovací listina Dozorčí rada Rada instituce Kontakty Historie Zaměstnanci Ročenky ústavu Výroční zprávy Publikace VÚRV Plán seminářů a konferencí Fytosanitární výbor... Nabídka volných míst Výběrová řízení Výzkum, služby, poradenství Hlavní směry Řešené projekty Výsledky výzkumu Služby Poradenství Referenční laboratoře Knihovna a informační služby Dotační programy Aktuality Databáze Agroekologie Ekologie rostlin a herbologie Ekotoxikologie Monitoring CL Pěstitelské technologie Precizní zemědělství VS Jevíčko VS Liberec Genetika, ... Genetika a šlechtitelské metody Mikrosporové kultury a embryokultury rodu Brassica Mikrosporové regeneranty rodu Brassica Morfologická variabilita izolátů braničnatky pšeničné Genová banka Molekulární biologie Zeleniny a speciální plodiny
Databáze ve VÚRV
22.02.2002
Plant Genetic Resources Documentation in the Czech Republic
Evidence genetických zdrojů rostlin v ČR
www.vurv.cz EVIGEZ vyhledávací formulář: Zadejte kriteria genetického zdroje:
Identifikátor (ECN) 09H58O1282 Název
Status
Rod
Stát původu
Informace o genetickém zdroji: Řešitelský ústav:Genebank Department - RICP Prague Vegetable Section Olomouc Olomouc – Holice Identifikátor: 09H5801282 Název: Jiný název: Stát původu: Czech Republic Taxon: Lactuca serriola L. x Lactuca sativa L. Status: planá forma Rok zařazení do kolekce:1999 Typ vývoje: Dostupnost: volně Dárce: Číslo dárce: Jiné číslo: 8/95 Šlechtitel: Rodokmen: Začátek registrace: Konec registrace: Poznámky: Sběrové údaje: Jméno sběratele: expedition 95 Kristkova Číslo sběru: 8/95 Místo sběru: Senov near Ostrava Ekolog. charakterist: Zeměp. délka: E01832— Zeměp. šířka: N4951— Nadm. výška: 255 Datum: 6.9.1995
Home
Search
Download
Description
Contributors
Species
The International Lactuca Database Centre for Genetic Resources, The Netherlands (CGN)
Database managers: Rob van Treuren and Frank Menting
The International Lactuca Database includes accessions of species belonging to the genus Lactuca, but also a few accessions belonging to related genera. Passport data can be searched on-line or downloaded. Characterization and evaluation data can be accessed via the downloading section. Requests for seed material from accessions included in the database should be directed to the institute that maintains the accession. An overview of the holding institutes is provided in the section "contributors". Database access
Further information
On-line - search
Passport descriptors
Off-line - download
Overview of contributors Overview of included species
Comments and questions to: Frank Menting.
2. Popis morfologických znaků položek genových zdrojů rodu Lactuca sběrové položky regenerace – skleník klasifikátor kvalitativní, semikvantitativní znaky stonkové (lodyžní) listy ve stadiu kvetení, ze střední části stonku
Set of descriptors for wild Lactuca spp.
Description of morphological characters of wild Lactuca L. spp. genetic resources (English-Czech version) I. Doležalová et al. 2002. Horticultural Science (Prague), 29 (2):56-83. Basic morphological descriptors for genetic resources of wild Lactuca spp. I. Doležalová, E. Křístková, A. Lebeda, V. Vinter, D. Astley and I. W. Boukema. 2003. Plant Genetic Resources Newsletter, 134:1-9. within the framework of the EU-funded project "GENE-MINE" (Fifth Framework Programme of the European Commission) A minimum set of the most important descriptors for Lactuca sativa genetic resources was composed in order to foster cooperation within the ECP/GR Working Group on Leafy Vegetable Genetic Resources (Lebeda, Boukema 2005); recently used in GENRES
The descriptors and codes for genetic resources of cultivated lettuce (Lactuca sativa L.) Křístková et al., 2008. Horticultural Science (Prague), 35 (3): 113-129.
Morphological assessment flower, inflorescence
stem 1
achene s descriptor list – 16 plants per accession continuously at different developmental stages visually, photodocumentation, scanning evaluation: qualitative, semiquantitative, quantitative
stem leaves
rosette leaves
Příklad: tvar apexu listu - obrázky z klasifikátoru
1 2 3 4 5
1 2 3 truncate – uťatý rounded – okrouhlý obtuse – tupý subacute – špičatý mucronate – hrotitý
4
5
Tvar apexu u položek L. serriola (regenerace 2011): 4
3
5
2
2
1
Příklad: dělený list - hloubka zářezů - obrázky z klasifikátoru
3 3 5 7 9
5
7
9
Příklad: dělení stonkových listů (hloubka zářezů) u položek L. serriola (regenerace 2011)
pinnatilobed – peřenolaločný pinnatifid – peřenoklaný pinnatipart – peřenodílný pinnatisect – peřenosečný
0
3
5
7
9
1. Field studies in Europe: Expedition ways and collection sites of L. serriola populations in Czech Republic, Germany, Netherlands and United Kingdom
Lebeda A., Doležalová I., Křístková E., Dehmer K.J., Astley D. van de Wiel C.C.M., van Treuren R., 2007. Acquisition and ecological characterization of Lactuca serriola L. germplasm collected in the Czech Republic, Germany, the Netherlands and United Kingdom. Genetic Resources and Crop Evolution, 54: 555-562.
Example of variability in qualitative character Descriptor number 1.3.7. – Divided cauline leaf of L. serriola – depth of incisions, fully developed leaf from the middle part of stem at a stage of full flowering Czech Netherlands Republic 1% 3%
24%
51%
17%
8%
96%
pinnatipart
7%
2%
pinnatifid
1% 5%
entire
pinnatisect
Germany
1% 1% 1%
85%
entire
pinnatilobed
pinnatifid
pinnatisect
United Kingdom
97%
pinnatilobed
pinnatipart
pinnatifid
pinnatisect
entire
pinnatilobed
pinnatifid
pinnatisect
pinnatifid
entire
pinnatipart pinnatilobed
pinnatisect
Lactuca saligna - příklady tvaru listů (regenerace 2010)
Lactuca aculeata - příklady tvaru stonkových listů (regenerace 2010)
3. Zpracování osiva k dlouhodobému uložení – příklad – semenné vzorky Lactuca serriola získané sběry v přírodě
vyčištění vzorků se prování po regeneraci (namnožení), u originálních sběrů se obvykle neprovádí; přítomnost chmýru – morfologické znaky – upřesnění taxonomické determinace vzorku zkouška klíčivosti dtto sušení – laboratorní teplota (asi na 13% obsahu vody v semenech), uzavření do vhodných obalů, skladování při teplotě -18 °C až -20 °C metoda „ultra-dry seed“ – vysušení na silikagelu na obsah vody v semenech asi 3%
César Gómez-Campo. Dep. Biología Vegetal. Escuela T.S. Ing. Agrónomos. Univ.Politécnica. Madrid
Dlouhodobé uchovávání semen metoda ultra-dry seed
Voda v semenech vliv na všechny vývojové fáze semen: formování a zrání stav klidu bobtnání a klíčení Semena podle tolerance k vyschnutí: většina kulturních rostlin vyžaduje pro úplný vývoj fázi vyschnutí, obsah vody se ustálí v rovnováze s prostředím, mnoho druhů si udrží schopnost klíčit po dlouhé období. U nás běžně pěstované druhy plodiny – obsah vody 5 – 10 – 15 – 18% Semena procházející fází vyschnutí – ortodoxní Tropy – zralá semena obsahují 20 – 40% vody, při poklesu vlhkosti ztrácejí klíčivost – semena rekalcitrantní (Coffea arabica, citrusy, někdy Passiflora)
Dlouhověkost semen Relativní indexy skladovatelnosti semen (doba snížení klíčivosti na polovinu: 1. (po 1 – 2 letech): kukuřice,žito, sója, slunečnice, mák, salát, cibule 2. (po 3 – 5 letech): ječmen, pšenice, oves, pohanka, řepka, bob, len, zelí, květák, mrkev, paprika 3. (po 5 a více letech): vojtěška, řepa, rajče, okurka, vikev, hrách u suchých semen obecně platí: při vlhkosti nad 30% může docházet ke klíčení semen vlhkost 18 – 30% podporuje rychlou deterioraci semen, zejména v souvislosti s rozvojem mikroorganismů vlhkost pod 8 – 9% zamezuje rozvoji hmyzu vlhkost 4 – 5% - semena jsou odolná proti napadení hmyzem a houbovými patogeny 1. s každým snížením vlhkosti o 1% se dvojnásobně prodlouží délka jeho životaschopnosti 2. s každým snížením teploty uskladnění o 5,6 °C se dvojnásobně prodlužuje délka jeho životaschopnosti
Pro dlouhodobé uchovávání semen FAKTORY PRODLUŽUJÍCÍ ŽIVOTNOST SEMEN NÍZKÁ TEPLOTA NÍZKÁ VLHKOST
NÍZKÁ KONCENTRACE KYSLÍKU (?)
NÍZKÁ KONCENTRACE ETYLENU
klasický postup
- Vysušit semena
- Umístit do utěsněné nádoby - Skladovat v chladné místnosti
Všichni mohou souhlasit nicméně …
- Desiccate your seeds to what extent?
- Place them in a tight container - Store in a cold room
- Desiccate your seeds
- Place them in a tight container which containers are tight?
- Store in a cold room
- Desiccate your seeds
- Place them in a tight container - Store in a cold room at what temperature?
- Desiccate your seeds to what extent?
Pro ortodoxní semena je „ultra-drying“ bezpečné a významně může prodloužit životnost semen
„Ultra-drying“ pomocí silikagelu má mnoho výhod.
VÝHODY POUŽITÍ SILIKAGELU 1. Jde o velmi jednoduchou metodu vysušení semen.
2. Lze dosáhnout vlhkosti semen nejméně o 2 % nižší než jinými metodami. 3. Dosaženou nízkou vlhkost lze udržovat prakticky neomezeně (v hermeticky uzavřených kontejnerech). 4. Silikagel lze snadno regenerovat (zahřátím) a znovu použít. adsorbční schopnost při 80% RV a 25°C je 36,3%váhových regenerace vysoušením při teplotě 130-160°C
5. Změny zbarvení silikagelu mohou upozornit na anomálie (změnu vlhkosti) v kontejneru. 6. Silikagel rovněž absorbuje toxické plyny uvolňované semeny při jejich uskladnění a tím oddaluje stárnutí semen.
Amorfní SiO2
Silikagel
Silikagel s CoCl2
Silikagel s CoCl2
přechodné zbarvení Silikagel s hrubšími zrny
(suchý)
(vlhký)
Náhrada kobaltu při barvení silikagelu:
Železo?
Železo?
Methyl violeť
Tři alternativní způsoby barvení silikagelu: vlevo – suchý, vpravo - vlhký
+ 20%
V hermeticky uzavřeném kontejneru vzdušná vlhkost ≈ 10% R.H. je udržována vysušeným silikagelem
V takových podmínkách lze udržet vlhkost osiva asi 1.5 - 3.0%
- Place them in a tight container which containers are tight?
Význam hermeticky uzavřeného obalu
Uložení v chladu Laboratorní teplota (RH variabilní)
Hermetický kontejner
Semena
Semena v kontejneru
Netěsnící kontejner
Typy kontejnerů
(above). Only these four containers (10%) proved to be completely hermetic to water vapour after 12 years of observation.
(right). Representative containers of all other thirty-six (90%) allowing moisture intake after periods between 2 months and 3 years.
see www.seedcontainers.net
ZÁVĚRY: 1) mezi testovanými kontejnery, které lze potenciálně ke skladování semen použít, je jen velmi malá část skutečně hermeticky těsná, umožňující dlouhodobé bezpečné uskladnění; 2) vhodné jsou pouze: Kilnerovy zavařovačky, skleněné zatavené ampule, plechové konzervy, láhve pro laboratorní chemikálie; 3) třívrstevné sáčky jsou rovněž vhodné 4) ostatní kontejnery nejsou spolehlivě hermeticky uzavíratelné; 5) vhodnost kontejneru je potřeba prověřit před použitím; 6) vložení indikátoru změny vlhkosti v kontejneru (barevné změny) umožňuje kontrolu a případnou nápravu
- Store in a cold room at what temperature?
„s každým snížením teploty uskladnění o 5,6 °C se dvojnásobně prodlužuje délka jeho životaschopnosti“
ale pokud je vlhkost osiva správně udržována a kontrolována,
teplota -5 °C až 0 ºC je dostatečná.
Takto lze ušetřit značné množství energie.
Tento postup byl navržen pro řadu druhů rostlin a ověřen v období 40 let skladování
Je tedy možné revidovat protokoly pro dlouhodobé uskladnění semen. (včetně počátečních a periodických testů semen, podmínek uskladnění, regeneračních protokolů atd.)
Thank you for listening! and long life to your seeds!
César Gómez-Campo. Dep. Biología Vegetal. Escuela T.S. Ing. Agrónomos. Univ.Politécnica. Madrid
