BiochemNet - Vytvoření sítě pro podporu spolupráce biomedicínských pracovišť a zvýšení uplatnitelnosti absolventů biochemických oborů v praxi
CZ.1.07/2.4.00/31.0133
Univerzita Palackého Přírodovědecká fakulta Katedra biochemie
Univerzita Palackého Založena již v 16. století Nejstarší vysoká škola na Moravě Druhá nejstarší vysoká škola v České republice Osm fakult Studuje přes 23 000 studentů = celá pětina obyvatel města Olomouce.
Přírodovědecká fakulta Hlavní budova PřF Třída 17. listopadu
Katedra biochemie
Biologické centrum PřF Šlechtitelů 11 Olomouc Holice
Katedra biochemie Založení katedry - rok 1996 Vedoucí Katedry biochemie • 1996-2006 – Prof.RNDr. Pavel Peč, CSc. zakladatel Katedry Biochemie • 2006-2012 Prof. Mgr. Marek Šebela
Akreditace výuky oboru Biochemie rok 2001
Výzkumné zaměření katedry biochemie Cytokininy – mechanismus biosyntézy a odbourávání (cytokininoxidasa/dehydrogenasa) Genetické manipulace u rostlin a hub Proteomika – hmotnostní spektrometrie biomolekul Obranné mechanismy rostlin – úloha reaktivních forem kyslíku a dusíku Metabolismus polyaminů u rostlin Studium a charakterizace enzymů – aminoaldehydehydrogenasa Nanotechnologie - imobilizace enzymů na nanočástice Modifikace proteinů - trypsin
Stáže studentů - metody Oddělení tkáňových kultur a rostlinných biotechnologií (Katedra botaniky) mikropropagace (meristémové kultury) prašníkové kultury embryokultury (izolace a kultivace nezralých zygotických hybridních embryí) izolace a fúze protoplastů karyologie, cytologické metody anatomie rostlin studium stresu na úrovni rostlinné buňky
L-Arg
NHCH3
NHCH 3
esterasa
O O
F
AcO
O
DAF-FM DA bez fluorescence
CH3N
NOS
N
NH2
NH2
F
OAc
COO
F
F
O
buněčná membrána
N
NO
-
-
O
DAF-FM
O
O2
COO
O
-
F
F -
O
DAF-FM T fluorescence
O
Stáže studentů - metody Oddělení fytopatologie a mikrobiologie (Katedra Botaniky) fytopatogenní houbové organismy mikroskopické metody konfokální mikroskopie fenolické látky v rezistenci rostlin oxidativní stres v průběhu patogeneze vliv růstových regulátorů na rezistenci rostlin a vývoj patogenů
Stáže studentů - metody Chromatografické metody – izolace malých molekul (Katedra Biochemie) – izolace proteinů
Stáže studentů - metody Nanotechnologie – imobilizace enzymů (Katedra Biochemie)
Stáže studentů - metody Studium obranných mechanismů rostlin (Katedra Biochemie) Studium vývoje patogenů Detekce, kvantifikace - ROS, RNS, GSNO Detekce nitrovaných proteinů Studium enzymů podílejících se na produkci RNS - GSNOR, NR, NO syntasa produkci ROS – NADPHoxidasa, SOD, POX, Kat Studium tvorby biofotonů Western blot, nativní elfo, stanovení aktivity, histochemie, RT PCR,
Stáže studentů - metody Metody vypracované v rámci projektu AescuLab www.aesculab.cz www.aesculab.portal.cz
Skupina
Moduly
Biochemie
39
Biologie
36
Imunologie
35
Celkem
110
160 videí
Stáže studentů - metody Č.
Název modulu
AE-301 První pomoc AE-302 GMO - geneticky modifikované organismy AE-303 Manipulace s laboratorními zvířaty AE-304 ELISA analýza specifické protilátkové odpovědi experimentálních zvířat AE-305 Inhibiční ELISA AE-306 Stanovení specifických protilátek ve vaginálním sekretu myší AE-307
Analýza antigen specifické odpovědi T lymfocytů a jejich subpopulací pomocí ELISPOT
AE-308 Analýza antigen specifické odpovědi T lymfocytů pomocí Flow Cytometry AE-309
Test proliferační odpovědi subpopulací T lymfocytů po stimulaci antigenem barvení propidium jodid
AE-310 Indukce tvorby cystyckých forem B. burgdorferi za různých kultivačních podmínek AE-311
Analýza životnosti kvasinek pomocí flow cytometry.
AE-312 Indukce morfologických změn Candida albicans. AE-313 Metody odstranění a průkazu endotoxinů (LPS) AE-314 Analýza subpopulací splenocytů pomocí Flow Cytometry AE-315 Analýza N-glykosylace gp120 proteinu pomocí lektinových blotů
Stáže studentů - metody Č.
Název modulu
AE-101 Precipitační metody purifikace peptidů a proteinů AE-102 Štěpení proteinů v roztoku a v gelu AE-103 SDS-PAGE a následná detekce proteinů v gelech AE-104 Dvojdimenzionální gelová elektroforéza rostlinných proteinů v malém formátu AE-105 Identifikace proteinů pomocí MALDI-TOF-MS AE-106 Western blot – detekce a kvantifikace Hsp70 AE-107 Slot blot a rychlá imunodetekce proteinů na přístroji SNAP id. AE-108 Isoelektrická fokusace AE-109 Nativní elektroforéza a detekce enzymů v gelu AE-111
Gelová chromatografie, gelová permeační chromatografie, gelová filtrace
AE-112
Kovalentní modifikace proteinů
AE-113
Stanovení aktivity xanthinoxidoreduktasy a detekce inhibitorů tohoto enzymu autografickou metodou na tenké vrstvě
AE-114
Stanovení produkce oxidu dusnatého a reaktivních forem dusíku
AE-115
Analýza metabolitů reaktivních forem dusíku – dusitany/dusičnany, nitrosothioly
AE-116a Stanovení aktivity enzymů metabolismu reaktivních forem dusíku - NO-synthasy
Stáže studentů - metody Č.
Název modulu
AE-101 Precipitační metody purifikace peptidů a proteinů AE-102 Štěpení proteinů v roztoku a v gelu AE-103 SDS-PAGE a následná detekce proteinů v gelech AE-104 Dvojdimenzionální gelová elektroforéza rostlinných proteinů v malém formátu AE-105 Identifikace proteinů pomocí MALDI-TOF-MS AE-106 Western blot – detekce a kvantifikace Hsp70 AE-107 Slot blot a rychlá imunodetekce proteinů na přístroji SNAP id. AE-108 Isoelektrická fokusace AE-109 Nativní elektroforéza a detekce enzymů v gelu AE-111
Gelová chromatografie, gelová permeační chromatografie, gelová filtrace
AE-112
Kovalentní modifikace proteinů
AE-113
Stanovení aktivity xanthinoxidoreduktasy a detekce inhibitorů tohoto enzymu autografickou metodou na tenké vrstvě
AE-114
Stanovení produkce oxidu dusnatého a reaktivních forem dusíku
AE-115
Analýza metabolitů reaktivních forem dusíku – dusitany/dusičnany, nitrosothioly
AE-116a Stanovení aktivity enzymů metabolismu reaktivních forem dusíku - NO-synthasy
Stáže studentů - metody Č.
Název modulu
AE-201 Průkaz apoptózy elektroforeticky (DNA fragmenty) AE-202 Testování mutagenicity v mikrodestičkovém uspořádání (Amesův test) AE-203 Práce v aseptickém prostředí AE-204 Morfologie živočišné buňky AE-205 Kultivace savčích buněčných linií AE-206 Sledování viability a proliferace AE-207 Transfekce buněk, selekce a detekce AE-208 Analýza schopnosti živočišných buněk tvořit kolonie AE-209 Synchronizace živočišných buněčných kultur AE-210 Modely angiogeneze in vitro AE-211
Příprava buněk pro mikroskopickou analýzu
AE-212 Vizualizace jednotlivých molekul DNA AE-213 Annexin V: Detekce apoptózy AE-214 Průtoková cytometrie: Analýza buněčného cyklu AE-215 Průtoková cytometrie: Analýza intracelulárních proteinů
Ubytování, stravování Koleje Ubytování v areálu v Holici
Menza
Jak se k nám dostanete AUTOBUSEM z Hlavního vlakového nádraží Olomouc (via náměstí Hrdinů): Linka číslo 13 (z Hlavního vlakového nádraží) nebo 22 (centrum – zastávky Tržnice, náměstí Hrdinů): Jízdní řád Dopravního podniku města Olomouce. a.s.. U vstupu do areálu je orientační tabule s vyznačením budovy VTP UP. Zastávka: Šlechtitelů nebo Technologická (spoje s "t"). AUTEM Ze směru od Ostravy, Brna, Prostějova: Směr Olomouc-Holice – sjezd z dálnice – exit č. 276, dále silnice č.46. Na kruhovém objezdu jeďte rovně směr Holice, projeďte Holicí stále po hlavní cestě. Silnice pokračuje mírným stoupáním přes železniční nadjezd a dále přibližně 300 metrů. Poté odbočte na první křižovatce doprava a cca po 500 metrech se po pravé straně nachází areál PřF UP, jeďte však dál. Fialová navigační cedule po cca 100 metrech Vás poté nasměruje doprava do průmyslové zóny.
Děkuji za pozornost
