Návrh žádosti děkanovi Fakulty chemicko-inženýrské Vysoké školy chemicko-technologické v Praze
Podávám návrh na zahájení řízení ke jmenování profesorem Jméno:
Michal Přibyl
Rodné číslo: Bydliště: Pracoviště:
Vysoká škola chemicko-technologická, Fakulta chemickoinženýrská, Ústav chemického inženýrství
Pro obor:
Chemické inženýrství
Návrh písemně podpořili: 1.
Prof. Hsueh-Chia Chang, University of Notre Dame, USA
2.
Prof. Dr. Volker Hessel, Technische Universiteit Eindhoven, Nizozemí
3.
Prof. Stanislav Y. Shvartsman, Princeton University, USA
Ke svému návrhu přikládám (podle § 74, odst.2 zákona č. 111/1998 Sb., o vysokých školách a o změně a doplnění dalších zákonů) v písemné a elektronické formě: 1. Soubor v nerozebíratelné úpravě obsahující a) životopis, b) přehled pedagogické a odborné činnosti, včetně výsledků dosažených při výchově vědeckých pracovníků, c) přehled vědeckých a odborných prací, vynálezecké a realizační činnosti, odborně-společenské aktivity, mezinárodní spolupráce, domácích a zahraničních stáží a nejvýznamnějších tvůrčích aktivit, d) stručný pedagogický projekt. 2. Dále ke svému návrhu přikládám*: doklady o dosaženém vysokoškolském vzdělání a získaných příslušných titulech, doklady o získání akademicko-vědeckých titulů nebo vědeckých hodností, doklad o habilitačním řízení.
Datum:
Podpis :
*
Doklady se předkládají na děkanát fakulty k nahlédnutí v originále či jako úředně ověřené kopie a vracejí se zpět uchazeči. 1
Obsah Životopis ............................................................................................................................................ 4 1.1. Vzdělání ............................................................................................................................. 4 1.2. Průběh praxe ...................................................................................................................... 4 2. Pedagogická činnost................................................................................................................... 5 2.1. Přehled ............................................................................................................................... 5 2.2. Vedení studentů ................................................................................................................. 6 2.3. Další aktivity spojené s pedagogickým působením ........................................................... 6 2.4. Inovační přínos pro pedagogickou práci ............................................................................ 6 2.5. Pedagogický projekt........................................................................................................... 7 3. Vědecká aktivita....................................................................................................................... 10 3.1. Přehled vědecko-výzkumných a inovačních aktivit ........................................................ 10 3.2. Vědecké práce v impaktovaných časopisech ................................................................... 11 3.3. Vědecké práce v neimpaktovaných časopisech s recenzním řízením .............................. 18 3.4. Kapitoly v monografiích, monografie.............................................................................. 19 3.5. Články v časopisech bez recenzního řízení, články ve sbornících .................................. 19 3.6. Osobně přednesené přednášky v zahraničí a na mezinárodních konferencích ................ 27 3.7. Osobně přednesené přednášky v ČR a na národních konferencích ................................. 29 Odpovědný řešitel zahraničních grantů ........................................................................... 30 3.8. 3.9. Odpovědný řešitel domácích grantů ................................................................................ 30 3.10. Spoluřešitel zahraničních grantů ...................................................................................... 30 3.11. Spoluřešitel domácích grantů ........................................................................................... 30 4. Technická a realizační činnost ................................................................................................. 31 4.1. Udělené evropské nebo mezinárodní patenty (EPO, WIPO), patenty USA a Japonska.. 31 4.2. Udělené české nebo jiné národní patenty, které jsou využívány na základě platné licenční smlouvy ........................................................................................................................... 31 4.3. Udělené české nebo jiné národní patenty, které jsou využívány jen vlastníkem patentu, nebo nejsou využívány .................................................................................................... 31 4.4. Autorství realizovaného komplexního technického díla s udaným společenským přínosem .......................................................................................................................... 31 4.5. Poloprovozy, ověřené technologie ................................................................................... 31 4.6. Užitné a průmyslové vzory, prototypy, funkční vzorky, software .................................. 31 4.7. Expertizní činnost ............................................................................................................ 32 5. Organizační a odborně-společenská činnost s oborem související .......................................... 32 5.1. Členství a funkce v mezinárodních a národních odborných společnostech .................... 32 5.2. Členství v odborných komisích a poradních orgánech .................................................... 32 5.3. Členství a funkce v redakčních radách odborných časopisů ........................................... 32 5.4. Členství a funkce v organizačních výborech konferencí ................................................. 32 5.5. Členství a funkce v oborových radách grantových agentur ............................................. 32 5.6. Ocenění výzkumné a vývojové práce .............................................................................. 32 6. Zahraniční spolupráce a pobyty v zahraničí ........................................................................... 32 7. Nejvýznamnější tvůrčí aktivity ................................................................................................ 33 2
7.1. 7.2. 7.3. 7.4. 7.5.
Vytvoření předmětu Multifunkční chemické a biochemické mikrosystémy ................... 33 Vytvoření předmětu Tepelné procesy .............................................................................. 33 Výzkum v oblasti elektrokinetického transportu a elektrochemických jevů ................... 33 Výzkum v oblasti mezibuněčné komunikace .................................................................. 34 Výzkum v oblasti bioreaktrorů, mikrobioreaktorů a biosenzorů ..................................... 35
3
Životopis Jméno:
Michal
Příjmení: Přibyl
1.1.
Vzdělání
1988-1992 studium na Střední průmyslové škole chemické v Ústí nad Labem, obor: chemická technologie 1992-1997 studium na Vysoké škole chemicko-technologické v Praze, obor studia: procesy a zařízení chemických a potravinářských výrob 1997-2001 doktorské studium na VŠCHT v Praze, obor studia: chemické inženýrství 2001 obhájení doktorské disertační práce: „Interakce enzymové reakce s procesy přenosu hmoty a tepla“ 1.2.
Průběh praxe
2000-2001 Glaverbel Czech a.s., technolog ve výrobě plochého skla 2002 postdoktorandský pobyt na Department of Chemical Engineering Princeton University, USA 2003-2006 odborný asistent na Ústavu chemického inženýrství VŠCHT v Praze 2007-2009 odborný asistent s atestací na Ústavu chemického inženýrství VŠCHT v Praze docent na Ústavu chemického inženýrství VŠCHT v Praze 2009-
4
2. Pedagogická činnost 2.1.
Přehled
Předmět (typ studia- magisterské, bakalářské, doktorské)
Chemické inženýrství I
Rozsah (hod/týden)
Počet semestrů
Druh (P, C, L)
Zkoušeno studentů
2
2
P
několik seta
3b
5
C
0
3b
5
C
0
4b
8
L
0
1
10
L
0
2
8
P
74
2/2 c
3
P/C
56
2/1 c
3
P/C
32
2/1
3
P/C
132
2/1
5
P/C
52
2/1
3
P/C
48
2
4
P
22
4
1
L
0
2
1
P
12
2/1c
2
P/C
33
(bakalářské) Chemické inženýrství I + Maple (magisterské, později bakalářské) Chemické inženýrství II + Maple (magisterské, později bakalářské) Laboratoř chemického inženýrství (magisterské, později bakalářské) Chemicko-inženýrský projekt (magisterské, později bakalářské) Multifunkční chemické a biochemické mikrosystémy (magisterské) Hydromechanické a tepelné procesy I (magisterské) Hydromechanické a tepelné procesy II (magisterské) Potravinářské a biotechnologické procesy (bakalářské) Separační procesy v biotechnologiích (magisterské) Tepelné procesy (magisterské) Bioreaktory (doktorské) Laboratoř přípravy nano a mikromateriálů (bakalářské) Unit Operations of Chemical Engineering I (bakalářské) Separation processes (magisterské)
Navrhovatel se významně podílí na zkoušení Chemického inženýrství I nepřetržitě od roku 2008. Tento předmět navrhovatel v některých semestrech vyučoval vícekrát v jednom týdnu. c Tento předmět vyučovali vždy dva vyučující. Navrhovatel polovinu rozsahu předmětu. a
b
5
2.2.
Vedení studentů
Obhájené bakalářské práce:
7
Obhájené diplomové práce:
14
Obhájené doktorské dizertační práce:
2 Walter Schrott: Vývoj plastových mikrofluidních zařízení pro detekci biologických markerů, 2011 (jako oficiální školitel je veden prof. Hasal, protože navrhovatel nebyl v době zahájení řešení habilitován) Petr Červenka: Studium elektrokinetického transportu a elektrochemických jevů v mikrofluidních zařízeních, 2013
Současné doktorské dizertační práce:
6 Marek Nebyla: Studium reakčních a transportních jevů v mikrobiosystémech Jiří Čech: Studium enzymových reakcí v mikrosystémech se segmentovaným tokem Rudolf Flittner: Studium mechaniky tekutin v mikrofluidních čipech řízených elektrickým polem Tereza Skybová: Matematické modelování bioreaktorů pro odbarvování odpadních vod (školitel specialista) Jiří Janouš: Studium dynamiky elektrických dvojvrstev v mikro-elektronických systémech (školitel specialista) Jaroslav Kotowski: Eletrodepozice kovových mikrostruktur (školitel specialista)
2.3.
Další aktivity spojené s pedagogickým působením
Člen zkušebních komisí pro státní závěrečné zkoušky bakalářského a magisterského studijního programu a pro státní doktorské zkoušky (VŠCHT). Člen komisí pro obhajoby doktorských dizertačních prací (VŠCHT, Slovenská technická univerzita v Bratislavě). Oponent magisterských diplomových prací studentů (VŠCHT). Oponent doktorských dizertačních prací (VŠCHT, Slovenská technická univerzita v Bratislavě). Od roku 2010 člen oborové rady doktorského studijního programu Chemické inženýrství (VŠCHT, Univerzita Pardubice). Jako školitel jsem vedl diplomovou i doktorskou práci Waltra Schrotta, který v roce 2007 obdržel cenu Werner von Siemens Excellence Award pro nejlepší diplomovou práci a v roce 2011 Cenu Jahn-Marie Lehna za chemii. 2.4.
Inovační přínos pro pedagogickou práci
1. Vytvoření předmětu Multifunkční chemické a biochemické mikrosystémy v rozsahu 2h přednášek týdně. Cílem předmětu je přiblížit studentům moderní problematiku mikrotechnologií a konkrétní aplikace využívající mikrofluidní a mikromaticová zařízení.
6
Předmět je v současné době vyučován jako povinně volitelný v magisterském studijním programu. Pro potřeby předmětu byl vytvořen soubor přednášek ve formátu PowerPoint. 2. Skripta pro potřeby předmětu Multifunkční chemické a biochemické mikrosystémy: M. Přibyl a kol.: Mikrofluidní zařízení – Experimentální aplikace a matematické modelování, VŠCHT v Praze, ISBN: 80-7080-614-1 (1. vyd., 2006), 978-80-7080-654-8 (2. vyd., 2007). 3. Vytvoření předmětu Tepelné procesy v rozsahu 2h přednášek a 1h cvičení. Předmět je zaměřen na popis a analýzu mechanizmů sdílení tepla v různých typech chemickoinženýrských systémů. Předmět je v současné době vyučován jako povinný v magisterském studijním programu. Pro potřeby předmětu byl vytvořen soubor přednášek ve formátu pdf a soubor řešených úloh ze sdílení tepla. Většina úloh je řešena pomocí simulačních programů. Vytvoření předmětu bylo podpořeno projektem OPPA. 4. Inovace předmětu Separační procesy v biotechnologiích v rozsahu 2h přednášek a 1h cvičení. V rámci předmětu jsou probírány tradiční i moderní metody používané pro získávání biotechnologických produktů. Předmět je v současné době vyučován jako povinně volitelný v magisterském studijním programu. Pro potřeby předmětu byl vytvořen soubor přednášek ve formátu pdf a soubor řešených problémů typických pro separace biotechnologických produktů. 5. Vytvoření jedné poloviny nového předmětu Separation Processes určeného pro studenty mezinárodního programu Erasmus-Mundus. Cílem předmětu je seznámit studenty s principy nejčastěji využívaných separačních procesů v technologické praxi. Pro potřeby předmětu byl vytvořen soubor přednášek ve formátu PowerPoint a soubor řešených problémů typických pro separační technologie. 6. Zásadní inovace kapitol o sdílení tepla ve skriptech: Schreiberová Lenka a kol., Chemické inženýrství I, VŠCHT Praha, 2011, ISBN: 978-80-7080-778-1. 7. Vytvoření kapitoly o teorii podobnosti do nových skript Chemické inženýrství II, jejichž vydání je plánováno na rok 2014. 8. Vytvoření několika laboratorních prací pro předmět Laboratoř přípravy nano a mikromateriálů. Tento předmět je povinný v bakalářském studijním programu. V naší laboratoři jsou studenti seznámeni s výrobou mikrofluidních struktur a čipů, a též s jejich charakterizací. Pro potřeby předmětu byly připraveny laboratorní návody a sestrojeny experimentální aparatury. 9. Vytvoření jedné poloviny předmětů Hydromechanické a tepelné procesy I a II v rozsahu 2 h přednášek týdně a 2h respektive 1h cvičení týdně. Oba předměty byly vyučovány jako povinné respektive povinně volitelné v magisterském studiu. V současné době však tyto předměty vyučovány nejsou z důvodu další inovace magisterského studijního programu. Pedagogický projekt
2.5.
Od nástupu na pozici odborného asistenta navrhovatel soustavně rozvíjí své pedagogické aktivity. Pro svou budoucí pedagogickou činnost na Ústavu chemického inženýrství si navrhovatel stanovuje tři cíle:
zdokonalovat a inovovat předměty bakalářských, magisterských a doktorských studijních programů zajišťovaných naším ústavem, vytvořit zcela nový předmět s pracovním názvem Studium a analýza biologických pochodů technikami chemického inženýrství, který by významným způsobem obohatil stávající magisterský studijní obor Chemické inženýrství a bioinženýrství zajišťovaný naším ústavem, věnovat se soustavné výchově a vzdělávání studentů specializace chemického inženýrství a přinášet progresivní témata diplomových a dizertačních prací. 7
Ústav chemického inženýrství se významným způsobem podílí na výuce dvou bakalářských studijních oborů: Procesní inženýrství a management a Nano a mikrotechnologie v chemickém inženýrství. Jedním ze základních předmětů je Chemické inženýrství (I. a II.) včetně anglické verze předmětu Unit operations of chemical engineering (I. a II.). Navrhovatel se bude i nadále věnovat přednášení předmětu v obou jazycích a vedení seminářů. Pracovat bude též na zdokonalování obsahu předmětu i výukových pomůcek. Hlavním aktivitou navrhovatele v nejbližším období je podíl na zkompletování a vydání skript pro předmět Chemické inženýrství II. Dalším bakalářským předmětem, jehož zavádění se navrhovatel účastní, je Laboratoř přípravy nano a mikromateriálů. V naší skupině vznikly tři laboratorní práce zaměřené na výrobu a charakterizaci mikrofluidních čipů. Laboratoře byly vyučovány poprvé v zimním semestru akademického roku 2013/2014 a v následujícím období budou odstraněny drobné nedostatky a zdokonaleny laboratorní návody. V magisterském studijním oboru Chemické inženýrství a bioinženýrství bude navrhovatel i nadále zajišťovat výuku předmětů Separační procesy v biotechnologiích a Tepelné procesy. Stejně jako doposud, výukové materiály budou průběžně aktualizovány, aby byly zohledněny aktuální trendy v problematice a potřeby studentů. Hlavním úkolem navrhovatele v nejbližším období bude vznik specializačního předmětu Studium a analýza biologických pochodů technikami chemického inženýrství, o kterém je detailněji pojednáno níže. V doktorském studiu navrhovatel zajišťuje předmět Bioreaktory. V uplynulých letech byl předmět inovován, aby doktorandi získali širší přehled o důležitých aspektech bioinženýrských procesů. Řada absolventů, kteří na Ústav chemického inženýrství přicházejí studovat v doktorském programu, má poměrně povrchní znalosti o biologických a biochemických pochodech v živých organizmech. Proto náplní předmětu bioreaktory nejsou pouze tradiční témata jako mikrobiální růst, enzymová katalýza, separace biologických produktů nebo konstrukce bioreaktorů, ale též okruhy se zaměřením na molekulární buněčnou biologii, mikrobiální interakce, chemotaxi nebo DNA technologie. Obsah předmětu bude i v následujícím období pravidelně aktualizován. V akademickém roce 2013/2014 studuje nový bakalářský obor Nano a mikrotechnologie v chemickém inženýrství 44 studentů v 1. ročníku, 25 studentů ve 2. ročníku a 18 studentů ve 3. ročníku. Snahou pedagogů Ústavu chemického inženýrství je přilákání co nejvyššího počtu absolventů ke studiu magisterskému oboru Chemické inženýrství a bioinženýrství. Abychom toho dosáhli, je nutné zatraktivnit skladbu vyučovaných předmětů a přizpůsobit ji potřebám studentů s mikro- a nanotechnologickým základem. Jedním z nových předmětů bude biologicky orientovaný kurz s pracovním názvem Studium a analýza biologických pochodů technikami chemického inženýrství, jehož bude navrhovatel garantem. V rámci předmětu (předpokládaný rozsah 2h přednášek a 1h cvičení) bude přednesen inženýrský, fyzikální a biologický nebo biochemický základ vybraných problémů souvisejících s transportem a vzájemnými interakcemi biologických molekul, buněk a tkání. Předmět bude rozčleněn na čtyři základní části: (i) problematika difúzního transportu v biologických systémech, (ii) problematika difúzního transportu kombinovaného s povrchovými či objemovými reakčními interakcemi, (iii) problematika kombinovaného difúzně-konvektivního transportu a (iv) problematika interakce biologických systémů s elektrickými poli. Na cvičeních budou odvozovány a řešeny matematické modely nejrůznějších biologických reakčně-transportních systémů, například (i) difúze kyslíku v nádorovém útvaru, hypoxie, (ii) neustálená difúze růstového faktoru ve vrstvě tkáně, (iii) mechanizmus vytváření párových orgánů, (iv) model šíření bakteriální infekce v přítomnosti leukocytů a chemoatraktantu, (v) režim dávkování růstového faktoru do bioreaktoru s imobilizovanými hepatocyty, (vi) vliv konvekce na rychlost šíření koncentračních vln růstového faktoru ve vrstvě tkáně, (vii) Hodgkin–Huxleyův model šíření akčního potenciálu podél axonu, (viii) model srdeční aktivity, EKG, (ix) smršťování pojivových tkání aj. Hlavním cílem vytvářeného předmětu je naučit studenty inženýrskému přístupu k řešení praktických problémů souvisejících s vývojovými procesy v organizmu, reakcemi organizmu na vnější stimul, dávkováním léčiv a jejich pronikání do tkání nebo patologickými stavy organizmu. Domnívám se, že obsah předmětu, který částečně staví na výzkumných aktivitách navrhovatele, bude pro studenty užitečný a atraktivní. 8
K nezbytným základům vědecké práce patří bezesporu individuální práce se studenty. Myšlení a invence studentů přináší jejich školiteli inspiraci pro další vědeckou činnost. Navrhovatel se proto i nadále bude věnovat vzdělávání studentů bakalářského, magisterského a doktorandského studia na Ústavu chemického inženýrství. V současné době navrhovatel nabízí studentům vědeckou činnost v oblasti mikrofluidiky, konkrétně v oblastech elektrokinetického transportu, elektrochemické kinetiky a enzymových mikroreaktorů. Navrhovatel též zapojuje studenty do řešení dílčích úloh z oblasti mezibuněčné komunikace. Charakter vědeckých prací studentů se vždy odvíjí od jejich schopnosti danou problematiku řešit (typ studia) a osobních preferencí (teoretická, experimentální nebo kombinovaná práce).
9
3. Vědecká aktivita 3.1.
Přehled vědecko-výzkumných a inovačních aktivit
Přehled publikačních aktivit, účasti na konferencích, grantových projektech, udělených patentech a technické realizační činnosti Aktivita
Počet
Z toho ve světovém jazyce
SCI*
Suma IF
1.
Vědecké práce v impaktovaných časopisech
41
41
194
92,954
2.
Vědecké práce v neimpaktovaných časopisech s recenzním řízením
5
5
-
-
3.
Kapitoly v monografiích, monografie
1
1
-
-
4.
Články v časopisech bez recenzního řízení, články ve sbornících
103
83
-
-
CELKEM 1 - 4
150
130
*Science Citation Index - suma citací bez autocitací Aktivita
Počet
5.
Osobně přednesené přednášky v zahraničí a na mezinárodních konferencích
31
6.
Spoluautorství ostatních přednášek a posterů na mezinárodních konferencích
68
7.
Osobně přednesené přednášky v ČR a na národních konferencích
15
8.
Spoluautorství ostatních přednášek a posterů na národních konferencích
19
CELKEM 5 - 8
133
9.
Odpovědný řešitel zahraničních grantů
0
10.
Odpovědný řešitel domácích grantů
4
11.
Spoluřešitel zahraničních grantů
0
12.
Spoluřešitel domácích grantů
1
CELKEM 9 - 12
5
13.
Udělené evropské nebo mezinárodní patenty (EPO, WIPO), patenty USA a Japonska
0
14.
Udělené české nebo jiné národní patenty, které jsou využívány na základě platné licenční smlouvy
0
15.
Udělené české nebo jiné národní patenty, které jsou využívány jen vlastníkem patentu, nebo nejsou využívány
0
16.
Autorství realizovaného komplexního technického díla s udaným společenským přínosem
0 10
17.
Poloprovozy, ověřené technologie
0
18.
Užitné a průmyslové vzory, prototypy, funkční vzorky, software
11
CELKEM 13 - 18
11
3.2. 1.
Vědecké práce v impaktovaných časopisech Janous, J., Cech, J., Beranek, P., Pribyl, M., Snita, D.: AC electric sensing of slug-flow properties with exposed gold microelectrodes. Journal of Micromechanics and Microengineering 24(1): Art. 015002, 2014. IF 1,790, počet citací 0 (s vyloučením autocitací 0). Citováno v: necitováno
2.
Nebyla, M., Pribyl, M., Schreiber, I.: Oscillatory Flow Accelerates Autocrine Signaling due to Nonlinear Effect of Convection on Receptor-Related Actions. Biophysical Journal 105(3): 818-828, 2013. IF 3,668, 0 (0). Citováno v: necitováno
3.
Lamborova, V., Fiser, J., Slouka, Z., Lindner, J., Snita, D., Pribyl, M.: Development of a dipstick electrochemical micro-biosensor: Stability of protein layers on gold. Microelectronic Engineering 111: 289-293, 2013. IF 1,224, 0 (0). Citováno v: necitováno
4.
Hrdlicka, J., Cervenka, P., Jindra, T., Pribyl, M., Snita, D.: Mathematical Modeling of Traveling Wave Micropumps: Analysis of Energy Transformation. IEEE Transactions on Industry Applications 49(2): 685-690, 2013. IF 1,672, 0 (0). Citováno v: necitováno
5.
Hadac, O., Schreiber, I., Pribyl, M.: On the origin of bistability in the Stage 2 of the HuangFerrell model of the MAPK signaling. Journal of Chemical Physics 138(6): Art. 065102, 2013. IF 3,164, 1 (1). Citováno v: Hadac O, Schreiber I: Russian Journal of Physical Chemistry A 87 (13), 2160-2165, 2013.
6.
Cech, J., Pribyl, M., Snita, D.: Three-phase slug flow in microchips can provide beneficial reaction conditions for enzyme liquid-liquid reactions. Biomicrofluidics 7(5): Art. 054103, 2013. IF 3,385, 0 (0). Citováno v: necitováno
7.
Skybova, T., Pribyl, M., Pocedic, J., Hasal, P.: Mathematical modeling of wastewater decolorization in a trickle-bed bioreactor. Journal of Biotechnology 157(4): 512-523, 2012. IF 3,385, 4 (4). Citováno v: Chiavola A: Water Environment Research 85 (10), 1581-1600, 2013. Choi J, Islam MS, Tumpa F et al.: Water Environment Research 85 (10), 1060-1091, 2013. Medina-Moreno SA, Perez-Cadena R, Jimenez-Gonzalez A et al.: Bioresource Technology 123, 452-462, 2012. Rodriguez-Escales P, Borras E, Sarra M et al.: Water Air and Soil Pollution 224 (2), 2013.
8.
Nebyla, M., Pribyl, M., Schreiber, I.: Effects of Convective Transport on Chemical Signal Propagation in Epithelia. Biophysical Journal 102(5): 990-1000, 2012. IF 3,668, 1 (0). Citováno v: Nebyla M, Pribyl M, Schreiber I: Biophysical Journal 105 (3), 818-828, 2013.
11
9.
Janous, J., Beranek, P., Pribyl, M., Snita, D.: Development of a conductivity microsensor considering electric double layer capacity. Microelectronic Engineering 97: 387-390, 2012. IF 1,224, 2 (1). Citováno v: Janous J, Cech J, Beranek P et al.: Journal of Micromechanics and Microengineering 24 (1), Art. 015002, 2014. Kotowski J, Navratil V, Slouka Z et al.: Microelectronic Engineering 110, 441-445, 2013.
10.
Cervenka, P., Schrott, W., Slouka, Z., Pribyl, M., Snita, D.: Hybrid gold-copper stamp for rapid fabrication of microchips. Microelectronic Engineering 98: 548-551, 2012. IF 1,224, 0 (0). Citováno v: necitováno
11.
Cervenka, P., Hrdlicka, J., Pribyl, M., Snita, D.: Kinetic mechanism for modeling of electrochemical reactions. Physical Review E 85(4): Art. 041505, 2012. IF 2,313, 2 (1). Citováno v: Hrdlicka J, Cervenka P, Jindra T et al.: IEEE Transactions on Industry Applications 49 (2), 685-690, 2013. Preiss U, Borukhovich E, Alemayehu N et al.: Modelling and Simulation in Materials Science and Engineering 21 (7), Art. 074006, 2013.
12.
Cech, J., Schrott, W., Slouka, Z., Pribyl, M., Broz, M., Kuncova, G., Snita, D.: Enzyme hydrolysis of soybean oil in a slug flow microsystem. Biochemical Engineering Journal 67, 194-202, 2012. IF 2,579, 2 (0). Citováno v: Cech J, Pribyl M, Snita D: Biomicrofluidics 7 (5), Art. 054103, 2013. Janous J, Cech J, Beranek P et al.: Journal of Micromechanics and Microengineering 24 (1), Art. 015002, 2014.
13.
Svoboda, M., Kratochvila, J., Lindner, J., Pribyl, M., Snita, D.: Dynamic behaviour of a diffusion layer around a cation-exchange membrane in an external electric field. Microelectronic Engineering 88(8): 1789-1791, 2011. IF 1,224, 1 (1). Citováno v: Yuan BY, Li W, Zhang XY et al.: Microelectronic Engineering 107 37-41, 2013.
14.
Schrott, W., Nebyla, M., Pribyl, M., Snita, D.: Detection of immunoglobulins in a laser induced fluorescence system utilizing polydimethysiloxane microchips with advanced surface and optical properties. Biomicrofluidics 5(1): Art. 014101, 2011. IF 3,385, 6 (5). Citováno v: Han HL, Livingston E, Chen XY: Analytical Chemistry 83 (21), 8184-8191, 2011. Kar P, Shankar K: Journal of Nanoscience and Nanotechnology 13 (7), 4473-4496, 2013. Lamborova V, Fiser J, Slouka Z et al.: Microelectronic Engineering 111, 289-293, 2013. Madadi H, Casals-Terre J: Microsystem Technologies-Micro-and Nanosystems-Information Storage and Processing Systems 19 (1), 143-150, 2013. Zhao W, Zhang L, Jing WW et al.: Biomicrofluidics 7 (1), Art. 011101, 2013. Zhou JW, Khodakov DA, Ellis AV et al.: Electrophoresis 33 (1), 89-104, 2012.
15.
Schrott, W., Nebyla, M., Meisterova, L., Pribyl, M.: Fast ferritin immunoassay on PDMS microchips. Chemical Papers 65(2): 246-250, 2011. IF 0,879, 1 (1). Citováno v: Yunphuttha C, Bunjongpru W, Porntheeraphat S et al.: Chemical Papers 66 (12), 1137-1145, 2012.
16.
Hrdlicka, J., Cervenka, P., Pribyl, M., Snita, D.: Zig-zag arrangement of four electrodes for AC electro-osmotic micropumps. Physical Review E 84(1): Art. 016307, 2011. IF 2,313, 3 (1). Citováno v: Balasuriya S, Finn MD: Physical Review Letters 108 (24), Art. 244503, 2012. Cervenka P, Hrdlicka J, Pribyl M et al.: Physical Review E 85 (4), Art. 041505, 2012. Hrdlicka J, Cervenka P, Jindra T et al.: IEEE Transactions on Industry Applications 49 (2), 685-690, 2013.
17.
Svoboda, M., Slouka, Z., Schrott, W., Cervenka, P., Pribyl, M., Snita, D.: Fabrication of plastic microchips with gold microelectrodes using techniques of sacrificed substrate and 12
thermally activated solvent bonding. Microelectronic Engineering 87(5-8): 1590-1593, 2010. IF 1,224, 8 (2). Citováno v: Cech J, Pribyl M, Snita D: Biomicrofluidics 7 (5), Art. 054103, 2013. Cech J, Schrott W, Slouka Z et al.: Biochemical Engineering Journal 67, 194-202, 2012. Cervenka P, Schrott W, Slouka Z et al.: Microelectronic Engineering 98, 548-551, 2012. Fu LM, Ju WJ, Yang RJ et al.: Microfluidics and Nanofluidics 14 (3-4), 479-487, 2013. Janous J, Beranek P, Pribyl M et al.: Microelectronic Engineering 97, 387-390, 2012. Janous J, Cech J, Beranek P et al.: Journal of Micromechanics and Microengineering 24 (1), Art. 015002, 2014. Svoboda M, Kratochvila J, Lindner J et al.: Microelectronic Engineering 88 (8), 1789-1791, 2011. Wang YN, Yang RJ, Ju WJ et al.: Biomicrofluidics 6 (3), Art. 034111, 2012.
18.
Svoboda, M., Schrott, W., Slouka, Z., Pribyl, M., Snita, D.: Plastic microfluidic systems made by imprinting against an epoxy stamp. Microelectronic Engineering 87(5-8): 15271530, 2010. IF 1,224, 7 (6). Citováno v: Baraket A, Zine N, Lee M et al.: Microelectronic Engineering 111, 332-338, 2013. Cervenka P, Schrott W, Slouka Z et al.: Microelectronic Engineering 98, 548-551, 2012. Kuo SM, Yang CC, Shiea J et al.: Sensors and Actuators B-Chemical 156 (1), 156-161, 2011. Marasso SL, Canavese G, Cocuzza M: Microelectronic Engineering 88 (8), 2322-2324, 2011. Metwally K, Robert L, Salut R et al.: Microsystem Technologies-Micro-and Nanosystems-Information Storage and Processing Systems 18 (11), 1863-1869, 2012. Novak R, Ranu N, Mathies RA: Lab on a Chip 13 (8), 1468-1471, 2013. Wang YN, Yang RJ, Ju WJ et al.: Biomicrofluidics 6 (3), Art. 034111, 2012.
19.
Schrott, W., Svoboda, M., Slouka, Z., Pribyl, M., Snita, D.: PDMS microfluidic chips prepared by a novel casting and pre-polymerization method. Microelectronic Engineering 87(5-8): 1600-1602, 2010. IF 1,224, 10 (6). Citováno v: Cech J, Schrott W, Slouka Z et al.: Biochemical Engineering Journal 67, 194-202, 2012. Cervenka P, Schrott W, Slouka Z et al.: Microelectronic Engineering 98, 548-551, 2012. Ewing KJ, Gibson D, Sanghera J et al.: Analytical Chemistry 85 (20), 9508-9513, 2013. Ewing KJ, Gibson D, Sanghera J et al.: Analytica Chimica Acta 776 64-68, 2013. Chumbimuni-Torres KY, Coronado RE, Mfuh AM et al.: Rsc Advances 1 (4), 706-714, 2011. Kuo SM, Yang CC, Shiea J et al.: Sensors and Actuators B-Chemical 156 (1), 156-161, 2011. Liu F, Tan KB, Malar P et al.: Microelectronic Engineering 102, 36-39, 2013. Shim JU, Patil SN, Hodgkinson JT et al.: Lab on a Chip 11 (6), 1132-1137, 2011. Schrott W, Nebyla M, Meisterova L et al.: Chemical Papers 65 (2), 246-250, 2011. Schrott W, Nebyla M, Pribyl M et al.: Biomicrofluidics 5 (1), Art. 014101, 2011.
20.
Sevcikova, H., Cejkova, J., Krausova, L., Pribyl, M., Stepanek, F., Marek, M.: A new traveling wave phenomenon of Dictyostelium in the presence of cAMP. Physica DNonlinear Phenomena 239(11): 879-888, 2010. IF 1,669, 4 (4). Citováno v: Cejkova J: Chemicke Listy 107 (7), 565-572, 2013. Grancic P, Stepanek F: Physical Review E 84 (2), Art. 021925, 2011. Steinbock O: Physica D-Nonlinear Phenomena 239 (11), 727-728, 2010. Wilson BP, Yliniemi K, Murtomaki L et al.: Electrochimica Acta 55 (15), 4669-4675, 2010.
21.
Pribyl, M., Adamiak, K.: Numerical Models for AC Electroosmotic Micropumps. IEEE Transactions on Industry Applications 46(6): 2179-2189, 2010. IF 1,672, 3 (2). Citováno v: Hossain R, Adamiak K: Journal of Electrostatics 71 (5), 829-838, 2013. Hrdlicka J, Cervenka P, Pribyl M et al.: Physical Review E 84 (1), Art. 016307, 2011. Chen B, Chao K, Wu J: Zhongguo Jixie Gongcheng/China Mechanical Engineering 23 (5), 590-594, 2012.
22.
Hrdlicka, J., Cervenka, P., Pribyl, M., Snita, D.: Mathematical modeling of AC electroosmosis in microfluidic and nanofluidic chips using equilibrium and non-equilibrium approaches. Journal of Applied Electrochemistry 40(5): 967-980, 2010. IF 1,836, 10 (4). Citováno v: Cervenka P, Hrdlicka J, Pribyl M et al.: IEEE Transactions on Industry Applications 46 (5), 1679-1691, 2010. Hossain R, Adamiak K: Journal of Electrostatics 71 (5), 829-838, 2013. Hrdlicka J, Cervenka P, Jindra T et al.: IEEE Transactions on Industry Applications 49 (2), 685-690, 2013. 13
Hrdlicka J, Cervenka P, Pribyl M et al.: Physical Review E 84 (1), Art. 016307, 2011. Chen B, Chen H, Wu JK: Applied Mathematics and Mechanics-English Edition 34 (3), 297-308, 2013. Pribyl M, Adamiak K: IEEE Transactions on Industry Applications 46 (6), 2179-2189, 2010. Yaroshchuk AE: Advances in Colloid and Interface Science 168 (1-2), 278-291, 2011. Chen B, Chao K, Wu J: Zhongguo Jixie Gongcheng/China Mechanical Engineering 22 (3), 253-256, 2011. Chen B, Chao K, Wu J: Zhongguo Jixie Gongcheng/China Mechanical Engineering 23 (5), 590-594, 2012. Chen B, Wu J: Lixue Xuebao/Chinese Journal of Theoretical and Applied Mechanics 44 (2), 245-251, 2012.
23.
Cervenka, P., Hrdlicka, J., Pribyl, M., Snita, D.: Toward High Net Velocities in AC Electroosmotic Micropumps Based on Asymmetric Coplanar Electrodes. IEEE Transactions on Industry Applications 46(5): 1679-1691, 2010. IF 1,672, 5 (1). Citováno v: Cervenka P, Hrdlicka J, Pribyl M et al.: Physical Review E 85 (4), Art. 041505, 2012. Hossain R, Adamiak K: Journal of Electrostatics 71 (5), 829-838, 2013. Hrdlicka J, Cervenka P, Jindra T et al.: IEEE Transactions on Industry Applications 49 (2), 685-690, 2013. Hrdlicka J, Cervenka P, Pribyl M et al.: Physical Review E 84 (1), Art. 016307, 2011. Pribyl M, Adamiak K: IEEE Transactions on Industry Applications 46 (6), 2179-2189, 2010.
24.
Schrott, W., Slouka, Z., Cervenka, P., Ston, J., Nebyla, M., Pribyl, M., Snita, D.: Study on surface properties of PDMS microfluidic chips treated with albumin. Biomicrofluidics 3(4): Art. 044101, 2009. IF 3,385, 9 (7). Citováno v: Bubendorfer AJ, Ingham B, Kennedy JV et al.: Lab on a Chip 13 (22), 4312-4316, 2013. Crabtree HJ, Lauzon J, Morrissey YC et al.: Microfluidics and Nanofluidics 13 (3), 383-398, 2012. Salim M, McArthur SL, Vaidyanathan S et al.: Molecular Biosystems 7 (1), 101-115, 2011. Sankaran JS, Goyal S, Kahsai WT et al.: Advanced Science Letters 4 (11-12), 3464-3469, 2011. Sen Y-H, Jain T, Aguilar CA et al.: Lab on a Chip 12 (6), 1094-1101, 2012. Schrott W, Nebyla M, Pribyl M et al.: Biomicrofluidics 5 (1), Art. 014101, 2011. Svoboda M, Schrott W, Slouka Z et al.: Microelectronic Engineering 87 (5-8), 1527-1530, 2010. van den Brink FTG, Gool E, Frimat J-P et al.: Electrophoresis 32 (22), 3094-3100, 2011. Yin Y, Zhang Y, Chen X et al.: Polymer Engineering and Science 51 (6), 1033-1040, 2011.
25.
Cervenka, P., Pribyl, M., Snita, D.: Numerical study on AC electroosmosis in microfluidic channels. Microelectronic Engineering 86(4-6): 1333-1336, 2009. IF 1,224, 5 (1). Citováno v: Cervenka P, Hrdlicka J, Pribyl M et al.: IEEE Transactions on Industry Applications 46 (5), 1679-1691, 2010. Hossain R, Adamiak K: Journal of Electrostatics 71 (5), 829-838, 2013. Hrdlicka J, Cervenka P, Pribyl M et al.: Journal of Applied Electrochemistry 40 (5), 967-980, 2010. Hrdlicka J, Cervenka P, Pribyl M et al.: Physical Review E 84 (1), Art. 016307, 2011. Pribyl M, Adamiak K: IEEE Transactions on Industry Applications 46 (6), 2179-2189, 2010.
26.
Schrott, W., Pribyl, M., Stepanek, J., Snita, D.: Electro-osmotic characteristics of Polystyrene microchips - Experiments and modeling. Microelectronic Engineering 85(5-6): 1100-1103, 2008. IF 1,224, 4 (2). Citováno v: Bouzek K, Jiricny V, Kodym R et al.: Electrochimica Acta 55 (27), 8172-8181, 2010. Sankaran JS, Goyal S, Kahsai WT et al.: Advanced Science Letters 4 (11-12), 3464-3469, 2011. Schrott W, Slouka Z, Cervenka P et al.: Biomicrofluidics 3 (4), Art. 044101, 2009. Svoboda M, Schrott W, Slouka Z et al.: Microelectronic Engineering 87 (5-8), 1527-1530, 2010.
27.
Postler, T., Slouka, Z., Svoboda, M., Pribyl, M., Snita, D.: Parametrical studies of electroosmotic transport characteristics in submicrometer channels. Journal of Colloid and Interface Science 320(1): 321-332, 2008. IF 3,172, 25 (22). Citováno v: Slouka Z, Senapati S, Yan Y et al.: Langmuir 29 (26), 8275-8283, 2013. Nandigana VVR, Aluru NR: Electrochimica Acta 105, 514-523, 2013. Kung CF, Wang CY, Chang CC: Electrophoresis 34 (22-23), 3133-3140, 2013. Kong GP, Zheng X, Li ZH: Shuidonglixue Yanjiu yu Jinzhan/Chinese Journal of Hydrodynamics Ser. A 28 (1), 56-62, 2013. Hossain R, Adamiak K: Journal of Electrostatics 71 (5), 829-838, 2013. Bera S, Bhattacharyya S: International Journal of Engineering Science 62 165-176, 2013. Yaroshchuk A: Microfluidics and Nanofluidics 12 (1-4), 615-624, 2012. Yaroshchuk A: Advances in Colloid and Interface Science 183-184 68-81, 2012. Nandigana VVR, Aluru NR: Journal of Colloid and Interface Science 384 (1), 162-171, 2012. 14
Chein R, Chung B: International Journal of Electrochemical Science 7 (12), 12159-12180, 2012. Biscombe CJC, Davidson MR, Harvie DJE: Journal of Colloid and Interface Science 365 (1), 16-27, 2012. Biscombe CJC, Davidson MR, Harvie DJE: Microfluidics and Nanofluidics 13 (3), 481-490, 2012. Cervenka P, Hrdlicka J, Pribyl M et al.: Physical Review E 85 (4), Art. 041505, 2012. Yaroshchuk AE: Advances in Colloid and Interface Science 168 (1-2), 278-291, 2011. Yaroshchuk A, Zholkovskiy E, Pogodin S et al.: Langmuir 27 (18), 11710-11721, 2011. Suss ME, Mani A, Zangle TA et al.: Sensors and Actuators, A: Physical 165 (2), 310-315, 2011. Berry JD, Davidson MR, Bharti RP et al.: Biomicrofluidics 5 (4), Art. 044102, 2011. Zangle TA, Mani A, Santiago JG: Chemical Society Reviews 39 (3), 1014-1035, 2010. Strickland DG, Suss ME, Zangle TA et al.: Sensors and Actuators, B: Chemical 143 (2), 795-798, 2010. Hrdlička J, Červenka P, Přibyl M et al.: Journal of Applied Electrochemistry 40 (5), 967-980, 2010. Bouzek K, Jiřičný V, Kodým R et al.: Electrochimica Acta 55 (27), 8172-8181, 2010. Schrott W, Slouka Z, Cervenka P et al.: Biomicrofluidics 3 (4), Art. 044101, 2009. Mani A, Zangle TA, Santiago JG: Langmuir 25 (6), 3898-3908, 2009. Choi YS, Kim SJ: Journal of Colloid and Interface Science 333 (2), 672-678, 2009. Cao F, Gao F, Chen M et al.: Dongnan Daxue Xuebao (Ziran Kexue Ban)/Journal of Southeast University (Natural Science Edition) 39 (5), 913-917, 2009.
28.
Stepanek, J., Pribyl, M., Snita, D., Marek, M.: Microfluidic chip for fast bioassays evaluation of binding parameters. Biomicrofluidics 1(2): Art. 024101, 2007. IF 3,385, 2 (1). Citováno v: Schrott W, Nebyla M, Meisterova L et al.: Chemical Papers 65 (2), 246-250, 2011. Atalay YT, Witters D, Vermeir S et al.: Biomicrofluidics 3 (4), Art. 044103, 2009.
29.
Slouka, Z., Pribyl, M., Snita, D., Postler, T.: Transient behavior of an electrolytic diode. Physical Chemistry Chemical Physics 9(39): 5374-5381, 2007. IF 3,829, 10 (8). Citováno v: McNealy BE, Hertz JL: International Journal of Hydrogen Energy 38 (13), 5357-5366, 2013. Gabrielsson EO, Tybrandt K, Berggren M: Lab on a Chip 12 (14), 2507-2513, 2012. Senapati S, Basuray S, Slouka Z et al., in Microfluidics: Technologies and Applications, Topics in Current Chemistry 304, 153-169, 2011. Cheng L-J, Chang H-C: Biomicrofluidics 5 (4), Art. 046502, 2011. Han J-H, Kim KB, Bae JH et al.: Small 7 (18), 2629-2639, 2011. Roszol L, Lawson T, Koncz V et al.: Journal of Physical Chemistry B 114 (43), 13718-13725, 2010. Schrott W, Svoboda M, Slouka Z et al.: Microelectronic Engineering 86 (4-6), 1340-1342, 2009. Schrott W, Slouka Z, Cervenka P et al.: Biomicrofluidics 3 (4), Article Number: 044101, 2009. Park S, Chung TD, Kim HC: Microfluidics and Nanofluidics 6 (3), 315-331, 2009. Han J-H, Kim KB, Kim HC et al.: Angewandte Chemie-International Edition 48 (21), 3830-3833, 2009.
30.
Pribyl, M., Snita, D., Kubicek, M.: Adaptive mesh simulations of ionic systems in microcapillaries based on the estimation of transport times. Computers & Chemical Engineering 30(4): 674-685, 2006. IF 2,091, 3 (1). Citováno v: Schrott W, Pribyl M, Stepanek J et al.: Microelectronic Engineering 85 (5-6), 1100-1103, 2008. Alopaeus V, Laavi H, Aittamaa J: Computers & Chemical Engineering 32 (7), 1494-1506, 2008. Slouka Z, Pribyl M, Snita D et al.: Physical Chemistry Chemical Physics 9 (39), 5374-5381, 2007.
31.
Pribyl, M., Knapkova, V., Snita, D., Marek, M.: Modeling reaction-transport processes in a microcapillary biosensor for detection of human IgG. Microelectronic Engineering 83(4-9): 1660-1663, 2006. IF 1,224, 9 (2). Citováno v: Schrott W, Nebyla M, Pribyl M et al.: Biomicrofluidics 5 (1), Art. 014101, 2011. Schrott W, Nebyla M, Meisterova L et al.: Chemical Papers 65 (2), 246-250, 2011. Fu E, Nelson KE, Ramsey SA et al.: Analytical Chemistry 81 (9), 3407-3413, 2009. Cervenka P, Pribyl M, Snita D: Microelectronic Engineering 86 (4-6), 1333-1336, 2009. Schrott W, Pribyl M, Stepanek J et al.: Microelectronic Engineering 85 (5-6), 1100-1103, 2008. Postler T, Slouka Z, Svoboda M et al.: Journal of Colloid and Interface Science 320 (1), 321-332, 2008. Henares TG, Mizutani F, Hisamoto H: Analytica Chimica Acta 611 (1), 17-30, 2008. Stepanek J, Pribyl M, Snita D et al.: Biomicrofluidics 1 (2), Art. 024101, 2007. Slouka Z, Pribyl M, Snita D et al.: Physical Chemistry Chemical Physics 9 (39), 5374-5381, 2007.
32.
Pribyl, M., Snita, D., Marek, M.: Nonlinear phenomena and qualitative evaluation of risk of clogging in a capillary microreactor under imposed electric field. Chemical Engineering Journal 105(3): 99-109, 2005. IF 3,473, 11 (8). 15
Citováno v: Salic A, Tusek A, Zelic B: Journal of Applied Biomedicine 10 (3), 137-153, 2012. Rath D, Kumar S, Panda S: Materials Science & Engineering C-Materials for Biological Applications 32 (8), 2223-2229, 2012. Schrott W, Nebyla M, Meisterova L et al.: Chemical Papers 65 (2), 246-250, 2011. Wang G, Driskell JD, Hill AA et al., in Annual Review of Analytical Chemistry 3, 387-407, 2010. Bouzek K, Jiricny V, Kodym R et al.: Electrochimica Acta 55 (27), 8172-8181, 2010. Stepanek J, Pribyl M, Snita D et al.: Biomicrofluidics 1 (2), Art. 024101, 2007. Pribyl M, Snita D, Kubicek M: Computers & Chemical Engineering 30 (4), 674-685, 2006. Pribyl M, Knapkova V, Snita D et al.: Microelectronic Engineering 83 (4-9), 1660-1663, 2006. Pribyl M, Snita D, Marek M: Chemical Engineering Journal 105 (3), 99-109, 2005. Pribyl M, Knapkova V, Snita D et al.: Chemical Papers 59 (6A), 434-440, 2005. Chen T, Lei JD, Tong AJ: Luminescence 20 (4-5), 256-260, 2005.
33.
Pribyl, M., Knapkova, V., Snita, D., Marek, M.: Analysis of reaction-transport phenomena in a microfluidic system for the detection of IgG. Chemical Papers 59(6A): 434-440, 2005. IF 0,879, 4 (1). Citováno v: Schrott W, Nebyla M, Meisterova L et al.: Chemical Papers 65 (2), 246-250, 2011. Craven TJ, Rees JM, Zimmerman WB: Physics of Fluids 20 (4), Art. 043603, 2008. Stepanek J, Pribyl M, Snita D et al.: Biomicrofluidics 1 (2), Art. 024101, 2007. Pribyl M, Knapkova V, Snita D et al.: Microelectronic Engineering 83 (4-9), 1660-1663, 2006.
34.
Pribyl, M., Snita, D., Hasal, P., Marek, M.: Modeling of electric-field driven transport processes in microdevices for immunoassay. Chemical Engineering Journal 101(1-3): 303314, 2004. IF 3,473, 11 (5). Citováno v: Salic A, Tusek A, Zelic B: Journal of Applied Biomedicine 10 (3), 137-153, 2012. Rath D, Kumar S, Panda S: Materials Science & Engineering C-Materials for Biological Applications 32 (8), 2223-2229, 2012. Schrott W, Nebyla M, Meisterova L et al.: Chemical Papers 65 (2), 246-250, 2011. Wang G, Driskell JD, Hill AA et al., in Annual Review of Analytical Chemistry 3, 387-407, 2010. Bouzek K, Jiricny V, Kodym R et al.: Electrochimica Acta 55 (27), 8172-8181, 2010. Stepanek J, Pribyl M, Snita D et al.: Biomicrofluidics 1 (2), Art. 024101, 2007. Pribyl M, Snita D, Kubicek M: Computers & Chemical Engineering 30 (4), 674-685, 2006. Pribyl M, Knapkova V, Snita D et al.: Microelectronic Engineering 83 (4-9), 1660-1663, 2006. Pribyl M, Snita D, Marek M: Chemical Engineering Journal 105 (3), 99-109, 2005. Pribyl M, Knapkova V, Snita D et al.: Chemical Papers 59 (6A), 434-440, 2005. Chen T, Lei JD, Tong AJ: Luminescence 20 (4-5), 256-260, 2005.
35.
Pribyl, M., Muratov, C.B., Shvartsman, S.Y.: Transitions in the model of epithelial patterning. Developmental Dynamics 226(1): 155-159, 2003. IF 2,590, 8 (8). Citováno v: Gutiérrez J, St Laurent G, Urcuqui-Inchima S: Theoretical Biology and Medical Modelling 7 (1), Art. 7, 2010. Zartman JJ, Kanodia JS, Cheung LS et al.: Development 136 (17), 2903-2911, 2009. Giurumescu CA, Sternberg PW, Asthagiri AR: PLoS Computational Biology 5 (4), Art. e1000354, 2009. Cassman M, Arkin A, Doyle F et al., Systems biology: International research and development, 1-262, 2007. Salazar-Ciudad I: Journal of Experimental Zoology Part B: Molecular and Developmental Evolution 306 (2), 107125, 2006. Yakoby N, Bristow CA, Gouzman I et al.: IEE Proceedings Systems Biology 152 (4), 276-284, 2005. Shvartsman SY: AIChE Journal 51 (5), 1312-1318, 2005. Muratov CB, Shvartsman SY: Physica D: Nonlinear Phenomena 186 (1-2), 93-108, 2003.
36.
Pribyl, M., Muratov, C.B., Shvartsman, S.Y.: Long-range signal transmission in autocrine relays. Biophysical Journal 84(2): 883-896, 2003. IF 3,668, 29 (26). Citováno v: Nebyla M, Přibyl M, Schreiber I: Biophysical Journal 105 (3), 818-828, 2013. Müller WEG, Schröder HC, Markl JS et al.: Journal of Histochemistry and Cytochemistry 61 (11), 814-832, 2013. Przybyla L, Voldman J, Annual Review of Analytical Chemistry 5, 293-315, 2012. Nebyla M, Přibyl M, Schreiber I: Biophysical Journal 102 (5), 990-1000, 2012. Pismen LM, Simakov DSA: Physical Review E 84 (6), Art. 061917, 2011. Radhakrishnan K, Halász Á, Vlachos D et al.: Current Opinion in Biotechnology 21 (5), 677-682, 2010. Posta F, Chou T: Journal of Theoretical Biology 266 (1), 70-78, 2010. Muratov CB, Shvartsman SY: Mathematical Modelling of Natural Phenomena 5 (5), 46-63, 2010. Brezina V: Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences 365 (1551), 2363-2374, 2010. Muratov CB, Posta F, Shvartsman SY: Physical Biology 6 (1), Art. 016006, 2009. 16
Jiang LL, Zhou T, Perc M et al.: New Journal of Physics 11, Art. 103001, 2009. Posta F, Shvartsman SY, Muratov CB: Journal of Computational Physics 227 (19), 8622-8635, 2008. Muratov CB, Shvartsman SY: Multiscale Modeling and Simulation 7 (1), 44-61, 2008. Shuryak I, Sachs RK, Brenner DJ: Radiation Research 168 (6), 741-749, 2007. Muratov CB, Vanden-Eijnden E, Weinan E: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 104 (3), 702-707, 2007. Mayawala K, Vlachos DG, Edwards JS: Chemical Engineering Science 62 (18-20), 5222-5231, 2007. Coppey M, Berezhkovskii AM, Sealfon SC et al.: Biophysical Journal 93 (6), 1917-1922, 2007. Walker D, Wood S, Southgate J et al.: Journal of Theoretical Biology 242 (3), 774-789, 2006. Nikolić DL, Boettiger AN, Bar-Sagi D et al.: American Journal of Physiology - Cell Physiology 291 (1), C68-C75, 2006. Mayawala K, Vlachos DG, Edwards JS: Biophysical Chemistry 121 (3), 194-208, 2006. Miller JH, Zheng F, Jin S et al.: Radiation Research 163 (3), 337-342, 2005. Belyakov OV, Mitchell SA, Parikh D et al.: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 102 (40), 14203-14208, 2005. You L: Cell Biochemistry and Biophysics 40 (2), 167-184, 2004. Muratov CB, Shvartsman SY: Physical Review Letters 93 (11), Art. 118101, 2004. Maly IV, Lee RT, Lauffenburger DA: Annals of Biomedical Engineering 32 (10), 1319-1335, 2004. Haugh JM, Schneider IC: Biophysical Journal 86 (1 I), 589-598, 2004. Davey RE, Zandstra PW: Current Opinion in Hematology 11 (2), 95-101, 2004. Berezhkovskii AM, Batsilas L, Shvartsman SY: Biophysical Chemistry 107 (3), 221-227, 2004. Přibyl M, Muratov CB, Shvartsman SY: Biophysical Journal 84 (6), 3624-3635, 2003
37.
Pribyl, M., Muratov, C.B., Shvartsman, S.Y.: Discrete models of autocrine cell communication in epithelial layers. Biophysical Journal 84(6): 3624-3635, 2003. IF 3,668, 35 (32). Citováno v: Simakov DSA, Pismen LM: Physical Biology 10 (4), Art. 046001, 2013. O'Dea RD, King JR: Mathematical Medicine and Biology 30 (2), 95-113, 2013. Nebyla M, Přibyl M, Schreiber I: Biophysical Journal 105 (3), 818-828, 2013. Han F, Zhang B: Cell Biochemistry and Biophysics 65 (2), 163-172, 2013. Nebyla M, Přibyl M, Schreiber I: Biophysical Journal 102 (5), 990-1000, 2012. Gupta S, Basak TK, Chaudhuri S: International Journal of Medical Engineering and Informatics 4 (3), 231-243, 2012. Posta F, Chou T: Journal of Theoretical Biology 266 (1), 70-78, 2010. Muratov CB, Shvartsman SY: Mathematical Modelling of Natural Phenomena 5 (5), 46-63, 2010. Joslin EJ, Shankaran H, Opresko LK et al.: Molecular Biosystems 6 (7), 1293-1306, 2010. Zartman JJ, Kanodia JS, Cheung LS et al.: Development 136 (17), 2903-2911, 2009. Smallwood R: Wiley Interdisciplinary Reviews: Systems Biology and Medicine 1 (2), 191-201, 2009. Muratov CB, Posta F, Shvartsman SY: Physical Biology 6 (1), Art. 016006, 2009. Galle J, Hoffmann M, Aust G: Journal of Mathematical Biology 58 (1-2), 261-283, 2009. Yakoby N, Bristow CA, Gong D et al.: Developmental Cell 15 (5), 725-737, 2008. Posta F, Shvartsman SY, Muratov CB: Journal of Computational Physics 227 (19), 8622-8635, 2008. Muratov CB, Shvartsman SY: Multiscale Modeling and Simulation 7 (1), 44-61, 2008. Štěpánek J, Přibyl M, Šnita D et al.: Biomicrofluidics 1 (2), Art. 024101, 2007. Coppey M, Berezhkovskii AM, Sealfon SC et al.: Biophysical Journal 93 (6), 1917-1922, 2007. Cassman M, Arkin A, Doyle F et al., Systems biology: International research and development, 1-262, 2007. Sarkar R, Shaw AK, Ghosh M et al.: Journal of Photochemistry and Photobiology B: Biology 83 (3), 213-222, 2006. Reeves GT, Muratov CB, Schüpbach T et al.: Developmental Cell 11 (3), 289-300, 2006. Nikolić DL, Boettiger AN, Bar-Sagi D et al.: American Journal of Physiology - Cell Physiology 291 (1), C68-C75, 2006. Mayawala K, Vlachos DG, Edwards JS: Biophysical Chemistry 121 (3), 194-208, 2006. Levin M: Birth Defects Research Part C - Embryo Today: Reviews 78 (3), 191-223, 2006. Goentoro LA, Reeves GT, Kowal CP et al.: Developmental Cell 11 (2), 263-272, 2006. Giurumescu CA, Sternberg PW, Asthagiri AR: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 103 (5), 1331-1336, 2006. Esser AT, Smith KC, Weaver JC et al.: Developmental Dynamics 235 (8), 2144-2159, 2006. Yakoby N, Bristow CA, Gouzman I et al.: IEE Proceedings Systems Biology 152 (4), 276-284, 2005. Shvartsman SY: AIChE Journal 51 (5), 1312-1318, 2005. Nelson CM, Jean RP, Tan JL et al.: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 102 (33), 11594-11599, 2005. Möller J, Runborg O, Kevrekidis PG et al.: International Journal of Bifurcation and Chaos in Applied Sciences and Engineering 15 (3), 975-996, 2005. Maly IV, Lee RT, Lauffenburger DA: Annals of Biomedical Engineering 32 (10), 1319-1335, 2004. Davey RE, Zandstra PW: Current Opinion in Hematology 11 (2), 95-101, 2004. Berezhkovskii AM, Batsilas L, Shvartsman SY: Biophysical Chemistry 107 (3), 221-227, 2004. Levchenko A: Biotechnology and Bioengineering 84 (7), 773-782, 2003.
17
38.
Pribyl, M., Chmelikova, R., Hasal, P., Marek, M.: Penicillin G hydrolysis in an electromembrane reactor with immobilized penicillin G acylase. Enzyme and Microbial Technology 33(6): 793-801, 2003. IF 2,592, 10 (10). Citováno v: Žuža MG, Obradović BM, Knežević-Jugović ZD: Chemical Engineering and Technology 34 (10), 1706-1714, 2011. Volpato G, Rodrigues RC, Fernandez-Lafuente R: Current Medicinal Chemistry 17 (32), 3855-3873, 2010. Hasal P, Penížková R: Asia-Pacific Journal of Chemical Engineering 4 (3), 356-364, 2009. Zhang YW, Tan Q, Liu RJ et al.: Chinese Journal of Antibiotics 33 (7), 385-391, 2008. Bešter-Rogač M, Bončina M, Apelblat A et al.: Journal of Physical Chemistry B 111 (41), 11957-11967, 2007. Wang Z, Guo Y, Bao D et al.: Journal of Chemical Technology and Biotechnology 81 (4), 560-565, 2006. Kukul'a R, Hasal P, Schultz T et al.: Catalysis Today 118 (1-2), 104-112, 2006. Wang Z: Huagong Xuebao/Journal of Chemical Industry and Engineering (China) 56 (4), 563-569, 2005. Tměj F, Limbergová Z, Hasal P: Bioprocess and Biosystems Engineering 28 (2), 123-130, 2005. Kallenberg AI, Van Rantwijk F, Sheldon RA: Advanced Synthesis and Catalysis 347 (7-8), 905-926, 2005.
39.
Pribyl, M., Chmelikova, R., Hasal, P., Marek, M.: Dynamics of penicillin G hydrolysis in an electro-membrane reactor. Journal of Chemical Technology and Biotechnology 77(1): 51-62, 2002. IF 2,504, 7 (6). Citováno v: Hasal P, Penizkova R: Asia-Pacific Journal of Chemical Engineering 4 (3), 356-364, 2009. Zhang Y-w, Tan Q, Liu R-j et al.: Zhongguo Kangshengsu Zazhi 33 (7), 385-391, 2008. Bester-Rogac M, Boncina M, Apelblat Y et al.: Journal of Physical Chemistry B 111 (41), 11957-11967, 2007. Kukul'a R, Hasal P, Schultz T et al.: Catalysis Today 118 (1-2), 104-112, 2006. Tmej F, Limbergova Z, Hasal P: Bioprocess and Biosystems Engineering 28 (2), 123-130, 2005. Zadrazil A, Chmelikova R, Hasal P: Biotechnology Letters 25 (6), 485-490, 2003. Pribyl M, Chmelikova R, Hasal P et al.: Enzyme and Microbial Technology 33 (6), 793-801, 2003.
40.
Pribyl, M., Chmelikova, R., Hasal, P., Marek, M.: Modeling of hydrogel immobilized enzyme reactors with mass-transport enhancement by electric field. Chemical Engineering Science 56(2): 433-442, 2001. IF 2,386, 11 (10). Citováno v: Huang D, Guo S, Li T et al.: Clean-Soil Air Water 41 (4), 383-389, 2013. Hasal P, Penizkova R: Asia-Pacific Journal of Chemical Engineering 4 (3), 356-364, 2009. Shi L, Mueller S, Loffhagen N et al.: Microbial Biotechnology 1 (1), 53-61, 2008. Shi L, Mueller S, Harms H et al.: Environmental Geochemistry and Health 30 (2), 177-182, 2008. Wick LY, Shi L, Harms H: Electrochimica Acta 52 (10), 3441-3448, 2007. Bester-Rogac M, Boncina M, Apelblat Y et al.: Journal of Physical Chemistry B 111 (41), 11957-11967, 2007. Kukul'a R, Hasal P, Schultz T et al.: Catalysis Today 118 (1-2), 104-112, 2006. Tmej F, Limbergova Z, Hasal P: Bioprocess and Biosystems Engineering 28 (2), 123-130, 2005. Pribyl M, Chmelikova R, Hasal P et al.: Enzyme and Microbial Technology 33 (6), 793-801, 2003. Ohmori T, Yamamoto T, Endo A et al.: Kagaku Kogaku Ronbunshu 29 (3), 357-362, 2003. Tmej F, Hasal P, Limbergova Z et al.: Chemical Papers 55 (6), 339-344, 2001.
41.
Pribyl, M., Hasal, P., Marek, M.: Coupling of enzymatic penicillin hydrolysis with masstransport processes. Chemical and Biochemical Engineering Quarterly 12(3): 141-149, 1998. IF 0,569, 7 (4). Citováno v: Hasal P, Penizkova R: Asia-Pacific Journal of Chemical Engineering 4 (3), 356-364, 2009. Kukul'a R, Hasal P, Schultz T et al.: Catalysis Today 118 (1-2), 104-112, 2006. Tmej F, Limbergova Z, Hasal P: Bioprocess and Biosystems Engineering 28 (2), 123-130, 2005. Pribyl M, Chmelikova R, Hasal P et al.: Enzyme and Microbial Technology 33 (6), 793-801, 2003. Pribyl M, Chmelikova R, Hasal P et al.: Journal of Chemical Technology and Biotechnology 77 (1), 51-62, 2002. Tmej F, Hasal P, Limbergova Z et al.: Chemical Papers 55 (6), 339-344, 2001. Pribyl M, Chmelikova R, Hasal P et al.: Chemical Engineering Science 56 (2), 433-442, 2001.
3.3. 1.
Vědecké práce v neimpaktovaných časopisech s recenzním řízením Červenka, P., Hrdlička, J., Přibyl, M., Šnita, D.: Mathematical modeling of electrochemical cell involving novel kinetics description. Conference Record - IAS Annual Meeting (IEEE Industry Applications Society), Art. 6074292, 2011. ISSN: 0197-2618, DOI: 10.1109/IAS.2011.6074292. 18
2.
Hrdlička, J., Červenka, P., Přibyl, M., Šnita, D.: Mathematical modeling of traveling wave micropumps: Analysis of energy transformation. Conference Record - IAS Annual Meeting (IEEE Industry Applications Society), Art. 6074284, 2011. ISSN: 0197-2618, DOI: 10.1109/IAS.2011.6074284.
3.
Přibyl, M., Červenka, P., Hrdlička, J., Šnita, D.: Non-Equilibrium Modeling of AC Electroosmosis in Microfluidic Channels- Parametrical Studies. International Journal of Plasma Environmental Science and Technology 3(2): 146-150, 2009. ISSN: 1881-8692.
4.
Pribyl, M., Adamiak, K.: Numerical models for AC electro-osmotic micropumps. Conference Record - IAS Annual Meeting (IEEE Industry Applications Society), Art. 4658881, 2008. ISSN: 0197-2618, DOI: 10.1109/08IAS.2008.93.
5.
Slouka, Z., Přibyl, M., Lindner, J., Šnita, D., Marek, M.: Dynamical and stationary analysis of an electrolyte diode and comparison with experiments. Computer Aided Chemical Engineering 21(C): 291-296, 2006. ISSN: 1570-7946, DOI: 10.1016/S1570-7946(06)800611.
3.4. 1.
3.5.
Kapitoly v monografiích, monografie Pribyl, M., Snita, D., Marek, M.: Multiphysical Modeling of DC and AC Electroosmosis in Micro- and Nanosystems, in Recent Advances in Modelling and Simulation, Eds. G. Petrone and G. Cammarata, I-Tech Education and Publishing, Vienna, Austria, 501-522, 2008. ISBN: 978-3-902613-25-7. Články v časopisech bez recenzního řízení, články ve sbornících
1.
M. Přibyl, P. Hasal, M. Marek: Interakce enzymové reakce s procesy přenosu hmoty, Sborník konference CHISA 97, Srní, Česká republika, 13.-16. říjen 1997. CD-ROM.
2.
M. Přibyl, P. Hasal, Marek: Studium enzymové reakce v membránových reaktorech, Sborník 25. Konference SSCHE, Jasná, Slovensko, 25.-29. květen 1998. CD-ROM.
3.
P. Hasal, M. Přibyl, M. Marek: Coupling of Immobilised Enzyme Reactions with ElectroTransport Processes. Proceedings of ESBES-2 - 2nd European Symposium on Biochemical Engineering Science, Porto, Portugal, September 16-19, 138-146, 1998.
4.
M. Přibyl, P. Hasal and M. Marek: Dynamics of penicillin G hydrolysis in a periodically forced membrane reactor, Proceedings of 2nd European Congress on Chemical Engineering ECCE2, Montpellier, France, October 5-7, 499-506, 1999. ISBN: 2-910239-45-4.
5.
M. Přibyl, R. Chmelíková, P. Hasal a M. Marek: Studium enzymové reakce v membránovém bioreaktoru s vloženým elektrickým polem, Sborník konference CHISA 99, Srní, Česká republika, 18. až 21. říjen, 1999. CD-ROM.
6.
R. Chmelíková, M. Přibyl, P. Hasal a M. Marek: Experimentální studium kinetických a transportních parametrů enzymové reakce, Sborník konference CHISA 99, Srní, Česká republika, 18. až 21. říjen, 1999. CD-ROM.
7.
R. Chmelíková, M. Přibyl, P. Hasal and M. Marek: Reaction Kinetics of Penicillin G acylase: Comparison of Immobilized and Soluble Enzyme, Proceedings of 27th International Conference SSCHE, Tatranské Matliare, Slovensko, May 22-26, 2000. CDROM, ISBN: 1-80-227-1350-3.
19
8.
M. Přibyl, R. Chmelíková, P. Hasal and M. Marek: Enzymatic hydrolysis of Penicillin G in a 2-D Membrane Reactor, Proceedings of 27th International Conference SSCHE, Tatranské Matliare, Slovensko, May 22-26, 2000. CD-ROM, ISBN: 1-80-227-1350-3.
9.
M. Přibyl, R. Chmelíková, P. Hasal and M. Marek: Membrane Reactor for Enzymatic Hydrolysis of Penicillin G by Penicillin Acylase: Experimental and Numerical Results, Proceedings of International Congress of Chemical and Process Engineering CHISA 2000, Prague, Czech Republic, August 27-31, 2000. CD ROM.
10.
R. Chmelíková, M. Přibyl, P. Hasal and M. Marek: Effects of an Electric Field on Enzymatic Reactions with Immobilized Enzymes, Proceedings of International Congress of Chemical and Process Engineering CHISA 2000, Prague, Czech Republic, August 27-31, 2000. CD ROM.
11.
P. Hasal, R. Chmelíková, M. Přibyl and M. Marek: Modeling of Thin Channel Microreactors with Gel-Immobilized Enzyme and/or Microbial Cells, Proceedings of International Congress of Chemical and Process Engineering CHISA 2000, Prague, Czech Republic, August 27-31, 2000. CD ROM.
12.
R. Chmelíková, M. Přibyl, F. Tměj, P. Hasal, M. Marek: Enzyme reaction in an electromembrane reactor. Proceedings of 28th Conference SSCHE, Tatranské Matliare, Slovakia, May 21-25, 2001. CD-ROM.
13.
R. Chmelíková, M. Přibyl, P. Hasal, M. Marek: Effects of an Electric Field on Enzymatic Reactions with Immobilized Enzymes. Proceedings of 3rd European Congress of Chemical Engineering ECCE3, Nuremberg, Germany, June 26-28, 2001. CD ROM.
14.
Přibyl M., Shvartsman S.Y.: A discrete model of signal transmission in an epithelial layer, Proceedings of 30th Conference SSCHE, Tatranské Matliare, Slovakia, 26 – 30 May, 2003. CD ROM, ISBN: 80-227-1889-0.
15.
M. Přibyl, D. Šnita, P. Hasal, M. Marek: Development of an ELISA system on a microchip platform, Proceedings of 31st International Conference of SSCHE, Tatranské Matliare, Slovakia, May 24-28, 2004. CD-ROM, ISBN: 80-227-2052-6.
16.
M. Přibyl, J. Lindner, D. Šnita, M. Marek: Dynamical simulations of reacting chemical systems in microcapillaries, Proceedings of 31st International Conference of SSCHE, Tatranské Matliare, Slovakia, May 24-28, 2004. CD-ROM, ISBN: 80-227-2052-6.
17.
M. Přibyl, D. Šnita, M. Marek, P. Hasal: Modeling of immunoassay in a microstructured device, Proceedings of 16th International Congress of Chemical and Process Engineering CHISA 2004, Prague, Czech Republic, August 22-26, 2004. CD-ROM, ISBN: 80-86059-405.
18.
V. Knápková, M. Přibyl, J. Lindner, M. Marek: Evaluation of electric potential distribution from the distribution of reacting ionic tracers in microchannels – tool for experiments, Proceedings of 16th International Congress of Chemical and Process Engineering CHISA 2004, Prague, Czech Republic, August 22-26, 2004. CD-ROM, ISBN: 80-86059-40-5.
19.
M. Přibyl, D. Šnita, M. Marek: Modeling of a Spatially Two−Dimensional Microchip for Immunoassay, Proceedings of European Micro and Nano Systems EMN 2004, Paris, France, October 20-21, 2004. CD-ROM, ISBN: 2-84813-037-7.
20.
M. Přibyl, D. Šnita, M. Marek: Dynamic simulation of microsystems with sharp gradients of pH and electric potential, Proceedings of 22th CAD-EM User’s Meeting 2004, Dresden, Germany, November 10-12, 2004. CD-ROM, ISBN: 3-937523-01-4.
21.
M. Přibyl, D. Šnita, M. Marek: Development of Microfluidic Device for Heterogeneous Immunoassay on Polystyrene Platform with Electroosmotic Control, Proceedings of Nanotech 2005, Anaheim, USA, May 8-12, 2005. CD ROM, ISBN: 0-9767985-4-9. 20
22.
J. Lindner, Z. Slouka, M. Přibyl, D. Šnita: Microchemical engineering: Materials, Technologies and our experiences, Proceedings of 32nd International Conference of SSCHE, Tatranské Matliare, Slovakia, May 23-27, 2005. CD ROM, ISBN: 80-227-2224-3.
23.
V. Knápková, M. Přibyl, M. Marek: Analysis of reaction-transport phenomena in a microfluidic system for detection of IgG, Proceedings of 32nd International Conference of SSCHE, Tatranské Matliare, Slovakia, May 23-27, 2005. CD ROM, ISBN: 80-227-2224-3.
24.
J. Štěpánek, M. Přibyl, D. Šnita, J. Lindner: Development of an experimental microdevice for detection of IgG, Proceedings of 32nd International Conference of SSCHE, Tatranské Matliare, Slovakia, May 23-27, 2005. CD ROM, ISBN: 80-227-2224-3.
25.
D. Šnita, Z. Slouka, J. Kosek, J. Lindner, M. Přibyl, M. Marek, Nerovnovážné a kvazirovnovážné modelování prostorově distribuovaných iontových mikrosystémů pod vlivem elektrického pole, Sborník konference 52. konference CHISA, Srní, Šumava 17.-20. října 2005. CD ROM.
26.
V. Knápková, M. Přibyl, D. Šnita, Diskuse vlivu volby okrajových podmínek na výsledky stacionárních a dynamických simulací mikrozařízení s probíhající biochemickou interakcí, Sborník konference 52. konference CHISA, Srní, Šumava 17.-20. října 2005. CD ROM.
27.
J. Štěpánek, M. Přibyl, M. Marek, Studium elektroosmotického toku elektrolytu v mikrofluidních systémech určených pro imunoanalytické experimenty, Sborník konference 52. konference CHISA, Srní, Šumava 17.-20. října 2005. CD ROM.
28.
Z. Slouka, J. Štěpánek, M. Svoboda, J. Chroust, T. Jindra, J. Lindner, M. Přibyl, D. Šnita: Microchemical and microlithography laboratory at Institute of Chemical Technology in Prague, CZ, Proceedings of 33rd International Conference of Slovak Society of Chemical Engineering, Tatranské Matliare, Slovakia, May 22-26, 2006. CD ROM, ISBN 80-227-24092.
29.
W. Schrott, L. Pecháčková, M. Přibyl, D. Šnita: Electroosmotic flow measurement, Proceedings of 33rd International Conference of Slovak Society of Chemical Engineering, Tatranské Matliare, Slovakia, May 22-26, 2006. CD ROM, ISBN 80-227-2409-2.
30.
J. Štěpánek, M. Přibyl, M. Marek: Heterogeneous immunoassay in polystyrene microchip, Proceedings of 33rd International Conference of Slovak Society of Chemical Engineering, Tatranské Matliare, Slovakia, May 22-26, 2006. CD ROM, ISBN 80-227-2409-2.
31.
T. Jindra, Z. Slouka, M. Přibyl, D. Šnita: Electroosmosis in chemical microsystems: Mathematical modelling and development of techniques to experimental research, Proceedings of 17th International Congress of Chemical and Process Engineering CHISA 2006, Prague, Czech rep., August 27–21, 2006. CD ROM, ISBN 80-86059-45-6.
32.
J. Štěpánek, W. Schrott, L. Pecháčková, M. Přibyl, D. Šnita: Development of a microfluidic chip for heterogeneous immunoassay, Proceedings of 17th International Congress of Chemical and Process Engineering CHISA 2006, Prague, Czech republic, August 27–21, 2006. CD ROM, ISBN 80-86059-45-6.
33.
P. Hasal, M. Přibyl, R. Kukula, R. Chmelíková, M. Marek: Biotransformations intensification by electric fields, Proceedings of 17th International Congress of Chemical and Process Engineering CHISA 2006, Prague, Czech republic, August 27–21, 2006. CD ROM, ISBN 80-86059-45-6.
34.
T. Postler, Z. Slouka, T. Jindra, M. Přibyl, D. Šnita: Electro-hydrodynamics in cation exchange membrane and surrounding electrolyte: the single pore model, Proceedings of International Symposium on Electrohydrodynamics 2006 ISEHD, Buenos Aires, Argentina, December 4–6, 2006. CD ROM, ISBN 950-29-0964-X.
21
35.
M. Přibyl, W. Schrott, A. Shahravan, D. Šnita: Mathematical modeling of a microchip driven by AC electric field, Proceedings of International Symposium on Electrohydrodynamics 2006 ISEHD, Buenos Aires, Argentina, December 4–6, 2006. CD ROM, ISBN 950-29-0964X.
36.
J. Štěpánek, M. Přibyl, M.Marek: Vývoj mikrofluidních aparátů pro biochemické aplikace, Sborník workshopu "Reakční a transportní jevy", Hrubá Skála, 1.-3. prosince 2006, ISBN 80-7080-626-5. CD ROM.
37.
Z. Slouka, W. Schrott, M. Svoboda, J. Štěpánek, T. Jindra, J. Lindner, M. Přibyl, D. Šnita: Micro-chemical Engineering, Proceedings of 34th International Conference of Slovak Society of Chemical Engineering, Tatranské Matliare, Slovakia, May 21-25, 2007. CD ROM, ISBN 978-80-227-2640-5.
38.
W. Schrott, M. Přibyl, D. Šnita: Electrokinetic transport of aqueous electrolytes in polystyrene microchips, Proceedings of 34th International Conference of Slovak Society of Chemical Engineering, Tatranské Matliare, Slovakia, May 21-25, 2007. CD ROM, ISBN 978-80-227-2640-5.
39.
J. Štěpánek, L. Pecháčková, M. Přibyl, M. Marek: Sandwich bioassays in a polystyrene microchip, Proceedings of 34th International Conference of Slovak Society of Chemical Engineering, Tatranské Matliare, Slovakia, May 21-25, 2007. CD ROM, ISBN 978-80-2272640-5.
40.
J. Čejková, L. Menclová, M. Přibyl, P. Hasal: Aggregation of Dictyostelium discoideum under the influence of cAMP in agar, Proceedings of 34th International Conference of Slovak Society of Chemical Engineering, Tatranské Matliare, Slovakia, May 21-25, 2007. CD ROM, ISBN 978-80-227-2640-5.
41.
L. Menclová, J. Čejková, H. Ševčíková, M. Přibyl: Reaction-transport processes in Dictyostelium discoideum, Proceedings of 34th International Conference of Slovak Society of Chemical Engineering, Tatranské Matliare, Slovakia, May 21-25, 2007. CD ROM, ISBN 978-80-227-2640-5.
42.
M. Přibyl, J. Hrdlička, D. Šnita: Mathematical Modeling of Electroosmotic Flow Driven by AC Electric Field – Poisson Equation Approach, Proceedings of MME2007-18th Workshop on MicroMechanics Europe, Braga, Portugal, 171-174, Sep 16-18, 2007. ISBN 978-97298603-3-1.
43.
T. Postler, T. Jindra, M. Přibyl, D. Šnita: Modeling of electroosmotic flow in submicron channels, Proceedings of MME2007-18th Workshop on MicroMechanics Europe, Braga, Portugal, 167-170, Sep 16-18, 2007. ISBN 978-972-98603-3-1.
44.
J. Čejková, M. Přibyl: Biologické aplikace mikroskopie atomárních sil, Sborník workshopu „Reakční a transportní jevy II“, VŠCHT Praha, 2007. ISBN 978-80-7080-024-9. CD ROM.
45.
J. Štěpánek, L. Pecháčková, M. Přibyl, M. Marek: Výroba a principy mikročipů v bioaplikacích, Sborník workshopu „Reakční a transportní jevy II“, VŠCHT Praha, 2007. ISBN 978-80-7080-024-9. CD ROM.
46.
M. Přibyl: Elektrokineticky řízené mikrofluidní aparáty, Sborník workshopu „Inženýrské systémy pro biotechnologické aplikace“, VŠCHT Praha, 2007. ISBN 978-80-7080-020-1.
47.
D. Šnita, M. Přibyl, J. Hrdlička, T. Jindra, T. Postler: Matematické modelování mikrofluidních systémů řízených elektrickým polem, Sborník workshopu „Inženýrské systémy pro biotechnologické aplikace“, VŠCHT Praha, 2007. ISBN 978-80-7080-020-1.
48.
J. Čejková, M. Přibyl: Studium proteinových vrstev pomocí mikroskopie atomárních sil, Sborník workshopu „Inženýrské systémy pro biotechnologické aplikace“, VŠCHT Praha, 2007. ISBN 978-80-7080-020-1. 22
49.
J. Štěpánek, L. Pecháčková, M. Přibyl, M. Marek: Proteinové mikrosoubory a mikrofluidní zařízení v bioaplikacích, Sborník workshopu „Inženýrské systémy pro biotechnologické aplikace“, VŠCHT Praha, 2007. ISBN 978-80-7080-020-1.
50.
L. Menclová, J. Čejková, H. Ševčíková, M. Přibyl: Vliv jednorázového přídavku cyklického adenosin-3’,5’-monofosfátu na vývoj hlenky Dictyostelium discoideum, Plné texty přednášek konference CHISA 2007, ČSCHI Praha, 2007. CD ROM, ISBN 80-86059-49-9.
51.
W. Schrott, M. Přibyl, D Šnita: Studium DC elektroosmotického toku v mikročipu vodivostní a fluorescenční technikou, Plné texty přednášek konference CHISA 2007, ČSCHI Praha, 2007. CD ROM, ISBN 80-86059-49-9.
52.
M. Přibyl, D. Šnita: Matematické modelování AC elektroosmózy v mikrofluidním kanále, Plné texty přednášek konference CHISA 2007, ČSCHI Praha, 2007. CD ROM, ISBN 8086059-49-9.
53.
J. Čejková, M. Přibyl: Studium adsorpce proteinu A a imunoglobulinu G na polystyren pomocí mikroskopie atomárních sil, Plné texty přednášek konference CHISA 2007, ČSCHI Praha, 2007. CD ROM, ISBN 80-86059-49-9.
54.
W. Schrott, J. Štěpánek, L. Pecháčková, M. Přibyl, D. Šnita: Optical system for detection of bioaffinity complexes in microfluidic chips, Proceedings of 35th International Conference of Slovak Society of Chemical Engineering, Tatranské Matliare, Slovakia, May 26-30, 2008. CD ROM, ISBN 978-80-227-2903-1.
55.
W. Schrott, M. Přibyl, J. Ston: Study of electroosmotic characteristics by current monitoring and fluorescence methods, Proceedings of 35th International Conference of Slovak Society of Chemical Engineering, Tatranské Matliare, Slovakia, May 26-30, 2008. CD ROM, ISBN 978-80-227-2903-1.
56.
L. Menclová, M. Přibyl, P. Kovačík: Study of the global wave in Dictyostelium discoideum, Proceedings of 35th International Conference of Slovak Society of Chemical Engineering, Tatranské Matliare, Slovakia, May 26-30, 2008. CD ROM, ISBN 978-80-227-2903-1.
57.
W. Schrott, L. Pecháčková, Z. Slouka, M. Přibyl: Detection of bioaffinity complexes in microchannels by fluorescence techniques, Proceedings of 18th International Congress of Chemical and Process Engineering CHISA 2008, Prague, Czech republic, August 24–28, 2008. CD ROM, ISBN 978-80-02-02047-9.
58.
M. Přibyl, P. Červenka, J. Hrdlička, D. Šnita: Non-equlibrium modeling of AC electroosmosis in microfluidic channels – parametrical studies, Proceedings of International Symposium on Electrohydrodynamics ISEHD 2009, Kuching, Malaysia-Sarawak, March 2528, 2009. CD ROM, ISBN 978-983-9257-95-3.
59.
W. Schrott, Z. Slouka, J. Ston, M. Přibyl, D. Šnita: Characterization of electroosmotic flow in PDMS microfluidic devices, Proceedings of 36th International Conference of Slovak Society of Chemical Engineering, Tatranské Matliare, Slovakia, May 25-29, 2009. CD ROM, ISBN 978-80-227-3072-3.
60.
J. Hrdlička, P. Červenka, M. Přibyl, D. Šnita: Mathematical modeling of top-bottom zig-zag four phase AC electroosmotic micropump, Proceedings of 36th International Conference of Slovak Society of Chemical Engineering, Tatranské Matliare, Slovakia, May 25-29, 2009. CD ROM, ISBN 978-80-227-3072-3.
61.
P. Červenka, Z. Slouka, M. Přibyl, D. Šnita: Dependence of effective zeta-potential on electrolyte concentration, Proceedings of 36th International Conference of Slovak Society of Chemical Engineering, Tatranské Matliare, Slovakia, May 25-29, 2009. CD ROM, ISBN 978-80-227-3072-3.
23
62.
P. Červenka, J. Hrdlička, M. Přibyl, D. Šnita: Comparison of slip and non-slip mathematical models of AC electroosmosis in microchannels with complex electrode geometries, Proceedings of 36th International Conference of Slovak Society of Chemical Engineering, Tatranské Matliare, Slovakia, May 25-29, 2009. CD ROM, ISBN 978-80-227-3072-3.
63.
T. Skybová, M. Přibyl, P. Hasal: Mathematical modeling of a biotrickling filter for removal of organic dyes from wastewaters, Proceedings of 36th International Conference of Slovak Society of Chemical Engineering, Tatranské Matliare, Slovakia, May 25-29, 2009. CD ROM, ISBN 978-80-227-3072-3.
64.
P. Červenka, J. Hrdlička, M. Přibyl, D. Šnita: Comparison of slip and non-slip mathematical models of AC electroosmosis in microchannels with asymmetric co-planar electrodes, Proceedings of 2009 Electrostatics Joint Conference Boston University, USA, June 16-18, 2009. http://www.electrostaticanswers.com/2009ESJC/2009ESJC.htm.
65.
T. Skybová, M. Přibyl, P. Hasal, Mathematical modeling of a trickle-bed bioreactor for wastewater treatment, 13th International Conference Environmental and Mineral Processing & Exhibition, Ostrava, June 4-6, 2009, Sborník Part III 265-270, 2009, ISBN 978-80-2481996-9.
66.
P. Červenka, J. Hrdlička, M. Přibyl, D. Šnita: Mathematical modeling of AC electroosmotic micropumps with asymmetric co-planar electrodes, Sborník z doktorského semináře "Reakční a transportni jevy III", Jablonec n. Nisou, 10.-13.6., 2009. CD ROM, ISBN 97880-7080-725-5.
67.
J. Hrdlička, P. Červenka, M. Přibyl, D. Šnita: Mathematical modeling of top-bottom zig-zag four phase AC electroosmotic micropump, Sborník z doktorského semináře "Reakční a transportni jevy III", Jablonec n. Nisou, 10.-13.6., 2009. CD ROM, ISBN 978-80-7080725-5.
68.
W. Schrott, M. Nebyla, Z. Slouka, M. Přibyl: Immunoanalytical detection of bioaffinity complexes in PDMS microfluidic chips, Sborník z doktorského semináře "Reakční a transportni jevy III", Jablonec n. Nisou, 10.-13.6., 2009. CD ROM, ISBN 978-80-7080725-5.
69.
T. Skybová, M. Přibyl, P. Hasal: Mathematical modeling of a trickle-bed biofilter, Sborník z doktorského semináře "Reakční a transportni jevy III", Jablonec n. Nisou, 10.-13.6., 2009. CD ROM, ISBN 978-80-7080-725-5.
70.
J. Hrdlička, P. Červenka, M. Přibyl, D. Šnita: Matematické modelování elektroosmotické pumpy napájené běžící vlnou střídavého napětí, 56. Konference chemického a procesního inženýrství CHISA 2009, Srní, Šumava, 19.-22.10., 2009. CD ROM.
71.
J. Čech, W. Schrott, Z. Slouka, M. Přibyl: Formation and separation of segmented flow in microfluidic chips, 37th International Conference of Slovak Society of Chemical Engineering, Tatranské Matliare, Slovakia, May 24-28, 2010. CD ROM, ISBN: 978-80-2273290-1.
72.
W. Schrott, M. Nebyla, J. Fišer, M. Přibyl: LIF microfluidic system for immunoanalytical detection, 37th International Conference of Slovak Society of Chemical Engineering, Tatranské Matliare, Slovakia, May 24-28, 2010. CD ROM, ISBN: 978-80-227-3290-1.
73.
P. Červenka, Z. Slouka, M. Přibyl: Microfluidic device for AC electroosmotic fluid pumping, 37th International Conference of Slovak Society of Chemical Engineering, Tatranské Matliare, Slovakia, May 24-28, 2010. CD ROM, ISBN: 978-80-227-3290-1.
74.
P. Červenka, J. Hrdlička, M. Přibyl, D. Šnita: Analysis of the effect of faradaic currents on electroosmotic flow, 37th International Conference of Slovak Society of Chemical
24
Engineering, Tatranské Matliare, Slovakia, May 24-28, 2010. CD ROM, ISBN: 978-80-2273290-1. 75.
T. Skybová, M. Přibyl, J. Pocedič, P. Hasal: Trickle-bed bioreactor for wastewater decolorization – mathematical modeling, 37th International Conference of Slovak Society of Chemical Engineering, Tatranské Matliare, Slovakia, May 24-28, 2010. CD ROM, ISBN: 978-80-227-3290-1.
76.
J. Hrdlička, P. Červenka, M. Přibyl, D. Šnita: Traveling-wave electroosmotic pumps driven by non-sinusoidal AC signals, 37th International Conference of Slovak Society of Chemical Engineering, Tatranské Matliare, Slovakia, May 24-28, 2010. CD ROM, ISBN: 978-80-2273290-1.
77.
P. Červenka, J. Hrdlička, M. Přibyl, D. Šnita: Study on Faradaic and Coulombic interactions at microelectrodes utilized in AC electroosmotic micropumps, Proceedings of the 2010 ESA Annual Meeting on Electrostatics, University of North Carolina, Charlotte, USA, June 22-24, 2010. URL: http://www.electrostatics.org/esa2010proceedings.html.
78.
T. Skybová, M. Přibyl, J. Pocedič, P. Hasal: Mathematical model of a trickle-bed bioreactor for wastewater decolorization, Proceedings of the 19th International Congress CHISA and 7th European Congress of Chemical Engineering, Prague, Czech Republic, August 28 – September 1, 2010. CD ROM, ISBN: 978-80-02-02210-7.
79.
J. Čech, W. Schrott, M. Přibyl: Development of slug-flow microfluidic devices for lipase catalyzed reactions, Proceedings of 10th AIChE Annual Meeting, Salt Lake City, USA, November 7-12, 2010. CD ROM.
80.
M. Přibyl, I. Schreiber: Effects of Convective Flow On Chemical Signaling in Cellular Systems, Proceedings of 10th AIChE Annual Meeting, Salt Lake City, USA, November 7-12, 2010. CD ROM.
81.
O. Hadač, I. Schreiber, M. Přibyl, P. Červenka, L. Nevoral: Stoichiometric network analysis of MAPK cascade, Sborník prací ze semináře Reakční a transportní jevy IV, Litomyšl, 9.-12. června, 2010. CD ROM.
82.
W. Schrott, M. Nebyla, M. Přibyl: Fabrication of PDMS microfluidic devices, Sborník prací ze semináře Reakční a transportní jevy IV, Litomyšl, 9.-12. června, 2010. CD ROM.
83.
T. Skybová, M. Přibyl, P. Hasal: Mathematical modeling of biotrickling filter for waste water decolorization, Sborník prací ze semináře Reakční a transportní jevy IV, Litomyšl, 9.12. června, 2010. CD ROM.
84.
P. Červenka, J. Hrdlička: AC electroosmotic micropumps, Sborník prací ze semináře Reakční a transportní jevy IV, Litomyšl, 9.-12. června, 2010. CD ROM.
85.
M. Nebyla, M. Přibyl: Effects of convective flow and extracellular inhibitors on EGFR signaling – mathematical modeling. 2011 AIChE annual meeting conference proceedings, Minneapolis, USA, October 16-21, 2011. ISBN: 978-0-8169-1070-0. CD ROM.
86.
J. Čech, W. Schrott, M. Přibyl, D. Šnita: Enzyme hydrolysis of soyabean oil in 3-phase slug flow microreactors. 2011 AIChE annual meeting conference proceedings, Minneapolis, USA, October 16-21, 1-8, 2011. ISBN: 978-0-8169-1070-0. CD ROM.
87.
M. Nebyla, M. Přibyl: Mathematical model of EGFR communication in epithelia affected by convective flow. Proceedings of the 38th International Conference of Slovak Society of Chemical Engineering, Tatranské Matliare, Slovakia, May 23 – 27, 44–53, 2011. ISBN: 978-80-227-3503-2. CD ROM.
88.
T. Skybová, M. Přibyl, P. Hasal: Mathematical model of a biofilm system in a trickle-bed reactor. Proceedings of the 38th International Conference of Slovak Society of Chemical 25
Engineering, Tatranské Matliare, Slovakia, May 23 – 27, 624-633, 2011. ISBN: 978-80227-3503-2. CD ROM. 89.
J. Čech, W. Schrott, M. Přibyl, D. Šnita: Enzyme hydrolysis of soyabean oil in slug flow microreactors. Proceedings of the 38th International Conference of Slovak Society of Chemical Engineering, Tatranské Matliare, Slovakia, May 23 – 27, 1138-1146, 2011. ISBN: 978-80-227-3503-2. CD ROM.
90.
M. Nebyla, M. Přibyl: Mathematical model of EGFR communication in epithelia affected by convective flow. Workshop Reakční a transporní jevy V, Roztoky u Křivoklátu, 8.-11. června, 253-262, 2011. ISBN: 978-80-7080-797-2. CD ROM.
91.
P. Červenka, W. Schrott, M. Přibyl: Metal stamps for hot embossing technique. Workshop Reakční a transporní jevy V, Roztoky u Křivoklátu, 8.-11. června, 238-244, 2011. ISBN: 978-80-7080-797-2. CD ROM.
92.
P. Červenka, M. Přibyl: Kinetic description for modeling of electrochemical systems. Workshop Reakční a transporní jevy V, Roztoky u Křivoklátu, 8.-11. června, 245-252, 2011. ISBN: 978-80-7080-797-2. CD ROM.
93.
J. Čech, W. Schrott, M. Přibyl, D. Šnita: Enzyme hydrolysis of soyabean oil in 2-phase and 3-phase slug flow microreactors. Workshop Reakční a transporní jevy V, Roztoky u Křivoklátu, 8.-11. června, 263-273, 2011. ISBN: 978-80-7080-797-2. CD ROM.
94.
J. Čech, W. Schrott, M. Přibyl: Enzymová hydrolýza sójového oleje v reaktoru s 3fázovým segmentovaným tokem, 58. Konference chemického a procesního inženýrství CHISA 2011, Srní, Šumava, 24.-27. října, 1-8, 2011. CD ROM.
95.
M. Nebyla, M. Přibyl, I. Schreiber: Mathematical model of signal propagation in epithelia. In Proceedings of the 39th International Conference of Slovak Society of Chemical Engineering, Tatranské Matliare, Slovakia, May 21 – 25, 60–68, 2012. ISBN: 978-8089475-04-9. CD ROM.
96.
J. Fišer, P. Červenka, M. Přibyl: Study on electrochemical biosensors for detection of bioaffinity complexes. In Proceedings of the 39th International Conference of Slovak Society of Chemical Engineering, Tatranské Matliare, Slovakia, May 21 – 25, 836-843, 2012. ISBN: 978-80-89475-04-9. CD ROM.
97.
J. Čech, W. Schrott, M. Přibyl: Comparison between enzyme hydrolysis in hydrophobic and hydrophilic slug flow microreactor. In Proceedings of the 39th International Conference of Slovak Society of Chemical Engineering, Tatranské Matliare, Slovakia, May 21 – 25, 1216– 1223, 2012. ISBN: 978-80-89475-04-9. CD ROM.
98.
M. Nebyla, P. Červenka, J. Hrdlička, M. Přibyl: Mathematical modeling of segmented flow in microchannels. In Proceedings of the 39th International Conference of Slovak Society of Chemical Engineering, Tatranské Matliare, Slovakia, May 21 – 25, 369–373, 2012. ISBN: 978-80-89475-04-9. CD ROM.
99.
M. Nebyla, M. Přibyl: Effects of oscillatory convection on chemical signal propagation in simple epithelia, CD-ROM of Full text, 20th International Congress CHISA, Praha, August 25-29, 2012, Art. 1270, ISBN: 978-80-905035-1-9. CD ROM.
100. M. Nebyla, M. Přibyl: Effects of oscillatory convective flow on chemical signal propagation in epithelia. 2012 AIChE annual meeting conference proceedings, Pittsburgh, USA, October 28-November 2, 2012, 1-6. ISBN: 978-0-8169-1073-1. CD ROM. 101. O. Hadač, I. Schreiber, M. Přibyl and S.Y. Shvartsman: Minimal reaction network for bistability in the MAPK signalling cascade. 2012 AIChE annual meeting conference proceedings, Pittsburgh, USA, October 28-November 2, 2012, 1-7. ISBN: 978-0-8169-10731. CD ROM. 26
102. M. Nebyla, M. Přibyl.: Oscillatory convection accelerates signal transmission in cellular systems. Proceedings of the 40th International Conference of Slovak Society of Chemical Engineering, Tatranské Matliare, Slovakia, May 27 - 31, 36–44, 2013. ISBN: 978-80-8947509-4. CD-ROM. 103. J. Čech, D. Šnita, M. Přibyl: Microdevices for generation of two-phase and three-phase slug flows coupled with an enzyme reaction. Proceedings of the 40th International Conference of Slovak Society of Chemical Engineering, Tatranské Matliare, Slovakia, May 27 - 31, 1159– 1166, 2013. ISBN: 978-80-89475-09-4. CD-ROM. 3.6.
Osobně přednesené přednášky v zahraničí a na mezinárodních konferencích
1.
M. Přibyl, P. Hasal and M. Marek: Numerical Study of Dynamical Behavior of an Enzyme Reaction, 26th International Conference of Slovak Society of Chemical Engineering, Jasná, Slovakia, May 24-28, 1999.
2.
M. Přibyl, R. Chmelíková, P. Hasal and M. Marek: Enzymatic hydrolysis of Penicillin G in a 2-D Membrane Reactor, 27th International Conference of Slovak Society of Chemical Engineering, Tatranské Matliare, Slovakia, May 22-26, 2000.
3.
M. Přibyl, S.Y. Shvartsman: A discrete model of signal transmission in an epithelial layer, 30th Conference SSCHE, Tatranské Matliare, Slovakia, May 26-30, 2003.
4.
M. Přibyl, T. Postler, D. Šnita, M. Marek: Poisson equation based modeling of ionic Microsystems, Workshop on Modeling and Simulation of BioMEMS, Microreactors and Microfluidic components, IMM Mainz, Germany, 25 June, 2003.
5.
M. Přibyl, D. Šnita, P. Hasal, M. Marek: Development of an ELISA system on a microchip platform, 31st International Conference of SSCHE, Tatranské Matliare, Slovakia, May 2428, 2004.
6.
M. Přibyl, D. Šnita, M. Marek: Numerical study of antigen-antibody interactions in an ELISA microchip, Joint Conference MPD7-DeStoBio 3 Computational and Mathematical Population Dynamics, Trento, Italy, June 21-25, 2004.
7.
M. Přibyl, D. Šnita, M. Marek: Discrete approach to the description of signal transmission in an epithelial tissue, Workshop 5 of the ESF Programme REACTOR, Prague, Czech Republic, September 2-6, 2004.
8.
D. Šnita, T. Postler, J. Lindner, M. Přibyl, J. Kosek, M. Marek: On the use of adaptive nonequidistant grids for Poisson equation based modeling of ionic systems, 22th CAD-EM User’s Meeting 2004, Dresden, Germany, November 10-12, 2004.
9.
J. Štěpánek, M. Přibyl, D. Šnita, J. Lindner.: Development of an experimental microdevice for detection of IgG, 32nd International Conference of SSCHE, Tatranské Matliare, Slovakia, May 23-27, 2005.
10.
M. Přibyl, S.Y. Shvartsman: Signal transmission and pattern formation in epithelial layers mediated by soluble peptide ligands, European Conference on Mathematical and Theoretical Biology, Dresden, Germany, July 18-22, 2005.
11.
V. Knápková, M. Přibyl, D. Šnita, M. Marek.: Modeling of reaction-transport processes in a microcapillary biosensor for detection of human IgG, 31st International Conference on Micro- and Nano-Engineering, Vienna, Austria, September 19-22, 2005.
12.
M. Přibyl, D. Šnita, M. Marek: Mathematical modeling microfluidic biosensors for heterogeneous immunoassay. 3rd Workshop Chemische und biologische Mikrolabortechnik, Ilmenau, Germany, February 21–23, 2006.
27
13.
J. Štěpánek, M. Přibyl, M. Marek: Heterogeneous immunoassay in polystyrene microchip, 33rd International Conference of SSCHE, Tatranské Matliare, Slovakia, May 22-26, 2006.
14.
J. Štěpánek, W. Schrott, L. Pecháčková, M. Přibyl, D. Šnita: Development of a microfluidic chip for heterogeneous immunoassay, 17th International Congress of Chemical and Process Engineering CHISA 2006, Prague, Czech republic, August 27–31, 2006.
15.
J. Štěpánek, M. Přibyl, D. Šnita: Quantification of human IgG in a Multichannel microfluidic chip, 32nd International Conference MNE2006, Barcelona, Spain, September 17-20, 2006.
16.
M. Přibyl, D. Šnita: Poisson equation based modeling of DC and AC electroosmosis in microfluidic channels, COMSOL Conference Prague, Czech Republic, October 27, 2006.
17.
M. Přibyl, J. Hrdlička, Z. Slouka: AC electroosmosis along systems of co-planar electrodes, 4th Workshop Chemische und biologische Mikrolabortechnik, Ilmenau, Germany, February 26–28, 2008.
18.
J. Hrdlička, P. Červenka, M. Přibyl, D. Šnita: Modeling of AC and DC electroosmosis in microfluidic chips, 35th International Conference of Slovak Society of Chemical Engineering, Tatranské Matliare, Slovakia, May 26-30, 2008.
19.
W. Schrott, M. Přibyl, D. Šnita, Mathematical modeling of the electric current monitoring technique used in the electrokinetic characterization of microchips, 18th International Congress of Chemical and Process Engineering CHISA 2008, Prague, Czech republic, August 24–28, 2008.
20.
M. Přibyl, P. Červenka, J. Hrdlička, D. Šnita: Non-equlibrium modeling of AC electroosmosis in microfluidic channels – parametrical studies, Proceedings of International Symposium on Electrohydrodynamics ISEHD 2009, Kuching, Malaysia-Sarawak, March 2528, 2009.
21.
M. Přibyl, W. Schrott, M. Nebyla, D. Šnita: Plastic microfluidic systems combined with the LIF detection for bioassays, 5th Workshop of Microtechnology for Chemistry and Biology Laboratories, Ilmenau, Germany, February 23-25, 2010.
22.
M. Přibyl: Microfluidic laboratory: Towards automated sensors, fast bioassays, and advanced chemical engineering applications, 37th International Conference of Slovak Society of Chemical Engineering, Tatranské Matliare, Slovakia, May 24-28, 2010. Plenary Lecture.
23.
J. Čech, Z. Slouka, W. Schrott, M. Přibyl, G. Kuncová: Enzyme hydrolysis of triglycerides in segmented flow microdevices, 19th International Congress CHISA and 7th European Congress of Chemical Engineering, Prague, Czech Republic, August 28 – September 1, 2010.
24.
M. Přibyl, I. Schreiber: Effects of Convective Flow On Chemical Signaling in Cellular Systems, 10th AIChE Annual Meeting, Salt Lake City, USA, November 7-12, 2010.
25.
M. Přibyl, O. Hadač, P. Červenka, I. Schreiber: Development of mathematical models of chemical signaling in cellular cultures under influence of interstitial flow, 2010 International Chemical Congress of Pacific Basin Societies, Honolulu, USA, December 15 - 20, 2010.
26.
J. Čech, W. Schrott, M. Přibyl, D. Šnita: Enzyme hydrolysis of soyabean oil in 3-phase slug flow microreactors. 2011 AIChE annual meeting conference, Minneapolis, USA, October 16-21, 2011. ISBN: 978-0-8169-1070-0.
27.
P. Červenka, J. Hrdlička, M. Přibyl, D. Šnita: Kinetic Mechanism of Electrochemical Reactions In a Microfluidic Cell. 2011 AIChE annual meeting conference, Minneapolis, USA, October 16-21, 2011. ISBN: 978-0-8169-1070-0.
28
28.
P. Červenka, J. Hrdlička, M. Přibyl, D. Šnita: Discussion on kinetics of electrochemical reactions - challenges for micro and nanofludics. 39th International Conference of Slovak Society of Chemical Engineering, Tatranské Matliare, Slovakia, May 21 – 25, 369–373, 2012.
29.
P. Červenka, J. Hrdlička, M. Přibyl, D. Šnita: Mathematical modeling of electrochemical reactions in a microfluidic cell, 20th International Congress CHISA, Praha, August 25-29, 2012.
30.
M. Přibyl: Electrochemical processes in microfluidic devices, Seminar at the Max Planck Institute for Dynamics of Complex Technical Systems, Magdeburg, October 23, 2012.
31.
M. Přibyl, J. Fišer, D. Šnita: Mathematical modeling of electrochemical cell in microfluidic chips. 40th International Conference of Slovak Society of Chemical Engineering, Tatranské Matliare, Slovakia, May 27 - 31, 2013.
3.7.
Osobně přednesené přednášky v ČR a na národních konferencích
1.
M. Přibyl, P. Hasal a M. Marek: Interakce enzymové reakce s procesy přenosu hmoty, Konference CHISA 97, Srní, Šumava, 13. až 16. října, 1997.
2.
M. Přibyl, P. Hasal a M. Marek: Studium enzymové reakce v membránových reaktorech, 25th International Conference of Slovak Society of Chemical Engineering, Jasná, Slovensko, 25. až 29. května, 1998.
3.
M. Přibyl, R. Chmelíková, P. Hasal a M. Marek: Studium enzymové reakce v membránovém bioreaktoru s vloženým elektrickým polem, Konference CHISA 99, Srní, Šumava, 18. až 21. října, 1999.
4.
M. Přibyl, D. Šnita, M. Marek, P. Hasal: Studium transportních jevů v mikroreaktoru s interakcí ligand-receptor, CHISA 2003, Srní, Šumava, 20. – 23. října, 2003.
5.
V. Knápková, M. Přibyl, D. Šnita: Diskuse vlivu volby okrajových podmínek na výsledky stacionárních a dynamických simulací mikrozařízení s probíhající biochemickou interakcí, 52. conference CHISA, Srní, Šumava 17.-20. října 2005.
6.
M. Přibyl: Elektrokinetický tok buzený střídavým elektrickým polem s malou amplitudou, Workshop „Reakční a transportní jevy II“, Konopiště, 8.-11. června, 2007.
7.
M. Přibyl: Elektrokineticky řízené mikrofluidní aparáty, Sborník workshopu „Inženýrské systémy pro biotechnologické aplikace“, Praha, 19. června, 2007.
8.
J. Štěpánek, L. Pecháčková, M. Přibyl, M. Marek: Proteinové mikrosoubory a mikrofluidní zařízení v bioaplikacích, Sborník workshopu „Inženýrské systémy pro biotechnologické aplikace“, Praha, 19. června, 2007.
9.
M. Přibyl, D. Šnita: Matematické modelování AC elektroosmózy v mikrofluidním kanále, Konference CHISA 2007, Srní – Šumava, 15.-18. října, 2007.
10.
M. Přibyl, W. Schrott, Z. Slouka, P. Červenka, J. Ston, M. Nebyla, D. Šnita: Povrchové vlastnosti mikrofluidních čipů z PDMS, Seminář "Reakční a transportni jevy III", Jablonec n. Nisou, 10.-13.6. , 2009.
11.
M. Přibyl, Z. Slouka, W. Schrott, P. Červenka, J. Čech, M. Nebyla, D. Šnita: Mikrofluidní čipy z PDMS: Povrchové vlastnosti a vybrané aplikace, 56. Konference chemického a procesního inženýrství CHISA 2009, Srní, Šumava, 19.-22.října, 2009.
12.
Přibyl M.: Popis elektrochemických systémů v mikro a nanoměřítku, Workshop – Letní škola mikrochemického inženýrství, 4.-9. září, Malenovice, 2012.
29
13.
M. Přibyl: Description of Faradaic interactions at electrode-electrolyte interfaces using ŠnitaPřibyl local kinetic theory. Letní škola mikrochemického inženýrství, Malenovice 3. – 8. září. 2013.
14.
Přibyl M.: Mathematical model of autocrine communication in epithelia, Workshop on Dynamics in Excitable Cells and Tissues, Institute of Physiology, Academy of Sciences of the Czech Republic, Praha, 2. října, 2013.
15.
M. Přibyl, D. Šnita: Lokální popis kinetiky a termodynamiky elektrochemických reakcí u rozhraní kov-elektrolyt a polovodič-elektrolyt. 60. Konference chemického a procesního inženýrství CHISA 2013, Srní, Šumava, 14.-17. října, 2013.
3.8.
Odpovědný řešitel zahraničních grantů
Není uváděno. 3.9.
Odpovědný řešitel domácích grantů
1. Vývoj postupů pro matematické modelování iontových mikrosystémů s vloženým elektrickým polem. (1K03003). Poskytovatel: MŠMT. Příjemce: VŠCHT Praha. Spoluřešitelská pracoviště: nejsou. Období řešení projektu: 2003 – 2005. 2. Studium mikroreaktorů pro bioinženýrské aplikace. (GP104/03/D006). Poskytovatel: GAČR. Příjemce: VŠCHT Praha. Spoluřešitelská pracoviště: nejsou. Období řešení projektu: 2003 – 2006. 3. Vliv konvektivního toku na šíření chemického signálu v živých tkáních. Bilaterální českoamerický grant (ME10036). Poskytovatel: MŠMT. Příjemce: VŠCHT Praha. Spoluřešitelská pracoviště: Princeton University. Období řešení projektu: 2010 – 2012. 4. Výzkum mechaniky tekutin v inteligentních mikrosystémech řízených elektrickými poli. (1401781S). Poskytovatel: GAČR. Příjemce: VŠCHT Praha. Spoluřešitelská pracoviště: nejsou. Období řešení projektu: 2014 – 2016. V letech 2006-2010 – koordinátor a klíčový člen řešitelského týmu projektu v programu Nanotechnologie pro společnost. Studium interakcí biologických makromolekul a nanovrstev se zaměřením na výzkum polymerních mikrofluidních biosenzorů a terapeutických nanočástic. (KAN208240651). Odpovědný řešitel: prof. Pavel Hasal. Poskytovatel: GAAV. Příjemce: VŠCHT Praha. Spoluřešitelská pracoviště: Apronex s.r.o. Období řešení projektu: 2006 – 2010.
3.10. Spoluřešitel zahraničních grantů Není uváděno. 3.11. Spoluřešitel domácích grantů 1. Senzory a biosenzory pro biotechnologie, lékařskou diagnostiku a životní prostředí, podpora rozvoje biotechnologií a inovační podnikání (ESF č. CZ.04.3.07/4.2.01/9). Poskytovatel: MPSV ČR. Příjemce: Vidia s.r.o. Řešitel: Ing. Michaela Poláková. Spoluřešitelská pracoviště: Ústav makromolekulární chemie AV ČR, Matematicko-fyzikální fakulta UK, Ústav fotoniky a elektroniky AV ČR, v.v.i., Vysoká škola chemicko-technologická v Praze, Ústav hematologie a krevní transfuze, Inova Pro, s.r.o., Safibra, s.r.o.. Období řešení projektu: 2005 – 2007.
30
4. Technická a realizační činnost 4.1.
Udělené evropské nebo mezinárodní patenty (EPO, WIPO), patenty USA a Japonska
Nejsou uváděny. 4.2.
Udělené české nebo jiné národní patenty, které jsou využívány na základě platné licenční smlouvy
Nejsou uváděny. 4.3.
Udělené české nebo jiné národní patenty, které jsou využívány jen vlastníkem patentu, nebo nejsou využívány
Nejsou uváděny. 4.4.
Autorství realizovaného komplexního technického díla s udaným společenským přínosem
Není uváděno. 4.5.
Poloprovozy, ověřené technologie
Nejsou uváděny. 4.6.
Užitné a průmyslové vzory, prototypy, funkční vzorky, software
1. Skleněný mikrofluidní čip. Autoři: J. Kotowski, P. Beránek, M. Přibyl. Druh výsledku: G/B Funkční vzorek, rok uplatnění výsledku: 2013.a 2. Mikrofluidní zařízení pro studium pohybu kapiček v elektrickém poli. Autoři: P. Beránek, M. Přibyl. Druh výsledku: G/B - Funkční vzorek, rok uplatnění výsledku: 2013.a 3. Mikrofluidní elektrochemická cela pro voltametrická měření v inertní atmosféře. Autoři: P. Beránek, M. Přibyl. Druh výsledku: G/B - Funkční vzorek, rok uplatnění výsledku: 2013.a 4. Mikrofluidní zařízení pro měření elektroosmotické mobility. Autoři: P. Beránek, M. Přibyl. Druh výsledku: G/B - Funkční vzorek, rok uplatnění výsledku: 2013.a 5. Mikročip pro vytváření třífázového segmentovaného toku. Autoři: J. Čech, M. Přibyl. Druh výsledku: G/B - Funkční vzorek, rok uplatnění výsledku: 2012. 6. Promíchávané zařízení pro galvanoplastiku. Autoři: J. Kotowski, M. Přibyl. Druh výsledku: G/B - Funkční vzorek, rok uplatnění výsledku: 2012. 7. Software pro studium přenosu signálu v epitelu. Autoři: M. Nebyla, M. Přibyl. Druh výsledku: R - Software, rok uplatnění výsledku: 2012. 8. Kovové raznice pro replikaci mikrofluidních čipů. Autoři: P. Červenka, M. Přibyl. Druh výsledku: G/B - Funkční vzorek, rok uplatnění výsledku: 2011. 9. Software for analysis of electrochemical processes in microfluidic chips. Autoři: P. Červenka, J. Hrdlička, M. Přibyl, D. Šnita. Druh výsledku: R - Software, rok uplatnění výsledku: 2011. 10. Software for optimization of electrokinetic pumps. Autoři: P. Červenka, J. Hrdlička, M. Přibyl, D. Šnita. Druh výsledku: R - Software, rok uplatnění výsledku: 2011. 11. Multikanálový polystyrenový mikročip pro paralelní bioanalýzu a kovová raznice. Autoři: Z. Slouka, W. Schrott, D. Šnita, M. Přibyl. Druh výsledku: S - Prototyp, rok uplatnění výsledku: 2007. Tyto výsledky byly vytvořeny v roce 2013 a budou uplatňovány jako aplikované výsledky v roce 2014 s konsolidovaným rokem uplatnění 2013. a
31
4.7.
Expertizní činnost
Oponent grantových projektů: MŠMT – program INGO II. Oponent grantového projektu: Agentura na podporu výskumu a vývoja, Slovensko – program LPP. Oponent grantového projektu: Israel Science foundation – Research Grant Application. Recenzent rukopisů zaslaných do impaktovaných časopisů: Lab on a Chip (více než 20 recenzí), Microfluidics and Nanofluidics, Electrophoresis, Journal of Colloid and Interface Science aj.
5. Organizační a odborně-společenská činnost s oborem související 5.1.
Členství a funkce v mezinárodních a národních odborných společnostech
Česká společnost chemického inženýrství – člen. Slovenská Spoločnosť Chemického Inžinierstva – člen. American Institute of Chemical Engineers (AIChE) – člen. Membership IEEE Industry Applications Society – abonent. 5.2.
Členství v odborných komisích a poradních orgánech
2010 – současnost Člen oborové rady doktorského studia oboru chemické inženýrství, VŠCHT Praha, Univerzita Pardubice 5.3.
Členství a funkce v redakčních radách odborných časopisů
2008 – 2013
Chemical Papers, Associate Editor
2013 – současnost
Chemical Papers, Editor
5.4.
Členství a funkce v organizačních výborech konferencí
International Conferences of SSCHE – člen programového výboru. Workshop Inženýrské mikrosystémy pro biotechnologické aplikace, Kongresové centrum Masarykovy koleje, Praha, 19. června 2007 – hlavní organizátor. 5.5.
Členství a funkce v oborových radách grantových agentur
Není uváděno. 5.6.
Ocenění výzkumné a vývojové práce
Votočkovo stipendium: 1998-2000. Stipendium Nadace Preciosa: 1998-2000.
6. Zahraniční spolupráce a pobyty v zahraničí Prof. Kazimierz Adamiak (University of Western Ontario, Kanada) – spolupráce při studiu elektroosmotických čerpadel řízených střídavým elektrickým polem, společná publikace v impaktovaném časopise IEEE Transactions on Industry Applications a konferenční příspěvky. Prof. Kai Sundmacher (Mac Planck Institute, Německo) – spolupráce v rámci programu Erasmus, školení diplomanta Rudolfa Flittnera na VŠCHT, úspěšná obhajoba v Magdeburgu v roce 2012.
32
Zahraničních pobyt, Princeton University, USA, 2002, 11 měsíců.
7. Nejvýznamnější tvůrčí aktivity 7.1.
Vytvoření předmětu Multifunkční chemické a biochemické mikrosystémy
Předmět vznikl jako odpověď na rostoucí význam mikrofluidních a mikromaticových zařízení v medicínské diagnostice a při výrobě speciálních chemikálií. Studenti jsou nejprve seznámeni s charakteristickými vlastnostmi zařízení pro transport, zpracování a analýzu tekutin v mikroměřítku. Následuje popis řešení typických chemicko-inženýrských jednotkových operací v mikroměřítku (čerpadla, mísiče, reaktory, extraktory, desintegrátory aj.). Zvláštní pozornost je věnována realizaci bioaplikací, jako jsou DNA a proteinové čipy, termocykléry pro amplifikaci nukleových kyselin, separátory biologických molekul pomocí kapilární elektroforézy a další. Probírány jsou též různé typy luminiscenčních a elektrochemických mikrosenzorů. V další části předmětu jsou studenti obeznámeni s nejčastěji používanými technikami pro přípravu mikrofluidních struktur, jako jsou fotolitografie, naprašování, napařování, mikroobrábění, galvanická depozice nebo 3D tisk. Závěrečná část předmětu je věnována teoretickým základům elektroosmózy a dalších elektrokinetických jevů. 7.2.
Vytvoření předmětu Tepelné procesy
Předmět patří k základním kamenům chemického inženýrství a je povinný pro všechny studenty naší specializace. Studenti jsou postupně seznamováni s klasickými problémy transportu tepla vedením, prouděním a sáláním. Probírané teoretické základy o sdílení tepla jsou procvičovány na praktických příkladech, a to obvykle s využitím softwarových prostředků Matlab nebo Comsol. Nabyté znalosti a dovednosti umožní studentům řešit a pochopit děje, se kterým se mohou setkat v řadě průmyslových zařízení, jako jsou tepelné výměníky, odparky, chemické reaktory různých typů, sušárny atd. 7.3.
Výzkum v oblasti elektrokinetického transportu a elektrochemických jevů
S rostoucím významem mikro a nanotechnologií v různých aplikacích, jako jsou elektrochemické mikrofluidní biosenzory a diagnostické systémy, bateriové a palivové články s mikrostrukturovaným povrchem elektrod nebo membránové elektroseparační procesy, vzniká potřeba účinně ovlivňovat a řídit transport tekutin a chemických látek na malém prostorovém měřítku. Proto byl na našem pracovišti vyvinut matematický model reakčně-transportních procesů založený na Poissonově-Nernstově-Planckově-Navierově-Stokesově popisu, který umožňuje predikovat chování elektrolytů v systémech s velmi malým charakteristickým rozměrem nebo v systémech ovlivňovaných elektrickými poli s vysokou frekvencí. Numerickou analýzou matematického modelu byla získána řada cenných poznatků, z nichž je možno jmenovat například: (i) vysvětlení experimentálně pozorovaného dynamického chování elektrolytické diody, (ii) vysvětlení experimentálně měřených polarizačních křivek v systémech s nanoporézní membránou nebo (iii) vysvětlení neobvyklých závislostí elektrokinetických charakteristik na koncentraci nosného elektrolytu v mikrofluidních zařízeních s imobilizovanými proteiny. Publikována byla též řada prací zabývajících se teoretickým studiem různých elektrokinetických čerpadel. V nedávné době byl navržen a publikován kinetický mechanizmus pro modelování rychlých elektrochemických reakcí v mikro a nanofluidních systémech, protože klasický přístup založený na ButlerověVolmerově rovnici mnohdy v takových systémech selhává. Uvažovaný mechanizmus pracuje pouze s lokálními koncentracemi a elektrickými potenciály na povrchu elektrody. Slouka, Z., Pribyl, M., Snita, D., Postler, T.: Transient behavior of an electrolytic diode. Physical Chemistry Chemical Physics 9(39): 5374-5381, 2007. IF 3,829, 10 (8). 33
Postler, T., Slouka, Z., Svoboda, M., Pribyl, M., Snita, D.: Parametrical studies of electroosmotic transport characteristics in submicrometer channels. Journal of Colloid and Interface Science 320(1): 321-332, 2008. IF 3,172, 25 (22). Schrott, W., Slouka, Z., Cervenka, P., Ston, J., Nebyla, M., Pribyl, M., Snita, D.: Study on surface properties of PDMS microfluidic chips treated with albumin. Biomicrofluidics 3(4): Art. 044101, 2009. IF 3,385, 9 (7). Cervenka, P., Hrdlicka, J., Pribyl, M., Snita, D.: Kinetic mechanism for modeling of electrochemical reactions. Physical Review E 85(4): Art. 041505, 2012. IF 2,313, 2 (1). 7.4.
Výzkum v oblasti mezibuněčné komunikace
Mezibuněčná komunikace hraje klíčovou roli ve vývojových procesech jednotlivých částí živých organizmů včetně procesů patologických. Organizované buněčné struktury, jako je například tkáň epitelu, jsou koordinovány mezibuněčnou signalizací krátkého dosahu. Autokrinní mezibuněčná komunikace je typicky založena na interakcích mezi membránovými receptory buňky a extracelulárními ligandy vylučovanými stejnou buňkou nebo buňkou stejného druhu. Výzkum navrhovatele v oblasti mezibuněčné signalizace byl zaměřen na studium autokrinní komunikace v jednovrstvém epitelu zprostředkované tyrosin kinázovým receptorem a extracelulárním růstovým faktorem (ligandem). Byl vytvořen matematický model zahrnující transport ligandu v extracelulárním prostoru, interakce ligandu s membránovými receptory a buněčnou odpověď na koncentraci vytvořeného ligand-receptorového komplexu. Bylo dosaženo řady důležitých poznatků využitelných pro plánování molekulárně-biologických experimentů, kultivaci tkáňových systémů in vitro nebo interpretaci buněčných odpovědí na vnější stimuly. Byl odvozen exaktní vztah pro závislost rychlosti šíření chemického signálu na geometrických, kinetických a transportních charakteristikách vrstvy epitelu. Bylo zjištěno, že závislost rychlosti mezibuněčné komunikace na síle vazby mezi ligandem a receptorem je nemonotónní a vyznačuje se jedním robustním maximem pro určitou hodnotu vazebné konstanty. Dále bylo dokázáno, že diskrétní charakter buněčné vrstvy může vést ke vzniku stabilních lokálních struktur se specifickou enzymovou aktivitou, což je velmi významné při vývojových procesech v živých organizmech. Konvektivní tok tekutiny v extracelulárním prostoru je pozorován v mnoha tkáních včetně svalů, chrupavek nebo mozku. Publikace řady autorů z nedávných let dokazují, že přítomnost konvektivního toku je nezbytná například pro vytváření cévních struktur, levo-pravé osy vyšších organizmů nebo pro zásobování některých tkání živinami. Do matematického modelu autokrinní komunikace byl proto zahrnut popis konvektivního transportu růstového faktoru v extracelulárním prostoru. Bylo například zjištěno, že konvektivní transport o intenzitě srovnatelné s intenzitou transportu difúzního může mnohonásobně urychlit, zpomalit, zastavit nebo obrátit směr šíření chemického signálu. Závislost rychlosti propagace signálu na intenzitě konvektivního toku je nelineární. V důsledku toho bylo pozorováno, že v přítomnosti periodicky se měnícího konvektivního transportu (srdeční rytmus, dýchání, chůze) s nulovou střední hodnotou rychlosti dochází k významnému urychlení šíření signálu v porovnání s případem bez přítomnosti konvekce. Toto zjištění může být vysvětlením specifického chování tkáňových kultur ovlivňovaných periodickými změnami směru toku extracelulárního média. Pribyl, M., Muratov, C.B., Shvartsman, S.Y.: Discrete models of autocrine cell communication in epithelial layers. Biophysical Journal 84(6): 3624-3635, 2003. IF 3,668, 35 (32). Pribyl, M., Muratov, C.B., Shvartsman, S.Y.: Long-range signal transmission in autocrine relays. Biophysical Journal 84(2): 883-896, 2003. IF 3,668, 29 (26). Nebyla, M., Pribyl, M., Schreiber, I.: Effects of Convective Transport on Chemical Signal Propagation in Epithelia. Biophysical Journal 102(5): 990-1000, 2012. IF 3,668, 1 (0). 34
Nebyla, M., Pribyl, M., Schreiber, I.: Oscillatory Flow Accelerates Autocrine Signaling due to Nonlinear Effect of Convection on Receptor-Related Actions. Biophysical Journal 105(3): 818828, 2013. IF 3,668, 0 (0). 7.5.
Výzkum v oblasti bioreaktrorů, mikrobioreaktorů a biosenzorů
Moderní bioinženýrské metody jsou využívány pro výrobu široké škály potravinářských a farmaceutických produktů. Součástí výrobního procesu je bioreaktor s volnými či imobilizovanými enzymy nebo buňkami. V praxi se setkáváme s řadou omezujících faktorů, které zpomalují výrobu produktů, zvyšují náklady na separaci nebo snižují výtěžek produktu. Těmito faktory mohou být například vysoké transportní odpory v heterogenních reakčních systémech, malá plocha mezifázového rozhraní nebo chemická a fyzikální podobnost reaktantů a produktů. Nové přístupy ke konstrukci bioreaktorů tak představují šanci na zlepšení stávajících ekonomických parametrů bioinženýrských výrob. Jiný problém představuje požadavek na rychlou a spolehlivou detekci chemických nebo biologických látek v životním prostředí nebo v medicínské diagnostice. Proto se velmi důležitou oblastí výzkumu stává problematika senzorů a biosenzorů. Z dosažených výsledků navrhovatele ve výzkumu bioreaktorů a biosenzorů je nutno zmínit následující: Využití stejnosměrného elektrického pole v bioreaktoru pro produkci kyseliny 6aminopenicilánové – důležitého meziproduktu pro výrobu -laktámových antibiotik. Aktivní částí bioreaktoru byla membrána s imobilizovaným enzymem. Ve vyvinutém bioreaktoru bylo možno významně urychlit chemickou reakci díky redukci transportních odporů a zároveň zajistit oddělení reakčních produktů a substrátu. Vytvořeno bylo též několik mikroreaktorových systémů pro enzymovou hydrolýzu sójového oleje. Olej s vodou vytváří dvoufázovou směs, přičemž hydrolýza oleje je katalyzována enzymem lipázou na mezifázovém rozhraní. V mikroreaktorových systémech bylo využito takzvaného segmentovaného toku, kdy malé objemy nemísitelných fází střídavě putují podél reakční mikrokapiláry. Segmentovaný tok zaručuje velkou plochu mezifázového rozhraní, intenzivní promíchávání uvnitř jednotlivých segmentů a konstantní dobu zdržení všech elementů tekutin v reakční kapiláře. Dosažené konverze v mikroreaktorech se segmentovaným tokem byly srovnatelné s hodnotami dosahovanými v klasických bioreaktorech, přičemž doba reakce byla kratší. Dalšího zlepšení provozních charakteristik mikroreaktoru bylo dosaženo s využitím třetí, inertní, fáze. Dále byl vyvinut automatizovaný luminiscenční senzor pro imunoanalytickou detekci protilátek v multikanálkovém mikrofluidním čipu. Koncentraci protilátek bylo možno detekovat v širokém rozmezí s dobou analýzy typicky nepřekračující deset minut, což představuje zlomek času v porovnání s běžnými ELISA systémy. Pribyl, M., Chmelikova, R., Hasal, P., Marek, M.: Penicillin G hydrolysis in an electro-membrane reactor with immobilized penicillin G acylase. Enzyme and Microbial Technology 33(6): 793-801, 2003. IF 2,592, 10 (10). Schrott, W., Nebyla, M., Pribyl, M., Snita, D.: Detection of immunoglobulins in a laser induced fluorescence system utilizing polydimethysiloxane microchips with advanced surface and optical properties. Biomicrofluidics 5(1): Art. 014101, 2011. IF 3,385, 6 (5). Cech, J., Schrott, W., Slouka, Z., Pribyl, M., Broz, M., Kuncova, G., Snita, D.: Enzyme hydrolysis of soybean oil in a slug flow microsystem. Biochemical Engineering Journal 67, 194-202, 2012. IF 2,579, 2 (0). Cech, J., Pribyl, M., Snita, D.: Three-phase slug flow in microchips can provide beneficial reaction conditions for enzyme liquid-liquid reactions. Biomicrofluidics 7(5): Art. 054103, 2013. IF 3,385, 0 (0). 35
