KEMAJUAN PERTENGAHAN TAHUN I
26/08/2016
MANUAL VIRTUAL STATISTICS LABORATORY PUPTN 2016 I Made Tirta et al
IDENTITAS Ketua
:
Anggota
:
Prof. Drs. I Made Tirta, MSc. Ph.D (NIDN: 0020125907) 1. Ir Martinus H. Pandutama, M.Sc., Ph.D (NIDN: 0026035402) 2. Drs. Budi Lestari, PGDiSc. M.Si (NIDN: 0025106308) 3. Diah Anggraini, S.Si, M.Si (NIDN:0016028201) MANUAL VSL
PUPT UNEJ 2016: I MADE TIRTA DKK
1
KEMAJUAN PERTENGAHAN TAHUN I
26/08/2016
Latar Belakang
Penelitian dalam bidang biosains masih sangat membutuhkan metode dan program statistika sebagai alat bantu dalam analisis data. Saat ini penggunaan piranti lunak statistika di Universitas Jember dan di Indonesia pada umumnya, masih didominasi oleh beberapa piranti lunak berbayar seperti SPSS, Minitab, SAS, dikarenakan kemudahan cara penggunaannya (berbasis GUI/menu). MANUAL VSL
Latar Belakang
Namun sebagian besar piranti lunak tersebut tidak memiliki ijin resmi dikarenakan harga yang berijin resmi masih relatif mahal. Di sisi lain tersedia piranti lunak statistika berbasis open source R yang gratis, tidak membutuhkan ijin resmi, berkembang pesat dan fleksibel untuk disesuaikan dengan kebutuhan. Namun piranti lunak ini tidak banyak diminati karena penggunaannya yang tidak mudah (berbasis skrip). MANUAL VSL
PUPT UNEJ 2016: I MADE TIRTA DKK
2
KEMAJUAN PERTENGAHAN TAHUN I
26/08/2016
GAP ANTARA STATISTISI & PRAKTISI
Wallace et al. (2012) Methodologists (usually statisticians) tend to implement advanced methods in statistical programming languages..., and perhaps most commonly now, in R. Non-technical researchers, meanwhile, are often deterred by programming and rely on available graphical user interface (GUI) driven tools. Such specialized software is generally easy to use, but usually lags withrespect to the statistical methods available. MANUAL VSL
GAP ANTARA STATISTISI & PRAKTISI
Wallace et al. (2012) ... The result is that practitioners continue to use inappropriate or suboptimal methods due to their being restricted to what is made available via GUIs. The problem is compounded by the fact that statistical programmers generally do not implement custom GUIs for new methods they develop.
MANUAL VSL
PUPT UNEJ 2016: I MADE TIRTA DKK
3
KEMAJUAN PERTENGAHAN TAHUN I
26/08/2016
GAP ANTARA STATISTISI & PRAKTISI Limited Access UNFRIENDLY
More Accessable MORE FRIENDLY
Belum Implementable
Pure Theoritical Statistician • Penghasil Teori • Pengisi Journal of Probability and Statistics
Peneliti Lapangan Good Stat + Good Programer • Mentransform teori ke Program Komputer • Pengisi JSS, R Journal
Sosialisasi Metode Baru Metode mudah dipahami Mudah diakses/ dieksekusi
• Aplikasi Statistika • Kasus Real, Lapangan
R
Bridging FILLING THE GAP MANUAL VSL
POPULARITAS R (Muenchen, 2015)
MANUAL VSL
PUPT UNEJ 2016: I MADE TIRTA DKK
4
KEMAJUAN PERTENGAHAN TAHUN I
26/08/2016
Handbook Statistika Online
E-Text Book, StatSoft (http://www.statsoft.com/textbook) yang mencakup teori statistika secara umum (dan mengacu pada paket StatSoft), tetapi tidak menggunakan notasi matematika yang baik, dan tidak dilengkapi dengan ilustrasi real. MANUAL VSL
IDE BESAR VIRTUAL STATS LAB WEB YANG MEMUAT E-modul/E-Tutorial (Dengan contoh riil dan dinamik) & dilengkapi Glosarium E-Praktikum (Simulasi) Analisis Data Online. Tujuan bukan sekedar “inform to others”, tapi transfer knowledge and experience to others khususnya dalam mengaplikasikan metode dengan lebih mudah
MANUAL VSL
PUPT UNEJ 2016: I MADE TIRTA DKK
5
KEMAJUAN PERTENGAHAN TAHUN I
26/08/2016
STARTING POINT
Fokus di bidang Biostatistika (khususnya yang mendukung penelitian kuantitatif di bidang lingkungan, seperti Regresi, Biodiversitas, Multivariat) Pada penelitian ini, lebih fokus lagi pada bidang Model Statistika (Regresi)
MANUAL VSL
KEUNGGULAN Desain:
lebih cepat, tidak perlu kompilasi seperti Latex, secara umum lebih sederhana dari GUI PC Pengguna: tidak perlu registrasi, tidak diperlukan penguasaan skrip R, hanya perlu penguasaan konsep, teori statistika. Cocok untuk pembelajar atau pengguna yang tidak cukup/perlu keterampilan pemrograman Dapat sekaligus belajar teori dan praktek analisis dengan data yang fleksibel (luaran dinamis) Ikut menaikkan rate webometrik MANUAL VSL
PUPT UNEJ 2016: I MADE TIRTA DKK
6
KEMAJUAN PERTENGAHAN TAHUN I
26/08/2016
PROTOTIFE VIRTUAL LAB PonStat (Pondok Statistik) Virtual Stats Lab
Metode Stats
E-Module/ eTutorial
Glosarium
Model Stats/ REGRESI
Multivariat*
Latex Board Analisis Data Online (SOLARS++)
MODEL STATS
Dasar & Menengah (SOLAR-S)
MULTIVARIAT* MANUAL VSL
CAKUPAN BIDANG
REGRESI/ MODELING
ROBUS
LINIER
NORMAL
ORDINAL
ADITIF
GLM
GAMMA (Kontinu Positif)
GLM+NS
POISSON (Cacahan)
LOGIT/PROBIT (Biner)
REPEATED
GAM
GAMLSS
GEE
GEE NOMINAL
MANUAL VSL
PUPT UNEJ 2016: I MADE TIRTA DKK
7
KEMAJUAN PERTENGAHAN TAHUN I
26/08/2016
KARAKTERISTIK E-TUTORIAL
Bisa Memilih/input Data Memuat uraian materi yang dilengkapi dengan contoh. paparan teorinya menggunakan notasi dan simbol-simbol matematika secara real dan benar contoh yang dibahas merupakan contoh yang dinamik dan interaktif paparan analisis akan menyesuaikan dengan data yang dipilih Estimasi, Uji inferensi (p-Val), Ukuran kecocokan (AIC/BIC) Dapat berfungsi sebagai file/dokumen penolong (help doc) MANUAL VSL
KARAKTERISTIK ANALISIS DATA (SOLARS++)
Mudah Input Data Eksplorasi Data (Numerik dan Grafik) Pemeriksaan Asumsi (Numerik dan Grafik) Ada Hasil Estimasi Ada Uji Signifikansi Ada Pemeriksaan Goodness of Fit Ada Seleksi Variabel Ada Visualisasi Grafik MANUAL VSL
PUPT UNEJ 2016: I MADE TIRTA DKK
8
KEMAJUAN PERTENGAHAN TAHUN I
26/08/2016
CONTOH TAMPILAN
MANUAL VSL
TAMPILAN WEB INDUK (VSL)
http://statslab-rshiny.fmipa.unej.ac.id/ MANUAL VSL
PUPT UNEJ 2016: I MADE TIRTA DKK
9
KEMAJUAN PERTENGAHAN TAHUN I
26/08/2016
DAFTAR TOPIK (SEMENTARA) http://statslab-rshiny.fmipa.unej.ac.id/indextc.html
MANUAL VSL
KUNJUNGAN
AWAL
AGUST 2016
MANUAL VSL
PUPT UNEJ 2016: I MADE TIRTA DKK
10
KEMAJUAN PERTENGAHAN TAHUN I
26/08/2016
MSI Regresi (Model Statistika) dengan Respon univariat/ saling bebas/ independen Ada banyak variabel bebas, tetapi hanya 1 variabel terikat/ respon LM/RLM, GLM, GLM+NS, GAM*, GAMLSS* http://statslab-rshiny.fmipa.unej.ac.id/ /RProg/MSI/ MANUAL VSL
MENU UTAMA
MANUAL VSL
PUPT UNEJ 2016: I MADE TIRTA DKK
11
KEMAJUAN PERTENGAHAN TAHUN I
26/08/2016
INPUT DATA
MANUAL VSL
INPUT DATA
Bisa memilih data yang sudah ada pada datanbase (online) Bisa mengimpor data sendiri (dalam format csv) Setiap kali melakukan penggantian data, laman web harus di-refresh !
MANUAL VSL
PUPT UNEJ 2016: I MADE TIRTA DKK
12
KEMAJUAN PERTENGAHAN TAHUN I
26/08/2016
EKSPLORASI DATA (UMUM)
MANUAL VSL
EKSPLORASI DATA UMUM Dapat melihat/menghitung/ menampilkan Numerik: Ringkasan Data Matriks korelasi (variabel numerik) Grafik: Matriks Diagram Korelasi Matriks Diagram Pencar
MANUAL VSL
PUPT UNEJ 2016: I MADE TIRTA DKK
13
KEMAJUAN PERTENGAHAN TAHUN I
26/08/2016
EKSPLORASI SMOOTHER
MANUAL VSL
EKSPLORASI SMOOTHER Eksplorasi Smoother (grafik) untuk nonlinear dengan 2 variabel LM/RLM GLM GLM+NS GAM GAMLSS
MANUAL VSL
PUPT UNEJ 2016: I MADE TIRTA DKK
14
KEMAJUAN PERTENGAHAN TAHUN I
26/08/2016
FORMULA MODEL
MANUAL VSL
FORMULA MODEL Dibuat tersendiri untuk menghemat penggunaan simbol dalam program, sehingga 1 formula berlaku untuk beberapa jenis regresi (jika mau membandingkan). Untuk menentukan, variabel bebas dan variabel terikat Untuk menentukan distribusi dan link
MANUAL VSL
PUPT UNEJ 2016: I MADE TIRTA DKK
15
KEMAJUAN PERTENGAHAN TAHUN I
26/08/2016
LUARAN/OUTPOT Untuk jens regresi LM, GLM, GLM+NS, RLM, Muntinom Meliputi Estimasi parameter (+Smoother) Nilai p-value Ukuran GOF (Goodness of Fit) Beberapa tersedia Regresi bertatar (stepwise) Grafik Diagram Pencar/ Diagnostik Luaran khusus yang diperlukan MANUAL VSL
LUARAN LM
MANUAL VSL
PUPT UNEJ 2016: I MADE TIRTA DKK
16
KEMAJUAN PERTENGAHAN TAHUN I
26/08/2016
LUARAN (PLOT LM)
MANUAL VSL
LUARAN (Plot, NonParametrik)
MANUAL VSL
PUPT UNEJ 2016: I MADE TIRTA DKK
17
KEMAJUAN PERTENGAHAN TAHUN I
26/08/2016
Cara Menyimpan Hasil Grafik
MANUAL VSL
Cara Menyimpan Hasil Teks
MANUAL VSL
PUPT UNEJ 2016: I MADE TIRTA DKK
18
KEMAJUAN PERTENGAHAN TAHUN I
26/08/2016
TUTORIAL TERKAIT (HELP DOC)
Hasil Pendukung (E-Tutorial) terkait Tutorial GLM (http://statslabrshiny.fmipa.unej.ac.id/RDoc/GLM/) Tutorial Logistik Multinom untuk respon nominal saling bebas (http://statslab-rshiny.fmipa.unej.ac.id/JORS/logmut)
MANUAL VSL
PERBANDINGAN DENGAN RCommander (Windows)
MANUAL VSL
PUPT UNEJ 2016: I MADE TIRTA DKK
19
KEMAJUAN PERTENGAHAN TAHUN I
26/08/2016
MSD Model Statistika dengan respon dependen/ multi respon (respon yang diukur berulang, atau gabungan beberapa variabel)
MANUAL VSL
GEE 1
MANUAL VSL
PUPT UNEJ 2016: I MADE TIRTA DKK
20
KEMAJUAN PERTENGAHAN TAHUN I
26/08/2016
GEE 1
Pilihan respon (Y) dan prediktor (X) untuk mean Pilihan identitas yang menunjukkan respon 1 kesatuan yang berulang (id) Jenis korelasi antar respon yang beriuang (CovStr) Uniform
(exchangeable)
AR1 Independen
(=GLM)
Jenis Distribusi dan Link MANUAL VSL
GEE 2
MANUAL VSL
PUPT UNEJ 2016: I MADE TIRTA DKK
21
KEMAJUAN PERTENGAHAN TAHUN I
26/08/2016
GEE 2
GEE1 + Pilihan prediktor (X) untuk dispersi (konstan=GEE1) + Link korelasi (identitas=GEE1)
MANUAL VSL
GUI-WINDOWS GUI versi windows yang populer adalah Rcommander (Rcmdr) Referensi awal: Presentasi dan Analisis Data dengan R
MANUAL VSL
PUPT UNEJ 2016: I MADE TIRTA DKK
22
KEMAJUAN PERTENGAHAN TAHUN I
26/08/2016
RCmdr
MANUAL VSL
RCmdr
Kontribusi sebagai penerjemah ke Bhs Indonesia
MANUAL VSL
PUPT UNEJ 2016: I MADE TIRTA DKK
23
KEMAJUAN PERTENGAHAN TAHUN I
26/08/2016
Kontak RCmdr developer
MANUAL VSL
GUI-WEB VS GUI WINDOWS No
Modeling
Web Virtual
GUI-Rcmdr
1
LM
√
√
2
GLM
√
√
3
GAM *
√
×
4
GAMLSS *
√
×
5
RLM
√
×
6
GLM+NS
√
×
7
GEE
√
×
8
Logistik Multinomial
√
√
9
Tutorial/ Teori
√
×
10
User perlu Download & Instal
×
√
11
Bergantung jaringan internet
√
×
MANUAL VSL
PUPT UNEJ 2016: I MADE TIRTA DKK
24
KEMAJUAN PERTENGAHAN TAHUN I
26/08/2016
MANUAL VSL
PUPT UNEJ 2016: I MADE TIRTA DKK
25
