Determinace sinic vodních květů v ČR Polyfázický přístup on „species“ level
Determinační praktikum PřF UK, 19. 11. 2007 Mgr. Lenka Šejnohová, Botanický ústav AVČR, Brno Oddělení experimentální fykologie a ekotoxikologie Botanický ústav Akademie věd ČR, Brno
Centrum pro cyanobakterie a jejich toxiny Botanický ústav Akademie věd ČR, Brno & Masarykova Univerzita
CCT – 4 sekce Vedoucí centra: : Doc. Ing. Blahoslav Maršálek, PhD.
1. Sekce cyanotoxinů Vedoucí sekce: Doc. Mgr. Luděk Bláha, PhD. analýzy cyanotoxinů, vlivy cyanotoxinů na ostatní organismy
2. Technologická sekce Vedoucí sekce: Doc. Ing. Blahoslav Maršálek, PhD. možnosti omezení rozvoje vodních květů sinic, metody pro detekci sinic
3. Sekce popularizace a ekologické výchovy Vedoucí sekce: Ing. Eliška Maršálková, PhD. popularizace problematiky sinic, školení a semináře pro odbornou veřejnost
4. Sekce autekologie a biologie sinic Vedoucí sekce: Mgr. Lenka Šejnohová autekologie sinic vodních květů, determinace fytoplanktonu a fytobentosu
Disertační práce:
Taxonomie a autekologie rodu Microcystis
Mgr. Lenka Šejnohová Školitel: Doc. Ing. Blahoslav Maršálek, CSc. Oddělení experimentální fykologie a ekotoxikologie Botanický ústav Akademie věd ČR, Brno
Centrum pro cyanobakterie a jejich toxiny Botanický ústav Akademie věd ČR, Brno & Masarykova Univerzita
Základní charakteristika sinic - 4vrst b. st. – gramnegativní bakterie - thylakoidy –- chl a, (b, c ), α- i β- karoten, xantofyly fykobilizómy: c-fykobilin, c-fykoerytrin, c-allofykocyanin - zás.l.: sinicový škrob - heterocyty: fixace vzdušného N - akinety: přežívání - gas vesicles: specifické plynové váčky - osídlují všechny biotopy - rozmnožování: výhradně nepohlavně - význam: vodní květy, použití ve výživě, farmacii a zemědělství http://www.sinicearasy.cz/pages/pokr/sinice
Vodní květy sinic (VKS) z
? Taxonomická jednotka, spojení ?
Ne vše co se vznáší na hladině jsou VKS …
Vodní květy sinic (VKS) sinice s aerotopy složené z gas vesiklů
65nm
Funkce: vznášení se na hladině
Vodní květy sinic – různé řády Řád
Typ stélky
Heterocyty
Akinety
Zástupci
Chroococcales
kokální
NE
NE
Microcystis,Chroococcus Woronichinia
Oscillatoriales
Vláknitá nevětvená
NE
Planktothrix,Oscillatoria, Phormidium, Spirulina Trichodesmium
NE
Nostocales
vláknitá nevětvená nebo s nepravým větvením
ANO
ANO
Nostoc, Anabeana, Anabaenopsis Aphanizomenon, Cylindrospermopsis, Tolypothrix Gloeotrichia
Stigonematales
Vláknitá s pravým větvením
ANO
ANO
Hapalosiphon, Stigonema
Na jaké znaky se při určování sinic musíme zaměřit Při určování sinic si musíme být vědomi: - sinice jsou staré organizmy prokaryotního typu, jsou proto mimořádně adaptabilní a to je spojeno s jejich širokou morfologickou variabilitou v rámci jednoho „druhu“ - není zde pohlavní rozmnožování
NUTNÉ prohlédnout co nejvíce kolonií nebo vláken v populaci a buňky měřit! - určovat KOMBINACÍ více ZNAKŮ, tzv. trvalých U vláknitých typů: U kokální typů: - velikost a tvar buněk - přímé/spirální vlákno - tvar kolonií - velikost a tvar buněk - uspořádání buněk v koloniích - míra zaškrcování vláken na přepážkách - šířka a forma slizu - vlákna jsou samostatná nebo tvoří shluky - přítomnost heterocytů a akinet (jejich tvar a umístění ve vlákně) - tvar koncových buněk Dobře určený druh (morfospecies): - musí odpovídat všem znakům, které jsou uvedeny v charakteristice druhu - pokud se vyskytnou sebemenší odchylky od charakteristiky druhu, je mnohem správnější k druhovému označení přiřadit cf. (znamená srovnej=confer) nebo za rod vložit pouze zkratku sp., než populaci označit nesprávným jménem
KOKÁLNÍ STÉLKA: Microcystis aeruginosa M. botrys M. flos-aquae M. ichthyoblabe M. natans M. smithii M. viridis M. wesenbergii Woronichinia naegeliana
VLÁKNITÁ STÉLKA: Anabaena affinis Anab. circinalis Anab. compacta Anab. crassa Anab. danica Anab. flos-aquae Anab. lemmermannii Anab. macrospora Anab. mendotae Anab. planctonica Anab. sigmoidea Anab. smithii Anab. solitaria Anab. spiroides Anab. viguieri Anabaenopsis arnoldii Anabs. milleri Anabs. elenkinii
Aphanizomenon elenkinii Aph. flos-aquae Aph. gracile Aph. issatschenkoi Aph. klebahnii Aph. yezoense Cylindrospermopsis raciborskii Gloeotrichia echinulata Planktothrix agardhii P. isothrix P. rubescens
KLÍČ NAD RÁMEC VK ZAHRNUJE Limnothrix redekei Pseudanabaena sp.
Chroococales Microcystis
vs.
Woronichinia
Forma slizu
Tvar buněk
Uspořádání buněk
Pět nejčastějších druhů r. Microcystis v ČR Vel. b.
Tvar kolonie
Sliz
2 – 3,2
nepravidelně sférické
rozplývavý, nezřetelný, někdy chybí
3,5 – 4,8
pravidelný kulovitý
4–7
4–6 5–9
krychlovité
Nahuštění b.
Druh
pravidelně rovnoměrně, zprvu M. ichthyoblabe velice hustě
rozplývavý
pravidelně rovnoměrně
M. flos-aquae
kopíruje okraje skupin b.
nepravidelně balíčkovité shluky
M. viridis
pravidelně rovnoměrně
M. aeruginosa
náhodně rozmístěné b.
M. wesenbergii
laločnaté, rozplývavý některé kolonie otvory zřetelně laločnaté, ohraničený, otvory oddálen od b.
..\..\Tax_sekce\IKVK\Vypracovani\IK_final\Interaktivni klic vyprac final\IKVK_sinic_1_unor06.ppt
Jak se naučit určovat VKS 1) Pomůcky Šejnohová et. al. (2005): Interaktivní klíč k určování vodních květů sinic CD () – r. 2008 plánovaná aktualizace + www forma Komárek, J. (1999): Přehled planktonních sinic v povodí Labe. IKSE/MKOL, Magdeburg. Komárek J. (1996): Klíč k určování vodních květů sinic v České republice. In: Maršálek B., Keršner V. & Marvan P. ed., Vodní květy sinic, p. 22-85, Brno. Komárek, J., Anagnostidis, K. (1999): Cyanoprocaryota – 1. Teil:Chroococcales.- In: Ettl, H., Gerloff, J., Heynig, H., Mollenhauer, D. (eds.): Süßwasserflora von Mitteleuropa, Band 19/1, Gustav Fischer Verlag. Komárek, J., Anagnostidis, K. (2005): Cyanoprokaryota – 2. Teil/ 2nd Part: Oscillatoriales. – In: Buedel B., Krienitz L., Gaertner G. & Schagerl M. (ed.), Süsswasserflora von Mitteleuropa, Band 19/2, Elsevier/Spektrum, Heidelberg. 2) Kurzy & konference Cyanobakterie 2004, 2006, 2008 – 2.-4.4. Taxonomické schůzky CCT – pátky 1x měsíčně http://www.sinice.cz/fytobentos/schuzky.htm Determinační kurzy fytoplankton – se specializací na VKS ve spolupráci SZU
Kontakty www.sinice.cz z www.sinice.cz/fytobentos z www.sinice.cz/fytobentos/algokurzy.htm z
z
Mailing list:
[email protected]
z
Kontakt na mě:
[email protected]
Polyfázický přístup v taxonomii sinic - moderní taxonomie sinic - kombinace mnoha metodických přístupů: molekulární studie 16S rRNA, ultrastruktura, morfologie
Microcystis Genera level – 16S rRNA potvrzeno Species level: ??? Ekologický a toxikologický rozdíl !!!
Metodika MALDI TOF
1. Odběr kolonií - plankton 400kol v průběhu sezóny Brněnská přehrada + 50kol plankton Břilický r. se zaměřením na M.flos-aquae
21
5 13 17
6. Oligopeptidové složení
550
770
mass m/z in Da
990
1210
5. MALDI-TOF MS
2. Izolace
3. Colony passport - určen druh - fotogr. dokumentace
Oddělení experimentální fykologie a ekotoxikologie Botanický ústav Akademie věd ČR, Brno
4.Přenesení kolonie na template
Centrum pro cyanobakterie a jejich toxiny Botanický ústav Akademie věd ČR, Brno & Masarykova Univerzita
Morfologické znaky u r. Microcystis vs. výskyt toxických oligopeptidů - CCA 51
46
M.aer.
77 cel_d_3
10.11. 43 92
M.icht.
5
82 62
m_0
41 23
81
clusters
15
38 7
cel_d_2
M.vir.
holes
59 17 86 63 76 47 70 74 13
cell diameter
Mcyst
9.7. 61
M.f-a..
cel_d_4 m_II_2 68
velikost buněk vs. produkce Mcyst
– malé buňky (2-3,5 um) - nižší frekvence pouze 27% – 5-6 um – frekvence 46-100%
Monitoring vodních květů sinic v ČR
Shrnutí výsledků mikroskopických rozborů VK Mgr. Lenka Šejnohová Oddělení experimentální fykologie a ekotoxikologie Botanický ústav Akademie věd ČR, Brno
Centrum pro cyanobakterie a jejich toxiny Botanický ústav Akademie věd ČR, Brno & Masarykova Univerzita
Organizace MVKS - historie 1. Odběr r. 1994 – Doc. Ing. B.Maršálek, CSc. – Vzorků celkem : 78 – Determinace: J.+J. Komárkovi – Finanční zázemí: Sdružení flos-aquae 2. Odběr r. 1999 – Rozšíření počtu lokalit (125) a vzorků (189) – Navíc analýzy Mcyst!! 3. Odběr 2004 – zahájení každoročního monitoringu (finanční zázemí 2004-2006 GAAV) – r. 2007 – hrazení výdajů SFA
Organizace MVKS - současnost Hlavní organizátor: Centrum pro cyanobakterie a jejich toxiny z Spolupracující instituce: 24 lidí (celkem 8 institucí, především Podniky Povodí, ZU Liberec) z Cíle: 1a) Jaké % fytoplanktonu tvoří v ČR sinice 1b) Jaké druhy sinic VK se v ČR pravidelně vyskytují 1c) V jakých sezónách dominují VK ve fytoplanktonu z
2a) Monitoring výskytu Mcyst intra/extracel. 2b) Lze odvodit asociaci výskytu Mcyst a rodu/druhu VK 3) Porovnání výsledků s okolními evropskými státy
Systém monitoringu VKS Počet lokalit: 125 Frekvence odběrů: 3x v sezóně (červen, červenec, srpen) Typ vzorků:
Vzorek volná voda
Analýza determinace, toxikologie
síťový plankton
determinace
filtrovaná voda (20um)
toxikologie
biomasa
toxikologie
Zpracování: - % obsah biomas hlavních rodů VKS - Podniky Povodí, ZU Liberec, CCT
Jaké rody tvoří VKS v ČR 100% 90% 80%
Woronichinia
70%
Planktothrix
60%
Cylindrospermopsis
50%
Aphnizomenon
40%
Anabaena
30%
Microcystis
20% 10% 0% 2004
2005
2006
Nejčastější rody tvořící VK Kokální: Woronichinia, Microcystis
Vláknité:
Planktothrix, Anabaena, Anabaenopsis, Aphanizomenon, Cylindrospermopsis
Nádrže zasažené rozvojem VK nejvíce Brněnská přehrada z České Údolí z Hracholusky z Nové Mlýny z Opatovický rybník z Rožmberk z Skalka z Vajgar z Žlutice z
Oddělení experimentální fykologie a ekotoxikologie Botanický ústav Akademie věd ČR, Brno
Centrum pro cyanobakterie a jejich toxiny Botanický ústav Akademie věd ČR, Brno & Masarykova Univerzita