Cover Page
The handle http://hdl.handle.net/1887/35349 holds various files of this Leiden University dissertation. Author: Hassan, Chopie Title: New strategies in identification and quantification of minor histocompatibility antigens Issue Date: 2015-09-16
Appendix
DANKWOORD In 2008 ben ik begonnen met mijn promotieonderzoek wat uiteindelijk geresulteerd heeft in dit proefschrift. Ik ben trots op het resultaat, maar dit proefschrift zou nooit tot stand zijn gekomen zonder de hulp van een heleboel mensen. Als eerste wil ik Michel bedanken. Michel zonder jou zou dit proefschrift niet tot stand gekomen zijn. Vanaf de eerste dag van mijn promotieonderzoek was jij al betrokken bij alle details van het onderzoek. Wij hebben de eerste twee jaren veel experimenten samen uitgevoerd. Ik zal nooit je hulp bij de celkweek, eiwitzuivering en de eluties vergeten. Pleun en Lorenz heel erg bedankt voor jullie bijdrage aan het onderzoek dat is beschreven in dit boek, vooral alle biologische experimenten met de tetrameren en T-cellen. Natuurlijk zal ik de tijd die ik doorgebracht heb bij het Laboratorium voor Experimentele Hematologie niet vergeten. Hierbij wil ik graag mijn collega’s en alle medewerkers van de Experimentele Hematologie bedanken voor hun hulp tijdens mijn werk bij de afdeling. George, bedankt voor je hulp bij de praktische uitdagingen bij mijn experimenten. Ik waardeer ontzettend de gesprekken waarin je jouw ervaringen met anderen deelt. Emmely, Jeroen en Kees, bedankt voor de leuke wetenschappelijke en niet wetenschappelijke discussies. Het was heel gezellig om samen met jullie in de kamer te zitten en te werken. Veronica, Frederike, Yvonne, Annemieke, Lianne, Allan en Jeroen, bedankt voor de gezellige dagen en jullie steun tijdens mijn promotie. Willemien, Robert en Natasja, bedankt voor de fijne samenwerking. Ik wil ook mijn collega’s van de Afdeling Immunohematologie en Bloedtransfusie bedanken voor hun steun en hulp tijdens mijn promotie. Dan de paranimfen: Kayi, bedankt omdat je mij altijd hebt gesteund vanaf het begin van de BFW-studie tot nu toe. Arnoud, ik wil je bedanken voor alle fractioneringen en metingen van de monsters met massaspectrometer die je hebt uitgevoerd. Zonder jou zou ik dit moment niet hebben kunnen bereiken. Het is een eer voor mij om naast jullie te staan tijdens mijn verdediging. Ik wil hiermee mijn familie en vrienden in het Koerdisch bedanken voor hun steun en belangstelling in mijn promotie:
ﻟﯾرەوە ﭘێم ﺧۆﺷﮫ زۆر ﺳوﭘﺎﺳﯽ ﺑﺎوک و داﯾﮑﯽ زۆر ﺧۆﺷﮫوﯾﺳﺗم ﺑﮑﮫم ﺑۆﺑﮫﺧێو ﮐردﻧﯽ ﻣن ﺑﮫﺷێوازێﮑﯽ زاﻧﺳﺗﯾﺎﻧﮫ و . ﺋێوە ھﮫﻣﯾﺷﮫ ﭘﺎڵﭘﺷﺗﯽ ﻣن ﺑوون ﻟﮫ ھﮫﻣوو ھﮫﻧﮕﺎوێﮑﯽ ژﯾﺎﻧﻣدا ﺧوا ﺑۆﻣﻧﺗﺎن ﺑﮭێﻠێت و ﺗﮫﻣﮫن درێژ ﺑن.ﻣۆدێرﻧﺎﻧﮫ ﺑراﮐﺎﻧم و ھﺎورێ، ﮐوڕی ﺷﯾرﯾﻧم ڕەوێن ﮔﯾﺎن،ھﮫروەھﺎ ﺋﮫﻣﮫوێت ﺳوﭘﺎﺳﯽ ھﺎوﺳﮫری ﺧۆﺷﮫوﯾﺳﺗم ڕێﺑوار .ﺧۆﺷﮫوﯾﺳﺗﮫﮐﺎﻧم ﺑﮑﮫم ﮐﮫ ھﮫﻣﯾﺷﮫ ﭘﺎڵﭘﺷت ﺑوون ﺑۆم و ﮐﺎرەﮐﺎﻧﯾﺎن ﺑۆ ﺋﺎﺳﺎن ﮐردوم
Rawen, door mijn studie en mijn promotie heb ik je vaak alleen moeten laten. Bedankt voor je geduld, steun en begrip in alle opzichten. Rebwar, zonder jou kon ik mijn promotie niet afronden. Bedankt voor je zorg, voor alle momenten die je mij gerust kon stellen en voor je oneindige begrip en geduld met mij.
217
Appendix
CURRICULUM VITAE Chopie Hassan werd geboren op 12 januari 1971 te Sulaimania, Koerdistan (Irak). In het jaar 1987 behaalde zij haar VWO-diploma in Sulaimania, Irak. In datzelfde jaar begon zij met de studie chemie aan de Universiteit van Salahadin in de stad Erbil (Irak). Na de eerste Golfoorlog heeft zij het bachelor diploma chemie behaald (1991). Door de moeilijke situatie in Irak mocht zij niet doorstuderen na die oorlog. Sinds 2000 woont zij in Nederland. In 2001 begon zij aan de vijfjarige studie Bio-farmaceutische wetenschappen aan de Universiteit Leiden. De masterstage werd uitgevoerd op de afdeling Farmacologie van het Leiden Amsterdam Center for Drug Research (LACDR) onder begeleiding van dr. Liesbeth de Lange en de prof. M . Danhof). De tweede stage vond plaats bij de Human Genetica-afdeling van het Leids Universitaire Medisch Centrum (LUMC) onder begeleiding van prof. Arn van den Maagdenberg. In 2006 werd de mastertitel behaald in de bio-farmaceutische wetenschappen. In hetzelfde jaar is zij begonnen als studieleider in vitro ADME te werken bij NOTOX in ‘s-Hertogenbosch. Daarna heeft zij als researchanalist gewerkt op de afdeling van Analytical Bio-Sciencesvan de Leidse Universiteit tot 2008. In hetzelfde jaar is zij begonnen aan het in dit proefschrift beschreven promotieonderzoek bij de afdeling van Immunohematologie bloedtransfusie’ en het ‘Laboratorium voor experimentele hematologie’van het LUMC onder begeleiding van dr. P.A.van Veelen en prof. dr. J.H.F. Falkenburg. Na de promotie periode begon zij werk als onderzoeker bij prof. Thomas Hankemeier op de Analytical Bio-Sciences afdeling van de Universiteit Leiden. Op dit moment werkt zij als Study Manager bij MicroSafe Laboratories in Leiden.
218
Appendix
LIST OF PUBLICATION Identification of Biological Relevant Minor Histocompatibility Antigens within the B-lymphocyte-Derived HLA-Ligandome Using a Reverse Immunology Approach. Hombrink P, Chopie Hassan, Kester MG, Lorenz Jahn, Pont MJ, de Ru AH, van Bergen CA, Griffioen M, Falkenburg JH, van Veelen PA, Heemskerk MH. Clin Cancer Res. (2015) 1;21 (9):2177-2186. Naturally processed non-canonical HLA-A*02:01 presented peptides. Chopie Hassan, Eric Chabrol, Lorenz Jahn, Michel G.D. Kester, Arnoud H. de Ru, Jan W. Drijfhout, Jamie Rossjohn, J.H. FrederikFalkenburg, Mirjam H. M. Heemskerk, Stephanie Gras & Peter A. van Veelen. J. Biol. Chem. (2014),M114.607028. Therapeutic targeting of the BCR associated protein CD79b in a TCR-based approach is hampered by aberrant expression of CD79b. Lorenz Jahn, Pleun Hombrink, ChopieHassan, Michel G.D. Kester, Dirk M. van der Steen, Renate S. Hagedoorn, J.H. FrederikFalkenburg, Peter A. van Veelen, andMirjam H.M. Heemskerk. Blood. (2014)-07587840. Accurate quantitation of MHC-bound peptides by application of isotopically labeled peptide MHC complexes. Chopie Hassan, Kester MG, Oudgenoeg G, de Ru AH, Janssen GM, Drijfhout JW, SpaapenRM, Jiménez CR, Heemskerk MH, Falkenburg JH, van Veelen PA. J Proteomics. (2014) 19 (109):240-244. Unique peptide-binding motif for Mamu-B*037:01: an MHC class I allele common to Indian and Chinese rhesus macaques. de Groot NG, Heijmans CM, de Ru AH, Chopie Hassan, Otting N, Doxiadis GG, Koning F, van Veelen PA, Bontrop RE. Immunogenetics. (2013)65(12):897-900. The human leukocyte antigen-presented ligandome of B lymphocytes. Chopie Hassan, Kester MG, de Ru AH, Hombrink P, Drijfhout JW, Nijveen H, Leunissen JA, Heemskerk MH, Falkenburg JH, van Veelen PA. Mol Cell Proteomics(2013) 12(7):1829-43. Discovery of T cell epitopes implementing HLA-peptidomics into a reverse immunology approach. Hombrink P, Chopie Hassan, Kester MG, de Ru AH, van Bergen CA, Nijveen H, Drijfhout JW, Falkenburg JH, Heemskerk MH, van Veelen PA. J Immunol. (2013)15 (190):3869-3877. Alternative peptide repertoire of HLA-E reveals a binding motif that is strikingly similar to HLA-A2. Lampen MH, Chopie Hassan, Sluijter M, Geluk A, Dijkman K, Tjon JM, de Ru AH, vander Burg SH, van Veelen PA, van Hall T. Mol Immunol. (2013)53(1-2):126-31. Comparison of peptide and protein fractionation methods in proteomics. Ekaterina Mostovenko, Chopie Hassan, Janine Rattke, André M. Deelder, Peter A. van Veelen, Magnus Palmblad. EuPA Open Proteomics, (2013) 1: 30 37. HSPVdb--the Human Short Peptide Variation Database for improved mass spectrometry-based detection of polymorphic HLA-ligands. Nijveen H, Kester MG, Chopie Hassan, Viars A, de Ru AH, de Jager M, Falkenburg JH, Leunissen JA, van Veelen PA. Immunogenetics. (2011) 63(3):143-53.
219
