ANALISIS SITOGENETIKA PADA PASIEN DENGAN AMENORE PRIMER DI CENTER FOR BIOMEDICAL RESEARCH (CEBIOR) SEMARANG
LAPORAN HASIL KARYA TULIS ILMIAH
Diajukan untuk memenuhi sebagian persyaratan guna mencapai gelar sarjana strata-1 pendidikan dokter Pirsa Hatpri Nur Ira 2201010111120022
PROGRAM PENDIDIKAN SARJANA KEDOKTERAN FAKULTAS KEDOKTERAN UNIVERSITAS DIPONEGORO 2015
ii
PERNYATAAN KEASLIAN
Yang bertanda tangan dibawah ini, Nama mahasiswa
: Pirsa Hatpri Nur Ira
NIM
: 22010111120022
Program Studi
: Program Pendidikan Sarjana Program Studi Pendidikan Dokter Fakultas Kedokteran Universitas Diponegoro
Judul KTI
: Analisis Sitogenetika Pada Dengan Pasien Amenore Primer di Center For Biomedical Research (CEBIOR) Semarang
Dengan ini menyatakan bahwa : 1) KTI ini ditulis sendiri tulisan asli saya sendiri tanpa bantuan orang lain selain pembimbing dan narasumber yang diketahui oleh pembimbing. 2) KTI ini sebagaian atau seluruhnya belum pernah dipublikasi dalam bentuk artikel ataupun tugas ilmiah lain di Universitas Diponegoro maupun di perguruan tinggi lain. 3) Dalam KTI ini tidak terdapat karya atau pendapat yang telah ditulis orang lain kecuali secara tertulis dicantumkan sebagai rujukan dalam naskah dan tercantum pada daftar kepustakaan.
iv
KATA PENGANTAR Puji syukur saya panjatkan kehadirat Tuhan Yang Maha Esa, karena atas berkat dan rahmat-Nya kami dapat menyelesaikan tugas Karya Tulis Ilmiah yang berjudul “Analisis Sitogenetika Pada Pasien Amenore Primer di Center For Biomedical Research (CEBIOR) Semarang”. Penulisan Karya Tulis Ilmiah ini dilakukan dalam rangka memenuhi salah satu syarat untuk mencapai gelar Sarjana Kedokteran di Fakultas Kedokteran Universitas Diponegoro. Kami menyadari sangatlah sulit bagi kami untuk menyelesaikan Karya Tulis Ilmiah ini tanpa bantuan dan bimbingan dari berbagai pihak. Bersama ini kami menyampaikan terima kasih yang sebesar – besarnya serta penghargaan yang setinggi – tingginya kepada: Rektor Universitas Diponegoro Semarang yang telah memberikan sarana dan prasarana untuk menimba ilmu di Universitas Diponegoro, Dekan Fakultas Kedokteran UNDIP yang telah memberikan sarana dan prasarana kepada kami sehingga kami dapat menyelesaikan tugas ini dengan baik, Prof. dr. Sultana M.H. Faradz, PhD selaku dosen pembimbing 1 yang telah menyediakan waktu, tenaga dan pikiran untuk membimbing kami dalam penyusunan Karya Tulis Ilmiah ini, dr. Mahayu Dewi Ariani, Msi.Med selaku dosen pembimbing 2 yang telah menyediakan waktu, tenaga dan pikiran untuk membimbing kami dalam penyusunan Karya Tulis Ilmiah ini, Bapak, ibu, Mas Bowo, Mas Aries, Mas Dana, Mas Rantos, yang senantiasa memberikan dukungan moral maupun material, Mbak Rita, Mbak Wiwik, Mbak Dina, Mbak Evi, Pak Joko, Mas Intus dan seluruh staf CEBIOR FK UNDIP yang senantiasa memberikan bantuan dan dukungan dalam menyelesaikan Karya Tulis Ilmiah ini, Ageng, Dinni, Genta, Mbak Ade, Fida, Bazilah dan seluruh sahabat yang selalu memberi dukungan dalam menyelesaikan Karya Tulis Ilmiah ini., Serta pihak lain yang tidak mungkin kami sebutkan satu – persatu atas bantuannya secara langsung maupun tidak langsung, sehingga Karya Tulis Ilmiah ini dapat terselesaikan dengan baik. Akhir kata, kami berharap Tuhan Yang Maha Esa berkenan membalas segala kebaikan semua pihak yang telah membantu. Semoga Karya Tulis Ilmiah ini dapat bermanfaat bagi kita semua.
Semarang, 20 Juni 2015
Penulis
iv
DAFTAR ISI HALAMAN JUDUL................................................................................................i LEMBAR PENGESAHAN.....................................................................................ii PERNYATAAN KEASLIAN................................................................................iii KATA PENGANTAR............................................................................................iv DAFTAR ISI............................................................................................................v DAFTAR TABEL................................................................................................viii DAFTAR GAMBAR..............................................................................................ix DAFTAR GRAFIK..................................................................................................x DAFTAR LAMPIRAN..........................................................................................xi DAFTAR SINGKATAN.......................................................................................xii DAFTAR ISTILAH..............................................................................................xiv ABSTRAK.............................................................................................................xv ABSTRACT..........................................................................................................xvi BAB 1 PENDAHULUAN....................................................................................... 1.1 Latar Belakang...................................................................................................1 1.2 Permasalahan......................................................................................................4 1.3 Tujuan Penelitian...............................................................................................4 1.4 Manfaat Penelitian.............................................................................................5 1.5 Orisinalitas Penelitian........................................................................................6 BAB 2 TINJAUAN PUSTAKA 2.1 Determinasi dan Diferensiasi Seks...................................................................10 2.2 Kelainan Determinasi dan Diferensiasi Seks...................................................15
v
2.3 Fisiologi Menstruasi.........................................................................................16 2.4 Amenore Primer...............................................................................................19 2.4.1 Definisi..........................................................................................................19 2.4.2 Insidensi........................................................................................................20 2.4.3 Patofisiologi..................................................................................................20 2.4.4 Etiologi..........................................................................................................21 2.5 Analisis Sitogenetika........................................................................................27 BAB 3 KERANGKA TEORI DAN KERANGKA KONSEP 3.1 Kerangka Teori.................................................................................................31 3.2 Kerangka Konsep.............................................................................................32 BAB 4 METODE PENELITIAN 4.1 Ruang Lingkup Penelitian................................................................................33 4.2 Tempat dan Waktu Penelitian..........................................................................33 4.3 Jenis dan Rancangan Penelitian.......................................................................33 4.4 Populasi dan Sampel........................................................................................33 4.4.1 Populasi Target..............................................................................................33 4.4.2 Populasi Terjangkau......................................................................................34 4.4.3 Sampel...........................................................................................................34 4.4.3.1 Kriteria Inklusi...........................................................................................34 4.4.3.2 Kriteria Eksklusi.........................................................................................34 4.4.5 Cara Sampling...............................................................................................34 4.4.6 Besar Sampel.................................................................................................34 4.5 Definisi Operasional.........................................................................................35
vi
4.6 Cara Pengumpulan Data...................................................................................35 4.6.1 Bahan.............................................................................................................35 4.6.2 Alat................................................................................................................35 4.6.3 Jenis Data......................................................................................................36 4.6.4 Cara Kerja.....................................................................................................36 4.7. Alur Penelitian................................................................................................38 4.8 Analisis Data....................................................................................................38 4.9 Etika Penelitian................................................................................................39 4.10 Jadwal Penelitian............................................................................................40 BAB 5 HASIL PENELITIAN...............................................................................41 BAB 6 PEMBAHASAN........................................................................................58 BAB 7 SIMPULAN DAN SARAN.......................................................................66 DAFTAR PUSTAKA............................................................................................68 LAMPIRAN...........................................................................................................79
vii
DAFTAR TABEL
Tabel 1. Orisinalitas penelitian................................................................................6 Tabel 2. Definisi Operasional................................................................................35 Tabel 3. Jadwal Penelitian.....................................................................................40 Tabel 4. Distribusi Jenis Kelamin, Usia, Kariotip dan Diagnosis Pasien Amenore Primer ....................................................................................................................46 Tabel 5. Distribusi Diagnosis, Jumlah Pasien dan Kariotip Pasien Amenore Primer di CEBIOR................................................................................................49 Tabel 6. Distribusi Klasifikasi Tanner stage dan Quigley Stage Pasien Amenore Primer.....................................................................................................................51 Tabel 7. Gambaran Pemeriksaan Fisik (Dismorfologi) Pada Pasien Amenore Primer di CEBIOR................................................................................................54
viii
DAFTAR GAMBAR
Gambar 1. Perkembangan testis.........................................................................13 Gambar 2. Fisiologi menstruasi............................................................................19 Gambar 3. Patofisiologi menstruasi......................................................................21 Gambar 4. Penyebab amenore primer pada tingkat hipotalamus........................23 Gambar 5. Kerangka teori...................................................................................31 Gambar 6. Kerangka konsep...............................................................................32 Gambar 7. Alur penelitian...................................................................................38 Gambar 8.Quigley Stage.......................................................................................80 Gambar 9.Tanner Stage........................................................................................83
ix
DAFTAR GRAFIK
Grafik 1. Persentase Umur Pasien Amenore Primer di CEBIOR.........................41 Grafik 2. Distribusi Pasien Amenore Primer Pertahun di Semarang....................42 Grafik 3. Persentase Usia Maternal Pada Pasien Dengan Amenore Primer di CEBIOR.................................................................................................................44 Grafik 4. Persentase Jenis Kromosom Pasien Amenore Primer...........................45 Grafik 5. Persentase Dismorfologi Pada Pasien Dengan Amenore Primer di CEBIOR.................................................................................................................52 Grafik 6. Jenis Kelainan Fisik (Dismorfologi) Pada Pasien Amenore Primer.....53.
x
DAFTAR LAMPIRAN
Lampiran 1.Quigley Stage....................................................................................79 Lampiran 2. Tanner Stage....................................................................................81 Lampiran 3. Prosedur Pemeriksaan Sitogenetik...................................................84 Lampiran 4. Ethical Clearance Penelitian...........................................................88 Lampiran 6. Biodata Penulis................................................................................89
xi
DAFTAR SINGKATAN
HPO
: Hipothalamus Pituitary Ovarium
GnRH
: Gonadotropin Releasing Hormone
FSH
: Follicle Stimulating Hormone
LH
: Luteinizing Hormone
DSD
: Disorders of Sexual Development
SF-1
: Steroidogenic Factor 1
MIS
: Mullerian Inhibiting Substance
WT-1
: Willms Tumor 1
DAX-1
: Dosage-sensitive sex reversal, Adrenal hypoplasia critical region, on chromosome X, gene 1)
DG
: Disgenesis Gonad
PGD
: Pure Gonadal Dysgenesis
TSH
: Tyroid Stimulating Hormone
GH
: Growth Hormone
MRKH
: Mayer Rokitansky Kuster Hauser
CYP 17
: 17 –Alpha Hidroksilase
MURCS
: Mullerian Duct Aplasia, Unilateral Renal Agenesis, and Cervicothoracis Somite Anomalies
KAL
: Kallmann Syndrome Gene
PHA-M
: Phytohemaglutininm Mixture
XCI
: X – Chromosome Inactivtion
xii
CAH
: Congenital Adrenal Hyperplasi
AIS
: Androgen Insensitivity Syndrome
PAIS
: Partial Androgen Insensitivity Syndrome
CAIS
: Complete Androgen Insensitivity Syndrome
AR
: Androgen Receptor
xiii
DAFTAR ISTILAH
Amenore Primer
: tidak terjadinya haid pada pubertas
Analisis Sitogentika : suatu pemeriksaan bahan genetik pada tingkat sel (kromosom) yang dapat diperiksa dengan mikroskop cahaya Kromosom
: struktur di dalam sel berupa deret panjang molekul yang terdiri dari satu molekul DNA dan berbagai protein terkait yang merupakan informasi genetik suatu organisme.
Kariotipe
: konstitusi kromosomal inti sel
Menstruasi
: sekret fisiologik darah dan jaringan mukosa serta bersiklus yang melalui vagina dari uterus tidak hamil
Menarche
: pembentukan atau permulaan fungsi menstruasi
Dismorfologi
: kelainan kongenital malformasi atau cacat bawaan yaitu bentuk fisik yang tidak biasa ditemukan pada kelompok umur tertentu
xiv
ABSTRAK Latar Belakang : Amenore primer bukan suatu penyakit tetapi gejala dari suatu penyakit yang disebabkan oleh berbagai sebab seperti kelainan differensiasi gonad, gangguan endokrin dan kelainan genetik spesifik. Amenore primer merupakan salah satu kelainan yang menjadi indikasi untuk dilakukan analisis kromosom guna mengetahui kelainan kromosom sebagai penyebab amenore primer. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui hasil dan distribusi hasil analisis kromosom pada pasien dengan amenore primer di Laboratorium Pusat Riset Biomedik (CEBIOR) Fakultas Kedokteran Universitas Diponegoro, Semarang. Metode : Penelitian ini menggunakan desain deskriptif retrospektif dan prospektif. Penelitian ini dilakukan pada pasien amenore primer yang memeriksakan diri ke CEBIOR periode Januari 2005 sampai dengan April 2015. Hasil : Penelitian dilakukan pada 71 pasien pasien dengan amenore primer pada periode Januari 2005 sampai dengan April 2015 dan mengidentifikasi 47 (65,3%) pasien dengan kariotipe 46, XX, 9 (12,7%) pasien dengan kariotipe 46, XY dan 16 (22,2%) pasien dengan aberasi kromosom baik numerik maupun struktural seperti 45, X, 45, X/46, XX, 1Xq, 46, XX/ 45, X (2%) dan 46,XX (99%)/ 45, X (1%), 46,X, i(X)(q10)(85%)/45, X(15%), 45,X(76%)/46, X, i(X)(q10)(24%), 47, XY+21, 46, XX,del (9)(p23)->pter, 46, XX, t(1; X)(p34; q25), 46, XX, t(1; X)(p34; q25), dan 46, XX/46, XY(10%). Kesimpulan dan Saran : Pemeriksaan sitogenetika telah dillakukan pada 71 pasien dan mayoritas mempunyai kromosom 46, XX. Pemeriksaan sitogenetika sangat penting dalam menegakkan diagnosis dan penanganan kelainan, meskipun terdapat beberapa kasus kelainan kromosom yang tidak dapat didiagnosis dengan pemeriksaan sitogenetika sehingga diperlukan pemeriksaan lanjutan yaitu pemeriksaan molekuler.
Kata Kunci : Amenore primer, Pemeriksaan Sitogenetika
xvi
ABSTRACT Background : Primary amenorrhea is a symptom that may result from several quite different causes such as gonadal anomalies, endocrinological imbalance and specific of genetic disorders. Primary amenorrhea is one of indications for cytogenetic analysis, which have shown the importance of chromosomal abnormalities as a cause of amenorrhea. The aim of this study is to know the distribution of karyotype in patients with primary amenorrhea in Center For Biomedical Research (CEBIOR) Medical Faculty of Diponegoro University, Semarang. Subject and Method : This study was a descriptive retrospective and prospective study design. The subjects are patients with primary amenorrhea who examined in CEBIOR Semarang since January 2005 to April 2015. Results : Cytogenetic analysis were carried out to 71 patients with primary amenorrhea during January 2005 to April 2015 and identified 47(65,3%) subjects with 46, XX; 9 (12,7%) subjects with 46, XY and 16 (22,2%) subjects with numerical and structural sex chromosome aberration such as 45, X, 45, X/46, XX, 1Xq, 46, XX/ 45, X (2%) dan 46,XX (99%)/ 45, X (1%), 46,X, i(X)(q10)(85%)/45, X(15%), 45,X(76%)/46, X, i(X)(q10)(24%), 47, XY+21, 46, XX,del (9)(p23)->pter, 46, XX, t(1; X)(p34; q25), 46, XX, t(1; X)(p34; q25), and 46, XX/46, XY(10%). Conclusion : Cytogenetic analysis was done for 71 subjects and mostly subjects have 46, XX karyotype. Cytogenetic investigations are important to established the diagnoses and management for primary amenorrhea cases, although in some cases with cryptic chromosome aberrations should be investigated with molecular analysis.
Keywords : Primary amenorrhea, Cytogenetic analysis
xvi
