ZHODNOCENÍ PŘÍPRAVNÉ FÁZE EURO-BIOIMAGING PROSINEC 2015
Zpracovali: prof. RNDr. Pavel Hozák, DrSc., národní koordinátor projektu Euro-BioImaging & CzechBioImaging Mgr. Markéta Morská, projektová manažerka Ústav molekulární genetiky AV ČR, v.v.i.
Materiál byl vypracován v rámci projektu „Podpora české účasti v pan-evropské výzkumné infrastruktuře Euro-BioImaging (LE12004)“, financovaném z programu EUPRO II Ministerstva školství, mládeže a tělovýchovy ČR.
Úvod Euro-BioImaging je projektem velké pan-evropské výzkumné infrastruktury zařazené v Cestovní mapě Evropského strategického fóra pro výzkumné infrastruktury (ESFRI). Euro-BioImaging je budován jako distribuovaná infrastruktura evropských pracovišť poskytujících otevřený přístup k biologickému a biomedicínskému zobrazování. Umožní vědcům stálý přístup k zobrazovacím technologiím, které nemají k dispozici ve svých mateřských institucích. Dalšími cíli je poskytnout vzdělávání a trénink v biologických a biomedicínských zobrazovacích technologiích a napomáhat vývoji zobrazovacích technologií v biomedicíně. Infrastruktura Euro-BioImaging je zaměřen na zobrazovací technologie pro sledování biologických systémů, a to od jednotlivé molekuly po celý lidský organismus. Infrastruktura EuroBioImaging také nabídne platformu pro ukládání, sdílení a zpracování biologických a medicínských dat ve velkém měřítku. Standardy pro ukládání a analýzu obrazových dat umožní vědcům sdílet data a opakovaně je využívat mezi jednotlivými vědeckými komunitami v různých státech. Euro-BioImaging přispěje k tomu, že investice do výzkumné infrastruktury budou využívány hospodárně a efektivně při dodržování standardů kvality v oblasti řízení, přístupu, vzdělávání a služeb zobrazovacích pracovišť.
Přípravná fáze Euro-BioImaging Přípravná fáze projektu Euro-BioImaging probíhala od 1. prosince 2010 do 31. května 2014. Přípravná fáze byla financována 7. rámcovým programem pro výzkum a technologický rozvoj. Konsorcium projektu bylo složeno z 39 příjemců (partnerů) z 15 členských a přidružených států EU. Dále bylo v konsorciu přes 200 přidružených partnerů z 26 členských a přidružených států EU. Kromě toho byl Euro-BioImaging formálně podporován více než 220 univerzitami, výzkumnými radami, grantovými agenturami, ministerstvy a průmyslovými partnery. Do přípravné fáze Euro-BioImaging byl zapojen Ústav molekulární genetiky AV ČR, který byl partnerem v konsorciu, odpovědným za koordinaci pracovního balíčku pro vzdělávací strategii Euro-BioImaging. Dále se přípravné fáze účastnilo dalších 10 institucí z ČR jako přidružení partneři:
Biotechnologické a biomedicínské centrum Akademie věd a Univerzity Karlovy ve Vestci (BioCeV) Fyziologický ústav Akademie věd ČR, v.v.i. Institut klinické a experimentální medicíny Karlova univerzita v Praze Masarykova univerzita v Brně Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy Středoevropský technologický institut (CEITEC) Ústav fyzikální chemie J. Heyrovského Akademie věd ČR, v.v.i. Ústav přístrojové techniky Akademie věd ČR, v.v.i. Ústav živočišné fyziologie a genetiky Akademie věd ČR, v.v.i.
V rámci přípravné fáze bylo dosaženo shody ohledně modelu infrastruktury, řídící struktury, finančního modelu a politiky uživatelského přístupu. Dále proběhla 1. otevřená výzva pro budoucí uzly Euro2
BioImaging. Konsorcium Euro-BioImaging pro přípravnou fázi ukázalo, že navržená infrastruktura přináší prospěch jak provozovatelům zobrazovacích pracovišť, tak jejich uživatelům, a je schopná produkovat kvalitní vědecké výstupy. Všechny dokumenty přípravné fáze jsou dostupné na: http://www.eurobioimaging.eu/contentpage/documents-gallery.
Přechodná fáze Euro-BioImaging Po ukončení přípravné fáze probíhá tzv. přechodná fáze na základě memoranda o porozumění k EuroBioImaging. Do současnosti přistoupilo k memorandu 14 států a mezinárodní organizace Evropská laboratoř pro molekulární biologii (EMBL). Česká republika přistoupila k memorandu o porozumění dne 28. února 2014. Přechodná fáze je řízena prozatímním výborem Euro-BioImaging složeným ze zástupců zemí, které podepsaly memorandum o porozumění. Českou republiku zastupuje v prozatímním výboru Euro-BioImaging JUDr. Jan Buriánek z Ministerstva školství, mládeže a tělovýchovy, prof. Pavel Hozák jako zástupce pro oblast biologického zobrazování, který zároveň plní funkci národního koordinátora, a prof. Ivan Rektor jako zástupce pro oblast medicínského zobrazování. Přechodná fáze Euro-BioImaging je financována dobrovolnými příspěvky členských států.
Zapojení ČR do konstrukční fáze Prozatímní výbor rozhodl, že do pilotní fáze Euro-BioImaging mohou být nominovány pouze uzly, které prošly nezávislých hodnocením v rámci 1. výzvy pro budoucí uzly Euro-BioImaging, která proběhla v přípravné fázi projektu. U uzlů, u nichž nezávislá hodnotící komise shledala potřebu úpravy nebo zlepšení, prozatímní výbor požadoval dopracování přihlášky zohledňující připomínky nezávislé hodnotící komise, a provedení národního hodnocení. Z důvodu, že u obou českých uzlů požadovala komise zlepšení přihlášky, oba uzly své přihlášky doplnily. Dne 21. ledna 2015 uspořádal prof. Pavel Hozák národní hodnocení těchto zlepšených přihlášek za účasti dvou nezávislých zahraničních expertů (Johna Erikssona z Finska a Jason Swedlowa z Velké Británie) a zástupce MŠMT. Zahraniční experti shledali zlepšení obou uzlů jako dostatečné a doporučili jejich zapojení do Euro-BioImaging. V červnu 2015 pak Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy formálně nominovalo dva české uzly do pilotní fáze Euro-BioImaging. Jedná se o tato dvě uskupení:
Uzel pro oblast pokročilé světelné a elektronové mikroskopie, předkladatel: Ústav molekulární genetiky AV ČR, účastnící se subjekty: Univerzita Karlova (zobrazovací servisní pracoviště Biotechnologického a biomedicínského centra Akademie věd a Univerzity Karlovy ve Vestci), Fyziologický ústav AV ČR a Ústav experimentální botaniky AV ČR, uzel pro oblast pokročilé světelné mikroskopie a medicínského zobrazování, předkladatel: Masarykova univerzita, účastnící se subjekty: Masarykova univerzita (Fakulta informatiky, 3
Středoevropský technologický institut – program genomika a proteomika rostlinných systémů, program molekulární a funkční neuro zobrazování), Ústav přístrojové techniky AV ČR a Vysoké učení technické v Brně. Během léta pracovní skupina 3 pro výběr uzlů, jejímž členem je prof. Hozák, zhodnotila všechny přihlášky a postoupila kladně vyhodnocené přihlášky k ratifikaci prozatímnímu výboru. Prozatímní výbor schválil první generaci uzlů Euro-BioImaging dne 31. listopadu 2015. Oba uzly z České republiky byly schváleny prozatímním výborem jednomyslně. První uživatelé by měli být přijati v rámci pilotní fáze Euro-BioImaging na začátku roku 2016.
Zapojení do mezinárodních projektů V návaznosti na zapojení Ústavu molekulární genetiky AV ČR (ÚMG) v přípravné fázi Euro-BioImaging jako koordinátora vzdělávací strategie byl ÚMG vyzván ke spolupráci na přípravě projektu „Vzdělávací program pro výzkumné infrastruktury“ (Research Infrastructures Training Programme - RItrain). Jde o projekt financovaný rámcovým programem pro vědu a inovace EU „Horizont 2020“, výzvy INFRASUPP-3 „Posílení lidského kapitálu výzkumné infrastruktury". Projekt byl schválen Evropskou komisí a oficiálně byl zahájen 1. září 2015. Cílem projektu je vytvořit vzdělávací program pro vedoucí výzkumných infrastruktur a jejich uzlů. Čtyřletého projektu se účastní 12 partnerů (zástupců výzkumných infrastruktur). ÚMG, který zastupuje v projektu Euro-BioImaging, se podílí na definování potřeb vedoucích infrastruktur a uzlů, analýze stávajících vzdělávacích aktivit zaměřených na pracovníky výzkumných infrastruktur, a vytvoření magisterského programu v oblasti řízení výzkumných infrastruktur. Dále jsou Ústav molekulární genetiky AV ČR a Masarykova univerzita zapojeny do projektu „Přípravná fáze Euro-BioImaging II“ (Euro-BioImaging Preparatory Phase II). Jde o projekt financovaný taktéž programem Horizont 2020 v rámci výzvy INFRADEV-2-2015 „Přípravná fáze ESFRI projektů“. Tento dvouletý projekt bude zahájen 1. ledna 2016. Cílem projektu je dokončit přípravu infrastruktury Euro-BioImaging, zejména přijmout právní základ infrastruktury tzv. ERIC (European Research Infrastructure Consortium), nastavit fungování mezi centrem infrastruktury a uzly, otestovat model otevřeného přístupu pro uživatele atd. Jak ÚMG tak Masarykova univerzita jsou zapojeny ve většině pracovních balíčků konsorcia a budou se podílet na testování nastavení infrastruktury.
Přínos ze zapojení ČR do přípravné fáze Euro-BioImaging Účast ČR v Euro-BioImaging je úzce provázána s národní výzkumnou infrastrukturou Czech-BioImaging, neboť oba uzly tvoří její páteřní osu. Czech-BioImaging je uveden v Cestovní mapě České republiky velkých infrastruktur pro výzkum, experimentální vývoj a inovace pro léta 2016 až 2022. Cílem Czech-BioImaging je propojit unikátní přístrojové vybavení pro biomedicínské zobrazování dostupné v ČR a zajistit koordinovaný otevřený přístup a vzdělávání v této oblasti pro českou i zahraniční vědeckou komunitu. Právě během přípravné fáze Euro-BioImaging se začala intenzivně formovat tato národní zobrazovací infrastruktura pro biologické a medicínské zobrazování. Zapojení subjektů z ČR do projektu, ať již v roli 4
člena konsorcia nebo přidruženého partnera umožnilo sdílet zkušenosti a navázat spolupráci s ostatními zobrazovacími pracovišti v Evropě. Dalším přínosem je, že ČR byla přímo zapojena do diskusí o nastavení infrastruktury Euro-BioImaging a mohla tak lépe prosazovat své zájmy a zároveň připravovat návrh národní infrastruktury tak, aby byl v souladu s principy nastavenými pro Euro-BioImaging. Přítomnost několika špičkových zobrazovacích technologií a vysoce kvalitní výzkum, který je postaven na využití těchto technologií, může podpořit spolupráci a zvýšit viditelnost českých zobrazovacích pracovišť v evropském výzkumném prostoru. Navíc zapojení dvou národních uzlů v Euro-BioImaging, který sdružuje nejlepší evropská zobrazovací pracoviště, podpoří mezinárodní spolupráci jak mezi uživateli a uzly, tak mezi uzly navzájem např. formou výměny technologického know-how. Projekty spolupráce v rámci EuroBioImaging mohou také vyústit v nové možnosti financování.
Odkazy: Euro-BioImaging - http://www.eurobioimaging.eu/ Czech-BioImaging - http://czech-bioimaging.cz/ RItrain - http://ritrain.eu/
5
