V´ypoˇcetn´ı cluster vytvoˇren´y pomoc´ı Debian Squeeze Jiˇr´ı Pech ˇ ˇ Jihoˇceska´ Univerzita v Cesk´ ych Budejovic´ ıch ˇ Pˇr´ırodovedeck a´ fakulta
´ ska pro ORS2011 Pˇrednaˇ
Jiˇr´ı Pech
V´ypoˇcetn´ı cluster vytvoˇren´y pomoc´ı Debian Squeeze
Co je to v´ypoˇcetn´ı cluster Definice V´ypoˇcetn´ı cluster – Skupina spolupracuj´ıc´ıch poˇc´ıtaˇcu, ˚ ´ vzajemn eˇ propojen´ych poˇc´ıtaˇcovou s´ıt´ı, ktera´ spoleˇcneˇ ˇreˇs´ı velke´ mnoˇzstv´ı paraleln´ıch uloh. ´
Pusob´ ı tedy podobneˇ jako jeden poˇc´ıtaˇc s velk´ym ˚ mnoˇzstv´ym procesoru˚ (jader). ´ ı software. Pro distribuci v´ypoˇctu˚ je nutn´y specialn´ ´ Jednotlive´ poˇc´ıtaˇce nemus´ı b´yt rovnocenne.
Jiˇr´ı Pech
V´ypoˇcetn´ı cluster vytvoˇren´y pomoc´ı Debian Squeeze
´ Zakladn´ ı pojmy ˇ ıd´ıc´ı poˇc´ıtaˇc (Head node) – hlavn´ı poˇc´ıtaˇc clusteru, kter´y R´ distribuuje v´ypoˇcty na ostatn´ı poˇc´ıtaˇce. Obvykle se neuˇ se ´ castn´ı pˇr´ımo v´ypoˇctu. ˚ Z tohoto duvodu ˚ muˇ ˚ ze jednat o slabˇs´ı poˇc´ıtaˇc neˇz jsou v´ypoˇcetn´ı uzly. V´ypoˇcetn´ı uzel (Working node) – v´ykonna´ jednotka clusteru. Pˇrij´ıma´ poˇzadavky na v´ypoˇcty od ˇr´ıd´ıc´ıho ´ ı je a v´ysledky opet ˇ pˇredav ´ a´ na poˇc´ıtaˇce, provad´ ˇr´ıd´ıc´ı poˇc´ıtaˇc. Pro zapojen´ı poˇc´ıtaˇcu˚ je vhodne´ dle naˇsich zkuˇsenost´ı pouˇz´ıt ´ ´ nasleduj´ ıc´ı schema.
Jiˇr´ı Pech
V´ypoˇcetn´ı cluster vytvoˇren´y pomoc´ı Debian Squeeze
Zapojen´ı v´ypoˇcetn´ıho clusteru
Jiˇr´ı Pech
V´ypoˇcetn´ı cluster vytvoˇren´y pomoc´ı Debian Squeeze
Naˇse situace ´ ˇ Ustav ´ ı biologie rostlin Biologickeho ´ Pracoviˇste: molekularn´ ˇ ˇ ˇ centra AV CR v Cesk´ych Budejovic´ ıch ´ ı Potˇreba: rˇeˇsit velke´ mnoˇzstv´ı mal´ych v´ypoˇctu˚ pˇri zkouman´ genomu rostlin ´ ˇ s´ım poˇctem jader bylo Pouˇz´ıt´ı v´ykonneho poˇc´ıtaˇce s vetˇ neefektivn´ı ˇ s´ıho mnoˇzstv´ı v´ıcejadrov´ ´ Lepˇs´ı je pouˇzit´ı vetˇ ych poˇc´ıtaˇcu˚ poˇr´ızen´ı dle potˇreby snadne´ nahrazen´ı nefunkˇcn´ıho poˇc´ıtaˇce vˇsechny poˇc´ıtaˇce nemus´ı b´yt vˇzdy v provozu
Jiˇr´ı Pech
V´ypoˇcetn´ı cluster vytvoˇren´y pomoc´ı Debian Squeeze
Naˇse situace ´ ˇ Ustav ´ ı biologie rostlin Biologickeho ´ Pracoviˇste: molekularn´ ˇ ˇ ˇ centra AV CR v Cesk´ych Budejovic´ ıch ´ ı Potˇreba: rˇeˇsit velke´ mnoˇzstv´ı mal´ych v´ypoˇctu˚ pˇri zkouman´ genomu rostlin ´ ˇ s´ım poˇctem jader bylo Pouˇz´ıt´ı v´ykonneho poˇc´ıtaˇce s vetˇ neefektivn´ı ˇ s´ıho mnoˇzstv´ı v´ıcejadrov´ ´ Lepˇs´ı je pouˇzit´ı vetˇ ych poˇc´ıtaˇcu˚ poˇr´ızen´ı dle potˇreby snadne´ nahrazen´ı nefunkˇcn´ıho poˇc´ıtaˇce vˇsechny poˇc´ıtaˇce nemus´ı b´yt vˇzdy v provozu
Jiˇr´ı Pech
V´ypoˇcetn´ı cluster vytvoˇren´y pomoc´ı Debian Squeeze
Naˇse situace ´ ˇ Ustav ´ ı biologie rostlin Biologickeho ´ Pracoviˇste: molekularn´ ˇ ˇ ˇ centra AV CR v Cesk´ych Budejovic´ ıch ´ ı Potˇreba: rˇeˇsit velke´ mnoˇzstv´ı mal´ych v´ypoˇctu˚ pˇri zkouman´ genomu rostlin ´ ˇ s´ım poˇctem jader bylo Pouˇz´ıt´ı v´ykonneho poˇc´ıtaˇce s vetˇ neefektivn´ı ˇ s´ıho mnoˇzstv´ı v´ıcejadrov´ ´ Lepˇs´ı je pouˇzit´ı vetˇ ych poˇc´ıtaˇcu˚ poˇr´ızen´ı dle potˇreby snadne´ nahrazen´ı nefunkˇcn´ıho poˇc´ıtaˇce vˇsechny poˇc´ıtaˇce nemus´ı b´yt vˇzdy v provozu
Jiˇr´ı Pech
V´ypoˇcetn´ı cluster vytvoˇren´y pomoc´ı Debian Squeeze
Naˇse situace ´ ˇ Ustav ´ ı biologie rostlin Biologickeho ´ Pracoviˇste: molekularn´ ˇ ˇ ˇ centra AV CR v Cesk´ych Budejovic´ ıch ´ ı Potˇreba: rˇeˇsit velke´ mnoˇzstv´ı mal´ych v´ypoˇctu˚ pˇri zkouman´ genomu rostlin ´ ˇ s´ım poˇctem jader bylo Pouˇz´ıt´ı v´ykonneho poˇc´ıtaˇce s vetˇ neefektivn´ı ˇ s´ıho mnoˇzstv´ı v´ıcejadrov´ ´ Lepˇs´ı je pouˇzit´ı vetˇ ych poˇc´ıtaˇcu˚ poˇr´ızen´ı dle potˇreby snadne´ nahrazen´ı nefunkˇcn´ıho poˇc´ıtaˇce vˇsechny poˇc´ıtaˇce nemus´ı b´yt vˇzdy v provozu
Jiˇr´ı Pech
V´ypoˇcetn´ı cluster vytvoˇren´y pomoc´ı Debian Squeeze
Naˇse situace ´ ˇ Ustav ´ ı biologie rostlin Biologickeho ´ Pracoviˇste: molekularn´ ˇ ˇ ˇ centra AV CR v Cesk´ych Budejovic´ ıch ´ ı Potˇreba: rˇeˇsit velke´ mnoˇzstv´ı mal´ych v´ypoˇctu˚ pˇri zkouman´ genomu rostlin ´ ˇ s´ım poˇctem jader bylo Pouˇz´ıt´ı v´ykonneho poˇc´ıtaˇce s vetˇ neefektivn´ı ˇ s´ıho mnoˇzstv´ı v´ıcejadrov´ ´ Lepˇs´ı je pouˇzit´ı vetˇ ych poˇc´ıtaˇcu˚ poˇr´ızen´ı dle potˇreby snadne´ nahrazen´ı nefunkˇcn´ıho poˇc´ıtaˇce vˇsechny poˇc´ıtaˇce nemus´ı b´yt vˇzdy v provozu
Jiˇr´ı Pech
V´ypoˇcetn´ı cluster vytvoˇren´y pomoc´ı Debian Squeeze
Naˇse situace ´ ˇ Ustav ´ ı biologie rostlin Biologickeho ´ Pracoviˇste: molekularn´ ˇ ˇ ˇ centra AV CR v Cesk´ych Budejovic´ ıch ´ ı Potˇreba: rˇeˇsit velke´ mnoˇzstv´ı mal´ych v´ypoˇctu˚ pˇri zkouman´ genomu rostlin ´ ˇ s´ım poˇctem jader bylo Pouˇz´ıt´ı v´ykonneho poˇc´ıtaˇce s vetˇ neefektivn´ı ˇ s´ıho mnoˇzstv´ı v´ıcejadrov´ ´ Lepˇs´ı je pouˇzit´ı vetˇ ych poˇc´ıtaˇcu˚ poˇr´ızen´ı dle potˇreby snadne´ nahrazen´ı nefunkˇcn´ıho poˇc´ıtaˇce vˇsechny poˇc´ıtaˇce nemus´ı b´yt vˇzdy v provozu
Jiˇr´ı Pech
V´ypoˇcetn´ı cluster vytvoˇren´y pomoc´ı Debian Squeeze
Naˇse situace ´ ˇ Ustav ´ ı biologie rostlin Biologickeho ´ Pracoviˇste: molekularn´ ˇ ˇ ˇ centra AV CR v Cesk´ych Budejovic´ ıch ´ ı Potˇreba: rˇeˇsit velke´ mnoˇzstv´ı mal´ych v´ypoˇctu˚ pˇri zkouman´ genomu rostlin ´ ˇ s´ım poˇctem jader bylo Pouˇz´ıt´ı v´ykonneho poˇc´ıtaˇce s vetˇ neefektivn´ı ˇ s´ıho mnoˇzstv´ı v´ıcejadrov´ ´ Lepˇs´ı je pouˇzit´ı vetˇ ych poˇc´ıtaˇcu˚ poˇr´ızen´ı dle potˇreby snadne´ nahrazen´ı nefunkˇcn´ıho poˇc´ıtaˇce vˇsechny poˇc´ıtaˇce nemus´ı b´yt vˇzdy v provozu
Jiˇr´ı Pech
V´ypoˇcetn´ı cluster vytvoˇren´y pomoc´ı Debian Squeeze
´ Pouˇzite´ softwarove´ nastroje Programy jsou linuxove´ – pouˇzijeme Linux Prvni pokusy – distribuce Rocks Cluster ( http://www.rocksclusters.org) ´ Rozhodnut´ı pˇrej´ıt na Debian – stranky Debian Clusters ( http://debianclusters.org) Prvn´ı verze Debian Lenny Nyn´ı Debian Squeeze
´ Omezen´ı stranek Debian Clusters Jsou jiˇz starˇs´ıho data a nejsou pˇr´ıliˇs aktualizovane´ Ne vˇse funguje tak jak se popisuje Ne vˇse je nutne´ instalovat Puvodn eˇ popisovaly Debian Lenny, nyn´ı Debian testing ˚
Jiˇr´ı Pech
V´ypoˇcetn´ı cluster vytvoˇren´y pomoc´ı Debian Squeeze
´ Pouˇzite´ softwarove´ nastroje Programy jsou linuxove´ – pouˇzijeme Linux Prvni pokusy – distribuce Rocks Cluster ( http://www.rocksclusters.org) ´ Rozhodnut´ı pˇrej´ıt na Debian – stranky Debian Clusters ( http://debianclusters.org) Prvn´ı verze Debian Lenny Nyn´ı Debian Squeeze
´ Omezen´ı stranek Debian Clusters Jsou jiˇz starˇs´ıho data a nejsou pˇr´ıliˇs aktualizovane´ Ne vˇse funguje tak jak se popisuje Ne vˇse je nutne´ instalovat Puvodn eˇ popisovaly Debian Lenny, nyn´ı Debian testing ˚
Jiˇr´ı Pech
V´ypoˇcetn´ı cluster vytvoˇren´y pomoc´ı Debian Squeeze
´ Pouˇzite´ softwarove´ nastroje Programy jsou linuxove´ – pouˇzijeme Linux Prvni pokusy – distribuce Rocks Cluster ( http://www.rocksclusters.org) ´ Rozhodnut´ı pˇrej´ıt na Debian – stranky Debian Clusters ( http://debianclusters.org) Prvn´ı verze Debian Lenny Nyn´ı Debian Squeeze
´ Omezen´ı stranek Debian Clusters Jsou jiˇz starˇs´ıho data a nejsou pˇr´ıliˇs aktualizovane´ Ne vˇse funguje tak jak se popisuje Ne vˇse je nutne´ instalovat Puvodn eˇ popisovaly Debian Lenny, nyn´ı Debian testing ˚
Jiˇr´ı Pech
V´ypoˇcetn´ı cluster vytvoˇren´y pomoc´ı Debian Squeeze
´ Pouˇzite´ softwarove´ nastroje Programy jsou linuxove´ – pouˇzijeme Linux Prvni pokusy – distribuce Rocks Cluster ( http://www.rocksclusters.org) ´ Rozhodnut´ı pˇrej´ıt na Debian – stranky Debian Clusters ( http://debianclusters.org) Prvn´ı verze Debian Lenny Nyn´ı Debian Squeeze
´ Omezen´ı stranek Debian Clusters Jsou jiˇz starˇs´ıho data a nejsou pˇr´ıliˇs aktualizovane´ Ne vˇse funguje tak jak se popisuje Ne vˇse je nutne´ instalovat Puvodn eˇ popisovaly Debian Lenny, nyn´ı Debian testing ˚
Jiˇr´ı Pech
V´ypoˇcetn´ı cluster vytvoˇren´y pomoc´ı Debian Squeeze
´ Pouˇzite´ softwarove´ nastroje Programy jsou linuxove´ – pouˇzijeme Linux Prvni pokusy – distribuce Rocks Cluster ( http://www.rocksclusters.org) ´ Rozhodnut´ı pˇrej´ıt na Debian – stranky Debian Clusters ( http://debianclusters.org) Prvn´ı verze Debian Lenny Nyn´ı Debian Squeeze
´ Omezen´ı stranek Debian Clusters Jsou jiˇz starˇs´ıho data a nejsou pˇr´ıliˇs aktualizovane´ Ne vˇse funguje tak jak se popisuje Ne vˇse je nutne´ instalovat Puvodn eˇ popisovaly Debian Lenny, nyn´ı Debian testing ˚
Jiˇr´ı Pech
V´ypoˇcetn´ı cluster vytvoˇren´y pomoc´ı Debian Squeeze
´ Pouˇzite´ softwarove´ nastroje Programy jsou linuxove´ – pouˇzijeme Linux Prvni pokusy – distribuce Rocks Cluster ( http://www.rocksclusters.org) ´ Rozhodnut´ı pˇrej´ıt na Debian – stranky Debian Clusters ( http://debianclusters.org) Prvn´ı verze Debian Lenny Nyn´ı Debian Squeeze
´ Omezen´ı stranek Debian Clusters Jsou jiˇz starˇs´ıho data a nejsou pˇr´ıliˇs aktualizovane´ Ne vˇse funguje tak jak se popisuje Ne vˇse je nutne´ instalovat Puvodn eˇ popisovaly Debian Lenny, nyn´ı Debian testing ˚
Jiˇr´ı Pech
V´ypoˇcetn´ı cluster vytvoˇren´y pomoc´ı Debian Squeeze
´ Pouˇzite´ softwarove´ nastroje Programy jsou linuxove´ – pouˇzijeme Linux Prvni pokusy – distribuce Rocks Cluster ( http://www.rocksclusters.org) ´ Rozhodnut´ı pˇrej´ıt na Debian – stranky Debian Clusters ( http://debianclusters.org) Prvn´ı verze Debian Lenny Nyn´ı Debian Squeeze
´ Omezen´ı stranek Debian Clusters Jsou jiˇz starˇs´ıho data a nejsou pˇr´ıliˇs aktualizovane´ Ne vˇse funguje tak jak se popisuje Ne vˇse je nutne´ instalovat Puvodn eˇ popisovaly Debian Lenny, nyn´ı Debian testing ˚
Jiˇr´ı Pech
V´ypoˇcetn´ı cluster vytvoˇren´y pomoc´ı Debian Squeeze
´ Pouˇzite´ softwarove´ nastroje Programy jsou linuxove´ – pouˇzijeme Linux Prvni pokusy – distribuce Rocks Cluster ( http://www.rocksclusters.org) ´ Rozhodnut´ı pˇrej´ıt na Debian – stranky Debian Clusters ( http://debianclusters.org) Prvn´ı verze Debian Lenny Nyn´ı Debian Squeeze
´ Omezen´ı stranek Debian Clusters Jsou jiˇz starˇs´ıho data a nejsou pˇr´ıliˇs aktualizovane´ Ne vˇse funguje tak jak se popisuje Ne vˇse je nutne´ instalovat Puvodn eˇ popisovaly Debian Lenny, nyn´ı Debian testing ˚
Jiˇr´ı Pech
V´ypoˇcetn´ı cluster vytvoˇren´y pomoc´ı Debian Squeeze
´ Pouˇzite´ softwarove´ nastroje Programy jsou linuxove´ – pouˇzijeme Linux Prvni pokusy – distribuce Rocks Cluster ( http://www.rocksclusters.org) ´ Rozhodnut´ı pˇrej´ıt na Debian – stranky Debian Clusters ( http://debianclusters.org) Prvn´ı verze Debian Lenny Nyn´ı Debian Squeeze
´ Omezen´ı stranek Debian Clusters Jsou jiˇz starˇs´ıho data a nejsou pˇr´ıliˇs aktualizovane´ Ne vˇse funguje tak jak se popisuje Ne vˇse je nutne´ instalovat Puvodn eˇ popisovaly Debian Lenny, nyn´ı Debian testing ˚
Jiˇr´ı Pech
V´ypoˇcetn´ı cluster vytvoˇren´y pomoc´ı Debian Squeeze
Puvodn´ ı cluster ˚
Jiˇr´ı Pech
V´ypoˇcetn´ı cluster vytvoˇren´y pomoc´ı Debian Squeeze
Puvodn´ ı cluster ˚
Jiˇr´ı Pech
V´ypoˇcetn´ı cluster vytvoˇren´y pomoc´ı Debian Squeeze
Co je nutne´ nainstalovat Debian Squezze ^ ¨ ˇ nastavit pˇrihlaˇ ´ sen´ı pˇres kl´ıcˇ e ssh server – a pozdeji NFS – kaˇzd´y node bude pracovat se stejn´ymi daty LDAP – hod´ı se kvuli ˚ NFS - kaˇzd´y uˇzivatel bude m´ıt stejne´ id Doporuˇcen´ı Pˇri instalaci v´ypoˇcetn´ıch nodu˚ doporuˇcuji nainstalovat jeden node a pak jej nakop´ırovat na ostatn´ı
Jiˇr´ı Pech
V´ypoˇcetn´ı cluster vytvoˇren´y pomoc´ı Debian Squeeze
Co je nutne´ nainstalovat Debian Squezze ^ ¨ ˇ nastavit pˇrihlaˇ ´ sen´ı pˇres kl´ıcˇ e ssh server – a pozdeji NFS – kaˇzd´y node bude pracovat se stejn´ymi daty LDAP – hod´ı se kvuli ˚ NFS - kaˇzd´y uˇzivatel bude m´ıt stejne´ id Doporuˇcen´ı Pˇri instalaci v´ypoˇcetn´ıch nodu˚ doporuˇcuji nainstalovat jeden node a pak jej nakop´ırovat na ostatn´ı
Jiˇr´ı Pech
V´ypoˇcetn´ı cluster vytvoˇren´y pomoc´ı Debian Squeeze
Co je nutne´ nainstalovat Debian Squezze ^ ¨ ˇ nastavit pˇrihlaˇ ´ sen´ı pˇres kl´ıcˇ e ssh server – a pozdeji NFS – kaˇzd´y node bude pracovat se stejn´ymi daty LDAP – hod´ı se kvuli ˚ NFS - kaˇzd´y uˇzivatel bude m´ıt stejne´ id Doporuˇcen´ı Pˇri instalaci v´ypoˇcetn´ıch nodu˚ doporuˇcuji nainstalovat jeden node a pak jej nakop´ırovat na ostatn´ı
Jiˇr´ı Pech
V´ypoˇcetn´ı cluster vytvoˇren´y pomoc´ı Debian Squeeze
Co je nutne´ nainstalovat Debian Squezze ^ ¨ ˇ nastavit pˇrihlaˇ ´ sen´ı pˇres kl´ıcˇ e ssh server – a pozdeji NFS – kaˇzd´y node bude pracovat se stejn´ymi daty LDAP – hod´ı se kvuli ˚ NFS - kaˇzd´y uˇzivatel bude m´ıt stejne´ id Doporuˇcen´ı Pˇri instalaci v´ypoˇcetn´ıch nodu˚ doporuˇcuji nainstalovat jeden node a pak jej nakop´ırovat na ostatn´ı
Jiˇr´ı Pech
V´ypoˇcetn´ı cluster vytvoˇren´y pomoc´ı Debian Squeeze
Co je nutne´ nainstalovat Debian Squezze ^ ¨ ˇ nastavit pˇrihlaˇ ´ sen´ı pˇres kl´ıcˇ e ssh server – a pozdeji NFS – kaˇzd´y node bude pracovat se stejn´ymi daty LDAP – hod´ı se kvuli ˚ NFS - kaˇzd´y uˇzivatel bude m´ıt stejne´ id Doporuˇcen´ı Pˇri instalaci v´ypoˇcetn´ıch nodu˚ doporuˇcuji nainstalovat jeden node a pak jej nakop´ırovat na ostatn´ı
Jiˇr´ı Pech
V´ypoˇcetn´ı cluster vytvoˇren´y pomoc´ı Debian Squeeze
Vlastn´ı software pro clustering ˇ Torque – rozdeluje ulohy na jednotlive´ nody ´ ´ ˇ an´ ´ ı - nen´ı nutn´y, ale prace ´ s Maui – planovaˇ c rozdelov ˇ s´ı neˇz pouze s Torque n´ım je pohodlnejˇ Oba programy je nutne´ pˇreloˇzit. Torque je pˇr´ımo v Debianu, ale ve starˇs´ı verzi. Pro staˇzen´ı Maui je nutna´ registrace.
Jiˇr´ı Pech
V´ypoˇcetn´ı cluster vytvoˇren´y pomoc´ı Debian Squeeze
Vlastn´ı software pro clustering ˇ Torque – rozdeluje ulohy na jednotlive´ nody ´ ´ ˇ an´ ´ ı - nen´ı nutn´y, ale prace ´ s Maui – planovaˇ c rozdelov ˇ s´ı neˇz pouze s Torque n´ım je pohodlnejˇ Oba programy je nutne´ pˇreloˇzit. Torque je pˇr´ımo v Debianu, ale ve starˇs´ı verzi. Pro staˇzen´ı Maui je nutna´ registrace.
Jiˇr´ı Pech
V´ypoˇcetn´ı cluster vytvoˇren´y pomoc´ı Debian Squeeze
Vlastn´ı software pro clustering ˇ Torque – rozdeluje ulohy na jednotlive´ nody ´ ´ ˇ an´ ´ ı - nen´ı nutn´y, ale prace ´ s Maui – planovaˇ c rozdelov ˇ s´ı neˇz pouze s Torque n´ım je pohodlnejˇ Oba programy je nutne´ pˇreloˇzit. Torque je pˇr´ımo v Debianu, ale ve starˇs´ı verzi. Pro staˇzen´ı Maui je nutna´ registrace.
Jiˇr´ı Pech
V´ypoˇcetn´ı cluster vytvoˇren´y pomoc´ı Debian Squeeze
Vlastn´ı software pro clustering ˇ Torque – rozdeluje ulohy na jednotlive´ nody ´ ´ ˇ an´ ´ ı - nen´ı nutn´y, ale prace ´ s Maui – planovaˇ c rozdelov ˇ s´ı neˇz pouze s Torque n´ım je pohodlnejˇ Oba programy je nutne´ pˇreloˇzit. Torque je pˇr´ımo v Debianu, ale ve starˇs´ı verzi. Pro staˇzen´ı Maui je nutna´ registrace.
Jiˇr´ı Pech
V´ypoˇcetn´ı cluster vytvoˇren´y pomoc´ı Debian Squeeze
ˇ ı programu˚ Spouˇsten´ ˇ ı programu˚ se vytvaˇ ´ r´ı skripty. Skripty se pouˇst´ı Pro spouˇsten´ pomoc´ı qsub skript. ´ Ukazka skriptu: #!/bin/bash #PBS -N test #PBS -t 0-128 #PBS -l walltime=10:00:00 echo ${PBS_ARRAYID} sleep 30 V´ıce o skriptech napˇr´ıklad zde: http://amdahl.physics.purdue.edu/using-cluster/node23.html
Jiˇr´ı Pech
)
V´ypoˇcetn´ı cluster vytvoˇren´y pomoc´ı Debian Squeeze
´ ˇ Ukazka behu 1
Jiˇr´ı Pech
V´ypoˇcetn´ı cluster vytvoˇren´y pomoc´ı Debian Squeeze
´ ˇ Ukazka behu 2
Jiˇr´ı Pech
V´ypoˇcetn´ı cluster vytvoˇren´y pomoc´ı Debian Squeeze
Monitoring clusteru Nagios – Monitoring stavu jednotliv´ych nodu˚ ´ ı aktivity jednotliv´ych nodu˚ Ganglia – Sledovan´ Pro oba programy potˇrebujeme na hlavn´ım poˇc´ıtaˇci funguj´ıc´ı ´ web server, nejlepe Apache2.
Jiˇr´ı Pech
V´ypoˇcetn´ı cluster vytvoˇren´y pomoc´ı Debian Squeeze
Okno s programem Ganglia
Jiˇr´ı Pech
V´ypoˇcetn´ı cluster vytvoˇren´y pomoc´ı Debian Squeeze
Nov´y cluster
Jiˇr´ı Pech
V´ypoˇcetn´ı cluster vytvoˇren´y pomoc´ı Debian Squeeze
Konec
ˇ Dekuji za pozornost
Jiˇr´ı Pech
V´ypoˇcetn´ı cluster vytvoˇren´y pomoc´ı Debian Squeeze
