ODŮVODNĚNÍ VEŘEJNÉ ZAKÁZKY s názvem
„ZAŘÍZENÍ PRO ANALÝZU FOTOSYNTÉZY – CEITEC MU“ vyhotovené podle § 156 zákona č. 137/2006 Sb., o veřejných zakázkách, v platném znění (dále jen Zákon o VZ)
1.
ODŮVODNĚNÍ ÚČELNOSTI VEŘEJNÉ ZAKÁZKY 1. Popis potřeb, které mají být splněním veřejné zakázky naplněny Zakázka je zadávána a financována z Operačního programu Výzkum a vývoj pro inovace v rámci projektu „CEITEC – středoevropský technologický institut“, registrační číslo projektu CZ.1.05/1.1.00/02.0068. Jejím cílem je naplnění plánovaného účelu projektu, který společně připravují nejvýznamnější brněnské univerzity a výzkumné instituce, a to vybudování evropského centra excelence v oblasti věd o živé přírodě a pokročilých materiálů a technologií. Projekt má být ukončen nejpozději do 31. 12. 2015. 2. Popis předmětu veřejné zakázky Předmětem podlimitní veřejné zakázky je dodávka zařízení pro analýzu fotosyntézy. Zakázka se skládá ze dvou položek - Chlorophyll Fluorometr (č. 2) a Přenosného fotosyntetického systému s možností integrace modulu fluorescence chlorofylu (č. 1) Přístroji budou vybaveny laboratoře programu "Genomika a proteomika rostlinných systémů" projektu CEITEC - Středoevropského technologického institutu. 3. Popis vzájemného vztahu předmětu veřejné zakázky a potřeb zadavatele Položka č. 1 - Přenosný systém pro měření výměny plynů CO2 a H2O, respirace a fluorescence chlorofylu v kontrolovaných podmínkách. Přístroj umožňuje různé způsoby měření, od rychlých měření míry fotosyntézy až k multifaktoriálním křivkám odpovědi fotosyntézy na proměnné vnějšího prostředí jako je světlo, CO2 či vlhkost vzduchu. Typickými aplikacemi je vyhodnocení asimilace CO2, vodivosti H2O či respirace CO2 v závislosti na koncentraci CO2, světlu, teplotě, vlhkosti vzduchu nebo denního období. PAM fluorometrie a metoda saturačních pulsů umožňují zjištění detailních informací o využití světelné energie fotosystémem II Y (II) a tím přidání důležité informace o primárních fotosyntetických reakcích k datům získaných na základě gas exchange. Získaná data jsou využívána k výpočtu zřejmého elektronového transportu (ETR). Navíc fluorescenční modul
umožňuje měření quenching koeficientů (qP, qN, NPQ). Fo mód umožňuje aplikaci far red light a zápis Fo'. Položka č. 2 - Fluorescence chlorofylu je velmi citlivý indikátor fotosyntézy. Kvantitativní hodnota kvantového výnosu konverze fotosyntetické energie je získávána pomocí PulseAmplitude fluorometrie a metodou saturačních pulsů. Z výsledků měření fluorescence může být odvozeno široké rozpětí fotosyntetických parametrů, což nám umožňuje náhled do fotosyntetického stavu všech fotosynteticky aktivních organismů včetně vyšších rostlin, mechů a kapradin, dále různých typů řas, fytoplanktonu a biofilmů. V naší laboratoři budeme používat pro měření chlorofylu modelovou rostlinu Arabidopsis thaliana, plodiny a izolované chloroplasty. S využitím vysoce citlivých CCD kamer a extrémně silných emitujících diod (LED) je možné měřit fluorescenci chlorofylu a její relevantní parametry s využitím metody saturačních pulsů. 4. Předpokládaný termín splnění veřejné zakázky Předmět veřejné zakázky bude realizován na základě smlouvy o dodávce, jež bude uzavřena s vybraným dodavatelem po ukončení zadávacího řízení a výběru nejvhodnější nabídky. Předpokládaný termín splnění veřejné zakázky je uveden v zadávací dokumentaci. Projekt jako celek bude ukončen nejpozději do 31. 12. 2015. 5. Popis rizik souvisejících s plněním veřejné zakázky, která zadavatel zohlednil při stanovení zadávacích podmínek Zadavatel spatřuje riziko zejména v prodlení se zadáním zakázky, čímž mohou být částečně ohroženy plánované cíle projektu CEITEC. 2.
ODŮVODNĚNÍ VYMEZENÍ TECHNICKÝCH PODMÍNEK
Zadavatel dále zdůvodňuje vymezení technických podmínek veřejné zakázky ve vztahu ke svým potřebám a k rizikům souvisejícím s plněním veřejné zakázky. Zdůvodnění jednotlivých požadavků je uvedeno v příloze tohoto dokumentu. 3. ODŮVODNĚNÍ STANOVENÍ ZÁKLADNÍCH A DÍLČÍCH HODNOTÍCÍCH KRITÉRIÍ A ZPŮSOBU HODNOCENÍ NABÍDEK Zadavatel dále zdůvodňuje stanovení základních a dílčích hodnotících kritérií ve vztahu ke svým potřebám. Zadavatel zvolil jako základní hodnotící kritérium nejnižší nabídkovou cenu, neboť při dodržení stanovených technických podmínek je toto kritérium dostatečnou zárukou výběru kvalitní nabídky za nejnižší cenu. V Brně, dne 23. 7. 2013
Mgr. Jan Sedláček
Digitálně podepsal Mgr. Jan Sedláček DN: c=CZ, o=Masarykova univerzita [IČ 00216224], ou=CEITEC, ou=219468, cn=Mgr. Jan Sedláček, serialNumber=P306081, title=administrátor veřejných zakázek Datum: 2013.07.24 14:59:29 +02'00'
Mgr. Jan Sedláček Manažer veřejných zakázek CEITEC MU
PODROBNÉ ODŮVODNĚNÍ VYMEZENÍ TECHNICKÝCH PODMÍNEK – dílčí plnění 1: Systém pro měření výměny plynů Základní požadavky zadavatele Je požadována dodávka systému pro měření výměny plynů (Portable Gas Exchange Fluorescence system) pro výzkumnou skupinu "Stresová signalizace a adaptace rostlin" projektu CEITEC Středoevropský technologický institut.
Požadované technické a funkční vlastnosti
Požadovaná hodnota
Zdůvodnění parametrů Nezbytné pro měření fotosyntézy při
4-kanálový systém pro měření výměny plynů CO2 a H2O Průtok
Měření CO2
Měření H2O 2 bateriové jednotky a přídavný zdroj pro použití systému v laboratoři
Ano
kontrolovaných podmínkách. Potřebné pro vysoce přesné určování CO 2 a H 2 O.
v rozsahu alespoň 320 Nezbytné pro správný tok vzduchu až 1350 μmol s-1 přes kyvetu. Nezbytné pro měření fotosyntézy. Měření výměny plynu spočívá v základním principu, kterým jsou změny koncentrací CO 2 a H 2 O určeny průchodem vzduchu komorou s kontrolovanými klimatickými v rozsahu alespoň 0 až podmínkami, ve které je umístěn 1900 ppm rostlinný vzorek. Nezbytné pro měření fotosyntézy. Měření výměny plynu spočívá v základním principu, kterým jsou změny koncentrací CO 2 a H 2 O určeny průchodem vzduchu komorou minimálně v rozsahu 0 s kontrolovanými klimatickými podmínkami, ve které je umístěn až 98% relativní vlhkosti rostlinný vzorek. Ano
Teplotní rozsah pro měřící jednotku
alespoň 0 až +50°C
Měřená plocha listu
nejméně 7,5 cm2
Nezbytné pro nabíjení kontrolní jednotky v laboratoři. Pro kontrolu teploty kyvety v závislosti na experimentálních podmínkách. Potřebné pro práci s listy Arabidopsis. Leaf Chamber Fluorometer je fluorometr PAM (pulse-amplitude modulated), který může být použit pro měření vzorků adaptovaných jak na světlo, tak na tmu. Měřené parametry zahrnují Fo, Fm, F, Fm´, and Fo´, a kalkulované parametry zahrnují Fv, Fv/Fm, Fv´/Fm´, ΦPSII, qP, qN, NPQ, a ETR.
Ano
Světelná intenzita LED PAM fluorometru je regulována světelnými senzory.
Sensor pro měření teploty listu
Ano
Pro správnou regulaci teploty listu.
Sensor pro měření okolní teploty
Ano
Sensor pro měření aktivního světla
fotosynteticky
Světelný zdroj
Pro správnou regulaci teploty listu. Světelný zdroj a světelný výstup fluorometru je neustále proměnný v průběhu celého měření, proto s integrovaným fluorometrem je možné specifikovat jakoukoli úroveň světla bez potřeby změny nastavení či změny filtrů. Světelné křivky mohou být vytvořeny automaticky s použitím Ano AutoProgramů. Potřebné pro minimalizaci vlivu červné a modré světlo světelného zdroje na teplotu listů. o intenzitě 0 až 2000 Kromě toho je světlo LED snáze μmol m-2 s-1 kontrolovatelné pomocí PC.
Řídící software
Kompatibilní s Win Nezbytné pro synchronizaci složek a XP/Vista, Win 7 32-bit souborů na přístroji a uživatelském a 64-bit PC.
Integrovaný fluorometr
USB komunikace Dotykový displej
Ano
Pro možnost připojení k jednotce PC. Pro umožnění zobrazení min. 12 min. 1000:1, Jas: 380 experimentálních proměnných cd/m2 najednou.
PODROBNÉ ODŮVODNĚNÍ VYMEZENÍ TECHNICKÝCH PODMÍNEK – dílčí plnění 2: Zobrazovací systém pro měření fluorescence chlorofylu a GFP Základní požadavky zadavatele Je požadována dodávka zobrazovacího systému pro měření fluorescence chlorofylu a GFP pro výzkumnou skupinu "Stresová signalizace a adaptace rostlin" projektu CEITEC - Středoevropský technologický institut.
Požadované technické a funkční vlastnosti
Požadovaná hodnota
Zdůvodnění parametrů
Pro provádění screeningu fluorescence chlorofylu a GFP bází u Ano Arabidopsis a izolovaných chloroplastů Nutné pro produkci reaktivních druhů kyslíku a determinovanou buněčnou Ano Přidaná možnost zobrazení DAPI a smrt v rostlinách pěstovaných ve H2DCFDA stresujících podmínkách Zajišťuje kvalitu obrazu, která je dostatečná pro různé vědecké rozlišení 1392x1040 zobrazovací aplikace. Zvláště vhodné (15 fps), 30 fps v v situacích, kdy je potřeba vysoké rozlišení 640 x 480 dynamické rozpětí. Integrovaná kamera s vysokou citlivostí
Kompaktní systém pro kombinované zobrazování fluorescence chlorofylu i GFP
Požadovaná intenzita pro superpuls
min. 7,500 µmol(photons)/m².s
Pro kontrolu měřicích světelných blesků, aktinického světla a saturačních blesků, které jsou generovány světelnými zdroji. Kontrolní jednotka může být integrována v kameře. Panely LED a světelný zdroj vytvářející saturační blesky umožňují nastavení v různých úhlech a vzdálenostech od vzorků. Aktinické světlo řídí fotosyntetické reakce při určitých fyziologických hodnotách (minimun 3,800 µmol(photons).m-2.s-1). Superpulsy přechodně redukují pool plastochinonu během vystavení aktinickému světlu.
Požadované měřící protokoly
FV / FM, Kautsky induction, quenching analysis, steady state fluorescence, multicolor fluorescence
Parametry kinetiky fluorescence chlorofylu jsou extrémně důležitou technikou neinvazivního studia dynamiky fotosyntézy v intaktních rostlinách, řasách a cyanobakteriích při různých růstových podmínkách.
mikrosekundy až sekundy
Integrační čas kamery
o vlnových délkách 627 nm a 470 nm
Osvícení pomocí LED panelů Požadovaná světlo
intenzita
pro
aktinické
Přídavný UV LED panel
min. 3,800 µmol(photons)/m².s
Ano nejméně 10x10 cm
Zobrazená plocha motorizovaný a softwarově řízený
8-poziční výměník filtrů
Pro měření exprese DAPI a H2DCFDA. Minimální plocha pro provádění screeningu na Petriho miskách. Pro detekci různých fluorescenčních markérů: GFP, DAPI, H2DCFDA.
Adjustace police pro měřené rostliny do různých výšek
Ano
Aby bylo možné použít rostliny různého vzrůstu.
Možnost temnostní adaptace měřených rostlin
Ano
Aby bylo možné použít různé rostlinné vzorky.
Automaticky přednastavené protokoly i možnost psaní protokolů vlastních
Ano
Nezbytné pro provádění experimentů.
Možnost automatického označování zobrazovaných rostlin nebo jejich vybraných částí
Ano
Pro usnadnění analýzy dat.
Možnost kinetické analýzy současně zobrazených vzorků
Ano
Pro usnadnění analýzy dat.
Ano
Nezbytné pro analýzu dat.
všech
Software kompatibilní s Win, možnost exportu dat
