Mezőgazdasági biotechnológus MSc szak dr. Kiss Erzsébet SZIE Mezőgazdaság- és Környezettudományi Kar Genetika és Biotechnológiai Intézet
Mezőgazdasági biotechnológus MSc szak
Szakvezető Dr. Kiss Erzsébet egyetemi tanár kiss.erzsebet @mkk.szie.hu Szakvezető-helyettes Dr. Veres Anikó egyetemi docens
[email protected]
Genetika és Biotechnológiai Intézet Igazgató Dr. Varga László Egyetemi docens
[email protected] Titkár Katona Melinda
[email protected]
Genetika és Biotechnológiai Intézet Telefonszám +36 28 522 069 +36 28 522 000/1691 Fax +36 28 522 069
Mezőgazdasági biotechnológus MSc szak Alapítás 2006 Dr. Heszky László MTA rendes tagja Genetika és Biotechnológiai Intézet akkori igazgatója
Genetika és Biotechnológiai Intézet
A hazai nemesítő utánpótlás képzésének meghatározó bázisa; Három fő diszciplina oktatásának felelőse: Genetika Növénynemesítés Növénybiotechnológa
Genetika és Biotechnológiai Intézet
Elsőként indított Magyarországon mezőgazdasági biotechnológus mesterképzést 2008-ban Nappali és levelező tagozaton Ez a mesterszak- az országban egyedülállóan – két szakirányt foglal magában: növénybiotechnológia és állatbiotechnológia szakirányokat.
Mezőgazdasági biotechnológus MSc szak
Hallgatószáma jelenleg 52 fő 49 fő diplomázott eddig Az Agricultural Biotechnology angol nyelvű MSc szakot külföldi hallgatókkal (12 fő) 2012-ben indította a genetika és Biotechnológiai Intézet. 14 új hallgató 2014-ben
A Mg. Biotech. MSc Szakon két szakirány között lehet választani Növénybiotechnológia
Állatbiotechnológia
Program 1. félév: azonos tantárgyak 2. félév: szakirány-választás / diplomamunka 2-4. félév közös és szakirány-specifikus tantárgyak
Diplomamunka
Saját kísérletek!
Ízelítő a választható témákból
Gyujtoványfű, cickafark, imola és csodatölcsér fajok molekuláris vizsgálata taxonómiai pontosítás céljából Az Orange gén öröklődése karalábé és karfiol hibridpopulációkban Emlős embriók in vitro előállítása vágóhídról származó petesejtekből Transzpozon alapú transzgenezissel előállított transzgénikus nyulak molekuláris jellemzése
Mikrobiológiai témát is lehet választani
Szakirány -választás
Az 1. szemeszter végén!
Molekuláris markerek alkalmazása szántóföldi és kertészeti növények nemesítésében
Kiss E., Gyulai G., Veres A., Szőke A., Tóth-Lencsés K., Kerekes A., Heszky L.
Mezőgazdasági biotechnológus MSc szak
Ízelítő a diplomamunka- témákból korábbi dolgozatok és publikációk alapján
Molekuláris markerek alkalmazása Genotipizálás Pedigré elemzés Hibridazonosítás Kapcsolt markerek
Miért van szükség a genotipizálásra? Nem elegendő a morfológiai összehasonlítás?
Perenne évelő rozs
Kárpát-medencei szőlőfajták mikroszatellit elemzése
Szőlő fajták összehasonlító elemzése mikroszatellit /SSR primerekkel
SSR allél adatok átalakítása vonalkóddá
MAGYAR SZŐLŐ MIKROSZATELLIT / SSR ADATBÁZIS HUNGARIAN VITIS MICROSATELLITE / SSR DATABASE KISS, Erzsébet; HALÁSZ, Gábor; *KOZMA, Pál; HESZKY, László Szent István Egyetem, Genetika és Növénynemesítés Tanszék Szent István University, Department of Genetics and Plant Breeding H-2103, Gödöllő, Magyarország / Hungary *FVM Szőlészeti és Borászati Kutatóintézet (FVM-SZBKI) Institute for Viticulture and Enology H-7634, Pécs, Magyarország / Hungary
Primerek / Primers: Fajták / Varieties: A-B - C-CS - D-E - É-F - G-H - I-J - K - LMN-NY - O-Ó - Ö-Ő - P-Q - R-S - SZ-T - U-Ú - Ü-Ű - V-Z - ZS List of Varieties / Teljes fajtalista
European Vitis Database: közel 6 000 fajta/klón mikroszatellit/SSR és ampelográfiai adata
259 magyarországi fajta/klón
European Vitis Database N-coded SSR values in 9 loci Accession name
Allél_1
Allél_2
HUN045-P14#30 - APROFEHÉR
N+8
N+18
HUN045-P14#49 - AGASFARK
N+8
N+8
HUN045-P14#60 - BAJOR, KÉK
N+8
N+8
HUN045-P14#61 - BAJOR, SZÜRKE
N+8
N+8
HUN045-P14#62 - BAKARKA
N+18
N+18
HUN045-P14#63 - BAKATOR, KÉK
N+8
N+18
HUN045-P14#64 - BAKATOR, PIROS
N+8
N+22
HUN045-P14#65 - BAKATOR, PIROS TÜDOSZINU *
N+8
N+22
HUN045-P14#66 - BAKSZEM
N+16
N+22
HUN045-P14#68 - BALAFANT
N+18
N+18
Almafajták mikroszatellit mintázata és allélmérete a CH03G07 primerpárral
CULTIVARS
CH03g07
CH04g10
CH04e03
CH05c02
CH05d11
CH05e03
Ozark Gold JerseyMac
119
129
135
168
196
196
168
172
165
165
135
137
184
198
160
176
Piros Gala Pioana Gloster Julyred
165
179
135
135
196
198
168
176
173
119
129
135
135
196
198
168
170
129
129
135
137
190
198
170
123
129
127
137
198
198
160
165
165
184
198
Wellspur Delicious Judeline Jonagold
127
127
137
168
198
123
129
135
135
196
129
135
135
186
198
123
135
135
186
196
168
200
173
175
129
127
135
198
222
168
174
169
173
198
168
168
173
173
173
179
170
200
173
173
185
185
170
174
169
173
179
Jonathan Pinova
119
123
119 119
127
123
135
143
168
179
163
173
175
173
173
173
173
173
185
174
169
171
163
185
168
195
197
160
191
160
176
175
197
163
163
202
168
168
173
197
191
191
198
168
174
173
173
163
168
174
200
173 165
169
173 173
173
197
175
163
185 179
163 163
185
185 179
185
Mutsu Akane
129
179
123
179
Sampion Charden
119
129
135
135
190
198
119
129
135
135
198
198
Jonager Summerred Goldstar
123
127
135
135
196
196
170
200
173
175
168
185
129
165
135
135
184
208
168
176
173
177
170
185
119
129
190
198
168
170
173
173
185
193
Golden Delicious Angold Granny Smith Kró óriás
119
129
135
135
198
198
168
174
169
173
179
185
119
129
135
135
198
198
168
170
171
173
173
185
129
153
127
137
196
198
160
172
171
173
168
181
129
129
196
202
168
172
173
197
168
191
Liberty Mizsei Reglindis Sir Prize
123
129
137
137
178
198
168
168
173
211
163
176
123
129
135
135
186
208
160
168
173
173
163
185
129
179
135
135
198
198
168
168
169
173
173
173
129
135
135
198
204
168
168
169
173
173
179
Red Stayman Rewena Rubinola Braeburn Rajka
127
129
127
135
196
204
168
172
169
173
163
191
119
123
135
135
178
210
168
168
173
173
164
185
129
129
135
135
184
198
168
176
173
173
179
193
127
129
168
168
198
202
168
168
171
173
191
119
129
135
135
190
196
Idared Fuji
123
129
135
186
198
168
200
173
197
172
185
119
127
196
198
168
168
173
197
163
191
Florina Prima
123
127
196
198
168
200
173
197
163
191
129
165
184
204
168
176
169
173
179
185
Elstar Remo Red Rome Van Well Topaz Pink Lady Relinda
119
119
135
135
190
198
168
170
173
187
164
179
119
123
135
135
178
190
168
170
173
173
163
172
123
129
135
135
186
198
168
168
173
173
163
163
119
129
135
135
190
198
168
168
169
173
185
193
129
129
135
137
198
204
160
168
169
171
168
179
123
129
123
135
143
196
208
168
172
173
173
172
185
Greensleeves
129
129
123
135
143
190
198
170
174
171
173
173
185
Reanda Pilot Fiesta
119
129
135
137
196
208
168
168
173
181
173
185
129
179
135
135
196
196
168
168
173
173
164
185
119
123
135
135
186
196
168
168
173
197
164
185
119
123
135 123
123
123
135 135
135
137
135 123
143
135 123
143
143
143
168
168 135
143
198 196
210
216
168
160
174
170
200
174
169
171
173
173
175
177
175
164
193 179
185
191 176
185
65 kereskedelmi és 38 tájfajta
Dinnye genotipizálás
Szamócafajták molekuláris összehasonlítása RAPD
M
1
2
3
4
5
6
7
8
9 10 11 12 13 14 15 16 17 M 3000
500 OPE 02
AP-PCR
WFRVC
Génspecifikus Adh 1f/ Adh1r
Diploid, oktoploid szamóca fajták SSR adatai Fajta
SSR / UDF-004 (bp)
Fragaria vesca ‘Rügen’
133:133
F. ananassa ‘’Hakras romata’
129:143
F. ananassa ‘Avalon classique’
125:131:137
F. ananassa ‘Frapendula’
125:129:143:149
F. ananassa ‘Fertődi 5’
125:127:129:133:149
F. ananassa ‘Gorella’
125:129:133:139:143:149
Repce genotipizálás SSR markerekkel
GKH 724
162:166:174:192
TPES 7
166:192
TPR 24
162:174
Tetraploiditás repcében
Származás, pedigré
Szőlő Alma Évelő rozs
Az SSR allélek méretezése /ALF-Express/
Lokusz
SSR allélek méretei bpban
♀ Izsáki
Mátrai muskotály
♂Ottonel muskotály
Scu08vv
185:185
185:185
185:185
Scu10vv
208:214
214:214
208:214
VVMD21
244:250
244:267
267:267
VVMD36
254:276
276:264
264:276
ssVrZAG62
191:207
191:191
191:197
ssVrZAG64
139:161
139:161
139:161
ssVrZAG79
240:246
240:258
258:262
ssVrZAG83
197:203
197:203
193:203
ssVrZAG112
237:245
237:237
237:245
VVMD5
226:232
232:226
226:228
VVMD7
242:252
242:246
242:246
VVMD32
258:274
274:266
242:266
ssVrZAG21
208:208
208:208
208:208
Vmc4f3
170:170
170:204
170:204
VVMD28
234:258
258:269
258:269
VVMD31
206:208
206:206
206:210
VMC4c6
157:166
157:163
162:163
VMC4g6
123:127
123:135
125:135
VVS2
143:143
143:143
133:143
SSR lokusz
Leányka
Királyleányka
Scu10vv
202:208
208:214
Scu08vv
185:185
185:185
VVMD21
250:250
244:250
VVMD36
266:276
254:266
VrZag64
161:165
161:161
VrZag79
240:254
252:254
VrZag62
195:197
197:207
X
Seyve-Villard 12375
Csabagyöngye
NEM!
Zalagyöngye
Perenne évelő rozs
Kapcsolt markerek
Ivar kender Rezisztencia Paradicsom: nematóda Szőlő: lisztharmat és peronoszpóra Hímsterilitás repce Szín Karfiol: rózsa Szőlő: bogyó
Ivarspecifikus marker fejlesztése RAPD fragmentumból kenderben
Nematóda rezisztens paradicsom genotípusok azonosítása molekuláris markerekkel Rezisztens és fogékony genotípusok domináns markerrel
A heterozigóta és homozigóta rezisztens genotípusok megkülönböztetése CAPS markerrel
Restrikciós emésztés után a homozigóta és a heterozigóta rezisztens genotípusok elkülöníthetőek
RUN1, REN1 lisztharmat rezisztenciagénekkel kapcsolt SSR markerek alkalmazása szelekcióra
Egyszeres PCR Multiplex PCR
A RUN1 gén jelenlétét a (RUN1+ növényeket) a 160 bp méretű csúcs jelzi
A BC4, a Kismis vatkana (szülők) és érzékeny fajta (Cardinal) alléljei a VMC8g9 markerrel R: Run1+ Sz: run1-
95 bp méretű külső, ill. belső sandard
275 bp méretű külső, ill. belső standard
Multiplex PCR 4%-os Metaphor agarózon (BMA) elválasztva
286 bp
286 bp
286 bp
VMC9h4.2
160 bp
VMC8g9 160 bp
160 bp
2. Kismis vatkana: Run1-/Ren1+ 3. BC4: Run+/Ren1-, Az utódpopuláció egyedei 601: Run1-/Ren1- 90: Run1+/Ren1+, 6: Run1+/Ren1-, 36: Run1-/Ren1+
Hímsterilitás
Csak a hímsteril növényekben jelenik meg a 278 bp fragmentum
Színes karfiol
Kárpát-medencei bogyószín variánsok
Lisztes piro
Gohér piros
Lisztes fehér
Bakator piros
Gohér fehér
Csíkos muskotály
Gohér változó
Furmint piros
Bakator tüdőszínű
Piros Sárga muskotály muskotály
Furmint fehér
Antocyanin biosynthesis White berried grapes
No UFGT expression
Reason: Gret-1 insertion into the promoter of VvMybA1 transcription factor gene SNP a VvMybA2 kódoló szekvenciában
VvMybA1 allél-variációk VvMybA1a
VvMybA1b VvMybA1c
M: MW marker, 1. Barbera, 2. Pinot noir, 3. Chardonnay, 4. Lisztes piros, 5. Lisztes fehér, 6. Bakator piros, 7. Bakator tüdőszínű, 8. Gohér piros, 9. Gohér fehér, 10. Gohér változó, 11. Piros muskotály, 12. Fekete muskotály, 13. Sárga muskotály, 14. Csíkos muskotály, 15. Furmint piros, 16. Furmint fehér, 17. Furmint változó, 18. Kék barátcsuha, 19. Szürke barátcsuha
20D18CB9 marker
VvMybA1 linked CAPS marker
PCR product
329 bp 329 bp 329 bp 248 bp 248 bp 213 bp 213 bp
329 bp 329 bp 248 bp 213 bp
DdeI digestion
M: molecular weight m., 1. Barbera, 2. Pinot noir, 3. Chardonnay, 4. Bakator piros, 5. Bakator tüdőszínű, 6. Gohér piros, 7. Gohér fehér, 8. Gohér változó, 9. Sárga muskotály, 10. Csíkos muskotály, 11. Furmint fehér, 12. Furmint változó, 13. Kék barátcsuha, 14. Szürke barátcsuha
Munkatársak, együttműködők SZIE GBI
Heszky László Gyulai Gábor Szőke Antal Veres Anikó Galli Zsolt Galbács Zsuzsanna Halász Gábor Katuláné Debreceni Diána Kerti Balázs Kovács László Lencsés Andrea Kitti
Molnár Stella Pilinszky Katalin Wichmann Barnabás
PTE SZBI
Kozma Pál Hoffmann Sarolta
GK Kht
Falusi János
Gyümölcskutató Fertőd Dénes Ferenc
Proplant Kft Dánszentmiklós Sipos Elvíra Lehoczky Péter
Gyümölcskutató Újfehértó Szabó Tibor Inántsy Ferenc
MGSZH Budapest Pernesz György Harangozó Tamás
Köszönöm a figyelmet!
