ISSN: 1978 - 8282
Pembuatan Model Transmisi dan Dinamika Persebaran Virus H5N1 Sebagai Sistem Manajemen Bencana Endemik Flu Burung di Kabupaten Semarang Provinsi Jawa Tengah Dengan Pedekatan Statistik Suprihadi1 Rudy Latuperissa2 e-mail :
[email protected],
[email protected] Diterima : 20 April 2012 / Disetujui: 14 Juni 2012
ABSTRACT Issues Avian Influenza outbreak in Indonesia that attacks on animals is now a very serious issue, and has spread to 23 provinces. In this study aims to develop models ofthe dynamics of transmission and spread of H5N1 virus in a system of disaster management outbreaks of H5N1 disease, so that they can become important tools in disaster management policy of the plague. The method used in this study is the SIR model (Suceptible-Infectious-recovered). The model is constructed in three stages of research. The first licensing arrangements related to the Department. Second,secondary data research and development the third mathematical model. The results of this study is to model the dynamics of transmission and spread of H5N1 virus in acommunity population. The results are expected to be utilized as a framework fordisaster management system of disease outbreaks. Outcomes research in the form of a mathematical model and strategic policies for development in the future. Keywords: SIR, transmission model, the dynamics of the spread, the H5N1 ABSTRAK Isu Wabah Flu Burung di Indonesia bahwa serangan pada hewan sekarang menjadi masalah yang sangat serius, dan telah menyebar ke 23 provinsi. Dalam studi ini bertujuan untuk 1. Program Studi Fakultas Teknologi InformasiUniversitas Kristen Satya Wacana Jl. Diponegoro 52 – 60, Salatiga – 50711, Indonesia 2. Program Studi Fakultas Teknologi InformasiUniversitas Kristen Satya Wacana Jl. Diponegoro 52 – 60, Salatiga – 50711, Indonesia
Vol.6 No.2 - Januari 2013
172
ISSN: 1978 - 8282 mengembangkan model tersebut yang dinamika penularan dan penyebaran virus H5N1 pada sebuah sistem manajemen bencana wabah penyakit H5N1, sehingga mereka dapat menjadi alat penting dalam kebijakan pengelolaan bencana wabah. Metode yang digunakan dalam penelitian ini adalah model SIR (Suceptible-Infeksi-sembuh). Model ini dibangun dalam tiga tahap penelitian. Pengaturan lisensi pertama terkait dengan Departemen. Kedua, data sekunder penelitian dan pengembangan model matematis ketiga. Hasil penelitian ini adalah untuk memodelkan dinamika penularan dan penyebaran virus H5N1 pada populasi acommunity. Hasilnya diharapkan dapat dimanfaatkan sebagai sistem manajemen fordisaster rangka wabah penyakit. Hasil penelitian dalam bentuk model matematika dan kebijakan strategis untuk pengembangan di masa depan. Kata kunci: SIR, transmisi model, dinamika penyebaran tersebut, H5N1 Pendahuluan Wabah avian influenza atau flu burung (yang disebabkan oleh virus subtipe H5N1) pertama kali terdeteksi pada unggas di Korea Selatan pada bulan Desember 2003. Di Indonesia wabah flu burung yang menyerang pada hewan saat ini sangat serius, dan telah menyebar ke 23 propinsi, meliputi 151 kabupaten/kota. Sampai dengan Desember 2004, jumlah kumulatif kasus kematian ternak unggas akibat flu burung mencapai lebih dari 8 juta ekor. Penularan pada manusia telah dilaporkan sebanyak 241 kasus infeksi dan 141 diantaranya telah meninggal dunia sejak bulan Agustus 2006. Antara tahun 2006 sampai tahun 2008 Indonesia secara global merupakan negara yang paling parah terkena wabah virus H5N1 dengan jumlah kasus 137 dan jumlah penderita meninggal sebanyak 112 orang. Kerugian jangka pendek pandemi flu burung di Indonesia diperkirakan sebesar 14–48 triliun rupiah [1]. Penyebaran flu burung yang semakin meluas wilayahnya disebabkan oleh tidak terkontrolnya pergerakan unggas yang terinfeksi flu burung, produk hasil unggas dan limbahnya, tenaga kerja serta kendaraan pengangkut dari wilayah terinfeksi ke wilayah yang masih bebas, serta rendahnya kapasitas kelembagaan kesehatan hewan dan tenaga kesehatan hewan yang terlatih. Secara kuantitas, individu yang telah terinfeksi dapat disimulasikan secara grafis menggunakan data sensus, data pola perubahan tata guna lahan dan data mobilitas penduduk. Model matematis dan analisis statistik dalam epidemiologi difokuskan untuk membuat prediksi faktor–faktor yang menjadi parameter terhadap transmisi penyakit dalam populasi (vektor maupun manusia)[9]. Model matematis persebaran penyakit yang memiliki validitas dan akurasi tinggi merupakan konsep dasar untuk memahami dampak penyakit dan menyusun strategi pengendaliannya. Dalam perumusan strategi pengendalian, model harus sudah memiliki parameter kunci seperti struktur sosiodemografi dalam populasi, konektivitas individu dalam populasi dan struktur geografi dimana populasi berada [3]. Pemodelan epidemiologi terdiri dari tiga kategori, pertama berbasis persamaan (model analisis), kedua berbasis agen (populasi direpresentasikan sebagai suatu sistem yang dapat berinteraksi) dan ketiga berbasis jaringan (interaksi sosial didasarkan pada teori jaringan)[12]. Pemodelan epidemiologi berbasis persamaan (model analisis) diawali dengan munculnya model SIR (Susceptible, Infectious, Recovered). Model ini digunakan untuk menentukan apakah seseorang dalam suatu populasi berada dalam fase rentan, terinfeksi atau penyembuhan/ mortalitas. Model SIR digunakan untuk menghitung jumlah teoritis individu yang terinfeksi dan seberapa cepat terjadi penularan dalam suatu populasi yang tertutup[6]. Pemodelan SIR 173 Vol.6 No.2 - Januari 2013
ISSN: 1978 - 8282 dapat dilakukan menggunakan aplikasi komputasi seperti Matlab dan R. SIR telah diterapkan untuk menganalisis kejadian demam berdarah dengue Kota Salatiga tahun 2000 – 2008 menggunakan Package Amei pada lingkungan pemrograman R [16]. Penelitian tentang H5N1 yang pernah dilakukan adalah pembangunan model kontrol endemik H5N1 dengan tujuan untuk menentukan target vaksinasi dan model surveillans yang dikembangkan [18].Penelitian sejenis lain adalah analisis statistika model transmisi virus H5N1 dan menghasilkan pola spasial endemik serta potensi distribusi penyakit di wilayah sekitarnya[4]. Penelitian yang berjudul “ Pembuatan Model Transmisi dan Dinamika Persebaran Virus H5N1 Sebagai Sistem Manajemen Bencana Endemik Flu Burung di Kabupaten Semarang” ini bertujuan untuk merancang, membangun dan menerapkan model spasial statistik pola transmisi dan persebaran virus H5N1 serta mengembangkan sebagai perangkat penting dalam kebijakan manajemen bencana wabah penyakit.
Pengembangan Metode Analisis menggunakan Suceptible Infectious Recovered (SIR) Terdapat berbagai tipe formulasi penyusun model (compartments), pemilihan penggunaan formulasi pembangun model berdasarkan pada karakteristik khusus penyakit yang akan dimodelkan dan tujuan pemodelan. Beberapa pola compartments yang sering digunakan adalah MSEIR, MSEIRS, SEIR, SEIRS, SIR, SIRS, SEI, SEIS, SI, and SIS [19]. Pemodelan persebaran penyakit dalam suatu populasi tertentu, bersifat epidemis dan disebabkan oleh virus dimodelkan menggunakan Suceptible Infectious Recovered (SIR)[21]. SIR adalah klasifikasi populasi berdasarkan pada derajad kerentanan terhadap penyakit dan mekanisme proses transmisi peyakit pada manusia. Ada tiga klasifikasi, kelompok populasi yang potensial/beresiko tertular (Susceptible), kelompok populasi yang telah terinfeksi/ penyebaran penyakit (Infectious) dan kelompok populasi yang telah mengalami penyembuhan (Removed/Recovered) sebagai akibat mekanisme sistem imun, atau proses karantina atau mengalami kematian [20]. Kelompok populasi pada vektor nyamuk terdiri dari dua klasifikasi, yaitu kelompok populasi yang potensial/beresiko menular (Susceptible) dan kelompok populasi terinfeksi/penyebaran penyakit (Infectious). Beberapa asumsi dasar model SIR adalah sebagai berikut : 1. Populasi bersifat tertutup, tidak ada kelahiran, kematian dan migrasi yang terepresentasi dalam model. 2. Populasi bersifat homogen dan acak, probabilitas kontak antar dua individual tidak hanya ditentukan oleh dua individu tersebut, dengan demikian memiliki karakteristik kontak yang sama dengan individu lainnya. 3. Populasi/penduduk suatu daerah diinisialisasi sebagai N − m , adanya individu yang telah terinfeksi pada suatu populasi/penduduk yang potensial/beresiko tertular. 4. Proses penularan terjadi jika terjadi kontak antara kelompok individu yang potensial/ beresiko menular (Susceptible) dan kelompok populasi terinfeksi/penyebaran penyakit (Infectious). 5. Kejadian kontak pada setiap individu dengan individu lainnya pada waktu tertentu dihitung sebagai proses Poisson dengan parameter : Vol.6 No.2 - Januari 2013
174
ISSN: 1978 - 8282
β N yang mana
adalah rerata kontak atau rerata terinfeksi pada suatu populasi/penduduk
N . (Trapman, 2006) Adapun keterhubungan antara compartments dalam dua kelompok populasi tersebut adalah sebagaimana pada Gambar 1.
β
Gambar 1. Keterhubungan antara compartments kelompok populasi manusia dan vektor Variabel SIR dan SI bersifat dependen dan masing–masing memiliki variabel yang bersifat independen yaitu waktu t () . Artinya keseluruhan variabel tersebut berlangsung pada suatu satuan waktu tertentu. Aliran dari Susceptible menuju Infectious disebut sebagai fase Transmission ( β ) sedangkan aliran dari Infectious menuju Recovered disebut fase Recovery( α ). Apabila populasi seluruh Salatiga dinyatakan sebagai N, maka S/N = s, I/N = i dan R/N = r. Proses epidemis dapat dimodelkan sebagai berikut : 175
Vol.6 No.2 - Januari 2013
ISSN: 1978 - 8282
ds = − βsi dt di = β si − αi dt dr = αi dt (persamaan 1) dimana,
β adalah rerata transmisi penyakit melalui rerata kontak,
adalah proses recovery, penyembuhan melalui imun, atau kematian yang tidak berpengaruh terhadap proses transmisi penyakit. Sesuai dengan persamaan dasar pada persamaan 1 maka dinamika transmisi penyakit pada manusia dapat diuraikan sebagai berikut :
α
bβ vektor →manusiatinggi bβ vektor →manusiarendah ds manusia IV + IV ) s manusia = λN T − ( µ mausia + dt NT + m NT + m ditinggi dt
=
bβ vektor →htinggi NT + m
IVektor smanusia − ( µ manusia + r ) I manusiatinggi
direndah bβ vektor →manusiarendah I vektor s manusia − ( µ hmanusia + r ) I hrendah = dt NT + m dr = r ( I manusiatinggi + I manusiarendah ) − µ hmanusia Rmanusia dt (persamaan 2) Dinamika transmisi penyakit pada vektor dapat diuraikan sebagai berikut :
bβmanusiatinggi→vektor bβmanusiarendah→vektor dsmanusia = A − (µv + I manusiarendah )shmanusia I tinggi + NT + m dt NT + m bβmanusiarendah→vektor divektor bβmanusiatinggi→vektor = I manusiarendah )smanusia − µvektorI vektor Itinggi + NT + m dt NT + m (persamaan 3) Dimana,
NT
adalah jumlah keseluruhan populasi manusia/penduduk suatu daerah
Vol.6 No.2 - Januari 2013
176
ISSN: 1978 - 8282
S tinggi adalah jumlah populasi manusia/penduduk yang beresiko tinggi tertular (Susceptible) I tinggi
adalah jumlah populasi manusia/penduduk yang terinfeksi endemis tinggi
I rendah
adalah jumlah populasi manusia/penduduk yang terinfeksi endemis rendah
Rtinggi
adalah jumlah populasi manusia/penduduk yang mengalami penyembuhan
bβ vektor→manusiatinggi adalah peluang terjadinya transmisi virus dari vektor ke manusia dalam endemis tinggi
bβ vektor → manusia rendah adalah peluang terjadinya transmisi virus dari vektor ke manusia dalam endemis rendah
NT − m
adalah individu yang telah terinfeksi pada suatu populasi/penduduk yang
potensial/beresiko tertular
µI manusiatinggi
peluang terjadinya kematian sebagai akibat terinfeksi pada suatu populasi/
penduduk
µ tinggi
peluang terjadinya kematian pada masa penyembuhan
bβ manusiatinggi →vektor adalah peluang terjadinya transmisi virus dari manusia ke vektor dalam endemis tinggi
bβ manusia rendah →vektor adalah peluang terjadinya transmisi virus dari manusia ke vektor dalam endemis rendah
I manusiatinggi S vektor adalah peluang terjadinya infeksi pada manusia dalam endemis tinggi yang berasal dari vektor yang beresiko tinggi tertular.
I manusia rendah S vektor adalah peluang terjadinya infeksi pada manusia dalam endemis rendah yang berasal dari vektor yang beresiko tinggi tertular.
Sv
adalah jumlah populasi vektor yang beresiko menularkan penyakit (Susceptible)
Iv
adalah jumlah populasi vektor yang beresiko terinfeksi penyakit (Infected)
µv
peluang terjadinya kematian vektor.
Metode Penelitian Proses penelitian dilakukan melalui tiga tahapan/langkah. Adapun kegiatan, metode dan hasil dari setiap langkah adalah sebagaimana pada Gambar 2.
177
Vol.6 No.2 - Januari 2013
ISSN: 1978 - 8282
Gambar 2.Tahapan pengembangan sistem peringatan dini langkah 1 - 3 Langkah ke 1 Langkah ke 1 adalah kegiatan pengurusan perijinan penelitian dilokasi penelitian yang meliputi : 1. Dinas Kesehatan Kabupaten Semarang. 2. Kesbangpolinmas Kabupaten semarang. 3. Dinas Peternakan Kabupaten semarang. 4. Bappeda Kabupaten Semarang. Langkah ke 2 Langkah ke 2 adalah inventarisasi data primer dan sekunder. Metode yang digunakan adalah : 1. Inventarisasi data primer menggunakan wawancara dan kuosiner. Wawancara dilakukan pada kelompok masyarakat yang telah dinyatakan sembuh oleh rumah sakit dari suspect H5N1. Kuesioner diberikan pada kelompok masyarakat yang selama ini bekerja pada sektor peternakan unggas. 2. Diskusi kelompok terfokus (Focus Group Discussion). 3. Mengkaji data sekunder (Secondary Data Review) yang meliputi : a. Data Sosial dan Kependudukan b. Data klimatologi c. Data penyelidikan epidemiologi (PE) Langkah ke 3 Langkah ke 3 terdiri atas beberapa kegiatan, yaitu : Vol.6 No.2 - Januari 2013
178
ISSN: 1978 - 8282 1.
2.
Penetapan parameter kunci KLB dengan metode FGD dan SDR. Parameter kunci ditetapkan setelah dilakukan proses inventarisasi dan analisis data yang diperoleh dari langkah ke 2. Analisis data dilakukan untuk mengetahui sejauh mana keterhubungan antara parameter dengan kasus H5N1. Penetapan metode analisis. Metode analisis yang digunakan dalam penelitian ini adalah sebagai beriku : a. Asosiasi antar parameter ditentukan menggunakan persamaan Moran’s dan Geary dan tool OpenGeoda. b. Pola transmisi penyakit ditentukan menggunakan Package Amei dalam lingkungan pemorgraman R.
Hasil Pengolahan Data Berdasarkan hasil pengolahan data yang diperoleh dari wawancara, penyebaran kuisioner, dan ditambah dengan pelaksanaan Forum Group Discussion (FGD), didapatkan gambaran informasi sebagai berikut : Berdasarkan data klimatologi didapatkan data curah hujan, temperatur dan kelembaban yang terjadi sepanjang tahun 2001-2010, sebagaimana seperti grafik yang diperlihatkan pada Gambar 3.
Gambar 3. Data curah hujan, kelembaban, dan temperature sepanjang tahun 2001-2010 Dan dari data yang diperoleh dari dinas perternakan memperlihatkan data populasi dari unggas-unggas yang terdapat pada masing-masing kecamatan yang terdapat sejak tahun 2001-2010 seperti yang terlihat pada Gambar 4. 179
Vol.6 No.2 - Januari 2013
ISSN: 1978 - 8282
Gambar 4. Populasi Unggas Kabupaten Semarang dari 2001-2010 Sedangkan data yang diterima dari dinas kesehatan memberikan gambaran yang nyata mengenai jumlah unggas yang meninggal di masing-masing kecamatan dan jenis dari unggas yang meninggal. Data tersebut dapat dilihat pada grafik yang ada pada Gambar 5.
Gambar 5. Grafik kematian unggas dari tahun 2007 – 2010 di kabupaten Semarang Vol.6 No.2 - Januari 2013
180
ISSN: 1978 - 8282
Analisis Dan Pembahasan Untuk membuat pemodelan SIR diperlukan data rerata transmisi virus(b), rerata penyembuhan (v), rerata kematian (µ) (dalam SIR dibuat asumsi nol) dan tingkat pencampuran populasi individu terinfeksi (k) [8]. Parameter biaya (cost) vaksinasi dihitung sebagai biaya vaksinasi tunggal dan perawatan individual. Dalam penelitian ini biaya vaksinasi diasumsikan nol (dengan pemikiran bahwa sebelum terjangkit, setiap individu belum mendapatkan vaksin dari Puskesmas setempat). Untuk melakukan simulasi jumlah populasi yang terjangkit, dan tingkat individu yang berada dalam Suspected, Infected dan Recovery dalam skala eksperimen maka digunakan fungsi Mcepi (Monte Carlo Epidemics). Parameter costs merupakan biaya untuk indikator vaksinasi, kematian dan terinfeksi. Pada penelitian ini diasumsikan tidak ada biaya yang dikeluarkan sehingga bernilai nol. Artinya jumlah yang divaksinasi, jumlah yang meninggal dan jumlah terinfeksi tidak ada biaya. Untuk melakukan simulasi strategi jumlah biaya vaksinasi terendah digunakan fungsi optvac yang bekerja secara stokastik epidemis, dapat dilihat pada gambar 6.
Gambar 6. Model SIR Pada Jumlah Penderita Infeksi Flu Burung Kabupaten Semarang Tahun 2000 – 2008 Pola distribusi posterior parameter SIR kejadian infeksi flu burung Kabupaten Semarang dapat dianalisis melalui parameter rerata transmisi, parameter dispersi, rerata mortalitas dan rerata penyembuhan. Nilai setiap parameter digambarkan dengan titik, nilai tengah posterior digambarkan dengan nilai x dan wilayah distribusi posterior sebesar 95% digambarkan dengan arsir. 181
Vol.6 No.2 - Januari 2013
ISSN: 1978 - 8282
Gambar 7. Pola Distribusi Posterior Parameter SIR Kejadian Flu Burung Pada Kabupaten Semarang 2001 – 2009 Dan sebagai gambaran secara langsung dapat dilihat pada gambar peta dibawah ini, diambil tahun 2007 karena pada tahun itu tigkat kematian unggas sangat tinggi, dan curah hujan yang cukup rapat pada setiap harinya.
Vol.6 No.2 - Januari 2013
182
ISSN: 1978 - 8282 Kesimpulan Package Amei efektif diterapkan sebagai tool untuk pemodelan optimasi epidemiologi pada kejadian epidemis demam flu burung di kabupaten Semarang pada tahun 2000 sampai dengan 2008. Dengan perangkat ini dapat dilakukan analisis perbandingan pola penurunan jumlah individu yang berada dalam Suspected Infected dan Recovery secara lebih signifikan sebagai dampak proses vaksinasi. Pola distribusi posterior parameter SIR
kejadian flu burung di kabupaten Semarang dapat dianalisis melalui parameter rerata transmisi, parameter dispersi, rerata mortalitas dan rerata penyembuhan. Nilai setiap parameter, nilai tengah posterior, dan wilayah distribusi posterior sebesar 95% DAFTAR PUSTAKA [1] Asmara Widya, 2007, Peran Biologi Molekuler dalam Pengendalian Avian Influenza dan Flu Burung, Pidato Pengukuhan Guru Besar FKH – UGM,Yogyakarta. [2] Atchade, Yves ; Gersende, Fort ; Moulines, Eric ; Priouret, Pierre, 199 . Adaptive Markov Chain Monte Carlo: Theory and Methods, University of Michigan, 1085 South University, Ann Arbor, 48109, MI, United States. http://www.stat.lsa.umich.edu/~yvesa/afmp.pdf [3] Barthelemy, Marc ; Barrat, Alain ; Pastor-Satorras, Romualdo ; Vespignani, Alessandro, 2005, Dynamical patterns of epidemic outbreaks in complex heterogeneous networks, Journal of Theoretical Biology 235 (2005) 275–288, School of Informatics and Biocomplexity Center, Indiana University, Bloomington, IN 47408, USA. www.cc.gatech.edu/classes/AY2010/cs8803ns_fall/barthelemy.pdf, [4] Eubank, Stephen ; Hasan, Guclu, S.; Kumar, Anil ; Marathe, Madhav V. ; Srinivasan, Aravind ; Toroczkai, Zolta ; Wang, Nan, 2008. Modelling disease outbreaks in realistic urban social networks, Basic and Applied Simulation Science Group, Los Alamos National Laboratory, MS M997, Los Alamos, New Mexico 87545, USA ndssl.vbi.vt.edu/Publications/modellingDisease.pdf. [5]
Harvey Neil, Aaron Reeves, Mark A. Schoenbaumc, Francisco J. Zagmutt-Vergara, Caroline Dube, Ashley E. Hill, Barbara A. Corso, W. Bruce McNab, Claudia I. Cartwright dan Mo D. Salman, 2007, The North American Animal Disease Spread Model: A simulation model to assist decision making in evaluating animal disease incursions, Preventive Veterinary Medicine 82 (2007) 176–197, USA www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/17614148.
[6] Teri, Johnson, 2009, Mathematical Modeling of Diseases: Susceptible-InfectedRecovered (SIR) Model, University of Minnesota, Morris, http:// www.morris.umn.edu/academic/math/Ma4901/Sp09/Final/Teri-Johnson-Final.pdf.
183
Vol.6 No.2 - Januari 2013
ISSN: 1978 - 8282 [7] Karandikar Rajeeva, 2006. On the Markov Chain Monte Carlo (MCMC) method, Indian Statistical Institute, Sadhana Vol. 31, Part 2, April 2006, pp. 81–104. www.ias.ac.in/sadhana/Pdf2006Apr/81.pdf [8] Keeling Matt dan Ken T.D Eames, 2005, Networks And Epidemic Models, Department of Biological Sciences & Mathematics Institute, University of Warwick, Gibbet Hill Road, Coventry CV4 7AL, UK. http://ukpmc.ac.uk/ articlerender.cgi?artid=1259156. [9] Maiti A, S. Pathak dan Samanta G.P., 2004, Rich dynamics of an SIR epidemic model, Nonlinear Analysis: Modelling and Control, 2010, Vol. 15, No. 1, 71–81, Department of Mathematics, Presidency College, Kolkata-700073, India, http:// www.lana.lt/journal/36/Pathak.pdf. [10] Merl Daniel, Leah R. Johnson, Robert B. Gramacy dan Marc S. Mangel, 2009. Amei: an R package for the Adaptive Management of Epidemiological Interventions, Department of Statistical Science, Duke University, Durham NC. cran.r-project.org/web/pa ck ag es /am ei /vignettes /am ei .pdp [11] Pang Wan-Kai, Shui Hung Hou, Marvin D.Trout, Wing-Tong Yu, Ken W, 2007, A Markov Chain Monte Carlo Approach to Estimate the Risks of Extremely Large Insurance Claims, International Journal of Business and Economics, 2007, Vol. 6, No. 3, 225-236, Department of Applied Mathematics, The Hong Kong Polytechnic University, Hong Kong http://www.ijbe.org/table%20of%20content/pdf/vol6-3/vol.6-3-04.pdf [12] Skvortsov, Connell, Dawson dan Gailis, 2007, Epidemic Modelling: Validation of Agent-based Simulation by Using Simple Mathematical Models, Defence Science and Technology Organisation, PO Box 4331, Melbourne, VIC, 3001, http://mssanz.org.au/MODSIM07/papers/13_s20/ EpidemicModeling_s20_Skvortsov_.pdf. [13] Soetaert Karline dan Thomas Petzoldt, 2010, Inverse Modelling, Sensitivity and Monte Carlo Analysis in R Using Package FME, Netherlands Institute of Ecology. Netherland cran.r-Project.org/web/packages/FME/vignettes/FMEother.pdf, [14] Yulianto Sri, Kasmiyati, Kristoko D.H.,Maria Marina H., 2009, Pengurangan Potensi Bencana Epidemi, Wabah Dan KLB Beberapa Penyakit Tropis Melalui Penerapan Paradigma Pengurangan Resiko Yang Diintegrasikan Dengan Kurikulum Pembelajaran Pada Sistem Manajemen Bencana, Laporan Akhir Hibah Strategis Nasional Batch IV, Tahun ke 1,Universitas Kristen Satya Wacana Salatiga. [15] Yulianto, Sri ; Kristoko Dwi Hartomo, Krismiyati, 2010, Spatial Autocorrelation Modelling for determining High Risk Dengue Fever Transmission Area in Salatiga,
Vol.6 No.2 - Januari 2013
184
ISSN: 1978 - 8282 Central Java, Indonesia, International Conference on Soft Computing, Intelligent System and Information Technology, Petra Christian University Surabaya. [16]
Yulianto S. dan Subanar, 2010, Pemodelan SIR (Suspect Infected Recovery) Kejadian Demam Berdarah Dengue Kota Salatiga Tahun 2000 – 2008 Menggunakan Package Amei pada R, Belum dipublikasikan.
[17]
Zaman Gul, Yong Han Kang dan Il Hyo Jung, 2007, Optimal vaccination and treatment in the SIR epidemic model, Department of Mathematics, Pusan National University, Busan 609-735, Korea. www.ksiam.org/conference/annual072/upfile/Optimal%2 0SIR.pdf.
[18]
Guan dkk, 2007, A model to control the epidemic of H5N1 influenza at the source, BMC Infectious Diseases 2007, 7:132, State Key Laboratory of Emerging Infectious Diseases, the University of Hong Kong, Pokfulam, Hong Kong SAR, China
[19]
Hetchote Herbert, 2000, The Mathematics of Infectious Diseases, Department of Mathematics, University of Iowa, Iowa City. www.math.uiowa.edu/~hethcote/PDFs/ 2000SiamRev.pdf
[20]
Regoes Roland, 2009. Stochastic simulation of epidemics, Institute of Integrative Biology
[21]
Galluzzo Bens, 2008. Epidemiology, Modeling Epidemics and Endemics, Department of Mathematics The University of Iowa.
185
Vol.6 No.2 - Januari 2013