STRUKTUR , MORFOLOGI , DAN KLASIFIKASI VIRUS
Morfologi dan komponen virus Virus merupakan mikroorganisme terkecil yang pernah dikenal. Umumnya tidak dapat dilihat dengan mikroskop biasa, kecuali poxvirus. Ukuran virus bervariasi mulai dari poxvirus yang kira-kira 300 x 25a x 100 nm sampai parvovirus yang kirakira berdiameter 20 nm. Karena itu, mudah dimengerti iika morfologi virus baru diketahui setelah dikembangkan mikroskop elektron dan metode difraksi sinar X. Inti virion merupakan asam nukleat yang seringkali bergabung dengan protein sehingga disebut nukleoprotein. Di luar nukleoprotein terdapat lapisan protein lain sebagai pembungkus yang dikenal sebagai bapsid. Kapsid terdiri dari sejumlah kapsomer yang terikat satu sama lain dengan ikatan nonkovalen. Kapsid melindungi asam nukle at dart pengaruh ekstraseluler, mempermudah proses penempelan dan mungkin pula proses penembusan ke dalam sei. Polipeptida yang menyusun kapsid dapat sama, dapat pula tidak. Agar dapat melindungi asam nukleat, molekutr polipeptida harus tersusun simetris, dan sampai saat ini hanya dua jenis simetri yang dikenal, yaitu simetri heliks dan simetri ikosahedral. Bentuk simetri ikosahedral adalah bentuk tata ruang yang dibatasi oleh 20 segitiga sama sisi. Bentuk ini mempunyai aksis rotasi berganda. Karena keteraturannya, jumlah kapsomer yang ada pada virion dapat dihitung dengan rumus tertentu. Pada picornavirus terdapat 60 kapsomer, adenovirus252 kapsomer, herpesvirus 162 kapsomer, papovavirus 72 kapsomer. Reovirus menduduki kelas tersendiri karena ia mempunyai dua lapis kapsid, yang keduanya tersusun menurut simetri ikosahedral. Pada simetri heliks, asam nukleat yang memanjang dikelilingi oleh molekul-molekul protein yang tersusun seperti spiral, sehingga hanya mempunyai satu aksis rotasi. Contoh simetri demikian ditemui pada myxovirus dan rhabdovirus. Hanya lima kelompok virus yang terdapat dalam keadaan telanjang, yaitu picornavirus, reovirus, adenovirus, papovavirus dan parvovims. Sedangkan pada virus-virus lainnya, di luar dari kapsid terdapat selubung luar (envelope) yang terdiri dari protein dan lipid, dimana spike glikoprotein (peplomer) menempel.
Untuk dapat menganalisis komponen kimia virus, diperlukan virus murni. Untuk pemurnian dipakai bahan-bahan yang mengandung virus dalam jumlah yang besar, misalnya bahan seluler yang berasal dari jaringan atav biakan sel terinfeksi atau bahan ekstraseluler seperti plasma, cairan alantois, medium biakan sel/jaringan. Pemurnian virus ikosahedral tak berselubung umumnya tidak mengalami kesulitan yang berarti. Sebalik nya bany ak virus berselubung tidak mudah dimurnikan, karena jumlah selubung per virion bervariasi sehingga virion-virion bersifat heterogen baik dalam ukuran maupun dalam densitasnya. Asam nukleat virus binatang ternyata sangat heterogen. Beberapa di antaranya merupakan DNA sedang yang lainnya RNA, sebagian rantar tunggal sebagian lagi rantai ganda, sebagian mempunyai polaritas positif sebagian lagi negatif. Pengertian tentang asam nukleat virus mempunyai arti penting untuk dapat memahami proses perkembangbiakan virus, sifat biologik dan sebagainya. Misalnya saja ukuran asam nukleat dihubungkan dengan jumlah informasi genetik yang dibawanya; segmentasi asam nukleat pada virus influensa dihubungkan dengan terjadtnya rekombinasi genetika yang menimbulkan terjadinya antigenic sbift, derajar homolog basa asam nukleat dihubungkan dengan taksonomi virus. Asam nukleat picornaviridae dan arbovirus mampu langsung bergabung dengan ribosom sel hospes atau berpolaritas positif, sehingga informasi genetik yang diperlukan untuk pembentukan progeni dapat langsung ditranslasikan darinya. Kejadian tersebut terakhir tak dapat feramati jika asam nukleat berpolaritas negatif atau anti ffiessage, seperti pada myxovirus dan rhabdovirus. Bagian terbesar dari struktur virus adalah protein. Protein merupakan komponen tunggal kapsid, bagian terbesar dari selubung dan dapat merupakan bagian proteininti (core protein) pada beberapa virus ikosahedral. Protein tersebut di atas disebut juga sebagai protein struktural, karena mempunyai fungsi membentuk rangka virion. Selubung virus sering mengandung glikoprotein. IJnsur karbohidratnya terdiri dari monosakari da y ang dihubungkan dengan r antai polipeptida oleh ikatan glikosida. Protein dari beberapa virus yang termasuk dalam
golongan arbovirus, myxovirus, picornavirus, reovirus, adenovirus dan papovavirus mempunyai sifat dapat menggumpalkan sel darah merah berbagai spesies binatang. Protein tersebut dikenal dengan haemaglutinin. Selain itu beberapa virus juga mengandung enzim, yang dapat dikategorikan ke dalam tiga golongan, 1. Neuraminidasa yang menghidrolisis galaktosa N asetil neuraminat. Enzim ini terdapat pada orthomyxovirus yaitu pada salah satu tonjolan glikoprotein nya. Enzim ini berfungsi membantu proses penetrasi ke dalam sel. 2. Beberapa jenis virion mengandung RNA polimerasa. Jika genom virus merupakan genom yang langsung dapat bertindak sebagai mRNA, maka ekspresi genom dapat terjadi secara langsung. Hal demikian ditemukan pada picornavirus dan arbovirus. Tetapi jika genom virus berupa DNA atau RNA dengan polaritas negatif, maka sebelum genom tersebut diekspresikan dalam bentuk prorein, terlebih dahulu harus ditranskripsikan menjadi RNA dengan polaritas positif. Dalam haI yang disebut terakhir, terdapat dua jenis sumber enzim polimerasa. Pertama virus menggunakan polimerase yang terdapat di dalam sel hospes, seperti pada herpesvirus, adenovirus, papovavirus. Kedua, virion mengandung polimerasa sendiri seperti pada poxvirus, myxovirus, rhabdovirus. Retrovirus mempunyai enzim transkriptasa terballk (reoerse transcriptase) yang berfungsi membentuk DNA dari cetakan RNA. 3. Beberapa virion juga mengandung enzim yang bekerja pada asam nukleat. Adenovirus, poxvirus dan retrovirus misalnya mengandung enzim nukleasa.
KLASIFIKASI VIRUS Nama famili virus ditandai dengan akhiran viridae. Anggota famili merupakan virus yang mempunyai sifat umum sama dan tidak banyak berubah. Anggota famili tertentu mempunyai morfologi virion, struktur dan replikasi genom khas. Hal ini menunjukkan kemungkinan filogenitas yang sama. Dari berbagai famili, emPat famili, yaitu herpesviridae, poxviridae, papova viridae dan retroviridae dibagi lagi atas subfamili. Nama subfamili diberi akhiran virinae. Nama genus virus ditandai dengan akhiran virus. Anggota genus merupakan spesies yang mempunyai sifat serupa. Kriteria penggolongan spesies dalam genus tertentu masih belum seragam dan bervariasi tergantung familinya. Kriteria yang dipakai dapat berupa sifat fisikokimia dan/atau serologi. Pengelompokan virus atas spesies merupakan hal yang masih diperdebatkan. Ada yang menganggap bahwa spesies merupakan kumpulan galur dengan sifat tertentu yang berbeda dari kumpulan galur lain. Sifat yang dipakai sebagai kriteria penentuan spesies dapat berupa sifat fisikokimia, sifat serologik ataupun sifat biologik lain. Penamaan virus tidak mengikuti penamaan binomial seperti pada penamaan bakteri. Dengan kata lain tidak mengikuti penamaan Linnaeus. Untuk kepentingan formal, huruf pertama dari famili, subfamili dan genus harus huruf besar dan nama lengkap ditulis dengan huruf miring atau digaris bawahi. Aturan tersebut boleh tidak dipakai pada pemakaian informal. Lwoff, Horrie dan Tournier merupakan ahli yang berjasa dalam pengembangan taksonomi virus. Mereka mengajukan beberapa kriteria sebagai berikut :
Dengan lebih majunya pengetahuan tentang bagai dasar penggolongan virus. virus, banyak kriteria tambahan yang dipakai. Kriteria tersebut adalah: Secara ringkas kriteria tersebut dapat dilihat L Jenis asam nukleat, RNA atau DNA pada Tabel 30-1. 2. Simetri kapsid Saat ini telah lebih dari enam puluh satu famili 3. Ada-tidaknya selubung virus diidentifikasi. Dua puluh satu di antaranya 4. Banyaknya kapsomer untuk virus ikosahe- mempunyai anggota yang mampu menyerang dral atau diameter nukleokapsid untuk virus manusia dan binatang. Famili yang penting dapat helikoidal. dilihat pada uraian di bawah dan untuk memudahkan, virus digolongkan dua bagian, yaitu virus bergenom RNA dan virus bergenom DNA. Pengelompokan sederh^na dapat dilihat pada Tabel30-2 dan 30-3. Selain itu masih terdapat sekelompok virus yang belum dapat diklasifikasikan dan sering disebut sebagai unclassified virus. Dikelompokkan sebagai unclassified virus karena banyak sifat biologiknya belum diketahui dan sifat-sifatnya yang telah diidentifikasi belum memungkinkan virus tersebut dimasukkan ke dalam golongan yang sudah ada. Dalam tabel 30 - 4 virus dan beberapa sifatnya diuraika.'r secara singkat.
