ANOVA
Anova (analysis of varian)
Uji hipotesis perbedaan nilai rata-rata dari 2 atau lebih kelompok independen Contoh: Adakah perbedaan berat bayi lahir dari keluarga SES tinggi dengan SES sedang atau SES rendah Asumsi Uji Anova: 1. Subjek diambil secara random dari populasi 2. Varian semua populasi adalah sama 3. Populasi terdistribusi secara normal 4. Error adalah independen dan terdistribusi sec. normal Ho : (Semua adalah sama) 1 2 3 HA : (Tidak semua sama) atau Setidaknya salah satu dari i berbeda dengan lainnya
Dept. Biostatistics FKM UI, 2006
1
Dept. Biostatistics FKM UI, 2006
ANOVA
ANOVA
PROSEDUR UJI ANOVA: 1 2 3 1. Ho: (Semua adalah sama) Ha: (Tidak semua adalah sama) 2. Tentukan tingkat kepercayaan (dengan tertentu) 3. Test Statistik: Uji-F-Anova 4. Area penolakan: Ho ditolak jika F hitung > F tabel (; df1=k-1; df2=N-k) atau p-value < 5. Keputusan: Ho ditolak atau gagal ditolak 6. Kesimpulan: Ho gatol Ho: Semua sama. Ho ditolak Ha: Tidak semua adalah sama/ minimal salah satu berbeda dengan lainnya
MODEL UJI ANOVA:
Dept. Biostatistics FKM UI, 2006
Dept. Biostatistics FKM UI, 2006
Page 3
xij j eij Xij = Nilai suatu karakteristik di populasi = Mean populasi (konstanta yang tdk diketahui) j = Efek dari treatment/perbedaan kategori (Variance Between Groups) eij = Residual/Error sbg efek dari selain treatment (Variance Within Groups)
ANOVA Data Lay-out: (perhitungan ANOVA) Treatment-j
Treatment-.
Treatment-k
x11
X1.
x13
x21
X2.
x23
x31
X3.
x33
xij
xi.
Xnk
Total
nj = …
n. = …
nk = …
N=…
j = …
. = …
k = …
= …
Sj = …
S. = …
Sk = …
xj = …
x. = …
xk = …
(X2) = …
Page 2
Page 4
ANOVA Keterangan: Xij = Nilai observasi pada sampel ke-i s/d -n pada kelompok ke-j s/d -k nj = Jumlah sampel pada kelompok ke-j s/d -k (k = jumlah treatment/kelompok) N = Jumlah sampel keseluruhan (Total observasi) j = mean tiap kelompok (dari j s/d k) = mean keseluruhan (grand mean) Sj = SD tiap kelompok (dari j s/d k) xj = Jumlah dari nilai observasi pada kelompok -j s/d –k (X) = Jumlah dari nilai semua observasi (X2) = Jumlah dari nilai kuadrat semua observasi
(X) = … Dept. Biostatistics FKM UI, 2006
Page 5
Dept. Biostatistics FKM UI, 2006
Page 6
1
ANOVA Anova Lay-out:
Rumus Grand Mean & Varian Grand mean
Source of variation
Sums of Squares
Df
Mean Squares
F
Between
SSB
k -1
MSB=SSB/k-1
MSB/MSw
Within
SSW
N -k
MSw= SSw/N-k
Total
SST
N -1
Rumus-1:
Varian betwen: betwen: (MSB )
2
SS B n j x j x .... nk xk x
2
2
2
xˆ
SSw ( n j 1). S j .... ( nk 1). Sk Dept. Biostatistics FKM UI, 2006
{n (x x)2 n2(x2 x)2 ...nk (xk x)2} B2 1 1 k 1
{s2(n 1)s22(n2 1)....sk2(nk 1)} W2 1 1 Nk
Varian within (MSw)
Page 7
{n1 x1 n2 x2 ..... nk xk } n1 n2 ....nk
Dept. Biostatistics FKM UI, 2006
Page 8
ANOVA Anova Lay-out: Source of variation
Sums of Squares
Df
Mean Squares
F
Source of variation
MSB/MSw
Between
SSB
Within
SSW
Total
SST
Between
SSB
k–1
MSB=SSB/k-1
Within
SSW
N–k
MSw= SSw/N-k
Total
SST
N-1
Rumus-2:
ANOVA Anova Lay-out:
( Xj ) 2 X 2 SS B n j N 2 k Xij SST X ij 2 N j
Dept. Biostatistics FKM UI, 2006
Page 9
Rumus-2:
Sums of Squares
F
k-1
MSB=SSB/k-1
MSB/MSw
N- k
MSw= SSw/N-k
SST X 2
2
X k
....
nk
X 2
2
2 X N
SS w SST SS B
N
Dept. Biostatistics FKM UI, 2006
Page 10
Contoh Aplikasi ANOVA 1. Ho: Ha: 2. Uji-ANOVA Rumus-2:
Lama tunggu (menit) P.Dalam Bedah Kebidanan Total 10 5 8 9 8 7 7 8 8 9 5 7 10 7 6 9 6 9 8 6 8 9 8 9 8 6 10 7 6 5 10 10 10 8.6 6.5 7.7 7.6 1.1 1.2 1.5 86 65 77 228 750 435 613 1798
Dept. Biostatistics FKM UI, 2006
Mean Squares
N-1
X j SS B nj
Contoh Aplikasi ANOVA
n mean sd x x2
Df
X j SS B nj
2
....
SST X 2
Page 11
Dept. Biostatistics FKM UI, 2006
X k
nk
X 2
2
2 X N
SS w SST SS B
N
Page 12
2
ANOVA Anova Lay-out: Source of Sums of variation Squares
Df
Mean Squares
F (hitung)
Between 44.1 27 1.63 Within 66.3 29 Total F tabel = … - = 0.05 - Numerator = k –1 = 3 – 1 = 2 - Denominator = N – k = 30 – 3 = 27 (dekat 30) F tabel = antara 3.40 dengan 3.32 (atau F tabel = 3.36) Keputusan: Ho ditolak karena F hitung > F tabel 22.2
2
11.1
6.97
Dengan uji ANOVA saja kita belum tahu kelompok mana yang berbeda, apakah k1 dg k2, k1 dg k3, atau k2 dg k3 Untuk menjawab pertanyaan ini kita harus melakukan uji banding ganda (multiple comparison test) Salah satu metodenya adalah the Least Significant Difference (LSD) Ho ditolak jika: 2.MSw X j X j ' t ( / 2 ,df N k ) N
Nilai-p = … - F = 6,97 (Berkisar 6,4 – 8,8) - Nilai-p = (Berkisar 0,005 – 0,001) - Nilai-p < alpha (5%) Ho ditolak Dept. Biostatistics FKM UI, 2006
Multiple Comparison
Page 13
Dept. Biostatistics FKM UI, 2006
Multiple Comparison
Page 14
Uji ANOVA
Descriptives lama_tunggu Multiple Comparisons
N P. Dalam Bedah Kebidanan Total
10 10 10 30
Dependent Variable: lama_tunggu Std. Deviation Std. Error LSD 1.07497 .33993 1.17851 .37268 Mean 1.49443 .47258 Difference 1.49943 .27376 (I) Ruang (J) Ruang (I-J) Std. Error P. Dalam Bedah 2.10000* .56437 Kebidanan .90000 .56437 Bedah P. Dalam -2.10000* .56437 Kebidanan -1.20000* .56437 Kebidanan P. Dalam -.90000 .56437 Bedah 1.20000* .56437 *. The mean difference is significant at the .05 level.
Mean 8.6000 6.5000 7.7000 7.6000
Sum of Squa res
Mean Square
df
Between Groups
22.200
2
11.100
Within Groups
43.000
27
1.593
Total
F
Sig. .001 .122 .001 .043 .122 .043
Sig.
6.970
.004
65.200 29 Dept. Biostatistics FKM UI, 2006
Page 15
Output komputer
VAR00001Between Groups
df
Mean Square
22.200
2
11.100
Within Groups
43.000
27
1.593
Total
65.200
29
Dept. Biostatistics FKM UI, 2006
Page 16
Within Group Variance
ANOVA Sum of Squares
F-rasio = Perbandingan variasi antar group (between group) dengan variasi di dalam group (within group) Jika rasio tsb besar, berarti variasi yang terjadi adalah akibat dari perbedaan treatmen/kelompok Jika rasio tsb kecil, berarti variasi yang terjadi hanyalah akibat perbedaan antar individu Berapa rasio yang disebut besar ? Tergantung dari derajat kemaknaan (alpha) yang dapat diterima
F 6.970
Sig. .004
Penyakit Dalam 2 Observasi (Observasi-rata-rata) (Observasi-rata-rata) 10 1.4 1.96 9 0.4 0.16 7 -1.6 2.56 9 0.4 0.16 10 1.4 1.96 9 0.4 0.16 8 -0.6 0.36 9 0.4 0.16 8 -0.6 0.36 7 -1.6 2.56 Jumlah 0 10.4
Sum of square within group Dept. Biostatistics FKM UI, 2006
Page 17
Dept. Biostatistics FKM UI, 2006
Page 18
3
Within Group Variance
Within Group Variance Kebidanan 2 Observasi (Observasi-rata-rata) (Observasi-rata-rata) 8 0.3 0.09 7 -0.7 0.49 8 0.3 0.09 7 -0.7 0.49 6 -1.7 2.89 9 1.3 1.69 8 0.3 0.09 9 1.3 1.69 10 2.3 5.29 5 -2.7 7.29 0 20.1
Bedah 2 Observasi (Observasi-rata-rata) (Observasi-rata-rata) 5 -1.5 2.25 8 1.5 2.25 8 1.5 2.25 5 -1.5 2.25 7 0.5 0.25 6 -0.5 0.25 6 -0.5 0.25 8 1.5 2.25 6 -0.5 0.25 6 -0.5 0.25 0 12.5
Dept. Biostatistics FKM UI, 2006
Page 19
Sum of square within group SSW Peny. Dalam = 10,4 SSW Bedah = 12,5 SSW Kebidanan = 20,1 SSW ketiga kelompok: 10,4+12,5+20,1 = 43,0 Rata Rata--rata deviasi kuadrat pd 3 kelompok: 43,0/((10--1)+(10 43,0/((10 1)+(10--1)+(10 1)+(10--1))=1,59
Dept. Biostatistics FKM UI, 2006
Page 20
Between of group Variance Between of Variance
SS A
(x x )
S A2
Dept. Biostatistics FKM UI, 2006
Mean of square within group
Page 21
Observasi (Observasi-rata-rata) Rata-rata semua kel.) 10 1.4 1 9 0.4 1 7 -1.6 1 9 0.4 1 10 1.4 1 9 0.4 1 8 -0.6 1 9 0.4 1 8 -0.6 1 7 -1.6 1 Jumlah 0
Dept. Biostatistics FKM UI, 2006
Dept. Biostatistics FKM UI, 2006
Page 22
Between group variance
Between group variance Penyakit Dalam (Rata-rata pd kel. -
SS A df A
(Rata-rata pd kel. 2 Rata-rata semua kel.) 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 10
Page 23
Bedah (Rata-rata pd kel. Observasi
Dept. Biostatistics FKM UI, 2006
(Rata-rata pd kel. 2
Rata-rata semua kel.) Rata-rata semua kel.) 5 -1.1 1.21 8 -1.1 1.21 8 -1.1 1.21 5 -1.1 1.21 7 -1.1 1.21 6 -1.1 1.21 6 -1.1 1.21 8 -1.1 1.21 6 -1.1 1.21 6 -1.1 1.21 0 12.1
Page 24
4
Sum of square within group
Between group variance
Observasi 8 7 8 7 6 9 8 9 10 5
Kebidanan (Rata-rata pd kel. - (Rata-rata pd kel. 2 Rata-rata semua kel.) Rata-rata semua kel.) 0.1 0.01 0.1 0.01 0.1 0.01 0.1 0.01 0.1 0.01 0.1 0.01 0.1 0.01 0.1 0.01 0.1 0.01 0.1 0.01 0.1
Dept. Biostatistics FKM UI, 2006
Page 25
SSB Peny. Dalam = 10,0 SSB Bedah = 12,1 SSB Kebidanan = 0,1 SSB ketiga kelompok: 10,0+12,1+0,1 = 22,2 Rata Rata--rata deviasi kuadrat pd 3 kelompok: 22,2/(3 kel. -1) = 11,1
Dept. Biostatistics FKM UI, 2006
Mean of square between group
Page 26
Variance BETWEEN & WITHIN GROUPS
ANOVA Variance Between Groups
SB 2
SS B df B
dimana
Total sum of squares
SS B
(x x)
SST ( x x )
Variance Within Groups
SW 2
SSW df w
Dept. Biostatistics FKM UI, 2006
dimana
SSw
( x x )2
Page 27
F
Dept. Biostatistics FKM UI, 2006
S A2 SW 2
Page 28
5